Abstract
Selv om eggstokkreft er den mest dødelige av gynekologiske kreftformer, stor variasjon i utfallet etter konvensjonell terapi fortsetter å eksistere. Tilstedeværelsen av tumor-infiltrerende regulatoriske T-celler (Tregs) har en rolle i utfallet av denne sykdom, og en økende mengde data støtter eksistensen av nedarvede prognostiske faktorer. Men rollen som arvet varianter i gener som koder for treg-relaterte immunmolekyler har ikke vært fullt utforsket. Vi analyserte uttrykk kvantitativ egenskap loci (eQTL) og sekvensbaserte tagging enkeltnukleotidpolymorfi (tagSNPs) for 54 gener assosiert med Tregs i 3662 invasiv eggstokkreft tilfeller. Med justering for kjente prognostiske faktorer, ble tankevekkende resultater observert blant sjeldne histologiske subtyper; dårligere overlevelse var assosiert med mindre alleler på SNPs i RGS1 (klarcellet, rs10921202, p = 2,7 × 10
-5), LRRC32 og TNFRSF18 /TNFRSF4 (mucinous, rs3781699, p = 4,5 × 10
-4, og rs3753348, p = 9,0 × 10
-4, henholdsvis), og CD80 (endometrioid, rs13071247, p = 8,0 × 10
-4). Fo0r den sistnevnte, korrelative data understøtter en CD80 rs13071247 genotype assosiasjon med CD80 RNA-tumor uttrykket (p = 0,006). En ytterligere eQTL SNP i CD80 ble assosiert med kortere overlevelse (rs7804190, p = 8,1 x 10
-4) blant alle tilfeller kombinert. Som produkter av disse genene er kjent for å påvirke induksjon, menneskehandel, eller immundempende funksjon Tregs Disse resultatene tyder på behovet for oppfølgings fenotypiske studier
Citation. Goode EL, DeRycke M, Kalli KR, Oberg AL, Cunningham JM, Maurer MJ, et al. (2013) Arvet Varianter i regulatoriske T-Cell Gener og utfallet av eggstokkreft. PLoS ONE 8 (1): e53903. doi: 10,1371 /journal.pone.0053903
Redaktør: Michael Scheurer, Baylor College of Medicine, USA
mottatt: 6 juli 2012; Godkjent: 04.12.2012; Publisert: 30 januar 2013
Copyright: © 2013 Goode et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Den vitenskapelige utvikling og finansiering av dette prosjektet ble støttet delvis av Mayo Clinic Eggstokkreft SPORE (P50-CA136393) til ELG, LCH, og KLK, National Cancer Institute GAME-ON Post-GWAS Initiative (U19-CA148112), National Cancer Institute forskning prosjektstøtte (R01-CA086888, R01-CA122443, R01-CA106414, R01-CA76016, R01-CA114343), Cancer Research Storbritannia (A10119, A10124, A8339, A6187, A11306, A7058), Medical Research Council (G0801875- 89310), den Ovarian Cancer Research Fund, Mayo Foundation, Minnesota Ovarian Cancer Alliance, Mayo Foundation, Roswell Park Cancer Institute Alliance Foundation, og Fred C. og Katherine B. Andersen Foundation. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Eggstokkreft er den femte største årsaken til kreft dødsfall blant kvinner i USA [1]. Fem års total overlevelse er ca 45%, og selv med moderne kirurgiske og kjemoterapeutiske strategier, de fleste tilfeller med fremskreden sykdom tilbakefall og bukke for sykdommen [2], [3]. Sjeldne germline BRCA1 eller BRCA2-mutasjoner gi bedret overlevelse [4]. Vanlige arvet varianter kan også påvirke utfallet; genom-wide assosiasjonsstudier (GWAS) er i gang, men har ennå ikke funnet overlevelse-forbundet loci [5]. Vurdering av nye biologiske mekanismer ved hjelp av grundig analyse av variasjon i kandidatgener holder løftet for identifisering av prognostiske genetiske faktorer.
