Abstract
Bakgrunn
microRNAs (mirnas) negativt regulere genuttrykket og fungere som tumor suppressors eller onkogener i onkogenese. Sammenhengen mellom enkeltnukleotidpolymorfi (SNP) i MIR-196a2 rs11614913 og mottakelighet for fordøyelsessystemet kreft var inkonsekvent i tidligere studier.
Metodikk /hovedfunnene
En oppdatert meta-analyse basert på 15 uavhengige case-kontrollstudier som består av 4999 kreftpasienter og 7606 kontroller ble utført for å løse denne foreningen. Det ble funnet at Mir-196a2 polymorfisme betydelig forhøyet risiko for fordøyelsessystemet kreft (CT vs TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,07 til 1,45; CC vs TT, OR = 1,38, 95% CI = 1,13 til 1,67 ; CC /CT vs. TT, OR = 1,29, 95% CI = 1,10-1,50; CC vs. CT /TT, OR = 1,14, 95% CI = 01.01 til 01.30, C vs. T, OR = 1,15, 95% KI = 01.05 til 01.26). Vi fant også at variant i MIR-196a2 økt mottakelighet for tykktarmskreft (CRC) (CT vs TT, OR = 1,23, 95% CI = 1,04 til 1,44; CC vs TT, OR = 1,32, 95% CI = 1,08 -1,61; CC /CT vs. TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,07 til 1,46; C vs. T, OR = 1,15, 95% CI = 01.05 til 01.28), mens foreningen i recessive modell (CC vs. CT /TT, OR = 1,16, 95% CI = 0,98 til 1,38) viste en marginal betydning. I tillegg ble signifikant sammenheng mellom MIR-196a2 polymorfisme og økt risiko for leverkreft (HCC) oppdaget. Ved stratifying svulster på grunnlag av området av opprinnelse, kilde til kontroller, etnisitet og allelfrekvenser i kontroller, ble forhøyet kreftrisiko observert.
Konklusjon /Betydning
Våre funn tyder på at signifikant sammenheng mellom MIR-196a2 polymorfisme og økt mottakelighet for fordøyelsessystemet kreft, spesielt av CRC, HCC og asiater. Dessuten kan C-allelet bidra til økt fordøyelseskreftrisiko
Citation. Guo J, Jin M, Zhang M, Chen K (2012) en genetisk variant i MIR-196a2 Økt fordøyelsessystemet kreftrisiko: En Meta- analyse av 15 kasus-kontrollstudier. PLoS ONE 7 (1): e30585. doi: 10,1371 /journal.pone.0030585
Redaktør: Brock C. Christensen, Dartmouth College, USA
mottatt: 19 oktober 2011; Godkjent: 22 desember 2011; Publisert: 24 januar 2012
Copyright: © 2012 Guo et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Denne studien ble støttet av Natural Science Foundation National of China (nr 81072356). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
microRNAs (mirnas) er endogene, liten non-koding og har en lengde på 18-25 nukleotider RNA. mirnas kan samhandle med messenger RNA (mRNA) ved å binde seg til 3′-un-translatert regioner (UTR) og føre til degradering eller translasjonelle undertrykkelse av mRNA. Undersøkelser viste at mirnas Dato viktige roller i forskjellige biologiske prosesser, inkludert cellevekstregulering, differensiering, apoptose og tumorigenesis [1], [2], [3]. mirnas regulere ca 30% av menneskets gener og viser en bemerkelsesverdig bidrag til kreftutvikling [2], [4]. Avvikende modulering av spesifikke mirnas ble ansett for å være en viktig hendelse av forskjellige sykdommer som inkluderer kreft [5] Selv om den detaljerte prosessen med mirnas uttrykk og mutasjon er fremdeles uklare. Dessuten, noen studier har oppdaget at mirnas deltok i etiologi, progresjon og prognose av kreft, for eksempel ikke-småcellet lungekreft [6] og leverkreft [7]. Flere mulige mekanismer, inkludert genetiske og epigenetiske vekslinger, er blitt foreslått. SNPs i mirnas er merket som nye genetiske varianter som kan endre kreft mottakelighet [8]. Genetisk variant i MIR-196a2 hadde vist seg å være assosiert med noen kreftrisiko, men ulike studier viste motstridende assosiasjoner. Meta-analyse på brystkreft, lungekreft og andre kreftformer avdekket at rs11614913 var en funksjonell SNP og hadde muligheten til å kunne modifisere kreftrisiko [9], [10], [11], [12], [13].
