Abstract
I de siste fire årene, Genome-Wide Association Studies (GWAS) har identifisert seksten lav penetrans polymorfismer på fjorten forskjellige loci assosiert med tykk- og endetarmskreft (CRC). På grunn av den lave risikoen er tillagt etter kjente vanlige varianter, de fleste av den brede forstand arvbarhet 35% beregnet av tvillingstudier er uforklart. Nylig vår gruppe utført en case-control studie for åtte enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i 4 CRC gener. Den nåværende undersøkelsen er en oppfølging av den undersøkelsen. Vi har genotypede seks SNPs som viste en positiv sammenheng, og gjennomførte en meta-analyse basert på ytterligere åtte studier som omfatter totalt mer enn 8000 tilfeller og 6000 kontroller. Den estimerte recessive odds ratio for en av SNPs, rs3219489 (MUTYH Q338H), redusert fra 1,52 i den opprinnelige svenske studien, til 1,18 i den svenske replikering, og til 1,08 i den første meta-analyse. Siden den tilsvarende oppsummering sannsynlighetsverdi var 0,06, bestemte vi oss for å hente tilleggsinformasjon for denne polymorfisme. Innlemmelsen av seks videre studier resulterte i rundt 13 000 tilfeller og 13000 kontroller. Den nylig oppdaterte OR var 1,03. Resultatene fra foreliggende store, multisenterstudie illustrere muligheten for avtagende effektstørrelser med økende prøver størrelser. Fenotypiske heterogenitet, differensial miljømessige eksponeringer, og befolkningen bestemt koblingsulikevekt mønstre kan forklare den observerte forskjellen av genetiske effekter mellom Sverige og de andre undersøkte kohorter
Citation. Picelli S, Lorenzo Bermejo J, Chang-Claude J, Hoffmeister M, Fernández-Rozadilla C, Carracedo A, et al. (2013) meta-analyse av Mismatch Reparasjon Polymorfisme innen Cogent Consortium for tykktarmskreft Følsomhet. PLoS ONE 8 (9): e72091. doi: 10,1371 /journal.pone.0072091
Redaktør: Nathan A. Ellis, University of Illinois i Chicago, USA
mottatt: 10 januar 2013; Godkjent: 06.07.2013; Publisert: 06.09.2013
Copyright: © 2013 Picelli et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Forfatterne er takknemlige til: den spanske National Genotyping Senter (CEGEN-ISCIII) -USC og UPF noder, samt Institutional Tumor Bank of Fondazione IRCCS Istituto Nazionale dei Tumori, Milano, Italia. Arbeidet ble utført (delvis) ved Esther Koplowitz Centre, Barcelona. Denne studien ble støttet av Instituto de Salud Carlos III, spansk Helsedepartementet, (tilskudd FIS PI08-1635 og PS09-1037, VM); Cancer Research UK Programme Grant (C348 /A12076) og et Senter Grant fra CORE Charity (MD); CZ: GA CR: GAP304 /10/1286 og CZ: GA CR: GA310 /07/1430 (PV); Hunter Medical Research Institute forskningsstipend og Prioritet Research Centre for informasjon basert medisin (RS); German Research Council, tyske føderale departementet for forskning og utdanning (HB, HV); Baden Württemberg departementet for forskning, vitenskap og kunst (HB); Fondo de INVESTIGACION Sanitaria /FEDER (08/0024, 08/1276, PS09 /02368, 11/00219, 11/00681); Instituto de Salud Carlos III (Acción Transversal de kreft), Xunta de Galicia (RHI07 /04 og 08CSA005208PR); Ministerio de Ciencia e Innovación (SAF2010-19273); Asociación Española contra el kreft (Fundación Científica y Junta de Barcelona); Fundació Olga Torres (CRP), og FP7 CHIBCHA Consortium (AC og SCB); Fondo de INVESTIGACION Sanitaria (CP 03-0070 til SCB og PS09 /02 368 til CFR). CIBERehd og CIBERER er finansiert av Instituto de Salud Carlos III. JLB er delvis støttet av en bevilgning på Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, SFB /TRR77, prosjekt Z2). LL er støttet av et stipend fra National Cancer Institute R01 CA136726. SB, JH, WVS og CS ble støttet av den tyske departementet for utdanning og forskning gjennom tyske nasjonal Genome Research Network (NGFNplus) Colon Cancer Network (CCN). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
i de siste årene med lav risiko vanlige alleler har fått økende oppmerksomhet i jakten på «the missing arvbarhet» i tykk- og endetarmskreft (CRC). Det gjelder den delen av arvbarhet som ikke kan forklares av mutasjoner i allerede kjente høyrisikogener, men bør ifølge tvillingstudier, står for om lag 35% [1]. Kjente høy penetrans germline mutasjoner i CRC gener bidrar til mindre enn 6% av de observerte tilfellene [2]. Derfor mye av den gjenværende arvet variasjon i genetisk mottakelighet skyldes trolig flere med lav penetrans varianter, både vanlige og sjeldne.
