Abstract
Bakgrunn og Objective
The X-ray reparasjon kryss utfyller gruppe 1 ( XRCC1) protein spiller en avgjørende rolle i basen excision reparasjon (BER) sti ved å fungere som et stillas for andre BER enzymer. Varianter i XRCC1 genet kan endre proteinstruktur eller funksjon eller lage alternativt spleisede proteiner som kan påvirke BER effektivitet og dermed påvirke individuell mottakelighet for blærekreft. Nyere epidemiologiske studier har vist inkonsekvente assosiasjoner mellom disse polymorfismer og blærekreft. For å avklare situasjonen, ble utført en omfattende meta-analyse av alle tilgjengelige studier i denne studien.
Metoder
PubMed, EMBASE og kinesisk Biomedisinsk litteratur database (CBM) databaser har vært systematisk søkt å identifisere alle relevante studier for perioden frem til februar 2013. data ble abstrahert uavhengig av to anmeldere og odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (cIS) ble beregnet. Subgruppeanalyser ble utført hovedsakelig av etnisitet og røykestatus.
Resultater
Totalt 26 case-kontrollstudier, inkludert 24 studier for R399Q polymorfisme, 15 studier for R194W polymorfisme, og 7 studier for R280H polymorfisme oppfylte inklusjonskriteriene og ble valgt. Med hensyn til R399Q polymorfisme, betydelig redusert blærekreft risiko ble funnet blant røykere (AA vs GG: OR = 0,693, 95% KI = 0,515 til 0,932,
P
= 0,015 og recessive modell AA vs. GA + GG: OR = 0,680, 95% KI = 0,515 til 0,898,
P
= 0,007, henholdsvis). Med hensyn til R194W og R280H polymorfisme, ble det observert signifikant økt blærekreft risiko blant asiater (TT + CT vs. CC: OR = 1,327, 95% KI 1,086 til 1,622,
P
= 0,006 for R194W, og AA + GA vs GG: OR = 2,094, 95% KI 1,211 til 3,621,
P
= 0,008 for R280H, henholdsvis)
Konklusjoner
Denne metaanalyse antyder. at XRCC1 R399Q polymorfisme kan spille en beskyttende rolle mot blærekreft hos røykere. Men XRCC1 R194W og R280H polymorfismer ble begge assosiert med økt blærekreft risiko blant asiater. Videre studier med større utvalgsstørrelser for å validere våre funn
Citation. Li S, Peng Q, Chen Y, Du J, Chen Z, Deng Y, et al. (2013) DNA Repair Gene XRCC1 Polymorfisme, røyking og blærekreft Risiko: A Meta-Analysis. PLoS ONE 8 (9): e73448. doi: 10,1371 /journal.pone.0073448
Redaktør: Peiwen Fei, University of Hawaii Cancer Center, USA
mottatt: 22 mars 2013; Godkjent: 21 juli 2013; Publisert: 09.09.2013
Copyright: © 2013 Li et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Disse forfatterne har ingen støtte eller finansiering for å rapportere
konkurrerende interesser:. forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Blærekreft er en av de vanligste kreftformene av. urinveiene og et stort problem over hele verden [1]. De viktigste kjente risikofaktorer for blærekreft inkluderer røyking, eksponering for industrielt relaterte aromatiske aminer, og inntak av stoffer som phenacetin, chlornaphrazine, og cyklofosfamid [2,3]. Disse eksponering føre til DNA-skade som, hvis forble ureparerte, kan resultere i uregulert cellevekst og til og med kreft [4]. DNA skade reparasjon og cellesyklus sjekkpunkter rette cellulære responser til DNA-skader fra endogene og eksogene mutagene eksponeringer for å opprettholde genomisk integritet [5]. Basen excision reparasjon (BER) bane er en av de fire store DNA-reparasjons baner i humane celler. Proteinene i BER pathway hovedsak fungere på skadede DNA-baser som oppstår fra endogene oksidative og hydrolytiske nedbrytning av DNA. Base skade og DNA enkelttrådbrudd er i hovedsak reparert gjennom BER sti [6].
X-ray reparasjon kryss utfyller gruppe 1 (XRCC1) er en viktig DNA-reparasjon protein som er involvert i BER veien. Den XRCC1 protein har ingen kjent katalytisk aktivitet, men tjener til å orkestrere basen excision reparasjon via sin rolle som en sentral stillas protein fysisk forbundet med DNA ligase III på sitt COOH endestasjonen, DNA polymerase på sitt NH
2 endestasjonen, human AP endonuklease, polynukleotid kinase, og poly (ADP-ribose) polymerase, og via sin funksjon i å gjenkjenne og binding til enkelttrådbrudd [7-9]. Derfor kan polymorfismer forårsake aminosyresubstitusjoner svekke interaksjonen av XRCC1 med de andre enzymatiske proteiner og dermed endre basen excision reparasjon aktivitet.
