Abstract
Bakgrunn
BCL-2-forbundet X protein (Bax) er et proapoptotiske medlem av Bcl-2 familien kjent for å være aktivert og oppregulert ved apoptose. Enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i Bax promoter kan delta i prosessen med karsinogenese ved å endre sin egen ekspresjon og kreftrelaterte gener. Bax-248G En polymorfisme har vært innblandet å endre risikoen for kreft, men de oppførte resultatene er inkonsekvent og mangelfulle. I denne studien, utførte vi en meta-analyse for å systematisk oppsummere en mulig sammenheng mellom denne polymorfisme med risiko for kreft.
Metodikk
Vi har utført et søk av case-kontrollstudier på sammenslutninger av Bax-248G En polymorfisme med faren for kreft i Pub med, Science Direct, Wiley Online Library og hånd søk. Data fra alle kvalifiserte studier basert på noen sentrale søkeord, inklusjons- og eksklusjonskriterier ble hentet for denne meta-analysen. Hardy-Weinberg likevekt (HWE) i kontroller, styrkeberegning, heterogenitet analyse, ble Begg trakten plot, Egger lineære regresjon test, skog tomt og sensitivitetsanalyse utført i denne studien.
Resultater
kreftrisiko forbundet med Bax-248G En polymorfisme ble anslått av sammenslåtte odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (95% cIS). De sammenslåtte Ors ble beregnet i allel kontrast, homozygot sammenligning heterozygot sammenligning dominant og recessiv modell. Statistisk signifikans ble kontrollert gjennom Z og p-verdien i skogen plot. I alt syv uavhengige studier inkludert 1772 tilfeller og 1708 kontroller ble inkludert i vår meta-analyse. Våre resultater viste at verken allel frekvens eller genotype fordelinger av denne polymorfisme var forbundet med risiko for kreft i en hvilken som helst av de genetisk modell. Videre gjorde Egger test ikke viser noen betydelig bevis for publikasjonsskjevhet
Konklusjon /Betydning
Denne metaanalyse antyder at Bax-248G . En polymorfisme er ikke en viktig kreft risikofaktor. Likevel er ekstra godt designede studier med større utvalg med fokus på ulike etnisiteter og krefttyper som kreves for å ytterligere validere resultatene
Citation. Sahu SK, Choudhuri T (2013) Mangel på foreningen mellom Bax Arrangøren (- 248G A) enkeltnukleotidpolymorfi og Følsomhet mot kreft: Bevis fra en meta-analyse. PLoS ONE 8 (10): e77534. doi: 10,1371 /journal.pone.0077534
Redaktør: Bhaskar Saha, Nasjonalt Senter for Cell Science, India
mottatt: 16 april 2013; Godkjent: 04.09.2013; Publisert: 17 oktober 2013
Copyright: © 2013 Sahu, Choudhuri. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. SKS var støttet av Rådet for industriell og teknisk forskning, Government of India. Dette arbeidet ble støttet av en egenutført bevilgning på Institutt for miljø- og biovitenskap, Institutt for bioteknologi, Government of India. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
De konkrete årsakene til kreft er ennå ikke kjent. Epidemiologiske studier bidra til å foreslå forholdet av genetisk polymorfisme til kreft mottakelighet. Genetiske foreningen studier med enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) rettet mot kreft dukker forskningsområde. SNP kan defineres som en genomiske locus hvor to eller flere alternative baser opptrer med betydelig hyppighet på større enn 1% [1]. Totalt rundt 10 millioner SNP’er er fordelt over hele det humane genom ved en frekvens på minst en av 1000 basepar og oppviser lav mutasjonsfrekvens [2]. Tidligere studier har vist at SNP’er i onkogener (f.eks Ras [3], MDM2 [4] og VEGF [5]) og tumorsuppressorgener (for eksempel p53 [6], Rb, og p16 [7]) kan beskytte eller øke sensitiviteten mot kreftrisiko. Således kan SNP analyse være et verktøy for å forklare de genetiske kompleksiteten som er ansvarlige for den kreftutviklingen i en viss grad. Det ser ut til å bidra til identifisering av