Abstract
Bakgrunn
Det er fortsatt et åpent spørsmål hvordan å forutsi tykktarmskreft før noen morfologiske endringer vises i tykktarmen.
mål
formålet var å undersøke avvik i kromosomene 1, 2 og 4 i perifert blod lymfocytter analysert ved fluorescens
in situ
hybridisering teknikk som et verktøy for å vurdere sannsynligheten for tykktarmskreft.
Metoder
en sykehusbasert case-control studie inkluderte 20 tykktarmskreftpasienter og 18 sykehus-baserte kontroller . Informasjon om potensielle kovariater ble samlet opp ved intervju. Hyppigheten av stabile og ustabile kromosomavvik i kromosom 1, 2 og 4 ble vurdert ved fluorescens
in situ
hybridisering teknikk.
Resultater
pasienter med kolorektal kreft, sammenlignet med kontroller, hadde en relativt høyere frekvens av kromosom 1 trans (median: 3,5 versus 1,0 /1000 celler, p = 0,006), stabile avvik (3,8 versus 1,0 /1000 celler, p = 0,007) og totalt avvik (p = 0,009). Det var ingen forskjeller observert for kromosomene 2 og 4. Våre resultater viste en økning i oddsen for å ha tykktarmskreft med ca 50-80% assosiert med en økning av 1/1000 celler i antall kromosom 1 avvik.
Konklusjoner
resultatene viste at hyppigheten av kromosomavvik, spesielt trans i kromosom 1, synes å være en lovende metode for å vise et kolon kreftrisiko. I tillegg antyder vår studie rimeligheten av bruk av biomarkører som kromosom 1 avvik i perifert blod lymfocytter i screening forebyggende programmer for enkeltpersoner på høyere tykktarmskreft risiko for å identifisere de som har økt risiko og krever hyppigere undersøkelser, f.eks . Ved sigmoidoskopi
Citation: Galas A, Miszczyk J (2016) Avvik som involverer kromosom 1 som en mulig Predictor av Odds Ratio for Colon Cancer – Resultater fra Krakow case-control studie. PLoS ONE 11 (1): e0147658. doi: 10,1371 /journal.pone.0147658
Redaktør: Lanjing Zhang, University Medical Center of Princeton /Rutgers Robert Wood Johnson Medical School, USA
mottatt: 31 august 2015; Godkjent: 06.01.2016; Publisert: 29 januar 2016
Copyright: © 2016 Galas, Miszczyk. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Data Tilgjengelighet:. All relevant data er i avisen og dens saksdokumenter filer
Finansiering: Dette forskningsprosjektet er finansiert av National Science Centre, Polen i 2010-2013 (nr NN404034039) – rektor etterforsker Aleksander Galas MD, PhD.. Presentert resultater ble delvis støttet av data fra departementet for vitenskap og utdanning prosjekt (No. 2P05D05329) -den hovedutprøver professor Wieslaw Jedrychowski, MD, PhD. Noen av disse undersøkelsene ble utført som en del av en utvidet undersøkelse av 250 kV røntgenstråling på IFJ PAN av cytogenetiske og molekylærbiologiske metoder og ble delvis støttet av Grant desember-2013/09 /D /NZ7 /00324 fra National Science Centre , Polen, rektor etterforsker Justyna Miszczyk, PhD
konkurrerende interesser:. forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
tykktarms~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP (CRC) er blant de. topp tre hyppigste kreft diagnostisert i høyinntektsland og i de fleste mellominntektsland. Det bidrar også til det høye antallet kreftdødsfall på verdensbasis. Det er en stor mengde kunnskap med hensyn til risikofaktorer for CRC og flertallet av dem peker til rollen livsstil som en avgjørende faktor, selv om flere studier ikke klarte å påvise en årsakssammenheng [1]. Genetisk predisposisjon er estimert til å bidra for ca 35% av CRC tilfellene [2]. De fleste av studiene som forsøkte å vurdere endringer som er ansvarlige for utvikling av tykktarmskreft fokusert på genetiske egenskaper observert i kreftvev. Mutasjoner i adenomatøs polypose coli (APC) genet, har MLH1, MSH2, PMS2 og MSH6 mismatch reparasjonsgener, og CpG island methylator fenotype (CIMP) blitt anerkjent og godt beskrevet [3]. I tillegg ble involvering av TP53, TGFB1, og mitogen-aktivert proteinkinase (MAPK) signalveier funnet å føre til utviklingen av CRC på grunn av et tap av cellevekst og differensiering kontroll, og apoptose [3,4]. Genom brede assosiasjonsstudier (GWAS) gjennomført siden 2007 har ikke klart å finne en felles genetisk variant ansvarlig for utviklingen av sporadisk kolorektal kreft. Selv om noen av disse studiene har funnet noen enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs), gjorde de ikke bevise en årsakssammenheng og den observerte tilhørende økning i CRC risiko var bare beskjeden (en økning på 5% til 30%) [5]. Det er et bevis som viser en økt risiko for arvelig CRC blant første slektninger [6], men lite er kjent om forutsi risikoen for å utvikle sporadisk kolorektal kreft blant friske individer som ikke har familie historie av CRC.
