Abstract
Formål
Xeroderma pigmentosum gruppe D (
XPD
) koder for et DNA helicase involvert i nucleotide excision reparasjon som fjerner platina-indusert DNA skade. Genetisk polymorfisme av XPD kan påvirke DNA-reparasjon kapasitet og føre til individuelle forskjeller i utfallet av pasienter etter kjemoterapi. Denne studien tar sikte på å finne ut om
XPD
polymorfismer påvirker klinisk effekt blant avansert ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) hos pasienter behandlet med platinabasert kjemoterapi.
Experimental Design
353 stadium III-IV NSCLC pasienter som fikk platinumbasert kjemoterapi som førstelinjebehandling ble inkludert i denne studien. Fire potensielt funksjonelle
XPD
polymorfismer (
Arg
156Arg
,
Asp
312Asn
,
Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
) ble genotypet ved matriks-assistert laser desorpsjon /ionisering time-of-flight massespektrometri eller PCR-basert sekvensering.
Resultater
Variant genotyper av
XPD Asp
312Asn, Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
var signifikant assosiert med dårligere NSCLC overlevelse (
P
= 0,006, 0,006, 0,014 henholdsvis ved log-rank test). Den vanligste haplotype GCA (i rekkefølge
Asp
312Asn, Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
) viste også betydelig risiko effekt på NSCLC overlevelse (log rank
P
= 0,001). Denne effekten var mer dominerende for pasienter med stadium IIIB sykdom (
P
= 2,21 × 10
-4, log-rank test). Økt risiko for variant haplotyper av
XPD
ble også observert blant pasienter med funksjonsstatus på 0-1 og pasienter med adenokarsinom. Det ble imidlertid ingen signifikante assosiasjoner funnet mellom disse polymorfismer, kjemoterapi respons og PFS.
Konklusjoner
Vår undersøkelse gir bevis for prediktiv rolle
XPD Asp
312Asn, Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
polymorfismer /haplotype på NSCLC prognose i ubrukelige avanserte NSCLC pasienter som behandles med platinabasert kjemoterapi
Citation. Wu W, Li H, Wang H, Zhao X, Gao Z, Qiao R, et al. (2012) Effekt av Polymorfisme i
XPD
på kliniske resultater av platinabasert kjemoterapi for kinesisk ikke-småcellet lungekreft pasienter. PLoS ONE 7 (3): e33200. doi: 10,1371 /journal.pone.0033200
Redaktør: Alfons Navarro, Universitetet i Barcelona, Spania
mottatt: 09.11.2011; Godkjent: 06.02.2012; Publisert: 29 mars 2012
Copyright: © 2012 Wu et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet delvis av China National High-Tech Research and Development Program Grant (2012AA02A517, 2012AA02A518), Shanghai Science and Technology Research Program (06DZ19501, 09JC1402200, 10410709100), vitenskapelig og teknologisk støtte planer fra Jiangsu provinsen (BE2010715), Natural Science Foundation of China (30800622) og Shanghai Subject Chief Scientist for folkehelse 08GWD07. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) står for ca 80% av primærlungekrefttilfellene, med de fleste av pasientene diagnostisert ved avansert stadium (stadium III eller IV) [1]. Selv om kjemoterapi involverer platina agenter representerer en av de mest vanlige første-linje behandling for disse pasientene [2], forblir 5-års overlevelse mindre enn 15% [3]. Kliniske faktorer, som for eksempel pasient funksjoner (alder og funksjonsstatus) og sykdom forlengelse, grovt preget av scenen, forble de store bestemmelser for prognose av NSCLC [4]. Men variasjon i resultatene har likevel blitt observert hos pasienter med lignende kliniske funksjoner. Det virker som vert arvet faktorer kan ha en viktig rolle i fastsettelse av behandlingsresultatet for NSCLC, som fremhever nødvendigheten av å identifisere genetiske markører for optimalt individuell terapi [5].
Med tanke på at platina midler som brukes for kjemoterapi årsaken DNA skade eller celledød ved aktivering av cellesignalveier [6], vertens cellulære DNA reparasjon kapasitet muligens påvirker utfallet av NSCLC etter kjemoterapi. Tidligere studier har vist at DNA-reparasjon suboptimal kapasitet innen tumoren kan føre til en redusert fjerning av DNA-lesjoner, og dermed øke sensitiviteten til platinabasert kjemoterapi, noe som resulterer i bedre klinisk utfall [7] -. [9]
nukleotid excision reparasjon (NER) er den viktigste veien for reparasjon av platina-indusert DNA kryssbindinger i pattedyrceller [10].