Til dato seksten vanligste variantene har blitt identifisert gjennom store multisenter genom-wide assosiasjonsstudier (GWAS) [3]. Tatt sammen, men de bare forklare en liten andel av familiær CRC tilfeller. Selv om risikoen knyttet til hver av disse variantene er beskjeden, bidrar de til sykdomsbyrde på grunn av sin høye frekvens i befolkningen og muligheten for å opptre på konsert med hverandre, noe som kan øke den enkeltes risiko for å utvikle CRC [4].
på bakgrunn av dette for noen år siden prøvde vi å vurdere rollen til åtte SNPs i fire allerede kjente CRC gener (
APC
,
MLH1
,
MSH6 Hotell og
MUTYH
) gjennom en case-control forening studie i den svenske befolkningen [5]. Disse 8 SNP’er tidligere var blitt studert, men deres patogenitet var ukjent, og de ble antatt å utgjøre polymorfismer. I vår første studien ble oppdaget flere positive assosiasjoner, men på grunn av begrenset utvalgsstørrelsen (1785 tilfeller og 1722 kontroller) [5], resultatene som trengs for å få den godkjent i en oppfølgingsstudie.
I denne studien var et initiativ fra den tvingende konsortiet [4], [6], hvor forskjellige grupper tilbudt å forlenge den genotyping til andre ikke-svenske kullene for SNP’er som viser statistisk signifikant sammenheng i det minste en analyse av den opprinnelige studien. Dette begrenset analysen til seks av de opprinnelige åtte SNPs.
Materialer og metoder
Etikk uttalelse
Innsamling av blodprøver og kliniske opplysninger fra pasienter og kontroller ble oppnådd med informert samtykke i samsvar med prinsippene i Helsinkideklarasjonen. Alle deltakerne ga skriftlig informert samtykke til å delta i studien. Studien ble gjennomført i henhold til svensk lov om etisk tillatelse (2003: 460) og godkjent av Stockholm regional forskningsetisk komité (Dnr 2002: 489).
Mutation screening
Seks SNPs i fire forskjellige CRC gener ble inkludert i analysen: rs459552: T A (
APC
D1822V), rs1799977: A G (
MLH1
I219V), rs1800932: A G (
MSH6
P92P), rs1800935: T C (
MSH6
D180D), rs3219484: G A (
MUTYH
V22M) og rs3219489: G C (
MUTYH
Q338H).
MUTYH
Q338H tilsvarer Q324H i vår første studien [5]. SNP nomenklatur ble endret for å møte Human Genome Variasjon Samfunnets (HGVs) retningslinjer, som anbefaler bruk av en referansesekvens som representerer den største teoretisk kjent karakterutskrift. For
MUTYH
dette tilsvarer NM_001128425.1 og NP_001121897.1 for mRNA og protein, henholdsvis [7], [8], [9].
Emner
Detaljer når det gjelder antall saker og kontroller i alle fjorten studier er oppsummert i tabell S1. En SNP, rs459552 (
APC
D1822V), ble genotypet i syv studier, for totalt 8654 tilfeller og 7731 kontroller. Fire SNPs, rs1799977 (
MLH1
I219V), rs1800932 (
MSH6
P92P), rs1800935 (
MSH6
D180D) og rs3219484 (
MUTYH
V22M) ble genotypet i 8 studier for totalt 8308 tilfeller og 7434 kontroller. SNP med rs nummer 3219489 (
MUTYH
Q338H) ble genotypet i 13 kohorter for totalt 12902 tilfeller og 14602 kontroller.
For alle fagene genomisk DNA ble ekstrahert fra perifert blod ved standard prosedyrer. Ytterligere informasjon om lokalisering av svulsten, alder ved diagnose, kjønn og etnisitet ble hentet når det er mulig. Ut av 5770 kontroller med etnisitet informasjon, 5647 var av kaukasisk opprinnelse, resten blir det meste African American.