Menneske XRCC1 genet er kartlagt til kromosom 19q13, 2 og er sammensatt av 17 eksoner. Den strekker seg over omtrent 31.9kb, og koder for et protein på 633 aminosyrer. Mer enn 300 validerte enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i XRCC1 er oppført i dbSNP database, som er ca 35 varianter ligger i eksoner eller promoter regioner. De mest omfattende studert SNPs er R399Q på ekson 10 (rs25487 i dbSNP, base 28152 G til A, Arg til Gin), R194W på ekson 6 (rs1799782 i dbSNP, basen 26304 C til T, Arg til Trp), og R280H på ekson 9 (rs25489 i dbSNP, basen 27466 G til A, Arg til Hans). Disse ikke-konservativ aminosyre endringer kan påvirke DNA reparasjonsevne ved å endre protein-protein interaksjoner mellom XRCC1 og andre BER proteiner. Derfor er det biologisk rimelig til hypoteser en potensiell sammenheng mellom XRCC1 polymorfismer og blærekreft risiko. En studie publisert i 2001 viste at det var en beskyttende virkning for fag som bar minst en kopi av kodonet 194 varianten allele sammenlignet med de homozygote for felles allelet (OR = 0,59, 95% CI = 0,3-1,0) [10]. Senere har mange studier blitt publisert på dette kontroversielle spørsmålet, men det er fortsatt uklart om det er signifikant sammenheng mellom XRCC1 polymorfismer og blærekreft risiko. Små genetiske assosiasjonsstudier har ulike design, forskjellig metodikk, og utilstrekkelig makt, og kunne uunngåelig øke risikoen for at sjansen kan være ansvarlig for sine konklusjoner, mens kombinere data fra alle kvalifiserte studier av meta-analyse har fordelen av å redusere tilfeldige feil og innhenting presise estimater for noen potensielle genetiske foreninger. Derfor utførte vi en meta-analyse av alle tilgjengelige studier for å avklare effekten av XRCC1 polymorfismer på blærekreft risiko.
Materialer og metoder
Søkestrategi
Denne studien ble utført i henhold til forslag fra Meta-analyse av observasjonsstudier i epidemiologi gruppe (MOOSE) [11]. Vi gjennomførte en omfattende litteratursøk i PubMed, Embase, og kinesisk Biomedisinsk litteratur database (CBM) databaser (opp til 15 februar 2013) med følgende søkestrategi: ( «blærekreft») og ( «X-ray reparasjon cross-komplette gruppe 1 «,» XRCC1 «, eller» BER «) og (» polymorfi «,» variant «,» mutasjon «,» genotype «, eller» genetisk polymorfisme «). Det var ingen restriksjoner på tidsperiode, utvalgsstørrelse, befolkning, språk eller type rapport. Alle kvalifiserte studier ble hentet og deres referanser ble sjekket for andre relevante studier. Litteraturen gjenfinning ble utført i duplisering av to uavhengige lesere (Shan Li og Qiliu Peng). Når flere publikasjoner rapportert på samme eller overlappende data, valgte vi den siste eller største befolkningen. Når en studie rapporterte resultatene på ulike subpopulasjoner, vi behandlet det som separate studier i meta-analysen.
Utvalgskriteriene
Studier inkludert i meta-analysen ble pålagt å oppfylle følgende kriterier : (1) Case-control studier som evaluerte sammenhengen mellom XRCC1 polymorfismer og blærekreft risiko; (2) brukt en urelatert case-control design; (3) hadde en odds ratio (OR) med 95% konfidensintervall (KI) eller andre tilgjengelige data for å estimere OR (95% CI); og (4) kontrollpopulasjon inneholdt ikke maligne tumorpasienter. Konferanse abstracts, kasuistikker, redaksjonell gjennomgang artikler og brev ble ekskludert.
Data utvinning
To separate etterforskere (Shan Li og Qiliu Peng) uavhengig vurdert og hentet ut data fra alle kvalifiserte studier. Data hentet fra utvalgte studier inkludert førsteforfatter, årstall, opprinnelsesland, etnisitet, genotyping metode, matchende kriterier, kilde av kontroll, blærekreft bekreftelse, QC når genotyping, totalt antall tilfeller og kontroller og genotypefrekvensene saker og kontroller. Etnisk bakgrunn ble kategorisert som kaukasisk, asiatisk og afrikansk, og røyker status (røyker eller nonsmoker) ble i tillegg registrert for stratifisert analyse. Røykere inkludert nåværende røykere og tidligere røykere. Nonsmokers hadde aldri røykt. Hvis en studie ikke oppgi etnisk etterkommer eller om det ikke var mulig å skille deltakerne i henhold til en slik fenotype, ble gruppen rapportert betegnet som «blandet etnisitet». For å sikre nøyaktigheten av den ekstraherte informasjon, de to søkerne kontrollert dataene utvinning resultatene og nådde enighet om alle av dataene uttrukket. Hvis forskjellige resultater ble generert, ville de sjekke dataene igjen og ha en diskusjon for å komme til enighet. En tredje anmelder (Xue Qin) ble invitert til diskusjon om uenighet fortsatt eksisterte.
