Abstract
HOX avskrift anti intergeniske RNA (
hotair
) er en lang ikke-kodende RNA (lncRNA) som fungerer som en onkogen molekylet i forskjellige kreftceller. Genetiske varianter av
hotair
kan påvirke aktivitet av visse regulatoriske forhold og videre regulere avvikende uttrykk for
hotair
, som kan være underliggende mekanismer som påvirker tumor mottakelighet og prognose. Nylig har flere studier blitt utført for å undersøke den mulige sammenhengen mellom polymorfismer i
hotair Hotell og kreftrisiko; har imidlertid resultatene vært mangelfulle. Derfor utførte vi en meta-analyse for å beregne assosiasjoner mellom
hotair
polymorfismer (rs920778, rs4759314 og rs1899663) og kreftrisiko. Åtte studier som omfatter 7,151 saker og 8,740 kontroller ble inkludert i vår studie. Total, ingen signifikant sammenheng mellom
hotair
polymorfismer (rs920778, rs4759314 og rs1899663) og kreftrisiko ble observert. Men i ytterligere stratifisert analysene varianten T-allelet av rs920778 viste en betydelig økt risiko for å utvikle fordøyelses kreft (dominerende modellen: OR = 1,44; 95% CI = 1,31 til 1,59). Disse funnene gitt bevis for at
hotair
rs920778 kan endre følsomhet for visse krefttyper. Videre studier som omfatter personer med ulik etnisk bakgrunn kombinert med re-sekvensering av merket regionen og funksjonelle evalueringer er garantert
Citation. Tian T, Li C, Xiao J, Shen Y, Lu Y, Jiang L, et al. (2016) kvantitativ vurdering av polymorfismer i
hotair
lncRNA og kreftrisiko: En meta-analyse av 8 kasus-kontrollstudier. PLoS ONE 11 (3): e0152296. doi: 10,1371 /journal.pone.0152296
Redaktør: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, USA
mottatt: 08.12.2015; Godkjent: 12 mars 2016; Publisert: 24 mars 2016
Copyright: © 2016 Tian et al. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Data Tilgjengelighet:. All relevant data er i avisen og dens saksdokumenter filer
Finansiering:. Dette arbeidet ble finansiert av Natural Science Foundation National of China (81502876), Natural Science Research of Jiangsu høgskolerådet (15KJB330006), Science and Technology Program for Nantong (MS22015088) og Stiftelsen doktorgrads Scientific Research Nantong University (14R16). De finansieringskilder hadde ingen rolle i studien design, innsamling og tolkning av data, skriving av rapporten, eller beslutning om å sende denne artikkelen for publisering
Konkurrerende interesser:. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer.
Innledning
Kreft er den ledende årsak til dødsfall på verdensbasis. Ifølge WHO anslår, var det 14,1 millioner nye krefttilfeller i 2012, og over 20 millioner nye krefttilfeller vil bli forventet årlig så tidlig som 2025, noe som indikerer en stadig økende global kreft byrden [1]. Vanligvis er kreft anses å være multifaktorielle sykdommer, og forekomsten av kreft er knyttet til miljømessige, genetiske og livsstilsfaktorer. Blant disse faktorene, genetiske faktorer er av spesiell interesse, spesielt fordi nyere genom-wide assosiasjonsstudier (GWAS) og neste generasjons sekvensering (NGS) har i stor grad utvidet vår forståelse av genetiske variasjoner der det gis risiko for kreft.
