Abstract
Bakgrunn
Transforming growth factor
(TGF) -β
signalveien, kan opptre både som en tumor suppressor og som en svulst promoter i bukspyttkjertelkreft, avhengig av tumorstadium og cellulær kontekst. TGF-β veien har vært under intens undersøkelse som et potensielt terapeutisk mål ved behandling av kreft. Vi antok en sammenheng mellom TGF-βR2 /SMAD4 uttrykk i svulsten, plasma TGF-β1 ligand nivå, genetisk variasjon i
TGF-B
sti og prognose av kreft i bukspyttkjertelen.
Metode
Vi undersøkte TGF-βR2 og SMAD4 protein uttrykk i biopsi eller kirurgiske prøver fra 91 pasienter med bukspyttkjertel duktalt adenokarsinom (PDAC) ved hjelp av immunhistokjemi. Plasmanivået av TGF-β1 ble målt i 644 pasienter med PDAC ved hjelp av ELISA. Tjueåtte enkeltnukleotidpolymorfi (SNP) i
TGF-β1, TGF-β2, TGF-β3, TGF-βR1, TGF-βR2
, og
SMAD4
gener ble bestemt i 1636 pasienter med PDAC bruker Sequenom metoden. Sammenheng mellom protein uttrykk i svulsten, ble plasma TGF-β1 nivå, og genotyper med total overlevelse (OS) evalueres med Cox proporsjonal regresjonsmodeller.
Resultater
Uttrykket nivå av TGF-βR2 og SMAD4 som en uavhengig markør ble ikke assosiert med OS. Imidlertid kan pasienter med både lav nukleær farging av TGF-βR2 og høy nukleær farging av SMAD4 har bedre overlevelse (
P
= 0,06). Gjennomsnittlig og median nivå av TGF-β1 var 15,44 (SD: 10.99) og 12.61 (interkvartilt område: 8,31 til 19,04) ng /ml. Pasienter med avansert sykdom og i øvre kvartil spekter av TGF-β1 nivå hadde betydelig redusert overlevelse enn de med lave nivåer (
P
= 0,02). En betydelig sammenslutning av
SMAD4
SNP rs113545983 med total overlevelse ble observert (
P
0,0001).
Konklusjon
Våre data gir verdifull grunnlagsinformasjon med hensyn til TGF-β bane i kreft i bukspyttkjertelen, som kan benyttes i målrettet terapi kliniske forsøk. Høy TGF-β1 plasmanivå,
SMAD4
SNP eller TGF-βR2 /SMAD4 svulst protein uttrykk kan foreslå en avhengighet av denne veien hos pasienter med avansert kreft i bukspyttkjertelen
Citation. Javle M, Li Y, Tan D, Dong X, Chang P, Kar S, et al. (2014) Biomarkører av TGF-β signalveien og prognose av kreft i bukspyttkjertelen. PLoS ONE 9 (1): e85942. doi: 10,1371 /journal.pone.0085942
Redaktør: John Souglakos, Universitetet General Hospital i Heraklion og Laboratorium for Tumor Cell Biology, School of Medicine, University of Crete, Hellas
mottatt: August 12, 2013; Godkjent: 04.12.2013; Publisert: 20 januar 2014
Copyright: © 2014 Javle et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av en bevilgning fra Imclone Corporation /Eli Lilly og av giverfond, en samling av midler fra pasienter med kreft i bukspyttkjertelen eller fra sine familier. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser. Denne forskningen ble delvis finansiert av Imclone Inc (nå Eli Lilly). Forfatterne bekrefter at denne finansieringen sponsing ikke endrer sin tilslutning til alle PLoS ONE politikk på deling av data og materialer.
