PLoS ONE: Korrelasjon av Chitinase 3-Like en enkeltnukleotidpolymorfi og haplotyper med livmorhalskreft in taiwanske Women

Abstract

Bakgrunn

Denne studien hadde som mål å undersøke relasjonene av

kitinase tre-lignende en

(

CHI3L1

) enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) og haplotyper med utvikling av livmorhalskreft i taiwanske kvinner. De SNPs frekvenser og haplotyper ble også korrelert med clinicopathologic variabler av livmorhalskreft, kreft tilbakefall, og pasienten overlevelse.

Metodikk og hovedfunnene

Ninety-ni pasienter med invasiv kreft og 61 med pre -cancerous lesjoner i livmorhalsen ble sammenlignet med 310 friske kontrollpersoner. Tre SNPs rs6691378 (-1371, G /A), rs10399805 (-247, G /A) og rs4950928 (-131, C /G) i promoter-regionen, og en SNP rs880633 (+2950, ​​T /C) i ekson 5, ble analysert ved hjelp av sanntids polymerase kjedereaksjon og genotyping. Resultatene viste at det muterte homozygot genotype AA av

CHI3L1

SNP rs6691378 og AA av rs10399805, og haplotyper AACC og AACT økt risiko for å utvikle forstadier til kreft og invasiv kreft. Pasientene med disse risiko haplotyper hadde høyere enn stadium I svulster, større svulster, og vaginal invasjon. I logistisk regresjonsmodell, de også en tendens til å ha dårlig overlevelse event [

p

= 0,078; odds ratio (OR): 2,99, 95% konfidensintervall (CI): 0,89 til 10,08] og en høyere sannsynlighet for gjentakelse hendelse (

p

= 0,081, OR: 3,07, 95% KI: 0,87 til 10,81) . Det var en signifikant sammenheng mellom

CHI3L1

risiko haplotyper og sannsynlighet for tilbakefall (

p

= 0,002; hazard ratio: 6,21, 95% KI: 1,90 til 20,41), og en marginal sammenheng mellom risiko haplotyper og total overlevelse (

p

= 0,051; hazard ratio: 3,76, 95% KI: 0,99 til 14,29). hos pasienter med SCC, ved hjelp av Cox proporsjonal risikomodell

Konklusjon

CHI3L1

SNPs rs6691378 og rs10399805 og

CHI3L1

haplotyper alle korrelert med utviklingen av livmorhals forstadier til kreft og invasiv kreft. De livmorhalskreftpasienter med

CHI3L1

haplotyper AACC eller AACT hadde dårlig clinicopathologic egenskaper og fattige tilbakefall og overlevelse hendelser. Disse risiko haplotyper var assosiert med høyere tilbakefall, spesielt hos pasienter med SCC

Citation:. Lin Y-S, Liu Y-F, Chou Y-E, Yang S-F, Chien M-H, Wu C-H, et al. (2014) Korrelasjonen av

Chitinase 3-Like 1

enkeltnukleotidpolymorfi og haplotyper med livmorhalskreft in taiwanske kvinner. PLoS ONE ni (9): e104038. doi: 10,1371 /journal.pone.0104038

Redaktør: Xuefeng Liu, Georgetown University, USA

mottatt: 5 mars 2014; Godkjent: 04.07.2014; Publisert: 09.09.2014

Copyright: © 2014 Lin et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Data Tilgjengelighet:. Den forfatterne bekrefter at alle data som underbygger funnene er fullt tilgjengelig uten restriksjoner. Alle data er inkludert i papir

Finansiering:. Denne studien ble støttet av forskningsmidler fra Chung Shan Medical University Hospital (CSH-2013-D-001, CSH-2014-D-003), Taiwan nasjonal Science Council (NSC 102-2314-B-040-014-My3) og Chung Shan Medical University Hospital og Chi-Mei Foundation Medical Center (CSMU-CMMC-102-02). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer

introduksjon til

Chitinase3-like1 (CHI3L1) er et glykoprotein kodet av

kitinase tre-lignende en product: (

CHI3L1

) genet ligger på menneskelig kromosom 1q32.1 [1] . Dette glykoprotein blir ofte referert til som YKL-40 eller human brusk glykoprotein-39 (HC gp-39) og er kjent for å være en pro-inflammatorisk cytokin fra kitinase [2], [3]. Det er et utskilt protein med en molekylvekt på 40 kD og er identifisert ved N-terminal sekvensering å være tyrosin (forkortet til Y), lysin (K), og leucin (L) [4]. Det er anerkjent som en vekstfaktor for connective celler og migrasjon fremmende faktor for endotelceller, og er produsert av en rekke celler, inkludert kreftceller, aktiverte makrofager og nøytrofile. Det er også kjent å spille en rolle i inflammasjon, celleformering, anti-apoptose, stimulering av angiogenese, og regulering av ekstracellulær vevsremodelleringen [2], [5] -. [7]