Som vi vet, den ovenfor refererte meta-analysen inkluderte magekreft (GC), HCC og andre fordøyelses kreft for SNP i MIR-196a2. Men ved begrensning av utilstrekkelig publikasjoner, de gjorde ikke beregne samlede ORS av fordøyelsessystemet kreft grundig. For å forbedre effektiviteten av meta-analyse på fordøyelses kreft og redusere potensialet mellom-studie heterogenitet som kan stamme fra ulike kreftformer i ulike systemer, fokuserte vi på fordøyelses bare system kreft og lagt nyere publikasjoner på CRC [14], [15] , [16] og HCC [17] i denne studien. Vi har også kontaktet forfatterne å be for genotypefrekvensene om munnhulen plateepitel lungekreft (OSCC) og svelg plateepitel kreft (PSCC) [18], [19] som ikke ble vist i publiserte artikler. I tillegg ble en upublisert case-kontrollstudie på CRC som ble utført av Mingwu Zhang et al på Molecular Epidemiology Laboratory i Zhejiang University School of Medicine samlet. Overall, 9 datasett fra 7 studier (inkludert 2875 tilfeller med fordøyelses kreft og 5556 kontroller) som ikke hadde blitt undersøkt i forrige meta-analyse ble også inkludert i vår studie. Og vi utførte dette meta-analyse med fokus på følgende problemstillinger: (a) Hva er sammenhengen mellom MIR-196a2 polymorfisme og mottakelighet for fordøyelsessystemet kreft, spesielt av tykk- og endetarmskreft? (B) vil endringer i kreft nettsteder, demografiske egenskaper og andre faktorer forvandle denne foreningen betydelig?
Materialer og metoder
Identifikasjon av utvalgte studier
En systematisk søk i PubMed ble utført ved hjelp av en opphentingsspørring formulering «(mikroRNA 196a2 OR rs11614913) polymorfismer kreft» (siste søk oppdatert den 20 august 2011). Vi har også søkt referanser i publiserte artikler og anmeldelser om dette emnet i PubMed. Kvalifiserte studier ble valgt i henhold til følgende eksplisitte inklusjonskriterier: (a) studie ble utformet ved hjelp metodikken i en case-control studie. (B) Sammenhengen mellom MIR-196a2 polymorfisme og fordøyelsessystemet kreft risiko ble utforsket. (C) Det var tilstrekkelige data for beregning av odds ratioer og tilsvarende 95% konfidensintervall (ORS, 95% CIS). (D) Saker med karsinom ble diagnostisert av histopatologi. Videre har vi også kontaktet noen forskere til å be om upubliserte utfall av studiene og detaljerte datasett for samlet beregning (figur 1).
Data utvinning
To etterforskere (Guo og Jin) skjermede titler, sammendrag og fullstendige tekster uavhengig ved hjelp av en standardisert screening guide. Datauttrekk ble utført uavhengig etter fortielse av forfattere, tidsskrifter, støtteorganisasjoner og midler til å unngå forskernes bias. Etter data abstraksjon, ble avvik og forskjeller løst ved konsensus og diskusjon.
Kjennetegn på registrerte studier ble tildelt strukturert form (tabell 1), inkludert første forfatterens navn, publikasjon tid, studere landet opprinnelse, etnisitet, kreft type, kilde til kontroller, genotyping metode, matchet kriteriene mellom saker og kontroller, sample size, C-allelet frekvens i kontroller (tabell S1), genotype frekvens distribusjon og kvalitetspoeng.
