Abstract
Prostatakreft (PCA) fortsatt som en av de vanligste årsaken til kreftrelaterte dødsfall blant menn i USA. Den brukte prostata spesifikt antigen (PSA) screening er begrenset av lav spesifisitet. Den diagnostiske verdien av andre biomarkører som RAS forening domene familie protein 1 A (RASSF1A) promoter metylering i prostatakreft og forholdet mellom RASSF1A metylering og patologiske funksjoner eller svulst scenen gjenstår å bli etablert. Derfor ble en meta-analyse av publiserte studier utført for å forstå sammenhengen mellom RASSF1A metylering og prostatakreft. I alt ble 16 studier med 1431 tilfeller og 565 kontroller samlet med en tilfeldig effekt modell i denne undersøkelsen. Sannsynlighetsforholdet (OR) av RASSF1A metylering i PCa tilfelle, sammenlignet med kontroller, ble 14,73 med 95% KI = 7,58 til 28,61. Stratifisert analyser konsekvent viste en tilsvarende risiko på tvers av ulike prøvetyper og, metylering deteksjonsmetoder. I tillegg ble RASSF1A metylering forbundet med høy Gleason score OR = 2,35, 95% KI: 1,56 til 3,53. Videre samlet spesifisitet for alle inkluderte studiene var 0,87 (95% KI: 0,72 til 0,94), og den samlede sensitiviteten var 0,76 (95% KI: 0,55 til 0,89). Spesifisitet i hver undergruppe stratifisert etter prøvetype holdt seg over 0,84 og følsomheten også holdt seg over 0,60. Disse resultatene antydet at RASSF1A arrangøren metylering ville være en potensiell biomarkør ved PCA diagnose og terapi
Citation. Pan J, Chen J, Zhang B, Chen X, Huang B, Zhuang J et al. (2013) Sammenheng mellom RASSF1A Arrangøren Metylering og prostatakreft: en systematisk oversikt og meta-analyse. PLoS ONE 8 (9): e75283. doi: 10,1371 /journal.pone.0075283
Redaktør: Ken Mills, Queens University Belfast, Storbritannia
mottatt: Mai 20, 2013; Akseptert: 14. august 2013, Publisert: 20.09.2013
Copyright: © 2013 Pan et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet med tilskudd fra China National Natural Science Foundation (81272809); Støttet av Science and Technology Planning Project of Guangdong (2011B050400021) og Guangdong Key Laboratory of Urology, Den første tilknyttet Hospital of Guangzhou medisinsk University (2010A060801016). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Prostatakreft er fortsatt som en av de vanligste årsaken til kreftrelaterte dødsfall blant menn i USA, med anslagsvis 29,720 dødsfall anslått i 2013 [1,2]. Prostatakreft er helbredelig hvis oppdaget tidlig ved digital rektal undersøkelse og prostataspesifikt antigen (PSA) i serum [3]. Med en følsomhet på 80%, PSA-screening signifikant øker tidlig diagnose av prostatakreft, men PSA-screening har bare 20% spesifisitet, noe som kan føre til unødvendige biopsier og overbehandling [4]. Derav diagnostisering og behandling blir forvirret av mangelen på kreftspesifikke diagnostiske teknikker som skal brukes under tidlige stadier av sykdommen. Novel tilnærminger for den definitive påvisning og kontroll av denne kreftformen er sterkt behov.
Molekylære studier har avdekket viktige hendelser i prostatakreft utvikling og progresjon, og fremveksten av nye biomarkører kan forbedre diagnostikk av prostatakreft [5]. Avvikende DNA-metylering av gen-promotorer er karakteristisk for kreftceller, og flere gener er epigenetiske endret på en bestemt måte kreft. GSTP1 genpromoteren metylering er allment kjennetegnet ved flere uavhengige grupper, og er funnet å være ha diagnostisk verdi på prostatakreft [6,7]. Hittil er mer enn hundre gener rapportert som metylering mål i prostatakreft, som kan representere en lovende metode for å overvåke forekomst og progresjon av kreft [7-9]. Nylig har neste generasjons sekvensebaserte studier også identifisert flere kandidat gener [10]. Det kromosomale region 3p21 er utsatt for hyppig tap (heterozygot og homozygot) i flere tumortyper, RAS krets domene familie protein 1 A (RASSF1A) genet ligger i dette området, er en antatt tumor suppressor som deler høy sekvenshomologi med en kjent muse protein (Nore1) [11,12]. Studier antyder rolle for RASSF1 som effektoren som forplanter de apoptotiske virkninger av RAS ved binding RAS i en guanosin-trifosfat avhengig måte [13]. Hypermethylation av CPG øyene innenfor RASSF1A promoter-regionen er den viktigste årsaken til tap av uttrykk [14]. I mange faste tumorer, har metylering av RASSF1A blitt identifisert og dens frekvens varierer mellom 30% til 50% [12]. Derfor påvirker RASSF1A metylering sin tumor suppressor rolle og er forbundet med ugunstig prognose [15,16].
