Abstract
bakgrunner
Aktivering av Toll-lignende reseptorer (TLR) kan være en viktig begivenhet i immun unndragelse av tumorceller. Nylig har flere studier undersøkt sammenhengen mellom
TLR2
-196 til -174 del og to SNPs av
TLR4 plakater (rs4986790 og rs4986791) og mottakelighet for ulike typer kreft; Men resultatene er fortsatt motstridende. Hensikten med denne studien var å vurdere sammenhengen mellom
TLR2 Kjøpe og
TLR4
polymorfismer og kreftrisiko i en meta-analyse med kvalifiserte publiserte studier.
Metodikk /prinsipp Funn
et datasett består av 14627 tilfeller og 17438 kontroller fra 34 publikasjoner ble inkludert i en meta-analyse for å vurdere sammenhengen mellom den samlede risikoen for kreft eller kreft spesifikk risiko og tre SNPs av
TLRs
(
TLR2
-196 til -174 del,
TLR4
rs4986790 og rs4986791). Resultatene viste at alle disse tre polymorfismer var signifikant assosiert med økt kreftrisiko (dominerende modellen: OR = 1,64, 95% KI: 1,04 til 2,60 for
TLR2
-196 til -174 del, OR = 1,19 , 95% KI: 1,01 til 1,41 for
TLR4
rs4986790, og OR = 1,47, 95% KI: 1,120 til 1,80 for
TLR4
rs4986791, henholdsvis). I stratifisert analyse, fant vi effekten av
TLR2
-196 til -174 del på kreftrisikoen forble signifikant i undergruppen av kaukasiere og Sør asiater, men ikke i Østasiater. Men sammenhengen mellom rs4986791 og kreftrisiko var betydelig i både Sør-asiater og Østasiater, men ikke i kaukasiere. Videre sammenhengen mellom rs4986790 og kreftrisiko var statistisk signifikant i fordøyelses kreft (dominerende modellen: OR = 1,76, 95% KI: 1,13 til 2,73) og kvinnelige spesifikke kreftformer (dominerende modellen: OR = 1,50, 95% KI: 1.16- 1.94). Imidlertid ble ingen signifikant sammenheng med risiko for fordøyelsessystemet kreft observert for
TLR2
-196 til -174 del og
TLR4
rs4986791.
Konklusjon /Betydning
Denne metaanalysen presenteres ytterligere bevis for sammenhengen mellom
TLR2 Hotell og
TLR4
polymorfismer og kreftrisiko. Videre veldesignede undersøkelser med store utvalgsstørrelser er nødvendig for å bekrefte denne konklusjonen
Citation. Zhu L, Yuan H, Jiang T, Wang R, Ma H, Zhang S (2013) Association of
TLR2 Hotell og
TLR4
Polymorfisme med risikoen for kreft: en meta-analyse. PLoS ONE 8 (12): e82858. doi: 10,1371 /journal.pone.0082858
Redaktør: Xiaoping Miao, MOE Key Laboratory for miljø og helse, Huazhong University of Science and Technology, Kina
mottatt: 06.09.2013; Godkjent: 29 oktober 2013; Publisert: 20.12.2013
Copyright: © 2013 Zhu et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet delvis av National Natural Science Foundation of China (81270044 og 81302361), Priority Academic Program Utvikling av Jiangsu høgskolerådet (PAPD), Jiangsu Natural Science Foundation (BK2011764) og Jiangsu-provinsen Clinical Science and Technology Projects (BL2012008). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Toll-lignende reseptorer (TLR) er en familie av membran spennende medfødte immun reseptorer som gjenkjenner ligander avledet fra bakterier, sopp, virus og parasitter [1]. TLRs spille en nøkkelrolle i realiseringen av medfødte og adaptive immunrespons, er involvert i reguleringen av betennelsesreaksjoner og aktivering av den adaptive immunresponsen å eliminere smittsomme patogener og kreft rusk [2], [3]. I tillegg kjører betennelsesreaksjoner, TLRs også regulere celleproliferasjon og overlevelse ved å utvide nyttige immunceller og integrere inflammatoriske responser og vev reparasjonsprosesser [4]. Videre er funksjonelle TLR’ene uttrykkes ikke bare i immunceller, men også i kreftceller, og dermed impliserer en rolle TLR’ene i tumorbiologi [5], [6]. Økende likene av bevis har antydet at TLRs kan fungere som et tveegget sverd i kreftceller fordi ukontrollert TLR signalering gir et mikromiljø som er nødvendig for tumorceller til å spre seg og unngå immunrespons [4], [7]. I tillegg aktivering av TLR’ene ikke bare fører til oppregulering av cellulære forsvarsmekanismer, men også resulterer i opp-regulering av DNA-reparasjonsgener og øket funksjonell DNA-reparasjon [8], [9].
