Abstract
Ikke småcellet lungekreft (NSCLC) er den ledende årsak til kreft-relaterte dødelighet på verdensbasis, og de aller fleste tilfeller blir diagnostisert på slutten stadier av sykdommen. Det er for tiden ingen kostnadseffektiv screening test for NSCLC, og utviklingen av en slik test er et folkehelse imperativ. Nyere studier har antydet at brystet computertomografi screening av pasienter med høy risiko for lungekreft kan øke overlevelsen av sykdom, men har ikke blitt etablert kostnadseffektivitet av slik screening. I denne fase I /II biomarkør studien undersøkte vi muligheten for å bruke serum miRNA som biomarkører av NSCLC ved hjelp av RT-qPCR å undersøke uttrykket av 180 miRNAs i sera fra 30 behandlingsnaive NSCLC pasienter og 20 friske kontroller. Receiver Operating karakteristiske kurver (ROC) og areal under kurven ble brukt til å identifisere forskjellig uttrykt miRNA parene som kan skille NSCLC fra friske kontroller. Utvalgte miRNA kandidater ble ytterligere validert i sera fra ytterligere 55 NSCLC pasienter og 75 friske kontroller. Undersøkelse av miRNA uttrykk nivåer i serum fra en multi-institusjonelle kohort av 50 pasienter (30 NSCLC pasienter og 20 friske kontroller) identifiserte forskjellig uttrykt miRNAs. En kombinasjon av to forskjellig uttrykt mirnas Mir-15b og MIR-27b, var i stand til å diskriminere NSCLC fra friske kontroller med sensitivitet, spesifisitet, positiv prediktiv verdi (PPV) og negativ prediktiv verdi (NPV) på 100% i treningssettet. Ved videre testing på flere 130 personer (55 NSCLC og 75 friske kontroller), spådde denne miRNA par NSCLC med en spesifisitet på 84% (95% KI 0,73 til 0,91), sensitivitet på 100% (95% KI, 0,93 til 1,0), NPV på 100%, og PPV på 82%. Disse dataene gir bevis for at serum mirnas har potensial til å være sensitive og kostnadseffektive biomarkører for tidlig deteksjon av NSCLC. Videre testing i en fase III biomarkør studie i er nødvendig for validering av disse resultatene
Citation. Hennessey PT, Sanford T, Choudhary A, Mydlarz WW, Brown D, Adai AT, et al. (2012) Serum mikroRNA Biomarkører for deteksjon av ikke-småcellet lungekreft. PLoS ONE 7 (2): e32307. doi: 10,1371 /journal.pone.0032307
Redaktør: Neeraj Vij, Johns Hopkins School of Medicine, USA
mottatt: 01.09.2011; Godkjent: 26 januar 2012; Publisert: 28 februar 2012
Copyright: © 2012 Hennessey et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Denne forskningen ble finansiert delvis av National Institute of Health SBIR stipend # 1R43CA141786-01 og ved National Institute of Health stipend # T32DC000027. Disse organer hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet. Denne forskningen ble også finansiert delvis av Asuragen, Inc. Forskerne ved Asuragen, Inc. som deltok i denne studien ikke var påvirket av ledelsen eller parter utenfor deres forskningsgruppe og hadde eksklusiv kontroll over studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:. Dr. Elizabeth Mambo, Tiffany Sanford, Ashish Choudhary, og Alex Tamas Adai er ansatt i Asuragen, Inc. David Brown var en ansatt i Asuragen på den tiden forskningen ble gjennomført. Alle disse forskerne utført forskningen rapportert i denne publikasjonen som en del av sitt arbeid med Asuragen. Det er ingen direkte økonomisk fordel for forskerne for publisering av dette manuskriptet. Asuragen gjennomfører uavhengig intern gjennomgang av manuskripter å opprettholde faglig integritet og håndtere interessekonflikter. David Brown i dag er ansatt i miRNA Therapeutics, Inc. Han utført forskningen som presenteres i denne artikkelen mens han var ansatt i Asuragen, Inc. Hans deltakelse i forskning presentert i dette manuskriptet endte etter at han forlot Asuragen, Inc. ledelse og eiere av miRNA Therapeutics hadde ingen rolle i forskningen presentert i dette manuskriptet eller noen innflytelse over utarbeidelsen av manuscript.This endrer ikke forfatternes tilslutning til alle PLoS ONE politikk på deling av data og materialer.
