Abstract
microRNAs er viktige regulatorer av genuttrykk og har vist seg å ha endret uttrykk i en rekke av kreft typer, inkludert epitelial eggstokkreft. Mirna funksjon er oftest oppnås gjennom binding til det 3′-ikke-translaterte området av mål-protein-kodende gen. Mutasjon screening ved hjelp av massivt parallell sekvensering av 712 miRNA gener i 86 eggstokkreft tilfeller identifiserte bare 5 muterte miRNA gener, hver i en annen sak. Én mutasjon ble plassert i den modne miRNA, og tre mutasjoner ble forutsagt til å endre den sekundære struktur av miRNA transkriptet. Screening av 3′-utranslaterte område av 18 kandidatkreftgener identifisert en mutasjon i hver av
akt2
,
EGFR
,
ERRB2 Hotell og
CTNNB1
. Den funksjonelle effekten av disse mutasjonene er uklart, som uttrykk data tilgjengelig for
akt2 Hotell og
EGFR
viste ingen økning i genet transkripsjon. Mutasjoner i miRNA gener og 3′-uoversatt regioner er derfor uvanlig i eggstokkreft
Citation. Ryland GL, Bearfoot JL, Doyle MA, Boyle SE, Choong DYH, Rowley SM, et al. (2012) mikroRNA gener og deres Target 3′-uoversatt regionene er sjelden somatisk mutert hos eggstokkreft. PLoS ONE 7 (4): e35805. doi: 10,1371 /journal.pone.0035805
Redaktør: Austin John Cooney, Baylor College of Medicine, USA
mottatt: 29 januar 2012; Godkjent: 22 mars 2012; Publisert: 20 april 2012
Copyright: © 2012 Ryland et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av den viktorianske Breast Cancer Research Consortium, Australia og Australian National Health and Medical Research Council (NHMRC). GLR er støttet av en australsk Postgraduate Award. Den australske Ovarian Cancer Study Group ble støttet av det amerikanske Army Medical Research og forsyningskommando i henhold DAMD17-01-1-0729, The Cancer Council Tasmania, The Cancer Foundation of Western Australia og NHMRC. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
microRNAs (mirnas), en klasse av små ikke-kodende RNA-molekyler, har viktige regulatoriske roller i ulike cellulære trasé inkludert spredning, differensiering, alderdom og metabolisme [1]. Denne regulering oppnås ved hjelp av semi-komplementær base paring med den 3′-ikke-translaterte området (3′-UTR) av målet budbringer-RNA (mRNA) [1] – [3], så vel som den 5′-utranslaterte region eller koding regioner av mRNA, som deretter nedbrutt eller post-transkripsjonelt stilnet [4] – [6]. Samle bevis viser nå at miRNA uttrykket er avvikende i kreft [7], som fører til hypotesen om at endringer i miRNA trasé kan være et viktig skritt i initiering og progresjon til malignitet. I overensstemmelse med denne hypotesen er den observasjon at miRNA gener er ofte lokalisert i genomiske regioner som vanligvis endres i kreft, inkludert minimale områder av delesjon, tap av heterozygositet og forsterkning samt skjøre områder [8] – [10]. Mutasjon er en alternativ mekanisme for miRNA deregulering i kreft setting, der mutasjon kan endre miRNA transkripsjon, bearbeiding eller miRNA-mRNA interaksjoner. Denne mekanismen ble først beskrevet av Calin
et al.
[8], som identifiserte en germline variasjon i
HSA-MIR-16-1 Hotell som ble koblet til mottakelighet for kronisk lymfatisk leukemi. Siden da har germline polymorfismer i miRNA gener assosiert med predisposisjon for andre krefttyper [11]. Til tross for hypotesen om at mirnas kan fungere som vanlig onkogener eller tumor dempere, har flere studier antydet at somatisk mutasjon innen mirnas er en sjelden forekomst og de som har blitt rapportert viser liten effekt på miRNA aktivitet [10], [12] – [14] . Imidlertid har de fleste av disse studiene favoriserte en kandidat genet tilnærming og til dags dato, er un-partisk vurdering av forekomsten av somatiske endringer i miRNA gener i noen krefttypen mangler.
