Abstract
Bakgrunn
En vanlig enkeltnukleotidpolymorfi (SNP), rs10795668, ligger på 10p14, ble først identifisert til å være signifikant assosiert med risiko for tykktarmskreft (CRC) av et genom -Stort forening studie (GWAS) i 2008; imidlertid en annen GWAS og følgende replikering studier gitt motstridende resultater.
Metoder
Vi har utført en case-control studie av 470 tilfeller og 475 kontroller i en kinesisk befolkning og deretter utførte en meta-analyse, integrere denne studien og 9 publikasjoner for å vurdere sammenhengen mellom rs10795668 og CRC risiko. Heterogenitet blant studier og publikasjonsskjevhet ble vurdert av
χ
2
basert Q statistikk test og Egger test, henholdsvis.
Resultater
I case-control studien, signifikant sammenheng mellom SNP og CRC risiko ble observert, med per-A-allelet OR på 0,71 (95% KI: 0,54 til 0,94,
P
= 0,017). Følgende meta-analyse ytterligere bekreftet signifikant sammenheng, med per-A-allelet OR på 0,91 (95% KI: 0,89 til 0,93,
P
heterogenitet
0,05) i europeisk befolkning og 0,86 ( 95% KI: 0,78 til 0,96,
P
heterogenitet 0,05) i asiatiske befolkningen. Dessuten analyserer sensitivitet og publikasjonsskjevhet vurdering indikerte robust stabilitet og pålitelighet av resultatene.
Konklusjoner
Resultatene fra vår case-control studie og fulgt meta-analyse bekreftet signifikant sammenheng av rs10795668 med CRC risiko
Citation. Qin Q, Liu L, Zhong R, Zou L, Yin J, Zhu B, et al. (2013) Den genetiske varianten på kromosom 10p14 er forbundet med risikoen for tykktarmskreft: Resultater fra en case-control studie og en meta-analyse. PLoS ONE 8 (5): e64310. doi: 10,1371 /journal.pone.0064310
Redaktør: Struan Frederick Airth Grant, Barnesykehuset i Philadelphia, USA
mottatt: 25 januar 2013; Godkjent: 10 april 2013; Publisert: May 22, 2013
Copyright: © 2013 Qin et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av Natural Science Foundation National of China (NSFC-81172752, og NSFC-81222038) og talent introduksjon plan Huazhong University of Science and Technology (Li Liu). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser. Xiao-Ping Miao er en PLoS ONE Editorial styremedlem. Dette endrer ikke forfatternes tilslutning til alle PLoS ONE politikk på deling av data og materialer.
Innledning
Tykktarmskreft (CRC) er den tredje vanligste kreft hos menn og den andre i kvinner, med over 1,2 millioner nye tilfeller og 608,700 dødsfall i 2008 på verdensbasis [1]. I utviklede land, i henhold til Surveillance epidemiologi og sluttresultatet database, er CRC den nest største årsaken til kreftdød i utviklede land, med livstidsrisiko beregnet til 5-6% [2]. I utviklingsland, som Kina, har forekomsten av CRC vokst raskt de siste tiårene, særlig i urbane områder [3]. Shanghai, som utviklet byen i Kina, opplevde en årlig økning på 4,2% i kolorektal kreftforekomst, som var enda høyere enn det globale plan (2%) [4].
CRC er provosert av samspillet mellom genetisk og miljøfaktorer. Blant alle årsaker til CRC, arvet genetiske faktorer står for ca 35% av sykdommen etiologi [5]. Men høy penetrans mutasjoner, slik som de i
APC
,
SMAD4 Hotell og
MMR
gener, er ansvarlig for mindre enn 5% av tilfellene i patogenesen av CRC [6]. Mildt eller moderat penetrant alleler kan forklare om 8,3% av etiologi i tilfeller med familiær aggregering [7], [8]. Det er forventet at den resterende andelen arvelig følsomhet er trolig forklares med lav risiko varianter [6].