Metodisk kvalitetsvurdering
Metodekvaliteten ble uavhengig vurdert av to korrekturlesere (Shan Li og Qiliu Peng), i henhold til et sett av forhåndsdefinerte kriterier (tabell 1) basert på omfanget av Thakkinstian et al. [12]. De reviderte kriterier dekke troverdighet kontroller, representativitet av tilfellene, vurdering av blærekreft, genotyping undersøkelse, Hardy-Weinberg likevekt (HWE) i kontroll befolkningen, og foreningen vurdering. Uenighet ble løst ved konsensus. Poeng varierte fra 0 (lavest) til 12 (høyest). Artikler med score mindre enn åtte ble vurdert » lav kvalitet » studier, mens de med score lik eller høyere enn 8 ble ansett som «høy kvalitet» «studier.
Kriterier
Resultat
representativitet casesSelected fra befolkningen eller kreft registry2Selected fra noen urologi /kirurgi service1Selected uten klart definerte prøvetaking ramme eller med omfattende inkludering /ekskludering criteria0Credibility av controlsPopulation- eller neighbor- based3Blood givere eller volunteers2Hospital-baserte (kreftfrie pasienter) 1Healthy frivillige, men uten total description0. 5Urology patients0.25Not described0Ascertainment av blæren cancerHistological eller patologisk confirmation2Diagnosis av blærekreft ved pasientens medisinske record1Not described0Genotyping undersøkelse Genotyping gjøres under » blendet » condition1Unblinded eller ikke mentioned0Hardy-Weinberg equilibriumHardy-Weinberg likevekt i controls2Hardy-Weinberg ulikevekt i controls1No sjekke for Hardy-Weinberg disequilibrium0Association assessmentAssess sammenheng mellom genotyper og blærekreft med passende statistikk og justering for confounders2Assess sammenheng mellom genotyper og blærekreft med passende statistikk uten justering for confounders1Inappropriate statistikk used0Table 1. Skala for Quality Assessment.
CSV ned CSV
Statistisk analyse
styrken i sammenhengen mellom XRCC1 polymorfismer og blærekreft risiko ble målt ved odds ratio (ORS) med 95% konfidensintervall (cIS). Betydningen av den samlede ELLER ble bestemt ved Z-test og en
p
verdi på mindre enn 0,05 ble betraktet som signifikant. Vi vurderte de sammenslutninger av XRCC1 R399Q polymorfisme med blærekreft risikoen ved hjelp av additive genetiske modeller (AA vs GG og GA vs GG), recessive genetiske modell (AA vs. GA + GG), og dominant genetisk modell (AA + GA vs. GG). Men med hensyn til R194W og R280H polymorfismer ble foreninger vurderes kun ved hjelp dominant genetisk modell (TT + CT vs. CC for R194W, og AA + GA vs. GG for henholdsvis R280H,) på grunn av den lave bærefrekvens på mutere homozygot i de undersøkte bestandene
To modeller av meta-analyse for dikotome utfall ble utført i denne studien:. den tilfeldig effekt-modell og den faste effekt-modell. Den tilfeldig effekt modellen ble gjennomført ved hjelp av DerSimonian og Laird metode [13], som antok at studier ble tatt fra populasjoner med varierende effektstørrelser og beregnet studie vekter både fra inn-studie og mellom-studie avvik. Den faste effekt-modell ble utført ved hjelp av Mantel-Haenszel metode [14], som antok at studier ble samplet fra populasjoner med samme effektstørrelse og gjort en justering av studie vekter i henhold til in-studien varians. For å vurdere den mellom-studien heterogenitet, både chi-kvadrat basert
Q
statistikk test til test for heterogenitet og
Jeg
2 statistikk å kvantifisere andelen av den totale variasjonen skyldes til heterogenitet ble beregnet. På grunn av den lave kraften i Cochran
Q
statistikk, ble heterogenitet betraktet som signifikant når resultatene av
Q
testen var
P
Q
0,1 eller
Jeg
2 ≥ 50%, og tilfeldig effekt modellen ble brukt til basseng resultatene. Ellers ble det faste-effekter modellen som brukes til basseng resultatene når resultatet av
Q
testen var
P
Q
≥ 0,1 og
jeg
2 50%. Dessuten ble det Galbraith tomten brukes til å oppdage uteliggere som mulige viktigste kildene til heterogenitet [15]. For bedre å undersøke mulige kilder til mellom-studie heterogenitet, ble meta-regresjonsanalyse også brukt til både generelle analyser og subgruppeanalyser når heterogenitet ble observert. For å validere troverdigheten av resultatene i denne meta-analysen, ble en sensitivitetsanalyse utført av sekvensiell utelatelse av enkeltstudier eller ved å utelate studier plottet av tomten Galbraith metoden som mulig kilde til stor heterogenitet.
