Abstract
Den vanlige -652 6N del variant i
CASP8
promoter (rs3834129) har blitt beskrevet som en antatt lav pene risikofaktor for ulike krefttyper. Spesielt noen studier antydet at den slettede allelet (del) ble omvendt assosiert med CRC risiko mens andre analyser mislyktes i å bekrefte dette. Derfor, for å bedre forstå hvilken rolle denne varianten i risikoen for å utvikle CRC, utførte vi en multi-sentriske case-control studie. I studien ble variant -652 6N del genotypet i totalt 6,733 CRC saker og 7.576 kontroller rekruttert av seks forskjellige sentre i Spania, Italia, USA, England, Tsjekkia og Nederland samarbeider til det internasjonale konsortiet overbevisende (kolorektal kreft genetikk). Vår analyse indikerte at rs3834129 ikke var assosiert med CRC risiko i hele datasettet. Men den del allel var underrepresentert i ett sett av tilfellene med en familie historie av CRC (per allel modell OR = 0,79, 95% CI = 0,69 til 0,90) tyder dette allelet kan være en beskyttende faktor mot familiær CRC. Siden dette multi-sentriske case-control studie ble utført på en svært stor utvalgsstørrelse, det ga robust avklaring av effekten av rs3834129 på risikoen for å utvikle CRC i kaukasiere
Citation. Pardini B, Verderio P, Pizzamiglio S, Nici C, Maiorana MV, Naccarati A, et al. (2014) Sammenheng mellom CASP8 -652 6N Del Polymorphism (rs3834129) og tykktarmskreft risiko: Resultater fra en Multi-Centric Study. PLoS ONE 9 (1): e85538. doi: 10,1371 /journal.pone.0085538
Redaktør: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, USA
mottatt: 27 september 2013; Godkjent: 04.12.2013; Publisert: 21 januar 2014
Copyright: © 2014 Pardini et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. For alle kohorter: Dette arbeidet ble støttet av COST Handling BM1206. Spansk kohort: Forfatterne er oppriktig takknemlig til alle pasienter som deltok i denne studien som ble rekruttert i 25 (EPICOLON 1) og 14 (EPICOLON 2) spansk sykehus som en del av EPICOLON prosjektet. Forfatterne er også i gjeld til Genomics Enhet for Institut d’Investigacions Biomèdiques august Pi i Sunyer for teknisk hjelp. Arbeidet ble utført (delvis) ved Esther Koplowitz Centre, Barcelona. SCB er støttet av en kontrakt fra Fondo de INVESTIGACION Sanitaria (CP 03-0070 til SCB). Nettbaserte Biomedical Research Centre for Lever- og Digestive Diseases og Centro de INVESTIGACION BIOMEDICA en Red de Enfermedades Raras er finansiert av Instituto de Salud Carlos III. Dette arbeidet ble støttet med tilskudd fra Fondo de INVESTIGACION Sanitaria /FEDER (08/0024, 08/1276, PS09 /02368, 11/00219, 11/00681), Instituto de Salud Carlos III (Acción Transversal de kreft), Xunta de Galicia (07PXIB9101209PR), Ministerio de Ciencia e Innovación (SAF2010-19273), Asociación Española contra el kreft (Fundación Científica y Junta de Barcelona), Fundació Olga Torres (SCB og CRP), FP7 CHIBCHA Consortium (SCB og A. Carracedo). Italiensk kohort: Forfatterne takker alle personer som ble enige om å delta i studien. Forfatterne også takke personalet på Tissue Bank of Fondazione Istituto di Ricovero e Cura en carattere Scientifico Istituto dei Tumori for prøvetaking og alle patologer for deres bidrag og samarbeid. American kohort: Kentucky Colon Cancer Genetisk epidemiologi Study er støttet av National Institutes of Health gi R01CA136726 til LL. Norsk kohort: grunnfinansiering av Wellcome Trust Centre for Human Genetics ble gitt av Wellcome Trust (090532 /Z /09 /Z). Tsjekkisk kohort: Grant byrå i Den tsjekkiske republikk (GACR) [CZ: GACR: GA P304 /10/1286 og P304 /12/1585] og ved Prvouk-P27 /LF1 /1 fra Kunnskapsdepartementet, ungdoms- og Sport, Tsjekkia (First medisinske fakultet, Charles University, Praha, Tsjekkia som mottaker). Dutch kohort: Nederlandsk Cancer Society, gi KWF-UL-2010-4656. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser. PP er en akademisk redaktør i PLoS ONE, men dette endrer ikke forfatternes tilslutning til alle Journal politikk på deling av data og materialer.