Kjaergaard et al. brukt en populasjonsbasert prospektiv studie av den danske befolkningen å undersøke genetiske varianter av

CHI3L1 Hotell som påvirker YKL-40 nivåer, og fant at åtte enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i

CHI3L1

genet er assosiert med plasma YKL-40 nivåer i den generelle befolkningen [8]. Disse

CHI3L1

SNPs inkludert rs10399805 (-247, G /A) og rs4950928 (-131, C /G) i promoter-regionen, og rs880633 (2950, ​​T /C) i ekson 5 etc. Imidlertid , Thomsen et al., også ved hjelp av den danske befolkningen i de internasjonale MONICA (overvåking trender og determinanter for kardiovaskulær sykdom) prosjektet, viste at 12SNPs var assosiert med serum YKL-40 nivåer [9]. Disse

CHI3L1

SNPs inkludert rs6691378 (-1371, G /A), rs4950928 og rs880633 etc.

livmorhalskreft er den femte vanligste typen kreft blant kvinner i Taiwan, med en age-standardisert insidensraten i 2009 på 11,86 per 100 000 kvinner i henhold til Health Promotion Administrasjon av departementet for helse og velferd. Sin alder-standardisert dødelighet var 3,72 per 100.000 kvinner i 2011, og er den syvende øverste årsaken til kreftdød i taiwanske kvinner.

enkeltnukleotidpolymorfi kan påvirke promoter aktivitet, genekspresjon, messenger RNA konformasjon (stabilitet) , og sub-cellulære lokalisering av mRNA og /eller proteiner, og sannsynligvis forårsake sykdommer [10]. Flere nyere studier har vist at genetiske varianter av

CHI3L1

SNPs ha en innvirkning på inter-individuelle serum YKL-40 nivåer samt følsomhet til atopi, sarkoidose, astma og lungefunksjonen [11] – [14] . Før behandling serumnivåer av YKL-40 er også blitt rapportert å være høyere hos livmorhalskreft [15]. Til dags dato har ingen studier korrelert

CHI3L1

SNPs med livmorhalskreft i taiwanske kvinner. Under hypotesen om at genet polymorfismer eller haplotyper av

CHI3L1

genet har en innvirkning på YKL-40 uttrykk i livmorhalskreft, denne studien undersøkte fordeling av

CHI3L1

genet polymorfismer og haplotyper blant pasienter med livmorhalskreft og forstadier til kreft og normale kontroller til å definere sine roller i livmorhalskreftutvikling i taiwanske kvinner. SNP frekvenser eller haplotyper av

CHI3L1

ble videre forbundet med clinicopathologic variabler av livmorhalskreft, kreft tilbakefall, og pasientens overlevelse. Denne studien viste signifikant sammenheng med

CHI3L1

SNPs og haplotyper med utvikling av forstadier til kreft og invasiv kreft i livmorhalsen, og avslørte at

CHI3L1

haplotyper var knyttet til prognosen for livmorhals kreftpasienter.