Genome-wide assosiasjonsstudier (GWAS), noe som gjorde det mulig å genotyping av hundretusener av enkelt nukleotid polymorfismer (SNPs) som tag koblingsulikevekt (LD) blokker i genomet, har blitt identifisert roman mottakelighet loci for CRC [9] – [19]. Blant disse loci ble SNP, rs10795668, ligger på 10p14, først identifisert av Tomlinson, IP et al. å være signifikant assosiert med CRC risiko i en fire-fase GWAS med 18831 saker og 18540 kontroller i europeere [18]. Men en annen GWAS rapportert av Peters, U. et al. fant ingen rolle denne varianten i CRC mottakelighet av en test sett av 2906 tilfeller og 3416 kontroller og 10 replikering sett med 8161 tilfeller og 9101 kontroller i europeere [17]. I replikasjonsstudier, noe gitt statistisk belegg av denne SNP for CRC risiko [20] – [22], men mye mer unnlatt å replikere denne forbindelsen [6], [23] – [28]. Dessuten rs10795668 viste en befolkning forskjell mellom de europeiske, japanske og afroamerikanske populasjoner [23]. Siden allele frekvens og LD mønstre på tvers av ulike populasjoner er forskjellige, har denne varianten for å bli replikert å fastslå dens rolle i CRC utvikling. De replikering studier av sammenhengen mellom rs10795668 polymorfisme og CRC har blitt gjennomført i Nord, Sør og Hong Kong kinesisk [20], [22], [25]. Heri, utførte vi en replikering studie som omfatter 470 saker og 475 kontroller i Central kinesisk. Videre er en meta-analyse som kombinerer den aktuelle studien og tidligere publiserte studier om rs10795668 ble videre gjennomført for å avklare forholdet mellom denne SNP og CRC risiko.
Materialer og metoder
Etikk uttalelse
studiet ble godkjent av Institutional Review board of Tongji Medical College of Huazhong University of Science and Technology. Og alle deltakerne gitt skriftlig informert samtykke til å delta i denne studien.
Studie populasjoner
Studiepopulasjonen besto av 470 CRC tilfeller med nylig diagnostisert CRC og 475 kreftfrie kontroller. Pasientene ble fortløpende rekruttert mellom 1 januar 2007 og 31 november 2009 på åttende Hospital of Wuhan i det sentrale Kina, som er et sykehus som spesialiserer seg på kolorektal sykdommer og absorberende fleste av colorectal pasienter i Wuhan og nærliggende områder. Kontrollene var kreftfrie personer som bor i byen Wuhan og omliggende regioner, som ble valgt fra en pool av friske frivillige som besøker helsekontroll senteret ved samme sykehus i løpet av samme periode i rekruttering av CRC pasienter. Inklusjonskriteriene for pasienter inkludert histopathologically bekreftet CRC, uten tidligere kjemoterapi eller strålebehandling og ingen begrensning i forhold til kjønn, alder eller sykdom scenen. Saker med patologi rapport utpekt familiær adenomatøs polypose, inflammatorisk tarmsykdom, tykktarms adenom, Lynch syndrom, intestinal tuberkulose og schistosomiasis var ikke kvalifisert. Utvalgskriteriene for kontroller inkludert kreftfrie individer og frekvens tilpasset saker etter kjønn og alder (± 5 år). Alle fag var urelaterte etniske Han-kinesere. Demografi og livsstil, og medisinske data ble samlet inn av opplært intervjuere via direkte intervju ved hjelp av standardiserte spørreskjemaer. Kliniske data ble abstrahert fra sykehus poster. 5-ml perifer venøs blod ble trukket fra hver deltaker.
Genotyping
Genomisk DNA ble ekstrahert fra perifer blodprøve bruker RelaxGene Blood System DP319-02 (Tiangen, Beijing, Kina) i henhold til produsentens instruksjoner. Den rs10795668 SNP ble genotypet ved hjelp av Sequenom MassARRAY plattform (Sequenom San Diego, CA, USA). Genotypene ble kalt bruker MassARRAY Typer 4.0-programvaren [29], [30]. For å sikre kvalitetskontroll, ble 5% dupliseres prøvene tilfeldig valgt å vurdere reproduserbarhet, med en konkordans hastighet på 100%.
Statistisk analyse
Hardy-Weinberg likevekt (HWE) ble testet av en godhet-of-fit
χ
2
test for å sammenligne de observerte genotypefrekvensene til de forventede genotypefrekvensene i kontroller. Pearsons
χ
2
test ble brukt for å sammenligne forskjellene i fordelingen av kategoriske variabler (kjønn, røykestatus, alkoholbruk og familiehistorie med kreft) og Student
t
-test ble brukt for kontinuerlige variabler [alder og kroppsvekt index (BMI)]. For SNP med mindre allel frekvens (MAF) på 0,35, ble kraften i våre utvalgsstørrelsen beregnet til å være 0,72 til å oppdage en OR på 0,7 i case-control studie.