Metodisk kvalitetsvurdering
Tre lesere (Guo, Jin og Zhang) uavhengig vurdert kvaliteten av utvalgte studier ved å score etter et sett med forhåndsbestemte kriterier (tabell S2) som ble trukket ut og endret fra tidligere studier [20], [21], [ ,,,0],22]. Kvalitet score varierte 0-10 og studier med høyere score presenteres bedre kvalitet. Uenighet ble løst ved diskusjon.
Statistisk analyse
Crude ORS og tilsvarende 95% CI’er ble beregnet til å undersøke sammenhengen styrke mellom MIR-196a2 polymorfisme og mottakelighet for fordøyelsessystemet kreft. Samlede Ors ble innhentet fra kombinasjon av enkelt-studier ved heterozygote sammenligning (CT vs TT), homozygot sammenligning (CC vs TT), dominant og recessive modeller (CC /CT vs. TT, CC vs. CT /TT), allelisk sammenligning (C vs. T) hhv. Vi brukte chi-kvadrat-baserte Q-test [23] og jeg
2 index [24] for å kontrollere heterogenitet mellom ulike studier. Når Q-test viste eksistensen av bemerkelsesverdige heterogenitet (P-verdi mindre enn 0,10 og /eller jeg
2-indeksen mer enn 50%,), vi brukte tilfeldig effekt modell (DerSimonian og Laird metode) [25]; ellers ble det faste effekt-modell (Mantel og Haenszel metode) gjennomførte [26].
Stratifisering av tumorlokalisering, kilden til kontroller, etnisitet og allelfrekvenser i kontrollene ble gjennomført. Alle kreftformer ble kategorisert i to grupper: fordøyelseskanalen kreft og fordøyelseskjertelen kreft. Kvalifiserte studier ble klassifisert i populasjonsbasert og sykehusbasert i henhold til styrekilde. Fagene ble klassifisert av etnisitet inn kaukasisk gruppe og asiatiske gruppen. Vi har også klassifisert de utvalgte studiene i C T (C-allelet frekvens mer enn T allele frekvens) gruppe og C≤T (C-allelet frekvens mindre enn eller lik T allelfrekvenser) gruppe av allelfrekvenser i kontroller
Hardy-Weinberg likevekt (HWE) i kontroll befolkningen ble dømt av chi-kvadrat test. P-verdi mindre enn 0,05 ble ansett for å være en tilstand av ubalanse. Publikasjonsskjevhet ble diagnostisert med Egger lineære regresjon metode [27], [28] og trakt plot. P-verdi mindre enn 0,05 i Egger lineære regresjon indikerte tilstedeværelse av potensielle publikasjonsskjevhet. Standard feil av logaritmen for OR ble plottet mot sin OR i trakten plot. Begg trakten tomten ble også plottet å påvise publikasjonsskjevhet og påvirkning av selvstudium på sammenslått OR. Logg OR ble plottet mot standard feil av loggen eller for hver inkluderte studie i Begg trakten tomten [29]. Og asymmetriske eller ufullstendige traktformede tomter demonstrerte publikasjonsskjevhet også. I enveis sensitivitetsanalyse, ekskluderte vi en enkelt studie hver gang, og de nye sammenslåtte resultatene kan reflektere påvirkning av det slettet studie til samlet oppsummering OR.
De frekvensfordelinger av C-allelet i asiater og kaukasiere ble sammenliknet med chi-kvadrat test. All statistisk analyse ble gjennomført med SAS 9.2-programvare (SAS Institute Inc., Cary, NC, USA), STATA 11,0 (STATA Corp, College Station, Texas) og RevMan 5.1 (https://ims.cochrane.org/revman/download ). Alle p-verdier var tosidig.