Flere studier viser betydningen av immunsystemet i eggstokkreft utfallet. For eksempel, i en rapport, saker med bevis på CD3 T-celle tumorinfiltrasjon (omtrent halvparten av tilfellene studert) viste økt progresjon og total overlevelse [6]. Senere studier har raffinert vår forståelse av tumor-infiltrerende T-celler, inkludert en som viser at CD8
+ T-lymfocytter er den primære sub-populasjon av T-celler forbundet med bedre overlevelse [7]. Sammen med det funn at tumor-antigen-spesifikke T-celle responser kan påvises i tilfeller er disse resultatene tyder på at anti-tumor-immunitet er fremkalt mot eggstokk-kreft og påvirker den kliniske forløpet av sykdommen [8]. Til tross for denne generering av en immunrespons, er imidlertid anti-tumorimmunitet oppveies av et immunundertrykkende mikromiljø [9]. Av immunsuppressive mekanismer, CD4
+ regulatoriske T-celler (tregs) er en primær hjelp av immununndragelser i eggstokkreft; disse er CD4
+ T avstamning celler hvis primære funksjon er immune regulering [10]. I samarbeid med andre, må vi først foreslått en rolle tumor-infiltrerende Tregs i eggstokkreft patogenesen, rapportering høyere nivåer av CD4
+ Tregs, målt med immunfluorescens, blant tilfeller med dårligere overlevelse [11]. Etterfølgende arbeide støtter viktigheten av CD4
+ Tregs i eggstokkreft patogenese og utfall [7], [12]. For eksempel, + Tregs synes nærværet av CD4
å påvirke antitumoraktivitet av tumor-infiltrerende cytotoksiske CD8
+ T-celler [7]. CD4
+ Tregs blokkere både adaptive og medfødte immun effektorer på cellen kontaktmekanismer samt av løselige meglere [13], [14]. Oppløselige mediatorer for undertrykkelse vanligvis forbindes med CD4
+ Tregs omfatter IL-10 og TGF-β, som begge blokk T-celleproliferasjon og celle-mediert immunitet [15], [16], [17]. Andre celleoverflatemolekyler involvert i å undertrykke immunresponsen inkluderer B7-H1 (CD274), GITR (TNFRSF18), LAG-3, CTLA-4, og overflate-bundet TGF-β [18], [19], [20].
på grunn av viktigheten av CD4
+ Tregs og en rolle for arvelige faktorer i utfallet, vi vurdert om felles arvelig variasjon relatert til CD4
+ treg-relaterte gener assosiert med eggstokkreft utfallet etter standard of care terapi. Spesielt vurderes vi 54 gener nøkkel til induksjon, menneskehandel, eller immunsuppressive funksjoner av CD4
+ Tregs. Utnytte data fra en roman kandidat genet studien kombinert med eksisterende data, studerte vi polymorfismer som har vist seg å påvirke uttrykket av eller å tagge arvet variasjon i disse genene. Varianter assosiert med utfall i flere studiepopulasjoner kan belyse immunsuppressive mekanismer i eggstokkreft.
Materialer og metoder
Etikk erklæringen
Protokoller ble godkjent av de aktuelle institusjonelle gjennomgang boards (Mayo Clinic Institutional Review Board, Roswell Park Cancer Institute Institutional Review Boards, Duke University Institutional Review Boards, National Cancer Institute Institutional Review Boards, Moffitt kreftsenter Institutional Review Boards) eller etikk panel (Royal Marsden Hospital etikk panel, University of Cambridge etikk panel University College London etikk panel). Alle deltakerne ga skriftlig informert samtykke.
