Abstract
Forskning på
hMLH1 Hotell og
hMSH2
mutasjoner tendens til å fokusere på Lynch syndrom (LS) og LS-lignende tykktarmskreft (CRC). Ingen studier hittil har vurdert rollen som
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i massesporadisk CRC (uten forvalg av MSI eller tidlig debutalder). Vi forsøkte å identifisere roman
hMLH1 Hotell og
hMSH2
DNA-varianter, for å fastslå mutasjon frekvenser og områder i både sporadisk og LS CRC og deres relasjoner med clinicopathological karakteristikker av CRC i Nordøst-Kina. 452 sporadiske og 21 LS CRC pasienter ble screenet for germline og somatiske mutasjoner i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener med PCR-SSCP sekvensering. Vi identifiserte 11
hMLH1 Hotell og sju
hMSH2
DNA-varianter i vår studie kohort. Seks av dem var romanen: fire i
hMLH1
genet (IVS8-16 A T, c.644 GAT GTT, c.1529 CAG CGG og c.1831 ATT TTT) og to i
hMSH2
genet (-39 C T, innsetting AACAACA på c.1127 og sletting AAG på c.1129). I sporadisk CRC, germline og somatisk mutasjon frekvenser av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet var 15,59% og 17,54%, henholdsvis (
p
= 0,52). Germline mutasjoner stede i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 5,28% og 10,78%, henholdsvis (
p
0,01). Somatiske mutasjoner i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 6,73% og 11,70%, henholdsvis (
p =
0,02). I LS CRC, både kimcellelinje og somatiske mutasjoner frekvenser av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet var 28,57%. Den mest utbredte germline mutasjon nettstedet i
hMSH2
genet ble c.1168 CTT TTT (3,90%), en polymorfisme. Somatisk mutasjon hyppigheten av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet var signifikant forskjellig i proksimale, distal tykktarm og endetarmskreft (
p
= 0,03). Våre funn belyse mutasjonsspekteret og hyppigheten av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i sporadisk og LS CRC, og deres relasjoner med clinicopathological karakteristikker av CRC
Citation:. Hu F Li D, Wang Y, Yao X, Zhang W, Liang J et al. (2013) Novel DNA-varianter og Mutasjon Frekvenser av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
Gener i tykktarmskreft i Nordøst-Kina Befolkning. PLoS ONE 8 (4): e60233. doi: 10,1371 /journal.pone.0060233
Redaktør: Anthony WI. Lo, det kinesiske universitetet i Hong Kong, Hong Kong
mottatt: 04.01.2013; Godkjent: 23 februar 2013; Publisert: 03.04.2013
Copyright: © 2013 Hu et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av tilskudd av National Natural Science Foundation of China (nr 30671801 og 30371243) og Stiftelsen for den returnerte Scholars av Harbin (No. 2005AFLXJ017). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
tykktarms~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP (CRC) er en av de vanligste kreftformen globalt, og rangerer den femte av alle krefttilfeller i Kina. Verdens helseorganisasjon anslår at 220.000 nye CRC tilfellene skjedde i Kina i 2008 (GLOBOCAN, 2008). Forekomsten av CRC har økt med 5,73% på årsbasis mellom 1992-2005 (13,06 til 23,54 /10,0000) i Nangang District, Harbin, Kina [1].
En av de genetiske baner i utvikling av CRC er svikt i DNA-reparasjon mismatch (MMR) system [2], noe som bidrar til opprettholdelse av genomisk stabilitet ved å gjenkjenne og fjerne innsetting /delesjonsmutasjoner som oppstår under DNA-replikasjonen [3]. De to viktigste mismatch-reparasjonsgener er
hMLH1 Hotell og
hMSH2, etter hvilket kart til kromosomene 3p21.3-23 [4] og 2p21-22 [5], henholdsvis.