TLR familien omfatter 2 undergrupper, ekstracellulære og intracellulære, avhengig av cellulær lokalisering. TLR1, 2, 5, 6 og 10 er ekstracellulære TLR’ene, som i stor grad er lokalisert på celleoverflaten. Omvendt, TLR3, 7, 8 og 9 (intracellulær TLR’ene) er lokalisert i intracellulære organeller. Den subcellulære lokalisering av
TLR4
er unik fordi den er lokalisert til både plasma membran og endosomal vesikler [10].
TLR2 Hotell og
TLR4
er store TLRs og har vært aktivt undersøkt i betennelse og kreft. Det er dokumentert at
TLRs
, spesielt
TLR2 Hotell og
TLR4
, direkte regulere store proinflammatoriske og vert forsvar funksjoner på menneske nøytrofile [11]. I tillegg
TLR2
gjenkjenner mikrobielle patogen-forbundet molekylære mønstre, for eksempel cellevegg av peptidoglykan og lipoteichonsyre syre [12]. Positiv
TLR2
uttrykk i svulsten mikromiljøet tyder på at immunovervåkning er aktivert mot de endrede epitelceller, mens
TLR2
uttrykk ved maligne keratinocytter kan være tegn på motstand mot apoptose som en prosurvival mekanisme [13 ].
TLR4
ligation på kreftceller kan øke utskillelsen av immunsuppressive cytokiner og indusere resistens mot TNF-relatert apoptose-induserende ligand (TRAIL) indusert apoptose [14], [15]. Studier har vist at lipopolysakkarid (LPS) ligering til
TLR4
fremmer svulst celle adhesjon og invasjon i en musemodell ved å opptre NF-kappa B [16], og ved å stanse all
TLR4
øker tumor progresjon og metastase i en murine modell av brystkreft [17].
Genetiske studier har identifisert en polymorfisme av
TLR2
som fører til en 22-bp nucleotide sletting (-196 til -174 del) i promoter-regionen, noe som kan innvirke på aktiviteten til promotoren
TLR2
og føre til redusert transkripsjon av
TLR2
genet. I tillegg to SNPs i
TLR4
har også blitt identifisert; en er en A → G substitusjon på 896 basepar (bp) som resulterer i en asparaginsyre til glycin erstatning ved kodon 299 (D299G, rs4986790) og den andre er en → T substitusjon C på 1196 bp som resulterer i en treonin til isoleucin utveksling ved kodon 399 (T399I, rs4986791). Det er blitt vist at disse to polymorfismer (rs4986790 og rs4986791) påvirker det ekstracellulære domene av reseptoren, og som kan forringe ligand gjenkjennelse [18]. De sammenslutninger av disse tre polymorfismer med kreftrisiko har vært mye studert, inkludert blærekreft [19], [20], brystkreft [21], [22], magekreft [23] – [31], prostata kreft [32] – [37], leverkreft [38], [39], galleblæren kreft [40], livmorhalskreft [41], nasopharyngeal kreft [42], leukemi [43], melanom [44], livmorkreft [45], lymfom [46] – [50], spiserørskreft [31] og endetarmskreft [51], [52]. Imidlertid forble inkonsekvent enn absolutt resultatene.