CRC utvikler seg som følge av lokale vevsforandringer [7], men det er fortsatt et åpent spørsmål om hvordan å forutsi risikoen for kreft før noen morfologiske endringer vises i tykktarmen. Det er på grunn av dette har vi undersøkt oddsen for CRC assosiert med kromosomskade målt i perifert blod lymfocytter (PBL).
Det er ikke noe etablert kromosom risikovurdering markør for CRC. En fersk studie, publisert i 2013 av Chen [8], har vist at et flertall av hypermethylated gener er mistenkt for å være en epigenetisk hendelse som stiller de tumorsuppressorgener i CRC. Disse genene er plassert på kromosom 1. Resultater fra en annen studie av åtti-tre CRC pasienter foreslått 1q31.3-32.1 (EEF1AL12) for å være den regionen som kan huse minst én CRC tumorsuppressorgenet [9]. Xiao et al. undersøkt vanlige kromosom endringer i sporadisk CRC og har funnet kromosomer 1, 2 og 4 for å ha kromosom gevinster [10]. Alle disse funnene, selv om lovende, har blitt observert som en forskjell mellom friske og kreft vev, noe som begrenser deres nytte som en prediktiv biomarkør for å vurdere risikoen for å utvikle CRC. Vurderer kreft som den progressive opphopning av DNA-skader i løpet av dereguleringen av cellulære prosesser, disse resultatene er samsvarende og ikke diskriminerer forholdet på grunnlag av observerte genetiske endringer som årsaks eller utløsende, særlig gitt tidsmessig og romlig heterogenitet av genetiske endringer som finnes i CRC [11].
formål
formålet med denne case-control studien var å undersøke om kromosomavvik (CAS) i kromosomene 1, 2 og 4 målt i tilsynelatende friske celler (PBL) ved hjelp av en fluorescens
in situ
hybridisering (FISH) teknikk vil bidra til å forutsi oddsen for å utvikle CRC. Som kostvaner er kjent for å være en av de viktigste faktorer som bestemmer sporadisk CRC, har frukt og grønnsaker forbruk vært ansett som hoved konfunderende variabel i dette forholdet.
Materialer og metoder
Studiedesign og smake
Et sykehus basert case-control studie inkluderte CRC pasienter innlagt til jeg leder generell kirurgi og Institutt for gastroenterologisk kirurgi, Jagiellonian University Medical College, Krakow, Polen, og kontroller behandlet på grunn av andre årsaker (urelatert til kreft) ved Universitetssykehuset i Krakow. Utformingen av studien er beskrevet andre steder [12,13]. I korte trekk, ble deltakerne nydiagnostiserte tilfeller av sporadisk adenokarsinom av enten tykktarmen eller endetarmen og ble bekreftet histopathologically. Inklusjonskriteriene var: alder opp til 75 år, kaukasisk, som opprinnelig fra Polen, henvist til kirurgisk behandling av CRC (krefttilfeller) eller for en behandling av en tilstand som ikke er relatert til kreft (kontroller). Neste følgende eksklusjonskriteriene ble gjennomført: radio- eller kjemoterapi før du tar en blodprøve, tilstedeværelse av kommunikasjon (verbal kontakt) problemer og /eller kognitive begrensninger, diagnostisering av sekundær kreft lokalisert i tykktarmen eller endetarmen (dvs. fjernmetastaser i tykktarmen) , diagnostisering av primærcancer annet enn kolorektal, tilbakevendende kreft, gjennomgikk kirurgi (før rekruttering) fra mage- og tarmkanalen, til stede eller tidligere diagnose av kronisk sykdom i mage-tarmkanalen (divertikulitt, irritabel tarm-syndrom, akutt eller kronisk magesår, akutt /kronisk pankreatitt) , diabetes (alle typer), nyresvikt og leversvikt. I tillegg fagene rapporterer å ha gastrointestinale symptomer i en periode på 5 år før et intervju ble også ekskludert.