Subgruppeanalyser var utført av etnisitet, røykestatus, og studier i HWE. Publikasjon skjevhet ble undersøkt ved trakt tomt, hvor standardfeilen for logor av hver studie ble plottet mot sin logor. En asymmetrisk tomten antydet mulig publikasjonsskjevhet. I tillegg ble trakt plott asymmetri vurdert ved fremgangsmåten til Egger lineære regresjon test [16]. Fordelingen av genotyper i kontrollpopulasjon ble testet for HWE ved hjelp av en godhet-of-fit Chi-square-test. Alle analyser ble utført ved hjelp av Stata programvare, versjon 12.0 (Stata Corp., College Station, TX). Alle
p
verdiene var tosidig. For å sikre påliteligheten og nøyaktigheten av resultatene, to forfattere importert dataene inn i statistikken program selvstendig og fikk samme resultat.
Resultater
Studie egenskaper
Med søkekriterier, 102 individuelle poster ble funnet i utgangspunktet. Etter screening av titler og sammendrag, 63 ble ekskludert (40 ikke undersøke XRCC1 R399Q, R194W og R280H Polymorfisme og blærekreft risiko, 23 ble overlappet studier blant de tre databasene) ble og bare 39 fulltekstpublikasjoner foreløpig identifisert for videre detaljert evaluering (Figur 1). Ifølge eksklusjonskriteriene ble 14 publikasjoner ekskludert inkludert 4 publikasjoner som inneholder overlappende data [17-20], 2 for ikke å presentere tilstrekkelige data for å beregne OR og 95% CI [21,22], 5 var ikke case-kontrollstudier [23 -27], 2 var meta-analyse [28,29] og en var en gjennomgang [30]. Manuelt søk av referanser sitert i de støtteberettigede studier har ikke vist noen ekstra artikkel Som et resultat av totalt 25 relevante studier inkludert 22 engelske artikler [2,6,10,31-49], 2 kinesiske papirer (en var en avhandling på hovedfags student) [50,51], og en spansk studie [52] oppfylte inklusjonskriteriene for meta-analyse. Blant dem, en av de kvalifiserte studiene inneholdt data på to forskjellige etniske grupper (afrikanske og kaukasiske) [10], og vi har behandlet det uavhengig. Derfor er en total av 26 separate sammenligninger ble til slutt inkludert i vår meta-analyse. Blant dem, data var tilgjengelig fra 24 individuelle case-control studier på R399Q polymorfisme (herunder totalt 6750 blærekreft tilfeller og 8483 kontroller), 15 studier på R194W polymorfisme (inkludert totalt 5834 blærekreft tilfeller og 6492 kontroller), og 7 studier på R280H polymorfisme (inkludert totalt 2428 blærekreft tilfeller og 2442 kontroller). De viktigste kjennetegn ved studiene ble presentert i tabell 2. Av alle de kvalifiserte studier, 17 (inkludert 6275 blærekreft tilfeller og 7702 kontroller) ble utført hos kaukasiske populasjoner, 8 (inkludert 1620 blærekreft tilfeller og 1853 kontroller) var i asiater, og 1 (inkludert 19 blære krefttilfeller og 13 kontroller) var i afrikanere. Syv studier (inkludert 3173 blærekreft tilfeller og 4698 kontroller) var populasjonsbasert og 18 (inkludert 4109 blærekreft tilfeller og 4308 kontroller) var sykehusbaserte studier. Seksten artikler (inkludert 5947 blærekreft tilfeller og 7358 kontroller) av alle kvalifiserte studier brukte kvalitetskontroll når genotyping og 6 (inkludert 1613 blærekreft tilfeller og 1642 kontroller) studier i dagens meta-analyse ikke gir patologisk eller histologisk bekreftelse for blæren kreftdiagnose. Flere genotyping metoder ble anvendt, blant annet PCR-RFLP, TaqMan®-analysen, og MALDI-TOF. Genotypen distribusjoner av kontrollene i 2 studiene var ikke forenlig med HWE for R399Q polymorphism [32,45], 3 ikke var i samsvar med HWE for R280H polymorphism [10,39,49], og en var ikke forenlig med HWE for R194W polymorfisme [51].