lange ikke-kodende RNA (lncRNAs) er en type av ikke-kodende RNA (ncRNA) som inneholder mer enn 200 nukleotider og ikke koder for proteiner, men har sentral rolle i mange biologiske funksjoner. Nyere rapporter tyder på at avvikende uttrykk for lncRNAs kan spille en viktig rolle i utvikling og progresjon av svulster [2,3,4] som sannsynligvis mediert gjennom endringer på kromatin, transkripsjons eller post-transkripsjon nivåer som påvirker målet genuttrykk [5] . I tillegg GWASs har blitt identifisert flere lncRNA polymorfismer som er forbundet med risikoen for å utvikle ulike typer kreft. Men, i likhet med de andre rapporterte GWAS, har flertallet av lncRNA SNPs som har blitt identifisert av GWAS kartlagt til intergeniske regioner eller introner som ikke koder for proteiner, og de potensielle funksjonene til disse SNPs i patogenesen av kreft forblir udefinert. Videre, på grunn av de strenge kriteriene for screening GWASs, noen mulige kausale lncRNAs og varianter som er forbundet med karsinogenese kan ha blitt i stor grad være ignorert. Dermed kan ytterligere innsats rettet mot kandidat lncRNAs som fungerer i utviklingen av kreft være hensiktsmessig å avdekke en del av den manglende arvbarhet. En slik lncRNA er HOX transkripsjon anti intergeniske RNA (
hotair
), funksjon som har vist seg å være nært knyttet til utvikling og progresjon av enkelte kreft [6,7,8].
til dags dato, forholdet mellom avvikende uttrykk for
hotair Hotell og kreft prognose har blitt utforsket av mange forskere. Dessuten har meta-analyser viste at avvikende uttrykk for
hotair
kan tjene som en indikator på at spår dårlige prognoser både kreft samlet [9] og i bestemte typer kreft (for eksempel fordøyelsessystemet kreft og østrogen- avhengige ondartede svulster) [10,11,12]. I tillegg er en meta-analyse utført av Cai et al. avslørte at overekspresjon av
hotair
er signifikant assosiert med lymfeknutemetastaser hos kreftpasienter, som kan videre påvirke kreftprognoser [13].
I 2015 Bayram S et al. viste at rs920778 SNP av
hotair
er signifikant assosiert med avansert stadium TNM, fjern metastase og dårlig histologisk karakter hos brystkreftpasienter, som indikerer at denne polymorfisme kan være assosiert med brystcancer prognose [14]. Tilsvarende har det blitt rapportert at en annen SNP i
hotair plakater (rs12826786) er assosiert med clinicopathological funksjoner som er involvert i mage Cardia adenokarsinom progresjon [15]. I tillegg relasjoner av
hotair
polymorfismer (inkludert rs4759314 og rs920778) med uttrykk for
hotair Hotell og ulike kreftrisiko har blitt observert [15,16,17,18]. Dessuten, Zhang et al. rapportert at SNP rs920778 i
hotair
kan endre aktiviteten til en roman intronic
hotair
Enhancer [17]. Dermed er det biologisk tenkes at de genetiske varianter av
hotair
kan påvirke virksomheten til visse regulatoriske forhold og videre regulere avvikende uttrykk for
hotair
, som kan være en av de underliggende mekanismene som påvirke svulst mottakelighet og prognose. Som forventet, relasjonene
hotair
av polymorfismer med overfølsomhet for kreft har tiltrukket seg mye interesse [14,15,16,17,18,19,20,21]. Men resultatene fra studiene som har undersøkt denne foreningen er mangelfulle. For eksempel, en tidligere studie rapport at rs920778 varianten genotype øker betydelig risikoen for magekreft hos kinesiske mennesker [16]; Men blant tyrkiske folk, samme variant viste ingen signifikant sammenheng, og effekten verdier var selv i motsatt retning i forhold til tidligere studier av kinesiske populasjoner [19]. Derfor basert på alle de nåværende publiserte data, utførte vi en meta-analyse for å mer presist karakterisere sammenslutninger av
hotair
polymorfismer (rs920778, rs4759314 og rs1899663) med kreftrisiko.