Materialer og metoder

Befolkning

Fire hundre og sytti kvinner, inkludert 99 pasienter med invasiv kreft, 61 pasienter med forstadier til kreft i livmorhalsen, og 310 normale kontroller, ble rekruttert fortløpende inn i denne studien. Pasientene med invasiv livmorhalskreft ble klinisk iscenesatt basert på 2009 International Federation of gynekologi og fødselshjelp Klassifisering og fikk rutinemessig behandling protokoller ved Institutt for obstetrikk og gynekologi i Chung Shan Medical University Hospital, Taiwan, fra mars 1999 til oktober 2012. Pasientene med forstadier til kreft, som bare består cervical høygradig dysplasi (høyverdig plateepitel intraepitelial lesjoner) i denne studien og inkludert moderat og alvorlig dysplasi samt carcinoma in situ, gjennomgikk kolposkopi-rettet cervical punsj biopsi, stor sløyfe eksisjon av transformasjon sonen, total abdominal hysterektomi, eller total vaginal hysterektomi. De 310 kontroller med normale Papanicolaou flekker ble ytterligere bekreftet ved hjelp kolposkopi under generelle eksamen ved poliklinisk avdeling ved vårt sykehus. Alderen på kvinner med livmorhals invasiv kreft, forstadier til kreft, og normale kontroller var 53,6 ± 12,0, 42,7 ± 12,7 og 44,7 ± 9,8 (gjennomsnitt ± SD) år, henholdsvis. Alle av dem var taiwanske kvinner som bodde i sentrale Taiwan. Chung Shan Medical University Hospital Institutional Review Board godkjent denne studien (CSMUH IRB: CS12218, CS12219, CS14014), og informert skriftlig samtykke er innhentet fra den enkelte

Valg av

kitinase tre-lignende en

genet polymorfismer

Tre SNPs rs6691378 (-1371, G /A), rs10399805 (-247, G /A), og rs4950928 (-131, C /G) i promotorområdet og ett SNP rs880633 (2950, ​​T /C) i ekson 5 ble valgt basert på den kinesiske HapMap (Han-kinesere i Beijing, Kina) data og studier av Thomsen et al. og Kjaergaard et al. [12], [16]. De mindre allelfrekvenser (MAFs) av disse SNPs var ≥5%.

Blood prøvetaking og genomisk DNA ekstraksjon

I alt ble 160 blodprøver innsamlet fra pasienter med livmorhals invasiv kreft og de med forstadier til kreft, og 310 blodprøver ble erholdt fra kontrollene. Genomisk DNA ble ekstrahert fra EDTA anti-koagulert venøs blod ved hjelp av en QIAamp DNA blod mini kit (Qiagen, Valencia, CA, USA) basert på produsentens protokoll. DNA ble løst opp i Tris-etylen-buffer (10 mmol /liter Tris og 1 mmol /l EDTA, pH 7,8) og deretter kvantifiseres ved måling av OD260. Den endelige forberedelser ble lagret ved -20 ° C og brukes som maler i polymerase chain reaction (PCR).

enkeltnukleotidpolymorfi av sanntids-PCR og genotyping

Allelic diskriminering av rs6691378 ( -1371, G /A), rs10399805 (-247, G /A), rs4950928 (-131, C /G), og rs880633 (2950, ​​T /C) polymorfismer ble vurdert ved hjelp av en ABI StepOne real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA), og analysert ved SDS versjon 3.0 programvare (Applied Biosystems) ved hjelp av TaqMan analysen. Den 10 mL endelig volum for hver reaksjon inneholdt 5 mL TaqMan Genotyping Master Mix, 0,25 mL TaqMan probe mix, og 10 ng genomisk DNA. Sanntids-PCR inkludert et innledende denatureringstrinn ved 95 ° C i 10 minutter, etterfulgt av 40 sykluser på 95 ° C i 15 sekunder, og deretter 60 ° C i ett minutt.

Statistisk analyse

variansanalyse (ANOVA) ble brukt til å analysere aldersfordelingen av studiepopulasjonen og kontrollpersoner. Scheffe test ble brukt for post hoc-analyse.

Hardy-Weinberg likevekt ble brukt til å analysere genotypen distribusjoner av rs6691378, rs10399805, rs4950928, og rs880633 i normale kontroller (grad av frihet = 2). Chi-kvadrat eller Fisher nøyaktige tester ble brukt for å undersøke forholdet mellom frekvensene av

CHI3L1

genet SNPs, alleler og haplotyper, og forekomsten av livmorhals neoplasi (inkludert invasiv kreft og forstadier til kreft), samt som ulike clinicopathologic parametere, inkludert klinisk stadium (i eller ≥II), histopatologiske typer som plateepitelkarsinom (SCC) eller adenokarsinom, celle gradering (vel, eller moderate og dårlig differensiering), invasjon dybde av livmorhals stroma (≤10 mm eller 10 mm av stromal invasjon dybde), tumor diameter (≤4 eller . 4 cm), parametrium og vaginal invasjon, og bekken lymfeknutemetastase funnet under operasjonen

logis~~POS=TRUNC regresjonsmodell eller multippel logistisk regresjon var brukes til å analysere flere sammenligninger av SNP genotyper av

