Abstract
Bakgrunn
Det er ingen validerte biomarkører som korrelerer med prognose for bukspyttkjertel ductal adenokarsinom (PDA).
CD24 Hotell og adenomatøs polypose coli (
APC
) gener er viktige i malign transformasjon av gastrointestinale celler. Denne studien undersøkte
APC Hotell og
CD24
genetisk polymorfisme og deres mulige innvirkning på overlevelsen av pasienter med PDA.
Metoder
Kliniske og patologisk data samt som blodprøver for å ekstrahere DNA som ble oppnådd for 73 pasienter med PDA. Real-time PCR vurderes genetiske varianter av
APC plakater (I1307K og E1317Q), og fire forskjellige enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i
CD24
gen: C170T (rs52812045), TG1527del (rs3838646) , A1626G (rs1058881) og A1056G (rs1058818).
Resultater
median alder ved diagnose var 64 (41-90) år. Trettien pasienter (42,5%) var drift, 16 (22%) hadde lokalt fremskreden sykdom og 26 (35,5%) hadde disseminert metastatisk kreft. Malignitet relatert dødelighet var 84%. Median overlevelse var 14 måneder (11.25-16.74). Overlevelse var lik for villtype (WT), heterozygot og homozygot varianter av
APC
eller
CD24
gener. De tre hyppigste
CD24
SNP kombinasjoner var: heterozygote for A1626G og WT for resten av allelene (14% av pasientene), heterozygot for C170T, A1626G, A1056G og WT for resten (14% av pasientene ), og heterozygot for C170T, A1056G og WT for resten (10% av pasientene). Alle pasientene var APC WT. De to første gruppene var betydelig yngre ved diagnose enn den tredje gruppen.
Konklusjoner
Spesifikke polymorfismer i
APC Hotell og
CD24
gener kan spille en rolle i kreft i bukspyttkjertelen utvikling. Korrelasjon med overlevelse krever en større kohort
Citation. Shamai S, Nabiochtchikov jeg, Kraus S, Zigdon S, Kazanov D, Itzhak-Klutch M, et al. (2015)
CD24 Kjøpe og
APC
genetisk polymorfisme i bukspyttkjertel kreft som potensielle biomarkører for klinisk utfall. PLoS ONE 10 (9): e0134469. doi: 10,1371 /journal.pone.0134469
Redaktør: Jonathan R. Brody, Thomas Jefferson University, USA
mottatt: 8 mars 2015; Godkjent: 10 juli 2015; Publisert: 22.09.2015
Copyright: © 2015 Shamai et al. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Data Tilgjengelighet: All relevant data er i avisen og dens saksdokumenter filer
Finansiering:.. Finansiert av interne avdelings midler
konkurrerende interesser:. forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Bukspyttkjertel duktalt adenokarsinom (PDA) er kjent for sin høye dødelighet og sturen prognose. Den samlede fem års overlevelse er 6%. I USA i 2015, vil anslagsvis 48,960 nye pasienter blir diagnostisert, og 40,560 pasienter vil dø av sin sykdom. [1]. PDA er forårsaket som følge av mutasjoner i kreftassosierte gener, hvorav de fleste er sporadisk, og bare ca 15% er germline mutasjoner. Sporadiske mutasjoner påvirke flere viktige gener. En tidlig innsettende mutasjon vises i
K-Ras
onkogen i 90% av tilfellene. Andre vanligvis berørt gener er tumorsuppressorgener, slik som
TP53
,
CDKN2A Hotell og
SMAD4
, med nye kandidat driverne av bukspyttkjertelen kreft nylig identifisert (
KDM6A
og
PREX2
) [2]. Mutasjoner i moderat penetrant resistensgener, for eksempel
BRCA2
,
CDKN2A
, og
MLH1
, står for mindre enn 5% av bukspyttkjertel kreft, noe som tyder på at mye av den nedarvede risikoen for denne sykdommen kan skyldes lav penetrans vanlige genetiske varianter [3]. Kjemoterapi har liten suksess ved residiverende eller spres kreft i bukspyttkjertelen. De beste terapeutiske resultater er blitt oppnådd med en kombinasjon av tre forskjellige kjemoterapeutika, hvilket ga en median overlevelse på mindre enn ett år [4]. Disse tallene understreker behovet for videre forskning og forståelse for de molekylære stier kjører denne malignitet.