Material og metoder
Identifisering og valgbarhet av relevante studier
En omfattende litteratursøk i PubMed og Embase opptil 30 november 2015 ble utført ved hjelp av følgende søkeord: ( «
hotair
«eller» HOX transkript antisens intergeniske RNA «) og (» cancer «,» carcinoma «,» svulst «,» tumor «, eller» svulst «) og (» polymorfi «,» variant «,» variant «eller» mutasjon «). Henvisningen i hentes artikler ble også anmeldt for mulig inkludering. Kun publikasjoner skrevet på engelsk med tilgjengelige fulltekstartikler ble inkludert i denne meta-analysen. Studier ble inkludert hvis de oppfylte følgende kriterier: (1) case-control studier fokusert på forholdet mellom
hotair
polymorfisme og alle typer kreft, (2) mer enn to artikler for hver studert
hotair
polymorfisme, (3) tilgjengelig informasjon om genotypen frekvensen for hver inkludert
hotair
SNP (dvs. rs920778, rs4759314 eller rs1899663), og (4) publisert som en full papir på engelsk. De viktigste årsakene til utelukkelse av studiene var følgende: (1) ikke fokusert på kreftrisiko, (2) ikke studere
hotair
SNPs (rs920778, rs4759314 eller rs1899663), (3) ikke rapporterer de relevante genotype frekvensdata, (4) ikke publisert på engelsk, og (5) ikke-menneskelig forskning. Til syvende og sist ble totalt 8 artikler inkludert 7,151 saker og 8,740 kontroller inkludert i denne meta-analyse (figur 1).
Data utvinning
To etterforskere (TT og LJ) uavhengig hentet ut data og nådde enighet om alle elementene. Følgende informasjon ble søkt fra hver artikkel: den første forfatterens navn, årstall, opprinnelsesland, etnisitet, type kreft, antall saker og kontroller, genotyping plattform og genotypet SNPs. Vi kategorisert de ulike etnisiteter som kaukasiere og asiater.
Statistisk analyse
Risikoen for kreft knyttet til hver
hotair
polymorfisme ble beregnet for hver undersøkelse ved hjelp av odds ratio (OR ) og 95% konfidensintervall (95% KI). Den mellom-studien heterogenitet ble undersøkt med en chi-kvadrat-baserte
Q
statistikk test, og
P
≤ 0,05 ble ansett som statistisk signifikant. Vi samlet resultatene med fast effekt modeller når heterogenitet mellom studiene var fraværende. Ellers var en tilfeldig effekt modellen valgt. Deretter evaluerte vi risikoen ved heterozygot og variant homozygot genotyper i forhold til villtype homozygot genotype og deretter evaluert risikoen for den kombinerte heterozygot og variant homozygot genotyper i forhold til villtype homozygot genotype mens forutsatt at de dominerende effektene av varianten allel. For rs920778 utførte vi også en lagdeling analyser basert på etnisitet (delt inn i hvite og asiater) og krefttyper. Trakt plott og Begg test ble brukt for å evaluere publikasjonsskjevhet. Alle analysene ble utført ved hjelp av Stata versjon 12.0 programvare (Stata Corporation, College Station, TX, USA).
Funksjonell annotering basert på offentlig tilgjengelige databaser
SNPs i høy LD (
r
2 ≥ 0,80) med markør SNP rs920778 ble identifisert i henhold med SNAP 2.2 (https://www.broadinstitute.org/mpg/snap/ldsearch.php/). Expression kvantitativ egenskap loci (eQTL) analyse ble utført basert på databasen Genotype-Tissue Expression-prosjektet (GTEx) (https://www.gtexportal.org/home/). Påvirkning av SNPs på miRNA binding ble spådd med en elektronisk tjeneste (https://www.bioguo.org/miRNASNP2/). I tillegg ble andre funksjonelle merknads resultatene utledet fra KODE database (https://genome.ucsc.edu/ENCODE/).
