Abstract
Bakgrunn
VEGF-uavhengig angiogen signalisering spiller en viktig rolle i utviklingen av tykktarmskreft (CRC). Imidlertid har sin innblanding i den kliniske utfallet av CRC ikke blitt rapportert. Denne studien hadde som mål å undersøke sammenhengen mellom genetiske variasjoner i flere store VEGF-uavhengige signalveien gener og total overlevelse av CRC-pasienter.
Metoder
Syv enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i fire viktige VEGF-uavhengig angiogene gener (
ANGPT1
,
Åmot
,
DLL4 Hotell og
ENG
) ble genotypet i en kinesisk befolkning med 408 CRC pasienter.
Resultater
En SNP, rs1954727 i
ANGPT1
, var signifikant assosiert med CRC total overlevelse. Sammenlignet med pasienter med homozygot villtypegenotype av rs1954727, de med heterozygote og homozygote variant genotyper viste en gunstig total overlevelse med hazard ratio (HR) på 0,89 (95% konfidensintervall [CI] 0,55 til 1,43,
P
= 0,623), og 0,32 (95% CI 0,15-0,71,
P
= 0,005), henholdsvis (
P
trend = 0,008). I stratifisert analyse, forble denne foreningen betydelig hos pasienter som får kjemoterapi (
P
trend = 0,012), men ikke i de uten kjemoterapi. Vi evaluerte videre effekten av kjemoterapi på CRC overlevelse som ble stratifisert etter rs1954727 genotyper. Vi fant ut at kjemoterapi resulterte i en betydelig bedre total overlevelse i CRC pasienter (HR = 0,44, 95% KI 0,26 til 0,75,
P
= 0,002), som var spesielt fremtredende hos pasienter med heterozygot genotype av rs1954727 (HR = 0,45, 95% KI 0,22 til 0,92,
P
= 0,028).
Konklusjon
Våre data tyder på at rs1954727 i
ANGPT1
genet kan være en prognostisk biomarkør for total overlevelse av CRC pasienter, særlig hos dem som fikk kjemoterapi, et funn som garanterer validering i større uavhengige populasjoner
Citation. Dai J, Wan S, Zhou F, Myers RE, Guo X, Li B, et al. (2012) genetisk polymorfisme i VEGF-Uavhengig Angiogenese Gene ANGPT1 og total overlevelse av pasienter med kolorektal kreft etter kirurgisk reseksjon. PLoS ONE 7 (4): e34758. doi: 10,1371 /journal.pone.0034758
Redaktør: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japan
mottatt: 07.10.2011; Godkjent: 05.03.2012; Publisert: 04.04.2012
Copyright: © 2012 Dai et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Arbeidet rapportert her er støttet av en oppstartsbevilgning fra Thomas Jefferson University, gi 2009CB521704 fra The National Basic Research Program i Kina, og gi 30.872.927 fra National Natural Science Foundation i Kina. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Worldwide, tykktarmskreft (CRC) er den tredje vanligste kreftformen og den fjerde største årsaken til kreftdød med anslagsvis 1,234,000 nye tilfeller og 608,000 dødsfall i 2008 [1]. CRC er en sykdom som i stor grad påvirkes av livsstil og kostholdsfaktorer [2], men har nyere studier antydet at interindividuelle genetiske variasjoner kan påvirke risikoen for CRC [3], [4], [5]. I tillegg oppsamling av bevis, inkludert de fra våre egne studier har også vist at enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) kan anvendes som surrogat biomarkører av den genetiske bakgrunn av CRC-pasienter for å predikere terapeutisk respons og prognose [6], [7], [8], [9].
tumor angiogenese, generering av nye blodkar, er en viktig cellulær prosess som påvirker tumor cellevekst, invasjon, lokal-regional gjentakelse, og metastatisk spredning av CRC, noe som gjør det et attraktivt mål for kreft narkotika utvikling [10] sikret tumor cellevekst, invasjon, og metastaser er sterkt påvirket av balansen av funksjoner av endogene angiogene og anti-angiogene faktorer [10]. De vaskulær endotelial vekstfaktorer (VEGFs) og dets reseptorer (VEGFRs) spiller en sentral rolle i angiogenese vei [11]. De funksjonelle inhibitorer av VEGF og VEGFRs, slik som anti-VEGF-nøytraliserende antistoff og små molekyler som blokkerer tyrosinkinase-aktiviteten til VEGFRs, har blitt godkjent som anti-angiogenese-terapi for mange kreftformer, inkludert CRC [12]. Men den brede motstanden mot den anti-angiogene terapier rettet mot VEGF veien stimulerte søket etter behandlinger rettet mot VEGF-uavhengig angiogenese vei [12], [13], som pro-angiogenic veier mediert av angiopoietins /TIE-2 og Delta /Notch [14], [15], samt anti-angiogen trasé mediert av angiomotin og endoglin proteiner [16], [17].