Analogt til mutasjoner oppstår innen miRNA frø regioner, kan mutasjoner som forekommer innenfor mål-mRNA-sekvens forandre binding og påfølgende miRNA-avhengig regulering av genekspresjon. Mens germline endringer ved miRNA bindingsseter i 3′-UTR kan bidra til cancer susceptibility [11], [15] – [17], rapporter av somatiske mutasjoner som forekommer i en tilsvarende sammenheng er begrenset til en enkelt tilfelle rapport [13] og har likevel være å undersøkt i store tumor kohorter. Hvis somatiske mutasjoner forekommer ved miRNA bindingsseter, vil det utgjøre et tidligere uoppdaget genetisk mekanisme for represjon eller aktivering av en cancer-assosiert mRNA.
Aberrant miRNA aktivitet er ofte assosiert med patogenesen og progresjon av ovarialcancer , den vanligste formen for ovarian kreft. MiRNA profilering studier konsekvent observere global stanse av miRNA uttrykket i ovarietumorer, som bidro til delvis av genomisk tap og epigenetiske forandringer [10], [18] – [22]. Tilsvarende er ekspresjon av mange kjente og antatte kreftgener dysregulerte i eggstokk-kreft, for eksempel
BRCA2
, hvor kun en del av den observerte tap av ekspresjon kan tilskrives mutasjonen, og promoter metylering er ikke observert [ ,,,0],23]. Tidligere har vi vist at hyppigheten av somatiske mutasjoner i kreft-10 implisert mirnas er lav i ovarietumorer [24]. I denne studien, utvider vi denne analysen av omfattende karakterisering av somatiske mutasjoner i 712 miRNA gener ved hjelp av massivt parallell målrettet re-sekvensering. I tillegg har vi vist at 3′-UTR av 18 kandidatkreftgener med sikte på identifisering av somatiske mutasjoner som endrer predikerte miRNA bindingsseter. Selv om disse genene er ofte innblandet i tumorigent prosessen koding mutasjoner, metylering eller kopi nummer endringer kun utgjøre en undergruppe av uttrykket forskjeller sett i ovarietumorer. Diskusjon
Somatiske mutasjoner
Resultater og målretting mikroRNA gener er sjeldne hendelser i ovarietumorer
for å undersøke om mutasjoner i miRNA gener bidrar til endret miRNA aktivitet i eggstokkreft, ble 86 primære epitelceller ovarietumorer vurderes for somatiske mutasjoner i genomiske regioner som tilsvarer forløper eller modent miRNA sekvenser. Kliniske kjennetegn ved disse tilfellene er oppsummert i tabell S1. Målrettet neste generasjons sekvensering ble brukt for å vurdere 712 miRNA gener kommenterte i Sanger miRNA database (versjon 13.0, mars 2009). Etter justering av data, 95% av målrettede baser innenfor 712 miRNA genene hadde en minimum 10 gangers sekvens dekning, med en tilsvarende midlere dekning av 92-fold. Filtrering for å fjerne kimcellelinje varianter oppdaget i matchet normal lymfocytt DNA og validering av konvensjonell sekvense identifisert somatiske mutasjoner i 5 miRNA gener:
HSA-MIR-10a
,
HSA-MIR-622
,
HSA-MIR-767-5p
,
HSA-MIR-888 Hotell og
HSA-MIR-1280 plakater (figur 1). Overall, somatiske mutasjoner ble oppdaget i 6% (5/86) av svulster og på mindre enn 1% (5/712) av miRNA gener analysert, uten miRNA gener recurrently målrettet ved mutasjon. I samsvar med tidligere rapporter, mutasjoner innenfor modne mirnas var uvanlig; bare en mutasjon var lokalisert innenfor den modne delen av
HSA-MIR-767-5p plakater (men utenfor frøet region), mens de resterende fire skjedde innenfor forløperen hårnål. Disse dataene er i samsvar med tidligere mindre skala studier som tyder på at somatiske mutasjoner i miRNA gener er en sjelden hendelse i tumorprøver [8], [12], [14], [24], [25].
tumorspesifikke mutasjoner er merket som svarte striper i forhold til den modne mikroRNA (hvit boks) og forløper mikroRNA (grå boks) sekvenser. Posisjonene til mutasjoner er rapportert med hensyn til følgende forløper mikroRNA transkripsjoner:
HSA-MIR-10a
NR_029608.1;
HSA-MIR-622
NR_030754.1;
HSA-MIR-767-5p
NR_030409.1;
HSA-MIR-888
NR_030592.1;
HSA-MIR-1280
NR_031703.1.