Resultater
Kjennetegn på publiserte studier
Etter påføring av de strenge screening kriteriene, 8 artikler som omfattet totalt 7,151 tilfeller og 8,740 kontroller skjuler magekreft, brystkreft, tykktarmskreft og øsofagus plateepitelkarsinom (ESCCs) ble til slutt tatt med i dagens kvantitative analysen. De generelle egenskapene til de inkluderte studiene er listet opp i tabell 1, og de ekskluderte studiene er oppført i S1 tabell. Blant de inkluderte studiene ble seks studier gjennomført i asiater (kinesisk) populasjoner, og to studier ble utført hos kaukasiske (Tyrkisk) populasjoner. Publikasjonen år med de inkluderte studiene var mellom 2014 og 2015, og utvalget av utvalgsstørrelsene var 245 til 4248. I alt fire artikler rapportert effekten av
hotair
polymorfismer i magekreft, to i brystkreft, ett i spiserørs plateepitelkarsinom (ESCC), og ett i tykk- og endetarmskreft. Blant studiene som utforsket forholdet av
hotair
SNPs med kreftrisiko, fem fokusert på rs920778 SNP, seks på rs4759314 SNP og tre på rs1899663 SNP. Genotyping ble utført ved bruk av TaqMan i 4 studier, PCR-RFLP i 3 studier og CRS-RFLP i en studie. Fordelingen av genotyper og alleler av
hotair
polymorfismer (rs920778, rs4759314 og rs1899663) i de enkelte studier er oppført i S2-S4 Tables.
Kvalitet vurderinger av den medfølgende studier
den metodiske kvaliteten på hvert inkluderte studien ble evaluert ved bruk av Newcastle-Ottawa kvalitetsvurdering skala (NOS). Ved hjelp av denne metoden, ble hver studie dømt på standard kriterier og deretter kategorisert basert på tre faktorer: utvalg, sammenlignbarhet, og eksponering. Oppsummering score fra 0 til 9 poeng ble beregnet, og høyere score indikerer lavere risiko for skjevhet (S5 tabell).
Kvantitativ syntese
Evalueringene av de sammenslutninger av rs920778 med kreftrisiko presenteres i Tabell 2. Total, T allel variant oppviste ingen signifikant sammenheng med kreftrisiko i noen av de testede modellene (CT versus CC: OR = 1,11; 95% CI = 0,86 til 1,44;
P
= 0,014 for heterogenitet test,
jeg
2
= 67,8%; TT versus CC: OR = 1,55; 95% CI = 0,84 til 2,85;
P
= 0.000 for heterogenitet test,
jeg
2
= 85,8%; dominerende modellen: OR = 1,20; 95% CI = 0,92 til 1,57,
P
= 0,005 for heterogenitet test,
jeg
2
= 73,2%; fig 2)
Vi har evaluert ved effekten av rs920778. polymorfisme på kreftrisiko blant undergrupper (tabell 2). I et stratifisert analysene, ble det observert en signifikant økt kreftrisiko blant asiater (kinesisk, dominerende modellen: OR = 1,46; 95% CI = 1,32 til 1,61;
P
= 0,953 for heterogenitet test,
I
2
= 0,0%). I motsetning til en betydelig redusert kreftrisiko ble observert blant kaukasiere (tyrkisk, dominerende modellen: OR = 0,65; 95% CI = 0,42 til 1,00;
P
= 0.080 for heterogenitet test,
I
2
= 67,4%). I tillegg, fordi majoriteten (60%, 3/5) av studiene som inngår i vår meta-analyse involvert fordøyelses kreft (magekreft og ESCC), vi så utført en separat analyse for fordøyelses kreft. Interessant, rs920778 variant viste en signifikant sammenheng med økt risiko for fordøyelses kreft (dominerende modellen: OR = 1,44; 95% CI = 1,31 til 1,59;
P
= 0,339 for heterogenitet test,
I
2
= 7,6%;. Tabell 2)
evalueringene av assosiasjoner mellom de 2 andre SNPs (rs4759314 og rs1899663) og kreftrisiko er presentert i figur 3 og 4. Totalt G variant allelet av rs4759314 viste ingen signifikant sammenheng med kreftrisiko (dominerende modellen: OR = 1,05; 95% CI = 0,86 til 1,27,
P
= 0,024 for heterogenitet test,
jeg
2
= 61,5%). T variant allel av rs1899663 også viste ingen signifikant sammenheng med kreftrisiko (dominerende modellen: OR = 0,77; 95% CI = 0,51 til 1,15,
P
= 0.000 for heterogenitet test,
I
2
= 89,3%).