Innledning
Transforming growth factor-β (TGF-β) spiller en viktig rolle i cellesyklus arrest, apoptose, homeostase, sårheling og immunregulering. I tilfelle av kreft, spiller TGF-β signale en kontekstavhengig doble rolle, både som en tumor suppressor i tidlig fase sykdom og som en svulst promoter i etablerte-kreft [1]. Det er tre TGF-p-isoformene, TGF-β1, 2 og 3. Av disse er TGF-β1 den mest rikelig i mennesker. TGF-β signalering finner sted ved flere trinn, som starter med aktivering og frigjøring av TGF-β1 etterfulgt av binding til tre høyaffinitets-reseptorer (TGF-βR1, 2 og 3). TGF-βR1 og TGF-βR2 reseptorer dimerisere etter binding TGF-β på celleoverflaten [2]. Disse reseptorene, når sekvensmessig aktivert fosforylere en familie av transkripsjonsfaktorer, de SMADs. En fersk exome sekvense studien indikerte at
TGF-βR2
er en av de 16 mest muterte gener i bukspyttkjertelkreft [3]. SMAD2 og SMAD3 aktiveres av TGF-βR1 og binder seg til den felles partner SMAD4. SMAD6 og SMAD7 er hemmende SMADs som blokkerer fosforylering av SMAD2 eller SMAD3. Den aktiverte SMAD komplekset ved translokasjon til kjernen regulerer transkripsjon av flere TGF-p-avhengig gener som kan ha en kontekstavhengig tumor-undertrykkende eller progressiv rolle. I tillegg til dette «kanonisk» TGF-β signalveien, eksisterer det en rekke intracellulære signalveier som aktiveres av TGF-β uavhengig av SMAD2 eller SMAD3 aktivering [4]. TGF-β signalisering er aktivert i flere kjente humane kreftformer, og er derfor et område som undersøkes aktivt [5].
TGF-β veien er en av de 12 sentrale signalveier som er involvert i kreft i bukspyttkjertelen [6]. Mutasjon i minst ett av de TGF-β pathway gener forekommer i 100% av de pankreatiske tumorer. LOH ved 18q hvor SMAD4 genet er lokalisert forekommer i 90% av pankreas cancer, mens gendelesjoner og tap av protein ekspresjon forekommer i 50% [7], [8]. Tap av SMAD4 (DPC4) har blitt benyttet for å bestemme bukspyttkjertelen opprinnelse i tilfeller av metastaser av ukjent primær. Det antas at kompromittert TGF-β signalering kan stå for tumorprogresjon snarere enn dens initiering [4]. Imidlertid er den faktiske rollen SMAD4 i bukspyttkjertelkreft fortsatt ansett som kontroversielt. For eksempel, Biankin
et al
vist at SMAD4 uttrykk sto for en dårligere prognose ved kirurgisk resectable sykdom; pasienter med SMAD4 overekspresjon ikke dra nytte av kirurgisk reseksjon i sin studie [9]. På den annen side, hurtig obduksjon data tyder på at SMAD4 tap er forbundet med disseminert sykdom [10]. Det er begrensede data vedrørende TGF-β-reseptoren og SMAD4 uttrykk eller deres prognostisk betydning i avansert kreft i bukspyttkjertelen pasienter. Videre er det ingen data angående TGF-β1 plasmanivå i kreft i bukspyttkjertelen og dens korrelasjon med prognosen.
Genetiske varianter av TGF-p-spredningsveier gener har blitt rapportert i bryst, eggstokk, tarm, ikke-småcellet lunge og tykktarm kreft og kan forutsi kreft følsomhet eller ha prognostisk betydning [11] – [15]. Det finnes imidlertid ingen data til vår kunnskap i forhold til samme i bukspyttkjertelkreft. Vi hypotese at TGF-β veien aktivering er vanlig i bukspyttkjertelkreft og genetiske varianter av veien, plasma TGF-β1 nivå og tumor TGF-βR2 eller SMAD4 uttrykk er assosiert med klinisk utfall av kreft i bukspyttkjertelen. Identifiseringen av en kohort bukspyttkjertelkreft tilfeller der veien er aktivert kan potensielt føre til pasienten utvalg for TGF-β-rettet behandling.