Siden den første rapporten fra
hMLH1 Hotell og
hMSH2
genmutasjoner i Lynch syndrom (LS) CRC [4], [5], studier på
hMLH1 Hotell og
hMSH2
genmutasjoner har blitt publisert. Men flertallet av de publiserte artikler fokusert på LS eller LS-lignende CRC. Totalt 30 små utvalgsstørrelse (n = 5-61, med unntak av én av 315 pasienter) studier har blitt publisert som vist germline mutasjoner i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i sporadisk CRC . Patologiske mutasjoner av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var mer sannsynlig å være til stede hos yngre pasienter [6], og i de med mikro ustabilitet (MSI). I vår analyse av disse 30 studiene, MSI eller tidlig alder debut (under 40, 45, 50 eller 55 år) ble brukt til å forhåndsvelge pasienter for
hMLH1 Hotell og
hMSH2
genet mutasjoner i sporadisk CRC. Men ingen studie forsøkte å påvise mutasjon frekvenser av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i massesporadisk CRC uten MSI eller alder forvalg. I Kina, fire studier (n = 26-58) skjermet germline eller somatiske mutasjoner av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i sporadisk CRC med forvalg av MSI [7], [8], [ ,,,0],9], [10]. Enten høye frekvenser av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
genmutasjoner oppstå i sporadisk CRC i Kina har ikke blitt klarlagt. Videre antyder sterke bevis for at sjeldne mutasjoner av alvorlig effekt er ansvarlig for en betydelig andel av komplekse menneskelige kreft [11]. Vi gjennomførte derfor denne studien å identifisere roman
hMLH1 Hotell og
hMSH2
DNA-varianter, for å fastslå både mutasjon frekvenser og områder i både sporadisk og LS CRC, og å anslå forholdet mellom kimcellelinje og somatisk mutasjoner av
hMLH1 /hMSH2
genet og clinicopathological karakteristikker av CRC i Nordøst-Kina.
Materialer og metoder
fag
Etter å ha innhentet informert samtykke fra forsøkspersonene og godkjenning fra Institutional Divisjonsstyret for Harbin Medical University, identifiserte vi CRC pasienter som gjennomgikk kirurgi ved Cancer Hospital og andre Affiliated Hospital of Harbin Medical University, uten forvalg og basert på patologisk diagnose alene. Pasienter med nevroendokrin kreft, malignt melanom, non-Hodgkins lymfom, gastrointestinal stromal tumor og metastatisk kolorektal karsinom ble ekskludert fra analysen. Fra 1 juni 2004 til 15. mai 2005, og 15 mai 2007 til 1. januar 2008, 473 primær CRC pasienter (452 sporadisk CRC, 21 LS CRC) ble rekruttert. 457 blodprøver og 356 tumorvev ble samlet for molekylær genetisk analyse.
DNA Extraction
DNA ble vellykket hentet fra alle 457 blodprøver (436 sporadisk CRC og 21 LS CRC) og 356 tumorvev (342 sporadisk og 14 LS) ved hjelp av den klassiske fenol-kloroform prosedyre [12].
i samlingen av blod og vevsprøver og DNA-ekstraksjon, vi kunne ikke få tak i svulstvev DNA av 117 CRC pasienter (110 sporadisk og 7 LS) på grunn av at svulstvevet var bare stort nok for patologi diagnose eller at vi ikke trekke ut DNA vellykket. Derfor har vi bare deres blod DNA. I de andre 16 sporadiske CRC pasienter, fikk vi koblet sammen blod og vevsprøver. Men i DNA-ekstraksjon, vi gjorde ikke trekke ut DNA vellykket fra blodprøven. Endelig har 340 CRC pasienter (326 sporadisk og 14 LS) paret blod og vev DNA.