CD24 er en membran mucin-lignende protein, forankret ved glykosylfosfatidylinositol (GPI), og sin kjerne protein består av 27-31 aminosyrer. Det uttrykkes hovedsakelig på hematopoetiske celler, for det meste B-celleforløpere, celler i det sentrale nervesystemet og epitelceller [5-7]. Det fungerer som et adhesjonsmolekyl, binding til P-selektin på blodplater og endotelceller, samt for å L1-protein uttrykt på lymfoide og neuralceller [5].
CD24
genet har flere genetiske varianter, som følge av enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs). Disse omfatter 170
C → T, en polymorfisme som fører til en aminosyre-substitusjon fra alanin til valin, på et sted som er koblet til membranbindings gjennom GPI-ankeret [8-9]. Ytterligere tre SNPs ligger i 3′-utranslaterte område, og de omfatter 1626
A → G, 1056
A → G og 1527
tgde, noe som kan påvirke
CD24
mRNA stabilitet .
Tidligere studier har vist at CD24 er en markør for en rekke kreft stamceller, inkludert kreft i bukspyttkjertelen [10]. Endringer i CD24 uttrykk i kreftcellelinjer kan endre celleegenskaper og tumorvekst. Vi hadde tidligere vist at behandling av bukspyttkjertel og tykktarmskreft cellelinjer med anti-CD24 monoklonale antistoffer (MAbs) eller CD24 downregulation bruker kort hårnål (sh) RNA effektivt hemmet celledeling
in vitro Hotell og tilbakestående tumorigenicity i xenopodet naken mus [11]. Rollen som
CD24
i PDA er fortsatt uklart. Det har vært knyttet til dårlig differensiering, men ikke for å overleve [12]
tumorsuppressorgen,
APC plakater (adenomatøs polypose coli), har blitt grundig undersøkt og knyttet til tykktarmskreftutvikling [ ,,,0],13,14]. Laken et al. rapporterte en kimlinje missense mutasjon som førte til substitusjon av T til A på nukleotid 3977, som fører til innsettingen av lysin (K) i stedet for isoleucin (I) i kodon 1307 (I1307K). Dette antas å føre til ustabilitet, og dermed muligens bidra til malign transformasjon [15]. En annen polymorfisme,
APC
E1317Q variant, er en substitusjon av glutaminsyre (E) for glutamin (Q) ved kodon 1317 (E1317Q). Dette skyldes en G til C substitusjon ved nukleotid 4006 og kan være knyttet til utvikling av kreft [16].
rolle
APC
i PDA er ikke klart. Det har vist seg at pankreastumorer mislyktes i å utvikle følgende kondisjoninaktivering av
APC
i bukspyttkjertelen, noe som tyder på at
APC
er nødvendig for tumordannelse i bukspyttkjertelen [17]. En tidligere studie som undersøkte
APC
E1317Q og I1307 i PDA fant ingen sammenheng i en kohort av 58 pasienter [16]. Den aktuelle studien var å undersøke en mulig sammenheng mellom det kliniske forløpet av PDA og genetiske endringer i
CD24 Hotell og
APC
gener.
Materialer og Metoder
Deltakere
Nylig diagnostiserte pasienter med PDA som ble behandlet ved Avdeling for kreftbehandling ved Tel Aviv Sourasky Medical Center, Tel Aviv, Israel, mellom 2000-2014, ble prospektivt rekruttert til studien. Etter å ha innhentet skriftlig informert samtykke ble blodprøver tatt for analyse og genotyping av
CD24 Hotell og
APC
SNPs. Pasientens filene ble retrospektivt sett, og kliniske og patologiske data ble samlet inn, blant annet demografi, sykdomsstadiet, behandling, respons på kjemoterapi og overlevelse. Rettssaken ble godkjent av den lokale Institutional Review Board (IRB, Sourasky legesenter Helsinky komiteen) og den israelske helsedepartementet (Helsinky godkjenningsnummer 02-130, israelske helsedepartementet søknad 919990171).