For den viktigste effekten av rs10795668, ubetinget logistisk regresjon ble utført for å beregne odds ratio (ORS) og tilhørende 95% konfidensintervall (cIS), justert for potensielle confounders (alder, kjønn, røykestatus alkoholbruk og BMI). ORS og 95% CI’er som beregninger av effektstørrelse ble beregnet for genotyper AG versus GG og AA versus GG. For å unngå antakelsen av genetiske modeller, var dominerende, recessive og additive modeller også analysert. To-faktor gen-miljø interaksjon analysene ble evaluert ved hjelp av likelihood ratio tester som sammenligner nøstede modeller med kun hovedeffekter og modeller med hovedeffekter pluss relevant interaksjon sikt. Der miljøfaktorer som røyking status, alkoholbruk og BMI, ble inkludert i samhandlingsmodeller. I følge WHO ekspertkonsultasjon konklusjon, BMI cut-off point for overvekt for kinesisk ble satt til å være 24 kg /m
2 [31]. Den Bonferroni metoden ble brukt for multippel sammenligning korreksjon. Alle statistiske analyser ble utført ved hjelp av SPSS programvare 12.0 (SPSS Inc., Chicago, III) og alle
P
verdiene var tosidige testet med et betydelig nivå på 0,05.
Meta-analyse av rs10795668 i forbindelse med CRC risiko
for ytterligere å undersøke sammenhengen mellom rs10795668 og CRC risiko, ble en meta-analyse gjennomført i samsvar med retningslinjene i den foretrukne Reporting Varer til systematiske oversikter og metaanalyser (PRISMA) uttalelse (https://www.prisma-statement.org) (Sjekkliste S1).
En systematisk litteratursøking ble utført i PubMed /Medline og ISI Web of Science uten språkbegrensninger frem til slutten av november, 2012. søkestrategi var basert på kombinasjoner av begrepene «rs10795668 eller 10p14» og «tykktarmskreft eller tykktarms svulst». For å utvide dekningen av våre søk, vi videre utført søk i kinesisk Biomedical database (CBM) basert på den samme strategien [32]. I tillegg ble det referanser i innhentede artikler skannet. Anmeldelser, kommentarer og brev ble også kontrollert for ytterligere studier. Søke ble utført i duplikat av to uavhengige lesere (Qin Qin og Li Liu)
Studier ble inkludert hvis de møtte alle av følgende kriterier: (1). Opprinnelige studien; (2) vurdering av sammenhengen mellom rs10795668 og CRC risiko; (3) case-control eller kohortstudie design; (4) som gir odds ratio (OR) med tilsvarende tillit 95% intervall (95% CI) eller tilstrekkelige data til å beregne dem; (5) studier av mennesker; (6) genotypene av rs10795668 i kontrollene er i HWE. Vi dro ut undersøkelser hos pasienter med Lynch syndrom. Case-rapporter, kommentarer, anmeldelser og ledere ble også ekskludert. Dersom undersøkelsene hadde overlappende fag, ble kun studier med den største bestanden endelig inkludert. Hvis mer enn ett geografisk eller etnisk populasjonen ble inkludert i en rapport ble hver populasjon vurderes for seg. Alle data ble hentet uavhengig av to korrekturlesere (Qin Qin og Li Liu) og uenighet ble pådømt av en tredje forfatter (Rong Zhong)
Følgende informasjon ble hentet fra hver studie. Første forfatterens navn, årstall , studere landet, etnisitet av studiepopulasjonen, studiedesign, studere type, genotyping metode, antall tilfeller og kontroller, kontroll kilde, MAF. HWE kontroller ble anslått igjen i meta-analyse av godhet-of-fit
χ
2
test (
P
0,01) [33] – [35]. Felles hyppigheten av A-allelet av rs10795668 i ulike etniske grupper ble beregnet ved hjelp av den inverse varians metoden beskrevet av Thakkinstian A et al. [36]. Statistiske heterogenitet på tvers av studier inkludert i meta-analysen ble vurdert av Cochran
Q
-statistic og betraktet som signifikant på
P
0,05 [37].