Resultater
Studier egenskaper
13 utvalgte studier inkludert 12 publiserte studier [14], [15], [16], [ ,,,0],17], [18], [19], [30], [31], [32], [33], [34], [35] og en upublisert en ble oppsamlet i denne meta-analyse i henhold til inklusjonskriteriene . Kjennetegn på disse studiene ble presentert i tabell 1 og genotype frekvensfordeling ble vist i tabell S1.
Blant studier på hode og hals plateepitelkarsinom (HNSCC, som inkluderte muntlig, svelget og strupehodet kreft) [18] [19], ble strupekreft i luftveiene ikke brukt. Vi vurderte pasienter med kreft i munnhulen og svelget kreft som separate grupper og samlet dem i kvantitativ analyse uavhengig. Derfor denne meta-analysen ansatt 15 separate case-kontrollstudier, inkludert 4999 tilfeller og 7606 kontroller, for polymorfisme av MIR-196a2.
12 studier ble matchet for alder, kjønn og /eller bosted, røyking, alkohol [14], [15], [16], [17], [18], [19], [32], [34], [35]; 9 studier innsamlede asiater som fag og den andre seks undersøkte kaukasiere; C-allelet hyppigheten av kontrollene var mindre allel frekvens (MAF) i 7 studier og T allelfrekvens var MAF i de 8 studiene forble; kontroller i 10 studier ble sykehusbasert og oppfølgingen av de andre studiene var populasjonsbasert; 11 studier beskrevet fordøyelses- kreft og 4 studiene fokuserte på svulster i fordøyelseskjertler. For å fortynne den potensielle konfunderende favorisering av HBV-infeksjon i studiet av Qi et al [33], vi holdt HBV pasienter uten HCC som kontroller og HBV-pasienter med HCC som tilfeller.
genotyper i alle studiene ble oppdaget med genetisk DNA fra blodprøver med 4 genotyping metoder helt. 13 av 15 studier sjekket genotyper for kvalitetskontroll. Genotype fordeling av kontroller i alle studier var i samsvar med HWE, bortsett Mingwu Zhang studie på CRC
publiseringsskjevheter
Vi fant ingen signifikant bevis for publikasjonsskjevhet. (P-verdi 0,05) i noen sammenligning modellen ved hjelp Egger lineære regresjon metode. Videre er formen på trakten plott for allel kontrast (C vs T) viste omtrent symmetrisk og omvendt traktformet (fig S1). Begge trakten plot (C vs. T) har ikke vist bemerkelsesverdig asymmetri i fordelingen av spredt poeng (figur 2). Blant alle studier inkludert, Wang studie på ESCC [35] og Lius på PSCC [19] avvek fra andre symmetrisk fordelt studier. Når disse to studiene ble slettet, jeg
2 ble redusert fra 63% (Ph = 0,0005) til 42% (Ph = 0,05). Mens sammendraget eller for allel kontrast (C vs. T) fortsatt holdes signifikant (OR = 1,15, 95% CI = 01.06 til 01.25), og dette resultatet var lik samlet eller uten sletting av et studie (OR = 1,15, 95% KI = 01.05 til 01.26).
Logg OR er plottet mot standard feil av loggen eller for hver inkluderte studien. Hver sirkel prikk representerer en egen studie for den angitte foreningen av allel kontrast (C i løpet T). Wang studie på ESCC (øvre dot) og Liu studie på PSCC (lavere dot) finne utenfor pseudo 95% KI grenser tydeligvis.
Test av heterogenitet
Mellom-studie hetrogeniteter og tilsvarende kvantitative grader i alle sammenligninger og undergrupper, ble vist i Tabell S3. Etter stratifisering, de hetrogeniteter redusert åpenbart i undergrupper av CRC, GC, fordøyelseskjertelen, HCC, sykehus-baserte kontroller, og C≤T gruppe (Ph 0,10 og jeg
2 50% i de fleste genetiske sammenligninger).