nye kreft-relatert gen som en biologisk markør for å forutsi et individs sannsynligheten for å utvikle kreft. Den Bax genet er en godt studert tumorsuppressorgen i forskjellige celletyper. Bax kodes av seks eksoner og uttrykker et komplekst mønster av alternative RNA-spleising som danner et 21kD membran (α) og to former av cytosolisk protein (β og γ). Den tilhører et proapoptotiske medlem av Bcl-2-familien og har vært implisert i induksjon av apoptose [8]. Det er inaktiv i cytosol fra ikke-apoptotiske celler i løpet av homeostatiske betingelser. Ved en celledød signal, Bax gjennomgår en konformasjonsendring som fører til deres innsetting, oligomerisering og dannelsen av store porer gjennom det ytre mitokondriemembranen [9]. Mange apoptogenic faktorer som cytokrom c [10,11], Smack /Diablo [12], Omi /HtrA2 [13], endonuklease G [14] og apoptose induserende faktor [15] blir sluppet gjennom denne pore og rekruttere ulike molekyler av apoptotiske trasé . Tallrike studier har vist at veksling av Bax ekspresjon spiller en viktig rolle i patogenesen av kreft [16-21]. Genetisk forandring av Bax genet kan ha fremstående betydning i kreft initiering og progresjon siden den har en serie av målgener inkludert mange onkogener og tumorsuppressorgener [22-26]. Studier av sammenhengen mellom SNPs i Bax og kreft hos mennesker har gitt ny innsikt i de molekylære mekanismene for kreftutvikling. Hittil har minst 111 Bax SNPs blitt rapportert i Enterzdatabase. I tilfelle av gastrointestinal kreft missense mutasjoner av Bax genet i kodon 169 (Thr Ala eller Thr Met) fører til inhibering av proapoptotiske aktivitet av proteinet og styrke utviklingen av kreft [27]. En guanin erstatter adenosin ved posisjon 125 (G125A) i Bax promoter er assosiert med høyere stadier av kronisk lymfatisk leukemi (KLL) og svikt i behandlingsrespons [28]. En stille punktmutasjon i Bax kodon 184 (TCG TCA) har blitt rapportert i lungekreft pasienten [29]. Selv Bax genet polymorfi er noe som tyder på sitt potensial engasjement i kreftutvikling, nåværende kunnskap SNP ligger innenfor 5′-utranslaterte område av arrangøren av Bax genet, 248G er A, i kreft fortsatt spredt og begrenset. Bax-248GA polymorfisme har blitt assosiert med nedregulering av Bax genekspresjon, avansert stadium av sykdommen, lavere behandlingsrespons og minsket overlevelse i KLL og lungekreft. Det er også motstridende rapporter som viser mangel på sammenheng mellom denne polymorfisme med risiko for KLL og brystkreft. Dermed noen gruppe forskere rapporterte Bax-248GA polymorfisme kan være bio-markør av følsomhet eller protectibility til kreft [30-32], mens andre [33-37] viser en mangel på sammenheng. Men med relativt små utvalgsstørrelser, disse tidligere studiene gitt begrenset informasjon, og kunne ikke trekke en convincible konklusjon. Derfor utførte vi en meta-analyse med alle tilgjengelige studier (Sjekkliste S1. PRISMA sjekkliste.) For å gi en mer pålitelig konklusjon om forholdet mellom Bax-248GA polymorfisme og kreftrisiko.
Materialer og Metoder
Publisering Søk
et omfattende søk ble utført på Pub med, Science Direct, Wiley Online Library og hånd søk med en kombinasjon av følgende søkeord: Bax, polymorfisme, SNP, mutasjon og /eller kreft opptil mars 2013. Vi evaluerte alle tilknyttede publikasjoner for å identifisere de mest kvalifiserte litteratur. Utvelgelsen Fremgangsmåten i denne studien er vist i figur 1. Resultatene var begrenset til artikler publisert i engelsk. Til slutt ble sju studier identifisert som kvalifisert artikler i denne meta-analyse for Bax-248GA polymorfisme, inkludert fire studier på KLL (812 tilfeller og 462 kontroller), en studie på plateepitelkarsinom (814 tilfeller og 934 kontroller), en studie på lungekreft (93 tilfeller 230 kontroller) og en studie på brystkreft (53 tilfeller 82 kontroller).
