Abstract
Proteinfosfatase 2A-(PP2A) er en av de viktigste cellulære serin-treonin-fosfataser og fungerer som en tumor suppressor som negativt regulerer aktiviteten til noen onkogene kinaser. Nyere studier har rapportert at PP2A uttrykk ble undertrykt under lunge kreftutvikling, vi er det antatt at disse enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i PP2A subenhetgenene kan påvirke PP2A funksjon og dermed bidra til lungekreft mottakelighet. I en to-trinns case-control studie med totalt 1559 lungekreftpasienter og 1679 kontroller, genotypet vi åtte antatte funksjonelle SNPs og en identifisert funksjonelle SNP (dvs. rs11453459) i sju store PP2A underenheter (dvs.
PPP2R1A
,
PPP2R1B
,
PPP2CA
,
PPP2R2A
,
PPP2R2B
,
PPP2R5C
,
PPP2R5E
) i sørlige og østlige kinesisk. Vi fant ut at rs11453459G (-G /GG) variant genotyper av
PPP2R1A
og rs1255722AA variant genotype av
PPP2R5E
overdro økt risiko for lungekreft (rs11453459, -G /GG vs. -: OR = 1,31, 95% CI = 1.13-1.51, rs1255722, AA vs AG /GG: OR = 1,27, 95% CI = 1.07-1.51). Etter kombinert de to variantene, ble antall uønskede genotyper positivt assosiert med lungekreft i et dose-respons måte (
P
trend = 5,63 × 10
-6). Videre funksjonell analyse viste at lungekreft vev bærer rs1255722AA variant genotype hadde signifikant lavere mRNA nivå av PPP2R5E sammenlignet med vev som frakter GG /GA genotyper. En slik effekt ble ikke observert for de andre SNP’er og andre kombinasjoner. Våre funn foreslo at de to funksjonelle varianter i
PPP2R1A Hotell og
PPP2R5E Hotell og kombinasjonen er assosiert med lungekreft i kinesisk, noe som kan være verdifulle biomarkører for å forutsi risikoen for lungekreft.
Citation: Yang R, Yang L, Qiu F, Zhang L, Wang H, Yang X, et al. (2013) Funksjonelle genetisk polymorfisme i PP2A subenhetgenene Confer økt risiko for lungekreft i Sør- og Øst-kinesisk. PLoS ONE 8 (10): e77285. doi: 10,1371 /journal.pone.0077285
Redaktør: Francesc Calafell, Universitat Pompeu Fabra, Spania
mottatt: 27 april 2013; Godkjent: 02.09.2013; Publisert: 29 oktober 2013
Copyright: © 2013 Yang et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Denne studien ble støttet av National Natural vitenskapelige grunnlag Kina gir 30671813, 30872178, 81072366, 81273149 (JL), og delvis 81001278, 81171895 (YZ); Guangdong Provincial High Level Eksperter Grants 2010-79 (JL); Changjiang Forskere og Innovativ Research Team i Universitets tilskuddet IRT0961 (JW), Guangdong Natural Science Foundation lag tilskuddet 10351012003000000 (WL). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:. Forfatterne har erklært ingen interessekonflikter
Innledning
reversibel fosforylering av proteiner er en viktig reguleringsmekanisme for å opprettholde homeostase celle som regulerer cellevekst, proliferasjon, apoptose, differensiering og overlevelse [1]. Den balanserer fosforylering avhengig signaltransduksjonsveiene i kraft av fosforylering med proteinkinaser og defosforylering med fosfataser. Flere bevis har antydet at den avvikende aktivitet hos fosforylering innebærer utvikling av en rekke kreftformer (f.eks lungekreft), som ble forårsaket av aktiverte onkogene kinaser og fosfataser inaktiv [2]. Inaktiverte fosfataser ville føre til avvikende aktivering av onkogene signaliseringsreaksjonsveier, og til slutt føre til tumorgenese [3], [4]. Dysfunksjonelle fosfataser har blitt observert i ulike svulster med genetiske eller funksjonelle endringer [2].
serin-treonin protein fosfatase 2A (PP2A) er en av de store mobilnettet Tjen /Thr protein fosfataser som spiller sentrale roller i regulering cellevekst [5], apoptose [6], transformasjon [7] og bevirker defosforylering i flere signalveier som for eksempel MAP kinase signalering og WNT signale [8], [9]. Flere bevis har antydet at PP2A fungerer som en tumor suppressor [10], [11] ved å hemme flere onkogene kinases_ENREF_11 så som c-Myc og AKT [12] – [14], og tumor-suppressorer som p53 [15]. I kontrast, ville inaktivert PP2A fremme tumorgenesis ved å fremme cellevekst og overlevelse [16] _ENREF_19_ENREF_20. Dysfunksjonell PP2A har blitt observert i ulike menneskelige kreftformer, inkludert lungekreft, som kan være på grunn av genetiske eller epigenetiske forandringer i ulike PP2A subenhetgenene [17], [18].