Den primære case-control studie ble planlagt å ha 80 pasienter totalt for genetisk undersøkelse og var planlagt å bruke en matchende strategi (saker og kontroller ble matchet i henhold til kjønn og alder +/- 5 år). Ved inngangen til studien ble fagene bedt om å delta i den genetiske delen av prosjektet. Etter skriftlig informert samtykke ble oppnådd, ble et intervju utført og blodprøver ble tatt. Ut av 80 pasienter 2 ble ekskludert på grunn av eksklusjonskriteriene som ble avdekket etter at blodprøven ble tatt (kreftdiagnose i det siste, bor i utlandet i barndommen). Ifølge protokollen hver pasient ble bedt om å gi to blodprøver for klassisk kromosomavvik vurdering, to for Søsterkromatidutbytting børser (SCE) og i tillegg fire prøver for fluorescens
in situ
hybridisering (to for vurdering av dagens status, og to for bestråling). I omtrent halvparten av pasientene som samles var blodprøver ikke er tilstrekkelig (på grunn av begrenset volum) for alle planlagt genetisk testing. Resultater av kromosomavvik vurdert av klassisk cytogenetisk metoden ble publisert i den primære undersøkelsen monografi [14]. Resultater av SCE vurderingen fra det neste settet med 38 fag, som inkluderte et sett med prøver fra ytterligere 24 pasienter som kommer fra en tilsvarende forskningsprosjekt ble også publisert [12]. Til slutt, et annet sett av 38 blodprøver (20 tykktarmskrefttilfellene og 18 kontroller) var også tilgjengelige for FISH teknikk for å evaluere nærværet og hyppigheten av kromosom 1, 2 og 4 avvik. Selv om inklusjonskriteriene for den primære undersøkelsen dekket tykktarm og endetarmskreft tilfeller bare kolon (ICD-X: C18) krefttilfeller deltok i FISH del. Hele studien ble gjennomført i samsvar med de etiske prinsippene i Helsinkideklarasjonen og ble godkjent av Bioetisk Komiteen Jagiellonian University (antall KBET /115 /B /2011).
Verktøy og datainnsamling
deltakerne i studien ble intervjuet om sine kostvaner, demografiske karakteristika og andre potensielle kovariater. Kliniske opplysninger ble samlet inn fra sykehuset medisinske poster. Matinntaket ble vurdert av en semi-kvantitativ mat frekvens spørreskjema (SFFQ). I alt ble 148-kosttilskudd elementer brukt blant annet spørsmål om forbruket av frisk frukt (sommer /vinter tid), salater og ferske og kokte grønnsaker, og for hver mat eller drikke element, ble en vanlig konsumert porsjonsstørrelsen angitt av standardiserte fotografier. Utdannede intervjuere samlet informasjon om vanlig (vanlig) forbruk over en periode på ett år ved kalender sesonger. For å kunne vurdere faste kostholdet, ble CRC tilfeller spurt om sine kostvaner i en tid på 5 år før utbruddet av gastrointestinale symptomer (hvis den finnes) eller før begynnelsen av den diagnostiske prosessen. Gyldigheten og reproduserbarhet av spørreskjemaet ble vurdert og publisert andre steder [15].
Cytogenetisk analyse
Blodprøvetaking og meta spredning forberedelse.