Innledning
Karsinogenese er preget av endring av normale prosesser utpekt til å opprettholde genomet stabilitet. Apoptose er den mest fremtredende mekanismen av programmert celle død, ansvarlig for sikker fjerning av skadede celler før genom avvik kan replikeres og videre spredning. Caspase enzymer er viktig for reguleringen og gjennomføring av de fleste av de apoptotiske celledødsveier. Spesielt caspase-8 (
CASP8
) er en avgjørende spiller ved regulering av apoptose av T-lymfocytter gjennom aktiveringen-indusert celle-død [1] og, samtidig, er en fysiologisk homeostase av T-lymfocytter et grunnleggende aspekt i den immun-overvåkning av cancerceller.
A-polymorfismen bestående av sletting av seks nukleotider i promoterregionen av
CASP8
, og betegnet som -652 6N del (rs3834129), har vært beskrevet å være svært vanlig i flere populasjoner [2]. Dette seks-nukleotid-delesjon ble vist å ødelegge en stimulerende protein 1 bindende element i den promoter regulatoriske område som fører til en redusert
CASP8
transkripsjon og til slutt en redusert apoptose av antitumor T-lymfocytter [2]. Dermed rs3834129 ble antatt å påvirke antitumor immunrespons i løpet av kreft initiering eller progresjon, og dermed regnes som en genetisk faktor potensielt assosiert med kreftrisiko. I lys av dette, ble det polymorfisme testet i en case-control studie og del allelet ble vist å være assosiert med en beskyttende effekt på flere typer kreft, inkludert CRC, i den kinesiske befolkningen [2]. To påfølgende studier undersøkte videre effekten av rs3834129 i CRC testing saker og kontroll av blandet og kaukasisk etnisitet, men klarte ikke å bekrefte foreningen [3], [4]. En meta-analyse av disse tre studiene indikerte at under en dominerende modellen ble del allelet assosiert med en betydelig redusert risiko for CRC med odds ratio (OR) = 0,89, 95% konfidensintervall (KI) = 0,83 til 0,96 [5 ]. Men en senere studie ikke inkludert i ovennevnte meta-analyse, igjen ikke klarte å avdekke en sammenheng mellom rs3834129 og CRC risiko i kinesisk [6].
Derfor, i denne studien vi har søkt etter mer robust bevis, enten rs3834129 kan være en CRC risikofaktor i en case-control studie basert på seks kohorter rekruttert i sentre i Spania, Italia, USA, England, Tsjekkia og Nederland og samarbeider innenfor overbevisende (kolorektal kreft genetikk) konsortium [7 ].
Materialer og metoder
Case-control kohorter
den overbevisende (kolorektal kreft genetikk) konsortium ble etablert i 2007 med hovedmål å studere genetisk mottakelighet for CRC i et samarbeids måte. Konsortiet bestod i over 20 forskningsmiljøer i Europa, Australia, Amerika, Kina og Japan arbeider aktivt med CRC genetikk og med kompetanse som omfatter genetisk epidemiologi, statistiske genetikk, genetisk kartlegging, biologi, molekylær genetikk, patologi og diagnostisering og den kliniske behandlingen av CRC [8]. Opprettholde sine hovedmål, har konsortiet nå utviklet seg til en mer strukturert initiativ kalt «Samarbeid Studier på Arvet mottakelighet for tykktarmskreft» (EuCOLONGENE – https://www.eucolongene.eu). I denne studien ble rs3834129 testet som genetisk risikofaktor for CRC i seks kohorter bestående 6,733 saker og 7.576 kontroller.