Dette er basert på publikasjonen søke, inklusjons- og eksklusjonskriteriene.
Inkludering og eksklusjons~~POS=TRUNC kriterier~~POS=HEADCOMP
følgende kriterier ble brukt til å velge studier for meta-analyse (a) publisert i fagfellevurderte tidsskrifter, (b) artikler om Bax-248GA polymorfisme og risiko for kreft og (c) artikler som inneholder nyttig allel og genotype frekvens. Eksklusjonskriteriene var (a) ikke case-control studier, (b) kontroll befolkningen blant annet med tilfeller av kreft, og (c) duplisering av en tidligere utgivelse.
datauttrekk
To etterforskere (SKS og TC) anmeldt og hentet informasjon fra alle kvalifiserte publikasjoner uavhengig av hverandre i henhold til inklusjons- og eksklusjonskriteriene nevnt ovenfor. Følgende egenskaper ble tatt fra hver studie: første forfatternavn, utgivelsesår, opprinnelsesland, krefttype, genotyping metode for vurdering av Bax-248GA polymorfisme, totalt antall kontroller og tilfeller med G /G, G /A og A /A genotyper.
Statistical Analysis
Først vurderes vi Hardy-Weinberg likevekt (HWE) for hver studie med SNPalyze programvare (Dynacom, Japan) for å identifisere systematiske feil i genotype. En styrkeberegning ble utført a priori å bruke PS: Makt og Sample Size Programvare for beregning (https://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize) som viste at en utvalgsstørrelse på nesten 200 kontroller og tilfeller vil gi en kraft på mer enn 50%. Genotype og allelfrekvenser ble beregnet ved manuell telling. All statistisk analyse for den aktuelle meta-analyse ble utført av omfattende meta-analyse versjon 2 programvare. Foreningen av Bax-248GA polymorfisme med kreft ble vurdert ved beregning av odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (CIS) i ulike modeller: (i) allelet kontrast (A versus G), (ii) homozygot sammenligning (AA versus GG), (iii) heterozygot sammenligning (GA versus GG), (iv) dominerende modellen (AA + GA versus GG) og (v) recessiv modell (AA versus GG + GA) i studie i, II, III, IV og V hhv. Også, Z og p-verdiene beregnet i skog plottet (figur 2) I alle tilfeller resultatene av heterogenitet testen var p
heterogenitet 0,05, så ORS ble oppsamlet i henhold til de tilfeldige virkninger modellen (Der Simonian og Laird metode). I tillegg har jeg
2 statistikk ble brukt til å kvantifisere inter studie variasjonen som kan tilskrives heterogenitet i stedet sjansen. Det varierer mellom 0% og 100%, hvor verdien 0% indikerer ingen observert heterogenitet og større verdier indikerer en økende grad av heterogenitet (I
2 = 0-25%, ingen heterogenitet, jeg
2 = 25 -50%, moderat heterogenitet, jeg
2 = 50-75%, stor heterogenitet, jeg
2 = 75-100%, ekstrem heterogenitet). Moderat heterogenitet ble observert i de fleste av modellene som ble inkludert for analyse (Overall allelet, A vs. G: P
heterogenitet 0,0001, jeg
2 = 79,42; homozygot sammenligning AA vs GG: P
heterogenitet = 0,01, jeg
2 = 69,92; heterozygot sammenligning GA vs GG: P
heterogenitet = 0,008, jeg
2 = 65,72; Totalt dominerende modellen, AA + GG vs. GG: P
heterogenitet 0,0001, jeg
2 = 75,54; Samlet recessive modell, AA + GG vs. GG: P
heterogenitet = 0,03, jeg
2 = 62,07).
De torg og horisontale linjer tilsvarer studien bestemte odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (KI) hhv. Arealet av kvadratene reflekterer undersøkelsen egenvekt (inverse av variansen). Diamanten representerer sammenslåtte ORS og 95% CI.