Mirna biogenesis er en flertrinnsprosess initiert av RNA polymerase II-mediert transkripsjon, etterfulgt av RNase III-avhengige trimming i en hårnål mellom og påfølgende spaltning til et funksjonelt modne miRNA [1], [26]. Denne prosessen er avhengig av sekvensmotiver og RNA sekundære strukturelementer innenfor de primære og forløper miRNA molekyler [26]. Som sådan, kan mutasjoner som oppstår i forløper-regioner endre RNA sekundærstruktur og derved blokkere bearbeidelse til modne miRNA. For å avgjøre om RNA strukturelle endringer kan resultere fra de somatiske miRNA identifiserte mutasjoner, brukte vi RNAfold programmet [27] for å forutsi den mest stabile sekundærstruktur for både villtype og mutante sekvenser. Konformasjonsendringer ble spådd for mutant
HSA-MIR-622
,
HSA-MIR-767-5p Hotell og
HSA-MIR-1280 plakater (Figur S1). Men spådd konformasjonsendringer
i silico
sjelden likestille til en fysiologisk effekt [12] og den funksjonelle implikasjon av identifiserte mutasjoner her krever videre undersøkelser med
in vitro
analyser.
i motsetning til den hyppige observasjon av tumorspesifikke varianter som bidrar til aktivering eller represjon av protein-kodende gener i kreft, viser disse funn at somatiske mutasjoner i miRNA gener er en sjelden hendelse i løpet av ovarial patogenese og legge til oppsamling av bevis fra et spekter av tumor typer som tyder på at mirnas sjelden dysregulerte av denne mekanismen. Gitt det store antall av mRNA-mål forutsagt for en enkelt miRNA og de ulike rollene til de predikerte målgener, noe somatisk mutasjon i et miRNA genet (og spesielt de som forekommer i frø sekvens) vil sannsynligvis påvirke mange biologiske reaksjonsveier [2], [3], kan noen av dem være involvert i å opprettholde homeostase celle. Følgelig, selv om en somatisk mutert miRNA gen endret mRNA uttrykk for å positivt påvirke svulst overlevelse, er det sannsynlig at det vil være et større antall genuttrykk endringer som ikke ville være bidrar til svulst celle overlevelse. Omvendt, i visse situasjoner, kan mRNA transkripsjonen undertrykkelse et resultat av virkningen av flere mirnas [28], og som sådan kan den forandrede aktiviteten til et enkelt miRNA være utilstrekkelig til å resultere i en biologisk effekt. Til slutt, er det stadig mer anerkjent at miRNA endringer observert i kreftvev kan oppstå sekundært til defekter i komponenter av miRNA behandling av maskiner, inkludert transkripsjonsfaktorer og kromatin remodeling gener som regulerer miRNA transkripsjon, samt komponenter av miRNA post-transcriptional regulering [29 ], [30]. I ovarietumorer,
DICER1 Hotell og
EIF2C2 plakater (Argonaute2) DNA kopinummer gevinster er observert hos 24,5% og 51,5% av svulster henholdsvis [9] og median total overlevelse er redusert blant kvinner som svulster har lavere
DICER1 Hotell og
drosha
mRNA uttrykk [31]. Videre undersøkelser er nødvendig for å etablere betydningen av endringer i disse og andre komponenter av miRNA biogenesis sti i patogenesen av eggstokkreft.
Somatiske mutasjoner rettet mot 3′-uoversatt regionene er sjeldne hendelser i ovarietumorer
for å undersøke muligheten for at somatiske mutasjoner oppstår i løpet av de 3′-UTR av kreftgener endre et eksisterende miRNA bindingssetet, og dermed bety en ny mekanisme for avvikende mRNA genekspresjon i kreft, vi sekvensert 3′-UTR av 11 onkogener (
akt2
,
BRAF
,
CCNE1
,
CTNNB1
,
EGFR
,
ErbB2
,
FGF1
,
KRAS
,
MYC
,
PIK3CA Hotell og
RAB25
) ved målrettet re-sekvensering i 86 ovarietumorer. I tilfelle av et onkogen, kan oppheving av et miRNA bindingssete tillate uregulert onkogen uttrykk. I tillegg 3′-UTR av 7 tumorsuppressorgener (TSGs) (
BRCA1
,
BRCA2
,
CDKN2A
,
PTEN
,
RB1
,
SPARC Hotell og
TP53
) ble også sekvensert for å kartlegge omfanget av somatiske mutasjoner som ville generere en
de novo
miRNA bindingssete og resultat i TSG nedregulering. Disse genene er anerkjent av Kreft Gene Census å være mulig innblandet i eggstokkene tumor utvikling enten ved somatisk mutasjon, genamplifisering eller sletting [32].