Følsomhetsanalyse analyse~~POS=HEADCOMP
Vi har slettet en enkelt studie fra den samlede samlet analyse hver gang for å sjekke påvirkning av de fjernede datasettet til den generelle ORS. To studier (Wang (ESCC) [35] og Liu (PSCC) [19]) endret mellom-studie hetrogeniteter vesentlig i heterozygote sammenligning og recessive modell hhv. Etter sletting av noen av de to studiene som er nevnt, den heterogenitet forsvant, mens foreningen fortsatt holdes signifikant (tabell S4).
Meta-analyseresultater
Foreningen styrke mellom MIR-196a2 polymorfisme og mottakelighet for fordøyelsessystemet kreft er vist i tabell 2. Totalt var det en statistisk økt risiko for fordøyelsessystemet kreft i hver genetisk sammenligning (CT vs TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,07 til 1,45; CC vs. TT, OR = 1,38, 95% CI = 1,13 til 1,67; CC /CT vs. TT, OR = 1,29, 95% CI = 1,10-1,50; CC vs. CT /TT, OR = 1,14, 95% KI = 1.01- 1,30;. C vs. T, OR = 1,15, 95% CI = 01.05 til 01.26)
Tumor området, kilde av kontroller, etnisitet og allelfrekvenser i kontroller ble tatt i betraktning for subgruppeanalyse. Skog plott av dominerende modeller (CC /CT vs. TT) i ulike undergrupper ble vist i Figur S2. Sammenligning med genotype TT, heterozygote CT (OR = 1,23, 95% CI = 1,03 til 1,48), homozygot CC (OR = 1,32, 95% CI = 1,05 til 1,65), kombinasjon av CT /CC (OR = 1,26, 95% KI = 1,04 til 1,51) hovedsakelig økt forekomst av kreft i fordøyelseskanalen. Og vi fant også at C-allel bærere hadde flere risikoen for fordøyelseskanalen kreft (C vs. T, OR = 1,13, 95% CI = 01.02 til 01.25), men ingen signifikant resultat ble observert i recessive modell (CC vs. CT /TT ELLER = 1,12, 95% CI = 0,98 til 1,28).
signifikant sammenheng mellom SNP rs11614913 og økt risiko for fordøyelseskjertelen kreft ble funnet i tre genetiske modeller (CT vs TT, OR = 1,30, 95% CI = 1,02 til 1,65; CC vs TT, OR = 1,64, 95% CI = 01.24 til 02.17, CC /CT vs. TT, OR = 1,38, 95% CI = 1,10 til 1,74), med unntak av recessive modell (CC vs . TT, OR = 1,24, 95% CI = 0,85 til 1,79) og allel kontrast (C vs. T, OR = 1,20, 95% CI = 0,96 til 1,51). I tillegg viste vi at dette locus polymorphism ble vesentlig knyttet til høyere risiko for CRC (CT vs TT, OR = 1,23, 95% CI = 1,04 til 1,44; CC vs TT, OR = 1,32, 95% CI = 1,08 til 1,61 ; CC /CT vs. TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,07 til 1,46; C vs. T, OR = 1,15, 95% CI = 01.05 til 01.28), men en marginal betydning ble funnet i recessive modell (CC vs . CT /TT, OR = 1,16, 95% CI = 0,98 til 1,38). Vi har også observert økt mottakelighet for HCC i homozygot sammenligning (OR = 1,79, 95% CI = 1,31 til 2,43), dominerende modellen (OR = 1,41, 95% CI = 1,11 til 1,79), recessiv modell (OR = 1,49, 95% KI = 1,16 til 1,91) og allel kontrast (OR = 1,32, 95% CI = 1,14 til 1,54). Vi fant en marginal betydning i homozygot sammenligning (OR = 1,27, 95% CI = 0,99 til 1,64) i HCC studien. Sammenlignet med CRC og HCC, ble ingen signifikante assosiasjoner funnet i GC, OSCC og PSCC.