Resultater
Study Karakteristisk
Vi identifiserte 230 potensielt relevante artikler fra vår leting etter den publiserte litteraturen, av som 196 artikler ble ekskludert etter første gjennomgang. Dermed ble totalt 34 studier identifisert gjennom valg basert på inklusjonskriteriene. Under utvinning av data 25 artikler som ikke var relevant for Bax-248GA polymorfisme og kreft ble ekskludert. Til slutt, igjen to studier ble ekskludert etter fulltekst gjennomgang, en på grunn av mangel på skikkelig kategorisering av kontroller /tilfeller [33] og en annen er ikke å gi relevante data [38]. Derfor sju kasus-kontrollstudier inkludert 1772 tilfeller og 1708 kontroller (oppdatert mars 2013) ble identifisert og inkludert i den endelige meta-analyse (Figur 1.) De viktigste egenskapene ble presentert i Tabell 1. Eksempel størrelsen av de syv studiene varierte fra 59 til 1748. de syv studiene inkluderer befolkningen fra USA (USA), Storbritannia (UK), Tyskland, Canada, Sverige, Russland, Tyrkia og Finland [30-32,34-37]. Fordelingen av Bax-248GA polymorfisme frekvens blant sakene og kontroll av de syv studier i ulike krefttyper (KLL, plateepitelkarsinom, lungekreft og brystkreft) ble oppført i tabell 1. genotype frekvens i kontroll av alle studiene er adlyde HWE bortsett studiet av Kuznestova et al [32].
Først forfatter, årstall, Ref
Country
Cancer typen
Genotyping metode
utvalgsstørrelsen
Controls
Cases
p
verdien av HWE
Power (%) plakater (Kontroll /case) GGGAAAGGGAAAA.Saxena, 2002, [30] Canada Kronisk lymfatisk leukemiaPCR25 /342410221200.9117J. Starczynski, 2005, [33] UKChronic lymfatisk leukemiaPCR135 /2031151911574420.8282A. Skogsberg, 2006, [34] Sverige, Germeny, FinlandChronic lymfatisk leukemiaPCR207 /4631634043738460.4099H. Nuckel, 2006, [35] GermanyChronic lymfatisk leukemiaPCR95 /11279151872140.7658K. Chen, 2007, [36] USASquamous celle carcinomaPIRA-PCR934 /81472320011627170170.49100Irina A. Kuznetsova, 2012, [32] RussiaLung CancerPCR-RFLP230 /931118039672150.000580Yemilha Yildiz, 2013, [37] TurkeyBreast cancerPCR82 /5363190431300.2339Table 1. Fordeling av Bax-248G En genotype blant krefttilfeller og kontroller omfatter i meta-analyse
MERK: PCR;. polymerase chain reaction, PIRA; Primer-introdusert restriksjonsanalyse, HWE; Hardy-Weinberg likevekt. CSV Last ned CSV
Meta-analyseresultater
I alt ble sju uavhengige studier undersøkt og resultatene var meta-analyse. Skog tomter i figur 2, viser de detaljerte resultatene av Bax-248GA polymorfisme og risikoen for kreft. ble observert overordnet analyse for alle genetiske modeller (OR = 1,032, 95% KI = 0,687 til 1,549, Z-verdi = 0,151, p-verdi = 0,880 for A versus G i studie I, OR = 0,903, 95% KI = 0,308 til 2,646, Z-verdi = -0,186, p-verdi = 0,852 for AA versus GG i studie II, OR = 1,028, 95% KI = 0,714 til 1,480, Z-verdi = 0,147, p-verdi = 0,883 for GA versus GG i studie III, OR = 1,031, 95% KI = 0,680 til 1,561, Z-verdi = 0,142, p-verdi = 0,887 for dominerende modellen AA + GA versus GG i studie IV, OR = 0,932, 95% KI = 0,360 til 2,417, Z-verdi = -0,144, p-verdi = 0,886 for recessive modell AA versus GG + GA i studie V). I alle tilfeller, p-verdier var 0,05. Så ingen av modellen viste ingen signifikante sammenhenger for Bax-248GA polymorfisme og risiko for kreft.