Genetiske variasjoner i
VEGF
genet har blitt rapportert til å modulere VEGF-genekspresjon [18], [19], [20]. De har også vært forbundet med etiologi og kliniske resultater av CRC [21], [22], [23]. Men selv om grunnleggende studier har avdekket en viktig rolle VEGF-uavhengig pathway gener i etiologi og kliniske resultatet av CRC, ingen studier har blitt rapportert om sammenhengen mellom genetiske varianter av disse genene og CRC prognose. Målet med den nåværende pilotstudien var å evaluere sammenhengen mellom SNPs i flere store VEGF-uavhengig angiogen pathway gener med total overlevelse av CRC-pasienter.
Materialer og metoder
Etikk
Denne studien ble godkjent av institusjonelle gjennomgang styrene i fjerde Military Medical University. En skriftlig informert samtykke med en signatur ble oppnådd for hver pasient.
Pasient befolkning og klinisk datainnsamling
Denne studien ble fokusert på VEGF-uavhengig angiogenese genet SNPs som potensielle prediktorer for CRC prognose. Derfor alle fag som inngår i denne studien hadde histopathologically bekreftet CRC. Opprinnelig ble 496 CRC pasienter rekruttert mellom februar 2006 og april 2010 fra Institutt for generell kirurgi i Xijing Hospital og Tangdu Hospital som er tilknyttet den fjerde Military Medical University i Xi’an, Kina. Det var ingen rekrutterings restriksjoner på alder, kjønn og kreft stadium. Alle CRC pasientene hadde ingen tidligere historie med andre kreftformer, cellegift eller strålebehandling. Alle CRC pasienter ble nylig diagnostisert og histopathologically bekreftet å ha adenokarsinom. Ved anvendelsen av denne studien ble 88 pasienter ekskludert, av følgende grunner: ikke gjennomgå en operasjon eller kun fikk palliativ operasjon (26 pasienter), hadde ufullstendig klinisk informasjon eller manglet oppfølging (48 pasienter), døde innen en måned kirurgi (6 pasienter) og hadde dårlig kvalitet og /eller kvantitet av DNA-prøve (8 pasienter). Til slutt ble 408 kirurgisk resected pasienter med fullstendig klinisk og følge opp data samt høy kvalitet DNA-prøver som inngår i denne studien. Alle pasientene var han-kinesere.
Demografiske og kliniske data
Detaljert demografiske og kliniske opplysninger ble samlet inn gjennom personlig intervju, medisinsk diagram gjennomgang, eller samråd med behandlende leger. De demografiske data samlet inkluderer alder, kjønn, etnisitet, røykestatus, drikking status, og kroppsmasseindeks (BMI). De kliniske data som samles inkluderer diagnosetidspunktet, tidspunktet for kirurgi og /eller kjemoterapi, dødstidspunktet, tumor stadium, differensiering, plassering nettsted, lymfeknute invasivitet, behandling protokollen, og serum CEA (carcinoembryonic antigen). En standard oppfølging ble utført av en utdannet klinisk spesialist gjennom intervju på stedet, direkte kall, eller medisinsk diagram gjennomgang. De siste oppfølgingsdata i denne analysen ble innhentet i februar 2011. For pasienten er registrert etter august 2008, 5-ml blod var tilgjengelig for genomisk DNA ekstraksjon ved hjelp av E.Z.N.A. Blood DNA Midi Kit (Omega Bio-Tek, Norcross, GA). For pasienter som deltok før august 2008 ble genomisk DNA ekstrahert fra ca 100 mg av tilstøtende normalt vev innhentet av en patolog etter operasjonen bruker E.Z.N.A. vev DNA Kit (Omega Bio-Tek).