Genetic Analysis
Analyse metoder.
blod ble samlet i rør som inneholder EDTA. Perifere blodleukocytter (PBL) ble isolert fra fullblod ved å samle hvite buffy coats oppnådd etter blodsentrifugering i 3 minutter ved 4 ° C ved 3000 rpm og kassering av plasmaet supernatanten.
DNA ekstraksjon
Genomisk DNA ble ekstrahert fra PBL’er ved standardmetoder som beskrevet av Miller et al. [18].
Fastsettelse av de forskjellige
CD24
polymorfismer
Real-time PCR (qPCR) ble brukt til å genotype rs8734 (C170T), rs3838646 (TG1527del), rs1058881 (A1626G), og rs1058818 (A1056G)
CD24
polymorfismer ved hjelp Custom TAQMAN SNP genotyping Analyser ferdige med Applied Biosystems (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA), etter de tekniske prosedyrer som anbefales av produsenten. Analyse reagenser for SNP genotyping fra analysene-by-utformingen besto av en 40X blanding av umerkede PCR primere og TaqMan MGB prober (FAM og VIC dye-merket). Disse analyser ble utformet for genotyping av de spesifikke SNP. Følgende primer sekvenser ble brukt:
For rs8734 polymorfisme: forover primer, GGTTGGCCCCAAATCCA; revers primer, GACCACGAAGAGACTGGCTGTT; allel 1 (VIC), CACCAAGGCGGCT; allel 2 (FAM), CACCAAGGTGGCTG
For rs1058818 polymorfisme. forover primer, AGCTAAACGGATTCCAAAGAGTAGAA; revers primer, TGGGCGACAAAGTGAGACTGT; allel 1 (VIC), TGCATTGACCACGACT; allel 2 (FAM), TGCATTGACCGCGAC
For de rs3838646 og rs1058881 polymorfismer:.. analysen ID AH0JB89 og analyse ID AH1SAFH, henholdsvis (Applied Biosystems)
Betingelsene for PCR amplifikasjon var identiske. PCR-reaksjonene ble utført i et 10 ul volum inneholdende 20 ng genomisk DNA, og fremstilt ved anvendelse av TaqMan Universal PCR Master Mix komponenter (Applied Biosystems), som inneholdt nukleotider, buffer, uracil-N-glykosylase, AmpliTaq, og en passiv referanse fargestoff (ROX). Reaksjonsblandingen inneholdt 5.0μl av TaqMan PCR Universal Master Mix, 2.75μl H
2o, 0.25μl av assay-komponentene (primersett og probe spesifikk for hvert polymorfisme), og 2.0μl av DNA fra hver prøve. A Step One Plus Real-Time PCR System (Applied Biosystems) ble brukt til å utføre qPCR eksperimenter ved hjelp av følgende sykling protokollen. Sykling ble initiert ved forvarming ved 600 ° C i 30 sekunder og 950 ° C i 10 minutter, etterfulgt av 40 sykluser på 920 ° C i 15 sek, 600 ° C i ett minutt og 600 ° C i 30 sekunder. Den Stepone v2.2 (Applied Biosystems) program ble brukt til å tolke reaksjonen resulterer, ved hjelp av grafisk representasjon av VIC og FAM fluoroforen utslipp med hensyn til konstitutive ROX utslipp.