Følsomhet Analyser
Sensitivitetsanalyser ble utført for å vurdere stabiliteten av resultatene ved sekvensiell utelatelse av enkelte studium hver gang. Dette reflekterer påvirkning av individuelle datasett til de sammenslåtte ORS. Betydningen av sammenslåtte ORS ble ikke påvirket overdrevet ved å utelate noen enkelt studie (tilleggstallene: S1, S2, S3, S4, S5, S6 og S7).
publikasjonsskjevhet
Begg trakten tomten og Egger er lineære regresjon tester [39] ble utført for å vurdere publikasjonsskjevhet i rapportene inkludert for meta-analyse. Trakten plottet er en plotting av et mål for undersøkelse størrelse (vanligvis standardfeil eller presisjon) på den vertikale aksen som en funksjon av effektstørrelse på den horisontale aksen. Formen på trakt plott viste ingen tegn på asymmetri i alle sammenligningsmodeller: (i) allelet kontrasten (A eller G), (ii) homozygot sammenligning (AA versus GG), (iii) heterozygot sammenligning (GA versus GG), (iv) dominerende modellen (AA + GA versus GG) og (v) recessiv modell (AA versus GG + GA) i studie i, II, III, henholdsvis IV og V (figur 3). Deretter ble Egger test brukes til å gi statistisk bevis for trakt tomten symmetri. Denne testen vurderer skjevhet ved hjelp av presisjon å forutsi standardisert effekt. I denne aktuelle analyser for studien I: skjærings = 0,91, 95% CI = -3,51 til 5,35, P-verdi = 0,61, SE = 1,72, t-verdi = 0,53, df = 5; For studie II: skjærings = 0,45, 95% CI = -7,13 til 8,05, P-verdi = 0,86, SE = 2,38, t-verdi = 0,19, df = 3; For studie III: skjærings = 1,09, 95% CI = -2,21 til 4,40, P-verdi = 0,43, SE = 1,28, t-verdi = 0,85, df = 5; For studie IV: skjærings = 0,97, 95% CI = -3,06 til 5,02, P-verdi = 0,56, SE = 1,57, t-verdi = 0,62, df = 5; For studie V: skjærings = 0,36, 95% CI = -6,39 til 7,11, P-verdi = 0,87, SE = 2,12, t-verdi = 0,17, gjorde df = 3. Resultatene viser ingen tegn på publikasjonsskjevhet (tabell 2 .).
Hvert punkt representerer en egen studie. Den ELLER ble plottet på en logaritmisk skala mot presisjon (gjensidige av SE) for hver studie.
Sammenligninger
Egger sin regresjonsanalyse
Heterogenitet analyse
modell som brukes for meta -analysemetoder
Intercept
95% konfidensintervall
P- verdi
SE
t-verdi
df
P
heterogenitet
jeg
2 (%)
A vs G0.91-3.51 til 5.350.611.720.535 0.000174.92RandomAA vs GG 0,45 til 7,13 til 8.050.862.380.1930.0169.92RandomGA vs GG1.09-2.21 å 4.400.431.280.8550.00865.72RandomAA + GA vs GG0.97-3.06 til 5.020.561.570.625 0.000175.54RandomAA vs GG + GA0.36-6.39 å 7.110.872.120.1730.0362.07RandomTable 2. statistikk for å teste publikasjonsskjevhet og heterogenitet i meta-analyse for Bax -248G . en polymorfisme og kreftrisiko
CSV ned CSV
Diskusjoner
Apoptose er en hendelse som fører til døden av cellen uten å slippe skadelige stoffer i vevet . I mitokondriene mediert celledød ved apoptose Fremgangsmåte Bax fungerer som en viktig gatekeeper som dens aktivering irreversibelt begår de fleste av cellene dør [40,41]. Det har blitt studert i stor utstrekning på dens forbindelse med forskjellige typer av cancer, slik som bukspyttkjertelen [19,42], blære [21], gastrisk [18], kolorektal [43,44], øsofageal [16], lunge [32,45 , 46], livmorhals [47], tykktarm [48,49], prostata karsinom [50,51], plateepitelkarsinom i hode og hals [36], nasofaryngeal karsinom [52], brystcarsinomer [32,53], ovarialcancer [54], nyre- og overgangsordning celle kreft [55], hjernesvulst [56], CLL [30,31,33-35,38,57], Hodgkins lymfom [17], non-Hodgkins lymfom [58], myelom [59], akutt leukemi [60], inneholder etc. Bax promoter responselementer for en viktig tumor suppressor p53 og dette påvirker genekspresjon [28]. Med hensyn til de viktige roller Bax i apoptose, er