Test av heterogenitet
for rs920778, ble det observert signifikant heterogenitet etter dataene ble samlet ( dominerende modellen:
P
for heterogenitet = 0,005,
jeg
2
= 73,2%). (Tabell 2) Når forsøkspersonene ble stratifisert basert på etnisitet, den heterogenitet åpenbart forsvant i asiater (dominerende modellen:
P
for heterogenitet = 0,953,
Jeg
2
= 0,0%); imidlertid heterogenitet var fortsatt til stede blant kaukasiere (dominerende modellen:
P
for heterogenitet = 0,080,
Jeg
2
= 67,4%), som kan ha vært på grunn av genetisk heterogenitet mellom de ulike inkluderte etnisiteter. I tillegg, i stratifiserte analyser basert på krefttyper, heterogeniteten ble betydelig redusert for fordøyelses kreft (dominerende modellen:
P
for heterogenitet = 0,339,
Jeg
2
= 7,6%).
følsomhets~~POS=TRUNC analyse~~POS=HEADCOMP
for å teste stabiliteten av rs920778 resultater, utførte vi sensitivitetsanalyser av sekvensielt fjerne hver kvalifiserte studie (S6 tabell). Studien av Bayram et al. som fokuserte på brystkreft var den største bidragsyteren av heterogenitet i den dominerende modellen (
Jeg
2
= 73,2%,
P
for heterogenitet = 0,005). Etter fjerning av denne studien, ble heterogenitet betydelig redusert (
Jeg
2
= 0,0%,
P
for heterogenitet = 0,536). Som forventet, ble lignende resultater observert i de andre genetiske modeller (dvs. CT versus CC og TT versus CC) og indikerte at den studie av Bayram et al. som fokuserte på brystkreft markert forandret den sammenslåtte OR.
publiseringsskjevheter
Vi brukte trakt plott og Begg test for å vurdere potensielle publiseringsskjevheter i studert litteratur. Som illustrert i S1-S3 figurene, figurer av trakt tomter var symmetrisk, og en Begg test gitt videre statistisk bevis for fravær av publikasjonsskjevhet (
P
= 0,14 for rs920778,
P
= 0,85 for rs4759314, og
P
= 0,60 for rs1899663).
Diskusjoner
Nylig, et økende antall studier har undersøkt foreninger av forskjellig
hotair
uttrykk nivåer med kreft overlevelse, men færre studier har fokusert særlig vekt på relasjoner til
hotair
polymorfismer med kreft mottakelighet og overlevelse. Likevel, relasjoner til
hotair
polymorfismer med kreft sensitiviteter har tiltrukket seg mye interesse; Men resultatene er kontroversielt. I denne studien, utførte vi en meta-analyse ved å samle 8 studier med summer av 7,151 saker og 8,740 kontroller og demonstrerte at T-allelet av rs920778 var assosiert med en betydelig økt risiko for fordøyelses kreft. Men rs4759314 og rs1899663 variant lene viste ingen signifikante assosiasjoner med kreftrisiko.