XPD
genet koder for en ATP-avhengig helicase, som formidler DNA avkobling for igangsetting av NER [11]. Flere studier har vist at
XPD
polymorphisms ser ut til å ha en effekt på DNA-reparasjon kapasitet muligens ved å endre funksjonen av proteinproduktet [12], [13]. Vanligste variantene i
XPD
genet ble funnet å være korrelert med redusert kreftrisiko [14], [15]. Og kliniske og epidemiologiske bevis indikerer videre at
XPD Lys
751Gln
polymorfisme var signifikant assosiert med kjemoterapi effekt [16], [17]. Men for polymorfismer av
XPD Arg
156Arg Hotell og
XPD Asp
711Asp
, epidemiologiske data om kliniske utfall av NSCLC pasienter er fortsatt mangelvare. Derfor den prognostiske betydningen av
XPD
polymorfismer er fortsatt uklart.
XPD Asp
312Asn plakater (rs1799793) og
Lys
751Gln
(rs13181) polymorfismer er nonsynonymous enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs), som resulterer i en endring i aminosyresekvensen til proteinet. Mens de
Arg
156Arg plakater (rs238406) og
Asp
711Asp plakater (rs1052555) polymorfismer er begge tause mutasjoner. Vår tidligere studie har vist at variant genotyper av
XPD Arg
156Arg
var assosiert med økt risiko for alvorlig hematologisk toksisitet i kinesiske Han befolkningen [18].
Basert på disse observasjonene, vi antok at disse fire potensielt funksjonelle SNPs av
XPD product: (i kodon 156, 312, 711 og 751) kan påvirke NSCLC prognose. I denne studien bruker DNA-prøver hentet fra en serie av NSCLC pasienter, vurdert vi sammenhengen mellom
XPD
polymorfismer og overlevelse i avanserte NSCLC pasienter som behandles med platinabasert kjemoterapi.
Materialer og Metoder
Pasienter rekruttering og oppfølging
studiet design og fag rekruttering har blitt beskrevet tidligere [18]. Pasienter med inoperabel og histologisk bekreftet stadium III til IV NSCLC ble fortløpende rekruttert mellom mars 2005 og august 2008, fra Shanghai Chest Hospital i Shanghai, Kina. De kvalifiserte pasienter for denne studien var minst 18 år gammel og ble pålagt å oppfylle følgende kriterier: tilstedeværelsen av en målbar lesjon; Eastern Cooperative Oncology Group funksjonsstatus (ECOG PS) 0~2 (The Eastern Cooperative Oncology Group Performance Status er kriterier som brukes for å vurdere hvordan sykdommen påvirker hverdagen evne pasienter ved gradering det inn i 5 karakterer.) [19]; et absolutt nøytrofiltall (ANC) ≥1.5 × 10
9 celler /L; blodplater ≥100 × 10
9 celler /l; serumkreatinin ≤1.5 × øvre grense normal; Aspartataminotransferase (ASAT) og alaninaminotransferase (ALAT) ≤1.5 × øvre grense normal; estimert kreatininclearance ≥60 ml /min. Pasienter ble ekskludert hvis de hadde en forhistorie med kreft med unntak av ikke-melanom hudkreft, carcinoma
in situ
av livmorhalsen, eller en allerede kurert tumor ( 5-y sykdomsfri overlevelse); tidligere kjemoterapi, strålebehandling eller kirurgi; aktiv hjertesvikt, hjertearytmi, eller nylig ( 3 mnd før datoen for behandling) hjerteinfarkt; noen alvorlig psykisk lidelse; smittsom sykdom trenger immunterapi. En skriftlig informert samtykke ble gitt av hver pasient. Studien ble gjennomført med godkjenning av Etisk komitéen av sykehuset.
Før behandling, alle pasienter fikk evaluering inkludert fullstendig medisinsk historie, helseundersøkelse, scoret funksjonstilstand, rutinemessige kliniske biokjemiske tester, bryst røntgenbildene og computertomografi av brystet og magen. Data om demografiske og kliniske kjennetegn (inkludert alder, kjønn, røykestatus og tumorhistologi) ble innhentet fra kliniske journaler med gjennomgang av onkologer. For røykestatus, ble de som hadde røykt mindre enn en sigarett per dag og mindre enn ett år i sin levetid er definert som ikke-røykere, ellers ble de betraktet røykere. Informasjon om overlevelse statistikk ble samlet inn fra flere kilder, inkludert oppfølgingssamtaler, Social Security Death Index, og innleggelse og poliklinisk kliniske journaler. Alle etterforskerne var blind for genetisk polymorfisme status av pasienter.