Genotyping
I studie 1, 5, 6, 7, 8, 9 og 10 SNPs ble genotypet med TaqMan SNP genotyping analyse (Applied Biosystems, Foster City, California). Genotyping i studie 2 og 12 (bare kontrollene) ble utført ved hjelp av Kaspar kjemien i K-Bioscience (Hoddesdon, Herts, UK) (https://www.kbioscience.co.uk/reagents/KASP_manual.pdf), som er en konkurransedyktig allel-spesifikk PCR SNP genotyping system som bruker FRET drikk kassett oligos. Studie 3 genotypede med MassARRAY (Sequenom Inc., San Diego, USA) teknologi. Studie 4 genotypet ved hjelp av fluorescerende hybridiseirngsprobe smelte kurver ved hjelp av lys sykler instrument (Roche). Studer 11 genotypet ved hjelp av Illumina HumanHap 550 Perler Arrays. Study 12 ble genotypet ved Sanger-sekvense (tilfeller bare). Studier 13 og 14 ble genotypet ved hjelp av Illumina HumanHap300 og Illumina HumanHap240S.
Statistisk analyse
Avvik på observerte genotypefrekvensene i kontroller fra de som forventet under Hardy-Weinberg likevekt ble vurdert av χ
2 tester. Risiko for CRC knyttet til genotyper ble sammenlignet med odds ratio (ORS) med tilhørende konfidensintervall (CIS) basert på logistisk regresjon. Studier heterogenitet ble oppsummert ved hjelp av en Mantel-Haenszel test, men vi antok at studiene var stikkprøver fra en generell befolkning og brukte en tilfeldig effekt modell for å oppsummere OR anslag som er dominerende, recessive og additive penetrans modeller i meta-analyser. Resultatene ble representert ved skog plott som følger: konfidensintervaller for hver enkelt studie ble indikert med horisontale linjer, enkelt ORS ved kvadrater og oppsummerings estimater av diamanter med horisontale grenser ved sannsynlighetsgrenser og bredde omvendt proporsjonal med standard feil. Meta-analyser ble utført ved hjelp av pakken
rmeta
i fri programvaremiljøet for statistisk databehandling R.
Resultater
Fordelingen av genotyper i kontrollene ikke avvike fra Hardy -Weinberg likevekt i noen studier. Mantel-Haenszel tester identifisert studie heterogenitet for rs1800932 (
MSH6
P92P) under recessive og additiv pene, med p-verdier lik 0,04 og 0,03, henholdsvis (tabell S2). Dette utgjør ikke et stort problem, siden dette SNP viste ingen forskjeller mellom genotypen distribusjoner av saker og kontroller enten i enkeltstudier eller i den globale analysen. Studier heterogenitet ble ikke funnet noen annen SNP. Genotyping resultater for de 6 SNPs basert på studier 1-8 er presentert i Tabell S2.
Den eneste SNP som var marginalt signifikant i metaanalysen var rs3219489 (
MUTYH
Q338H), begge under en recessiv modell (sammendrag OR = 1,08, 95% KI 1,00 til 1,17; p = 0,05) og antar additiv allele effekter (sammendrag OR = 1,07, 95% KI 1,00 til 1,14; p = 0,06). Vi tilskriver den kombinerte resultatet i hovedsak til den svenske studien, med individuelle ORS av 1,18 (95% CI = 1,01 til 1,38, recessive modell) og 1,19 (95% CI = 1,05 til 1,35, additiv modell) (tabell S2). Den egnethets var litt bedre for recessive enn for den additive modellen, og de recessive og additive modeller klart bedre resultat enn den dominerende modellen.
I et forsøk på å validere funnene i henhold recessiv arv, setter vi opp samarbeid med flere grupper og bedt om å genotype rs3219489 i sine årskull. Til slutt, ekstra 4234 tilfeller og 6800 kontroller ble inkludert, og legger opp til totalt 12232 tilfeller og 13380 kontroller (tabell S3).