i betraktning den forholdsvis lille prøvestørrelsen i hvert enkelt studie kan ha lav effekt for å påvise effekten av polymorfismer på kreft, og det underliggende heterogenitet blant forskjellige studier behøver å bli undersøkt gjennomførte vi en meta-analyse på alle kvalifiserte publisert case-control studier for å etablere et relativt omfattende bilde av forholdet mellom disse genetiske varianter (-196 til -174 del i
TLR2
, rs4986790 og rs4986791 i
TLR4
) og kreftrisiko.
Materialer og metoder
utvalgskriterier og identifisering av utvalgte studier
Kandidat studier ble identifisert gjennom dataassistert litteratur søk i PubMed etter relevante artikler på engelsk og kinesisk (siste søk var i januar 2013). Følgende søkeord ble brukt for dette søket: «
TLR2
eller Toll like receptor 2 «eller»
TLR4
eller Toll like receptor 4 «og» kreft «og» polymorfisme «. Vi har også inkludert flere studier av en hands-on jakt etter referanser originale studier. Abstracts, case-bare artikler, ledere, oversiktsartikler og gjentatte litteratur ble ekskludert. Inklusjonskriteriene fra undersøkelser med dagens meta-analyse ble definert som følger: (1) opprinnelige papir som inneholder uavhengig av data; (2) case-control design på foreningen av
TLR2 plakater (-196 til -174 del) eller
TLR4 plakater (rs4986790 og rs4986791) polymorfismer og kreftrisiko; (3) å gi tilstrekkelig informasjon til å beregne odds ratio (OR) eller
P
-verdi; (4) skrevet på engelsk eller kinesisk.
Data Extraction
To etterforskere (Zhu LB og Jiang T) uavhengig hentet data og nådd en enighet på alle varer. For hver studie ble følgende informasjon hentet: første forfatter, publiseringsdato, land, etnisitet, totalt antall tilfeller og kontroller, var antall tilfeller og kontroller gruppert etter ulike genotyper og Hardy-Weinberg likevekt test hos kontrollpersonene
.
Statistical Analysis
De urene odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (95% CIS) av
TLR2 plakater (-196 til -174 del) og
TLR4
(rs4986790 og rs4986791) polymorfismer og kreftrisiko ble estimert for hver studie. I tillegg utførte vi også stratifisering analyser av krefttyper og raser. Fordøyelsessystemet inkludert mage, esophageal, colorectal, galleblæren og hepatocellulær kreft; blodsystemet inkludert leukemi og lymfom; kvinnelig spesifikke inkludert endometrial, brystkreft og livmorhalskreft; mannlig spesifikke inkludert prostatakreft. Hvis en krefttype inneholdt mindre enn tre individuelle studier, ble de slått sammen til «annet» gruppen. Alle forsøkspersonene ble kategorisert som kaukasisk, østasiatisk (Kina og Japan), Sør-Asia (India) og blandet. De sammenslåtte Ors ble utført av allel sammenligninger og genetiske modeller sammenligninger. Den HWE ble vurdert via χ
2 test. En Chi-kvadrat basert Q test og
I
2
-statistic testen ble utført for å vurdere potensialet heterogenitet blant studier [53]. Hvis resultatet av testen var heterogenitet
p
0,05, ORS ble oppsamlet i henhold til de fast-effekt modell [54]. Ellers ble de tilfeldig-effekt modellen [55]. Betydningen av de sammenslåtte ORS ble bestemt av Z-test. Sensitivitetsanalysen ble gjennomført for å teste stabiliteten av den samlede effekten ved å utelukke hver studie individuelt og omberegning ORS og 95% CI. For ytterligere å utforske mulige kilder til heterogenitet blant studiene ble meta regresjon utført med noen lære egenskaper, herunder etnisitet, genotyping metoder, tumortyper, utvalgsstørrelse (≥500 eller 500), mindre allel frekvens (MAF) i kontrollpersoner, og kilde til kontroller (populasjonsbasert eller sykehusbasert). I tillegg ble de inverterte trakt plott og Begg trakten tomten brukes til å evaluere publikasjonsskjevhet [56]. De statistiske analysene ble utført av STATA 12,0 programvare. Alle
P
verdiene var tosidig.