Førsteforfatter (år)
Etnisitet (land)
Prøvestørrelse størrelse~~POS=HEADCOMP (sak /kontroll)
genotyping metoder
BC bekreftelse
Kilde av kontroll
matchende kriterier
QC når genotyping
SNP studert
HWE (
P
verdi)
Kvalitet score
R399Q
R280H
R194W
Stern1 (2001) kaukasisk (America) 214 /197PCR-RFLPHCHBEthnicity, sex, og ageNoR399Q, R280H, R194W0 .9230.0050.1857Stern2 (2001) Afrikansk (Amerika) 19 /13PCR-RFLPHCHBEthnicity, sex, og ageNoR399Q, R280H, R194W0.512NA0.6387Shen (2003) kaukasisk (Italia) 201 /214PCR-RFLPHCHBAgeNoR399Q0.784–7.25Sanyal (2004) kaukasisk (Sverige) 311 /246PCR-RFLPNAHBEthnicity, alder og regionYesR399Q0.610–9Kelsey (2004) kaukasisk (America) 355 /544PCR-RFLPHCPBAge, sex, og regionYesR399Q0.031–8.5Matullo (2005) kaukasisk (Italia) 317 /317PCR-RFLPHCHBAge, og regionYesR399Q, R194W0.768-0.7699Broberg (2006) kaukasisk (Sverige) 61 /155MALDI-TOFHCPBEthnicity, alder og regionYesR399Q0.840–10Matullo (2006) kaukasisk (Frankrike et al.) 124 /1094TaqMan, AssayPCPBAge, sex, og regionYesR399Q, R194W0.632-0.1719Karahalil (2006) kaukasisk (Tyrkia) 146 /100PCR-RFLPHCHBAgeNoR399Q0.277–4Wu (2006) kaukasisk (America) 696 /629TaqMan, AssayHCHBAge, sex, og ethnicityYesR399Q, R194W0. 339-0.3176Figueroa (2007) kaukasisk (Spania) 1150 /1149TaqMan, AssayHCPBAge, sex, og regionYesR399Q, R280H, R194W0.6020.5060.1738Sak (2007) kaukasisk (England) 532 /562TaqMan, AssayNAMixedAge, og sexNoR399Q, R280H, R194W0.9530.0340 .4509Wu (2005) Asiatisk (Kina) 155 /155PCR-RFLPHCHBAge, sex, og regionYesR399Q, R280H, R194W0.6160.1670.0609Zhang (2006) Asiatisk (Kina) 242 /225PCR-RFLPNAPBNAYesR194W – 0.02610Fontana (2008) kaukasisk (Frankrike) 51 /45TaqMan, AssayHCHBNAYesR399Q, R194W0.264-0.6936Wang (2008) Asiatisk (Kina) 234 /253PCR-RFLPHCHBAge, og sexYesR399Q, R280H, R194W0.0650.0680.0699Arizono (2008) Asiatisk (Janpan) 251 /251PCR-RFLPNAHBSexNoR399Q0.235- -6NARTER (2009) kaukasisk (Tyrkia) 83 /45PCR-RFLPNAHBNANoR194W – 0.3525Wen (2012) Asiatisk (Kina) 130 /304TaqMan, AssayPCHBNANoR399Q0.517–6.25Zhi (2012) Asiatisk (Kina) 302 /311PCR-RFLPPCHBNAYesR399Q0.059 –8Andrew (2008) kaukasiske (USA, Italia) 1029 /1281PCR-RFLPHCPBAge, og sexYesR399Q, R194W0.010-0.09410Huang (2007) kaukasisk (USA) 614 /600TaqMan, AssayHCHBAge, sex, og ethnicityYesR399Q, R194WNA * -NA * 8Wen (2009) Asiatisk (Kina) 94 /104TaqMan, AssayHCHBAge, sex, og regionYesR399QNA * – 7.25Covolo (2008) kaukasisk (Italia) 197 /211PCR-RFLPHCHBAge, og regionNoR399QNA * – 8Gao (2010) kaukasisk (UK) 194 /313TaqMan, AssayNAHBAge, og sexNoR399QNA * -. 4Mittal (2012) Asiatisk (India) 212 /250PCR-RFLPHCPBAge, sex, og ethnicityYesR399Q, R280H, R194W0.2760.0000.9858Table 2. Kjennetegn på utvalgte studier
HC, Histologisk bekreftet ; PC, Patologisk bekreftet; NA, Ikke tilgjengelig; QC, Kvalitetskontroll; PB, populasjonsbasert; HB, Hospital basert; HWE, Hardy-Weinberg likevekt i kontroll befolkningen; PCR-RFLP, Polymerase kjedereaksjon-rflp; MALDI-TOF, Matrix-assistert laser desorpsjon /ionisering time-of-flightNA *: De eksakte data for genotyper for beregning av
P
verdien av HWE var ikke tilgjengelig, men ble rapportert å være i HWE i studiene. CSV Last ned CSV
Meta-analyseresultater
For R399Q polymorfisme, mellom-studien heterogenitet var signifikant når alle studiene ble samlet inn meta-analyse (
I
2 = 55,1%,
P
Q