Vurdere I1307K Polymorphism på
APC
Gene
Genomisk DNA ble amplifisert ved PCR ved hjelp av en fremover primer (5 «-GAAATAGGATGTAATCAGACG – 3») og en omvendt primer (5 «-AGTCTGCTGGATTTGGTTCTA – 3»). For sanntids-PCR, ble en sensor primer konstruert i henhold til villtype (WT) allel, og nedstrøms for det som et anker primer. For påvisning av det spesifikke polymorfe nukleotid (T /T i posisjon 3977 av SEQ ID NO: 7), ankerprimeren var: LC-Red 640- TTTGCAGGGTATTAGCAGAATCTGCTTCCTGTG-ph (SEQ ID NO: 9) og sensorprimeren var: CCAATCTTTTCTTTTTTTTCTGC -FL (SEQ ID NO: 10)
Vurdere E1317Q Polymorphism på
APC
Gene
Genomisk DNA ble amplifisert ved PCR ved hjelp av en fremover primer (5′. GAAATAGGATGTAATCAGACG- 3 «) og en revers primer (5′-CACCACTTTTGGAGGGAGA- 3»). Primere og påvisning av de spesifikke polymorfe nukleotid (G /C ved posisjon 4006 av SEQ ID NO: 7) ble ved sanntids-PCR ved anvendelse av ankeret primer: TGCTGTGACACTGCTGGAACTTCGC-FL (SEQ ID NO: 11) og føleren primer (ph-LC -Red705-CACAGGATCTTGAGCTGACCTAG (SEQ ID NO: 12).
Statistical Analysis
Beskrivende statistiske verdier for alle variabler ble beregnet for hele studiepopulasjonen Disse inkluderte medianen, utvalg, frekvenser og relative. frekvenser som er aktuelt i henhold til variabel type. de relative frekvenser for hvert gen permutasjon (kombinasjon) ble beregnet, og de tre mest vanlige permutasjoner ble ytterligere analysert. Beskrivende statistikk ble beregnet for hver permutasjon gruppe. Forskjeller i kategoriske variabler mellom de ulike permutasjon gruppene var analysert ved hjelp av Chi-squared test av uavhengighet. Forskjeller i demografiske kvantitative variabler ble analysert ved parametrisk ANOVA med Kruskal-Wallis test (for omnibus tester) og videre med Wilcoxon rank-sum test hvis paret sammenligninger ble indikert av den tidligere. Forskjeller i overlevelseskurver ble analysert ved hjelp av Log-rank test. En
p
-verdi 0,05 ble ansett som statistisk signifikant. Når det er aktuelt, tester var tosidig og justert for multiple sammenligninger. Alle statistiske analyser ble utført ved bruk av SPSS 22 (IBM Corporation Inc., USA).
A effektanalyse for Log Rank test var basert ona to-sidig alfanivå 0,05. Den genotyper ratio var basert på tidligere studier, (19,20). Wt gruppe ble tatt som referanse, med en antatt overlevelse på 12 måneder for den undersøkte populasjon (behandlet i bukspyttkjertelen kreftpasienter) og sammenlignet med ikke-wt genotyper. Strøm for symmetrisk forskjell i overlevelse (dvs. vekt like sannsynlig å bli bedre eller dårligere enn sammenligningsgruppen) ble beregnet, gitt utforskende natur denne studien, med en klinisk signifikant forskjell definert som 4 måneder (S1-data)
resultater
kliniske kjennetegn ved pasientene
de registreringer av 73 PDA pasienter som hadde vært behandlet ved vår institusjon mellom 2000-2014 var tilgjengelig for både genetiske og kliniske vurderinger (tabell 1). De inkluderte 38 (52%) menn og 35 (48%) kvinner med en median alder på 64 år (41-90). Ti pasienter (14%) hadde tidligere malignitet uten gjentagende mønster. Ved diagnose, 31 (42,5%) pasienter var drift, hadde 16 (21,9%) lokalt avansert inoperable sykdom, og 26 (35,6%) hadde metastatisk kreft. Tretti-fire pasienter ble operert med kurativ hensikt: 22 hadde Whipple prosedyren, ni hadde en distal pancreatectomy og tre hadde en total pancreatectomy. Tjueseks pasienter (76,5%) hadde R0 reseksjon og åtte pasienter (23,5%) hadde R1 reseksjon. Av de trettifire pasienter som ble operert, sytten (50%) hadde ingen spredning til lymfeknuter, mens sytten (50%) hadde patologiske lymfeknuter [median: 1, range (1-13)]. Tretten av de 16 pasientene (81%) som lokalt hadde avansert ubrukelige sykdom fått neoadjuvant kjemoterapi, oftest gemcitabin og cisplatin, og ni radioterapi, med samtidig ukentlig cisplatin. På tidspunktet for siste vurdering, 13 av 73-pasient kohort (17,8%) holdt seg fri for sykdom, 56 (76,7%) hadde disseminert sykdom, og 4 (5,5%) ble ikke fulgt opp.