Kandidat Gene SNP Array
Femti-fire gener av nøkkel relevans for biologi Tregs (ACVR2B, AGTR1, CCL11, CCL17, CCL19, CCL2, CCL20, CCL22, CCI3, CCI4, CCL5, CCR4, CCR6, CCR7, CCR8, CD274, CD46, CD80, CD86, CXCL10, CXCL13, CXCR5, DUSP4, EGR2, Gpr83, IDO1, IKZF2, IKZF4, IL10RB, IL15RA, IL2RB, IL6ST, IL9, INHBA, INHBB, IRF4, ITGAE, KLF10, LAG3, LRRC32, MDFIC, NRP1, PDCD1, PLAG1, PRNP, RGS1, RGS16, SH3BGRL2, SLC22A2, SMAD3, SOCS2, TNFRSF18, TNFRSF4, og TNFRSF9) ble valgt for studien ( Tabell S1). Relevansen av disse genene ble etablert fra et PubMed [21] databasesøk som avslørte publisert informasjon som enten direkte viste eller foreslått en rolle for de respektive genprodukter i induksjon, immun undertrykkende funksjon, eller smugling av tregs. Åttifem SNPs forbundet (p 10
-6) med lymfocytter mRNA uttrykk av ett eller flere kandidatgener (eQTL SNPs) ble inkludert [22]. I tillegg innen fem kb av hvert gen, SNPs tagging andre SNPs med mindre allel frekvens (MAF) ≥0.05 på r
2≥0.9 ble identifisert fra 60 europeiske-amerikanske deltakere i lav-dekning Pilot i 1000 genomer Prosjekt (for 53 gener) [23] eller SeattleSNPs Variasjon Discovery Resource (for CCL2) [24], avhengig av hva som var mest informative. Valgte tagSNPs (N = 1451) ble optimalisert for å inkludere SNPs med riktig design score for en Illumina Golden BeadArray analysen, spådde funksjonalitet, og til å omfatte mer enn én tagSNP for store grupper av korrelerte SNPs [25]. Tilleggs SNP informasjon i tabell S2.
Kandidat Gene deltagerne og Genotyping
Cases genotypet på Treg tilpasset SNP rekke inkluderte kvinner med patologisk-bekreftet invasiv primære epitelovarialcancer, peritoneal, eller eggleder kreft innrullert ved Mayo Clinic og Roswell Park Cancer Institute (RPCI). Mayo Clinic tilfeller (N = 905) ble konstatert mellom desember 1999 og november 2010 i Mayo Clinic Eggstokkreft case-control studie (MAI) eller Mayo Clinic Case-Only Ovarian Cancer Study (MAC) og inkluderte kvinner i alderen 20 år eller over registrert gjennom Mayo Clinic divisjoner av gynekologisk kirurgi og medisinsk onkologi. Seksti åtte prosent av disse tilfellene ble registrert innen en uke etter diagnose (median tid fra diagnose til rekruttering var null dager). RPCI tilfeller (N = 167) var beboere i Vest-Pennsylvania, Øst Ohio, eller Western New York, i alderen 25 år eller over og konstatert mellom januar 2004 og mai 2009 innen seks måneder etter diagnose gjennom Roswell Park Cancer Institute divisjoner av gynekologisk kirurgi og onkologi . Disse sakene ble registrert med en median tid fra diagnose til rekruttering av 80 dager. Begge steder ble DNA ekstrahert 10-15 ml frisk perifert blod (ved hjelp Gentra AutoPure LS Purgene utsal metodikk ved Mayo Clinic og FlexiGene DNA Kit metodikk ved RPCI), lagret ved -80 ° C, og bar-kodet for å sikre nøyaktig behandling. Totalt 1072 deltakere ble genotypet ved hjelp av en tilpasset Illumina Golden BeadArray analysen sammen med 24 dubletter og 24 HapMap CEU gjentak (8 trios). Samstemmighet blant studie duplikater var 99,998%, ingen SNPs hadde uløst replikere eller mendelsk feil, og gjennomsnittlig genotype takst var 99,88%. Prøver med genotyping svikt (N = 22) eller ring hastighet 97% (N = 11) ble ekskludert samt prøver funnet å være feil belagt (N = 1) eller fra saker anses uegnet på grunn av ikke-epitelial sykdom (N = 5), borderline tumor atferd (N = 34), eller innmelding mer enn ett år før diagnose (N = 5). SNPs med genotyping svikt (N = 162), ring hastighet 95% (N = 19), eller HWE 0,0001 og dårlig clustering (N = 15) ble ekskludert. Dermed Analysene var basert på 994 saker og 1,340 SNPs.