I
2
statistikken ble deretter benyttet til å beregne heterogenitet kvantitativt (
I
2
= 0-25%, ingen heterogenitet;
I
2
= 25-50%, moderat heterogenitet;
I
2
= 50-75%, stor heterogenitet;
I
2
= 75-100%, ekstrem heterogenitet ) [38]. Den faste effekt-modell, ved invers varians metoden ble brukt til å beregne den samlede anslaget når heterogenitet var ubetydelig; ellers ble tilfeldig effekt modellen, ved DerSimonian og Laird metoden anvendt [39]. Sensitivitetsanalyse ble utført for å vurdere innvirkningen av hver studie på totale anslaget ved sekvensiell fjerning av hver studie [40]. Publikasjonsskjevhet ble estimert ved trakt tomt og Eegger test [41], [42]. Alle statistiske analyser ble utført i STATA statistisk programvare (version11.0, Stata Corporation, College Station, Texas) og alle
P
verdiene var tosidige testet med et betydelig nivå på 0,05
Resultater
Resultater fra case-control studie
Befolknings egenskaper.
det som kjennetegner de forsøkspersonene ble beskrevet i tabell 1. det var ingen signifikante forskjeller i fordelingen av alder, kjønn og alkoholbruk mellom saker og kontroller. Gjennomsnittsalderen [± standardavvik (SD)] var 58,1 (± 11,6) år for saker og 58,4 (± 13,1) år gammel for kontroller (
P
= 0,652). Flere røykere ble observert i tilfeller enn i kontrollene (
P
0,001). I tillegg BMI i tilfeller var betydelig høyere enn i kontrollgruppen (
P
= 0,023).
Association analyse.
genotypen data for rs10795668 for saker og kontroller ble vist i tabell 2. genotypefordeling kontroller holdt Hardy-Weinberg likevekt (
P
= 0,433). Det ble ikke observert signifikant forskjell i genotype fordeling mellom saker og kontroller (
χ
2
= 9,89,
P
= 0,007). I ubetinget logistisk regresjon modell, personer med AA genotype viste en signifikant redusert CRC risiko sammenlignet med dem som bærer GG genotype (OR = 0,51, 95% KI: 0,28 til 0,94). I alleliske modell, A allel bærere viste også betydelig redusert risiko i forhold til de med G allel bærere (OR = 0,70, 95% CI: 0.52-0.93). I tillegg er betydelig redusert risiko for CRC ble også funnet i additiv modell, med per-A-allel OR på 0,71 (95% CI: 0,54 til 0,94). Likeledes signifikant sammenheng mellom denne polymorfisme og redusert CRC risiko ble funnet i dominerende modellen (OR = 0,65, 95% KI: 0,44 til 0,96). Selv om ingen signifikant sammenheng ble funnet for AG versus GG og recessive modell.
To-faktor-genet-miljø interaksjon analyser.
Å utforske mulige interaksjoner mellom rs10795668 og røykestatus, alkohol bruke og BMI, vi spilte to-faktor-genet-miljø interaksjon analyser av ubetinget Logistic Regression. Resultatene ble vist i tabell 3. Ingen signifikant interaksjon ble funnet i henhold til
P
verdien av samspillet sikt (
P
≥0.017). Blant personer med BMI≥24 kg /m
2, bærer med AA og AG genotyper viste signifikant redusert risiko for CRC sammenlignet med de med GG genotype, med en OR på 0,45 (95% KI: 0,22 til 0,91). Men foreningen ble ikke funnet blant personer med BMI. . 24 kg /m
2
Resultater av Meta-analyse
Kjennetegn på inkluderte studiene
som vist i figur 1, ble 31 potensielt relevante artikler identifisert og screenet, hvorav 17 artikler oppfylte inklusjonskriteriene. Men etter nærmere undersøkelse, ekskludert vi 4 studier [26] – [28], [43] for å inkludere pasienter med Lynch syndrom og en annen 4 studier [44] – [47] for inneholder overlappende deltakerne med de inkluderte studiene. Til slutt, ved å kombinere denne studien, totalt 10 publikasjoner [6], [17], [18], [20] – [25] med 14 dato sett bestående av 39341 tilfeller og 41566 kontroller ble inkludert i meta-analyse (Tabell 4). Av disse ble 7 studier gjennomført i europeere, fem i asiater og to i afrikanske amerikanere. Genotyper av rs10795668 kontroller dannet Hardy-Weinberg likevekt for alle inkluderte studier (
P
0,01)..