= 0,002), og dermed er tilfeldig effekt modellen ble brukt til basseng resultatene. Resultatene av å samle alle studier viste at R399Q polymorfismen ikke var assosiert med blære risiko i alle genetiske modeller (modeller additive AA vs. GG og GA vs. GG, recessive modell, og dominerende modellen; tabell 3). Videre har vi ikke identifisert betydelige resultater mellom R399Q polymorfisme og blærekreft risiko i alle sammenligning modeller i subgruppeanalyser henhold til etnisitet og studiene etter eksklusive fagene ikke i HWE. Men i subgruppeanalyse stratifisert etter røykestatus, fant vi betydelig redusert blærekreft risiko i genetiske modeller AA vs GG og recessive modell AA vs. GA + GG (OR = 0,693, 95% KI = 0,515 til 0,932,
P
= 0,015 og OR = 0,680, 95% KI = 0,515 til 0,898,
P
= 0,007, henholdsvis figur 2) hos røykere, ingen signifikant sammenheng ble funnet i alle sammenligninger i ikke-røykere. Host Sammenligning
Befolkning
No. studier
Test av foreningen
M
Test av heterogenitet
P
Egger «
s test
OR
95% KI
P
Verdi
P
Q
Verdi
I
2 (%)
R399QAA vs. GGOverall190.8840.733-1.0660.195R0.00255.10.202Caucasian130.9280.819-1.0510.239F0.6540.00.266Asian60.7620.376-1.5440.450R0.00083.60.085Smokers60.6930.515-0.9320.015F0.6740.00.670Non-smokers71.0600.723-1.5550.765F0.8160.00.667Studies i HWE170.8920.714-1.1130.311R0.00158.10.186Studies etter eksklusive outliers170.9340.831-1.0490.249F0.4690.00.268GA vs. GGOverall201.0640.989-1.1450.096F0.09031.40.721Caucasian131.0790.994-1.1720.069F0.5600.00.796Asian60.9650.727-1.2800.804R0.01066.80.176African12.5000.568-11.0110.226————Smokers61.0200.848-1.2270.832F0.16037.00.966Non-smokers70.7790.496-1.2230.278R0.03156.80.236Studies i HWE181.0320.950-1.1220.458F0.13427.60.907Studies etter eksklusive outliers181.0700.992-1.1540.081F0.27714.80.964AA + GA vs. GGOverall241.0060.922-1.0970.892R0.03637.10.365Caucasian161.0370.966-1.1130.320F0.7940.00.334Asian70.9080.674-1.2210.552R0.00174.80.130African12.5000.568-11.0110.226————Smokers70.9720.837-1.1300.715F0.4780.00.874Non-smokers80.8650.638-1.1730.350R0.08743.70.306Studies i HWE220.9880.896-1.0910.815R0.03039.70.408Studies etter eksklusive outliers221.0280.963-1.0980.410F0.5140.00.604AA vs. GA+GGOverall190.8670.736-1.0230.091R0.01048.50.238Caucasian130.8920.793-1.0030.055F0.4790.00.328Asian60.7820.433-1.4120.415R0.00078.70.169Smokers60.6800.515-0.8980.007F0.4450.00.738Non-smokers71.0880.758-1.5610.648F0.8300.00.826Studies i HWE170.8980.746-1.0810.257R0.01846.80.162Studies etter eksklusive outliers170.8990.805-1.0030.058F0.4143.50.338R194WTT + CT vs. CCOverall151.0080.909-1.1180.880F0.24718.50.166Caucasian100.9160.811-1.0350.158F0.8450.00.077Asian41.3271.086-1.6220.006F0.8480.00.121African10.1850.017-2.0240.167————Smokers20.8660.627-1.1950.381F0.5000.0—Non-smokers30.8740.589-1.2950.501F0.4410.0—Studies i HWE140.9830.882-1.0950.754F0.33311.10.152R280HAA + GA vs. GGOverall71.6091.153-2.2470.005R0.00270.70.507Caucasian31.2090.972-1.5030.088F0.5130.0—Asian32.0941.211-3.6210.008R0.00680.2—African13.8570.171-87.1990.396————Table . 3. Meta-analyse av XRCC1 genet polymorfismer om blærekreft risiko
M, modell; OR, odds ratio; CI, konfidensintervall; R, tilfeldig effekt-modell; F, faste effekter modell; HWE, Hardy-Weinberg likevekt CSV ned CSV
En skog tomter XRCC1 R399Q polymorfisme og blærekreft risiko blant røykere som bruker en fast effekt modell (kontrast AA vs GG); B Forest plott av XRCC1 R399Q polymorfisme og blærekreft risiko blant røykere som bruker en fast effekt modell (recessive modell AA vs. GA + GG).