CHI3L1

genet polymorfismer før og etter kontroll for alder mellom pasienter med cervical neoplasi og kontrollene, eller blant pasienter med invasiv kreft eller forstadier til kreft og kontrollene. Ingen aldersfordelingen ble justert for allel sammenligninger (allelet antall hvert allel i hver undergruppe tilsvarte to ganger av antall homozygot genotyper pluss én-fold av antallet heterozygote genotyper, derfor ikke kunne analysere aldersfordeling blant fagene undergrupper, for eksempel antallet G- alleler = 2 * antall GG alleler + 1 * antall GA alleler) eller haplotype fordeling (vilkårlig omklassifisering). Utvalgsstørrelsen ble estimert med strøm (1-β), 0,8 og α, 0,05, og kreftene ble beregnet ved sammenligninger mellom undergruppene nådd statistiske betydninger (

p

0,05) med en tilstrekkelig utvalgsstørrelse bruker WinPepi programvare, versjon 10.0.

En logistisk regresjonsmodell ble også brukt til å relatere de ulike clinicopathologic parametere og

CHI3L1

polymorfismer med kreft tilbakefall hendelse eller pasientens overlevelse hendelsen. En Cox proporsjonal risikomodell ble brukt for å evaluere effektene av

CHI3L1

haplotyper på sannsynligheten for tilbakefall eller total overlevelse etter justering for ulike clinicopathologic parametere i multivariat analyse i forhold til tilbakefall eller overlevelse. Når oppfølgingsperioden ble inkludert i overlevelse eller tilbakefall analyse, ble pasienter inkludert for total overlevelse analyse inkludert 5-års overlevelse eller sannsynligheten for tilbakefall mellom primær kirurgi og død eller tilbakefall eller slutten av studien (oktober 2013) ved hjelp av Kaplan-Meier-modellen og multivariate og univariate Cox regresjonsmodeller. En vesentlig forskjell er satt til

p

0,05. Statistiske analyser inkludert odds ratio (OR) og justert odds ratio (AOR, kontrollerer for alder) og deres 95% konfidensintervall (KI) ble beregnet av SPSS, versjon 12.0 og WinPepi Software, versjon 10.0

Resultater.

alders~~POS=TRUNC fordelingen~~POS=HEADCOMP av forsøkspersonene var signifikant forskjellig mellom pasienter med livmorhalskreft og de med forstadier til kreft (53,6 ± 12,0 vs. 42,7 ± 12,7 år,

p

0,001 ) og mellom de med livmorhalskreft og kontrollene (53,6 ± 12,0 vs. 44,7 ± 9,8 år,

p

0,001), men ikke mellom de med forstadier til kreft og kontrollene (42,7 ± 12,7 vs . 44,7 ± 9,8 år,

p

= 0,407). Genotypen distribusjoner av rs6691378, rs10399805, rs4950928, og rs880633 møtte Hardy-Weinberg likevekt, som ble brukt til de vanlige kontrollene.

Association of

kitinase tre-lignende 1

genet polymorfismer med livmorhals neoplasi

det var signifikante forskjeller i fordelingene av SNPs rs6691378 og rs10399805 av

CHI3L1

gen mellom kvinner med livmorhals neoplasi og normale kontroller (

p

0,001 og

p

0,001, henholdsvis) (tabell 1). Men ingen slike forskjeller ble observert i rs4950928 og rs880633. Mutant homozygot genotype AA av SNP rs6691378 ble ulikt fordelt mellom kvinner med livmorhals neoplasi og kontrollene i forhold til vill homozygot genotype GG og heterozygot genotype GA (

p

0,001). Videre kontrollerer for alder, kvinner med mutasjonen homozygot AA gjennomført en høyere risiko for å utvikle livmorhals neoplasi sammenlignet med dem med vill genotype GG (AOR: 3,53, 95% KI: 1,71 til 7,35) eller GG /GA (AOR: 3,40, 95% KI: 1,69 til 6,85) (tabell 1). Mutant homozygot genotype AA av SNP rs10399805 ble også ulikt fordelt mellom de med livmorhals neoplasi og kontrollene i forhold til vill GG og heterozygot GA (

p

0,001). Etter kontroll for alder, kvinner med mutasjonen homozygot AA hadde en høyere risiko for å utvikle livmorhals neoplasi sammenlignet med dem med vill genotype GG (AOR: 3,68, 95% KI: 1,71 til 7,87) eller GG /GA (AOR: 3,60, 95% KI:. 1,82 til 7,52)