Resultater
Kjennetegn på Studier
115 artikler ble først identifisert. Blant dem, gjorde 70 papirer ikke oppfyller våre kriterier og ble ekskludert. Etter å ha lest de fullstendige tekster av de resterende 45 papirer, fant vi 10 papers ikke hadde nok genotype data og en papir var en gjennomgang. Derfor ble totalt 34 publikasjoner inkludert 51 studier forble (figur 1). Alle studiene var av case-control design, inkludert fjorten typer kreft. Blant dem, 10 case-control studier fokusert på
TLR2
-196 til -174 del (2521 tilfeller og 3247 kontroller), 27 på
TLR4
rs4986790 (9743 tilfeller og 10839 kontroller), og 14 på
TLR4
rs4986791 (2363 tilfeller og 3352 kontroller). Videre tre publikasjoner fokusert på alle tre SNPs, ti publikasjoner fokusert på to SNPs, og tjueen publikasjoner fokusert på bare en SNP av alle. De detaljerte kjennetegn ved disse studiene, blant annet førsteforfatter, årstall, land, etnisitet, krefttype, antall tilfeller og kontroller, mindre allel frekvens (MAF) og HWE for alle studier ble oppsummert i Tabell 1. Fordelingen av genotyper i kontrollene i studiene var alle i avtalen med HWE unntatt fire studier [20], [35], [40], [42].
Meta-analyse resultater
De viktigste resultatene av denne meta-analysen ble oppført i tabell 2 og figur S1. For
TLR2
polymorfisme (-196 til -174 del), viste meta-analyse en betydelig økt risiko for alle kreftformer (allel sammenligning: OR = 1,62, 95% KI: 1,09 til 2,43,
P
0,001 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,64, 95% KI: 1,04 til 2,60,
P
0,001 for heterogenitet test; recessive modell: OR = 2,28, 95% KI: 01.23 til 04.20,
P
0,001 for heterogenitet test). På samme måte som begge
TLR4
rs4986790 (allel sammenligning: OR = 1,17, 95% KI: 1,00 til 1,37,
P
0,001 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,19, 95 % KI: 1,01 til 1,41,
P
0,001 for heterogenitet test) og rs4986791 (allel sammenligning: OR = 1,47, 95% KI: 1,21 til 1,78,
P
= 0,070 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,47, 95% KI: 1,20-1,80,
P
= 0,078 for heterogenitet test) også betydelig økt den totale kreftrisikoen
Vi videre utført. stratifisering analyse av etnisitet og krefttyper. Resultatene indikerte at variant genotyper av
TLR2
-196 til -174 del tendens til å være assosiert med samlet kreftrisiko hos kaukasiere (allel sammenligning: OR = 3,29, 95% KI: 1,14 til 9,51,
P
0,001 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 3,56, 95% KI: 1,10 til 11,51,
P
0,001 for heterogenitet test) og Sør asiater (allel sammenligning: OR = 1,32, 95% KI: 1,11 til 1,58,
P
= 0,785 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,37, 95% KI: 1,11 til 1,68,
P
= 0.870 for heterogenitet test), men ikke i Østasiater (tabell 2). Men sammenhengen mellom rs4986791 og kreftrisiko var betydelig i både Sør asiater (allel sammenligning: OR = 1,58, 95% KI: 01.16 til 02.16,
P
= 0,718 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,55 , 95% KI: 01.11 til 02.17,
P
= 0,846 for heterogenitet test) og Østasiater (allel sammenligning: OR = 1,72, 95% KI: 1,14 til 2,62,
P
