Forskere ved Rice University og University of Texas MDAnderson Cancer Center har blitt profilert protein pathwaysfound å være karakteristisk for leukemipasienter med spesielle varianter av sykdommen. Deres forskning involvert etableringen av en ny computationalapproach å identifisere komplekse nettverk i protein signalering. Theyreported sitt arbeid denne måneden i tidsskriftet proteomikk. Med sin nye metode, Rice bioingeniør Amina Qutub, MD Andersonclinician og forsker Steven Kornblau og Rice utdannet studentHeather York analysert mer enn et tiår verdt av data. Theyidentified mønstre i uttrykket av 203 proteiner studert incells av akutt myelogen leukemi (AML) pasienter og fant nesten 700 protein parene (fra amongthousands muligheter) innblandet i slike nettverk.
Målet er å finjustere terapi for pasienter, sier Qutub. Hvis it’spossible å vite protein signalveier som er av særlig typesof leukemi, sa hun, så stoffene kan være funnet – eller utformet – totarget sykdommen ved å blokkere disse veiene. «Leukemi er ikke bare en sykdom,» sier Qutub, som deltok Riceas en lavere og er nå assisterende professor ofbioengineering basert på Rice BioScience Forskning Collaborative. «Det er mange, mange sykdommer samlet i én kategori. Du kan ikke bruke asledgehammer tilnærming til behandle det, men det er det clinicianshave gjort. » «En stjerneskrutrekker gjør stor hvis du har et kors onyour skruehodet,» sa Kornblau.
«Det fungerer ikke veldig godt ifyou’ve fikk et spor. Selskapene har medisiner som kan fungere gangbustersin en liten brøkdel av pasientene, men hvis du studerer en largeaggregate, ser det ikke ut som en veldig aktiv agent. Ideelt hvis itworks i fem prosent av pasientene, og du kan plukke dem ut fremover oftime, legger du dem på høyre narkotika og spare de andre 95 percentfrom få et stoff som ikke kommer til å hjelpe dem. » Det er ikke uvanlig for leukemi pasienter å gå i remisjon, Qutubsaid, men de fleste har fått tilbakefall innen to år. «Vi prøver tofigure ut hva som er så annerledes med disse pasientene, og om wecan forbedre behandlingen.
Den eneste måten vi vet å gjøre det på er tofigure ut proteinet signatur.» Proteiner er arbeidshester av cellen. Laget fra blueprintsstored i DNA, passerer de kjemiske signaler fra en til en annen withinstructions på omtrent hver aktivitet en celle er i stand til. Butwhen deres grunnleggende koding er kryptert, kan de like gjerne causea celle å ødelegge seg selv. Qutub lignes protein signalveier til bytrafikk.
«youmight ta tog, kjøre bil, gå eller ta en sykkel, buteventually du ville komme til din posisjon,» sa hun. «I kreftpasienter, protein veier synes å følge mønstre I normalcells, er det dominerende trasé, og mens du kan ha thesame veier i kreftceller, kan de også ha alternateroutes -.. Og ta dem i varierende grad» Spesifikke ruter proteiner bruke til å passere signaler kan være nøkkelen todetermining sin type, så det var verdt å undersøke en treasuretrove av data som hadde blitt samlet fra MD Anderson pasienter, sa Qutub. Prosjektet startet med et tilfeldig møte med Qutub og Kornblau på aconference i Colorado på hypoksi.
«Steve sa:« Du workingwith matematisk modellering av hypoksisk respons. Jeg har en patientset jeg tror du kan være interessert i. « Det er slik det startet, federasjon tok oss ned en helt annen vei, ved hjelp av maskin learningalgorithms og statistiske teknikker som ikke hadde vært en del av mycore forskning, men har nå blitt en integrert del av både dette prosjektet andother forskning i laboratoriet, «sa Qutub. Verdens helseorganisasjon hadde kategorisert AML pasienter bycertain celle fenotyper, Qutub sa, «men svært lite hadde vært doneat proteinnivået. Våre kliniske samarbeidspartnere hadde startedgenetic og proteomikk studier en stund tilbake og identifisert recurrentpatterns protein uttrykk, noen som var assosiert withrecurrent kromosomforandringer som «inv (16), «inversjon ofchromosome 16, eller» t (8; 21), «. som er den transponerte av de 8 og 21chromosomes» De finnes i om lag 15 prosent av pasientene withAML, sa hun.
«Pasienter med disse to kromosomforandringer svare mer favorablyto dagens AML terapi,» Kornblau sa, «og genene fra hver ofthese genetiske avvik er involvert i samme transcriptionfactor kompleks, noe som skaper en mekanistisk kobling. Men til tross for thismechanistic link, de skiller seg i noen kliniske funksjoner andoutcome. » Kornblau data var nøyaktig hva Qutub og hennes gruppe nødvendig. Theytargeted inv (16) og t (8; 21) for å lære hva protein trasé werecommon til begge disse cytogenetiske kategorier, hva kan explaintheir økt respons og hvilke endringer som er unik for eachthat kan forklare deres kliniske forskjeller. Fra massen ofdata – mer enn 20.000 mulige protein parene – de fant that678 parvis i forbindelse med inv (16) og t (8; 21) ble significantlydifferent sammenlignet med normale celler. «Det er noen genetiske markører som er definitivt forbundet witha prognose av leukemi,» sa Qutub.
«Og andre ting kan causeleukemia – akutt myelogen spesielt -. Kanskje chemotherapyitself Måten kreftpasienter blir behandlet kan være causingmutations og i sin tur utløser leukemi respons.» Med sin analysemetode prøvd og testet, Qutub og hennes teamcan nå statistisk gruppe pasienter som har particularprotein trasé etter alder, kjønn, behandlinger og andre kriterier, andthen ta en nærmere titt på protein signalveier i beinmarg-avledet stamceller, en hovedmistenkt hos pasienter som opplever tilbakefall selv etter tiår ofremission. «Vi tror at noe må være unikt med stamceller,» sa hun. Hovedproblemet med alle kreft, inkludert leukemi, er theirplasticity, sa hun.
«Kreft har flere måter å komme til thesame destinasjon. Du prøver et rusmiddel, og kreft er det som skjer tocircumvent deg og gå en annen måte. Det vi prøver å si er:» Her er alle mulige måter, «så vi kan begynne å målrette theintersections. » Andre Referanser Siteringer.
Jeg er en ekspert fra dimmableledlight-bulbs.com, mens vi gir kvalitetsprodukt, for eksempel LED Par Lampe Produsent, LED Spot Light Bulb, LED Hus lyspærer, og mer.