FGF1
,
RAB25 Hotell og
SPARC
ble valgt basert på deres demonstrerte funksjonell rolle i eggstokkreft [33] – [37]. 3′-UTR ble sekvensert til 108-gangers betyr dekning og mer enn 99% av den målrettede baser innenfor disse områdene ble dekket med 10 eller flere sekvens leser. Tumor-spesifikke mutasjoner ble sjelden identifisert i 3′-UTR i ovarier prøver: 4/86 tumorprøver ble hver identifisert med en mutasjon i ett av fire forskjellige onkogener (
akt2
,
CTNNB1
EGFR Hotell og
ErbB2
) (tabell 1), uten mutasjoner påvist i de 7 TSGs undersøkt.
I silico
miRNA mål prediksjon algoritmer foreslår at mutert loci i
akt2
,
CTNNB1 Hotell og
ErbB2
kan forekomme i samme område som en spådd miRNA bindende området, med to mutasjoner, c * 538T . A (
CTNNB1
) og c * 460g . C (
ErbB2
) erstatninger, spådd til å skje i løpet av frø sekvens av
HSA-MIR-630 Hotell og
HSA-MIR-640
bindende hhv. RNA uttrykk profilering var tilgjengelig for prøver med mutasjoner i
akt2 Hotell og
EGFR Hotell og viste at transkripsjonsnivåer av disse genene ikke ble endret i prøver med somatisk 3′-UTR mutasjoner i forhold til andre svulst prøver av den samme ovarial undertype (figur S2).
Selv om det er erkjent at mirnas kan også formidle transkripsjonen undertrykkelsen gjennom handling på 5′-UTR fra en mRNA-mål, gir denne studien foreløpige bevis for at somatiske mutasjoner endrer miRNA bindingssteder innenfor 3′-UTR vanlige kreftgener er sjeldne i epiteliale ovarietumorer. Effektiv translasjonell lyddemping kan kreve synergistisk handling av miRNAs på flere steder over en UTR, enten ved en enkelt familie av microRNAs eller ved en kombinasjon av urelaterte microRNAs, og dermed de enkelte somatiske mutasjoner er identifisert her er sannsynligvis ikke tilstrekkelig for å dempe respektive transkripsjon [28] [38]. Den somatisk mutasjon utbredelsen i 3′-UTR regioner av kandidat kreftgener sekvensert var 1,43 mutasjoner per Mb. Til sammenligning er det mutasjon utbredelsen i proteinkodende regioner av kjente kreftgener i denne svulsten kohort 570,57, 183,60 og 32,63 mutasjoner per Mb for
TP53
,
KRAS Hotell og
PIK3CA
henholdsvis, mens estimert mutasjon utbredelsen i kodingen exome er 2,4 mutasjoner per Mb i ovarietumorer [23]. Således er det sannsynlig at den lave frekvensen av mutasjoner i 3’UTRs forhold til eksoner indikerer at majoriteten av mutasjoner i 3′-regulatoriske områder som er identifisert her forekomme som bystander hendelser i tumorcelleutvikling.
Oppsummert somatiske mutasjoner i miRNA gener ble i enkelte tilfeller observert i ovarietumorer og dermed er neppe å ta hensyn til endrede miRNA aktivitet observert i denne svulsttypen. I tillegg gir vi foreløpige bevis for at valget for somatiske mutasjoner i 3′-UTR av kandidatkreftgener, noe som ville være en hypotese å forstyrre miRNA avhengig genregulering, er usannsynlig å representere en felles mekanisme for endret mRNA uttrykk i ovarietumorer.
materialer og metoder
Etikk uttalelse
Periodisering og bruk av pasientmateriale for denne studien ble godkjent av følgende menneskeforskningsetiske komiteer: Southampton Hospital Menneskelig forskningsetiske komité, Peter MacCallum Cancer Centre forskningsetiske komité Menneske, Queensland Institute of Medical Research menneskelige forskningsetiske komité, University of Melbourne Menneskelig forskningsetiske komité, Westmead Hospital Menneskelig forskningsetiske komité. Alle individer ga skriftlig informert samtykke for bruk av deres vev i forskning. Dette prosjektet ble godkjent av Peter MacCallum Cancer Centre Menneskelig forskningsetiske komité (Godkjenning # 09/29).