Til tross for en rekke enkeltstudier utført på pasienter med prostatakreft, den diagnostiske verdien av RASSF1A metylering status på prostatakreft og forholdet mellom RASSF1A metylering og patologiske funksjoner eller svulst scenen er fortsatt kontroversielt. Derfor hensikten med denne studien var å gjennomføre en meta-analyse på den prognostiske verdien av RASSF1A metylering status på prostatakreft, og forholdet mellom RASSF1A metylering og patologisk stadium, Gleason score, og PSA-nivå. Vi vurderte også sensitivitet og spesifisitet av RASSF1A metylering i kroppsvæsker og vev på å oppdage prostatakreft.
Materialer og Metoder
Study utvalg
Tidligere publiserte artikler som studerte RASSF1 promoter DNA metylering i prostatakreft ble identifisert via et elektronisk søk i PubMed ved hjelp av følgende stikkord; Prostatakreft, PCA, RAS forening domene familie protein1A, og RASSF1A. Ytterligere studier ble funnet via referanselistene til de identifiserte artiklene. Bare studier publisert som fulltekstartikler på engelsk ble inkludert i denne studien. Den siste gjenfinning ble gjennomført i mars 2013.
inklusjons- og eksklusjonskriterier
Studier ble valgt for analyse hvis de oppfylte følgende kriterier (1): måling av DNA metylering i en av følgende prøver : blod, plasma, serum, urin eller prostata vev; (2) fagene i hvert studium består av prostatakreftpasienter og ikke-kreft kontroller; (3) Data ble inkludert i analysen bare hvis den fullstendige teksten i artikkelen var på engelsk. Eksklusjonskriterier var: (1) RASSF1A metylering gjennomført bare i cellelinjer; (2) ingen rådata tilgjengelige eller kan ikke hente noen rådata; (3) gjennomgang papirer.
Datainnsamling
For hver studie, to uavhengige etterforskere hentet følgende informasjon som inkluderer forfatterens etternavn, årstall, land, rase, type saker og kontroller. I tillegg ble også samlet inn informasjon om hvilken type analysemetode (for eksempel PCR), kreft klinisk stadium klassifisering, PSA, Gleason stillingen, primere plassering, CpG plassering og primere sekvens. Data er oppsummert i Tabell 1, Tabell S2 og S3 Tabell. Før vi gjennomførte sensitivitet og spesifisitet analyser, ble saken og kontroll metylering data ordnet. Blant de inkluderte studiene ble to kategorier tildelt som kontroller: friske kontrollpersoner og pasienter som hadde negative biopsier men hadde andre sykdommer, inkludert benign prostatahyperplasi (BPH). Kun biopsi bekreftet PCa og høy grad av prostata intra-epitelceller neoplasi (HGPIN) ble behandlet som saker. Derav den sanne positive (TP) prøver ble begrenset til de som hadde metylering i indeksen saken, mens den falske negative (FN) ble angitt å ha noen metylering blant saks prøvene. De samme definisjonene ble gitt for falsk positive (FP) og sant negative (TN) i kontroller (tabell S1).