Screening for kimcellelinje og somatiske mutasjoner av
hMLH1 Kjøpe og
hMSH2
Gener
PCR-SSCP sekvensering analyse.
de primere for 20 par alle 19 eksoner i
hMLH1
genet og 17 par av alle 16 eksoner i
hMSH2
-genet (tabell 1), som blant annet ekson-introngrenser, ble syntetisert for genomisk PCR. PCR-amplifikasjoner ble utført ved anvendelse av følgende protokoll for 35 sykluser: denaturering i 30 sek ved 95 ° C, gløding i 30 s ved 54 ° C til 64 ° C, forlengelse i 30 s ved 72 ° C, etterfulgt av en endelig forlengelse for 5 min ved 72 ° C (ABI 9700). PCR-produktene ble identifisert ved 1% agarose-elektroforese (BioWest Agarose, Gene Company Ltd.).
PCR-produktene ble denaturert ved 98 ° C i 8 minutter og plassert på is. Elektroforese ble utført på 8% til 15% nondenaturing polyakrylamidgeler. Etter elektroforese ble gelene farget med sølv (Raffinert Chemical Plant, Shanghai, Kina). 15% av prøvene ble replikert ved påvisning av mutasjoner av enhver amplifisert PCR-fragmentet i den PCR-SSCP-analyse, med den samstemmighet som strekker seg fra 99,1% til 100% for forskjellige forsterker PCR-fragmenter.
PCR-produkter som viser unormal bevegelighet henhold SSCP analyse ble sendt til sekvensere hjelp ABI3730XL. Sekvense resultatene ble analysert for genmutasjoner med Chromas 2,22 programvare (Technelysium Pty. Ltd., QLD, Australia).
Vurdering av Mutation patogenitet
For tidligere rapportert mutasjoner, resultatene av funksjon verifikasjon ble brukt å bestemme patogenitet. Hvis ingen funksjon Verifikasjonen ble rapportert, var funksjon prediksjon av to av de PolyPhen /SIFT /MAPP-MMR resultatene brukes til å bestemme deres patogenitet.
For de nye DNA-varianter, patogenitet basesubstitusjon i eksoner ble spådd av PolyPhen program [13] og MAPP-MMR [14]. Base innsetting, sletting og substitusjon i promoter, introner eller 3’UTR ble vurdert etter kriterier for å avgjøre potensialet patogenitet [15]. Vi har også oppdaget de nye DNA-varianter i 100 friske kontroller for å fastslå potensialet patogenitet.
Statistical Analysis
Kategori og kontinuerlige variabler ble testet av chi-kvadrat test og
t
test, respektivt. Alle de statistiske analysene ble utført av SAS 9.1 (SAS Institute, Cary, NC, USA).
Resultater
Mutasjoner
Mutasjoner i
hMLH1
genet .
Vi identifiserte 11 DNA-varianter i
hMLH1
genet. IVS8-16 A T, c.1831 ATT TTT og c.1845_1847 sletting GAA var somatiske DNA-varianter, andre åtte DNA-varianter var både kimcellelinje og somatiske varianter. Fire (IVS8-16 A T, c.704 GAT GTT, c.1529 CAG CGG, c.1831 ATT TTT) var romanen DNA-varianter identifisert i sporadiske CRC pasienter (figur 1 og tabell 2). Alle de fire nye DNA-varianter ble ikke oppdaget i 100 friske kontroller. c.1529 CAG CGG ble spådd å ha noen pathogeneity, den pathogeneity andre tre nye DNA-varianter var usikre. Syv mutasjoner (-28 A G, c.927 CCC CCT, IVS13 + 14 G A, IVS14-19 A G, c.1742 CCG . CTG, c.1845_1847 sletting GAA og c * 35_ * 37 sletting CTT) ble tidligere rapportert i Insight databasen [10], [16], [17], [18], [19], [20], [21]. c.1742 CCG CTG og c.1845_1847 sletting GAA ble rapportert å være patologiske mutasjoner [21], [22]
Vi har også identifisert to polymorfismer.. c.655 ATC GTC ble rapportert å være en vanlig polymorfisme i kaukasiere [23], [24], [25], mens c.1151 GTT GAT ble rapportert å være mer vanlig i asiatiske befolkningen [26]. Derfor vi ikke kategorisere dem som mutasjoner i vår studie.