Genome-Wide Association Study
Vi har også analysert data fra Oppfølging av Ovarian Cancer Genetisk Association og interaksjonsstudier (foci) samarbeid som er en del av National Cancer Institute GAME-ON Post-GWAS initiativ og er beskrevet andre steder [26], [27]. I korte trekk, deltakerne var 2,167 selvrapporterte hvite invasiv eggstokkreft tilfeller registrert i North Carolina Ovarian Cancer Study (NCO), NCI Ovarian case-control studie i Polen (POL), Royal Marsden Cancer Study (RMH), Storbritannia studier av epidemiologi og risikofaktorer i Cancer arvelighet Ovarian Cancer Study (SEA), Tampa Bay Ovarian Cancer Study (TBO), og Storbritannia Familiær Ovarian Kreftregisteret og Storbritannia Ovarian Cancer befolkningsundersøkelsen (UKR + UKO). Genotyping brukt Illumina 317 k eller 610-Quad infinium Arrays med imputering til HapMap v 26 ved hjelp av doserings verdier hentet fra MACH programvarepakken [28]. Data om 820 SNPs var tilgjengelig på alle saker.
Statistical Analysis
Vi brukte Cox regresjon regnskap for venstre avkutting å anslå hazard ratio (timer) og 95% konfidensintervall (CIS) for assosiasjon med total overlevelse. Overlevelse ble definert som tiden fra diagnosen eggstokkreft til død uansett årsak eller siste oppfølging. For hver SNP, ble HRS med 95% konfigurasjons beregnet per-allelet (dvs., 0, 1, eller 2 kopier av mindre allelet), som er analoge med den Armitage test for trend for binære endepunkter. Log-additive Cox regresjonsmodeller ble justert for studiested (MAI + MAC, RPCI, POL, NCO, RMH, SEA, TBO, UKO + UKR), alder ved diagnose ( 50 år, 50-69 år, 70 år), tumorstadium (i eller II, III eller IV, ukjent), tumor Karakter (lav, høy, ukjent), og rase (hvit, ikke-hvite, ukjent), modellering direkte genotype samtaler for MAI + MAC og RPCI og kalkulatoriske allel doseverdier der det er hensiktsmessig for foci deltakere. Heterogenitet HRS over studiested ble formelt undersøkt ved hjelp av studie-by-SNP interaksjons vilkår og utfører sannsynligheten ratio tester; ingen korreksjon for multippel testing ble utført.
Tumor Expression Quantitative Trait Locus (eQTL) Analyse
For 54 genotypet Mayo Clinic tilfeller (33 serøs, ni klarcellet, åtte endometrioid, fire mucinous), uttrykk analyser ble også utført. Tumor RNA ble isolert fra friske frosne prøver, ved bruk av Qiagen RNeasy-protokollen og kvantifisert ved hjelp av et Nanodrop Spectrophotomer (Agilent Technologies, Santa Clara, CA). Total RNA (750 ng) av høy kvalitet (RNA integrert nummer 8,0) ble merket med cyanine 5-CTP eller cyanine 3-CTP, ved hjelp av lav RNA Input Fluorescent Linear Amplification Kit (Agilent Technologies), renset på RNeasy Mini kolonner ( Qiagen), og hybridiserte til Agilent hele menneskelige genom 4 × 44 K uttrykk arrays (ved hjelp av en blandet referanse som inneholder 106 tumorprøver). Lysbilder ble skannet med Agilent 2565BA Scanner, og data ble normalisert ved hjelp av Agilent feil modell og eksporteres av Agilent Feature Extraction programvare (versjon 7.5.1). Data i form av tømmer forhold mellom signalene fra de enkelte tumorer til signaler fra referanseblandingen ble anvendt for analyse. For gener med SNPs som var knyttet til overlevelse på p 0,001, ble sammenhengen mellom genotype og uttrykk prober vurdert ved hjelp av Wilcoxon rank-sum tester
Resultater
De nesten 1000 invasiv eggstokkreft tilfeller genotypet. i en treg tilpasset SNP rekke og ca 2600 saker i foci samarbeid demonstrert de forventede fordelinger av dødelighet, alder og kliniske egenskaper (tabell 1). 1,529 dødsfall ble observert under en median oppfølgingstid på 5,4 år. I kombinerte analyser av alle saker og saksgrupper definert av histologi, åtte SNPs ga p 0,001 inkludert seks uavhengige på r
2 0,95 (tabell 2). Resultatene var lik da begrenset til 2,518 tilfeller med komplette data på scenen, klasse, og histologi. Ved hver SNP ble mindre alleler forbundet med dårligere eggstokkreft overlevelse. Den mest statistisk signifikant sammenheng var mellom overlevelse etter klarcellet eggstokkreft (N = 217) og mindre alleler i en uvanlig intronic SNP i regulator av G-protein signaliserer en (RGS1), noe som tyder på en nesten tre ganger økt risiko for død ( p = 2,7 × 10
-5).