rs920778 SNP på 12q13.13 ligger i intron 2 av
hotair
. Basert på offentlige datasett og verktøy (se metoder; S7 Table), vi utført ytterligere funksjonelle merknader til markør SNP rs920778 og SNPs som er i sterk LD med rs920778 (
r
2 0,8). Blant de 11 SNPs som ble funnet å være i sterk LD med rs920778 betydelige genotype-spesifikke effekter av 5 SNPs (dvs. rs10783618, rs11170775, rs4759059, rs4237809 og rs2366150) på mRNA uttrykk for
hotair
ble observert (eQTL analyse). Deretter utforsket vi de mulige mekanismer som disse SNPs modulerer uttrykk for
hotair
. Ifølge chip-Seq data fra KODE database (https://genome.ucsc.edu/ENCODE/), ble totalt 10 SNPs ligger i motiver som kan påvirke bindende aktivitetene til mange transkripsjonsfaktorer, inkludert EZH2, CTBP2 , CHD1, ZNF143, SUZ12, TCF7L2, CTCF, RAD21, og YY1. De transkripsjonsfaktorer som er nevnt ovenfor kan være intimt forbundet med forekomst og progresjon av mange typer av tumorer i menneske. For eksempel, Enhancer av Zeste homolog 2 (EZH2) er over-uttrykt i flere humane svulster og står for aggressiviteten og ugunstige prognoser av ulike svulster [22,23]. Videre suppressor av Zeste-12 protein (SUZ12) er av stor betydning i den tumorgenesen av flere humane cancere [24,25] og er involvert i utviklingen av ikke-småcellet lungekreft via dets rolle i å fremme celleproliferasjon og metastase [26]. I tillegg, som spådd av en miRNA-bindende analyse nettside (https://www.bioguo.org/miRNASNP2/), kan rs7958904 SNP påvirke bindingsaktiviteten av HSA-MIR-615. Dette miRNA er et nylig identifisert tumor suppressor som kan regulere proliferasjon, migrering, invasjon, og apoptose av forskjellige typer kreftceller [27,28]. Således er disse funksjonelle kommentarer tyder på at de ovennevnte SNP’er (inkludert markør SNP rs920778 og den kodede SNP’er) kan hver for seg eller i fellesskap påvirke avvikende aktivitetene til visse transkripsjonsfaktorer eller mirnas og videre påvirke forekomst og progresjon av visse tumorer gjennom ulike mekanismer . Imidlertid er eksperimentelle bevis validere denne hypotesen begrenset, og fremtidige funksjonelle studier er nødvendig for å avklare mulige mekanismer.
I denne meta-analysen, kan vi ikke identifisere en signifikant sammenheng av rs920778 SNP med kreftrisiko. Men ifølge analysene stratifisert av befolkningen etnisitet, den rs920778 SNP var signifikant assosiert med økt risiko for kreft i asiater (kinesisk). I kontrast, fant vi at rs920778 polymorfisme utstilt motsatt assosiasjon med risiko for kreft hos kaukasiere (Tyrkisk). Mulige årsaker til de ulike resultatene mellom asiatere og kaukasiere er som følger. For det første kan forskjellen ha vært forårsaket av forskjeller i de genetiske bakgrunn av de studerte populasjoner. For eksempel, basert på HapMap data (International HapMap Prosjekt), allelfrekvensene av rs920778 SNP er forskjellig mellom asiatiske og kaukasiske populasjoner. For det andre kan forskjellen skylder til utnyttelse av forskjellige genotyping metoder, som inkluderte PCR-RFLP, CRS-RFLP, TaqMan Real-Time PCR, etc. For det tredje, sammenlignet med asiatiske populasjoner, utvalgsstørrelsene på de kaukasiske populasjoner kan ikke ha vært tilstrekkelig stor til å nå et overbevisende konklusjon om foreningen av rs920778 SNP med kreftrisiko. I tillegg kan de forskjellige typer kreft involvert og tilfeldige feil også være mulige årsaker til forskjellene i resultatene mellom asiatere og kaukasiere.