SNP utvalg og genotyping
Fire store gener i VEGF-uavhengig angiogen veien ble studert, inkludert
AGNPT1
som koder for et Tie2-agonist som stimulerer PI3K-Akt signalveien som en overlevelses signal og stabiliserer blodårer,
DLL4 plakater (Delta-lignende ligand 4), som koder for et protein som blir utskilt fra endotelceller og fremmer angiogenese ved å undertrykke ikke- Funksjonelle spirende av vaskulære endotelceller,
Åmot plakater (Angiomotin) som koder for et angiostatin inhibitor som medierer rør dannelse og migrering av endotelceller mot vekstfaktorer under dannelsen av nye blodkar, og
ENG
(Endoglin) som koder for en komponent av den transformerende vekstfaktor beta-reseptor-komplekset som er involvert i angiogenese, hjerte-utvikling, og vaskulær homeostase. Potensielt funksjonelle SNPs, i funksjonelle regioner, inkludert arrangører, eksoner, og uoversatt regioner (UTR) ble valgt ved hjelp av et sett av web-baserte SNP utvalg verktøy (fritt tilgjengelig på https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpfunc.htm) , ved hvilken man kan velge SNP’er basert på koblingsulikevekt (LD) og forutsagt funksjonelle egenskaper både kodende og ikke-kodende SNP’er. De 5 «og 3» flankerende regioner ble vilkårlig satt til 1000 bp for alle genene. Bare validerte SNPs ble valgt og SNPs med mindre allel frekvens (MAF) 5% i asiatiske befolkningen ble ekskludert. I tilfelle av flere potensielt funksjonelle SNP’er innenfor den samme haplotype blokken (definert av bindingen koeffisienten r
2 0,8), ble det bare en SNP inkludert. Til slutt ble totalt syv SNPs identifisert for de fire genene, inkludert to SNPs i
ANGPT1
(rs1954727 og rs9297395), tre SNPs i
Åmot plakater (rs2286064, rs2286063, rs640009), en SNP i
DLL4 plakater (rs12439845) og en SNP i
ENG plakater (rs7865146). Genotyping ble utført ved hjelp av Sequenom iPLEX genotyping system (Sequenom Inc, California). Laboratoriepersonell som utfører genotyping ble blindet for pasientens informasjon. Gjennomsnittlig takst for genotyping var 99,4%. Streng kvalitetskontroll tiltak ble iverksatt i løpet av genotyping med over 99% samsvar mellom prøvene genotypet i duplikat.
Statistisk analyse
endepunkt vurdert i denne studien var total overlevelse, definert som tiden fra første operasjonen til døden eller siste oppfølging. Hazard ratio (HR) og 95% konfidensintervall (95% KI) ble estimert ved hjelp av en multivariat Cox modellen, justert for alder, kjønn, røykestatus, drikking status, BMI, tumor posisjon, tumor differensiering, tumor stadium, og kjemoterapi der det er hensiktsmessig. Haplotype /diplotype ble bestemt ved anvendelse av HelixTree programvare (gylden Helix, Inc.), og HR ble estimert ved multivariate Cox-modellen, ved hjelp av haplotype /diplotype som inneholder alle villtype-alleler som referanse. Testene for interaksjoner mellom SNPs og DNA kilde ble utført ved å inkludere en cross-produkt ordet i Cox modell. Log-rank test ble benyttet for å vurdere forskjeller i total overlevelse mellom ulike pasientgrupper. SAS statistisk pakke (SAS software versjon 9.2, Cary, NC) ble benyttet for analysen. Alle
P
verdier i denne studien var tosidig.
P
≤0.05 ble ansett terskelen til statistisk signifikans.
Resultater
Pasient Kjennetegn
Det er totalt 408 kirurgisk resected CRC pasienter ble inkludert i denne studere, med en gjennomsnittsalder på 59,4 år (fra 22 til 90 år) og gjennomsnittlig BMI på 22,7 (område, 15,8 til 32,9). Blant pasientene, 56,4% (n = 230) var menn og 46,6% (n = 178) var kvinner. De fleste pasientene var aldri røykere (70,8%) og aldri drikker (89,5%). Prosentandelen av pasienter med kreft i tykktarmen (47,1%) var noe lavere enn rektum kreftpasienter (52,9%). Omtrent 47,1% av pasientene hadde stadium II svulst, mens stadium 0, I, III og IV tumorer var til stede i 2,0%, 14,2%, 27,2% og 9,6% av pasientene, respektivt. Omtrent 66,4% av pasientene hadde moderat differensiert svulster og 78,2% av pasientene ble behandlet med cellegift etter operasjonen. I en median oppfølgingstid på 22,9 måneder, ca 23,0% (n = 94) av pasientene var døde som den siste oppfølging (februar 2011) (tabell 1).