1. Spansk kohort. Saker og kontroller ble rekruttert gjennom EPICOLON Consortium som er basert på en prospektiv, multisenter og populasjonsbasert epidemiologi kartlegging av forekomst og funksjoner av CRC i den spanske befolkningen [9]. Kort fortalt saker ble valgt som pasienter med
de novo
histologisk bekreftet diagnose av tykk- og adenokarsinom. Eksklusjonskriterier var arvelig CRC former, for eksempel arvelig non-polypose tykktarmskreft (HNPCC) og familiær adenomatøs polypose (FAP) og en personlig historie med inflammatorisk tarmsykdom. Kontrollene var fra den spanske National DNA bank og ble bekreftet ikke å ha kreft eller tidligere svulst og ingen familie historie av CRC. Alle saker og kontroller var av kaukasisk etnisitet. 2. italiensk kohort. Saker og kontroller ble rekruttert som beskrevet av [10]. Kort fortalt tilfellene var påfølgende personer berørt med CRC som gjennomgikk kirurgi ved Fondazione IRCCS Istituto Nazionale Tumori i Milano (INT). Kontrollene var blodgivere rekruttert gjennom immunhematologiområdet og transfusjonsmedisin Service of INT Associazione Volontari Italiani Sangue Comunale i Milano. Alle saker og kontroller var av kaukasisk etnisitet. 3. amerikanske kohort (Kentucky, USA). Saker og kontroller ble rekruttert som nylig beskrevet [11]. Kort fortalt ble hendelsen tykktarm kreft tilfeller identifisert gjennom Kentucky Kreftregisteret. Befolknings kontroller ble rekruttert via tilfeldig oppringing etter følgende kriterier: å være minst 30 år eller eldre og fri for personlige historie av kreft enn hudkreft. For begge tilfeller og kontroller, eksklusjonskriteriene var inflammatoriske tarmsykdommer, FAP og HNPCC. Flertallet av deltakerne var kaukasiere (93,7%). 4. Norsk kohort. Tilfeller (CRC eller vesentlige adenomer) og kontroller ble rekruttert gjennom Colorectal Tumor Gene Identification (Corgi) konsortium som tidligere beskrevet [12]. Kort fortalt tilfeller hadde minst en første-graders slektning rammet av CRC. Kontrollene var ektefeller eller partnere upåvirket av kreft og uten en personlig og familiehistorie med tykktarms neoplasi. En enkelt proband fra hver familie ble inkludert i denne studien. Arvelige CRC former som, HNPCC /Lynch syndrom eller bi-allel MutYH mutasjonsbærere ble ekskludert. Alle saker og kontroller var av kaukasisk etnisitet. 5. Tsjekkia kohort. Saker og kontroller ble rekruttert som tidligere beskrevet [13]. Kort fortalt alle tilfeller hadde histologisk bekreftet CRC og ble fortløpende konstatert gjennom onkologiske avdelinger. Kontrollene var enten sykehusbaserte frivillige med negative koloskopi resultater eller blodgivere samlet inn fra blodgiver sentrum i Praha. Alle saker og kontroller var av kaukasisk etnisitet. 6. nederlandsk Cohort. Saker og kontroller ble rekruttert som tidligere beskrevet [14]. Kort fortalt ble de fleste tilfellene rekruttert gjennom klinisk genetikk avdelingen. Alle saker ble diagnostisert med CRC og hadde tidlig debut og /eller positiv familiehistorie for CRC. Kjente dominerende polypose syndrom, ble HNPCC /Lynch syndrom eller bi-allel MutYH mutasjonsbærere utelukkes. En enkelt proband fra hver familie ble inkludert i denne studien. Kontrollene var friske blodgivere fra sørvest-regionen i Nederland. Alle saker og kontroller var av kaukasisk etnisitet.