Med hensyn til kontroll kilde, studier med sykehus-baserte kontroller viste forhøyet risiko i fire genetiske sammenligninger (CT vs TT, OR = 1,21, 95% CI = 1,08 til 1,36; CC vs TT, OR = 1,37, 95% CI = 1,12 til 1,66; CC /CT vs. TT, OR = 1,24, 95% CI = 1,12 til 1,38; C vs. T, OR = 1,16, 95% CI = 01.05 til 01.28) og en kant effekt ble oppnådd i recessive modell (OR = 1,18, 95% CI = 1,00 til 1,40). Men studier med populasjonsbaserte kontroller presenteres ingen signifikant sammenheng
For den asiatiske gruppen, hver genetisk sammenligning produserte signifikant økt risiko (CT vs TT, OR = 1,26, 95% CI = 1,05-1,50;. CC vs TT, OR = 1,47, 95% CI = 1,18 til 1,82; CC /CT vs. TT, OR = 1,32, 95% CI = 1,10 til 1,57; CC vs. CT /TT, OR = 1,25, 95% KI = 1,11 til 1,40; C vs. T, OR = 1,20, 95% CI = 1.10 til 1.31), mens ingen signifikant sammenheng ble påvist i kaukasisk gruppe
i undergruppen av C . T, bemerkelsesverdig forhøyet kreftrisiko var funnet i homozygot sammenligning (OR = 1,45, 95% CI = 01.01 til 02.07) og dominerende modellen (OR = 1,39, 95% CI = 1,02 til 1,90). Selv om vi ikke finner signifikante sammenhenger mellom heterozygote sammenligning (OR = 1,36, 95% CI = 1,00 til 1,85), recessiv modell (OR = 1,11, 95% CI = 0,91 til 1,36) og allel kontrast (OR = 1,15, 95% KI = 0,98 til 1,34). I mellomtiden signifikant sammenheng mellom MIR-196a2 polymorfisme og økt risiko for fordøyelsessystemet kreft ble også funnet i C≤T gruppen (CT vs TT, OR = 1,18, 95% CI = 1,04 til 1,34; CC vs TT, OR = 1,33, 95% CI = 1,14 til 1,55; CC /CT vs. TT, OR = 1,22, 95% CI = 1,08 til 1,37; CC vs. CT /TT, OR = 1,20, 95% CI = 1,05 til 1,37; C vs . T, OR = 1,15, 95% CI = 01.07 til 01.24).
Når vi sammenlignet C allelfrekvenser i asiater med at i kaukasiere, ble Zhang studie på CRC ekskludert på grunn av sin HWE ulikevekt i kontroller. C-allelet hyppigheten av MIR-196a2 varierte 0,419 til 0,754 tvers asiatiske og kaukasiske kontroller. I asiatiske kontroller, sto C allelfrekvens for 45,60% som var betydelig lavere enn i kaukasiske kontroller (59,90%, χ
2 = 222,32, P 0,0001). En tidligere studie rapporterte en parallell observasjon [9].
MOOSE Sjekkliste for vår studie ble vist som tabell S5.
Diskusjoner
mirnas delta i ulike biologiske prosesser og er ansett som en nøkkelfaktor i onkogenese. SNP i MIR-196a2 rs11614913 var tenkt å være innblandet i endret uttrykk og funksjon av modne miRNAs, og dermed bidratt til endrede kreftrisiko. Mange studier vist variant i rs11614913 var signifikant assosiert med mottakelighet for ulike kreftformer. Hong et al. fant at bærere med TC /CC genotype av MIR-196a2 hadde høyere risiko for ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) å sammenligne med TT operatører [36]. Sammenligning med TT genotype, Hu et al. observert at CC eller CC /CT-genotyper betydelig økt brystkreftrisiko [37]. Lignende resultater ble også funnet i glioma [38], prostatakreft [39] og andre typer kreft.