Ovarian tumor kohort
86 primær epitelovarialcancer tumor vevsprøver ble oppnådd gjennom Peter MacCallum Cancer Centre Tissue Bank, Australia Ovarian Cancer Study eller fra pasienter til sykehus i den sørlige delen av England [39]. Alle tumor-DNA-prøver ble microdissected for å sikre større enn 80% epitelial cellekomponent. Denne tumor kullet består av en blanding av serøs (n = 45), endometrioid (n = 28), mucinous (n = 7) og klar celle (n = 6) subtyper. Passende perifere blodprøver ble også samlet fra alle pasienter på tidspunktet for innsamling tumor og brukes som en kilde for kimlinje DNA.
Kandidat region identifikasjon for målrettet neste generasjons sekvense
3′-UTR av 18 protein-kodende gener ble valgt for somatisk mutasjon screening. Genom koordinater for utvalgte 3′-UTR ble identifisert basert på de som kommenterte i Ensembl database (frigjøre 54) for følgende transkripsjoner:
akt2 plakater (ENST00000392038),
BRAF plakater (ENST00000288602)
CCNE1 plakater (ENST00000262643),
CTNNB1 plakater (ENST00000349496),
EGFR plakater (ENST00000275493 og ENST00000344576),
ErbB2 plakater (ENST00000269571),
FGF1 product: (ENST00000359370),
KRAS plakater (ENST00000256078),
MYC plakater (ENST00000259523 og ENST00000377970),
PIK3CA plakater (ENST00000263967),
RAB25
(ENST00000361084),
BRCA1 plakater (ENST00000309486),
BRCA2 plakater (ENST00000380152),
CDKN2A plakater (ENST00000304494),
PTEN plakater (ENST00000371953),
RB1 product: (ENST00000267163),
SPARC plakater (ENST00000231061) og
TP53 plakater (ENST00000269305). De genomiske koordinater for menneske forløper mirnas ble hentet fra Sanger Institute miRBase (slipp 13,0, mars 2009) [40], [41], inkludert 548 individuelle miRNA gener samt 164 mirnas innenfor 62 miRNA klynger. Alle koding eksoner av
TP53
,
KRAS Hotell og
PIK3CA
ble inkludert for sekvensanalyse.
Bibliotek forberedelse og target berikelse
200 ng av tumor eller matchet normal lymfocytt-DNA var tilfeldig fragmentert til omtrent 200 bp (Covaris, Woburn, MA) og ende reparasjon og A-tailing utført i henhold til Illumina genomiske DNA-bibliotek fremstilling protokoll (Illumina, San Diego, CA). Etter dette ble DNA ligert med en av 7 tilpasset multipleksing adaptere kompatibel med Illumina enkelt slutten sekvensering. Indekserte DNA-prøver ble samlet like før PCR berikelse. Alle reagenser som brukes under fremstilling av bibliotek ble erholdt fra New England Biolabs (NEB, Ipswich, MA). Et boutique ekson fangst (atVelg, Agilent Technologies, Santa Clara, CA) ble brukt til å spesifikt berike for utvalgte 3′-UTR, mirnas og koding eksoner av kreftgener fra genomiske DNA-biblioteker før neste generasjon sekvensering. Capture prober ble utformet ved hjelp av standardparameterne ved å sende genomiske koordinater til eArray (Agilent Technologies, Santa Clara, CA). Løsning hybridisering, ble vasking, eluering og forsterkning utført i henhold til det anbefalte protokollen.
Somatisk mutasjon analyse av Illumina GAIIx sekvensering og kapillær elektroforese
Target beriket DNA-bibliotekene ble sekvensert på en Illumina GAIIx, genererer 75 bp enkelt slutten sekvens leser. Bildeanalyse og basen kall ble utført ved hjelp av Genome Analyser Pipeline v1.6. Sequence leser ble justert til den menneskelige referansen genom (GRCh37 /hg19 montering) med BWA og resterende kartlagt leser ble justert med Novoalign programvare [42]. Dette ble etterfulgt av lokal omstilling med GATK [43]. Punktmutasjoner og innsett /slettinger (indels) ble identifisert ved hjelp av GATK og henholdsvis Dindel [44] og kommenterte med informasjon fra Ensembl utgivelse 56. Kun mutasjoner innenfor miRNA transkripsjoner kommenterte i miRBase ble vurdert for videre analyse.
punktmutasjoner og indels ble identifisert som somatiske endringer bare når (
i
) varianten ikke ble kalt i den matchende normal prøve eller identifisert som en germline endring i en annen tumor /normal par (
ii
) den varianten ble ikke sett i 2% av lyder i den matchende normal prøve følgende manuell inspeksjon av sekvensen leser bruker Integrated Genomics Viewer [45] (
iii
) varianten ble identifisert i minst fire unik sekvens leser med minst to kartlegging i den fremre og to tilordning i omvendt retning.