Metoder
pasientpopulasjon og Biospecimens
alle pasienter med patologisk bekreftet bukspyttkjertelen duktalt adenokarsinom (PDAC) og som har signert et informert samtykke til medisinsk journal og trene seg studier for forskning ble inkludert. The Institutional Review Board of MD Anderson Cancer Center godkjent studiet. Klinisk informasjon om dato for pasientens diagnose, dødsdato eller siste oppfølging, tumorreseksjon status, klinisk tumorstadium, og serumnivået av karbohydrat antigen 19-9 (CA19-9) ved diagnose ble hentet fra pasienter medisinske poster. Vevsprøver, plasma og tumor-DNA ble hentet fra MD Anderson vev Banks.
Immunohistochemistry
Immunohistokjemi ble utført på formalinfiksert parafin innebygd (FFPE) deler. De primære antistoffer mot TGF-βR2 (Novus Biologicals, LLC, Littleton, CO) og SMAD4 (Proteintech Group, Inc. Chicago, IL) ble brukt på 1:350 og 1:450 fortynninger, henholdsvis. Den antistoffkomplekset ble påvist ved hjelp av ABC-kit (Vector Laboratories, Burlingame, CA). Kjerne- og cytoplasma farging ble spilt for begge merkene. Den fargeintensitet ble scoret som 0 for negativ, en for svak, to for middels, og 3 for sterk farging. Prosentandelen av celler med positiv farging ble scoret som 0 for ingen, ett for 1-50%, og to for 50%. Den endelige farging poengsum var et produkt av intensiteten og prosent score. Hver side ble evaluert av to etterforskere (DRS. Dongfeng Tan og Yanan Li) og konsistente data fra begge evaluatorer ble brukt i den endelige statistiske analysen.
Plasma nivå av TGF-β1
Plasma nivå av TGF-β1 ble målt ved hjelp av immunovervåkings kjernen Laboratory of MD Anderson hjelp av MSD® 96-brønners multi ARRAY®Human TGF-β1 Assay kit (Meso Scale Discovery, Rockville, MD). Alle prøver ble analysert i duplikat, og hver analyse hadde en positiv og en negativ kontroll. Variansen for dobbeltprøver var mindre enn 10%. Alle pasienter som er involvert i denne analysen ble rekruttert til en kasus-kontrollstudie på MD Anderson Cancer Center [16], [17]. Blodprøver ble oppsamlet før kreftbehandling eller ved tidspunktet for diagnose i 95% av tilfellene. Plasmaprøver var blitt lagret ved -80 ° C uten å tine før bruk i denne analysen.
genotyping
DNA ble ekstrahert fra perifere lymfocytter i de fleste av prøvene, og fra FFPE i 27 prøver. Genotyping brukte Sequenom fremgangsmåten som tidligere er beskrevet [18]. Totalt 28 SNPs av
TGF-β1
,
TGF-β2
,
TGF-β3
,
TGF-βR1
,
TGF-βR2 Hotell og
SMAD4
genene ble valgt med fokus på potensielt funksjonelle SNPs, dvs. SNPs i koderegionen (nonsynonymous eller synonymt), uoversatt region (UTR), arrangøren regionen og skjøting nettsteder, eller ins /del og frame-shift SNPs. SNPs ble identifisert fra NCBI SNP database og SNP500 Cancer database eller via litteraturgjennomgang og funksjonell analyse ved hjelp av F-SNP programvare (https://compbio.cs.queensu.ca/F-SNP/). Om lag 10% av prøvene ble analysert i duplikat og inkonsistente data ble utelatt fra den endelige statistisk analyse.
Statistical Analysis
IHC rille og plasma TGF-P1 nivåer ble presentert som gjennomsnitt ± standardavvik . Gjennomsnittlig forskjell mellom gruppene ble sammenlignet med t-test. De sammenslutninger av disse markørene og OS ble analysert ved hjelp av Kaplan Meier plott, log-rank test og Cox-modeller med justering for kjønn, rase, alder, tumorstadium, og CA19-9 nivåer. Disse markørene ble også analysert som kategoriske variabler ved hjelp av median eller kvartiler som cutoff-verdier.