Videre, SNPs i mirnas kan tidvis forstyrre genet eller proteinet uttrykk og resultere i patogenitet [40]. Zhan og hans kolleger rapporterte at uttrykket nivåer av MIR-196a i CC og CC /CT-genotyper var høyere enn i TT genotypen i CRC [15]. Li et al. fant også at CC og CC /CT-genotyper økt uttrykk nivå av MIR-196a i HCC pasienter med HBV infeksjon sammenligne med TT genotype [30]. Hu et al. oppdaget at ekspresjonsnivået av MIR-196a i CC genotypen bærere var signifikant lavere enn det i CT eller TT bærere med NSCLC [6]. I tillegg, sammenlignet med CT /TT genotype, CC genotype av MIR-196a2 overveiende reduserte overlevelsestiden av NSCLC i Hu undersøkelse [6]. Dermed foreslo Hu og hans kolleger den genetiske varianten i dette locus å være en prognostisk biomarkør for NSCLC.
Vår studie viste at forekomsten av C-allelet betydelig økt risiko for fordøyelsessystemet kreft med lignet med T-allelet. Dette funnet viser at den genetiske varianten i MIR-196a2 kan avgjørende endre mottakelighet av fordøyelsessystemet kreft. Forrige meta-analyse som beskrevet kreft finne i flere systemer av organisme støttet våre funn [9], [13].
Vi fant at Mir-196a2 polymorfisme i stratifisert analyse av kreft området, ble statistisk relatert med forhøyet kreftrisiko i fordøyelseskanalen gruppen og fordøyelseskjertelen gruppe. Videre ble signifikant økt risiko som finnes i CRC og HCC. Vi har imidlertid ikke observere noen signifikant sammenheng mellom den genetiske varianten og mottakelighet for GC, OSCC og PSCC. Det er noen muligheter for dette avviket blant kreft nettsteder. For det første fører vevsspesifisiteten til forskjellige kreft mottakelighet i forskjellige vev. For det andre kan den relative lille mengden av utvalgte studier i stratifisert analyse indusere betydelig /ubetydelig forening ved en tilfeldighet på grunn av utilstrekkelig statistisk styrke [41]. To tidligere meta-analyse rapporterte ubetydelig sammenheng mellom MIR-196a2 polymorfisme og HCC risiko [9], [13], som var inkonsekvent å våre funn. Vi antyde at færre inkluderte studier og forsømmelse av HBV-infeksjon i kontroller kan føre til ubetydelige resultater i forrige meta-analyse.
I undergruppen av etnisitet, vi fant signifikant sammenheng mellom MIR-196a2 polymorfisme og økt risiko for fordøyelsessystemet kreft i asiater, men ikke i kaukasiere. En tidligere meta-analyse rapporterte en parallell observasjon til oss [9]. Uoverensstemmelser mellom de to etniske grupper kan forklares med muligheten for at ulike etniske grupper bor sammen med flere livsstil og miljøfaktorer, og dermed gi ulike gen-miljø interaksjoner [42]. Og forskjellige populasjoner bære forskjellige genotypen og /eller allel frekvenser av denne locus polymorfi og kan føre til varierende grad av cancer susceptibility [43]. Relativ liten utvalgsstørrelse i kaukasiere kan føre til at inconspicuousness også.
De fleste (70%, 7/10) studier med sykehus-baserte kontroller rekruttert asiater som testet fag og vi fant betydelig økt risiko i denne undergruppen. Mens de fleste studier med populasjonsbaserte kontroller (60%, 3/5) undersøkt kaukasiere og vi har ikke funnet noen signifikante resultater i denne undergruppen. Så de nevnte etniske tolkninger er tilgjengelige for inkonsekvens i kontroll kilde lagdeling. Og mulig seleksjonsskjevhet i kontroller med forskjellige matchet kriteriene og utvalgsstørrelsen kan også være årsakene. Chu meta-analyse studien rapporterte også betydelig økt kreftrisiko i asiater, men ikke i kaukasiere [9].
Uenighet i lagdeling av allelfrekvenser i kontrollene kan lede til ovennevnte tolkninger for etnisk effekt til en viss grad.