Vi har oppdatert metaanalyse gang vurderer alle prøvene, uavhengig av tumorlokalisasjon samt stratifisering dem for tykktarm og endetarm svulster. Som vist i tabell S4, data var tilgjengelige for 4573 tykktarm og 1774 endetarmskreft. Resultater fra de oppdaterte meta-analyser er vist i figur 1. Den nye sammendrag eller for tykktarmskreft var 1,03 (95% KI 0,97 til 1,10, sannsynlighetsverdi 0,25) (figur 1A). Sammendraget eller var praktisk talt identisk etter justering for alder og kjønn OR = 1,03 (95% KI 0,93 til 1,13). Studier heterogenitet ble ikke lagt merke til (P = 0,29, data ikke vist). Den kombinerte OR for tykktarmskreft var 1,07 (95% KI 0,99 til 1,16, verdier sannsynlighet 0,09 (OR = 1) og 0,37 (studie homogenitet) (figur 1B) og for endetarmskreft var 1,06 (95% KI 0,94 til 1,19, sannsynlighetsverdier 0,37 (OR = 1) og 0,31 (studie homogenitet)) (figur 1C).
Diskusjoner
i den foreliggende undersøkelsen vi utført en case-control forening studie for seks av åtte tidligere undersøkt SNPs [5]. for fem av dem, rs459552 (
APC
D1822V), rs1799977 (
MLH1
I219V), rs1800932 (
MSH6
P92P), rs1800935 (
MSH6
D180D) og rs3219484 (
MUTYH
V22M) prøver ble hentet fra åtte ytterligere studier på totalt 8308 tilfeller og 7434 kontroller. For sjette SNP, rs3219489 (
MUTYH
Q338H), som ble valgt basert på lovende resultater fra to prøver av svensk opprinnelse (studie 8 i dagens manuskript og referanse [5]), setter vi opp en enda større replikering datasettet består av 14 forskjellige studier med totalt 12232 saker og 13380 kontroller.
for alle SNPs inkludert i analysen vi klarte ikke å bekrefte assosiasjoner med CRC risiko som finnes i den svenske befolkningen. Spesielt de recessive ORS av CRC for rs3219489 redusert fra 1,52 i den opprinnelige svenske studien til 1,18 i den svenske replikering årsklasse, til 1,08 (95% KI 1,00 til 1,17) i første meta-analyse og til 1,03 (95% KI 0,97 til 1,10) i den oppdaterte meta-analyse (tabell S2). Oppsummerings ORS i de utvidede metaanalyser var 1,07 (95% KI 0,99 til 1,16) for tykktarmskreft og 1,06 (95% KI 0,94 til 1,19) for endetarmskreft, i kontrast med resultater basert på svenske prøver. Den oppdaterte meta-analyse hadde statistisk styrke på 99% for å påvise en recessiv OR på 1,52 og en kraft på 89% for å påvise en recessiv OR på 1,18 (Type I feilrate 5% og prevalens av CC genotyper blant kontrollene 5,6%). Biologisk plausibilitet var også fraværende. MUTYH Q338H er interessant fordi den representerer en missense endring i MUTYH protein, som er involvert i base excision reparasjon (BER) pathway. En vanlig produkt av oksidativ skade på 2′-deoksyguanosin er 7,8-dihydro-8-oxo-2′-deoksyguanosin (OG) [10], [11]. I pattedyrceller OG har vist seg å være meget mutagene og fører til en økt forekomst av G → T transversions, på grunn av sin feilkoding egenskaper som forårsaker en mispairing med et adenin i løpet av DNA-replikasjon for å danne en stabil OG: En mismatch [11], [12]. BER pathway spiller en viktig rolle i å reparere denne type DNA-skader gjennom handling av mutY homolog
MUTYH
, i konsert med
OGG1 Hotell og
MTH1 product: [11] , [1. 3]. Det er godt etablert at biallelic mutasjoner i
MUTYH
gen innføre G: C til T: A transversions også i adenomatøs polypose coli (APC) genet, som fører til genomisk ustabilitet og unormal og dis-regulert celleproliferasjon i kolonepitelet [14], [15]. Pasienter med to mutasjoner i
MUTYH
genet utvikle
MUTYH
-associated polypose (MAP) syndrom [13].
Til dags dato, 85 forskjellige MAP-mutasjoner har blitt funnet [16], spredt over hele lengden av proteinet, men bare 3 (inkludert Q338H) kart innenfor antatte protein interaksjon domener som åpenbart av den nylig løst krystallstrukturen av hMUTYH [17]. Det er fristende å spekulere i at Q338H kan påvirke dette proteinet og protein, men ekstra eksperimentell støtte er berettiget.