Fordelingen av genotyper ble undersøkt for Hardy-Weinberg likevekt med godhet-of-fit chi-squared test. Genotype og allel hyppigheten av SNP ble bestemt ved direkte telling genet. De homozygote og heterozygote genotyper ble kombinert hvis frekvensen av den homozygote var meget lav, eller hvis begge genotyper hadde samme trenden med virkning [f.eks kortere total overlevelse (OS) sammenlignet med referent gruppe]. Sammenhengen mellom genotype og OS ble beregnet ved hjelp av Kaplan-Meier plott og log-rank test. Hazard ratio (HR) og 95% konfidensintervall (KI) ble estimert ved hjelp av multivariat Cox regresjon proporsjonal farer modeller. All statistisk testing brukt SPSS programvare (SPSS Inc, Chicago, IL).
P
verdien av 0,05 ble ansett som statistisk signifikant. Falske positive funn assosiert med multippel testing ble kontrollert av Bonfferoni korreksjon.
Resultater
Studiepopulasjonen ble identifisert fra en case-control studie på kreft i bukspyttkjertelen utført ved The University of Texas MD Anderson Cancer Center fra 1999 til 2012 [16], [17]. Tre grupper av pasienter ble identifisert: 1) 120 pasienter hadde tilstrekkelig biopsi eller kirurgiske prøver for immunhistokjemi; 2) 644 pasientene hadde blodprøver tatt for plasma TGF-β1 måling; og 3) 1636 pasienter hadde tilstrekkelig DNA-prøver som er tilgjengelige for genotyping. De demografiske og kliniske kjennetegn ved de tre studiepopulasjoner er beskrevet i tabell 1. alder, kjønn og rase /etnisk distribusjoner for pasientene var representative for MD Anderson pasientpopulasjonen. Gjennomsnittsalderen er 60,6, 61,4 og 62,1 år for pasienter inkludert i IHC, ELISA og genotyping studien, henholdsvis. Menn besto 72,5%, 61,5% og 59,0% av de tre studiepopulasjoner. Mer enn 85% av forsøkspersonene var ikke-spanske hvite. Nesten 74% av pasientene i IHC gruppe hadde metastatisk sykdom og derfor de vevsprøver som brukes for IHC var for det meste biopsiprøver [Trinn II: 8 (8,8%); Trinn III: 16 (17,6%); Stage IV: 67 (73,6%)]. Informasjon om svulst klasse var tilgjengelig i 60 prøver av dem, 20 ble moderat differensiert og 40 var dårlig differensierte svulster.
Protein Expression
I alt 91 prøver ble farget for TGF βR2 og SMAD4. Kvantitativ evaluering ble oppnådd i 88 prøver for TGF-βR2 og 81 prøver for SMAD4 (fig. 1). Kjerne- og cytoplasma farging ble observert, henholdsvis i 81 (92%) og 87 (99%) prøver for TGF-βR2 og i 47 (58%) og 72 (89%) prøver for SMAD4 (Fig. 1). Den samlede IHC poengsum for hver markør ble ikke forbundet med OS (data ikke vist). Pasienter med en høyere nukleær farging poengsum for TGF-βR2 hadde en forholdsvis kortere OS enn de med lavere score (Median overlevelsestid [MST] 12,0 versus 8,6 måneder, tabell 2), men denne forskjellen var ikke statistisk signifikant. Nuclear farging av SMAD4 var tilstede oftere (16/20, 80%) i dårlig differensierte svulster enn i moderat differensierte svulster (19/40, 47,5%) (
P
= 0,016, χ
2 test ). Videre, når TGF-βR2 og SMAD4 atom ekspresjon ble analysert i kombinasjon, ble det registrert at pasienter med lav ekspresjon av TGF-βR2 og høy ekspresjon av SMAD4 hadde en betydelig lengre OS enn andre (fig. 2), selv om denne forskjellen ikke var statistisk signifikant etter justering for andre kliniske prediktorer (tabell 2)
A:. Positive atom uttrykk for TGF-βR2 i en moderat differensiert ductal adenokarsinom i bukspyttkjertelen (Forstørrelse: 10 × 40). B: Positiv atom uttrykk for SMAD4 i moderat differensiert ductal adenokarsinom i bukspyttkjertelen (Forstørrelse: 10 × 40).