= 0,198 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,77, 95% KI: 1,12 til 2,77,
P
= 0,192 for heterogenitet test), men ikke i kaukasiere (tabell 2). Når stratifisert etter krefttyper, betydelig økt risiko for
TLR4
rs4986790 ble funnet i fordøyelses kreft (allel sammenligning: OR = 1,79, 95% KI: 1,14 til 2,81,
P
= 0,001 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,76, 95% KI: 1,13 til 2,73,
P
= 0,003 for heterogenitet test) og kvinnelig-spesifikke kreftformer (allel sammenligning: OR = 1,44, 95% KI: 1,14 til 1,83
P
= 0,641 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,50, 95% KI: 1,16 til 1,94,
P
= 0,537 for heterogenitet test), men ikke i blodkreft eller mannlig -spesifikke kreftformer (tabell 3). Men ingen signifikant sammenheng med risiko for fordøyelses kreft ble observert for
TLR2
-196 til -174 del og
TLR4
rs4986791 (tabell 3). Vi har også undersøkt videre assosiasjoner mellom tre SNPs og magekreft eller prostatakreft (involvert i mer enn tre studier) og fant at både
TLR4
rs4986790 (allel sammenligning: OR = 2,18, 95% KI: 1,67 til 2,84
P
= 0,068 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 2,20, 95% KI: 1,67 til 2,89,
P
= 0,104 for heterogenitet test) og rs4986791 (allel sammenligning: OR = 1,90, 95% KI: 01.20 til 03.12,
P
= 0,193 for heterogenitet test; dominerende modellen: OR = 1,98, 95% KI: 01.22 til 03.21,
P
= 0,104 for heterogenitet test ) var assosiert med en betydelig økt risiko for magekreft, men ikke
TLR2
-196 til -174 del (tabell 4). Videre har vi ikke observere signifikant sammenheng mellom rs4986790 og prostata kreftrisiko.
Test av heterogenitet
En meta-regresjon ble utført for å utforske mulig kilde til heterogenitet for -196 til -174 del og rs4986790 fordi begge
P
verdier for heterogenitet test var mindre enn 0,05 i sammenligninger. Vi identifiserte at MAFs av -196 til -174 del og rs4986790 var betydelige kilder til heterogenitet (
P
= 0,008 for -196 til -174 del,
P
= 0,039 for rs4986790, henholdsvis) . Vi fant også at etnisitet var en betydelig kilde til heterogenitet for -196 til -174 (
P
= 0,036). Men genotyping metoder, tumortyper, utvalgsstørrelse og kilde av kontroller kan ikke vesentlig påvirke den opprinnelige heterogenitet.
Følsomhet Analyser og publikasjonsskjevhet
leave-one-out følsomhetsanalyse indikerte at ingen enkelt studie endret samlede ORS kvalitativt (data ikke vist). Videre gjennomførte vi også en sensitivitetsanalyse på
TLR2 Hotell og
TLR4
polymorfisme og risiko for kreft ved å utelukke alle fire studier avgang fra HWE blant kontroller [20], [35], [40 ], [42] og deres utelukkelse ikke vesentlig påvirke resultatene av meta-analyse (dominerende modellen: OR = 1.68, 95% KI: 1,00 til 2,81 for -196 til -174del, dominerende modellen: OR = 1,20, 95% KI: 1,00 til 1,44 for rs4986790, dominerende modellen. OR = 1,49, 95% KI: 1,21 til 1,83 for rs4986791)
de inverterte trakt plott (figur 2) og Begg test ble utført for å vurdere publikasjonsskjevhet , og resultatene viste ingen åpenbare tegn på asymmetri for
TLR2 Hotell og
TLR4
polymorfismer (
P
= 0,152 for -196 til -174 del;
P
= 0,505 for rs4986790;.
