Abstract
Bakgrunn
microRNAs (mirnas) er en klasse av liten ikke-kodende RNA for å regulere celledifferensiering, proliferasjon, utvikling, og apoptose. Den enkeltnukleotidpolymorfi (SNP) rs895819 ligger ved terminalen løkke av
pre-MIR-27a
. Her ønsket vi å undersøke om SNP rs895819 var assosiert med utvikling av nyrecellekreft (RCC) i en kinesisk befolkning.
Metoder
I denne case-control studie, rekruttert vi 594 RCC pasienter og 600 kreftfrie kontroller med frekvens matchet etter alder og kjønn. Vi genotypede denne polymorfisme med TaqMan analysen og vurdert effekten av denne polymorfisme på RCC overlevelse. Logistisk regresjonsmodell ble brukt for å vurdere de genetiske effekter på utvikling av RCC og interaksjoner mellom rs895819 polymorfi og risikofaktorer.
Resultater
Sammenlignet med AA homozygot, enkeltpersoner bærer AG /GG genotyper hadde en statistisk signifikant redusert følsomhet for RCC (justert OR = 0,71, 95% CI = 0,56 til 0,90). Videre ble AG /GG genotyper assosiert med redusert RCC mottakelighet lokalisert klinisk stadium (justert OR = 0,71, 95% CI = 0,55 til 0,91), og lignende effekter ble observert i godt differensiert og dårlig differensiert RCC (justert OR = 0,71, 95 % CI = 0,55 til 0,93 for godt differensiert, justert OR = 0,51, 95% CI = 0,28 til 0,93 for dårlig differensiert). Vi observerte også at rs895819 hadde multiplikative samhandling med alder og hypertensjon. Men den polymorfisme ikke påvirke overlevelsen av RCC.
Konklusjon
Våre resultater tyder på at
pre-MIR-27a
rs895819 polymorfisme kan forutsi RCC risiko i en kinesisk befolkning. Større populasjonsbaserte prospektive studier bør brukes til å validere våre funn
Citation. Shi D, Li P, Ma L, Zhong D, Chu H, Yan F et al. (2012) en genetisk variant i
pre-MIR-27a
er assosiert med redusert nyrecellekreft Risiko i en kinesisk befolkning. PLoS ONE 7 (10): e46566. doi: 10,1371 /journal.pone.0046566
Redaktør: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugal
mottatt: 19 juni 2012; Godkjent: 31 august 2012; Publisert: 30 oktober 2012
Copyright: © 2012 Shi et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Denne studien ble delvis støttet av Natural Science Foundation of China (81230068, 30972444, 81102089 og 81201571) National, Key Program of Science Foundation i Jiangsu-provinsen Natural (BK2010080) og Science Foundation i Jiangsu-provinsen (BK2011773 og BK2011775) National, Qin Lan-prosjektet i Jiangsu Provincial Department of Education, og Priority Academic Program Utvikling av Jiangsu høgskolerådet (Public Health og forebyggende medisin). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
nyrecellekreft (RCC) utgjør mer enn 90% av nyre karsinomer, og klar-celle nyrekreft er den vanligste typen i RCC [1], [2]. Insidensen av RCC variere betydelig over hele verden, med høyere priser i Europa og Nord-Amerika og lavere priser i Asia og Sør-Amerika [1]. Rater blant kvinner er generelt omtrent halvparten av dem blant menn [1]. Selv om noen risikofaktorer er etablert for RCC, er det en rekke av predisponerende betingelser som er kjent for å være relatert til utviklingen av RCC, såsom sigarettrøyking, fedme, høyt blodtrykk, diabetes, familiehistorie med kreft, og andre [3], [4], [5]. Men bare en del av de personene som utsettes for disse risikofaktorene vil utvikle RCC i sin levetid, noe som tyder på at individuelle forskjeller inkludert genetisk mottakelighet faktorer kan være en av de mest kritiske agenter i nyrecellekreftutvikling.