Nuclear farging 0-1 er definert som lav for TGF-βR2 og en poengsum 0 så lavt for SMAD4. Rød linje: TGF-βR2 er høyt og SMAD4 er lav (HL); svart linje: både høy (HH); grønn linje: begge er lav (LL); lilla linje: TGF-βR2 er lav og SMAD4 er høy (LH). Median overlevelse ganger er 7,8, 8,6, 11,3 og 15,6 måneder for HL, HH, LL og LH grupper, henholdsvis. Log-rank test P-verdier og resultater av Cox regresjonsanalyse er presentert i tabell 2. Dermed kan TGFfi-R2 /SMAD4 forholdet være prognostisk, med lave verdier tilsvarende med en bedret overlevelse.
Plasma TGF-β1 nivå
plasmanivået av TGF-β1 ble målt i 644 pasienter. Gjennomsnittlig og median nivå av TGF-β1 var 15,44 (SD 10,99) og 12.61 (interkvartilt område: 8,31 til 19,04) ng /ml. Nivået av TGF-β1 var forholdsvis høyere hos pasienter med lokalisert tumor enn de med avanserte tumorer. Gjennomsnitt ± SD av TGF-β1 nivået var 17,2 ± 14,3, 13,9 ± 8,7 og 15,5 ± 10,0 ng /ml hos pasienter med lokaliserte, lokalavansert eller metastatisk svulster, henholdsvis (
P
= 0,02, ANOVA). Imidlertid nivået av TGF-β1 var ikke assosiert med OS hos pasienter med lokalisert tumor (Tabell 3) eller i det hele studiepopulasjonen (MST = 12,9 og 11,1 måneder for de i de lavere kvartil versus de i den øvre kvartil rekkevidde,
P
= 0,78, log-rank test). Men pasienter med lokalavansert eller metastatisk sykdom og i øvre kvartil spekter av TGF-β1 nivå hadde betydelig redusert overlevelse enn sine kolleger (Tabell 3). TGF-β1 forble som en signifikant prediktor i en Cox regresjonsmodell med justering for demografi og andre kliniske faktorer.
Genotyping
Genotyping ble utført i 1636 pasienter. Den rapporterte mindre allelet frekvens og potensial funksjonelle betydningen av den 28 testes SNP er beskrevet i tabell 4. Ingen variant allel ble påvist i ni SNP’er. Blant de seks vanlige SNP’er med mindre allel frekvens større enn 5%, tre fulgt Hardy Weinberg Equilibrium (HWE) og tre avvek fra HWE (tabell 2). Genotypen distribusjon og total overlevelse tid ved genotype av de 19 informative SNPs er presentert i tabell 5. En betydelig sammenslutning av
SMAD4
SNP rs113545983 med OS ble observert (panel A, Fig. 3), og foreningen var sterkere hos pasienter med langt fremskreden sykdom (paneler C og D, fig. 3) enn de med lokalisert sykdom (panel B, fig. 3). Mutant G allel av SNP rs113545983 forble som en signifikant prediktor for død i Cox regresjonsmodell justert for scene og reseksjon status blant alle pasientene (HR: 1,54, 95% KI: 1,21 til 1,96,
P
0,001). Ingen andre SNPs viste signifikant sammenheng med OS. TGF-βR2 SNP rs2248048 hadde en svak sammenheng med OS uten statistisk signifikans (
P
= 0,09, log rank test)
Blå linje:. AA genotype; grønn linje: AG /GG genotype. AA-genotype var forbundet med en forbedret overlevelse i hele studiepopulasjonen. På subgruppeanalyse, dette overlevelse forskjellen var mer relevant for avansert sykdom stadium. P-verdier ved log-rank test er 0,0001, 0,369, 0,007 og 0,031 for paneler A, B, C og D, henholdsvis