For R194W polymorfisme, var det ingen mellom-studie heterogenitet når alle 15 utvalgte studier ble samlet inn meta-analyse (
jeg
2 = 18,5%,
P
Q
= 0,247), og dermed den faste-effekter modellen ble brukt til basseng resultatene. De kombinerte resultatene viste at R194W polymorfismen ikke var assosiert med blærekreft risiko (tabell 3). I subgruppeanalyser av etnisitet, resultatene viste at R194W polymorfisme var forbundet med en økt blærekreft risiko blant asiater (TT + CT vs. CC: OR = 1,327, 95% KI 1,086 til 1,622,
P
= 0,006), mens foreningen ble heller ikke funnet i kaukasiere og afrikanere (figur 3). Tilsvarende ble det ikke noen signifikant sammenheng observert i subgruppe analyse stratifisert etter røykestatus og studier etter eksklusive fagene ikke i HWE.
For R280H polymorfisme, ble det observert åpenbart betydelig mellom-studie heterogenitet når alle de kvalifiserte studiene ble samlet inn meta-analyse (
jeg
2 = 70,7%,
P
Q
= 0,002), og dermed randomisert effekter modellen ble brukt til basseng resultatene. Den kombinerte resultatet viste at R280H polymorfisme var signifikant assosiert med økt blærekreft risiko (AA + GA vs GG: OR = 1,609, 95% KI 1,153 til 2,247,
P
= 0,005). I subgruppeanalyser av etnisitet, resultatene viste at R280H polymorfisme var forbundet med en økt blærekreft risiko blant asiater (AA + GA vs GG: OR = 2,094, 95% KI 1,211 til 3,621,
P
= 0,008, figur 4).
heterogenitet analyse
for R399Q polymorfisme,
jeg
2 verdier av heterogenitet var større enn 50%, og
P
Q
verdiene var lavere enn 0,10 i additiv modell AA vs GG, recessive modell AA vs. GA + GG, og dominerende modellen AA + GA vs. GG i generelle populasjoner, som indikerte statistisk signifikant heterogenitet blant studier. For å utforske kildene til heterogenitet, utførte vi metaregression og subgruppeanalyser. Metaregression analyse av data viste at etnisitet var den viktigste kilden som bidro til heterogenitet. De genotyping metoder, Blærekreft bekreftelse, Source av kontroll, QC når genotyping, og kvalitetspoeng ble ikke effekt ved. Deretter utførte vi subgruppeanalyser stratifisert etter etnisitet. Men heterogenitet fortsatt eksisterte i alle de ovennevnte tre genetiske sammenligning modeller i asiater (Tabell 3). For ytterligere å undersøke den heterogeniteten, utførte vi Galbraith plott analyse for å identifisere de utliggere som kan bidra til den heterogene. Våre resultater viste at studiene Wu et al. [50] og Zhi et al. [44] var uteliggere i additiv modell AA vs GG, recessive modell AA vs. GA + GG, og dominerende modellen AA + GA vs GG modell for R399Q polymorfisme (figur 5). Alle
Jeg
2 verdier redusert åpenbart og
P
Q
verdier var større enn 0,10 etter unntatt de to studiene Wu et al. [50] og Zhi et al. [44] i alle genetiske sammenligning modeller i den generelle populasjoner (additiv modell AA vs GG:
P
Q
= 0,469,
Jeg
2 = 0,0; recessive modell AA vs. GA + GG:
P
Q
= 0,414,
jeg
2 = 3,5; dominerende modellen AA + GA vs GG:
P
Q
= 0,514,
jeg
2 = 0,0), asiater (additiv modell AA vs GG:
P
Q
= 0,107,
jeg
2 = 46,8; recessive modell AA vs. GA + GG:
P
Q
= 0,186,
jeg
2 = 37,7; dominerende modellen AA + GA vs GG:
P
Q
= 0,101,
jeg
2 = 48,5), og studier i HWE (additiv modell AA vs GG:
P
Q
= 0,481,
jeg
2 = 41,0; recessive modell AA vs. GA + GG:
P
Q
= 0,670,
I
2 = 0,0; dominerende modellen AA + GA vs GG:
P
Q
= 0,491,
jeg
2 = 0,0). Det har betydning for sammendrags ORS for R399Q polymorfisme i ulike sammenligning modeller i den generelle populasjoner og subgruppeanalyser var ikke i fl uenced ved å utelate de to studiene.
studier av Wu et al. og Zhi et al. ble oppdaget som uteliggere
For R280H polymorfisme, betydelig mellom-studie heterogenitet ble også observert i pooling analyser av totale tilgjengelige studier (AA + GA vs GG:.