I 2014, Deng et al. gjennomført en meta-analyse som viste at
hotair
overflod kan tjene som en roman prediktiv faktor for fattige kreft [9] prognoser. Resultatene av denne studien og våre resultater både viste signifikante sammenhenger mellom
hotair Hotell og kreft. Funnene i vår studie gitt bevis for at
hotair
polymorfismer kan endre kreft mottakelighet. Dessverre, i sin meta-analyse av den prognostiske verdien av
hotair
i kreft, Deng et al. ikke utforske de sammenslutninger av
hotair
polymorfismer med kreftprognoser, og relevant forskning på
hotair
polymorfismer og kreftprognoser er begrenset. Men basert på både funn og funksjonelle merknads resultater, spekulerer vi at
hotair
polymorfismer kan regulere uttrykk for
hotair Hotell og videre påvirke kreftutvikling og progresjon via visse understreking mekanismer, som kan åpne nye veier for forebygging og behandling av kreft.
styrken i denne meta-analysen er at vi systemisk anmeldt forholdet mellom
hotair
polymorfismer og tumor mottakelighet for første gang, og vi identifisert annerledes sammenslutninger av den rs920778 SNP med kreftrisiko i ulike etniske populasjoner. I tillegg er veldesignede funksjonelle merknader som ytterligere bekreftet våre funn er en annen styrke ved studien. Men det er også noen begrensninger som må tas opp. Først ble det observert betydelig heterogenitet mellom studier. Blant de 8 publiserte studier som inngår i vår meta-analyse, noen av studiene var populasjonsbasert, mens andre var sykehusbasert. For det andre, vi fikk ikke søke kinesiske databaser, noe som vil resultere i publikasjonsskjevhet. Tredje, i noen av studiene, detaljert informasjon (f.eks alder, kjønn, røykestatus og alkoholforbruk) ble ikke oppgitt, som begrenset ytterligere stratifisering analyser. I tillegg, hvis vi hadde vært i stand til å tilegne seg mer detaljert informasjon, ville vi ha oppnådd mer presise estimater ved å justere for andre potensielle kovariatene. Til slutt, for denne studien, samlet vi bare åtte rapporter. De fleste av fagene var asiater, og antallet kaukasiske fag som inngår i denne studien var relativt liten. Dermed er godt gjennomført storeksempelstudier for å utforske videre kreftrisikoen forbundet med
hotair
SNPs, spesielt i kaukasiere.
Konklusjoner
Denne meta-analysen forutsatt bevis at
hotair
rs920778 kan endre følsomhet for visse krefttyper. Videre studier som omfatter personer med ulik etnisk bakgrunn kombinert med re-sekvensering av merket regionen og funksjonelle evalueringer er garantert.
Hjelpemiddel Informasjon
S1 Fig. Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av
hotair
rs920778 polymorfisme og kreftrisiko i henhold dominerende modellen (trakt tomt med pseudo 95% konfidensintervall ble brukt)
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s001
(TIF)
S2 fig. Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av
hotair
rs4759314 polymorfisme og kreftrisiko i henhold dominerende modellen (trakt tomt med pseudo 95% konfidensintervall ble brukt)
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s002
(TIF)
S3 fig. Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av
hotair
rs1899663 polymorfisme og kreftrisiko i henhold dominerende modellen (trakt tomt med pseudo 95% konfidensintervall ble brukt)
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s003
(TIF)
S1 Table. Liste over ekskluderte artikler og deres grunner for eksklusjon
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s004 plakater (docx)
S2 Table. Utdeling av genotypene og alleler av
hotair
rs920778 polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s005 plakater (docx)
S3 Table. Utdeling av genotypene og alleler av
hotair
rs4759314 polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s006 plakater (docx)
S4 Table. Utdeling av genotypene og alleler av
hotair
rs1899663 polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s007 plakater (docx)
S5 Table. Newcastle-Ottawa kvalitetsvurdering skala for hver inkluderte studie
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s008 plakater (docx)
S6 Table. Sensitivitetsanalyse av rs920778 i dominerende modellen
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s009 plakater (docx)
S7 Table. Funksjonell merknad for markør SNP rs920778 og SNPs i sterk koblingsulikevekt med markøren SNP
doi:. 10,1371 /journal.pone.0152296.s010 plakater (docx)