Forfatter
Country
År
Eksempel
Metoder
sak
Kontroll
sak Met
sak Umet
Kontroll Met
Kontroll Umet
1.Hoque et alUSA2005UrineQMSPPCaBPH /OCD eller Normal
# 38 (73,1%) 1410 (11,0%) 812. Roupret et alFrance2007UrineQMSPPCaNormal
# 74 (77,9%) 213 (7,9%) 353.Bastian et alPortugal2008SerumMSPPCaNormal
# 3 (1,4%) 2070 (0) 354.Roupret et alUK2008BloodQMSPPCaBPH41 (97,6%) 15 (22,7%) 175 .Maruyama et alUSA2002TissueMSPPCaBPH /Normal * (7) 54 (53,5%) 475 (15,6%) 276.Kang et alKorea2004TissueMSPPCa /HGPINNormal
# 40 (78,4%) 110 (0) 207.Jeronimo et alPortugal2004TissueQMSPPCa /HGPINBPH117 (99,2% ) 128 (93,3%) 28.Yegnasubramanian et alUSA2004TissueQMSPPCaNormal * (12) 70 (95,9%) 30 (0) 259.Singal et alUSA2004TissueMSPPCaBPH40 (49,4%) 418 (19,0%) 3410.Woodson et alUSA2004TissueQMSPPCa /HGPINNormal * (11) 23 (67,6%) 110 (0) 1111.Florl et alGermany2004TissueMSPPCaNormal
# 88 (77,9%) 2519 (52,8%) 1712.Bastian et alGermany2005TissueQMSPPCaBPH36 (67,9%) 174 (28,6%) 1013.Cho et alKorea2007TissueMSPPCaBPH155 (86,6%) 247 (23,3%) 2314.Kawamoto et alJapan2007TissueMSPPCaBPH97 (74,0%) 3412 (18,5%) 5315.Syeed et alIndia2010TissueMSPPCaBPH17 (34,0%) 337 (15,6%) 3816.Vasiljevic et alUK /China2011TissuePYROPCaBPH44 (91,7%) 42 (6,9%) 27Table 1. Kjennetegn på studier som inngår i meta-analysen
BPH, Benign prostatahyperplasi.; MSP, Methlation Spesifikke PCR; QMSP, Kvantitativ Real time Metylering Spesifikk PCR; PYRO, pyrosekvensering; Met, metylering; Umet, ingen metylering; PCA prostatakreft; HGPIN, High Grade Postatic intraepitelial neoplasi, OCD, andre kreftsykdommer; * Tall i parentes under kontroll kolonne indikerer matchet normalt vev; # Indikerer normal prostata vev fra menn med ingen bevis for prostatakreft. CSV Last ned CSV
Meta-analyse og statistiske analyser.
Odds ratio (OR) med tilsvarende 95% KI ble brukt for å undersøke forskjeller i hyppigheten av RASSF1A metylering mellom prostatakreft saken og kontroller. Tilsvar sammenhengen mellom RASSF1A metylering og prostatakreft patologisk stadium, Gleason score, og PSA nivåer ble også undersøkt. For å vurdere heterogenitet på tvers av studiene ble en statistisk test for heterogenitet utført. Ved undersøkelsene ble vist å være homogent med P 0,05 til Q-statistikk ble sammendrag av OR beregnet ved en fast-effekt-modell, ellers ble en tilfeldig effekt-modellen valgt. I tillegg ble det stratifiserte analyser også utført ved eksempler og metoder ble meta-regresjon benyttes for å studere heterogenitet kilde, og en sensitivitetsanalyse, ved hvilken en enkelt undersøkelse i meta-analyse ble slettet hver gang for å bestemme innvirkningen av den enkelte datasett til den totale samlede OR, ble utført for å bedømme stabiliteten. Potensialet publikasjonsskjevhet ble undersøkt visuelt av en trakt plotting av log [OR] mot dens standardfeil (SE), og graden av asymmetri ble testet ved Egger test. Endelig en trim-and-fill metoden ble brukt til å trekke stabil konklusjon. Denne meta-analyse ble utført ved hjelp av programvaren STATA 11.0. Alle p-verdier var basert på tosidige tester og p 0,05 ble ansett som statistisk signifikant
Følsomhet og spesifisitet ble analysert ved hjelp av tilfeldig effekt-modeller, og i denne analysen, både væske og vev undergrupper ble behandlet.. Vi utnyttet sammendraget mottar drift karakteristisk (S-ROC) kurve, for å vurdere om variasjonen i terskelen definisjonen av et positivt resultat produsert en sammenheng mellom sensitivitet og spesifisitet verdier på tvers av studier. Beregning av lineær regresjon av log-odds ratio fra hver studie på summen av logits av de sanne positive og falske positiver aktivert S-ROC beregninger. Når regresjon mellom disse mengdene var null, ble en uavhengig analyse av sammenslåtte sensitivitet og spesifisitet ved hjelp av standardmetoder for binære data tatt i bruk. Under disse omstendighetene, ble data analysert på log-odds skala (for eksempel for sært, effekten størrelsen var log (Spec /(1-Spec)). Alle analysene ble utført i STATA 11.0.