Alle pasientene som deltok i denne studien var ubrukelig og fikk den første platinumbasert kjemoterapi. De kjemoterapeutiske regimer var som følger: navelbin (25 mg /m
2) på dag 1 og dag 8 og cisplatin (75 mg /m
2) eller karboplatin (AUC 5) på dag 1, gjentas hver 3. uke ; gemicitabine (1250 mg /m
2) på dag 1 og 8 pluss cisplatin (75 mg /m
2) eller karboplatin (AUC 5) på dag 1, hver 3. uke; Taxol (175 mg /m
2) pluss cisplatin (75 mg /m
2) eller karboplatin (AUC 5) på dag 1, hver 3. uke; docetaxel (75 mg /m
2) pluss cisplatin (75 mg /m
2) på dag 1, hver 3. uke. Noen få pasienter fikk andre platinabasert kjemoterapi. Alle kjemoterapi narkotika ble administrert intravenøst, og alle behandlinger var for to til seks sykluser. Pasient respons på behandlingen ble evaluert etter første linje sykluser med kjemoterapi av responsen evalueringskriterier i solide tumorer (RECIST) retningslinjer versjon 1.0.
Totalt 445 pasienter med avansert NSCLC deltok i denne studien, hvorav 353 hadde vært helt fulgt opp. Ingen statistisk signifikant forskjell ble observert i fordelingen av demografiske og kliniske trekk mellom pasientene i denne studien, og de som ikke gjorde det (data ikke vist). Som et resultat av dette ble vår endelige analysen begrenset til disse 353 pasienter.
SNP genotyping
Blodprøver ble tatt fra hvert fag på tidspunktet for rekruttering, og genomisk DNA ble ekstrahert ved hjelp QIAamp DNA maxi kit (Qiagen GmbH).
XPD Arg
156Arg
,
Asp
312Asn
, og
Asp
711Asp
polymorfismer ble bestemt ved bruk av Sequenom MassARRAY iPLEX plattformen ved matrisen -assisted laser desorpsjon /ionisering time-of-flight massespektrometer som tidligere beskrevet [18], og
Lys
751Gln
ble identifisert ved PCR-basert sekvensering. Primer sekvenser er tilgjengelig på forespørsel. Total, 98% av genotypene ble med hell bestemt for alle de SNP’er. For kvalitetskontroll, ble 5% prøver av fagene tilfeldig valgt å re-genotype. Alle duplikatprøvene hadde en genotype samstemmighet på 100%.
Statistisk analyse
Hardy-Weinberg likevekt ble testet for hver SNP av godhet-of-fit X
2 test. Pearson X
2 test (for kategoriske variabler) eller t-test (for kontinuerlige variabler) ble brukt til å sammenligne de demografiske og kliniske kjennetegn. Pasienter som oppnådde komplett respons (CR) eller partiell respons (PR) ble definert som «respondere», og pasienter med stabil sykdom (SD) eller progressiv sykdom ble definert som «ikke-respondere». Ytterligere analyser ble gjort ved å gruppere pasienter med CR, PR, og SD (definert som «pasienter med klinisk nytte») versus de med PD (definert som «pasienter uten klinisk nytte»).
Total overlevelse (OS) ble beregnet som tiden til døden fra dato for diagnose. Progresjonsfri overlevelse (PFS) ble beregnet som tiden til progresjon eller død uten progresjon fra dato for diagnose. Kaplan-Meier metoden ble brukt til å plotte PFS eller OS kurve, og den log-rank test ble brukt for å sammenligne fordelingen mellom gruppene. Multivariat Cox modeller ble brukt til estimert hazard ratio (HR) med 95% konfidensintervall (95% KI). Kliniske variabler med log-rank
P
0,05 i univariat analyse ble inngått multivariat analyse. På grunn av begrenset antall homozygote varianten genotyper,
Asp
312Asn, Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
polymorfismer ble modellert i en dominerende modellen. For koblingsulikevekt (LD) analyse, D «og r
2 verdier for genotypede SNPs ble beregnet ved Haploview programvare (https://www.broad.mit.edu/personal/jcbarret/haplo/). Den haplotype Vurderingen ble utført ved hjelp av PHASE 2.0. Data ble analysert ved bruk av SPSS, versjon 15.0 (SPSS Inc.). Alle P-verdiene var to sider, og statistisk signifikans ble satt til 0,05 nivå.