Alle mutasjoner som har møtt de ovenfor nevnte kriterier ble utsatt for validering av konvensjonelle PCR-amplifisering og toveis kapillær elektroforese på ABI3130 Genetic Analyzer ved hjelp BigDye Terminator v3 0,1 sekvense kjemi (Applied Biosystems, Foster City, California).
Identifikasjon av miRNA-bindingssteder
TargetScan (slipp 5.2) [46], mikrokosmos Targets (versjon 5) [40 ], DIANA-mikrotiterplater (versjon 3.0) [47], [48] og Miranda (release august 2010) [49] prediktive algoritmer ble brukt til å bestemme om de somatiske mutasjoner påvist i mRNA 3’UTRs skjedde innenfor miRNA bindingssteder. En mirSVR stillingen terskel på mindre enn -0,1 og minst folding energi stillingen terskel på mindre enn eller lik -16 kcal /mol ble anvendt for Miranda algoritmen. Standardparametere ble brukt for alle andre algoritmer.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
Forut sekundære strukturen endres som følge av somatiske mutasjoner i miRNA transkripsjoner. Eldre sekvenser er skygget og det muterte basen indikeres av pilspissen i (a)
HSA-MIR-622
, (b)
HSA-MIR-1280 Hotell og (c)
HSA -miR-767-5p
. Forløperen miRNA sekvens pluss 50 bp flankerer forløper ved 5 «og 3» endene ble brukt til å forutsi sekundærstruktur med lavest fri energi ved RNAfold programmet [29] med standardparameterne
doi:. 10,1371 /journal. pone.0035805.s001 product: (PDF)
Figur S2.
akt2 Hotell og
EGFR
mRNA uttrykk ikke er endret i nærvær av 3′-utranslatert region somatiske mutasjoner i forhold til andre eggstokkene prøver av samme subtype. (A)
akt2
uttrykk i endometrioid svulster, blant annet eksempler på P1768 med en
akt2
c * 892C . T somatisk mutasjon (angitt i rødt). mRNA expression profilering data er innhentet fra Tothill
et al.
[50].
akt2
uttrykk probe setter 225471_s_at og 226156_at vises. (B)
EGFR
uttrykk i endometrioid svulster, blant annet eksempler på IC151 med en
EGFR
c * 101C . G somatisk mutasjon (angitt i rødt). mRNA expression profilering data er innhentet fra Ramakrishna
et al.
[51]. Feilfelt er representative for gjennomsnittlig ± SD
doi:. 10,1371 /journal.pone.0035805.s002 product: (PDF)
Tabell S1.
Kliniske karakteristika ovarietumorer sekvensert for somatiske mutasjoner i mikroRNA gener og kandidat 3′-uoversatt regioner.
doi: 10,1371 /journal.pone.0035805.s003 plakater (XLS)
Takk
Vi erkjenner takknemlig samarbeid med institusjonene i Australia deltar i den australske Ovarian Cancer Study (AOCS). Vi erkjenner også bidraget fra AOCS studie sykepleiere, vitenskapelig assistent og alle kliniske og vitenskapelige medarbeidere og ønsker å takke alle de kvinnene som deltok i AOCS. Medlemmer av den australske Ovarian Cancer Study Group, kan samarbeidspartnere og sykehus som er involvert i AOCS finnes på https://www.aocstudy.org
Australian Ovarian Cancer Study Group. David Bowtell (Peter MacCallum Cancer Centre, East Melbourne, Victoria, Australia), Georgia Chenevix-Trench (Queensland Institute of Medical Research, Brisbane, Queensland, Australia), Adele Grønn (Queensland Institute of Medical Research, Brisbane, Queensland, Australia), Penny Webb (Queensland Institute of Medical Research, Brisbane, Queensland, Australia), Anna DeFazio (Westmead Institute for Cancer Research, Westmead Millennium Institute, Westmead, New South Wales, Australia), Dorota Gertig (viktoriansk Cervical Cytologi registeret, Carlton South, Victoria, Australia).