Resultater
Studie kjennetegn
totalt 16 kvalifiserte studier med 1431 tilfeller og 565 kontroller ble inkludert i den samlede analyser basert på våre inklusjonskriterier [15-30]. det som kjennetegner disse studiene er oppsummert i tabell 1. blant de 16 studier, 12-studiene benyttet vevsprøver og 4, karakterisert kroppsvæsker slik som blod, urin blant andre. de metylerte RASSF1A nivåer ble overvåket ved anvendelse av enten metylering spesifikk PCR (MSP), kvantitativt metylering spesifikk PCR (QMSP) eller pyrosekvensering. Alle tilfellene var fra biopsi bekreftet PCa eller HGPIN, mens kontroller ble begrenset til enten BPH, friske eller de som hadde genitourinary kreft (blære carcinoma) med en sunn prostata. prøvene fra 11 studier var hovedsakelig fra fagene kaukasiske rase, mens fire studier preget prøver fra asiatiske befolkningen, en studie inkluderte fag fra flere raser som stammer fra forskjellige kontinenter. Prostatakreft ble bekreftet patologisk i alle studiene.
Association mellom RASSF1A promoter metylering og patologisk stadium, Gleason score, og PSA nivåer ved PCA tilfeller
Under tilfeldig effekt modellen, den samlede OR av RASSF1A metylering i prostata krefttilfeller, sammenlignet med ikke-kreft-kontroller, ble 14,73 med 95% KI = 7,58 til 28,61 (tabell 2). I stratifisert analyse av prøven, ble betydelig økt risiko forbundet med RASSF1A metylering i begge væskeprøver (OR = 26,27, 95% CI = 7.79-88.61) og i vev (OR = 12,28, 95% CI = 5,86 til 25,76). Som stratifisert analyse av metoden ble betydelig økt risiko også i MSP (OR 6,75, 95% CI = 3,42 til 13,22) og QMSP (OR = 31,50, 95% CI = 10,95 til 90,62) (figur 1A). Vi har også gjennomført en analyse av forholdet mellom patologisk stadium, Gleason score, og PSA nivåer blant PCA saker og RASSF1A metylering. Syv studier [17,19,21-23,25,26] hadde tilstrekkelig informasjon til å utføre denne analysen (tabell S2), fant vi ingen signifikant sammenheng mellom grupper med de riktige modeller unntatt for Gleason score (OR = 2,35, 95% KI: 1,56 til 3,53, jeg
2 = 32,3%). Detaljer er vist i Tabell 3.
Variabler
p
en
OR (95% CIS)
Heterogenitet Test (I
2, p-verdi)
RASSF1ATotal1614.73 (7,58 til 28,61) 75,5%, 0.000Sample TypeFluid426.27 (7,79 til 88,61) 56,6%, 0.075Tissue1212.28 (5,86 til 25,76) 75,5%, 0.000MethodQMSP731.50 (10,95 til 90,62) 61,8%, 0.015MSP86.75 ( 3,42 til 13,22) 67,9%, 0.003Pyrosequencing1148.50 (25,45 til 866,36) NATable 2. Stratifisering analyser av RASSF1A metylering og prostatakreft risiko
MSP, metylering-Specific PCR.; QMSP, Kvantitativ sanntid Metylering Spesifikk PCR; ELLER, Odds Ratio, KI, konfidensintervall;
en rekke studier; NA, Ikke relevant. CSV Last ned CSV
(A) Forest tomt på 16 studier viste at RASSF1A metylering var assosiert med PCa risiko som stratifisert analyse av metoder. (B) Forest tomten etter sensitivitetsanalyse fjerne 6 studier viste samme risiko uten heterogenitet (p = 0,089). Diamanten symbolet representerer det totale anslaget fra meta-analyse og dens CI (konfidensintervall), mens midten er plassert på verdien for den samlede effekten anslaget. Diamond bredde viser bredden av den samlede CI.