For å vurdere sjansen for å få en falsk-positiv sammenheng på grunn av flere hypotesetesting, vi brukte bayesiansk falske funnsannsynlighet (BFDP) test [20] for å beregne sannsynligheten for noen tilknytning til en moderat rekke tidligere sannsynligheter 0,1 og 0,05 på tilstedeværelsen av en krets. Den BFDP terskelen ble satt til 0,8, hvor en falsk non-funnraten er fire ganger så dyrt som en falsk funn.
Resultater
Pasient egenskaper og kliniske resultater
Demografisk og klinikk funksjoner i pasienter er presentert i tabell 1. median alder var 57 (intervall, 32-80 år), og 246 (69,7%) av pasientene var menn. Blant fagene, 34 (9,6%) hadde stadium IIIA sykdom, 107 (30,3%) hadde stadium IIIB, og 212 (60,1%) hadde stadium IV sykdom. Tatt i betraktning den histopatologiske typen, ble 213 (60,3%) pasienter diagnostisert med adenokarsinom, 75 (21,2%) med plateepitelkarsinom, 12 (3,4%) med adenosquamocarcinoma, og 53 (15,0%) med andre carcinoma.
Association mellom polymorfismer og klinisk nytte
Genotype informasjon presenteres i tabell 2. Alle genotypen distribusjoner var i samsvar med Hardy-Weinberg likevekt (
P
0,05). Assosiasjoner mellom polymorfismer og effekten utfallet av svarprosent og klinisk nytte ble vurdert ved hjelp av Pearson X
2 test og univariat logistisk regresjon. Ingen SNPs var signifikant prediktor for responsrate eller klinisk nytte samlet (tabell 2).
Association mellom
XPD
polymorfismer /haplotyper, PFS og OS
Tabell 3 viser PFS og OS analysedata ifølge undersøkt polymorfismer. Totalt median PFS var 7,3 måneder (95% konfidensintervall, 6.52-8.14 måneder). Selv
Lys
751Gln
polymorfisme viste marginal sammenheng med PFS, var det ingen signifikant forskjell i PFS med hensyn til
XPD
genotyper.
Asp
312Asn
,
Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
polymorfismer viste statistisk signifikante assosiasjoner med OS ved log-rank test (tabell 3, tabell 4 og fig. 1). For
XPD Asp
312Asn Hotell og
Lys
751Gln
polymorfismer, median overlevelse for pasienter med varianten genotyper (13 måneder, 15 måneder, henholdsvis) ble kortere enn med villtype homozygote (MST, 19 måneder, log-rank
P
= 0,006, 0,014, henholdsvis). Disse betydninger igjen etter justering for funksjonsstatus, scene og behandlingsregimer (faktorer som var signifikant assosiert med OS ved log-rank test, Tabell S1) i Cox regresjonsmodellen (justert
P
= 0,032, 0,034, henholdsvis ) (tabell 4). For
Asp
711Asp
polymorfisme, ble T-carrier genotyper assosiert med redusert overlevelse sammenlignet med villtype
C /C
genotype (14 måneder versus 19 måneder, log-rank
P
= 0,006). En marginalt signifikant
P
verdi (0,053) ble observert etter justering for kliniske funksjoner (justert HR, 1,54; 95% CI, 1,00 til 2,38). Ingen signifikant forskjell mellom
Arg
156Arg Hotell og OS ble observert.
Parvise koblingsulikevekt (LD) for de fire SNPs ble presentert i tabell S2. Det ble observert en moderat LD blant
Asp
312Asn, Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
varianter (0,42
D «
0,86). Den vanligste haplotype GCA (i rekkefølge
Asp
312Asn, Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
) ble funnet å utgjøre 90,5% av de studerte populasjonene . Overlevelse av pasienter med to kopier av GCA haplotype (vill type) var signifikant lengre enn den til pasienter med null til én kopi (tabell 4).