Når livmorhals neoplasi gruppen ble videre inndelt i undergrupper av invasiv kreft og forstadier til kreft, signifikante forskjeller eksisterte i fordelinger av SNP rs6691378 og rs10399805 av

CHI3L1

gen blant kvinner med livmorhals invasiv kreft og forstadier til kreft og normale kvinner (

p

= 0,002 og

p

= 0,003, henholdsvis; table2). Men ingen slike forskjeller ble observert i rs4950928 og rs880633. Mutant homozygote genotyper av både SNPs utstilt forskjellige distribusjoner blant pasienter med livmorhals invasiv kreft og forstadier til kreft, og kontrollene i forhold til de ville homozygote og heterozygote genotyper (

p

0,001 og

p

0,001, respektivt; tabell 2). Etter justering for alder, mutant homozygot AA både SNPs rs6691378 og rs10399805 ikke bare økt risiko for å utvikle invasiv livmorhalskreft (AOR: 2,37, 95% KI: 1,04 til 5,38 og AOR: 2,82, 95% KI: 1,20 til 6,58, henholdsvis), men også forstadier til kreft (AOR: 5,26, 95% KI: 2,22 til 12,50 og AOR: 4,83, 95% KI: 1,90 til 12,35, henholdsvis) i forhold til GG /GA (tabell 2)

Analyse av allelfrekvenser av

kitinase tre-lignende en

polymorfismer i studiekohorten

analysere allelfrekvensene av de fire

CHI3L1

genet polymorfismer i 470 prøvene samles inn, allelfrekvensene i

CHI3L1

SNPs rs6691378 og rs10399805 polymorfismer ble ulikt fordelt blant kvinner med livmorhals invasiv kreft, de med forstadier til kreft, og de vanlige fagene (

p

= 0,008 og

p

= 0,012, henholdsvis) (tabell 3). Det var ingen slike forskjeller i SNPs rs4950928 og rs880633. De mutante alleler A og A i SNPs rs6691378 og rs10399805 økt og tendens til å øke risikoen for å utvikle livmorhals forstadier til kreft (OR: 1,66, 95% KI: 1,11 til 2,49 og OR: 1,48, 95% KI: 0,98 til 2,25, respektivt; tabell 3). De økte også risikoen for å utvikle invasiv livmorhalskreft (OR: 1,51, 95% KI: 01.08 til 02.12 og OR: 1,60, 95% KI: 01.14 til 02.25, henholdsvis tabell 3)

. haplotyper av

kitinase tre-aktig 1

SNPs basert på taiwanske kvinner og deres engasjement i livmorhalskreft

basert på plasseringen av de analyserte varianter (rs6691378, rs10399805, rs4950928 og rs880663), den

CHI3L1

genet, plassering av genotypede varianter, og deres parvis koblingsulikevekt mønstre ble plottet (figur 1). Fordi mutant homozygot AA og AA i

CHI3L1

SNPs rs6691378 og rs10399805 økt risiko for å utvikle livmorhals forstadier til kreft eller invasiv kreft, haplotyper inneholder dem (AACC og AACT) ble ansett som en risiko undergruppe, mens andre haplotyper (dvs. GGCC, GGCT, GGGC, GGGT, GACC, GACT, AGCC, og AGCT) ble betraktet som en kontroll undergruppe. Personer med haplotyper AACC og AACT hadde en økt risiko for å utvikle livmorhals neoplasi (

p

= 0,002). Når livmorhals neoplasi gruppen ble videre inndelt i undergrupper av invasiv kreft og forstadier til kreft, signifikante forskjeller eksisterte i fordelinger av

CHI3L1

haplotyper blant kvinner med livmorhals invasiv kreft og forstadier til kreft og kontrollene (

p

= 0,01). Kvinnene med AACC eller AACT haplotyper hadde en høyere risiko for å utvikle invasiv livmorhalskreft (OR: 1,60, 95% CI: 01.13 til 02.26, tabell 4).

(A) Skjematisk fremstilling av

CHI3L1 product: (genet ID: 1116) viser plasseringen av de analyserte varianter (rs6691378, rs10399805, rs4950928, og rs880663). Den svarte og hvite bokser indikerer un-oversatte og kodende områder, henholdsvis. Exonet antall merkede under eksonene og variant steder begynner med translasjonsstartsetet. (B) Den ene observerte haploblock at den parvise LD måles er D’merket og farget i gråtoner ved hjelp av befolkningsdata fra Han-kinesere i Beijing, Kina (CHB) i HapMap 3.