For hver årsklasse, er antall tilfeller og kontroller inkludert i studien og deres kjønn og alder data vist i tabell 1. Alle personer som deltar i denne studien undertegnet et informert samtykke til bruk av deres biologiske prøver for forskningsformål. Denne studien ble godkjent av følgende institusjoner: Klinisk forskningsetiske og forsknings komiteer Hospital Clinic i Barcelon (spansk kohort); Etikkutvalget av Fondazione IRCCS Istituto Nazionale dei Tumori, Milan, Italia (italiensk kohort); Institutional Review Boards ved University of Kentucky, Lexington, Case Western Reserve University /universitetssykehusene i Cleveland og University of Southern California, USA (American kohort); Southampton og South-West Hampshire forskningsetiske komité (engelsk kohort); Etikkutvalget ved Institutt for eksperimentell medisin, og etikkomiteen ved Institutt for klinisk og eksperimentell medisin og Thomayer Hospital, Praha, Tsjekkia (Tsjekkia kohort); Medisinsk Etisk komité i Leiden University Medical Center, Nederland (protokoll P01.019) (nederlandsk kohort).
Genotyping
genomisk DNA ble isolert fra perifert blod lymfocytter ved hjelp standardprosedyrer. DNA-prøver fra kasser og kontroller var tilfeldig delmengde i 96-brønners plater. Genotyping av rs3834129 ble utført ved hjelp av Taqman assay (Life Technologies /Applied Biosystems, USA) i spansk, italiensk, USA og nederlandske kohorter og bruk av Kaspar analysen (K-biovitenskap, UK) i engelsk og Tsjekkia kohorter . Duplicate prøver (5%), templat-kontroller i hver plate, og Hardy-Weinberg likevekt test ble brukt som kvalitetskontrolltester.
Statistisk analyse
Innenfor hver årsklasse, logistikk regresjonsanalyse [ ,,,0],15] ble utført for å sammenligne genotyper hyppigheten av
CASP8
rs3834129 i saker og kontroller. Vi anslo odds ratio (OR) og deres relative 95% konfidensintervall (CI) ved å vurdere i hver logistiske modellen alder og kjønn som justerings kovariater. Fire forskjellige modeller ( «tre genotyper», dominerende, recessive og per allel) ble utført for hver årsklasse separert og vurderer alle individer sammen. I dette tilfellet ble den variable med angivelse av kullet og kryssledd mellom denne variabelen og genotype som inngår i den logistisk modell i tillegg til den variable genotype, alder og kjønn. Avvikene av genotypefrekvensene i kontrollene fra de forventet under Hardy-Weinberg likevekt (HWE) ble vurdert innenfor hver årsklasse samt ved å vurdere alle personer som bruker Pearsons kji-kvadrat test. Alle statistiske analyser ble utført med SAS programvare. (Versjon 9.2, SAS Institute Inc. Cary, NC)
Diskusjon
I denne studien har vi analysert rs3834129 genotypefordeling
Resultater og i en total av 6,733 saker og 7.576 kontroller fra seks kohorter, alle kaukasisk etnisitet. Genotypen distribusjoner i kontrollene var i samsvar med HWE i alle kohortene, og over dem frekvensene til del allelet var lik i kontroller (range: 0,45 til 0,52). Vi utførte en samlet analyse for å sammenligne genotyper hyppigheten av
CASP8
rs3834129 i tilfeller med CRC og hos friske kontroller. Som i de nederlandske kontroller data på kjønn og /eller alder manglet (tabell 1), ble denne gruppen ekskludert fra den totale analysen og totalt 6,148 tilfeller og 7,217 kontroller ble vurdert. Alle årskull var basert på hendelsen /påfølgende tilfeller bortsett fra den engelske kohort som var basert på familiære saker. Derfor også utførte vi en ekstra ordnet analyse utenom norsk kohort og testing totalt 4,572 tilfeller og 6,450 kontroller. I begge disse analysene samspillet sikt mellom kohort og genotype var ikke statistisk signifikant og også ORS avledet fra de forskjellige gjennomført genetiske modellene var ikke statistisk signifikant (data ikke vist).