microRNAs ( mirnas) er en klasse av endogen, små og ikke-kodende RNA (~22 nt), som innledningsvis transkribert fra genomisk DNA til lange primær transkripter (pri-mirnas) og deretter spaltes ved kjerne drosha til 60-70 nt hairpin- formede forløper-RNA (før mirnas) [6], [7]. Forhånds mirnas blir eksportert til cytoplasma ved exportin-5 og er videre behandlet i ~22 nt modne miRNA tomannsboliger ved spalting av dicer [8], [9]. I forbindelse med RNA-indusert stanse kompleks (RISC), kan indusere mirnas mRNA degradering eller translasjons-undertrykkelse ved binding til den 3′-ikke-translaterte området av deres målgener ved posttranskripsjonelt nivå [10]. Til dags dato har det blitt anslått at mirnas modulere ekspresjonen av omtrent 30% av humane gener [11]. Mirnas er involvert i en rekke biologiske prosesser, inkludert cellesyklusregulering, apoptose og stamcelle vedlikehold, utvikling, metabolisme og aldring [11]. Det har vist seg at mirnas delta i human karsinogenese som enten tumor-suppressorer eller onkogener [12], [13]. Akkumulerende studier har antydet at enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) eller mutasjoner kan gi et betydelig bidrag til sykdom mottakelighet og utfall. Genetiske varianter eller mutasjoner i mirnas eller pre-mirnas kan endre miRNA uttrykk og /eller modning [14], [15].
En studie har systematisk identifisert 323 SNP i 227 kjente menneskelige mirnas, og 12 SNPs er plassert innenfor miRNA forløpere [14]. SNP rs895819 ligger i løkke av
pre-MIR-27a Hotell og innebærer en A G nukleotid overgang. Sun
et al.
[16] rapporterte polymorfisme kan føre til prosessen variasjon, høyere uttrykk av MIR-27a og til slutt predisposisjon for magekreft [16]. Mens Yang
et al.
[17] fant at G allel av rs895819 kan svekke modningen av MIR-27a, og dermed var assosiert med redusert familiær brystkreft. Videre Mertens-Talcott
et al.
Rapportert at i brystkreftceller, transfeksjon av anti MIR-27a fører til økt uttrykk av sink finger og BTB domene som inneholder 10 (ZBTB10) (en antatt Sp repressor) og disse svarene ble ledsaget av redusert uttrykk for Sp avhengig overlevelse og angiogene gener, inkludert
survivin
, vaskulær endotelial vekstfaktor (
VEGF
) og VEGF reseptor 1 (
VEGFR1
) [18]. Men over-uttrykk for survivin ble hyppig observert i ulike typer kreft, inkludert RCC [19]. Til dags dato er det ingen studie på sammenhengen mellom
pre-MIR-27a
polymorfisme og RCC mottakelighet.
Basert på vår kunnskap om den nye polymorfisme og biologisk funksjon av
speil 27a
, hypotese vi at
pre-MIR-27a
polymorfisme var assosiert med RCC mottakelighet. For å teste denne hypotesen, genotypet vi denne spesielle SNP rs895819 og vurdert sammen med risikoen for RCC i vår pågående case-kontrollstudie i en kinesisk befolkning.
Materialer og metoder
forsøkspersonene
Denne studien omfattet 594 pasienter og 600 kreftfrie kontroller. Alle fag i vår studie er etniske Han-kinesere uten genetisk sammenheng. Alle pasientene ble nylig diagnostisert med histopathologically bekreftet hendelsen RCC. De tilfellene som fikk kjemoterapi eller radioterapi før kirurgi eller hadde annen type kreft ble ekskludert fra studien. Sammenhengende RCC pasienter ble rekruttert mellom mai 2004 og august 2010 på The First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University, Nanjing, Kina. Sykdommen ble klassifisert i henhold til Verdens helseorganisasjons kriterier og iscenesatt i henhold til den amerikanske Joint Committee on Cancer TNM klassifisering. Den Fuhrman skala ble brukt for å vurdere tumoratom klasse [20]. Kontrollene ble rekruttert fra de som søkte helsetjenester i poliklinikker ved samme sykehus. De kreftfrie kontroller ble frekvens matchet etter kjønn og alder (± 5 år) til de tilfeller uten individuelle historie av kreft og familie uten tilknytning til sakene. En guidet spørreskjema om demografiske og livsstilsfaktorer ble administrert gjennom ansikt-til-ansikt intervjuer av trente intervjuere. Hver pasient donert 5 ml blod for genomisk DNA ekstraksjon etter et skriftlig informert samtykke skaffe fra alle fag. Denne studien ble godkjent av Institutional Review Board of Nanjing Medical University.