PP2A er et trimere holoenzyme besto av en stillaser en subenhet, en regulatorisk B-subenhet og en katalytisk C subenhet [19]. Vanligvis den strukturelle kjerne subenheten PP2Aa (PPP2R1A /PPP2R1B) samhandlet med den katalytiske subenhet PP2Ac (PPP2CA /PPP2CB) for å gjøre opp kjernen av enzymet, og bindingen av de svært varierte B regulatoriske subenheter (15 gener) til kjernen enzymet resultater i vev-spesifisitet uttrykt og substrat spesifisitet av PP2A holoenzyme komplekser. Nylig har flere studier har rapportert at genetiske varianter i disse PP2A subenhetgenene ble assosiert med ulike menneskelige sykdommer, inkludert kreft [20] – [22]. Bemerkelsesverdig, resultatene fra en genome-wide forening studie (GWAS) gjennomførte i kinesisk, der vi tidligere deltatt, identifisert et intron enkeltnukleotidpolymorfi (SNP) i nærheten av en B regulatorisk subenhet (
PPP2R2B
) for å være en lungekreft utsatt locus, som reflekterer en viktig rolle i PP2A på lungekreft mottakelighet [23]. Imidlertid har ingen studier ennå systematisk testet assosiasjoner mellom genetiske varianter i PP2A subenhetgenene og risikoen for lungekreft. Derfor, i denne studien, testet vi hypotesen om at genetiske varianter i PP2A subenhetgenene kan endre mottakelighet for lungekreft.
Fordi PP2A har vev-uttrykt spesifisitet, vi valgte genetiske varianter av disse PP2A underenheter med funksjon i lunge basert på tidligere publiserte artikler (dvs.
PPP2R1A product: [24],
PPP2R1B product: [25],
PPP2CA product: [26],
PPP2R2A
[27],
PPP2R2B product: [23],
PPP2R5C product: [28] og
PPP2R5E product: [29]). I en to-trinns case-control studie, genotypet vi ni antatte funksjonelle SNPs av ovennevnte gener i det sørlige kinesiske og validert lovende SNPs i østlige kinesiske å analysere assosiasjoner mellom dem og risikoen for lungekreft. Effekten av lovende SNPs på genekspresjon ble ytterligere oppdaget.
Materialer og metoder
forsøkspersonene
I denne studien, to uavhengige case-control prøvetakinger inkludert en sørlige kinesiske befolkningen som et funn sett og en østlig kinesiske befolkningen som en valideringssettet ble brukt som tidligere beskrevet [30] – [34]. I korte trekk, var det 1056 histopathologically bekreftet primær lungekreft tilfeller og 1056 alder (± 5 år) og sex frekvens matchet kreftfrie kontroller i oppdagelsen sett, og 503 nydiagnostiserte lungekreftpasienter og 623 alder (± 5 år) og sex frekvens-matchet friske kontroller i valideringssettet. Alle deltakerne var genetisk urelaterte etniske Han-kinesere og ingen hadde blodoverføring i løpet av de siste 6 månedene. Etter å ha gitt et skriftlig informert samtykke, ble hver deltaker planlagt for et intervju med en strukturert spørreskjema for å samle utvalgt informasjon, og til å donere 5 ml perifert blod. Definisjonen av røykestatus, paknings år røykte, drikke status og familiehistorie med kreft har blitt beskrevet tidligere [32], [35]. Studien ble godkjent av institusjonelle gjennomgang styrene i Guangzhou Medical University og Suzhouuniversitetet.
