Abstract
Bakgrunn
Samler bevis støtter at tumorvekst og kreft tilbakefall er drevet av kreft stamceller. Vår tidligere arbeid har vist at det finnes CD90
+ leverkreftstamceller (cscs) i leverkreft (HCC). Ikke desto mindre, egenskapene til disse cellene er fremdeles dårlig forstått. I denne studien benyttet vi en mer følsom RNA-sekvensering (RNA-Seq) å sammenligne genuttrykk profilering av CD90
+ celler sortert fra tumor (CD90
+ cscs) med parallelle ikke-tumor levervev (CD90
+ NTSCs) og belyse rollene til antatte målgener i hepatocarcinogenesis.
metodikk /hovedfunnene
CD90
+ celler ble sortert henholdsvis fra svulsten og tilstøtende ikke-tumorous menneske leveren vev ved hjelp av fluorescens-aktivert cellesortering. De forsterkede RNA av CD90
+ celler fra 3 HCC pasienter ble utsatt for RNA-Seq analyse. En differensial genekspresjon profilen ble opprettet mellom CD90
+ cscs og CD90
+ NTSCs, og validert av kvantitativ real-time PCR (QRT-PCR) på samme sett med forsterkede RNA, og ytterligere bekreftet i en uavhengig kohort 12 HCC pasienter. Fem hundre gener ble uttrykt forskjellig (119 oppregulert og 381 nedregulert gener) mellom CD90
+ cscs og CD90
+ NTSCs. Gene ontology analyse indikerte at over-uttrykte gener i CD90
+ cscs var assosiert med inflammasjon, medikamentresistens og lipidmetabolisme. Blant de forskjellig uttrykte gener, glypican-3 (GPC3), et medlem av glypican familien, ble markert forhøyet i CD90
+ cscs forhold til CD90
+ NTSCs. Immunhistokjemi viste at GPC3 ble sterkt uttrykt i førtito humane lever tumorvev, men fraværende i tilstøtende ikke-tumor leveren vev. Flowcytometri indikerte at GPC3 ble sterkt uttrykt i leveren CD90
+ cscs og modne kreftceller i leveren kreftcellelinjer og humane lever tumorvev. Videre GPC3 uttrykk var positivt korrelert med antall CD90
+ cscs i leveren tumorvev.
Konklusjon /Betydning
De identifiserte gener, for eksempel GPC3 som er tydelig uttrykt i lever CD90
+ cscs, kan være lovende genet kandidater for HCC terapi uten å indusere skader på normale lever stamceller
Citation. Ho Dwy, Yang ZF, Yi K, Lam CT, Ng MNP, Yu WC, et al. (2012) Gene Expression Profilering av leverkreft Stem Cells av RNA-sekvensering. PLoS ONE 7 (5): e37159. doi: 10,1371 /journal.pone.0037159
Redaktør: Dean G. Tang, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, USA
mottatt: 01.09.2011; Godkjent: 15 april 2012; Publisert: May 14, 2012