Frekvens av A-allelet i kontrollpopulasjoner
Ingen signifikant heterogenitet ble observert i europeiske og afroamerikanske grupper (
P
heterogenitet
= 0,236 og 0,462, henholdsvis). Den sammenslåtte frekvens ved hjelp av faste tilfeldig effekt modellen var 0,327 (95% KI: 0,322 til 0,333) i europeiske styrer og 0,063 (95% KI: 0,051 til 0,075) i African American kontroller. Det var signifikant heterogenitet blant de asiatiske studier (
P
heterogenitet
0,001), og den samlede frekvens var 0,385 (95% KI: 0,352 til 0,419) under tilfeldig effekt modell. Disse sammenslåtte frekvensene var lik de som ble rapportert i dbSNP database over 0,353, 0,390 og 0,065 for europeere, asiater og afro-amerikanere, henholdsvis. På grunn av de ulike frekvensfordeling av SNP rs10795668 tvers av ulike populasjoner ble startet meta-analyse i hver etnisk gruppe for seg.
Den meta-analyse av rs10795668 i forbindelse med CRC.
Som vist i tabell 5, bare i asiatiske gruppen betydelig bevis for heterogenitet er registrert (
P
heterogenitet
= 0,031,
i
2 = 62,3%), derfor ORS i asiatiske gruppen ble samlet etter tilfeldig effekt modell, og ORS i europeisk og afrikansk amerikansk gruppe ble både slått sammen under anleggs effekt-modell. Signifikant sammenheng mellom den varianten og CRC risiko ble funnet både i europeiske og asiatiske grupper, med ORS av 0,91 (95% KI: 0,89 til 0,93) (figur 2) og 0,86 (95% KI: 0,78 til 0,96) (figur 3), henholdsvis. Mens i African American gruppe, den varianten viste border invers assosiasjon med CRC risiko (OR = 1,24, 95% KI: 0,99 til 1,56) (figur 4)
for de europeiske datasettene ytterligere analyse uten innledende studie [18] ble utført, slik som å unngå bias. Etter eksklusjon av den opprinnelige studien prøver, sammenhengen mellom den varianten og CRC risikoen var fortsatt betydelig, med OR på 0,94 (95% KI: 0,90 til 0,98,
P
heterogenitet
= 0,242) (figur S1) .
sensitivitetsanalyser.
for å vurdere påvirkningen av hver enkelt studie på den sammenslåtte additiv eller sensitivitetsanalyser ble utført ved å fjerne enkelte studium sekvensielt. Som vist i Figur S2, de samlede ORS var like før og etter sletting av hver studie, noe som indikerer robust stabilitet dagens resultater.
Publication bias.
Trakt tomten og Egger test var brukes til å vurdere publikasjonsskjevhet. Som det fremgår i figur S3, formen på trakten plottet virket symmetrisk. Og Egger test ble det ikke konstatert publikasjonsskjevhet (tabell 5).
Diskusjoner
SNP rs10795668 ligger på 10p14 ble først avslørt å være assosiert med CRC risiko ved en flertrinns GWA studien, men inkonsistente resultater har blitt rapportert ved å følge studier. Den nåværende case-control studie fant en signifikant sammenheng mellom rs10795668 polymorfisme og CRC risiko i kinesiske befolkningen. Deretter følgende meta-analyse også foreslått at SNP var signifikant assosiert med CRC risiko. Denne meta-analysen var den første til å integrere publiserte GWA studier og replikering studier for å avklare effekten av rs10795668 variant på CRC risiko.
SNP rs10795668 kart til en 82-kb LD blokk (8,73 til 8,81 Mb) innen 10p14 [18]. Tomlinson IP et al. undersøkt tre ekstra SNP’er i denne LD blokk (rs706771, rs7898455 og rs827405) og fant ingen tegn på mer enn én sykdom locus i området [18]. Som de fleste av risiko varianter identifisert av GWAS, ligger rs10795668 utenfor de kodende regioner av gener. De nærmeste spådd gener er
BC031880
, som ligger 0,4 Mb proksimalt for rs10795668, og
LOC389936
, som ligger 0,7 Mb distalt. Selv om variant rs10795668 har blitt funnet å være assosiert med CRC risiko, er lite kjent om funksjonen av SNP. For å undersøke mulige regulatoriske funksjoner på uttrykk for nabo gener, Loo LW gjennomført cis-uttrykk kvantitativ egenskap loci analyser og fant en signifikant sammenheng mellom lav kolorektal kreft risiko allel (A) for rs10795668 på 10p14 og økt uttrykk av
ATP5C1
[48].