P
= 0,324 for rs4986791, henholdsvis)
Hvert punkt representerer en egen studie for den angitte foreningen. se, standardisert effekt.
Diskusjoner
I denne meta-analyse av 34 uavhengige publikasjoner, fant vi at tre genetiske varianter av
TLRs product: (
TLR2
-196 til -174 del,
TLR4
rs4986790 og rs4986791) var signifikant assosiert med økt risiko for generelle kreft. Videre lagdel analyse viste at risikoen virkningen av polymorfismer var mer fremtredende hos personer med noen spesielle løp eller cancertyper. Alle disse funnene antydet at polymorfismer av
TLR2 Hotell og
TLR4
kan bidra til risiko for kreft hos mennesker.
-196 til -174 del polymorfisme i
TLR2
ligger på kromosom 4 fører til en 22-bp nucleotide sletting og det har nylig blitt foreslått å gjenspeile differensial trans-aktivering av
TLR2
promoter konstruksjoner og uttrykk nivåer av
TLR2 product: [38]. Men befolkningsstudier viste at
TLR2
-196 til -174 del polymorfisme kan spille motstridende roller for risikoen for ulike typer kreft. For eksempel ble det rapportert at
TLR2
-196 til -174 del polymorfisme var assosiert med risiko for flere kreftformer, som livmorhalskreft, magekreft, brystkreft og leverkreft [21], [23] , [24], [38], [41], men ikke forbundet med andre kreftformer, inkludert blære, prostata cancer og galleblærekreft [19], [32], [40]. Og til og med den samme type av kreft, var resultatene inkonsekvent [23], [25]. Omfattende undersøke effekten av denne polymorfisme på risikoen for overordnede kreft, gjennomførte vi denne meta-analyse og funnet ut at
TLR2
-196 til -174 del polymorfisme betydelig økt risiko for kreft, støtter hypotesen om at denne SNP spiller en rolle i endret uttrykk for
TLR2 Hotell og kreftutvikling.
TLR4
genet er kartlagt på kromosom 9 og består av tre eksoner. I ekson 3, to ikke-synonyme SNPs (+ 896A /G rs4986790 og + 1196C /T rs4986791) induserer substitusjon av aminosyrer Asp299Gly og Thr399Ile hhv. Substitusjon av Asp299Gly forstyrrer den normale strukturen i den ekstracellulære region av
TLR4
, noe som kan føre til redusert ligand anerkjennelse eller protein interaksjon og redusert respons på lipopolysakkarid [57]. Følgelig kan en slik endring påvirke transporten av
TLR4
til cellemembranen og føre til en overdrevet inflammatorisk respons med alvorlig vevsødeleggelse. Resultatene fra tidligere studier om sammenhengen mellom disse to SNPs og kreftrisiko var inkonsekvent. These samlet analyse fant ikke noen signifikant sammenheng mellom de to SNPs og risikoen for prostatakreft [58] eller magekreft [59]. Men en fersk meta-analyse av 22 publikasjoner på seks utvalgte SNPs (rs1927914, rs4986790, rs4986791, rs11536889, rs1927911 og rs2149356) i
TLR4 Hotell og kreftrisiko rapportert at
TLR4
rs4986790 og rs4986791 var signifikant assosiert med øket risiko for total kreft og ble observert signifikant forhøyet risiko for magekreft for rs4986790 i en lagdeling studie [60]. Vår meta-analyse, inkludert flere studier (27 studier for rs4986790 og 14 studier for rs4986791) og flere krefttyper gitt ytterligere bevis for at disse to SNPs kan spille en rolle i utviklingen av kreft. I lagdel analyse av krefttyper, har vi funnet at effekten av rs4986790 på kreftrisiko var mer tydelig i kvinnespesifikke kreftformer og fordøyelses kreft, spesielt for magekreft. Tilsvarende er det risiko effekten av rs4986791 var også fremtredende i magekreft. Studier har vist at H.pylori aktiverer