Noen fordeler kan bli markert i vår studie. På den ene siden denne meta-analysen belyse sammenhengen mellom MIR-196a2 polymorfisme og økt risiko for fordøyelsessystemet kreft, CRC og HCC grundig og systematisk. På den annen side er inkluderingen av en upublisert studie på CRC og innsamling av upubliserte genotype frekvens av OSCC og PSCC forsterket kraft og påvirkning av vår slutning. Videre, alle inkluderte studiene hadde akseptabel kvalitet (scoret minst 6). Begrensninger av denne studien bør bli lagt merke til på samme tid. For det første, genetiske faktorer, svulst biologiske egenskaper og deres samspill med miljøfaktorer produsere tydelige påvirkninger til kreft mottakelighet og tumorigenesis. Ulike kreftformer har ulike risikofaktorer og ulike overfølsomhet for dem. For eksempel kan Heliobacter pylori infeksjoner og røyking øker forekomsten av magekreft. Og hepatitt B, C virusinfeksjoner og eksponering av aflatoksin i mat er risiko for leverkreft [44]. Studier som er inkludert i denne meta-analysen inneholdt ulike kreftformer, etniske befolkningsgrupper og nasjoner, og flere faktorer som kjønn, alder, livsstil, kultur barrierer, tilgang til helsetjenester og eksponering for patogener og kreftfremkallende var uensartet. Mens mangler av individuell informasjon hemmet oss fra å kontrollere mulige konfunderende faktorer som kan være forårsaket av de uoverensstemmelser over. Vi kunne heller ikke utføre mer presis beregning av justert ORS og videre analyse av mulige gen-miljø interaksjoner. For det andre, inkludert forskere ikke dekke alle typer fordøyelsessystemet kreft, for eksempel kreft i bukspyttkjertelen. Og for det tredje kan språket skjevhet utlede fra de siktede referanser av engelske dokumenter bare.
I sammendraget, denne meta-analysen indikerte at Mir-196a2 rs11614913 polymorfisme kan øke følsomheten av fordøyelsessystemet kreft, spesielt av CRC og HCC . SNP i dette locus kan betraktelig fungere som en kandidat av biomarkør for kreft screening, diagnostisering og behandling i fremtiden. For å bekrefte våre funn, ytterligere veldesignede studier med stor utvalgsstørrelse i forskjellige etniske befolkningsgrupper, flere typer fordøyelsessystemet kreft sammen med vev-spesifikke biokjemiske, funksjonelle og uttrykks egenskaper er påkrevd.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
Trakt tomt på publikasjonsskjevhet. Standardfeilen for log (OR) blir plottet mot OR for hver undersøkelse. Hver rute representerer en egen studie for den angitte foreningen av allel kontrast (C vs. T). Den stiplede linjen i blått indikerer estimert OR
doi:. 10,1371 /journal.pone.0030585.s001 plakater (TIF)
Figur S2.
Forest plott av dominerende modellen (CC /CT vs. TT) i ulike undergrupper. Rutene og horisontale linjene tilsvarer OR og 95% CI av spesifikk studie, og arealet av firkanter reflekterer studien vekt (inverse av variansen). Diamanten representerer samlet OR og dens 95% KI
doi:. 10,1371 /journal.pone.0030585.s002 plakater (TIF)
Tabell S1.
Genotype frekvensfordeling av studier inkludert.
doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s003 plakater (DOC)
Tabell S2.
Scale for metodisk kvalitetsvurdering.
doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s004 plakater (DOC)
tabell S3.
Heterogenitet test.
doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s005 plakater (DOC)
Tabell S4.
ORS (95% KI) av sensitivitetsanalyse.
doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s006 plakater (DOC)
Tabell S5.
MOOSE Sjekkliste.
doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s007 plakater (DOC)
Takk
Vi takker Qingyi Wei og Zhensheng Liu fra University of Texas MD Anderson Cancer Center, Karl T. Kelsey fra Avdeling for patologi og laboratoriemedisin, Brown University, for sjenerøst gi sine upubliserte data. Vi takker også Xiang Shu fra School of Public Health, University of Texas Health Science Center, for kritikk og redigere papiret.