De kontrasterende resultater på rs3219489 og sin tilknytning til CRC risiko i det svenske versus andre populasjoner kan tyde på at effekten av denne varianten er spesifikk for den svenske befolkningen eller ikke stor nok til i de andre populasjoner som skal påvises med den foreliggende prøvestørrelse. For eksempel, den statistiske kraften av den oppdaterte meta-analyse var bare 43% for å påvise en recessiv OR på 1,10 (type I feilrate 5% og prevalens av CC genotyper blant kontrollene 5,6%). En nærmere titt på dataene viser faktisk at en av de tyske kohorter (ESTHER) ga resultater i overensstemmelse med våre svenske kohorter, med OR = 1,36 (95% KI 1,00 til 1,86) for kolorektal kreft (figur 1A) og OR = 1,61 ( 95% KI 1,08 til 2,40) for endetarmskreft (figur 1C). Dette er sannsynligvis et falsk resultat på grunn av den lille størrelsen av den kohort (318 tilfeller og 365 kontroller).
På den annen side, i overensstemmelse med svensk resultater, har rs3219489 også blitt vist å være assosiert med CRC risiko i tre uavhengige studier i den japanske befolkningen [18], [19], [20] og blant afro-amerikanere (Yuan et al., andre innsikt møte, Yokohama, Japan, upublisert), selv om alle disse studiene har en begrenset utvalgsstørrelse og resultatene trenger ytterligere validering.
det er også mulig at rs3219489 representerer en risiko-assosiert variant i den svenske befolkningen i kombinasjon med miljøfaktorer i vid forstand. For eksempel kan screeningsprogrammer for CRC i Sverige resultere i en diagnose tidligere i livet, og således blåse ORS estimert i Sverige. Et annet alternativ er at polymorfi er i koblingsulikevekt med andre uidentifiserte kausale varianter. Markøren og årsaks variant kan være lokalisert på samme risiko haplotype i den svenske befolkningen og på ulike haplotyper i andre populasjoner.
Uavhengig av ukjent grunn for replikering svikt, resultatene fra denne studien tydelig illustrerer muligheten for avtagende effektstørrelser med økende samlinger av individer, et fenomen kjent på området genetisk epidemiologi betegnet det vinneren forbannelse [21]. Det bør være oppmerksom på at dette resultatet er heller forventet i assosiasjonsstudier, særlig de som arbeider med regionalt heterogene komplekse sykdommer.
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1. .
Antall saker og kontroller genotypet i de fjorten studier
doi: 10,1371 /journal.pone.0072091.s001 plakater (DOC)
Tabell S2.
Genotype teller og allelfrekvenser for rs459552 (APC D1822V), rs1799977 (MLH I219V), rs1800932 (MSH6 P92P), rs1800935 (MSH6 D180D), rs3219484 (MUTYH V22M) og rs3219489 (MUTYH Q338H). De estimerte odds ratio med 95% konfidensintervall for de enkelte studier er også vist, sammen med kombinert ORS, 95% Cis og sannsynlighetsverdier for OR = 1 basert på tilfeldige effekter modell og sannsynlighetsverdier for studier homogenitet i henhold dominant, additiv og recessive pene.
doi: 10,1371 /journal.pone.0072091.s002 plakater (DOC)
tabell S3.
Genotype teller og allelfrekvenser for rs3219489 (MUTYH Q338H)
doi:. 10,1371 /journal.pone.0072091.s003 plakater (DOC)
Tabell S4.