Blant 272 mucinkjertler eggstokkreft, mindre alleler på fire SNPs i leucine rik gjenta inneholder 32 (LRRC32) var assosiert med mer enn to gangers dårligere overlevelse. Tre av disse SNPs (rs3781699, rs3197153, rs3781701) ble sterkt korrelert (R «> 2≥0.97), for således bare en av disse er vist i tabell 2 (rs3781669 p = 4,5 x 10
-4). En fjerde SNP, LRRC32 SNP rs7944357, ble bare beskjedent korrelert med denne tre-SNP klynge (r
2≤0.26), men var også assosiert med overlevelse blant tilfeller med mucinous eggstokkreft (p = 8,3 × 10
– 4). En annen SNP rs3753348 viste sammenheng med en mer enn tredoblet risiko med å overleve i mucinous eggstokkreft (tabell 2); dette SNP ligger i 5 kb regionen mellom tumor nekrose faktor reseptor super medlemmer 4 og 18 (TNFRSF4 og TNFRSF18) på kromosom 1.
Blant 570 endometrioid eggstokkreft tilfeller mindre alleler på et intronic CD80 tagSNP rs13071247 var assosiert med en 73% økt risiko for dødelighet (p = 8,0 x 10
-4, tabell 2). I tillegg har analysen av alle tilfeller, uavhengig av histologi foreslått at en eQTL SNP for CD80 (rs7804190) assosiert med en 14% kortere tid overlevelse (p = 8,0 x 10
-4). Den rs7804190 eQTL, som ligger intronic til MAD1 mitotisk stopp mangelfullt-like 1 (gjær) (MAD1L1), er av interesse fordi genotypen har blitt funnet å korrelere med ekspresjon av CD80 (p = 6,0 x 10
-7), så samt polymerase (DNA rettet), beta (POLB), prolin-serin-treonin fosfatase samspill protein 2 (PSTPIP2), og KIAA1128 (p 10
-6) i lymfoblastoide cellelinjer [22]. Av notatet, ble det ikke SNPs assosiert med overlevelse etter serøs eggstokkreft (p 0,001), den vanligste og mest dødelige histologisk subtype. Tester for samhandling viste ingen stedsspesifikk heterogenitet av foreningen for noen av SNPs i tabell 2 (p 0,05 for hver).
For å utforske mulige mekanismer av de observerte SNPs assosiert med eggstokkreft overlevelse, undersøkte vi svulst RNA uttrykk data på 54 Mayo Clinic saker og korrelert uttrykk med genotype på de mest tankevekkende overlevelses-forbundet SNPs beskrevet ovenfor. På CD80 rs13071247, ble en forening observert slik at heterozygoter og mindre allel homozygote (AC og CC genotyper) hadde litt økt svulst uttrykk (median ganger endring = 1.04 på rå skala, 0,06 på loggen
2 skala) enn tilfeller med AA genotype (p = 0,006; figur 1). Ingen andre assosiasjoner mellom genotype og tumor RNA uttrykk ble observert ved p. 0,05
Blant N = 54 MAI + MAC invasiv eggstokkreft tilfeller, Agilent hele menneskegenom 4 × 44 K uttrykk rekke sonde A_24_P155632; CD80 log
2-forhold på tumor versus henvisning RNA-ekspresjon (y-aksen) som funksjon av genotype (x-aksen); streker indikerer median; hvert symbol representerer en unik pasient; datapunkter jittered slik at alle data er synlige.