Diskusjon
Vårt mål i denne studien var å undersøke biomarkører i TGF-β sti som kan ha prognostisk verdi og potensielt prediktiv verdi for målrettet behandling med hemmere. Vi avhørt svulsten biorepository ved MD Anderson Cancer Center og undersøkt arkivmateriale inkludert DNA, plasma og prøver svulst vev for SNPs, TGF-β1 plasmanivå og protein uttrykk av TGF-βR2 og SMAD4. Vi observerte at pasienter med lav ekspresjon av TGF-βR2 og høy uttrykk for SMAD4 i sine tumorer hadde en betydelig lengre OS enn andre undergrupper i vår studie. Vi har også lagt merke til at pasienter med avansert sykdom og høy TGF-β1 plasmanivået hadde betydelig redusert overlevelse enn de med et lavere nivå av TGF-β1. Til slutt, vi har oppdaget en signifikant sammenheng med
SMAD4
SNP rs113545983 med pasientens overlevelse. Disse observasjonene tilveiebringe verdifull informasjon vedrørende referanse TGF-β signalveien i kreft i bukspyttkjertelen, som kan benyttes i fremtiden målrettet terapi kliniske forsøk. TGF-β signalveien omfatter ligander og reseptorer; og de ligand-reseptor-interaksjoner føre til signaltransduksjon via SMADs. IHC foregående analyse har vist tilstedeværelse av ligand TGF-β1, TGF-β2 og TGF-β3 i PDAC kreft celler og nærvær av TGF-β2 var forbundet med avansert stadium tumor [19]. TGF-βR2 mRNA ble uttrykt i de fleste kreftceller og forbedrede nivåer av TGF-βR2 er blitt foreslått å ha en rolle i regulering av human bukspyttkjertelkreft cellevekst [20].
TGF-β2R
og
SMAD4
genet ble mutert i 4% og 50% av den menneskelige PDAC, henholdsvis [21]. Mangel på SMAD4 ekspresjon i tumor har vært assosiert med mer aggressiv sykdom [22]. Det er svært begrensede data som undersøker den prognostiske verdien av TGF-β pathway proteiner i avansert kreft i bukspyttkjertelen pasienter. Selv om vi ikke finner en signifikant sammenheng mellom SMAD4 og TGF-βR2 uttrykk individuelt med prognose, observerte vi at TGF-β2R og SMAD4 protein uttrykk ble påvist i 81% og 47% av svulstene og pasienter med lav ekspresjon av TGF-βR2 og høy uttrykk for SMAD4 hadde en betydelig lengre OS enn andre undergrupper i vår studie. Hua et al, rapporterte lignende funn i en mindre retrospektiv studie av pasienter med avansert kreft i bukspyttkjertelen [23]. En tidligere studie fra vår institusjon antydet at SMAD4 tap korrelerer med negativt resultat hos pasienter med lokalavansert kreft i bukspyttkjertelen mottar gemcitabin, oksaliplatin og cetuximab [24]. Som nevnt tidligere, ble SMAD4 tap forbundet med sykdom formidling i lokalavansert eller metastatisk kreft i bukspyttkjertelen tilfeller av Iacobuzio-Donahue, et al i en obduksjon serie [10]. På den annen side, har en litteratur-baserte meta-analyse av biomarkører i opererte kreft i bukspyttkjertelen ikke støtter den prognostiske verdi av SMAD4 i kirurgisk resectable sykdom [25]. Disse funn er i overensstemmelse med et scene-avhengig rolle av TGF-β veien.