Sammenhengen mellom individuelle SNPs og total overlevelse i CRC pasienter
sammenslutninger av de sju utvalgte SNPs med CRC overlevelse ble analysert ved hjelp av univariate og multivariate analyser justert for alder, kjønn, røykestatus, drikking status, BMI, tumor posisjon, tumor differensiering , tumorstadium, og kjemoterapi. Resultatene er oppsummert i tabell 2. Blant dem, en SNP, rs1954727 lokalisert i 3′-UTR-regionen til
ANGPT1
-genet, var signifikant assosiert med den generelle overlevelse i CRC pasientene i både univariate og multivariate analyser. I multivariat analyse, sammenlignet med homozygot villtypegenotype (WW), ble heterozygot (WV) og homozygot variant genotype (VV) av rs1954727 forbundet med en HR på 0,89 (95% KI 0,55 til 1,43,
P
= 0,623) og 0,32 (95% CI 0,15-0,71,
P
= 0,005), henholdsvis med observert en signifikant dose-respons-effekt (
P
trend = 0,008, Tabell 2 ). Logg rank test indikerte en signifikant forskjell i total overlevelse mellom villtype og homozygot variant genotyper av rs1954727 (log rank
P
= 0,019, figur 1). Resultatene indikerte at rs1954727 var en uavhengig prediktor for CRC overlevelse i vår studiepopulasjonen. I tillegg har vi tilfeldig valgt 50 pasienter inkludert i denne studien med både blod og normalt vev tilgjengelig og genotypet alle de syv SNPs i både blod og vev DNA for disse pasientene. De genotyping Resultatene var 100% konkordant mellom blod og vev DNA-prøver. Videre, for hver av de sju SNPs, gjennomførte vi en test for interaksjon (heterogenitet) mellom SNP og DNA kilde og ikke identifisere noen signifikant interaksjon (
P
for samhandling for total overlevelse varierer fra 0,143 til rs1954727 til 0,651 til rs2286063, data ikke vist). Samlet utgjør disse linjene av bevis indikerte at de ulike DNA-kilder ikke påvirke funnene avdekket i denne studien.
Association of rs1954727 med total overlevelse av CRC pasienter stratifisert etter verts egenskaper
Vi analyserte videre effekten av rs1954727 på total overlevelse i CRC pasienter stratifisert etter demografiske og kliniske kjennetegn. Som vist i tabell S1, ble betydelig bedre total overlevelse gitt av rs1954727 observert hos eldre pasienter (HR = 0,12, 95% KI, 0,03 til 0,60,
P
= 0,010), mannlige pasienter (HR = 0,20, 95% KI 0,05-0,75,
P
= 0,017), som aldri har røykt (HR = 0,28, 95% KI, 0,11 til 0,73,
P
= 0,009), aldri drinkers (HR = 0,35, 95% KI, 0,15 til 0,84,
P
= 0,018), og pasienter med lavere utdanningsnivå (HR = 0,28, 95% KI, 0,08 til 0,94,
P
= 0,040 ), med kjemoterapi (HR = 0,33, 95% KI, 0,14 til 0,79,
P
= 0,012), med tykktarmskreft (HR = 0,09, 95% KI, 0,02 til 0,40,
P
= 0,002), med dårlig og moderat tumor differensiering (HR = 0,32, 95% KI, 0,13 til 0,78,
P
= 0,012), med stadium 3 eller 4 svulster (HR = 0,16, 95% KI, 0,04 til 0,65,
P
= 0,011), og med både lavere eller høyere BMI (HR = 0,20, 95% KI, 0,04 til 0,97,
P
= 0,045, eller HR = 0,32, 95% KI, 0,11 til 0,92,
P
= 0,035, henholdsvis). Den betydelige doseavhengig effekt gitt av rs1954727 var tydelig hos pasienter som var eldre (
P
trend = 0,006), mann (
P
trend = 0,012), aldri røyker (
P
trend = 0,021), aldri drikker (
P
trend = 0,025), og pasienter med høyere BMI (
P
trend = 0,025), med kjemoterapi (
P
trend = 0,012), med svulst plassering av tykktarmskreft (
P
trend = 0,012), med dårlig og moderat tumor differensiering (
P
trend = 0,016), og med avansert tumor stadium av 3-4 (
P
trend = 0,003). Blant de 319 pasientene som fikk kjemoterapi, 308 (96,6%) fikk FOLFOX diett, inkludert folinsyre (FOL), fluorouracil (F) og oksaliplatin (OX). Begrense analysen til de pasientene som fikk FOLFOX ga lignende resultater til de av dagens analyse (data ikke vist).