Innledning
Lungekreft er den ledende årsak til kreft-relaterte dødelighet på verdensbasis, og var ansvarlig for 1,38 millioner dødsfall i 2008 [1]. Røyking er den viktigste risikofaktoren for lungekreft, og det er anslått at 20,8% av amerikanske voksne er aktive røykere [2]. For øyeblikket er det ingen validert, kostnadseffektiv screening test som sikkert gir en diagnose av lungekreft. Utviklingen av en slik test er en offentlig helse viktig siden tidlig diagnose og behandling av lungekreft er forbundet med opp til en 92% 5 års overlevelse [3]. Fordi lungekreft ikke vanligvis blir klinisk synlig inntil det når et avansert stadium, er større enn 75% av lungekreft diagnostisert etter at sykdommen er allerede lokalt avansert eller metastatisk [4]. På grunn av den betydelige overlevelse fordel til tidlig oppdagelse, har det vært et omfattende arbeid for å oppdage lungekreft på et tidlig stadium. Tidlig Lung Cancer Handling Project (ELCAP) [5] og National Lung Cancer Screening Trial (NLST) [4] er prospektive studier som skjermede symptomfrie høyrisiko røykere som bruker lavdose computertomografi (CT) og foreløpige resultater viser økt evne til å oppdage tidlig stadium, potensielt herdbare lesjoner [3]. Den NLST ble stoppet tidlig i november 2010 etter at foreløpige data viste en 20,3% nedgang i lungekreft dødsfall i CT screening arm av rettssaken [4], [6]. Imidlertid er sannsynlig å hindre innføringen av CT i befolkningen screening høy falsk positiv rate på 96,4% observert i lav dose CT gruppen [6]. I tillegg spørsmål om kostnadseffektiviteten av CT-basert screening for lungekreft forbli ubesvart [7], [8], [9], [10], [11]. Også er det noen bekymring for at gjentatt eksponering for lave doser CT-skanning kan utsette pasienter for potensielt skadelige nivåer av stråling som kan føre til flere krefttyper [12]. Selv om CT-skanning kan identifisere lesjoner mistenke for lungekreft, er vev diagnose den eneste måten å finne ut om en lunge lesjon er kreft. En meta-analyse av syv lunge kreft screening studier evaluert lavdose spiralformede CT scanning som en screening test for lungekreft og funnet at 14-55% av høyrisikopasienter, med alderen ≥40 og ≥20 pakke året røyking historie, som hadde en mistenkelig lunge lesjon på en screening CT ble til slutt funnet å ha godartede lungelesjoner etter under en invasiv prosedyre for vev diagnose [13]. Denne høye frekvensen av invasive prosedyrer for godartet sykdom understreker nødvendigheten av ytterligere screening modaliteter som potensielt kan redusere antall pasienter som gjennomgår invasive prosedyrer unødvendig.
I tillegg til de store studier som undersøker effekten av CT screening for lungekreft kreft, mange grupper er aktivt undersøker muligheten for blodbaserte biomarkører for ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) [14]. Sirkulerende biomarkører er attraktive for kreft screening, siden de er blodbaserte tester som er minimalt invasiv, forholdsvis lav pris og lett kan repeteres. Serum microRNAs (mirnas) er attraktive kandidater til å bli brukt som kreft biomarkører. Serum miRNA kan bli pålitelig isolert fra serum, og har vist seg å være meget stabile, selv under vanskelige forhold slik som flere fryse-tine-sykluser og endringer i pH [15]. Nyere lovende studier tyder på at plasma mirnas kan være et nyttig skritt i screening prosessen for lungekreft, og for å avgjøre hvilke pasienter til videre skjermen ved CT scan [16], [17], [18]. I et forsøk på å utvikle ikke-invasive biomarkør analyser som kan brukes for tidlig deteksjon av lungekreft, vurderte vi uttrykk for miRNA hentet fra serum hentet fra pre-behandling NSCLC pasienter og kreftfrie friske personer, for å identifisere miRNA-baserte biomarkører som er i stand til å skille mellom disse gruppene.