Clinicopathology
Kategori
OR (95% CIS)
Heterogenitet test (I
2, P-verdi)
Publication skjevhet test (P-verdi)
Gleason scoreGS≥72.35 (1,56 til 3,53) 32,3%, 0.1820.40GS 7PSA levelsPSA 4 2,19 (0.27-17.76) 67,4%, 0.0460.04PSA≤4Pathological stageⅢ ⅳ2.01 ( 0.77-5.23) 68,4%, 0.0070.73Ⅰ ⅱTable 3. Sammenheng mellom RASSF1A promoter metylering og patologisk stadium, Gleason score, og PSA nivåer i PCA tilfeller
OR, Odds ratio.; KI, konfidensintervall; PSA, prostataspesifikt antigen; GS Gleason Score. CSV Last ned CSV
Resultatene fra meta-regresjon viste at utviklingen i ORS korrelerte med metylering deteksjonsmetoder, som utgjorde en del av heterogenitet (koeffisient = -1,69, p = 0,024, justert R
2 = 47,41% ), men andre faktorer som prøvetyper (p = 0,525), årstall (p = 0,608), og opprinnelsen av pasientene (p = 0,847) kunne ikke forklare heterogenitet. Vi utførte også sensitivitetsanalyser for å fastslå effekten av å utelate en eneste studie på den samlede effekten hvor seks uavhengige studier ble funnet å introdusere noen kilde til heterogenitet. Derfor når vi utelatt de seks studiene som sannsynligvis ville innføre høy heterogenitet på grunn av ulike typer saker og kontroller, observerte vi en nedgang i heterogenitet (p = 0,089) med stabil konklusjon (OR = 14,45, 95% CI = 8,35 til 25,01) ( . Figur 1B)
Vi har ikke observere noen publikasjonsskjevhet (Egger test; p = 0,066), og ytterligere bekreftet denne observasjonen ved å implementere en trim-and-fill-metoden. Meta-analyse med eller uten trim-and-fill metoden ikke trekke ulike konklusjoner, noe som indikerer at resultatene var statistisk robust. Egger test antydet fravær av publikasjonsskjevhet (P . 0 05). I studier av foreningen mellom RASSF1A metylering og patologisk stadium eller Gleason score (tabell 3)
spesifisitet og sensitivitet av RASSF1A arrangøren metylering ved hjelp av ulike typer prøver
den sammenslåtte spesifisitet for alle inkluderte studiene var 0,87 (95% KI: 0,72 til 0,94), og den samlede sensitiviteten var 0,76 (95% KI: 0,55 til 0,89). For den tradisjonelle biomarkør, følsomheten av PSA variert, men spesifisiteten var generelt lav ved omtrent 20%, noe som antydet at RASSF1A metylering testen har en mye høyere spesifisitet enn PSA-test. P-verdien for heterogenitet var mindre enn 0,001, noe som indikerer en betydelig heterogenitet. Det var ingen tegn på publikasjonsskjevhet (p = 0,13). I tillegg klassifisert vi alle prøver i to grupper etter prøvetype (væske /vev). Blant de væske studier (urin /blod /plasma), den samlede sensitivitet og spesifisitet var 0,60 (95% KI: 0,08 til 0,96) og 0,93 (95% KI: 0,75 til 0,98), henholdsvis. For vevet studier, den samlede sensitivitet og spesifisitet var 0,79 (95% KI: 0,64 til 0,89) og 0,84 (95% KI: 0,63 til 0,94), henholdsvis og S-ROC-kurven er presentert i figur 2.
SENS: følsomhet, SPEC: spesifisitet, AUC:. arealet under kurven
Diskusjoner
resultatene fra vår meta-analyse viste at RASSF1A metylering i prostata kreft var signifikant forbundet med kreftrisiko når overvåkes i urin, blod eller vevsprøver. Det var også assosiert med økt risiko for høy Gleason score. Det sammenslåtte spesifisitet (0,87) av RASSF1A var mye høyere enn spesifisiteten av PSA (20%). I tillegg spesifisitet i hver undergruppe stratifisert etter prøvetype holdt seg over 0,84 og følsomheten av RASSF1A også holdt seg høyt over 0,60. Disse resultatene antydet at RASSF1A promoter metylering ville være en verdifull i diagnostisering av biomarkør PCa.