SNP utvalg
Ved å søke på dbSNP database (https://www.ncbi.nlm.nih.gov /), fant vi at det var ni mulige funksjonelle SNP’er i de nevnte syv-genene som er plassert i den forutsagte 2000 bp promoteren, det kodende område og 3′-ikke-translaterte området (3′-UTR) med mindre allel frekvens (MAF) 5 % i Han-kinesere. De er rs13344984T C i promoter, rs10421191G A i 3′-UTR av
PPP2R1A
, rs2850247 C A og rs612345 A G i formidler av
PPP2R1B
, rs7840855C T i promoter av
PPP2R2A
, rs3742424G C i kodende område av
PPP2R5C plakater (forårsaker en aminosyre endring fra alanin til Proline ved kodon 476), rs1255720T C og rs1255722G A i formidler av
PPP2R5E, etter rs2292283G A i formidler av
PPP2CA
. Den koblingsulikevekt (LD) analyse viste videre at de to SNPs (rs1255720T C og rs1255722G A)
PPP2R5E
var i helt LD med hverandre (r
2 = 0,309, D « = 1,0), valgte vi derfor en av dem (rs1255722G A) i studien. Videre har Yu-Chun Lin et.al identifisert en SNP rs11453459- G innen arrangøren av
PPP2R1A
er funksjonell og felles med MAF 5% i kinesisk, vi også valgt denne SNP skjønt det var ikke rapportert i dbSNP med frekvensdata av CHB [36]. Det ble imidlertid ikke slik SNP observert for
PPP2R2B
. Til sammen valgte vi ni SNPs av PP2A subenhetgenene (rs10421191G A, rs11453459- /G og rs13344984T C av
PPP2R1A
, rs2850247 C A og rs612345 A G av
PPP2R1B
, rs7840855C T av PPP2R2A, rs1255722A G av
PPP2R5E
, rs3742424G C av
PPP2R5C
, rs2292283A G av
PPP2CA
) i studien.
Genotype analyse
Taqman allel diskriminering assay ble brukt til å genotype hver SNP på ABI PRISM 7500 Sequence Detection Systems (Applied Biosystems, Foster City, CA), og dukke opp genotypene med Detection Systems programvare 2.0.1 (Applied Biosystems). De primere og prober for påvisning av hver SNP ble selv designet av Primer Express 3.0 (Applied Biosystems) og syntetisert av Shanghai GeneCore Bioteknologi (Shanghai, Kina) som er oppført i tabell S1. Vi ytterligere tilfeldig valgt omtrent 10% av eksemplene for å utføre gjenta analysen, og resultatene var 100% konkordant. Suksessraten ved genotyping for disse polymorfismer var alle over 99%
PPP2R5E mRNA uttrykk analyse
Fordi tidligere studie hadde vist funksjonen SNP rs11453459- . G [36], vi fokusert på testing av den biologiske virkning av SNP en annen rs1255722A G av PPP2R5E, som har en signifikant sammenheng med risikoen for lungekreft. MRNA nivået av
PPP2R5E
ble oppdaget i trettito lunge svulst vev [32]. Total RNA ble ekstrahert ved bruk av Trizol reagens (Invitrogen) og revers transkribert til komplementære DNA ved bruk av oligo primer og Superscript II (Invitrogen). MRNA nivåene av PPP2R5E og en intern referanse gen β-actin ble målt på ABI Prism 7500 sekvens deteksjonssystem (Applied Biosystems) ved hjelp av SYBR- grønne metoden. De primere for
PPP2R5E
var: 5’TCA GCA CCA ACT ACT CCT CCA -3 «(fremover) og 5’GCC TTG AGA CCT AAA CTG TGA G -3» (bakover) og for β- aktin var: 5’GGC GGC ACC ACC ATG TAC CCT -3 «og 5» – AGG GGC CGG ACT CGT CAT ACT -3 «. Alle analyser ble utført på en blindet måte med laboratorie personer uvitende om genotyping data og hver analyse ble gjort i tre eksemplarer.