BFDP verdiene for de observerte forbindelser ble beregnet på to nivå ved tidligere sannsynligheter (0,1 og 0,05) (tabell 4). Ved tidligere sannsynlighet på 0,1, to SNPs (
Asp
312Asn Hotell og
Lys
751Gln
) og haplotype forble bemerkelsesverdig (BFDP≤0.8).
undergruppe analyse av sammenhengen mellom
XPD
haplotyper og total overlevelse
effekten av
Asp
312Asn
haplotyper på NSCLC overlevelse ble ytterligere evaluert av undergrupper analyse av scenen, histologisk type kjemoterapi og funksjonsstatus (tabell 5). En mer tydelig bevis på sammenheng mellom haplotyper og OS ble observert i stadium IIIB pasienter (log-rank
P
= 2,21 × 10
-4). Varianten haplotyper var assosiert med signifikant redusert overlevelse (MST, 15 måneder, justert HR, 3,11; 95% CI, 1,66 til 5,81), sammenlignet med villtype GCA haplotypen (MST, 20 måneder). Statistisk signifikante forskjeller ble også observert i andre undergrupper (pasienter med ECOG funksjonsstatus på 0-1 og pasienter med adenokarsinom) (tabell 5). Videre gjorde haplotype distribusjon ikke avvike vesentlig fra NSCLC pasienter, vurderer kliniske faktorer som histologi type, klinisk stadium og PS (tabell S3).
BFDP ble gjennomført for stratifisert analyse ved hjelp av forhånds sannsynlighet på 0,1 og 0,05 (tabell 5). De observerte foreninger forble bemerkelsesverdig selv på tidligere sannsynlighet på 0,05.
Diskusjoner
Denne studien vurdert om felles XPD polymorfismer ville påvirke kliniske utfall av kinesisk NSCLC pasienter behandlet med platinabasert kjemoterapi. Vi fant at variant genotyper og haplotyper av
Asp
312Asn
,
Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
polymorfismer betydelige bidra til kortere overlevelse tid sammenlignet med tilsvarende vill-type homozygote genotyper. Korrigert for kliniske faktorer ble
XPD
haplotyper fremdeles signifikant assosiert med OS, og denne effekten var mer dominerende for pasienter med stadium IIIB sykdom. I tillegg vår BFDP korreksjon antydet at observerte sammenslutninger av disse SNPs i hovedeffekten og subgruppeanalyse var sannsynligvis ikke på grunn av falske funn.
XPD er medlem av en ni-subenheten kompleks TFIIH som fungerer i NER, og dets helikaseaktiviteten er nødvendig for initiering av NER prosess. Begge
in vivo Hotell og
in vitro
studier har indikert at variasjoner i
XPD
gen kan påvirke kliniske fordelene med platinabasert terapi. Polymorfismer av
XPD
kodon 312 og 751 har blitt undersøkt i flere studier [12] – [17], [21] – [27], men ingen konsensus er nådd. De genetiske variasjoner i kodon 312 og 751 er nonsynonymous polymorfismer, noe som resulterer i en endring i aminosyresekvensen til proteinet. I en tidligere studie, Seker et al. [28] rapporterte at lymfoblastoide celler som bærer den variant A /vises en genotype ved kodon 312 en høyere apoptotisk respons på UV sammenlignet med dem som bærer villtype-genotype. Dessuten flere studier antydet at
XPD
751-GLN erstatninger kan produsere betydelig konformasjonsendring til protein [25], noe som fører til et lavt antall kromatid aberrasjon og redusert risiko for suboptimal DNA-reparasjon [12]. Våre resultater var i samsvar med tidligere eksperimentelle og epidemiologiske funn som variant genotyper ble assosiert med mer effektiv DNA-reparasjon kapasitet i menneskelig vev, noe som resulterer i redusert effekt av cytostatika. Den Asp711Asp polymorfisme er en vanlig taus substitusjon. De Asp711Asp og Lys751Gln polymorfismer var i sterk LD (D «= 0,86), og den nøyaktige funksjonen til Asp711Asp er ikke klarlagt ennå. Det kan muligens påvirke stabiliteten til mRNA eller påvirke den oversettelse ved å konvertere en høy bruk kodon til et lite bruk en. Alternativt, det var biologisk plausibel at denne sammenhengen ble formidlet av koblingsulikevekt med Lys751Gln eller noen andre potensielt funksjonelle SNPs.