De pasienter som hadde metastatisk sykdom fikk en median på en behandlingslinje (range 0-5). Den vanligste første behandlingsalternativet var gemcitabin basert dublett (16/56, 28%), en klinisk studie (14/56, 25%) eller beste støttebehandling alene (16/56, 28%). Blant de førti pasienter som fikk kjemoterapi, svarprosenten til den første linjen var 22% (ni pasienter), mens 30% (tolv pasienter) hadde stabil sykdom, 35% (fjorten pasienter) hadde sykdomsprogresjon, og 12,5% (fem pasienter ) hadde manglende data. Median total overlevelse for hele kohorten var 14 måneder (11.25-16.74). Endelig oppfølging, 61 pasienter (83,6%) døde av sykdommen, tre (4%) døde av urelaterte årsaker, tre (4%) var i live med sykdom, og fem (6,8%) var i live uten sykdom. Bare én pasient ble tapt for oppfølging. Median oppfølgingstid på 85,7 måneder (16,8 til 158,4).
Full kliniske egenskaper i henhold til de forskjellige SNPs presenteres (S2 Data for APC I1307K, S3 Data for APC E1317Q, S4 Data for CD24 C170T, S5 data for CD24 Tgdel, S6 data for CD24 A1056G, S7 data for CD24 A1626G).
APC
Forekomst og overlevelsesdata
APC
I1307K og E1317Q polymorfismer ble identifisert i 11 (15%) og en (1,5%) pasienter, henholdsvis. Alle operatører i dette kullet var heterozygoter av
APC
polymorfismer. Det var ingen statistisk signifikant forskjell i overlevelse mellom bærere av de ulike
APC
polymorfismer og ikke-bærere. Median overlevelse for pasienter med WT
APC
I1307K var 14 måneder, i motsetning til en median på åtte måneder i heterozygote gruppen (fig 1). Men forskjellen var ikke signifikant (
p
= 0,528). Bare én pasient var heterozygote for
APC
E1317Q polymorfisme, utelukker påvisning av en overlevelse forskjell. Interessant, at pasienten overlevde mye lenger enn medianen, dvs. 28 måneder.
CD24
forekomst og overlevelsesdata.
CD24
polymorfisme 170
C → T ble identifisert i 29 (39,7%) heterozygote pasienter og fire (5,5%) homozygote pasienter. Den 1527
tgdel
CD24
variant var til stede i sju (9,6%) heterozygote pasienter og én (1,4%) homozygot pasienten.
CD24
polymorfisme 1056
A → G ble identifisert i 50 pasienter, 34 (46,6%) av dem var heterozygoter og 16 (21,9%) var homozygote. Den siste
CD24
variant, 1626
A → G, var tilstede i 52 (71,2%) heterozygote pasienter og to (2,7%) homozygote pasienter (tabell 2). Det var ingen statistisk signifikant forskjell i overlevelse mellom bærere av de ulike
CD24
polymorfismer og ikke-bærere.