Mutasjoner i
hMSH2
genet.
Vi identifiserte sju
hMSH2
DNA-varianter. Innsetting AACAACA på c.1127 og sletting AAG på c.1129 var somatiske DNA-varianter, seks andre DNA-varianter ble både kimcellelinje og somatiske varianter. To DNA-varianter (-39 C T, innsetting AACAACA på c.1127 og sletting AAG på c.1129) ble nylig oppdaget i denne studien (figur 2 og tabell 2). I screening de to nye DNA-varianter i 100 friske kontroller ble ingen varianter oppdaget. Patogenitet av de to DNA-variantene var usikker. Fem andre mutasjoner (C.23 ACG ATG, c.471 GGC GGA, c.505 ATA GTA, c.1168 CTT TTT og c.1886 CAA CGA) ble tidligere rapportert i Insight databasen [14], [27].
To mannlige pasienter gjennomført somatiske mutasjoner i begge
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener. En annen mannlig pasient båret c.1831 ATT TTT mutasjon av
hMLH1
genet og C.23 ACG . ATG mutasjon av
hMSH2
genet i både tumor vev og blod
Mutation frekvenser
mutasjons~~POS=TRUNC frekvenser i sporadiske CRC pasienter.
Blant 436 sporadiske CRC pasienter med tilgjengelige blod DNA, germline mutasjon frekvenser av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 5,28% (23/436) og 10,78% (47/436), henholdsvis (
p
0,01) (Tabell 3). Justert for synonyme mutasjoner (c.927 CCC CCT i
hMLH1 Hotell og c.471 GGC GGA i
hMSH2
), mutasjonsfrekvenser i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 4,59% (20/436) og 8,72% (38/436), henholdsvis (
p =
0,01). Hvis pasienten som utførte to germline mutasjoner ble kun en gang (en pasient næret både -39 C T og C.23 ACG ATG mutasjoner i
hMSH2
og IVS13 + 14 G En mutasjon av
hMLH1
, den andre pasienten gjennomført både c.1831 ATT TTT mutasjon i
hMLH1 Hotell og C.23 ACG ATG i
hMSH2
); deretter 15,59% (68/436) av pasientene viste germline mutasjoner i
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet. Patologisk mutasjon frekvenser av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 0,23% (1/436) og 0%, henholdsvis.
Blant 342 sporadiske CRC pasienter med tilgjengelige DNA i tumorvev, de somatisk mutasjon frekvensene i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 6,73% (23/342) og 11,70% (40/342), henholdsvis (
p =
0,02) (tabell 3). Eksklusive synonyme mutasjoner (c.927 CCC CCT i
hMLH1 Hotell og c.471 GGC GGA i
hMSH2
), mutasjons frekvenser av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 5,85% (20/342) og 9,94% (34/342), henholdsvis (
p =
0,03). Hvis mutasjoner ble talt av pasienter i stedet for det faktiske antall mutasjoner (tre pasienter gjennomført somatiske mutasjoner både
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener), deretter 17.54% (60/342) av pasientene viste somatisk mutasjoner av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet. Patologisk mutasjon frekvenser av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 0,58% (2/342) og 0%, henholdsvis.
kimcellelinje mutasjonsfrekvens var ikke signifikant forskjellig fra somatisk mutasjon frekvens i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener, henholdsvis (
p =
0,49 og
p =
0,69, henholdsvis).
mutasjons~~POS=TRUNC frekvenser i LS CRC pasienter.
Blant 21 blod DNA-prøver av LS CRC pasienter, ett (4,76%) pasient gjennomført en germline mutasjon av
hMLH1 Kjøpe og fem (23.81%) pasienter gjennomført germline mutasjoner i
hMSH2
. Totalt seks (28.57%) pasienter viste germline mutasjoner av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet.
tumorvev var bare tilgjengelig i 14 LS CRC pasienter, ett (7,14 %) pasient gjennomført en somatisk mutasjon i
hMLH1 Hotell og tre (21.43%) pasienter gjennomført en somatisk mutasjon i
hMSH2
. I alt fire (28,57%) av pasientene viste somatiske mutasjoner i
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet.