det sannsynlig at dens biologisk polymorfisme kan modulere risikoen for kreft. Endret uttrykk for Bax protein synes relevant for kreftutvikling, men mutasjoner fører til deregulering og korrelasjoner av disse mutasjonene med kreft har tiltrukket seg oppmerksomheten blant forskeren. Flere grupper har undersøkt forholdet mellom Bax-248GA polymorfisme og kreft i ulike studier så langt. I den første rapport av Saxena et al. i løpet av 2002, i en studie av 25 kontroller og 34 KLL pasienter de har vist at en økt genotype frekvensen av Bax-248GA polymorfisme i pasient sammenlignet med kontroller, spesielt i høyere sykdomsstadiet. I denne studien genotypen frekvens i kontrollgruppen var 5,7% for GA genotyper, som var 68,7% for KLL i stadium I-IV [30]. Dette funnet ble støttet av en studie av Moshynska et al. i hvilken de har demonstrert dette SNP som en årsak til redusert Bax proteinekspresjon [31], som kan være en grunn av resistens ved CLL pasient. I en fersk undersøkelse utført av Kuznestova et al. i 2012, viste en betydelig økning i hyppigheten av -248G allel (88,33%) og -248GG genotype (72,04%) hos lungekreftpasienter som var henholdsvis 65,65% og 48,26% for friske kontroller. Således, har de vist den beskyttende rollen til denne polymorfisme.
Men resultatene fra andre grupper rapporterte manglende sammenslutning av denne polymorfisme og risiko for kreft. Starczynski et al. i deres studie funnet 23% av KLL og 15% av kontrollen uten signifikant allel frekvens mellom de to gruppene [33]. Skosberg et al. i deres CLL pasienter fant ingen signifikant forskjell i total overlevelse med eller uten Bax polymorfisme [34]. Nuckel et al. viste genotype fordeling mellom KLL pasienter (87 GG, 21AG, 4 AA) og friske kontroller (79 GG, 15 AG, en AA) var ikke signifikant forskjellig som tyder på at dette polymorphism ikke kan øke sannsynligheten for KLL (G-allel frekvens KLL pasienter : 0.87; kontroller: 0,91) [35]. Chen et al. fant ingen statistisk signifikant forskjell i frekvensfordelingene av Bax-248 G En SNP mellom saker og kontroller (P = 0,625). Når Bax GG genotype ble tatt som referansegruppen, ble ingen sammenheng funnet mellom AA og AG variant genotyper med plateepitelkarsinom i hode og hals (SCCHN) risiko [36]. Yildiz et al. viste at Bax Bax-248GA genotype og allel frekvens mellom kontroller og pasienter med brystkreft ble ikke statistisk signifikant (p = 0,866; p = 0,856 henholdsvis) [37]. I det hele tatt, de resultater om sammenhengen mellom Bax-248GA polymorfisme og kreftrisiko er fortsatt motstridende og mangelfulle. De motstridende resultater er muligens på grunn av en liten effekt av Bax-248GA polymorfisme på kreftrisiko eller relativt lav statistisk styrke av publiserte studier. Så ble trengte denne meta-analyse for å vise en kvantitativ metode for å kombinere de forskjellige tilgjengelige resultater. Meta-analyse er en kraftfull fremgangsmåte som kan kombinere resultatene av flere uavhengige lignende studier med inkonsekvente resultater for å fremstille et enkelt estimat av større effekt med forbedret presisjon [39]. I denne aktuelle meta-analyse, ble totalt syv kasus-kontrollstudier analysert for å gi en helhetlig vurdering av sammenhengen mellom Bax-248GA polymorfisme og samlet kreftrisiko. Som er involvert i den meta-analyse studiene var forholdsvis liten, men det totale antallet kontroller og tilfeller var betydelig, noe som øker den statistiske kraften av analysen. De case-control studier inkludert i denne analysen var tilfredsstillende som de møtte våre forhåndsdefinerte inklusjonskriteriene. Vi gjorde ikke oppdage eventuelle publikasjonsskjevhet som tyder på at hele samlede resultatene var objektivt.