Metoder
Prøvetaking
Prøver brukt i denne studien ble samlet ved University of Rochester Medical Center av Dr. Stephen Ahrendt som en del av en lunge kreft screening studier og på The Johns Hopkins Hospital som en del av et hode og nakke kreft screening-protokollen. Klinisk informasjon ble også samlet inn for hver enkelt pasient på tidspunktet for blodprøvetaking. Skriftlig informert samtykke ble innhentet fra alle pasienter før innmelding i studiene, og studiene ble godkjent av University of Rochester Medical Center Forskningstemaer Review Board og Johns Hopkins Hospital Institutional Review Board, henholdsvis. Blod fra pasienter med NSCLC og friske donorer ble oppsamlet i BD Vacutainer® Plus plast serumrør og behandles i serum. For alle kreftpasienter, ble blod samlet på diagnosetidspunktet, men før tumorreseksjon eller behandling. Serumet ble umiddelbart lagret ved -80 ° C inntil den skal benyttes. Etter samlingen prosessen ble gjennomført, alle postene ble avidentifisert å beskytte pasientens konfidensialitet. Kohorter ble samlet retrospektivt fra disse store samlinger av serumprøver i et forsøk på å kompilere alders- og kjønns matchet kohorter med lignende røyking historie og med tidlig stadium svulster for kreftpasienter (tabell 1). Pasientene ble definert som å ha en historie med å røyke hvis de hadde en historie med konsekvent å røyke i minst ett år. En to tailed Fishers eksakte test ble brukt for å bestemme assosiasjoner mellom Alle serumprøver blir opprettholdt i vevet bank ved Johns Hopkins Hospital Division of Head and Neck Cancer Research, ved hjelp av en web-database applikasjon fra The Johns Hopkins Hospital Avdeling for kreftbehandling forsknings IT-systemer (RITS) (https://www.rits.onc.jhmi.edu/). Prøvene ble sendt til Asuragen, Inc., Austin TX for RNA isolering og evaluering av miRNA og dataanalyse.
Utvinning av Serum RNA
Serum RNA (0,5 ml) ble hentet av den Asuragen Farmakogenomikk Services Group bruker Mirvana PARIS Kit (Ambion, Austin, TX), i henhold til produsentens instruksjoner. Etter at det organiske ekstraksjon ble den vandige fasen applisert på kolonnene levert med settet. RNA ble vasket og ekstrahert i henhold til produsentens anvisninger. RNA ble kvantifisert ved hjelp av Nanodrop 1000 (Nanodrop, Wilmington, DE) og lagret ved -80C. RNA avkastning oppnådd var vanligvis 300-500 ng /ml serum.
miRNA Kvantifisering av RT-qPCR
Vi brukte TaqMan RT-qPCR analyser (Applied Biosystems, Carlsbad, California) for å undersøke uttrykk av 181 miRNAs i serum RNA av 50 fag, (30 pasienter med NSCLC, og 20 kreftfrie, friske personer). Alle reagenser, primere og probe ble kjøpt fra Applied Biosystems. Revers transkripsjon (RT) ble utført i 10 pl reaksjoner, hver inneholdende 1 x RT-buffer (Invitrogen, Carlsbad, CA), 250 uM hver dNTP (GE Healthcare, Piscataway, NJ), 2 pl TaqMan RT primer (Applied Biosystems, Carlsbad, CA), 4 enheter RNase inhibitor (Promega, Madison, WI), 10units MMLV-RT (Invitrogen, Carlsbad, California), og ~ 1 ng av RNA per reaksjon. Reaksjonsblandingen ble inkubert ved 16 ° C i 30 min, 42 ° C i 1 time og 85 ° C i 5 minutter. qPCR reaksjoner ble utført ved å bruke 384-brønners ABI Prism 7900 HT Sequence Detection System (Applied Biosystems, Carlsbad, CA). For miRNA screening, ble en romtemperatur og qPCR reaksjon per prøve utført, mens det for miRNA verifiserings analyser legge screening, to RT reaksjoner fulgt hver av en qPCR ble utført for hver av de 130 prøvene som benyttes for validering. Hver qPCR ble utført i 15 ul reaksjoner som inneholder 1 x Platinum Taq buffer (Invitrogen, Carlsbad, California), 5 mM MgCl
2 (Invitrogen), 250 uM dNTP, 2 pl TaqMan mikroRNA assay primer /probe mix (Applied Biosystems, Carlsbad, CA), 1 × ROX, (0,5 enheter Platinum Taq (Invitrogen, Carlsbad, California), og 2 pl cDNA fra RT reaksjon.