Ingen patologiske mutasjoner ble oppdaget i LS CRC pasienter.
mutasjonen Distribution i forskjellige Eksoner
Den høyeste germline mutasjon utbredelsen av
hMSH2
i sporadisk CRC ble oppdaget i ekson 7 (3,90%), fulgt av ekson 12 (2,52%), ekson 1 (1,38%), og ekson 3 (0,46%). Mutasjoner i disse fire eksoner utgjorde 76,6% av de totale mutasjoner i
hMSH2
. Så langt som
hMLH1
, mutasjonsfrekvenser var generelt lavere enn i
hMSH2
; de høyeste mutasjon prevalens var i ekson 16, ekson 9, ekson 13, og ekson 19 (0,23%) (tabell 3).
forholdet mellom kimcellelinje og somatiske mutasjoner av
hMLH1 /hMSH2
gene og Clinicopathological Kjennetegn på CRC
Somatisk mutasjon hyppigheten av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet var 22,7% (15/66) i proksimale tykktarmskreft, 17,7% (11 /62) i distal tykktarmskreft og 10,5% (22/209) i endetarmskreft (
p
= 0,03). Mens germline mutasjon hyppigheten av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet var ikke signifikant forskjellig i proksimale tykktarmskreft (17,3%, 14/81), distal tykktarmskreft (17,8%, 13/73) og endetarmskreft (10,1%, 28/276) (
p
= 0,09). (Tabell 4 og 5).
kimcellelinje og somatisk mutasjon hyppigheten av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet var ikke signifikant forskjellig i andre clinicopathological egenskaper ( alder, kjønn, BMI, Dukes stadium, Histotypes, Patologiske typer, Differensiert grad og tumorstørrelse) av CRC.
på grunn av mindre LS CRC pasienter vi ikke analysere forholdet mellom kimcellelinje og somatisk
hMLH1 /hMSH2
genmutasjoner og clinicopathological kjennetegn LS CRC.
Diskusjoner
Under den antatte modellen av vanlig sykdom sjeldne varianten [28], [29], vist vi de sjeldne varianter av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i sporadisk og LS CRC. Vi identifiserte 18 typer DNA-varianter i vår studie. Seks ble nye DNA-varianter, og 12 er tidligere blitt rapportert. Av de seks nye DNA-varianter, fire var i
hMLH1 Hotell og to i
hMSH2
.
To av de fire nye
hMLH1
DNA-varianter, p .Asp235 Val (c.644 GAT GTT) og p.Gln510Arg (c.1529 CAG CGG), både føre til aminosyre polaritet endringer som kan påvirke strukturen i
hMSH2
bindende domene og
hPMS2 /hPMS1
bindende domene av
hMLH1
genet henhold og føre til dysfunksjon av DNA MMR-systemet. En annen DNA varians, p.Ile611Phe (c.1831 ATT TTT), føre til at ingen aminosyre polaritet endringer i
hPMS2 /hPMS1
bindende domene av
hMLH1
genprodukt, kan ha ingen innvirkning på funksjonen av DNA MMR system [30]. IVS8-16 A T er spådd til å ha noen effekt på spleising i ekson 9.
En av de to romanen
hMSH2
DNA-varianter, -39 C T, var en varians i fem «UTR, noe som kan påvirke mRNA transkripsjon. Den andre varians, c.1127 ins AACAACA og c.1129 del AAG, var et rammeskifte mutasjon, noe som kan påvirke
hMSH6
bindende domene og
hMutL
homolog samspillet av
hMSH2
genprodukt og bevirke at dysfunksjon i DNA MMR system [30].