Statistisk analyse
Hardy-Weinberg likevekt (HWE) ble testet av en godhet-of-fit chi-kvadrat test for å sammenligne de forventede genotypefrekvensene med observerte genotypefrekvensene i kontroller. Chi-kvadrat-test ble anvendt for å vurdere forskjellene i fordelingen av genotypene samt alleler fra hver SNP mellom saker og kontroller. Et ubetinget logistisk regresjonsmodell med justering for alder, kjønn, røykestatus, drikking status og familiehistorie med kreft ble brukt til å estimere sammenhengen mellom SNPs og kreftrisiko. Den beste genetiske modell av hver SNP ble valgte basert på den minste Akaike informasjonskriterium [37]. Den mulige samspill mellom SNPs og omkringliggende faktorer på risikoen for lungekreft ble vurdert av en multiplikativ samhandlingsmodell som når OR 11 OR 10 × OR 01, hvor OR 11 = OR når begge faktorene var til stede, eller 01 = OR når bare faktor 1 var til stede, OR 10 OR = den når eneste faktor 2 var til stede [38], [39]. Den Breslow-Day test ble brukt for å teste homogenitet mellom stratum-ORS. Dessuten ble den statistiske kraften beregnes ved hjelp av PS Programvare [40]. The One-way ANOVA test og student
t
test ble brukt for å vurdere forskjellene i
PPP2R5E
uttrykk i tumorvev mellom ulike genotyper. Alle testene var tosidige ved hjelp av SAS (versjon 9.3, SAS Institute, Cary, NC).
P
. 0,05 ble ansett som statistisk signifikant
Resultater
Distribusjon av PP2A subenhetgenene genotyper og deres foreninger med risiko for lungekreft
genotype frekvenser av ovennevnte SNPs blant kontrollene var alle i avtalen med Hardy-Weinberg likevekt (
P
0,05 for alle). Som vist i tabell 1, den logistisk regresjon analyse viste at -G og GG genotyper av rs11453459- G er tillagt en 1,29 ganger og 1,51 ganger økte risikoen for lungekreft i forhold til den vanlige – genotypen (-G vs. – : odds ratio [OR] = 1,29, 95% konfidensintervall [CI] = 1,08 til 1,56,
P
= 0,006; GG vs. -: OR = 1,51, 95% CI = 01.04 til 02.22,
P
= 0,033), og AA variant genotype av rs1255722G A hadde en 38% økt risiko for lungekreft (OR = 1,28, 95% CI = 1,07 til 1,77,
P
= 0,012) i forhold til den felles GG genotype, men AG gjorde det ikke. I henhold til den minste AIC, effekten av rs11453459- G beste tilpasset den dominerende modellen, rs11453459G variantene (-G + GG) som utøves en 1,32 ganger høyere risiko for lungekreft (OR = 1,32, 95% CI = 1.11- 1.58,
P
= 0,002); mens rs1255722G En beste montert recessive genetiske modell, rs1255722AA varianten hadde en 27% økt risiko for lungekreft (OR = 1,27, 95% CI = 1,02 til 1,57,
P
= 0,031) sammenlignet med G genotyper (AG + GG). Men for de andre syv SNPs, ingen signifikant sammenheng mellom dem og risikoen for lungekreft (
P
0,05 for alle). Videre rs11453459G varianter ble fortsatt signifikant assosiert med økt kreftrisiko etter flere tester (
P
Bonferroni = 0,018), mens rs1255722AA ble ikke (
P
Bonferroni = 0,279 ).
de assosiasjoner av de to lovende SNPs ble ytterligere bekreftet i valideringssettet som vist i Tabell 2, rs11453459G genotypene var signifikant assosiert med økt risiko for lungekreft (OR = 1,28, 95 % CI = 1,00 til 1,63,
P
= 0,048), og rs1255722AA genotype tillagt en økt risiko for lungekreft sammenlignet med andre genotyper (OR = 1,32, 95% CI = 0,98 til 1,77) med en border statistisk signifikans (
P
= 0,069). Men multippel test viste at bare polymorfisme rs11453459- G hadde en nærmer signifikant sammenheng med risikoen for lungekreft (
P
Bonferroni = 0,096), mens rs1255722G A hadde ikke (
P
Bonferroni = 0,198). Vi har kombinert de to populasjonene å øke studie makt fordi homogenitet testen viste at de ovennevnte foreninger i to settene var homogen (
P
= 0,974 for rs11453459- G;
P
= 0,559 for rs1255722G A). Bærere av rs11453459G genotyper hadde en 1,31 ganger økt kreftrisiko lunge i dominerende modellen (justert OR = 1,31, 95% CI = 1,13 til 1,51;
P
= 2,00 × 10
-4;
P
Bonferroni = 4.00 × 10
-4), og bærere av rs1255722AA genotype hadde en 1,27 ganger økt risiko for lungekreft i recessive modell (OR = 1,27; 95% CI = 1.07- 1,51;
P
= 0,007;
P
Bonferroni = 0,014). I tillegg fordelingen av demografiske kjennetegn og risikofaktorer for oppdagelsen satt og valideringssettet ble presentert i tabell S2.