Blodprøver ble tatt ved blodprøvetaking inn litium-heparinisert vacutainers, kodet, og deretter raskt transportert til laboratoriet i H. Niewodniczanski Institute of Nuclear Physics Polish Academy of Sciences i Krakow, Polen (IFJ PAN) før noen medisinsk intervensjon. I korthet ble helt blod (1,6 ml) tilsettes til 15 ml RPMI 1640 dyrkningsmedium supplert med 20% varme-inaktivert føtalt bovint serum, L-glutamin (2 mM) og antibiotika (100 U /ml penicillin og 100 g /ml streptomycin). Lymfocyttene ble stimulert med fytohemagglutinin (PHA) og dyrket i 72 timer, 37 ° C i 5% CO
2 i en fuktet inkubator. To timer før slutten av dyrkingen, 200 ul colcemid løsning (for å stanse delende celler i metafase) ble tilsatt. Deretter ble cellene behandlet med hypoton KCl og fiksert i 3: 1 metanol /eddiksyre. Metafase sprer ble utarbeidet ved å slippe de faste celler (1-2 dråper) på rene lysbilder. Slides ble deretter tørket ved romtemperatur (RT) og lagret i en -20 ° C fryser.
Farging.
Detaljene i FISH metoden er beskrevet andre steder [16]. Kort, farging ble utført i henhold til protokollen gitt av en representant for produsenten av sondene (Cytocell LPP124, Whole kromosom Paint Kombinasjon 1, 2, 4). Lysbilder ble tørket ved romtemperatur i 15-20 minutter og sjekket for tilstrekkelig kromosom spre å bestemme egnetheten av prøven for
in situ
hybridisering prosedyre. Objektglassene ble dyppet i saltoppløsning-natriumcitrat (SSC) i 2 minutter ved 37 ° C, inkubert med Pepsin løsning ved RT i 5 minutter, og ble satt inn i fosfat-bufret saltvann (PBS) ved romtemperatur i 3 minutter. Glass ble dehydrert i en serie av etanol bad (70%, 90%, 100%) ved romtemperatur i 1 minutt hver, og tørkes i 10-15 minutter ved RT. Da 10 ul probe (varmet til RT) ble plassert på lysbildet og dekk gled med en 22×22 mm glass dekkglass sikrer god dekning. Kantene på dekkglass ble forseglet med lim. Å denaturere lysbildene de ble satt i 75 ° C i 8 minutter. Da objektglass ble plassert i 37 ° C i minst 24 timer for hybridisering. Post-hybridisering, ble limet og dekkglass fjernet, og objektglassene ble vasket i vaskebufferen I ved 72 ° C i 2 minutter og deretter raskt overført til Wash Buffer II i 1 minutt ved romtemperatur. Glass ble dehydratisert på nytt i en serie av etanol bad (70%, 90%, 100%) ved RT hver i 1 minutt og tørket ved RT. Deretter ble 10 ul 4,6-diamidino-2-fenylindol (DAPI) påført og lysbilder var dekk gled og lagret i mørke ved temperatur 4 til 10 ° C inntil undersøkelse. Skinnene ble visualisert under fluorescerende mikroskopi. Den flytende sonde blanding av hel kromosom maleri sonder 1, 2 og 4, 3 farger, 3 probe kombinasjoner, ble Cytocell Ltd brukt.
scoring.
metafase sprer ble fremstilt av en total av 38 fag. Minst 1000 meta ble scoret for hver av de 22 av deltagerne og for de resterende mindre enn 1000 (4 fag har under 500 meta scoret) på grunn av en lav indeks spredning resulterer i et lavere antall metafase sprer seg. Metafase sprer ble scoret blindt for typer skader, som inkluderte stabile (trans, slettinger og innsett) (figur 1 og 2) og ustabile (asentrisk fragmenter) skade i kromosomene 1, 2 og 4. Hyppigheten av kromosomskade ble beregnet og uttrykt for 1000 meta (celler). Analyser har blitt utført for å vise forskjeller for alle typer skader og for gruppen av stabile skader samt for det totale antall avvik.
kromosompar en er malt rød, 2 (grønn) og 4 (gul ).
Statistiske metoder
Sample size hensyn.