Association of

kitinase tre-aktig 1

genet polymorfismer og haplotyper med clinicopathologic variabler av livmorhalskreft, kreft tilbakefall, og pasienten overlevelse

Det var ingen sammenheng mellom

CHI3L1

gen polymorfismer og clinicopathologic variabler av livmorhalskreft, kreft tilbakefall, og pasientens overlevelse. Når

CHI3L1

haplotyper ble inkludert i analysen, ble de knyttet til klinisk stadium (

p

= 0,040, OR: 2,31, 95% KI: 0,95 til 5,72; ≥ stadium II vs . stadium I, tabell 5), tumor diameter (

p

= 0,054, OR: 2,19, 95% KI: 0,90 til 5,43; 4 cm vs. ≤4 cm) og vaginal invasjon (

p

= 0,024, OR: 2,66, 95% KI: 0,98 til 6,83; invasjon vs. ingen invasjon). Videre ble signifikante assosiasjoner enda tydeligere mellom

CHI3L1

risiko haplotyper og klinisk stadium (

p

= 0,009, OR: 3,29, 95% KI: 1,18 til 9,63; ≥ stadium II vs. stadium I, tabell 5), tumor diameter (

p

= 0,029, OR: 2,75, 95% KI: 0,99 til 8,04; 4 cm vs. ≤4 cm), og vaginal invasjon (

p

= 0,004, OR: 4,10, 95% KI: 1,40 til 11,62; invasjon vs. ingen invasjon) i SCC prøver, men ikke i adenokarsinom vev

livmorhals~~POS=TRUNC med

CHI3L1

risiko haplotyper tendens til å ha dårlig overlevelse hendelse (logistisk modell;

p

= 0,078, OR: 2,99, 95% KI: 0,89 til 10,08, tabell 6). Men celle gradering 2/3 (

p

= 0,049, OR: 5,47, 95% KI: 1,01 til 29,78) og positiv bekken lymfeknutemetastase (

p

= 0,002, OR: 5,58 , 95% KI: 1,92 til 12,63) var uavhengige prediktive faktorer for pasientens overlevelse hendelsen. De fem-års overlevelse var 66,1% for pasienter med

CHI3L1

risiko haplotyper, og dette økte til 88,1% for de med andre haplotyper. Men det kunne ikke komme til en statistisk signifikant (

p

= 0,21, OR: 1,68, 95% KI: 0,73 til 3,85; Tabell 7). Videre

CHI3L1

haplotyper hadde også en tendens til å være relatert til en høyere sannsynlighet for gjentakelse hendelse (

p

= 0,081, OR: 3,07, 95% KI: 0,87 til 10,81, tabell 6) . Cell gradering 2/3 (

p

= 0,015, OR: 8,73, 95% KI: 1,52 til 50,29) og positiv bekken lymfeknutemetastase (

p

= 0,001; OR: 6,52, 95 % KI: 2,25 til 18,93) var uavhengige prediktive faktorer for kreft tilbakefall hendelsen. I livmorhalskreftpasienter med SCC,

CHI3L1

risiko haplotyper økt risiko for tilbakefall hendelse (

p

= 0,011, OR: 7,50, 95% KI: 1,60 til 35,16) og tendens til å øke risikoen for dårlig overlevelse hendelse (

p

= 0,051, OR: 4,36, 95% KI: 0,99 til 19,14), i logistisk regresjonsmodell. Deep invasjon dybde og ≥stage II også økt risiko for tilbakefall hendelse (

p

= 0,04, OR: 4,61, 95% KI: 1,08 til 19,74 og

p

= 0,047, OR: 6,17 , 95% KI: 1,03 til 37,04, henholdsvis). Positiv bekken lymfeknutemetastaser økt risiko for tilbakefall hendelse (

p

= 0,012, OR: 4,49, 95% KI: 1,40 til 14,46) og tendens til å øke risikoen for dårlig overlevelse hendelse (

p

= 0,058, OR:. 3,10, 95% KI: 0,96 til 10,00)