Kombinert genotyper og risikoen for lungekreft
Som vist i tabell 3 kombinerte vi risiko genotyper av de to SNPs basert på antall risiko genotyper (dvs. rs11453459G og rs1255722AA genotyper). Vi definerte som bærere med rs11453459- og rs1255722G genotyper har null risiko genotype; bærere med rs11453459- og rs1255722AA, eller rs11453459G og rs1255722G genotyper har en risiko genotype; og bærere med rs11453459G og rs1255722AA genotyper har to risiko genotyper. Vi fant ut at sammenlignet med null risiko genotyper bærere, ble den ene og to antall risiko genotyper forbundet med økt risiko for lungekreft i en doseavhengig måte (OR = 1,32, 95% CI = 1,14 til 1,53 for en, OR = 1,59, 95% KI = 01.23 til 02.06 for to risiko genotyper;
P
trend = 5,63 × 10
-6)
Stratifisering analyse av nummeret. av risiko genotyper og lungekreft risiko
Vi utførte stratifisering analyse for å evaluere effekten av omkringliggende faktorer på assosiasjoner mellom økt antall risiko genotyper og risikoen for lungekreft. Som vist i tabell 3, foreninger var signifikant i alle undergruppene unntatt i personer med en familie historie av lungekreft, røykere som røykte mindre enn 20 stk-årene, fag som histologiske typer er stor celle karsinom og i fase II, som kan være på grunn av begrensning av små utvalgsstørrelser i disse undergruppene. Videre observerte vi en positiv signifikant samspill mellom antall
PPP2R1A Hotell og
PPP2R5E
risiko genotyper og drikke status på å øke risikoen for lungekreft (
P
= 0,034, Tabell S3) .
Association mellom rs1255722G A genotyper og mRNA nivåer av PPP2R5E genet
Som vist i figur 1, de mRNA nivåer av PPP2R5E i vev med rs1255722AA genotype var betydelig lavere enn de med G genotyper (ANOVA test:
P
= 0,003). Den dikotomisert Analysen viste at AA genotype var signifikant assosiert med en redusert mRNA nivå av PPP2R5E forhold til G genotyper (Student
t
test:
P
= 0,032).
bioinformatikk analyse
Vi videre utført bioinformatikk analyse for å forutsi den biologiske effekten av rs1255722G A på å påvirke bindingsevnen av potente transkripsjonsfaktorer ved hjelp TFSEARCH (https://www.cbrc.jp/research /db/TFSEARCH.html). Programvaren viste at G til A transversjon kan resultere i et tap binding av en transkripsjonsfaktor c-Ets.
Diskusjoner
I dagens to-trinns case-control studier av 1559 lunge krefttilfeller og 1,679 kontroller utført i sørlige og østlige kinesiske populasjoner, fant vi at rs11453459G genotyper av
PPP2R1A Hotell og rs1255722AA genotype av
PPP2R5E, etter og deres kombinerte genotyper tillagt økt risiko for lungekreft. Begge de to SNPs var funksjonell som at rs1255722AA genotype hatt en betydelig redusert uttrykk for
PPP2R5E
i lunge tumorvev i forhold til G genotyper, og rs11453459G genotype redusert
PPP2R1A
uttrykk som tidligere beskrevet [ ,,,0],36]. For de andre SNPs av PP2A subenhetgenene, hadde vi ikke observere noen signifikant sammenheng mellom dem og risikoen for lungekreft. Så langt vi kjenner til, er dette den første rapporten om de genetiske varianter i PP2A subenhetgenene og lungekreft mottakelighet.
Strukturen A subenhet PPP2R1A og regulatoriske B-subenheten PPP2R5E blir ofte uttrykt i lungene [24], [28] _ENREF_36. De kan dephosphorylate flere onkogene kinaser via dannelsen av PP2A kompleks [9]. De ofte genetiske mutasjoner og tap-av-funksjon av dem i tumorer (f.eks lungekreft) foreslo dem for å være kreftdempere [41] – [43]. En tidligere studie har identifisert at SNP rs11453459- G kan gi lav transkripsjonen aktivitet og redusere
PPP2R1A
uttrykk i lunge vev [36]. Her har vi stadig funnet at SNP rs1255722G En kunne betydelig redusert
PPP2R5E
uttrykk i lunge tumorvev, fordi G til A transversjon kan føre til tap binding av en transkripsjonsfaktor c-Ets som bioinformatikk analyse vist. Interessant er det rapportert at c-Ets fungerer som transkripsjonsforsterkere fremme PP2A uttrykk i menneskelig [44]. Derfor er det biologisk tenkelig at de to SNP var assosiert med øket risiko og deres kombinasjon føre til en mye høyere risiko for lungekreft, fordi de kan forårsake dysfunksjonell PP2A.