TLR4
uttrykk i mage epitelceller og TLR4 kan tjene som en reseptor for H. pylori binding [61], [62]. Dermed potensielt funksjonelle polymorfismer av
TLR4
kan påvirke funksjonen til
TLR4 Hotell og bidra til H. pylori-assosiert kreftutvikling. . En viktig årsak til de ulike funn av tidligere utførte studier kan være utilstrekkelig studie makt for å oppdage beskjedne effekter av polymorfismer
På sikt av stratifiserte analyser av løpene, våre funn indikerer at
TLR2 Anmeldelser – 196 til -174 del hadde en signifikant sammenheng med kreftrisiko hos kaukasiere og Sør asiater, men ikke i Østasiater. Men sammenhengen mellom
TLR4
rs4986791 og kreftrisiko var betydelig i både Sør-asiater og Østasiater, men ikke i kaukasiere. Disse forskjellene kan induseres av forskjellige genetiske bakgrunner og miljøeksponering, som angitt ved differansen av mindre allel frekvens i kontrollene mellom de to populasjonene (tabell 1). For eksempel, MAF av
TLR2
-196 til -174 del i kaukasiske kontroller varierte 0,05 til 0,15, men at det i asiater var 0,12 til 0,38. Allel frekvens kan gjenspeile den naturlige seleksjonstrykk eller en balanse av andre relaterte funksjonelle genetiske varianter og /eller miljømessige eksponeringer. Vi har også søkt noen offentlige databaser, for eksempel Hapmap (https://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/) og SNPinfo (https://snpinfo.niehs.nih.gov/), og fant ut at rs4986790 var i høy koblingsulikevekt (LD) med rs4986791 i kaukasiere (r
2 = 1), men ikke data var tilgjengelig i asiater på grunn av lav allel frekvensen av disse to SNPs. I vår analyse, sammenslutninger av rs4986790 og rs4986791 med kreftrisiko var konsekvent i kaukasiere, men inkonsekvent i asiater. Disse funnene indikerer videre at effekten av genetiske varianter på kreftrisikoen kan være forskjellig mellom flere etniske grupper. Noen begrensninger og potensial skjevhet skal rettes. For det første kan undergruppene ha en forholdsvis lavere effekt basert på et lite antall studier. For det andre bør gjennomføres en mer presis analyse, dersom enkelt data var tilgjengelige, slik at for justeringen av noen co-varianter som alder, kjønn og andre miljøfaktorer. Men denne informasjonen var utilgjengelig fra de fleste studier. Tredje, ble kontrollene i de inkluderte studiene rekrutteres fra forskjellige måter, og ikke jevnt definert, noe som kan ha ført til noen skjevhet for meta-analyse. Sist, er genet-genet samhandling viktig for utvikling av komplekse sykdommer, inkludert kreft fordi enkelt genetisk variasjon kan bare ha en beskjeden effekt [63], [64]. Men de opprinnelige genotyping data for hver publikasjon var utilgjengelig, og vi kunne ikke gjennomføre gen-gen interaksjonsanalyse i denne studien.
I konklusjonen, denne meta-analysen gitt statistisk bevis for at
TLR2
og
TLR4
polymorfismer var assosiert med kreftrisiko, spesielt for magekreft. Men på grunn av begrensninger i originale studiene som inngår i meta-analyser, veldesignede prospektive studier med større prøver for å bekrefte disse funnene.
Hjelpemiddel Informasjon
Sjekkliste S1.
doi: 10,1371 /journal.pone.0082858.s001 plakater (DOC)
Figur S1.
doi: 10,1371 /journal.pone.0082858.s002 plakater (DOC)