Odds ratio ble benyttet for å bestemme de relative oddsen for forekomsten av kreftrisiko med Bax-248GA polymorfisme og 95% KI for å estimere presisjonen av OR. Et stort CI indikerer et lavt nivå av presisjon av OR, mens en liten CI indikerer en høyere presisjon av OR. I våre resultater som vist i figur 2, personer med allel A hadde en økt risiko for kreft sammenlignet med villtype-allel A (OR = 1,032, 95% C I = 0,687 til 1,549). Personer med homozygot variant AA hadde en redusert risiko for kreft sammenlignet med villtype GG variant (OR = 0,903, 95% KI = 0,308 til 2,646) og med heterozygot variant GA hadde en økt risiko for kreft sammenlignet med villtype GG variant (OR = 1.028, 95% KI = 0,714 til 1,480). I dominerende modellen, personer med genotype (AA + GA) hadde en økt risiko for kreft sammenlignet med villtype GG variant (OR = 1,031, 95% KI = 0,680 til 1,561) og i recessive modell, homozygot variant AA hadde en redusert risiko for kreft sammenlignet med (GA + GG) genotype (OR = 0,932, 95% KI = 0,360 til 2,417). Men i hele over fem sammenligning modell p-verdier var 0,05 som foreslo en mangel på signifikant assosiasjon til økning eller reduksjon risiko for kreft på grunn av Bax-248GA polymorfisme.
Heterogenitet ble observert blant disse studiene gjennom jeg
2 verdi. Den heterogenitet kan skyldes ulike faktorer, som for eksempel mangfold i befolkningen karakteristisk, studiedesign, forskjeller i antall tilfeller og kontroller, genotype metode, etc. Noen kvalifiserte upubliserte publikasjoner var ikke tilgjengelig for å inkludere i den nåværende meta-analyse, som kan påvirke resultatene. Utvalgsskjevhet kunne ha spilt en rolle for å påvirke resultatet fordi genotype distribusjon av denne polymorfisme fravikes HWE i en studie [32]. Resultatene var basert på ujusterte estimater, mens en mer presis statistisk analyse bør gjennomføres dersom enkelte datasettet var tilgjengelig. Dette ville tillate etterforsker for justering av andre konfunderende variabler, inkludert miljøfaktorer og annen livsstil.
Så langt vi kjenner til er dette den første meta-analyse vedrørende helhetlig vurdering av forholdet mellom Bax-248GA polymorfisme og risikoen for kreft. Våre resultater støttet ikke en genetisk sammenheng mellom denne polymorfisme og faren for kreft bekrefter med noen av de tidligere case-control studier [34-37]. Verken allelfrekvenser heller genotype distribusjoner var signifikant assosiert med faren for kreft som hypoteser som Bax-248GA polymorfisme kan ha noen rolle i sårbarhet kreft. I tillegg, på grunn av den relativt lite utvalg, resultatet trengte ytterligere validering og bekreftelse med store prøve studier
Etter praktiske anbefalinger som utgjør handlingspoeng kan være vurdere i fremtidige assosiasjonsstudier.
mangelen foreningen i denne studien av Bax-248GA polymorfisme og kreftrisiko bør gjentas med biologiske funksjoner for å bedre motivere studien og for å muliggjøre tolkningen av resultatene. Histopatologiske og kliniske data kan under klassifisere type og stadium av mange krefttilfeller for å få mer homogen befolkning for analyse.
Prøv å redusere falske positive og negative resultater ved å gjennomføre studiene i et stort utvalg med lagdeling av alder, sex, mat vane, livsstil og etnisitet.
studier undersøke den kombinerte effekten av forskjellige Bax polymorfisme eller ulike polymorfismer av Bax relaterte gener (f.eks BCL2) bør undersøkes.
rollen til miljøfaktorer og epistatisk interaksjonen ikke er vurdert i denne studien på grunn av mangel på informasjon i originale publiserte artikler som trenger å utforske videre for å trekke mer sikre konklusjoner.
Konklusjon
denne studien viser ingen signifikant sammenheng med Bax -248GA SNP til kreftrisiko som bevis fra alle genetiske modeller. Dessuten ville det være opplysende å utvide etterforskningen til et bredere spekter av menneskelige populasjoner blant annet ulike krefttyper som kan føre til et bedre, helhetlig forståelse av sammenhengen mellom denne polymorfisme og faren for kreft. Evnen til å gjennomføre involvering av denne SNP mot kreft etiologi og den enkeltes mulighet for å utvikle kreft ved å vurdere den foreslåtte anbefalingen vil bidra i fremtiden. Dette kan videre føre til grunnleggende forskning eller klinisk praksis for å redde menneskeliv.