Dessuten ble det observert en positiv signifikant interaksjon mellom rekke risiko genotyper og drikking på å øke risikoen for lungekreft. Det er vel kjent at i lang tid alkohol er en potent kreft risikofaktor [45], og etanol drikking er en stimulans av PP2A aktivitet [46], SNP-induserte lav
PPP2A
ekspresjon kan føre til mer negativ virkning i respons til etanol stimulering og dermed interaksjon med drikking på lunge kreftutvikling.
Genetiske varianter i
PPP2R1A
eller
PPP2R5E
hadde blitt rapportert å være assosiert med risiko for kreft hos mennesker. Flere SNPs i
PPP2R1A
ble rapportert til forbundet med ulike kreftrisiko inkludert brystkreft [22] og livmor serøs carcinoma [41]. Tilsvarende
PPP2R5E
SNP’er er utsatt loci for risiko for brystkreft [47], lymfatisk leukemi [48], og sarkom mykt vev [49]. Imidlertid er disse SNPs alle ligger i introner. Vår studie var unik og avdekket to funksjonelle SNPs i
PPP2R1A Hotell og
PPP2R5E
var assosiert med økt risiko for lungekreft. Uansett, alle disse impliserte SNPs i
PPP2R1A Hotell og
PPP2R5E
er involvert i tumorgenesis, noe som tyder på at de variantene i
PPP2R1A Hotell og
PPP2R5E
kan være verdifulle biomarkører for å forutsi risikoen for kreft.
Fordi denne studien er en sykehusbasert case-control studie begrenset på kinesisk Han populasjoner, noen begrensninger er uunngåelig (f.eks utvalg bias). Men genotypefrekvensene blant kontroller montert Hardy-Weinberg disequilibrium lov foreslo tilfeldigheten av faget valg. Og studien myndighet ble akseptabelt, vi har oppnådd en 95,5% studie makt (tosidig test, α = 0,05) for å oppdage en OR på 1,31 for de rs11453459G genotyper (37,1% i kontrollene), og 88,3% studie makt for å oppdage en OR på 1,27 til rs1255722AA genotype (som forekom ved en frekvens på 18,3% i kontrollene). I mellomtiden, foreninger var også funksjonell mulig. Videre resultater fra GWAS viste også at frekvensfordeling av SNP rs1255722G A var signifikant forskjellig mellom saker og kontroller (rs1255722:
P
= 0,014) [23], men SNP rs11453459- G ble ikke inkludert i Affymetrix® Genome-Wide Menneskelig SNP Array 6.0. Dermed ser det ut til at vår finner at sammenhengen mellom PP2A subenheten genvarianter og økt risiko for lungekreft er usannsynlig å ha blitt oppnådd ved en tilfeldighet.
I konklusjonen, våre data antydet at de to funksjonelle SNPs (rs11453459- G av
PPP2R1A Hotell og rs1255722A G av
PPP2R5E
) er forbundet med risiko for lungekreft på kinesisk. Identifisering og beskrivelse av disse to SNPs kan føre til deres bruk som genetisk biomarkør som personlig forebyggende og terapeutisk strategi. Valideringer med større befolkningsbaserte studier i ulike etniske grupper er garantert.
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1.
Primær informasjon om TAQMAN analysen av ni SNPs i PP2A subenhetgenene
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077285.s001 plakater (DOC)
Tabell S2.
Frekvens distribusjoner av utvalgte variabler i lungekreftpasienter og kreftfrie kontroller
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077285.s002 plakater (DOC)
tabell S3.
Samspillet mellom antall risiko genotyper og drikking på å øke risikoen for lungekreft med et multiplum interaksjonsanalyse
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077285.s003 plakater (DOC)
takk til
Vi takker Dr. Bohang Zeng, Dr. Zhanhong Xie og Ms Wanmin Zeng for deres hjelp i å rekruttere fagene.