data Analysis
for å identifisere kandidat biomarkører for skille NSCLC fra friske kontroller, må vi først beregnet ΔCt verdi matrise for hver prøve ved å trekke grensen syklus nummer (Ct) verdi for en miRNA fra Ct verdi av et annet miRNA i samme prøve. den ΔCt matrise tilnærming vurderer sett alle forskjellig uttrykt miRNA par skjønt beregningsmessig belastende, men har fordelen av å unngå behovet for å påkalle eksplisitte normalizers. for de 181 mirnas analysert per prøve, hver prøve vektor gitt 16290 elementer (), heretter kalt miRNA «diffpairs». [19 ], [20] deretter beregnes den skjeve varians t-test p-verdier og AUC for ROC-kurven for hver av diffpairs. Cutoff poeng for hvert ΔCt ble valgt for å maksimalisere summen av sensitivitet og spesifisitet. Kandidat miRNA par for verifisering i en annen prøvesett ble videre valgt basert på en sensitivitet og spesifisitet på minst 80% hver. Disse kriteriene produsert totalt 140 kandidat miRNA diffpairs (Figur S1). Cutoff punktet brukes for hver miRNA diffpair i treningssettet ble brukt i valideringen datasett.
Resultater
For å identifisere forskjellig uttrykt miRNA i NSCLC, vi først screenet sera fra 16 NSCLC og 20 friske givere for uttrykk av 328 miRNA bruker RT-qPCR. For å unngå falsk deteksjon, vi først fjernet alle mirnas som ble ubemerket etter 40 sykluser av qPCR i alle prøvene, slik at bare 181 miRNAs. Derfor begrenset vi ytterligere screening av sera fra 30 NSCLC pasienter og 20 friske personer til kun 181 mirnas som ble uttrykt på eller under 40 sykluser. Pasientene ble matchet for alder, kjønn og røyking historie. En to-tailed Fishers eksakte tester som brukes til å analysere gruppene. Den eneste statistisk signifikant sammenheng var mellom kreft og røyking (p = 0,015). Forsøk ble gjort for å balansere representasjon av plateepitelkreft karsinomer og adenokarsinomer. De fleste av treningssettet prøver (66,7%) var adenokarsinom, mens 33,3% var squamous cell carcinoma. De demografiske karakteristikker av de 30 NSCLC pasienter og 20 friske pasienter som ikke hadde hatt kreft er vist i Figur 1 og Tabell 1. Selv om aldersområdet var 20-75 år i de friske kontrollene, bare en donor var under 35 år gammel.
Bruk av forskjellig uttrykt miRNA parvise dataanalyse er beskrevet ovenfor, treningssettet data på 181 mirnas ga 16290 diff par, hvorav 140 kandidat miRNA par skilles NSCLC fra friske kontroller med en sensitivitet og spesifisitet minst 80% hver (se figur S1). Flere miRNA parene som involverer mirnas-106a, MIR-15b, MIR-27b, MIR-142-3p, MIR-26b, MIR-182, 126 #, let7g, la-7i og MIR-30e-5p viste en negativ prediktiv verdi ( NPV) og en positiv prediktiv verdi (PPV) på 100% (tabell 1), noe som indikerer disse mirnas som mulige biomarkører kandidater for lungekreft diagnose. De 140 kandidat miRNA par representerte totalt 26 unike miRNAs. Følgelig ble RT-qPCR av de 26 mirnas utført på serum RNA fra ytterligere 55 NSCLC pasienter (60% trinn I, 24% Stage II, 12% Stage III og 4% Stage IV), og fra 75 kreft-fri, sunn kontroller. De demografiske karakteristikker av de 55 NSCLC pasienter og 75 friske pasienter som ikke hadde hatt kreft er vist i Figur 1 og Tabell 1. En to-halet Fishers eksakte tester som brukes til å analysere gruppene. Den eneste statistisk signifikant sammenheng var mellom kreft og røyking (p = 0,005). Differential uttrykk for kandidaten biomarkør miRNA parene fra treningssettet (Figur S1) ble undersøkt i testsettet bruker samme cut-off point som ble brukt i treningssettet. Resultatene ga 5 kandidat biomarkører med en sensitivitet og spesifisitet på minst 75% (tabell 2). Alle de fem søker miRNA parene vist i tabell 2 var signifikant forskjellig uttrykt mellom NSCLC og friske kontroller, som indikert av p-verdiene 0,001. Differensial ekspresjon av miRNA paret MIR-15b /MIR-27b er vist i figur 2 for både treningssettet og testsettet. Fordelingen av denne miRNA paret ble spredt over et bredere spekter ( 4 CTS) i friske kontroller, mens fordelingen i NSCLC prøvene var smalere med et utvalg av ~ 2 Cts. Arealet under kurven (AUC) til mottakeren opererer karakteristikk (ROC) plot (fig. 3) for dette miRNA paret var 0,98 for testdata, med en sensitivitet og spesifisitet på 100% i treningssettet (figur S1) og en sensitivitet på 100% (95% CI; 0,93 til 1,0) og spesifisitet på 84% (95% CI 0,73 til 0,91) i testsettet (tabell 2 og figur 2). Den andre klassifisering miRNA paret som er involvert MIR-15a og MIR-27b, med en sensitivitet på 87% og spesifisitet på 93% i treningssettet, mens dens sensitivitet og spesifisitet i testsettet var 94% og 75% henholdsvis (tabell 2). Flere av miRNA parene i treningssettet hadde suboptimal ytelse i testsettet med enten følsomhet og /eller spesifisitet mindre enn 75%. Den toppkandidat miRNA par (MIR-15b og 27b) skilles NSCLC fra friske kontroller med en NPV på 100% og en PPV på 82% i testsettet (Tabell 2). Disse funnene viser potensialet i serum-baserte miRNA som screening biomarkører for lungekreft.