Selv om svikt av DNA MMR system er en av de genetiske veier i utvikling av CRC [2]. Ifølge kriteriene for mutasjon pathogeneity vurdering, en roman DNA variant, c.1529 CAG CGG, ble spådd å ha noen pathogeneity, den pathogeneity andre fem nye DNA-varianter var usikre. Derfor kan vi ikke belyse rollen til disse nye DNA-varianter av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i forekomst og utvikling av CRC
c.1742 CCG . CTG av
hMLH1 Hotell og c.1886 CAA CGA av
hMSH2
var grunnlegger mutasjoner i den asiatiske befolkningen [31]. Tre andre mutasjoner av
hMSH2
, C.23 ACG ATG, c.505 ATA GTA og c.1168 CTT TTT, var av høyere forekomst i asiater (2,44%, 1,74% og 6,97%, henholdsvis) sammenlignet med hvite (0,05%, 0,05% og 0,53%, henholdsvis) [31]. Det kan forklare raseforskjell på CRC pasienter. I tillegg kan det være mer effektivt å oppdage disse mutasjonene i asiatiske populasjoner
Siden vi oppdaget en høyere prevalens av c.1168 CTT . TTT av
hMSH2
i begge LS (14,29%, 3/21) og sporadisk (3,90%, 17/436) CRC, vi skjermet for mutasjon hos friske kontroller. Mutasjonen frekvens i friske kontroller ble 4,16% (21/505), som ikke var signifikant forskjellig sammenligner med CRC (
p
= 0,84). Denne spesielle mutasjonen ble også rapportert som en polymorfisme i Korea etter Kim et al, som ikke påvise en signifikant forskjell mellom saker og kontroller [26].
signifikant sammenheng ble bare observert mellom somatisk
hMLH1 /hMSH2
genmutasjoner og svulst plassering av sporadisk CRC (
p =
0,03). Den somatisk mutasjon hyppigheten av
hMLH1 /hMSH2
genet var høyest i endetarmskreft, følgende var i proksimale tykktarmskreft, og det laveste var i distal tykktarmskreft. Den ikke-pathogeneity eller usikker pathogeneity kan forklare den ikke-signifikant sammenheng mellom
hMLH1 /hMSH2
genmutasjoner og andre clinicopathological kjennetegn ved sporadisk CRC.
I vår forrige meta-analyse basert på germline mutasjoner av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener (papir akseptert, 10,1371 /journal.pone.0051240), den samlede patologisk mutasjon hyppigheten av
hMLH1
var 8,72% (95% CI: 6,12% -12,29%) i sporadisk CRC. Det var 10,28% (95% KI: 4,28 til 22,70%) i amerikanske studier, 7,47% (95% KI: 4,06 til 13,34%) i europeiske studier, og 3,21% (95% KI: 0,88 til 11,03%) i asiatiske studier (
p =
0,65). I vår kohort, det var bare 0,23%. Den sammenslåtte patologisk mutasjon hyppigheten av
hMSH2
var 7,28% (95% KI: 5,12% -10,26%) i sporadisk CRC. Det var 5,89% (95% KI: 2,08 til 15,61%) i amerikanske studier, 7,58% (95% KI: 4,05 til 13,76%) i europeiske studier, og 3,64% (95% KI: 1,96 til 6,65%) i asiatiske studier (
p
= 0,85). Men ingen patologisk mutasjon av
hMSH2
ble påvist i vår studie.
Åtte [7], [9], [32], [33], [34], [35], [36], [37] og ni studier [7], [9], [32], [33], [34], [35], [36], [37], [38] i Asia detektert somatiske mutasjoner av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i sporadisk CRC. Den samlede forekomsten av patologiske mutasjoner var 11,86% (95% KI: 7,62 til 18,01%) og 7,90% (95% KI: 4,72 til 12,94%) henholdsvis ved meta-analyse, som er høyere enn i vår studie (0,58% og 0%).
Alle de publiserte studiene oppdaget germline eller somatiske mutasjoner i sporadisk CRC med forvalg (MSI, tidlig debut alder, eller TGF-B RII mutasjon) [36], noe som kan forklare den høyere mutasjonsfrekvens i de publiserte individuelle studier og meta-analyser av tidligere publiserte studier. I tillegg kan den lille størrelsen på utvalget i de publiserte studier også bidra til inkonsistente resultater.