Diskusjoner
Tidligere studier støtter en viktig rolle for Tregs i eggstokkreft som synes å fremme en immunundertrykkende mikromiljø. Her, analyserte vi eggstokkreft overlevelse i forhold til arve treg genotyper ved hjelp av en kombinasjon av tilpasset genotyping og integrering av eksisterende genotyper fra en samarbeid GWAS. Selv om ingen SNPs gitt tankevekkende resultater blant de mer vanlige serøs tilfeller ble dårligere overlevelse assosiert med mindre alleler på SNPs i RGS1 (klar celle), LRRC32 og TNFRSF18 /TNFRSF4 (mucinous) og CD80 (endometrioid). For den sistnevnte, men ytterligere data understøtter en CD80 genotype assosiasjon med CD80 RNA-tumor-ekspresjon. Kombinert analyse av flere uavhengige datasett gir større statistisk styrke enn separate funn og replikering analyser [29]; dermed har vi brukt dette studiedesign og undersøkt muligheten for heterogenitet av resultater på tvers av studier. Som ingen statistisk signifikant heterogenitet på tvers av studier ble observert, er vår slutning basert på denne kombinerte, mektigste tilnærming. Det er verdt å merke seg at vi undersøkte et relativt stort antall SNPs over 54 Treg-assosierte gener og på tvers av ulike histologiske subtyper, og derfor har vi erkjenner at flere testspørsmål kan eksistere; noen av våre uthevede resultater kan faktisk være falske positive assosiasjoner. Det faktum at genene undersøkes ble valgt på grunnlag av en a priori rolle i eggstokkreft, og at vi konsentrert bare på SNP assosiasjoner med p-verdier mindre enn 0,001 minsker, men ikke helt eliminere denne mulighet. Likevel understreker dette arbeidet spesielle Treg-relaterte gener av interesse.
CD80 har blitt grundig undersøkt for sin rolle i immunresponser, men har blitt rapportert ingen fokusert analyse av SNPs og eggstokkreft utfallet, så vidt vi vet. Det fungerer som en ligand for både CD28 og CTLA4, som fører til proliferasjon og anergi i naive T-celler, henholdsvis [30], [31], [32]. CTLA4 er konstitutivt uttrykt i Tregs, hvor det er viktig i å undertrykke immunreaksjoner gjennom en rekke foreslåtte mekanismer, deriblant aktivering av indoleamine-2,3-dioksygenase banen i dendrittiske celler (DCS) og inhibering av interaksjoner mellom aktiverte T-celler og DCS [33], [34], [35]. Vi observerte at en intronic tagging CD80 SNP var assosiert med dårligere overlevelse endometrioid tilfeller og med økt tumor CD80 uttrykk, og blant alle tilfeller, observerte vi at en eQTL SNP på et annet kromosom som assosiert med CD80 lymfocytt uttrykk var også assosiert med dårligere overlevelse . Til sammen tyder disse data på at CD80-ekspresjonen kan være delvis drevet av arvelige faktorer, og kan føre til økt immunsuppresjon og dårligere resultat.
Av interesse for å fjerne celle kreft i eggstokkene, genproduktet av RGS1, RGS1 eller BL34 er medlem av RGS protein familien hvis medlemmer er involvert i regulering av G-protein signalering. Nærmere bestemt er de GTPase-aktiverende proteiner som begrenser varigheten av G-proteinsignalisering [36], [37]. Lymfocyttmigrering til kjemotaktiske signaler blir mediert av G-protein-signaler og tidligere studier har funnet at Tregs ikke svare så godt til kjemokin signalering som naive T-celler [38]). Videre RGS1 er mer høyt uttrykt i tregs og uttrykk er negativt korrelert med migrasjon [38]. Interessant er RGS1 genekspresjon øket i aktivert Tregs, og dette er mediert ved binding av treg transkripsjonsfaktor foxp3 til RGS1-genet [39]. Sammenslutninger av RGS1 SNP’er har også blitt observert i en rekke T-celle-medierte autoimmune sykdommer, inkludert type 1 diabetes, cøliaki, og multippel sklerose [40], [41], [42], [43]. Basert på disse tidligere studier, er det fristende å spekulere i at genetisk bestemt RGS1 nivåer kan regulere Treg infiltrasjon i klart celle eggstokkreft og dermed bidra til utfallet.