Videre vurderes vi effekten av rs3834129 på CRC risiko innenfor hver kohort. De ELLER estimatene ble justert for kjønn og alder med det eneste unntaket av nederlandsk årsklasse, er resultatene i tabell 2. ORS av de ulike gjennomførte modeller (tre genotyper, dominerende, recessive og pr-allelet modell) i stor grad bekreftet resultatene av overordnet analyse er ikke statistisk signifikant i hver årsklasse med det eneste unntaket av den engelske. ORS i familiære kasus-kontrollprøver fra England var statistisk signifikant (per allel modell OR = 0,79, 95% CI = 0,69 til 0,90) indikerer del allel kan være en beskyttende faktor mot familiær kreft. Dette resultatet kan forklares med tanke på at de familiære tilfeller, med hensyn til hendelsen /følgende tilfeller kan være en bedre kilde til krets testing fordi de er forventet å bli beriket av genetiske risikofaktorer, eller omvendt, berøvet med faktorer med en beskyttende virkning.
så vidt vi vet, er dette den største analysen teste sammenhengen mellom rs3834129 og CRC risiko i kaukasiere og våre data gi sterkere og entydig bevis så langt at rs3834129 er ikke en CRC risikofaktor i denne etnisk gruppe. Mens vår analyse var pågående, andre studier dukket opp, viser inkonsistente resultater. På den ene siden, var mangel på foreningen funnet i case-kontroll analyser basert på greske og kinesiske populasjoner [16], [17]; på den andre siden, en meta-analyse basert på tre studier av mix etnisitet, og en egen tilleggs studie på kinesisk viste en moderat beskyttende effekt av del allel [18], [19]. Våre funn i kaukasiske, med hensyn til den antatte beskyttende effekt påvist i kinesisk-som må bekreftes av ytterligere større studier-, kan forklares med økt risiko-assosiert varianter i kobling med rs3834129 og med ulik frekvens i ulike etniske genetiske bakgrunn. Nærmere bestemt del av allelet rs3834129 har en 0,48 kontroll frekvens i vår studie mens vi utledet en frekvens på 0,20 til 0,25 i kinesiske kontroller [2], [6], [16], [18].
I konklusjon, mens videre studier er nødvendig for å bekrefte den beskyttende effekten av den del allel vi observert i familiære CRC tilfeller med familiens historie, gir vår studie robust bevis indikerer rs3834129 er ikke en risikofaktor for CRC i kaukasiere.
Takk til
medlemmer av EPICOLON Consortium (Gastrointestinal Oncology Group av den spanske gastroenterologisk Association) er: Hospital 12 de Octubre, Madrid: Juan Diego Morillas (lokal koordinator), Raquel Muñoz, Marisa Manzano, Francisco Colina, Jose Díaz , Carolina Ibarrola, Guadalupe López, Alberto Ibáñez; Hospital Clinic, Barcelona: Antoni Castells (lokal koordinator), Virginia Piñol, Sergi Castellví-Bel, Francesc Balaguer, Victoria Gonzalo, Teresa Ocaña, María Dolores Giraldez, Maria Pellisé, Anna Serradesanferm, Leticia Moreira, Miriam Cuatrecasas, Josep M. Piqué; Hospital Clínico Universitario, Zaragoza: Ángel Lanas (lokal koordinator), Javier Alcedo, Javier Ortego; Sykehus Cristal-Pinor, Complexo hospitalario de Ourense: Joaquin Cubiella (lokal koordinator), M
en Soledad Díez, Mercedes Salgado, Eloy Sánchez, Mariano Vega; Parc de Salut Mar, Barcelona: Montserrat Andreu (lokal koordinator), Anna Abuli, Xavier Bessa, Mar Iglesias, Agustín Seoane, Felipe Bory, Gemma Navarro, Beatriz Bellosillo; Josep M