Median total overlevelse (MOS) av
CD24
polymorfi 170
C → T heterozygoter og homozygote var 13 og 14 måneder, sammenlignet til 14 måneder for WT gruppe (
p
= 0,722, figur 2A). MOS i 1527
tgdel variant var 13 måneder for WT gruppen, 21 måneder for heterozygote pasienter, og 42 måneder for enkelt homozygot pasient (
p
= 0,494, figur 2B). De 34 pasientene som var heterozygoter for
CD24
1056
A → G polymorfisme hadde en MOS på 12 måneder, i motsetning til 15 måneder i WT-gruppen og 16 måneder for homozygote pasienter (
p
= 0,685, figur 2C). Den siste gruppen som skal testes, de med 1626
A → G variant, også unnlatt å vise noen overlevelses forskjeller i forhold til Mos 15, 13 og 16 måneder i WT, heterozygote og homozygote pasienter, henholdsvis (
p
= 0,834, figur 2D).
A. For
CD24
170
C → T polymorfisme. B For
CD24
1527
tgdel polymorfisme. C For
CD24
1056
A → G polymorfisme. D For
CD24
1626
A → G polymorfisme.
Genetiske Permutasjoner
Vi identifiserte tre genotyper som dukket opp i vår kohort med høy forekomst. Genotype 1 (10/73 pasienter, 14% av kohorten) var WT til alle seks polymorfismer testet, med unntak av
CD24
1626
A → G heterozygositet. Genotype 2 (10/73 pasienter, 14%) var WT til både
APC
varianter og
CD24
1527
tgdel, og heterozygote for de resterende tre
CD24
polymorfismer. Den tredje gruppen, genotype 3 (9/73 pasienter, 10%) var heterozygote til
CD24
170
C → T og 1056
A → G polymorfismer og WT til resten. Det var ingen statistisk forskjell i overlevelse mellom pasienter med de tre forskjellige genotyper og resten av kullet (
p
= 0,440). På tidspunktet for diagnose, median alder på 73 pasienter var 64 år, og det var ingen statistisk signifikant forskjell mellom de ulike
APC Hotell og
CD24
polymorfisme blant dem. Men når man vurderer de tre dominerende genotyper, alder ved diagnose var 58,5 år for genotype 1, 60 år for genotype 2 og 74 år for genotype 3, som var statistisk signifikant sammenlignet med resten av kullet (
p
= 0,041, figur 3). Sammenligning av ytterligere kliniske egenskaper, for eksempel svar på førstelinje kjemoterapi (
p
= 0,27), tid til sykdomsprogresjon (
p
= 0,536) og tumor Karakter (
p
= 0,782) avslørte at ingen var signifikant forskjellig mellom gruppene.
Aldersforskjeller forskjeller~~POS=HEADCOMP mellom pasientene med tre dominerende genotyper og resten av kullet.
Diskusjoner
ektopisk ekspresjon av CD24 i tumorceller øker proliferasjon, fremmer tumorcelle adhesjon til fibronektin, laminin og collagen i, IV (i tillegg til P-selektin), og bidrar til økt celle motilitet og invasivitet [5, 21]. Fremskritt i nyere forskning har knyttet CD24 til progresjon og malignitet av flere epiteliale og blodkreft svulster. Høy ekspresjon av dette protein ble rapportert å være en uavhengig prediktor for dårlig overlevelse i lungekreft [22-23]. Cytoplasmatisk farging for CD24 protein var fraværende i normal epitel i eggstokkreft, og til stede i eggstokkene adenokarsinom, og dens overekspresjon ble uavhengig knyttet til en dårligere overlevelse [24-25]. Det samme korrelasjon ble demonstrert i bryst [26] og prostatakreft [27-28].