Hjelpemiddel Informasjon
Sjekkliste S1.
PRISMA sjekkliste.
doi: 10,1371 /journal.pone.0077534.s001 plakater (DOC)
Figur S1.
Forest plot (A) og trakt plot (B) av Bax-248G En polymorfisme i forbindelse med kreft etter utelatelse av A. Saxena et al. (2002) studie.
I skogen plot (A), torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (KI) hhv. Arealet av kvadratene reflekterer undersøkelsen egenvekt (inverse av variansen). Diamanten representerer sammenslåtte ORS og 95% CI. I trakt plot (B), representerer hvert punkt en egen studie. Den ELLER ble plottet på en logaritmisk skala mot presisjon (gjensidige av SE) for hver studie
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077534.s002 plakater (TIF)
Figur S2.
Forest plot (A) og trakt plot (B) av Bax-248G En polymorfisme i forbindelse med kreft etter utelatelse av J. Starczynski et al. (2005) studie.
I skogen plot (A), torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (KI) hhv. Arealet av kvadratene reflekterer undersøkelsen egenvekt (inverse av variansen). Diamanten representerer sammenslåtte ORS og 95% CI. I trakt plot (B), representerer hvert punkt en egen studie. Den ELLER ble plottet på en logaritmisk skala mot presisjon (gjensidige av SE) for hver studie
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077534.s003 plakater (TIF)
Figur S3.
Forest plot (A) og trakt plot (B) av Bax-248G En polymorfisme i forbindelse med kreft etter utelatelse av A. Skogsberg et al. (2006) studie.
I skogen plot (A), torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (KI) hhv. Arealet av kvadratene reflekterer undersøkelsen egenvekt (inverse av variansen). Diamanten representerer sammenslåtte ORS og 95% CI. I trakt plot (B), representerer hvert punkt en egen studie. Den ELLER ble plottet på en logaritmisk skala mot presisjon (gjensidige av SE) for hver studie
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077534.s004 plakater (TIF)
Figur S4.
Forest plot (A) og trakt plot (B) av Bax-248G En polymorfisme i forbindelse med kreft etter utelatelse av H. Nuckel et al. (2006) studie.
I skogen plot (A), torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (KI) hhv. Arealet av kvadratene reflekterer undersøkelsen egenvekt (inverse av variansen). Diamanten representerer sammenslåtte ORS og 95% CI. I trakt plot (B), representerer hvert punkt en egen studie. Den ELLER ble plottet på en logaritmisk skala mot presisjon (gjensidige av SE) for hver studie
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077534.s005 plakater (TIF)
Figur S5.
Forest plot (A) og trakt plot (B) av Bax-248G En polymorfisme i forbindelse med kreft etter utelatelse av K. Chen et al. (2007) studie.
I skogen plot (A), torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (KI) hhv. Arealet av kvadratene reflekterer undersøkelsen egenvekt (inverse av variansen). Diamanten representerer sammenslåtte ORS og 95% CI. I trakt plot (B), representerer hvert punkt en egen studie. Den ELLER ble plottet på en logaritmisk skala mot presisjon (gjensidige av SE) for hver studie
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077534.s006 plakater (TIF)
Figur S6.
Forest plot (A) og trakt plot (B) av Bax-248G En polymorfisme i forbindelse med kreft etter utelatelse av Irina A. Kuznetsova et al. (2012) studie.
I skogen plot (A), torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (KI) hhv. Arealet av kvadratene reflekterer undersøkelsen egenvekt (inverse av variansen). Diamanten representerer sammenslåtte ORS og 95% CI. I trakt plot (B), representerer hvert punkt en egen studie. Den ELLER ble plottet på en logaritmisk skala mot presisjon (gjensidige av SE) for hver studie
doi:. 10,1371 /journal.pone.0077534.s007 plakater (TIF)
Figur S7. Arealet av kvadratene reflekterer undersøkelsen egenvekt (inverse av variansen).