P
Q
= 0,002,
jeg
2 = 70,7). Metaregression analyse av data viste at etnisitet, genotyping metoder, Blærekreft bekreftelse, Source av kontroll, QC når genotyping og kvalitetspoengene ble ikke effekt ved. Galbraith plott analyse indikerte at studien Wu et al. [50] ble oppdaget som den viktigste kilden til heterogenitet (figur 6).
Jeg
2 verdier redusert åpenbart og
P
Q
verdier var større enn 0,10 etter eksklusive studien Wu et al. [50] i den generelle populasjoner (AA + GA vs GG:
P
Q
= 0,107,
Jeg
2 = 11,7) og asiater (AA + GA vs GG:
P
Q
= 0,062,
jeg
2 = 48,3). Det har betydning for ORS for R280H polymorfisme i den generelle befolkningen og subgruppeanalyser ikke ble endret ved å utelate denne studien.
Studiet av Wu et al. ble oppdaget som avvikende.
For R194W polymorfisme, vi ikke observere noen betydelig mellom-studie heterogenitet i den generelle populasjoner og subgruppeanalyser.
Følsomhetsanalyse
Følsomhetsanalyse analyse~~POS=HEADCOMP ble utført ved sekvensiell utelatelse av enkeltstudier. For analyser av pooling mer enn tre individuelle studier, ble betydningen av ORS ikke påvirkes for mye ved å utelate noen enkeltstudie (data ikke vist). For R399Q polymorfisme, ble sensitivitetsanalyse ytterligere utført ved å utelate studiene av Kelsey et al. [32] og Andrew et al. [19], som kontrollpopulasjoner var ikke forenlig med HWE, og betydningen av alle ORS ble ikke endret etter unntatt disse to studiene (Tabell 3). For R194W polymorfisme, ble sensitivitetsanalyse også ytterligere utført ved å utelate studie av Zhang et al. [51] som kontrollpopulasjoner ble betydelig avveket fra HWE, og betydningen av alle ORS ble heller ikke endret. For R280H polymorfisme, sensitivitetsanalyse ved å utelate disse studiene som har kontroll populasjoner ble fraveket HWE ble ikke utført fordi det kan være uakseptabelt og kan føre til at noen fordommer ved å utelukke for mange studier.
publiseringsskjevheter
Begg trakten tomten og Egger test ble utført for å få tilgang til publikasjonsskjevhet av litteratur som inngår i denne meta-analysen. Figurer av trakt tomten ikke avsløre åpenbare bevis på asymmetri, og alle
p
verdier av Egger tester var mer enn 0,05, gir statistisk bevis på trakt tomter «symmetri. Resultatene ovenfor antydet at publikasjonsskjevhet var ikke tydelig i denne meta-analysen.
Diskusjoner
Tidligere studier som undersøker sammenhengen mellom XRCC1 Polymorfisme og blærekreft risiko har gitt inkonsistente resultater, og de fleste av dem studier involvert ikke mer enn noen få hundre blære krefttilfeller, som er for få til å vurdere eventuelle genetiske effekter på en pålitelig måte. Meta-analysen har blitt anerkjent som et viktig verktøy for å mer presist definere effekten av utvalgte genetiske polymorfismer på risikoen for sykdom og for å identifisere potensielt viktige kilder til mellom-studie heterogenitet. En meta-analyse av 12 studier gjennomført i 2008 [28] viste at XRCC1 R194W polymorfisme ikke kan være risikofaktorer for blærekreft, men R399Q polymorfisme assosiert med redusert følsomhet for blærekreft etter recessive modell (OR = 0,65, 95% KI = 0,49 til 0,86) og homozygot kontrast (OR = 0,66, 95% CI = 0,49 til 0,90) blant noensinne røykere. En annen meta-analyse [29], utført nesten samtidig og ganske lik i metoder, viste at det ikke var noen sammenheng mellom XRCC1 R399Q, R194W og R280H polymorfismer og blærekreft mottakelighet. Den forrige meta-analyse dekket ikke kvalifiserte studier publisert på kinesisk. Noen studier ble bare indeksert i CBM databasen, men ikke indeksert i de valgte i meta-analyse av Lao et al databaser. [28] og Wang et al. [29], noe som kan føre til plassering skjevhet og makt skjevhet effekten estimat av en meta-analyse.