Differensial uttrykk verdiene ble beregnet som differansen av de Ct-verdiene for de to miRNAs. Terskelen indikert ved den horisontale linje ble valgt for å maksimalisere summen av sensitivitet og spesifisitet som er beskrevet i dataanalysen. Følsomhet, spesifisitet, positiv prediktiv verdi (PPV) og negativ prediktiv verdi (NPV) oppnådd ved hjelp av differensial uttrykk for de 2 miRNA vises som tabeller for treningssettet (til høyre) og testsettet (på venstre side).
Diskusjoner
i denne utforskende fase i /II biomarkør studie (som skissert av Early Detection Research Network (EDRN) (http: //edrn. nci.nih.gov)) vi vist serum fra pasienter uten historie av kreft, og pasienter med NSCLC i et forsøk på å identifisere mirnas som kan brukes som biomarkører for påvisning av tidlig stadium lungekreft. Vi identifiserte en miRNA par MIR-15b /MIR-27b som var i stand til å skille mellom serum fra NSCLC pasienter og kreftfrie friske kontroller, og med en høy grad av følsomhet. Våre resultater støtter resultatene av nyere studier som har vist at sirkulerende mirnas profiler kan være nyttige i screening for NSCLC, [16], [17] men vår studien inkluderte betydelig flere pasienter (180 totalt) enn noen av disse tidligere studier. En ulempe for disse markørene er den lave spesifisitet på 84% i testsettet. Den relativt høye falsk positiv rate for disse testene kan anses uakseptabelt for screening av befolkningen. Men i en populasjon av røykere med høy risiko for lungecancer, unødvendig screening ville dempes ved evnen av denne test, med sin negative prediktiv verdi på 100%, for å være i stand til å utelukke et stort antall pasienter fra å gå videre til mer dyre screening modaliteter, slik som skruelinjeformet bryst CT. Selv om disse dataene er overbevisende, er ytterligere testing i en stor, prospektiv kohort som en fase III biomarkør studie er nødvendig for å vurdere den kliniske nytten av disse miRNA markører som første linje screening test for NSCLC.