Genotype teller for tykktarm og endetarmskreft i studier med tilgjengelig informasjon om svulst plassering
Doi:. 10.1371 /journal.pone.0072091.s004
(DOC)
Takk
Vi takker alle pasientene som deltok i denne studien. Medlemmer av EPICOLON Consortium (Gastrointestinal Oncology Group av den spanske Gastroenterologisk Association):
Hospital 12 de Octubre, Madrid: Juan Diego Morillas (lokal koordinator), Raquel Muñoz, Marisa Manzano, Francisco Colina, Jose Díaz, Carolina Ibarrola, Guadalupe López, Alberto Ibáñez; Hospital Clinic, Barcelona: Antoni Castells (lokal koordinator), Virginia Piñol, Sergi Castellví-Bel, Francesc Balaguer, Victoria Gonzalo, Teresa Ocaña, María Dolores Giraldez, Maria Pellisé, Anna Serradesanferm, Leticia Moreira, Miriam Cuatrecasas, Josep M. Piqué; Hospital Clínico Universitario, Zaragoza: Ángel Lanas (lokal koordinator), Javier Alcedo, Javier Ortego; Sykehus Cristal-Pinor, Complexo hospitalario de Ourense: Joaquin Cubiella (lokal koordinator), M
en Soledad Díez, Mercedes Salgado, Eloy Sánchez, Mariano Vega; Parc de Salut Mar, Barcelona: Montserrat Andreu (lokal koordinator), Anna Abuli, Xavier Bessa, Mar Iglesias, Agustín Seoane, Felipe Bory, Gemma Navarro, Beatriz Bellosillo; Josep M
en Dedeu, Cristina Álvarez, Marc Puigvehí; Hospital San Eloy, Baracaldo og sykehus Donostia, CIBERehd, Universitetet i Baskerland, San Sebastián: Luis Bujanda (lokal koordinator) Ángel Cosme, Inés Gil, Mikel Larzabal, Carlos Placer, María del Mar Ramírez, Elisabeth Hijona, Jose M. Enríquez- Navascués, Jose L. Elosegui; Hospital Generelt Universitario de Alicante: Artemio Payá (EPICOLON jeg lokal koordinator), Rodrigo Jover (EPICOLON II lokal koordinator), Cristina Alenda, Laura Sempere, Nuria Acame, Estefanía Rojas, Lucía Pérez-Carbonell; Hospital General de Granollers: Joaquim Rigau (lokal koordinator), Ángel Serrano, Anna Giménez; Hospital General de Vic: Joan Saló (lokal koordinator), Eduard Batiste-Alentorn, Josefina Autonell, Ramon Barniol; Hospital Generelt Universitario de Guadalajara og Fundación para la Formación e INVESTIGACION Sanitarias Murcia: Ana María García (lokal koordinator), Fernando Carballo, Antonio Bienvenido, Eduardo Sanz, Fernando González, Jaime Sánchez, Akiko Ono; Hospital Generelt Universitario de Valencia: Mercedes Latorre (lokal koordinator), Enrique Medina, Jaime Cuquerella, Pilar Canelles, Miguel Martorell, José Ángel García, Francisco Quiles, Elisa Orti; CHUVI-Hospital Meixoeiro, Vigo: EPICOLON I: Juan Clofent (lokal koordinator), Jaime Seoane, Antoni Tardío, Eugenia Sanchez. EPICOLON II M
en Luisa de Castro (lokal koordinator), Antoni Tardío, Juan Clofent, Vicent Hernández; Sykehus universitari tyskerne Trias Pujol, Badalona og Seksjon for fordøyelsessykdommer og ernæring, University of Illinois i Chicago, IL, USA: Xavier Llor (lokal koordinator), Rosa M. Xicola, Marta Piñol, Mercè Rosinach, Anna Roca, Elisenda Pons, José M. Hernández, Miquel A. Gassull; Hospital Universitari Mutua de Terrassa: Fernando Fernández-Bañares (lokal koordinator), Josep M. Viver, Antonio Salas, Jorge Espinós, Montserrat Forné, Maria Esteve; Hospital Universitari Arnau de Vilanova, Lleida: Josep M. René (lokal koordinator), Carmen Piñol, Juan Buenestado, Joan Viñas; Hospital Universitario de Canarias: Enrique Quintero (lokal koordinator), David Nicolás, Adolfo Parra, Antonio Martín; Hospital Universitario La Fe, Valencia: Lidia Argüello (lokal koordinator), Vicente Pons, Virginia Pertejo, Teresa Sala; Hospital Sant Pau, Barcelona: Dolors Gonzalez (lokal koordinator) Eva Roman, Teresa Ramon, Maria Poca, M
a Mar Concepción, Marta Martin, Lourdes Pétriz; Hospital Xeral Cies, Vigo: Daniel Martinez (lokal koordinator); Fundacion Publica Galega de Medicina Xenomica (FPGMX), CIBERER, Genomisk medisin Gruppe-universitetet i Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Galicia, Spania: Ángel Carracedo (lokal koordinator), Clara Ruiz-Ponte, Ceres Fernández-Rozadilla, M
a Magdalena Castro; Hospital Universitario Central de Asturias: Sabino Riestra (lokal koordinator), Luis Rodrigo; Hospital de Galdácano, Vizcaya: Javier Fernández (lokal koordinator), Jose Luis Cabriada; Fundación Hospital de Calahorra (La Rioja) La Rioja: Luis Carreño (lokal koordinator), Susana Oquiñena, Federico Bolado; Hospital Royo Villanova, Zaragoza: Elena Peña (lokal koordinator), José Manuel Blas, Gloria Cena, Juan José Sebastián; Hospital Universitario Reina Sofía, Córdoba: Antonio Naranjo (lokal koordinator)
.