Modulerende effekter av kjemoterapi på CRC total overlevelse ved rs1954727
Fordi de fleste av CRC pasientene i denne studien ble behandlet med kjemoterapi, vi videre vurdert de modulerende effekt på sammenhengen mellom kjemoterapi og generell pasient overlevelse, stratifisert etter rs1954727. Som vist i tabell 3, pasienter som får kjemoterapi hadde en betydelig bedre total overlevelse med en HR på 0,44 (95% KI, 0,26 til 0,75,
P
= 0,002), sammenlignet med pasienter uten kjemoterapi. Dette betydelig effekt på pasientens overlevelse konferert med kjemoterapi ble kun observert hos pasienter med heterozygot genotype av rs1954727 i stratifisert analyse (HR = 0,45, 95% KI 0,22 til 0,92,
P
= 0,028), men ikke i de bærer homozygot villtype eller variant genotype.
haplotype og diplotype av
ANGPT1
genet og CRC total overlevelse
haplotype og diplotype analyser ble gjennomført for å evaluere den kombinerte effekten av de to SNPs i
ANGPT1
genet på CRC total overlevelse. Som vist i tabell 4, var det fire haplotyper i størrelsesorden rs9297395 og rs1954727 (W_W: 52,5%, W_V: 42,2%, V_W: 4,3%, og V_V: 1,0%) og tre diplotypes (W_W-W_W: 28,8%, W_W-W_V: 44,3%, og W_V-W_V: 19,7%) med en frekvens 1% i studiepopulasjonen. Sammenlignet med den haplotype inneholdende villtype-allelet for de to SNP (W_W), pasienter med haplotype av W_V oppviste en betydelig bedre total overlevelse (HR = 0,59, 95% CI 0,42 til 0,83,
P
= 0,002), som var konsistent med den viktigste effekten analyse av rs1954727 SNP. For diplotype analyse, sammenlignet med den diplotype inneholdende homozygot villtypegenotype både for SNP’er (W_W-W_W), diplotype inneholdende en kopi av W_V haplotype (W_W-W_V) og to kopier av W_V haplotype (W_V-W_V) oppviste en gradvis forbedret total overlevelse med en HR på 0,74 (95% KI 0,44 til 1,24, P = 0,247) og 0,30 (95% KI 0,13 til 0,67,
P
= 0,004), henholdsvis. Vi har også utført haplotype og diplotype analyser for de tre SNPs i
Åmot
genet ble imidlertid ingen signifikante funn observert (data ikke vist).
Diskusjoner
i denne studien, rapporterte vi en signifikant sammenheng av total overlevelse i en kohort av 408 CRC pasienter kirurgisk behandlet med en genetisk variant, rs1954727, i
ANGPT1
, en sentral gen i VEGF-uavhengig angiogen signalisering sti. Videre identifiserte vi en plausibel interaksjon mellom denne SNP og kjemoterapi på moduler CRC pasientens overlevelse.