mirnas markører identifisert i denne studien, er blitt implisert i humane maligniteter. MIR-15a og MIR-15b har vist seg å være de-regulert i human lungekreft [21]. Både MIR-15a og MIR-15b har vist seg å ha en diagnostisk og prognostisk verdi i kronisk lymfatisk leukemi [22], [23]. MIR-27b ble funnet å være nedregulert i lungekreft vev sammenlignet med ikke-cancerous lungevevet [24]. I tillegg har MIR-27b ekspresjonsnivåer blitt korrelert med invasivitet av brystkreft [25] og med regulering av angiogenese [26]. En studie som involverte totalt 86 NSCLC og 57 kontroller nylig avdekket en fire miRNA panel i plasma inkludert MIR-126 som skilte NSCLC fra friske kontroller med en sensitivitet og spesifisitet på 73% og 96% henholdsvis [27]. Ved hjelp av fullblod, Keller og kollegaer [28] viste at MIR-126 og MIR-98 var blant de beste mirnas som kunne skille NSCLC fra friske kontroller. MIR-126 er sterkt uttrykt i lungevev og er involvert i regulering av karcelleadhesjonsmolekyl 1 (VCAM-I) [29]. Avvikende uttrykk for MIR-126 har vært innblandet i patogenesen av NSCLC [30], [31]. I denne studien flere par involverer MIR-126 var blant de flere kandidater identifisert i treningssettet (figur S1), men ved ytterligere testing i ytterligere 130 prøver, alle miRNA-126 kandidat parene oppviste følsomhet større enn 75% og spesifisiteten var mindre enn 75%. Andre nyere studier av Foss og kollegaer [17] viste serum MIR-1254 og MIR-574-5p ble uttrykt forskjellig mellom NSCLC (n = 33) og friske kontroller (n = 42). Det er viktig å merke seg at flere faktorer påvirke utfallet av miRNA studier i biofluids, inkludert variasjoner i prøvetype, f.eks fullblod, plasma eller serum, prøvenummer, studere design, prøvetaking, RNA isolering, pasientkarakteristika, antall miRNA undersøkt og teknologier som brukes i miRNA profilering f.eks Solexa sekvense, RT-qPCR eller microarray teknologi. I tillegg er standardisering av isoleringsmetoder, normalisering og dataanalyse fremgangsmåter som trengs for å demonstrere en klar klinisk anvendelighet av disse mulige markører.
Selv om disse data er lovende, testsettet inkluderte et forholdsvis lite antall prøver . Til syvende og sist disse miRNA biomarkører kreve ytterligere validering på større prospektive kohorter som en fase III biomarkør studie for å validere disse resultatene. Innlemming blodbaserte miRNA markører i spiral CT undersøkelser kan hjelpe til å utforske nytten av miRNAs i screening for lungekreft. Selv om dette er en utforskende fase I /II studien ble pasientene valgt først og fremst fra kirurgiske klinikker, og er vektet mot tidlig sykdom (60% Stage I, 24% Stage II, 12% Stage III og 4% Stage IV). Dette skew mot tidlig sykdom støtter etterforskningen av disse markørene i en fase III eller IV studie som tar sikte på å definere resultatene av disse markørene i en prospektiv måte i tidlig stadium deteksjon.
Den siste formidling av nytten av screening spiral brystet CT skanner for reduksjon i dødelighet av lungekreft fra NLST rettssaken plasserer en premie på identifisering av høy risiko individer som kunne ha nytte av screening. Tilleggs serum basert testing kan utføres på en svært kostnadseffektiv måte i forhold til bildebehandling, og kan være nyttig for å identifisere høyrisikopopulasjoner som kan ha nytte av brystet CT, eller som skal brukes i kombinasjon med bildebehandling for å identifisere tidlige lungekrefttilfellene.
det er stort behov for bedre screening for lungekreft gitt det store antallet personer som berøres hvert år, og den høye dødeligheten av sykdommen når diagnosen i senere stadier. Det er for tiden en rekke kliniske studier blir utført for å teste effekten av nye behandlingsformer for NSCLC, men de fleste av disse er fase II-studier og nylig en rekke fase III studier har unnlatt å oppfylle sine primære endepunkter [32] Til dags dato, forbedret screening for å gi tidlig diagnose er den mest lovende avenue for å redusere dødeligheten av NSCLC. Vår undersøkelse styrker ytterligere den begrunnelse at serum miRNA har potensiale til å bli brukt som et kostnadseffektivt, ikke-invasiv diagnostisk test for NSCLC, og kan potensielt bli anvendt som en første linjeraster for å hjelpe risiko stratifisere pasienter for ytterligere, mer kostbare eller invasive screening regimer.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
Differential miRNA uttrykket i sera fra NSCLC pasienter (kreft) og friske kontroller (normal) i treningssettet. Diff, differensial uttrykk mellom de to mirnas, beregnet som differansen mellom Ct-verdiene for de to angitte miRNAs. PPV, positiv prediktiv verdi; NPV, negativ prediktiv verdi; SENS, følsomhet; og SPEC, spesifisitet. Den grenseverdi brukes for å oppnå det angitte spesifisitet og sensitivitet er angitt pr miRNA diff par
doi:. 10,1371 /journal.pone.0032307.s001 plakater (XLS)
Takk
Vi er takknemlige til Ana Ward og legene. Gary Latham, Bernard Andrus, og Rolland Carlson for sine kritiske kommentarer og hjelp i utarbeidelsen av dette manuskriptet.