I vår analyse, en mer signifikant sammenheng ble funnet med redusert overlevelse i haplotype analyse. Denne effekten var fremdeles signifikant etter korrigering for kliniske faktorer (justert P = 0,008). Den kumulative effekten av XPD haplotype kan være et resultat av den synergistiske virkning av hver SNP [29]. Videre in vitro /vivo studier basert på en kombinasjon av disse tre loci ville hjelpe undersøke den sanne biologiske mekanismer. Overlevelse forskjell fra haplotype ble mer tydelig hos pasienter med stadium IIIB sykdommer, noe som var meget i overensstemmelse med studiet av Gurubhagavatula et al [8]. En av de mulige forklaringer er at personer med stadium IV sykdom kan ha samlet seg for mange mutasjoner i løpet av tumorvekst, noe som kan drive behandling motstand og overvelde noen genetisk endring som kan ha endret DNA-reparasjon kapasitet [8].
En fersk meta-analyse påpekte at ingen av
Asp
312Asn Hotell og
Lys
751Gln
alene var signifikant assosiert med OS i NSCLC pasienter som fikk platinabasert kjemoterapi [ ,,,0],30]. Men når bare asiater befolkningen ble inkludert, for
Lys
751Gln
polymorfisme, bare en studie som inkluderte 108 pasienter var kvalifisert for finalen OS analyse; og for
Asp
312Asn
, ingen studien var kvalifisert for OS analyse. Som mindre allelfrekvenser for de tre polymorfismer er betydelig lavere i asiatiske befolkningen enn i europeiske befolkninger [31] – [33], tilstrekkelig utvalgsstørrelse var nødvendig for å øke kraften i denne studien. Derfor vil undersøkelse av disse SNPs i vår kinesiske befolkningen også hjelpe belyse mekanismen av inter forskjeller i utfallet av pasienter etter kjemoterapi.
De statistisk signifikante forskjeller i OS for disse SNPs ble også observert hos pasienter med adenokarsinom. Siden adenokarsinom var den vanligste svulsttypen i kinesiske befolkningen og tendens til å vise dårligere prognose [34], dette funnet var meningsfylt for effektiv prediksjon i en bestemt undergruppe av lungekreftpasienter. Imidlertid XPD status i tumorceller som trengs for å bli bestemt i tumorprøver. Selv om overlevelse utfallet avvek over
XPD
genotyper, behandlingsrespons var ikke annerledes blant de undergrupper. Det foreslås at genetiske faktorer ansvarlig for kortsiktig effekt var sannsynlig å være annerledes enn for OS [35].
Vår studie har flere sterke sider. Sammenlignet med publiserte studier, ble et forholdsvis stort antall avanserte NSCLC pasienter som behandles med platinabasert kjemoterapi som førstelinjebehandling inkludert i studien. Den relativt homogen behandling standard begrenset potensialet confounding effekt. Både pasient rekruttering og datainnsamling ble utført uten kjennskap til genetisk status. I tillegg har en konsistens som undergruppeanalyse indikerte at våre funn var sannsynlig å være biologisk plausibel.
Begrensninger av dette arbeid omfattet sin tilbakevirkende enkelt-senter utforming og mangel på andre DNA-reparasjonsgener. Inntil blir bekreftet av multisenter prospektive studier, bør resultatene fra denne studien ikke være over-tolket. Siden forekomsten av EGFR mutasjon var forventet å være særlig høy i østasiatiske befolkningen, kliniske studier undersøker
XPD
SNPs i NSCLC pasienter med hensyn til EGFR mutasjon kan bidra til å avklare om
XPD
polymorfismer eller haplotype kunne fungere som en prediktiv markør for kjemoterapi.
i konklusjonen, våre resultater gitt bevis for prediktiv rolle
XPD Asp
312Asn, Asp
711Asp Hotell og
Lys
751Gln
polymorfismer /haplotype på NSCLC prognose blant NSCLC pasienter behandlet med platinabasert kjemoterapi, noe som antydet at disse
XPD
polymorfismer kan brukes i risikovurdering for kjemoterapi effekt prediksjon og individualisert behandling optimalisering .
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1. Host Sammenligning av total overlevelse i henhold til kliniske kjennetegn ved pasientene.
doi: 10,1371 /journal.pone.0033200.s001 plakater (DOC)
Tabell S2.
koblingsulikevekt (D «og r
2) mellom SNPs i
XPD
.
doi: 10,1371 /journal.pone.0033200.s002 plakater (DOC)
tabell S3.
haplotype fordeling i henhold til kliniske faktorer.
doi: 10,1371 /journal.pone.0033200.s003 plakater (DOC)
Takk
Vi takker Hongliang Liu for å få hjelp med prøvetaking. Vi takker også våre frivillige for å donere blod og samarbeidspartnere for innsamling av blodprøver og informasjon.