en Dedeu, Cristina Álvarez, Marc Puigvehí; Hospital San Eloy, Baracaldo og sykehus Donostia, CIBERehd, Universitetet i Baskerland, San Sebastián: Luis Bujanda (lokal koordinator) Ángel Cosme, Inés Gil, Mikel Larzabal, Carlos Placer, María del Mar Ramírez, Elisabeth Hijona, Jose M. Enríquez- Navascués, Jose L. Elosegui; Hospital Generelt Universitario de Alicante: Artemio Payá (EPICOLON jeg lokal koordinator), Rodrigo Jover (EPICOLON II lokal koordinator), Cristina Alenda, Laura Sempere, Nuria Acame, Estefanía Rojas, Lucía Pérez-Carbonell; Hospital General de Granollers: Joaquim Rigau (lokal koordinator), Ángel Serrano, Anna Giménez; Hospital General de Vic: Joan Saló (lokal koordinator), Eduard Batiste-Alentorn, Josefina Autonell, Ramon Barniol; Hospital Generelt Universitario de Guadalajara og Fundación para la Formación e INVESTIGACION Sanitarias Murcia: Ana María García (lokal koordinator), Fernando Carballo, Antonio Bienvenido, Eduardo Sanz, Fernando González, Jaime Sánchez, Akiko Ono; Hospital Generelt Universitario de Valencia: Mercedes Latorre (lokal koordinator), Enrique Medina, Jaime Cuquerella, Pilar Canelles, Miguel Martorell, José Ángel García, Francisco Quiles, Elisa Orti; CHUVI-Hospital Meixoeiro, Vigo: EPICOLON I: Juan Clofent (lokal koordinator), Jaime Seoane, Antoni Tardío, Eugenia Sanchez. EPICOLON II M
en Luisa de Castro (lokal koordinator), Antoni Tardío, Juan Clofent, Vicent Hernández; Sykehus universitari tyskerne Trias Pujol, Badalona og Seksjon for fordøyelsessykdommer og ernæring, University of Illinois i Chicago, IL, USA: Xavier Llor (lokal koordinator), Rosa M. Xicola, Marta Piñol, Mercè Rosinach, Anna Roca, Elisenda Pons, José M. Hernández, Miquel A. Gassull; Hospital Universitari Mutua de Terrassa: Fernando Fernández-Bañares (lokal koordinator), Josep M. Viver, Antonio Salas, Jorge Espinós, Montserrat Forné, Maria Esteve; Hospital Universitari Arnau de Vilanova, Lleida: Josep M. René (lokal koordinator), Carmen Piñol, Juan Buenestado, Joan Viñas; Hospital Universitario de Canarias: Enrique Quintero (lokal koordinator), David Nicolás, Adolfo Parra, Antonio Martín; Hospital Universitario La Fe, Valencia: Lidia Argüello (lokal koordinator), Vicente Pons, Virginia Pertejo, Teresa Sala; Hospital Sant Pau, Barcelona: Dolors Gonzalez (lokal koordinator) Eva Roman, Teresa Ramon, Maria Poca, M
a Mar Concepción, Marta Martin, Lourdes Pétriz; Hospital Xeral Cies, Vigo: Daniel Martinez (lokal koordinator); Fundacion Publica Galega de Medicina Xenomica (FPGMX), CIBERER, Genomisk medisin Gruppe-universitetet i Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Galicia, Spania: Ángel Carracedo (lokal koordinator), Clara Ruiz-Ponte, Ceres Fernández-Rozadilla, M
a Magdalena Castro; Hospital Universitario Central de Asturias: Sabino Riestra (lokal koordinator), Luis Rodrigo; Hospital de Galdácano, Vizcaya: Javier Fernández (lokal koordinator), Jose Luis Cabriada; Fundación Hospital de Calahorra (La Rioja) La Rioja: Luis Carreño (lokal koordinator), Susana Oquiñena, Federico Bolado; Hospital Royo Villanova, Zaragoza: Elena Peña (lokal koordinator), José Manuel Blas, Gloria Cena, Juan José Sebastián; Hospital Universitario Reina Sofía, Córdoba: Antonio Naranjo (lokal koordinator)
.