angiogenesehemmere rettet mot VEGF signalveien, for eksempel bevacizumab, sunitinib og sorafenib, har vist betydelig terapeutisk effekt i ulike kreftformer og blitt godkjent av US Food and Drug Administration i kreftbehandling [24]. Men disse VEGF-rettet mot anti-angiogenese behandling ofte resultere i bare forbigående reaksjoner hos kreftpasienter, først og fremst på grunn av de to modusene for motstand mot angiogenese hemming, adaptive motstand og iboende ikke-respons [13]. Begge moduser av motstand kan tilskrives den iboende heterogenitet av genetisk ustabile tumorceller, tilstedeværelse av overflødige angiogene faktorer, og rekruttering av hematopoetiske celler og inflammatoriske celler inn i tumormassen [13]. Det kan tenkes at terapeutiske tilnærminger samtidig rettet mot flere angiogene faktorer, inflammatoriske baner, og metastase prosesser kan indusere mer klinisk relevant respons [25]. Den ANGPT-TIE sti er en attraktiv mulighet for en slik terapeutisk intervensjon som det er ikke bare avgjørende for angiogenese og vaskulær homeostase i en VEGF-uavhengig måte, men det gir også et viktig bindeledd mellom angiogenese og betennelse trasé [25].
Menneske ANGPT-TIE protein familien består av tre ligander, ANGPT1, ANGPT2 og ANGPT4, samt to reseptorer, TIE1 og Tie2. ANGPT1 er den viktigste mediator av VEGF-uavhengig pro-angiogene signalveien, som aktiverer den nedstrøms PI3K /AKT rute gjennom interaksjon med Tie2-proteinet [26], [27]. ANGPT2 inhiberer ANGPT1 binding til reseptoren Tie2 og hindrer dens aktivisering [28]. Dynamisk balanse og sekvensiell ekspresjon av ANGPTs og VEGF er nødvendig for å opprettholde angiogenese [29], [30]. Den oppregulering av ANGPT1 har blitt undersøkt i mange kreftformer, noe som tyder på at ANGPT1 er sterkt korrelert med tumor malignitet [25]. Imidlertid har flere studier har rapportert en inhiberende effekt av ANGPT1 på den patologiske vaskulær vekst, noe som indikerer at ANGPT1 kan også fungere som en tumor suppressor i flere kreftformer, inkludert CRC [31], [32], [33], [34]. Disse funn var i overensstemmelse med rapporter om flere uavhengige studier som viser at høyere andel av ANGPT2 /ANGTP1 var assosiert med dårlig prognose av flere maligniteter, inkludert CRC [25]. Disse funnene tyder paradoksale virkningene av ANGPT1 på tumoregenskaper og prognose kan være kreftspesifikke og også avhengig av andre angiogenese-relaterte gener.
genetiske variasjoner i ANGPT gener kan føre til endret gen produksjon og resultere i aktivering /inaktivering av genet. SNP’er i
ANGPT1
-genet har blitt assosiert med risiko for sykdommer så som autoimmune sykdommer, idiopatisk juvenil artritt, og portopulmonary hypertensjon [35], [36]. Men til dags dato, har det ikke vært studien rapporterer om en sammenslutning av
ANGPT1
SNPs med risiko og klinisk utfall av kreft. I denne studien har vi identifisert en
ANGPT1
SNP, rs1954727, som kan forutsi total overlevelse av CRC pasienter etter operasjonen. Denne SNP ligger i 3 «UTR av
ANGPT1
genet. Funksjonelle SNPs i denne regionen kan påvirke messenger RNA stabilitet eller mikroRNA bindende. En bioinformatikk søk på PolymiRTS Databasen fant ikke identifisere alle potensielle miRNA bindingssetet i de umiddelbare omgivelsene regionen i denne SNP [37]. Imidlertid kan en ytterligere søk førte til identifisering av fire SNP i 3’UTR av
ANGPT1
gen som befinner seg innenfor antatte miRNA bindende regioner (data ikke vist). Den nærmeste SNP er ca 600 nukleotider fra rs1954727. Funksjonelle karakteristikkene som real-time PCR etterfulgt av luciferase assay vil være nødvendig for å fastslå om rs1954727 har noen direkte fysiologisk påvirkning på messenger RNA uttrykk for
ANGPT1
.