ATP5C1
koder for gamma-subenheten av den katalytiske kjerne (F1) i det mitokondrielle ATP syntase, enzymet komplekset er ansvarlig for ATP-syntese, kjent for å spille en sentral rolle i cellulær respirasjon. En vanlig hendelse i tumorceller er den metabolske overgangen fra respirasjon (i mitokondriene) til glykolyse (i cytosol), ofte betegnet som «Warburg-effekten» [49]. Flere mekanismer kan initiere denne bryter, hvorav den ene er en nedgang i ekspresjon av beta-underenheten av ATP syntase (F1) (
ATP5B
), som fører til avbrudd av den katalytiske funksjon av ATP-syntase-komplekset, en hendelse som tidligere er blitt observert i flere krefttyper [50], [51]. Den økte uttrykk for
ATP5C1
knyttet til A-allelet på rs10795668 ville være forenlig med å opprettholde virksomheten i ATP syntase og cellulær respirasjon og potensielt hemme tumorprogresjon for tykktarmskreft. Men
ATP5C1
, ligger at10p15.1, er ikke det nærmeste nabo genet. Noen studier [52], [53] tyder på at risiko varianter GWAS ikke kan fortrinnsvis regulere gener som er nærmest. De transkripsjonsregulerende mekanismer påvirket av allel status kan innebære komplekse kromatin bekreftelse stater og funksjon i en vev bestemt kontekst. Dessuten, de fleste av variantene som er identifisert av GWAS innebærer at sannsynligheten for å være i kobling med «ekte» årsaks varianter [54], så det er mulig at polymorfisme er i koblingsulikevekt med «ekte» årsaks loci. Hva mer, forstå den biologiske funksjonen til disse loci, med fokus på ikke-koding varianter, kanskje er den største utfordringen i «post-GWAS «era [55].
meta-analysen Resultatene viste signifikant sammenheng mellom varianten rs10795668 og CRC risiko både i europeisk og asiatisk befolkning, men i afrikanske amerikanere foreningen var border betydelig og i motsatt retning. Den sammenslåtte A-allelet frekvens på tvers av ulike etniske befolkningen variert. Dessuten ble det bemerket at Kupfer SS et al. fant også at det var genetisk heterogenitet i CRC foreninger i amerikanere av afrikansk versus europeisk avstamming [24]. Den sensitivitetsanalyser og publikasjonsskjevhet vurdering indikert dagens resultater fra denne meta-analysen var pålitelig.
Noen begrensninger i case-control studier og meta-analyse må tas opp. Først, prøvestørrelse på vårt case-control studie var forholdsvis liten, hvilket resulterer i forholdsvis mangelfull statistisk styrke. For det andre, i meta-analysen, antall publiserte studier var fortsatt utilstrekkelig for analysene i asiatiske og afrikanske amerikansk gruppe, som kan maskere eller overdrive mulig sann forening. For det tredje, selv om signifikant sammenheng mellom rs10795668 og CRC har blitt bekreftet i denne studien, funksjonelle eksperimenter har ikke blitt gjort, så om denne varianten beskytter forble usikker.
I konklusjonen, vår case-control studie i en kinesisk befolkning og meta-analyser bekreftet at den varianten rs10795668 var signifikant assosiert med CRC risiko. Videre funksjonell verifisering bør gjennomføres for å bekrefte funnene, som kan hjelpe løse de underliggende mekanismene for denne varianten i CRC utvikling og progresjon.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
skog tomt på sammenslutning av rs10795668 med tykktarmskreft for europeisk gruppe uten den opprinnelige studien. (TIF)
doi: 10,1371 /journal.pone.0064310.s001 plakater (TIF)
Figur S2.
Sensitivitetsanalyser for europeisk gruppe. (TIF)
doi: 10,1371 /journal.pone.0064310.s002 plakater (TIF)
Figur S3.
Trakt tomt på publikasjonsskjevhet for europeisk gruppe. (TIF)
doi: 10,1371 /journal.pone.0064310.s003 plakater (TIF)
Sjekkliste S1.
PRISMA 2009 sjekkliste
doi:. 10,1371 /journal.pone.0064310.s004 plakater (DOC)