Bare én studie i Asia oppdaget somatiske mutasjoner av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i 31 sporadiske CRC pasienter uten forvalg [37]. Den største studien påvise germline mutasjoner var på 315 europeiske BG-CRC pasienter under 55 år; mutasjonen hyppigheten av
hMSH2
ble funnet å være 0,32% (1/325, usikker patogenitet), mens ingen mutasjon i
hMLH1
ble oppdaget [39].
I vår forrige meta-analyse, de samlede germline mutasjon frekvenser av
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 28,55% (95% CI: 26,04% -31,19%) og 19,41% (95% CI: 15.88% -23,51%) i Amsterdam-kriteriene positive LS CRC. I Amsterdam-kriteriene negativ LS CRC, disse sammenslåtte mutasjonsfrekvenser var 16,70% (95% CI: 14,53 til 19,13%) og 11,13% (95% KI: 9,49 til 13,42%) for
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener, henholdsvis. I vår studie, ingen germline mutasjon i
hMLH1
eksoner ble funnet, ligner på en studie i Japan [40]. Kimlinje mutasjonsfrekvens på
hMSH2
var 9,52% (2/21) (unntatt den polymorfe mutasjonen c.1168 CTT TTT), som var forholdsvis lavere enn det i den meta-analyse (11.13%, 95% CI:. 9,49 til 13,42%)
Fem asiatiske studier oppdaget somatisk mutasjon av
hMLH1
eller
hMSH2
i LS CRC [7], [41], [42 ], [43], [44]. De sammenslåtte somatisk mutasjon frekvenser i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 9,57% (95% KI: 1,36 til 44,73%) og 25,65% (95% CI: 10,30 til 50,89%), henholdsvis ved meta-analyse. I vår studie, den somatiske mutasjon hyppigheten av
hMSH2
i LS CRC var 14,29% (2/14) (unntatt det polymorfe mutasjon, c.1168 CTT TTT). Men ingen somatiske mutasjoner i
hMLH1
eksoner ble funnet i LS CRC, i likhet med de to japanske studier [41], [43]. Den somatisk mutasjon hyppigheten av
hMSH2
i LS CRC varierte fra 5,88% til 58,33% i de fem asiatiske publiserte studier. En liten utvalgsstørrelse kan forklare avvikene av mutasjonsfrekvensen i LS CRC.
I konklusjonen, vi identifisert seks nye DNA-varianter (fire i
hMLH1 Hotell og to i
hMSH2
). I sporadisk CRC, germline og somatisk mutasjon frekvenser av
hMLH1 /hMSH2
genet var 15,59% og 17,54%, henholdsvis. Prevalensen av germline mutasjoner var 5,28% i
hMLH1 Hotell og 10,78% i
hMSH2
. De somatiske mutasjoner frekvenser i
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener var 6,43% og 11,70%, henholdsvis. I LS CRC, både kimcellelinje og somatiske mutasjoner frekvenser av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet var 28,57%. Den mest utbredte germline mutasjon nettstedet i
hMSH2
genet ble c.1168 CTT TTT (3,90%), en polymorfisme. Somatisk mutasjon hyppigheten av
hMLH1 Twitter /
hMSH2
genet var signifikant forskjellig i proksimale tykktarmskreft, distal tykktarmskreft og endetarmskreft.
Våre funn kan bidra til å belyse DNA variant spekteret og frekvensen til
hMLH1 Hotell og
hMSH2
gener i CRC pasienter, spesielt sporadiske CRC pasienter i Kina, og deres relasjoner med clinicopathological kjennetegn ved sporadisk CRC. Funksjonelle studier for å finne ut hvordan disse nye DNA-varianter påvirke proteinfunksjonen er nødvendig.
Takk
Takk for den innfødte redigering av International Science redigering.