Vi forventet å observere den gjennomsnittlige frekvensen av kromosomavvik på ca 3/1000 cellene i kolorektal kreft og ved omtrent 1/1000 i kontrollgruppen (med SD = 2/1000 celler). Forutsatt at alfa = 0,05 og strøm mål = 0.90 måtte vi undersøke 23 personer per gruppe. Forutsatt strøm mål = 0,80 nødvendig utvalgsstørrelse var 17 per gruppe. Antall blodprøver ble redusert som det hadde vært i hovedsak planlagt i vår studie, men det var fortsatt 20 og 18 blodprøver tilgjengelig for saker og kontroller, henholdsvis, derfor har vi antatt at utvalget vil gjøre oss i stand til å svare på våre forskningsspørsmål.
Statistikk og analyse.
Selv om studien er designet for å ha saker og kontroller matchet i forhold til alder og kjønn, tilgjengeligheten av blodprøver forårsaket at antall fag forskjellig på tvers av grupper. Beskrivende statistikk har blitt gitt av median og grensene for inter kvartil range (IQR). Som prøvestørrelsen var forholdsvis liten og med den manglende evne til å avvise null hypotesen om ekvivalens til normalfordelingen kan bestemmes ved prøvestørrelse, ble forskjellene mellom CRC-pasienter og kontroller testet av parametriske U-Mann-Whitney-test for kontinuerlige variabler . Chi-kvadrat test ble brukt for kategoriske og Cochran-Armitage test for ordinale variabler. Odds ratio (OR) oppnådd ved logistisk regresjon ble brukt for å vurdere odds (en tilnærming til risiko) av CRC knyttet til hyppigheten av avvik. Følgende modeller er blitt analysert: I) en univariable modell; II) en modell med tanke kosttilskudd jern (fullmektig mål på kjøttforbruket, kontinuerlig) som en enkel kovariat; III) en modell med røykestatus som en enkelt kovariat; IV) en modell med tanke på frukt og grønnsaker forbruk (antall porsjoner ukentlig, kontinuerlig) som en enkel kovariat; og V) en modell vurderer frukt og grønnsaker forbruk som kategorisk av tertiles som en enkelt kovariat. Et begrenset antall kovariater har blitt brukt på grunn av lite utvalg, men det er verdt å nevne at gruppene var ganske sammenlign ifølge de grunnleggende egenskapene. Analysene ble gjort av Stata /IC 13.1 for Windows (64-bit x86-64) StataCorp LP programvare. Det var ingen mangler data i det tilgjengelige utvalget. Betydningen nivå på 0,05 ble brukt
Resultater
De grunnleggende egenskapene til deltagerne har blitt presentert i tabell 1. Median alder var 62 år (første kvartil. 54, tredje kvartil: 66 ), og 50% av gruppen var menn. Kontrollene var litt yngre, røkt oftere, forbrukes mer grønnsaker og frukt, og hadde en lavere mengde jern i kostholdet. Ingen forskjell var statistisk signifikant. CRC pasienter hadde signifikant høyere frekvens av trans, stabile avvik og totale avvik i kromosom 1. Det var ingen forskjeller observert for kromosom 2 og kromosom 4 (tabell 2).
Som hovedformålet med studien var å vurdere oddsen for CRC assosiert med kromosomskade i PBL, har vi besluttet å utføre analyser bare for kromosomene som viser forskjellene i instanser mellom gruppene. Etter noen justering herunder også grønnsaker og frukt forbruk, en økning i CRC sjanser for trans (OR = 1,71 til 1,82 på tvers av modeller), stabile avvik (OR = 1,62 til 1,75) og de totale avvik (OR = 1,53 til 1,66) på kromosom 1. er blitt observert. Barnekonvensjonen risiko ble også økt hvis trans, stabile avvik og totalt antall avvik for kromosomene 1, 2 og 4 ble analysert sammen, men økningen i risiko var beskjeden (OR = 1,24 til 1,46) (Tabell 3). Ytterligere analyse utført for å vurdere rollen til grønnsaker og frukt forbruk avslørte en reduksjon i CRC risiko over tertiles forbruk i modellene med tanke enten antallet stabile avvik for kromosomer 1, 2 og 4, eller det totale antall avvik for disse tre kromosomer (Tabell 3). Datasettet som ligger til grunn funnene er tilgjengelig i S1 File.
