New Approach to Screening Chemo Drugs
Forskere er nå i stand til å bruke en 3D datamodell som hjelper dem å sile millioner av chemo narkotika. Dette splitter nye tilnærmingen har vært i stand til å gi forskerne et fullt bevegelig oversikt over strukturen til et protein som antas spilte en avgjørende rolle i kjemoterapi fiasko.
For lengst tid, medisinske forskere kan bare bruke stillbilder av proteiner knyttet til tilbakevendende former for kreft. De håpet at det å studere disse bildene ville gi dem en forståelse av nøyaktig hvorfor disse proteinene kan gjøre noen chemotherapies mislykkes.
Heldigvis stirret på disse stillbilder vil snart være en saga blott. Foreløpig biokjemikere ved Southern Methodist University, en kreft forskningssenter i Dallas, er i stand til å bruke en komplett 3D-modell av P-glykoprotein. Dette er det humane protein som antas å spille en sentral rolle i å forårsake kjemoterapi svikt i et antall tilbakevendende kreft. Disse SMU biokjemikere bruker denne 3D-modellen til effektivt skjermen mer enn 8 millioner potensielle legemiddel forbindelser i håp om at det vil være minst en som kan hindre denne feilen.
En av biokjemikere, en Mr. John G . Wise, ble intervjuet i en skoleavis. Han nevnte at denne nye tilnærmingen har fungert som en virkelig god «proof-of-prinsippet». De biokjemikere har vist at å kjøre disse narkotika forbindelser gjennom beregningsmodell fungerer som en effektiv måte å raskt screene enorme antall forbindelser. Ved hjelp av denne nye fremgangsmåten, vil de være i stand til å filtrere ut et mindre antall forbindelser, som deretter kan testes i våt laboratoriet. Denne prosessen er også svært økonomisk i forhold til tidligere metoder.
Wise beskriver søke hans superdatamaskin i biokjemi, den biofysiske og molekylær kjemi journal. Hans søk har allerede gitt flere hundre forbindelser som biokjemikere har ansett «interessant». Han og hans kollega, Pia Vogel, har allerede begynt å teste 30 av disse «interessant» forbindelser i lab. Utrolig, av disse 30 forbindelser, de har allerede funnet noen som kan hemme P-glykoprotein!
Wise nevner at laget kan for tiden skjermen rundt 40.000 forbindelser per dag ved hjelp av High Performance Computer ved SMU. Dessverre, selv med denne fantastiske datakraft for hånden, oddsen er fortsatt stablet mot eventuelle medisinske forskere prøver å identifisere en medikamentforbindelse som faktisk vil fungere. Vi har sett andre forsøk, som for eksempel bruk av nano-teknologi for kreftbehandling, noe som gir håp i en dag å utvikle en kur.
Dette virker merkelig, gitt det faktum at Wise og hans kollega har allerede funnet et noen forbindelser som kan hemme protein. Som Wise sier det, kan du finne 100 forbindelser som er «gode hemmere», men 99 av disse forbindelsene kan være for giftig til å bli brukt på pasienter. Wise har innrømmet at det faktisk finnes en rekke ting som kan være galt med forbindelsene. De kunne være for giftige, de kan forbrenne for fort, eller de kan ikke være løselig nok til å være akseptabelt for mennesker
han opprettholder et positivt syn, og har uttalt at de er definitivt på rett spor. Men Wise ville bli blåst bort hvis en av de første flere forbindelser de har testet viser seg å være den de leter etter. Det er som å lete etter en nål i en utrolig stor høystakk, men med en datahastighet som kraftig, (40.000 forbindelser en dag!) De kan bare finne at nålen etter alt.