I stratifisert analyse, har vi funnet beskyttende effekt gitt av rs1954727 var mer fremtredende hos pasienter som fikk kjemoterapi (tabell S1). Tidligere studier har rapportert en betydelig økt antitumoraktivitet ved felles bruk av ANGPT1 antistoff og kjemoterapi ved behandling av faste tumorer inkludert CRC [38]. Disse linjene av bevis førte oss til ytterligere evaluere modulerende effekt av kjemoterapi på pasientens overlevelse stratifisert av genotyper av rs1954727. I samsvar med funn som variant genotyper av rs1954727 konferert bedre total overlevelse i kjemoterapi-behandlede pasienter, fant vi det bedre overlevelse gitt av kjemoterapi forble tydelig hos pasienter med heterozygot genotype av rs1954727 (tabell 4). Vi merket oss også at hos pasienter med homozygot variant genotype av rs1954727,
P
verdi var ikke signifikant (p = 0,297), selv om det generelt bedre overlevelse gitt av kjemoterapi var mye mer fremtredende (HR = 0,19). Dette kan være på grunn av en ustabil anslag som følge av det lille antall pasient i denne gruppen (bare en død hos pasienter uten kjemoterapi, tabell 3) .Future studier med større prøvestørrelse er nødvendig for å tilveiebringe tilstrekkelig statistisk strøm til analyse av interaksjoner mellom rs1954727 og kjemoterapi på pasientens overlevelse.
Det er flere sterke sider i denne studien. Pasientene ble inkludert fra Xi’an og tilstøtende område, et område som er svært attraktive for å gjennomføre populasjonsbasert forskning på grunn av den geografiske stabilitet med lav mobilitet rate. Også pasientene analysert i denne studien var svært homogen, ved at alle pasientene hadde adenokarsinom og ble kirurgisk behandlet for å fjerne de primære svulster. I tillegg ble alle kjemoterapi behandlinger startet innen 2 måneder etter kirurgi og nesten 80% av pasientene fikk kjemoterapi. Den svært homogene pasientkarakteristika og behandlinger, samt lav sats av pasientens tap til oppfølging, sterkt redusert konfunderende effekter av heterogene legemiddel modaliteter i mange andre lignende biomarkør studier av CRC prognose. Begrensningene i vår studie omfatter generalizability problemet, fordi vår studie var begrenset til Han-kinesere. Videre evaluering er nødvendig for å avgjøre hvorvidt disse funnene kan generaliseres til andre etniske grupper. Videre moderat utvalgsstørrelsen begrenset gyldigheten av noen stratifiserte analyser med liten utvalgsstørrelse. Vi analyserte studien kraft for hovedeffekten analyse samt kjemoterapi-stratifisert analyse. Under forutsetning av et tilsetningsstoff genetisk modell (anvendt i analyse av denne studien) med monoton virkning, en MAF på 43,5% for rs1954727, det eneste betydelige SNP identifisert i denne studien, 23,0% av Dødeligheten blant den totale studiepopulasjonen, en median tid til døden av 15,2 måneder i avdøde pasienter og en median tid på oppfølging av 23,9 måneder i sensurerte pasienter, har vi ca 82% styrke til å påvise en HR på 0,6 (heterozygot genotype vs. homozygot villtypegenotype) og 0,4 (homozygot variant genotype vs. villtypegenotype). Kraften er litt høyere ved bruk av en trend test. Når analysen er begrenset til de pasienter som får kjemoterapi, er vår kraft omtrent 70% for å påvise de nevnte effektstørrelser. Men vår makt begrenset når analysen er begrenset til de 89 pasientene uten kjemoterapi eller noen andre ikke-signifikante SNPs i denne studien som har en lav MAF, og resultatene av disse under-drevet analyser er utforskende og bør tolkes med forsiktighet . Likevel pågår fortsatt med en lav sats av pasientens tap, noe som vil gjøre oss i stand til å oppnå høyere statistisk styrke for inngående analyser i fremtiden innmelding av denne befolkningen.
I konklusjonen, våre funn tyder på at en genetisk polymorfisme i
ANGPT1
genet er assosiert med en signifikant bedre total overlevelse i CRC-pasienter etter kirurgi. Fremtidige studier med større populasjoner for å validere dette funnet.
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1.
Association of rs1954727 i ANGPT1with total overlevelse i CRC pasienter stratifisert ved verts egenskaper.
doi: 10,1371 /journal.pone.0034758.s001 plakater (DOC)
Takk
Vi takker Dr. Marie Dennis og frøken Heidi Swan (Division of Population Science, Avdeling for medisinsk onkologi, Thomas Jefferson University) for den vitenskapelige redigering.