Diskusjoner
Vi besluttet å bruke FISH teknikk som det oppfattes som et kraftig verktøy for å påvise spesifikke kromosomavvik på grunn sin høye følsomhet og hastigheten med hvilken analyser kan utføres. Teknikken tjener som et diagnostisk verktøy for mange krefttyper [17]. FISH metoden brukes til å identifisere kromosom ustabilitet biomarkører på annen kreftforskning [18,19]. Vi har valgt kromosom 1, 2 og 4 fordi den representerer 22,71% av mannlige og 22,34% av kvinnelige genomet som anslås utifra kromosom fysiske lengder [16]. Det er genene som hMSH2 og hMLH1 ligger på kromosom 2p og 3p [20], og MYH gen på kromosom 1, mellom p32.1 og p34.3, som mutasjoner ble knyttet til tykktarmskreft [21]. Selv om flertallet av fisk studier er utført på biopsi materialer for diagnose eller klassifisering av svulster, i presenterte studien brukte vi PBL for å analysere spesifikke kromosomavvik som involverer kromosomene 1, 2 eller 4.
Vår studie har vist en økning i aberrasjoner i kromosom 1 som antall translokasjoner, antallet av stabile forstyrrelser inkludert translokasjoner, delesjoner og innskudd, og det totale antall avvik (stabile og ustabile) i PBL eventuelt forbundet med en økning i sjanser for tykktarmskreft. Vi observerte ikke noen tilknytning til slettinger eller innsettinger for dette kromosomet enten de ble vurdert hver for seg eller som antall asentrisk fragmenter. Det var ingen forskjeller observert i nivået av skader i kromosom 2 og kromosom 4 mellom CRC pasienter og kontroller.
Det er en generell enighet om at kreft, inkludert CRC, utvikle seg som en følge av en opphopning av genetiske skader [ ,,,0],3,22,23] derfor måle frekvensen av kromosomavvik synes å være et godt virkemiddel for å forutsi oddsen for kreft på grunn av genetisk polymorfisme, xenobiotisk metabolisme, effektiviteten av DNA-reparasjon og rollen gentoksisk stress. Således har vi målt graden av skader i et sett av spesifikke kromosomer i PBL. Perifert blod kan enkelt hentes fra fagene ved en enkel blodprøvetaking og sirkulerende lymfocytter som representerer god surrogat for en vurdering av kromosom endringer i vev [24] lett kan høstes.
Hyppigheten av kromosomavvik i PBL har vært foreslått som en biomarkør for gentoksisitet, spesielt i yrkes innstillinger [25]. Forholdet mellom høy frekvens av instanser og en økt kreftrisiko ble observert i det nordiske studier og i den italienske etterforskningen, både som viser nesten to ganger høyere kreftrisiko i høy tertile av instanser og betydelige trender over tertiles [26]. Resultatene fra samarbeidsstudie av 11 ulike europeiske kohorter avslørte en økt kreftrisiko på tvers tertiles, og i tillegg ble det observert at tilstedeværelsen av ring kromosomer var assosiert med omtrent 2 ganger økning i kreftrisiko [27]. Det skal bemerkes imidlertid at alle de nevnte studiene benyttet CA, målt ved lysmikroskopi for å evaluere en generell risiko for alle krefttyper. Andre studier publisert i det tidsrommet antydet at høyt nivå av instanser ble mer tydelig assosiert med gastrointestinale fordøyelses kreft, spesielt magen og CRC [28,29].
Våre resultater tyder på en økning av tykktarmskreft odds assosiert med en økning i stabil instanser uavhengig av nivå av frukt og grønnsaker forbruk og røykestatus. Dette er i tråd med andre observasjoner som indikerte en sammenheng mellom instanser og kreft, som ikke var bare på grunn av noen yrkesrisiko eller røykestatus [30], noe som tyder på at «kvaliteten» av genom kan også spille en rolle. Det er også noen bevis som viser effekten av kosttilskudd forbindelser å hindre DNA-skade [12,31,32]. Som i noen av våre modeller både CAS og frukt og grønnsaker forbruk ble vurdert, mener vi at denne ekstra justering er en av styrkene i vår undersøkelse, og støtter hypotesen om at økt instanser kan være assosiert med tykktarmskreft.