En SNP av mulig relevans for mucinous sykdommen er i LRRC32 som koder Garp, uttrykte en trans protein spesifikt på naturlig forekommende aktivert Tregs, men ikke hviler Tregs [44], [45]. Garp har vist seg å være en reseptor for inaktive, latens-assosiert peptid (LAP) bundet TGF-β [46], [47]. Garp induserer ikke aktivering av latent TGF-β; men det kan fungere i smittsomme toleranse, konvertering foxp3
– celler til undertrykkende foxp3
+ celler [46], [48]. I tillegg Garp er en del av en positiv tilbakekoplingssløyfe med foxp3 i Tregs, som er kjent for å ha en undertrykkende tumor mikromiljøet og forhindre en effektiv immunologisk reaksjon [45]. Våre funn av dårligere overlevelse blant mucinkjertler tilfeller med mindre alleler på et LRRC32 SNP tyder på at disse sakene kan ha økt immunsuppresjon.
Vi rapporterer en sammenheng mellom risiko for død på grunn av mucinous eggstokkreft og en SNP i et gen klynge inneholder TNFRSF18 og TNFRSF4. TNFRSF18 koder GITR, en co-stimulerende molekyl til stede konstitutivt på Treg celler og oppregulert på naive T-celler etter stimulering. Rapportene er motstridende med hensyn til den rolle GITR, som det har blitt rapportert både for å øke [49], [50], og for å oppheve den undertrykkende funksjon av Tregs [51], [52]. Mens den spesifikke mekanisme GITR handling er fortsatt kontroversielt, er det klart at det modulerer Tregs. TNFRSF4 koder OX40 (CD134), og signalisering gjennom OX40 reduserer muligheten for Tregs til å virke som suppressorceller ved å redusere ekspresjon av foxp3 [53], [54]. Reduserte foxp3 resulterer i redusert miR155 og en påfølgende økning i SOCS1 (suppressor av cytokin signale 1). SOCS1 er en komponent av en negativ tilbakekoblingssløyfe for IL-2-signalkaskade; øket ekspresjon av SOCS1 resulterer i et behov for økte IL-2-nivåer for overlevelse av Tregs [55]. Således kan OX40 signalisering i Tregs modulere suppressor fungerer både ved å redusere deres effektor-funksjon, og ved å kreve høyere mengder av IL-2 for videre overlevelse og aktivering. Den intergeniske SNP assosiert med total overlevelse i tilfeller med mucinous eggstokkreft kan opptre enten gjennom en GITR eller OX40 mekanisme. Dissekere rolle germline varianter kan bidra til å identifisere mekanismer som kan forklare hvorfor immunsystemet ikke er i stand til å montere et effektivt tiltak mot eggstokkreft.
I konklusjonen, tyder vår analyse av 3662 invasiv eggstokkreft saker som arvet varianter i forbindelse med Tregs er forbundet med eggstokkreft utfall i en undertype-spesifikk måte, selv etter korrigering for kjente prognostiske egenskaper. Våre funn understreker viktigheten av subtype spesifikke analyser i kliniske og epidemiologiske studier av eggstokkreft, gitt etablert sykdom heterogenitet, med hver histologisk subtype uttrykker ulike mønstre av genetiske, epidemiologiske og kliniske kjennetegn (gjennomgått av Karst og Drapkin [56]). Fremtidig arbeid bør inkludere undersøkelse av flere studiepopulasjoner, immunologiske studier, og korrelasjon av arvede varianter med andre tumor funksjoner, for eksempel nivåer av treg infiltrasjon.
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1. .
Gene informasjon
doi: 10,1371 /journal.pone.0053903.s001 plakater (XLS)
Tabell S2.
SNP informasjon
doi:. 10,1371 /journal.pone.0053903.s002 plakater (XLSX)
Takk
Vi er takknemlige til familie og venner av Kathryn Sladek Smith for deres generøse støtte for eggstokkreft Association Consortium gjennom sine donasjoner til Ovarian Cancer Research Fund.