Bare celle gradering ble funnet å være en uavhengig prediktor for total overlevelse i multivariat analyse (

p

= 0,037, hazard ratio: 5,59, 95% KI: 1,11 til 28,57; Tabell 7). Men

CHI3L1

risiko haplotyper, dybde av stromal invasjon, cellesortering og bekken lymfeknutemetastase var uavhengige prediktive faktorer for sannsynligheten for tilbakefall (tabell 8). I multivariat analyse for sannsynligheten for tilbakefall og total overlevelse av pasienter med SCC,

CHI3L1

risiko haplotyper viste en signifikant sammenheng med sannsynligheten for tilbakefall (

p

= 0,002; hazard ratio: 6,21 , 95% KI: 1,90 til 20,41) og en marginal sammenheng med total overlevelse (

p

= 0,051; hazard ratio: 3,76, 95% KI: 0,99 til 14,29) blant clinicopathologic parametere og

CHI3L1

haplotyper, ved hjelp av Cox-modell (tabell 8). Men disse funnene ble ikke påvist hos pasienter med adenokarsinom.

Diskusjoner

Så langt vi kjenner til, er den første som viser en signifikant sammenheng mellom

CHI3L1

genet polymorfismer og mottakelighet for livmorhalskreft. Både mutant homozygot genotype AA og AA i promotorområdene -1371 og -247 av

CHI3L1

SNPs rs6691378 og rs10399805 ikke bare økt mottakelighet for forstadier til kreft, men også invasiv kreft i livmorhalsen, selv etter kontroll for alder. Ingen slike forskjeller ble observert i rs4950928 (-131, promoter region) og rs880633 (2950, ​​ekson 5). Flere studier på

CHI3L1

SNPs har dokumentert at den genetiske varianter av

CHI3L1

påvirke sirkulerende YKL-40 nivåer, både hos friske voksne og pasienter med sykdommer [17] – [20]. Kajergarred et al. og Thomsen et al. demonstrerte de regulatoriske virkningene av en del promoter SNPs, inkludert rs6691378, rs10399805, og rs4950928, på plasma YKL-40 nivåer i den danske befolkningen [21], [22]. Den mindre allel av rs10399805 har blitt rapportert å forbedre bindingen av CCAAT enhancer-bindende protein (C /EBFα) til genpromoteren og øke

CHI3L1

transkripsjon, og følgelig øker plasma YKL-40 nivåer [23], [ ,,,0],24]. I motsetning til dette, Zheng et al. viste ingen signifikant sammenheng mellom SNP rs10399805 og YKL-40 nivåer i en kinesisk befolkning [17]. Ulike studiepopulasjoner kan påvirke resultatet. Verlaan et al. avslørte at rs10399805 og rs4950928 modulere

CHI3L1

transkripsjon og promoter polymorfismer i

CHI3L1 Hotell og er assosiert med astma [25]. De fleste av mottakelighet gener for vanlige sykdommer ikke spiller en viktig rolle i disponerer for sykdommen, men fungere som responsmodifiser til interne eller eksterne miljøfaktorer [26], [27].

YKL-40 protein kodes av

CHI3L1

og SNPs i

CHI3L1

arrangøren har vært assosiert med forhøyet serum YKL-40 nivåer [20], [28], og differensial genuttrykk [28] og transkripsjonsnivåer [29]. YKL-40 er blitt rapportert å initiere mitogen-aktivert proteinkinase (MAPK) og phosphoinoside-3-kinase (PI3K) signalveier, noe som fører til økt celleformering i bindevev celler [30]. Den murine homolog av YKL-40 er et bryst regresjon protein på 39 kDa (BRP-39) som har blitt beskrevet å bli uttrykt i cancerceller, og YKL-40 /BRP-39 er blitt vist å spille en rolle i celleproliferasjon, overlevelse, og vev remodellering [30] – [32]. Serum YKL-40 kan bli utskilt fra fullt aktiverte makrofager som er knyttet til tumor og kan fremstilles ved tumorceller i seg selv eller ved hjelp av ikke-maligne celler så som aktiverte neutrofiler og fibroblaster, kondrocytter og synovialceller [32] – [34]. Tumorceller har blitt rapportert til å uttrykke og produsere YKL-40 i bryst- og tykktarmskreft [35], mens tumorassosierte makrofager, men ikke tumorceller, er blitt rapportert å utskille YKL-40 i lungekreft [36]. Mitsuhashi et al. fant at før behandling serumnivåer av YKL-40 er forhøyet i livmorhalskreft, selv i de tidlige stadiene [15]. Fordi

CHI3L1

SNPs påvirke YKL-40 uttrykk, kan de senere påvirke utviklingen av sykdommer som livmorhalskreft.