Videre har vi funnet at pasienter med langt fremskreden sykdom og høy TGF-β1 plasmanivå var signifikant redusert overlevelse enn de med lavere TGF β1 nivå. Denne foreningen ble ikke sett hos pasienter med lokalisert sykdom. En tidligere studie har vist at mangel på TGF-β1 ekspresjon i tumorvev var forbundet med øket overlevelse postoperativ [19]. Grunnen til tilknytningen mellom høy TGF-β1 plasmanivå og dårlig overlevelse ved fremskreden sykdom trinn (og ikke med tidlig fase sykdom) er uklar. Disse resultatene er i samsvar med prekliniske data som tyder på at tapet av den veksthemmende reaksjon på TGF-β signale varierer direkte med ondartet stadium av tumoren og de mer aggressive former faktisk gå over til autokrin og /eller parakrin vekst stimuleres av TGF- β. Svulster kan også utskille TGF-β1 fører til endret antitumorimmunitet [26], [27]. Så vidt vi vet er det ingen tidligere data som undersøker prognostisk rolle TGF-β1 plasmanivået i bukspyttkjertelkreft. Tidligere undersøkelser i bryst, prostata, spiserøret og blærekreft indikerer en korrelasjon mellom høy TGF-β1 plasmanivå og dårlig prognose [28] – [31]. Konsistens med disse rapportene og den forholdsvis store prøvestørrelse på vårt studium bidrar til styrken av våre funn. På grunn av utfordringene i å få tilgang til målet vev hos pasienter med avansert sykdom, kan plasma biomarkører for TGF-β1 veien har en større klinisk verdi.
Genetiske varianter av TGF-β veien har vært knyttet til prognose og overlevelse i lungekreft med en annen studie utført ved vår institusjon. Hos pasienter som får platina-basert kjemoterapi; BNIP2: rs235756 og SMAD3: rs4776342 var signifikant assosiert med overlevelse [15]. Det er imidlertid ingen studier i bukspyttkjertelkreft samkjøre genomiske varianter av denne veien med prognosen. Vi observerte en signifikant sammenheng mellom
SMAD4
SNP rs113545983, en synonymt SNP, med OS i denne studien. Pasienter som bærer variant allelet hadde signifikant kortere OS og økt risiko for død etter justering for andre kliniske prediktorer. Dette SNP er en synonymt SNP som ikke produserer endrede sekvenser og aminosyresubstitusjon. Imidlertid har en tidligere studie viste at en synonymt SNP kan resultere i et proteinprodukt med endret legemiddel og inhibitor interaksjoner 32. Således må den funksjonelle konsekvens av dette SNP som skal undersøkes. Det er også mulig at denne SNP er i koblingsulikevekt med andre funksjonelle SNP’er av dette genet eller en del viktige gener i dette kromosom sted. Videre undersøkelser vil bidra til å finne ut hvordan dette SNP er funksjonelt knyttet til SMAD4 signale transduksjon og overlevelse i bukspyttkjertelen kreftpasienter.
Studien har flere begrensninger. På grunn av begrensning av vevsprøver og den lave MAF SNP valgt i studien, kan vi ikke undersøke sammenhengen mellom genotyper, plasma markør nivå og vev markører. Vi bare målt noen utvalgte markører fra de mange molekyler som er involvert i dette komplekset signalveien. Likevel, våre data gi verdifull grunnlagsinformasjon om denne veien uttrykk i kreft i bukspyttkjertelen, noe som kan utnyttes i målrettede terapi kliniske studier. Basert på ovennevnte funn kan det bli antatt at deteksjonen av høy TGF-β1 plasmanivå, SMAD4SNP rs113545983 eller høy TGF-βR2 /SMAD4 tumor proteinekspresjon forholdet kan foreslå en avhengighet av denne reaksjonsvei hos pasienter med fremskreden kreft i bukspyttkjertelen, og denne undergruppe kan potensielt ha nytte av TGF-β-rettet behandling.