CD24 har en viktig onkogen rolle i gastrointestinale svulster. Dens overekspresjon ble uavhengig knyttet til dårlig prognose i spiserørskreft [29-30]. Positiv immunhistokjemisk farging for cytoplasmisk CD24 var relatert til mer forhånd staging hos pasienter med magekreft [31]. En ny studie viste at tykktarmsslimhinne har en økt ekspresjon av CD24, selv på et tidlig stadium av malign transformasjon [21]. CD24 overekspresjon ble korrelert til redusert overlevelse i kolorektal kreft [32]. Sagiv et al. demonstrert en rolle i CD24 i kreftfremkallende prosess i bukspyttkjertelkreft [33]. I sin studie, ble menneske Colo357 bukspyttkjertelen adenokarcinomceller behandlet
in vitro
med anti-CD24 Mabs, noe som resulterte i pågripelsen av cellevekst i en dose- og tidsavhengig måte, mens cellene negative til CD24 uttrykk ble ikke påvirket på samme måte. Anti-CD24-mAb var også effektiv i å redusere tumorvekst av bxpc3 kreft i bukspyttkjertelen transplantater i mus [34]. Bukspyttkjertelen og kolon adenokarcinomceller behandlet
in vitro
med shRNA velig downregulated
CD24
uttrykk og hadde svekket cellevekst og motilitet [11]. Den aktuelle studien søkt en sammenheng mellom fire forskjellige
CD24
SNPs, to
APC
genetiske varianter, og det kliniske forløpet av kreft i bukspyttkjertelen. Så langt vi kjenner til, er dette den første rapporten om en undersøkelse av disse foreningene. Det var ingen forskjell i overlevelse av heterozygote og homozygote pasienter, muligens på grunn av den relativt lille størrelsen på kullet. Videre alder ved diagnose, behandlingsrespons, og tid til sykdomsprogresjon også ut til å ha noen prognostisk verdi i denne innstillingen.
Forekomsten av de fire forskjellige
CD24
SNPs i vår pasientpopulasjon var lik sin forekomst blant friske individer beskrevet av vår gruppe i et tidligere arbeid [19], med den eneste viktige unntaket etter å ha blitt funnet i forekomsten av
CD24
1626
A → G: 29% av de friske kontroller i den studien var heterozygoter, sammenlignet med 71,2% av PDA pasientene i nåværende arbeid.
Vi hadde undersøkt forekomsten av
APC
polymorfismer I1307K og E1317Q hos friske personer i tidligere [20]. Forekomsten av E1317Q variant var 1,2% (tolv individer av 1000 vist), som er lik vår nåværende resultat på 1,4% i PDA-pasienter. Den I1307K variant, men ble identifisert i bare 5,3% friske personer, sammenlignet med 15% i PDA-pasienter.
Det er interessant av mange forskjellige genotype permutasjoner, tre stod ut å være dominerende i 14%, 14 % og 10% av pasientene. To av de tre genotyper, heterozygositet til
CD24
1626
A → G (WT til resten), og heterozygositet til
CD24
170
C → T, 1626
A → G, 1527
tgdel (WT til resten) ble diagnostisert på et betydelig yngre alder enn resten av gruppen (median på 58,5 og 60 år sammenlignet med 64 år, henholdsvis). Den tredje genotype, den ene med heterozygositeten til
CD24
170
C → T og 1056
A → G og WT til resten, ble diagnostisert på et mye eldre alder (74 år).
Konklusjon
Selv om vi ikke var i stand til å oppdage noen innvirkning på
APC Hotell og
CD24
gener på overlevelse hos pasienter med PDA, dataene som vises her garanterer videre studere med hensyn til deres rolle i bukspyttkjertelen kreftutvikling og prognose, og i en større kohort.
Hjelpemiddel Informasjon
S1 data. Statistiske beregninger, sammen med selve utvalgsstørrelser per SNP
doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s001 plakater (TIF)
S2 data. Tumor scenen, klasse og plassering for APC I1307K polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s002 plakater (TIF)
S3 data. Tumor scenen, klasse og plassering for APC E1317Q polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s003 plakater (TIF)
S4 data. Tumor scenen, klasse og plassering for CD24 C170T polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s004 plakater (TIF)
S5 data. Tumor scenen, klasse og plassering for CD24 Tgdel polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s005 plakater (TIF)
S6 data. Tumor scenen, klasse og plassering for CD24 A1056G polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s006 plakater (TIF)
S7 data. Tumor scenen, klasse og plassering for CD24 A1626G polymorfisme
doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s007 plakater (TIF)
Takk
Esther Eshkol takkes for redaksjonell assistanse.