i vår studie observerte vi en nedgang i tykktarm kreft odds over tertiles av grønnsaker og frukt forbruk og en økning i forbindelse med instanser, hvis de ble analysert sammen. Dette førte til et spørsmål om mulig endring effekten av grønnsaker og frukt forbruk på CA og tykktarmskreft odds. Samspillet sikt mellom instanser og forbruk av grønnsaker og frukt (cutoff av tredje tertile) var ikke statistisk signifikant verken for kromosom 1 trans (p = 0.080) eller for kromosom 1 totalt avvik (p = 0,132), eller for alle kromosomene 1, 2 og 4 translokasjoner (p = 0,174) eller for alle total kromosom 1, 2 og 4 aberrasjoner (p = 0,287). Dermed vår studie ikke viser tydelig en modifikasjon effekt av grønnsaker og frukt forbruk på instanser. Vi tror imidlertid at det kan være på grunn av et begrenset utvalgsstørrelse, og derfor dette spørsmålet krever videre undersøkelser.
Vi testet hyppigheten av avvik i kromosomene 1, 2 og 4 som en prediktor for odds ratio for tykktarmskreft. Våre resultater tyder på at sjansene for kreft er assosiert med økningen i antallet av kromosom 1 translokasjoner, så vel som med det antall stabile avvik, og følgelig et totalt antall på kromosom 1 forstyrrelser. Vi observerte ikke noen tilknytning til kromosomene 2 eller 4. Det er ingen klare bevis for et kromosom markør for CRC risiko. Men i tillegg til rollen som kromosom 1 i CRC risiko, er det også bevis som viser kromosomet inneholder «det meste av hypermethylated gener «som kan legge til risikoen for CRC [8]. Kromosom 1 ble også foreslått å ha CRC tumorsuppressorgener [9]. Noen nyere studier som undersøker rollen kromosom tap og gevinster i CRC primære svulster og deres synkrone metastaser viste kromosomforandringer (tap) for kromosomene 1, 17 og 18, og gevinster i kromosomer 7, 8, 13 og 20 [33]. En annen studie har vist gevinster for kromosom 1, og også for kromosomer 2, 4, 7, 8, 11 [10]. I vår studie prøvde vi å vurdere en generell mottakelighet som kan være «synlig» som en opphopning av skader i sirkulerende blod lymfocytter. Vurderer bevis på at kromosom 1 inneholder viktige gener som
MUTYH
genet (plassert på 1p34.1) ansvarlig for DNA-reparasjon og assosiert med utvikling av kjente adenomatøs polypose samt
MTHFR
gen (på 1p36.3), våre funn støtter rollen CA måling i prediksjon av CRC odds.
formålet med vår studie var å undersøke kromosom 1, 2 og 4 avvik forbundet med tykktarmskreft odds. Et annet punkt som krever diskusjon er molekylær sykdom signatur. Målet med å bruke molekylære sykdoms signaturer, som fremhevet av molekylær patologisk epidemiologi, er «å under klassifisere sykdom for å bedre prediksjon av sykdom forekomst og progresjon for presisjon medisin og folkehelse» [34]. I vår studie var vi ikke i stand til å vurdere genetiske varianter av tykktarmskreft som kreftvevet ikke var tilgjengelig for oss. Det kliniske bildet av sykdommer foreslo FAP type tykktarm kreft rekruttert til studien.
I sammendraget, våre resultater viser at hyppigheten av kromosomavvik, spesielt trans i kromosom 1, oppdaget i perifere blod lymfocytter ved fluorescens
in situ
hybridisering hel-kromosom maleri, synes å være en lovende metode for å beregne odds ratio for CRC, og kan overvinne begrensninger med konvensjonelle metoder for CA analyse. I tillegg antyder vår studie rimeligheten av bruk av biomarkører som lymfocytt instanser i screening forebyggende programmer for enkeltpersoner på høyere tykktarmskreft risiko for å identifisere de som har økt risiko og krever hyppigere undersøkelser, f.eks ved sigmoidoskopi.
Hjelpemiddel Informasjon
S1 fil. Datasettet underliggende resultatene i studien
doi:. 10,1371 /journal.pone.0147658.s001 plakater (XLS)
Takk
Forfatterne ønsker å takke Joseph Scrimali for kopi-redigering av manuskriptet, og Prasanna Pat for kopi-redigering og verdifulle kommentarer, og alle de ansatte i prosjektet for deres innsats i datainnsamlingen.