MAFs i rs6691378, rs10399805, og rs4950928 av

CHI3L1

arrangører i det taiwanske kvinner i studien (27,4%, 25,5% og 18,1%, henholdsvis) er lik de rapportert i Han-kinesere i Beijing, henholdsvis Kina (HCB, 25,6%, 25,6% og 17,1%, ), som er basert på Nasjonalt Senter for Bioteknologi Information (NCBI) SNP database (dbSNP). Den MAF i rs880633 (33,9%) i ekson 5 av

CHI3L1

genet er også lik som i HCB (35,6%), som også er basert på dbSNP. Videre mutant allel A i SNP rs6691378 økt risiko for å utvikle livmorhals forstadier til kreft og invasiv kreft. Selv om mutant allel A i SNP rs10399805 også økt mottakelighet for livmorhalskreft, dens effekt på utvikling av forstadier til kreft var ikke så sterk som for A i SNP rs6691378. For å bruke haplotyper, ble parvise koblingsulikevekt mønstre etablert for disse SNPs, og resultatene viste at rs6691378 har et sterkt koblingsulikevekt med rs10399805 (D «= 0,94). Mutant homozygot AA samt AA i

CHI3L1

SNPs rs6691378 og rs10399805 var assosiert med livmorhalskreftutvikling. Dermed

CHI3L1

haplotyper kan brukes for videre sammenheng med utviklingen og clinicopathologic variabler av livmorhalskreft og pasient prognose.

Ikke bare allelet distribusjon av

CHI3L1

SNPs men også

CHI3L1

risiko haplotyper, AACC og AACT, korrelert med mottakelighet for livmorhals forstadier til kreft og invasiv kreft i denne studien. Det er få eksisterende studier som har rapportert relasjoner til

CHI3L1

haplotyper med sykdommer. Zhao et al. viste signifikante assosiasjoner av tre SNPs i promoter-regionen i

CHI3L1

genet (rs6691378, -1371, rs10399805, -247 og rs4950928, -131) med schizofreni [28]. De videre konstruert disse tre SNPs som

CHI3L1

haplotyper og funnet at

CHI3L1

haplotyper innblandet i schizofreni mottakelighet var assosiert med endrede uttrykket nivåer av genet. Genetiske variasjoner som endrer uttrykk for

CHI3L1

kan påvirke noen viktige prosesser som er

CHI3L1

-dosage avhengig. Den ene er den AKT-mediert signalveien gjennom PI3K-avhengig fosforylering [30]. Denne AKT veien har vært assosiert med celleoverlevelse [37], [38], og kan regulere cytokin-induserte cellulære responser [39]. Ikke desto mindre, Zheng et al. kunne ikke påvise noen sammenheng mellom

CHI3L1

vanlige haplotyper og koronarsykdom eller alvorlighetsgrad [17].

Mitsuhashi et al. viste at serum YKL-40 nivå er det beste biomarkør for livmorhalskreft i forhold til SCC-antigener, CA-125, CA19-9, og C-reaktivt protein [15]. Forbehandling YKL-40 nivåer var signifikant korrelert med FIGO stadium og med tilbakefall eller vedvarende sykdomsstatus, mens korrelasjoner med lymfeknutestatus og tumorstørrelse var marginale i cervical adenokarsinom. Cox regresjonsanalyse viste at en forhøyet YKL-40 nivå er forbundet med tilbakefall eller vedvarende sykdom i livmorhalsen adenokarsinom [15]. YKL-40 har blitt foreslått å spille en rolle i celledeling, differensiering, og for å beskytte celler fra apoptotiske signaler og handle på ekstracellulære vevsremodelleringen [30], [40]. Rapportert som en stimulator av angiogenese i tumorer, er YKL-40 hevdet å være involvert i kreft-metastase [41], [42]. Denne studien postulerer at

CHI3L1

SNPs eller haplotyper påvirke uttrykket av YKL-40. Analysere forholdet mellom

CHI3L1

SNPs eller haplotyper, clinicopathologic variabler, kreft tilbakefall og pasientens overlevelse, kunne vi ikke påvise noen signifikant sammenheng mellom

CHI3L1

SNPs og disse egenskapene.

Legg att eit svar