DNA metylering er en vanlig mekanisme for inaktive tumor-suppressor-gener i-kreft [10]. Overvåking avvik metylering mønstre har hjulpet i påvisning av tumorceller i kliniske prøver som vev biopsi eller kroppsvæsker. RASSF1A er en antatt tumorsuppressorgen og spiller en viktig rolle i reguleringen av forskjellige typer av humane tumorer. Tidligere rapporter har vist at genetisk variant av RASSF1A påvirke prostatakreft følsomhet og frekvens av RASSF1A metylering ble funnet å være signifikant høyere hos pasienter gruppen sammenlignet med kontrollgruppen [13]. For ytterligere å bekrefte RASSF1A promoter metylering status ved PCA pasientens diagnose, gjennomførte vi en meta-analyse av 16 studier med 1431 tilfeller og 565 kontroller for å utlede en mer presis estimering av foreningen. Våre resultater antydet at RASSF1A metylering er en potensiell risikofaktor for PCa som detektert både i kroppsvæsker og vev. Frekvensen av RASSF1A metylering i PCA tilfeller var 14.73 ganger høyere enn hos kontrollpersoner. I tillegg, på grunn av forskjeller mellom saker og kontroller mellom studier, utførte vi sensitivitetsanalyser og fjernet enkelte studier for å gjøre data mer homogen og observerte ingen store endringer i vår konklusjon. Viktigere, hyppig metylering av RASSF1A genet viste signifikant sammenheng med Gleason score, selv om det ikke korrelerer med patologiske scenen eller PSA nivåer i denne studien.
Som vist tidligere, hadde PSA-test varierende sensitivitet og lav spesifisitet (ca. 20%) [1]. Tester som gir høyere spesifisitet i stedet for følsomhet og utfyller PSA-testing er dagens krav. Lovende, våre resultater viser at RASSF1A metylering testing har et potensial til å utfylle PSA screening på grunn av høy spesifisitet. Her mener vi en sekvensiell testing av modellen vil være mer nyttig hvor PSA-test starten vil bli brukt til å identifisere pasienter med forhøyede nivåer PSA, etterfulgt av metylering RASSF1A test for å øke sann positivitet. Pasienter med negativ RASSF1A test kan plasseres på vaktsom venter, mens personer med positive resultater kan anbefales for biopsier. Dermed sekvensiell testing vil sterkt redusere unødvendige biopsi anbefalinger basert utelukkende på PSA-testing.
I denne studien har flere begrensninger. Først den heterogenitet i metodene som anvendes som MSP, Q-MSP og pyrosekvensering for å overvåke genet promoter metylering. Basert på studier utført, vil det være nyttig dersom en konsensus kunne være kommet til en standardtester. Sekvense baserte teknikker er generelt ansett for å ha overlegen ytelse i forhold til metoder som benytter PCR alene. Den raskt å få fart i å bruke neste generasjons sekvensering (NGS) analyser for å overvåke genomisk og epigenomic endringer vil sikkert innlede fremskritt på dette området [31]. Man kan forutse utviklingen av omfattende diagnostiske tester som samtidig vil måle transkripsjon uttrykk og DNA metylering endringer av et panel av biomarkører i tillegg til å identifisere genetiske avvik som Genfusjonene og kopi nummer varianter for hver pasient [32]. Den aktuelle studien sammen med andre hjelper i shortlisting biomarkører for stort potensiale som vil bli gitt spesiell oppmerksomhet mens analysere NGS resultater som vanligvis produserer en lang liste med denaturert regioner. Deretter de forskjellige prøvetyper anvendt i disse studiene som omfatter plasma, serum, urin, helt blod og vev er en potensiell kilde for heterogenitet. Her igjen utvikling av høy ytelse robuste analyser med høy sensitivitet og spesifisitet kan bidra til å løse dette i nær fremtid.
Konklusjon
Denne metaanalyse har vist at RASSF1A metylering i prostatakreft var assosiert med kreftrisiko på tvers av ulike studiepopulasjoner. RASSF1A er en lovende biomarkør for screening og identifisering PCa spesielt kombinert med PSA-test for å få ned frekvensen av unødvendige biopsier. Fremtidige studier med større utvalg kohort og nye analyser basert på neste generasjons sekvensering tilnærminger vil bidra til ytterligere å styrke våre observasjoner.
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1.
Kjennetegn på studier som inngår i meta-analysen.
doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s001 plakater (XLSX)
Tabell S2.
Detaljer om studier inkludert i meta-analyse: Sammenhengen mellom RASSF1A promoter metylering og patologisk stadium, Gleason score, og PSA nivåer.
doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s002 plakater (XLSX)
tabell S3.
Oppsummering av primer sekvenser som brukes i metylering studie av RASSF1A.
doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s003 plakater (XLSX)
Takk
Vi ønsker å takke dr Srinivasan Yegnasubramanian (Johns Hopkins University) for å gi relatert rådata og Dr. Saravana Mohan Dhanasekaran (University of Michigan) for diskusjon og manuskript forberedelse.
