APOBEC-2 er et medlem av APOBEC familie | Source Protein APOBEC3G | Kilde DNA replikering prosessen | Kilde
En fersk undersøkelse utført av et team av sveitsiske og russiske forskere ledet av Sergey Nikolaev ved Universitetet i Genève, Sveits tydet på at APOBEC, et forsvar protein som vanligvis fungerer som beskyttende middel mot virusinfeksjon som forårsaker kreft hos mennesker.
APOBEC er en familie av indre celleprotein som har makt til å endre et enkelttrådet DNA. Siden virale DNA blir ofte enkelttrådet, kan den dobbelt-trådet humant DNA ikke endres.
Omtrent 20% av APOBEC mutasjoner oppstå på grunn av uregelmessigheter i den DNA som kalles «dobbelt-trådede bryter», hvor en del av DNA er i en enkelt-trådet tilstand for en tidsperiode forårsake multiple mutasjoner. Forskerne var i stand til å styre de resterende 80% av APOBEC relaterte mutasjoner. De klarte å identifisere i hvilken retning replikasjonsgaffelen var på reise gjennom menneskeceller. I løpet av celledelingen prosessen starter DNA-replikasjonen på et bestemt sted for å produsere to identiske kopier av den opprinnelige DNA. Replikasjonsgaffelen er forårsaket av separasjonen av to opprinnelige tråder og syntese av de nye. DNA-replikasjon prosess er en farlig mutagen når det utnyttet en svakhet i løpet av DNA-replikasjonsprosessen og dermed indusere mutasjoner i genomet.
Som et resultat av dette nye tråder gjenoppbygges som gaffel beveger seg langs kromosomet. De to tråder blir replikert i to forskjellige mekanismer avhengig av retningen av den replikasjonsgaffelen. Derfor gjenoppbyggingen av tråder er bare mulig når en av dem er konstruert umiddelbart.
Derfor er en tråd dvs. «ledende strand» aldri eksisterer som enkelttrådet DNA, mens den andre tråden «lagging strand» fortsetter å være enkelt-trådet for en periode av tid. Forskerne var i stand til å oppdage dobbelt så mange mutasjoner på «lagging strand» sammenlignet med «ledende strand». Funn antydet at APOBEC utnyttet DNA når «lagging strand» er fortsatt singel og svak
DNA replikering prosessen
.
DNA replikering prosessen er en prosess med å lage to identiske kopier fra den opprinnelige DNA-molekylet som sikrer at neste generasjon av celler inneholder den samme genetiske informasjonen
Ledende strand
.
det er en av de to trådene som er orientert i 5 «til 3» retning reiser mot replikasjonsgaffelen. Det er syntetisert kontinuerlig uten pauser i mellom
lagging strand.
Det er et enkelttrådet DNA replikeres i 3 «til 5» som beveger seg bort fra replikering gaffel. Det er syntetisert diskontinuerlig i fragmenter som er kjent som Okazaki-fragmenter
Okazaki Fragments:.
Okazaki fragmenter er en forholdsvis kort fragment av DNA som blir dannet på den lagging templatkjeden i løpet DNA replikering prosessen. I 1968, Reiji Okazaki, en pioner japansk molekylær biolog sammen med sin kone Tsuneko Okazaki og deres kolleger oppdaget Okazaki fragmenter mens drive en forskning på replikering av bakteriofag DNA i Escherichia coli.
Noen av koding medlemmer av APOBEC protein familien er nevnt nedenfor:
APOBEC3G (A3G):
er et enkelttrådet DNA som fungerer som en effektiv cellevert forsvare middel som forbyr uttrykk for funksjonell form av det HIV-kodede protein Vif. Når dette vill type Vif angriper A3G enzymet, alle slags vertens forsvar fordel som tilbys av A3G gradvis avtar og dermed fremme fremveksten av nye virulente stammer av HIV virus.A3G fungerer som en dobbeltagent i forsvar. Den kan enten være et anti-viralt faktor stand til å ødelegge viruset, eller det kan bidra til å spre virale genomer gjennom genmutasjon som tillater at viruset til å være mer motstandsdyktig mot drugs.To være mer effektive, A3G bør innarbeides i viruset.
APOBEC-1 (A1):
Det er en cytidindeaminase som er forbundet med kolesterol kontroll, kreftutvikling og hemming av virusreplikasjon. Nivåer av A1 er ekstremt lav i det humane leveren og tynntarmen, men høyere i gastrointestinale epitel-celler. A1 er sterkt uttrykt i gnagere med en bred fordeling vev
APOBEC 3A product::. Det er en DNA-cytidindeaminase som vanligvis finnes i mennesker, ikke-humane primater og pattedyr som inneholder antivirale effekter. Studier tyder på at APOBEC 3A kan hemme aktivitet mot parvovirus, retrovirus, adeno assosiert virus (AAV), human T-celle leukemivirus type 1 (HTLV-1), fremmed DNA og mobilitet av retrotransposons.
Aktivering indusert cytidindeaminase.
AICDA er et enzym som skaper mutasjoner i DNA ved å konvertere cytosin til uracil
APOBEC cytidindeaminase og kreft:
DNA cytidindeaminase APOBEC3B står for flere kreft hos mennesker. Forskerne fant at mutasjoner indusert av APOBEC3B kan finnes i mange tumorceller gjennom hele genomet. Det er tilstedeværelsen av APOBEC mutasjon mønster i blæren, cervical, bryst, hode og nakke, og lungekreft.
DNA replikering prosessen