For overlevelsesanalyse, 296 RCC tilfeller registrert i vår pågående kohort studie fra mai 2004 til oktober 2009 ble brukt. Pasientene ble fulgt opp prospektivt hver 6. måned fra datoen som får en bekreftet diagnose til død eller siste gang med oppfølging. Den maksimale Oppfølgingstiden var 72 måneder (siste oppfølging i august 2010) og median oppfølgingstid var 19,3 måneder.
Genotyping
Genomisk DNA ble isolert fra leukocytter av venøs blod av proteinase K fordøyelse og fenol /kloroform ekstraksjon. Genotyping ble utført med TaqMan SNP genotyping analysen bruker 384-brønnen 7900HT real time PCR System og SDS 2.3 programvare for allel diskriminering (Applied Biosystems, Foster City, California). Sekvensen av primere og prober er oppsummert i tabell S1. Genomisk DNA fra 50 ng og 0,5 x mix (Takara Bio, JPN) ble anvendt for hver reaksjon og amplifisering ble utført under følgende betingelser: 50 ° C i 2 min, 95 ° C i 10 minutter etterfulgt av 45 sykluser med 95 ° C i 15 sekunder og 60 ° C i 1 min. Polymorfismen-analyse ble utført av to personer uavhengig av hverandre på en blindet måte. Omtrent 10% av prøvene ble tilfeldig valgt ut for gjentatt genotyping for validering, og resultatene var 100% konkordant. PCR-produktene av SNP med forskjellige genotyper ble valgt og bekreftet ved direkte sekvensering (figur 1).
(A) Dobbelts topper som er merket med en pil representerte heterozygot genotype TC (AG). (B) enkel topp merket med en pil representert homozygot genotype TT (AA). (C) Enkelt topp merket med en pil representert homozygot genotype CC (GG).
Analyse av HSA-MIR-27a uttrykk
For å ytterligere evaluere sammenhengen mellom HSA-speil 27a uttrykk og rs895819 polymorfisme
in vivo
, ble 25 kirurgisk fjernet normale nyre vevsprøver som inneholder 100% normale celler ved siden av svulster fra pasienter av ulike genotyper samlet. Total RNA ble ekstrahert fra disse prøver ved bruk av Trizol reagens (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) i henhold til produsentens protokoll. Applied Biosystems 7900HT Real Time PCR System ble brukt til å utføre sanntid kvantifisering PCR (Foster City, CA, USA) basert på SYBR-Grønn-metoden (Takara Bio, JPN). Primere som brukes til forsterkning av HSA-MIR-27a mRNA var 5’ACACTCCAGCTGGGTTCACAGTGGCTAAG-3 «(fremover) og 5’TGGTGTCGTGGAGTCG-3» (bakover), og primere for U6 var 5’CTCGCTTCGGCAGCACA-3 «(forover ) og 5’AACGCTTCACGAATTTGCGT-3 «(bakover). Alle reaksjoner ble utført i tre eksemplarer. Brett endringer ble normalisert til uttrykket nivåer av U6.
Statistisk analyse
Forskjeller i fordelingen av utvalgte demografiske variabler og frekvenser av genotyper mellom sakene og kontroller ble evaluert ved hjelp av Student
t
-test (for kontinuerlige variabler) eller Pearsons χ
2-test (for kategoriske variabler). Hardy-Weinberg likevekt (HWE) av kontrollene «genotypefrekvensene ble vurdert av en godhet-of-fit χ
2 test. Sammenhengen mellom SNP rs895819 polymorfisme og RCC risiko ble beregnet ved å beregne odds ratio (ORS) og deres 95% konfidensintervall (CIS) fra ubetinget logistisk regresjonsanalyse med justering for mulige confoundere. Kaplan-Meier metoden, log-rank test, univariate og multivariate Cox regresjonsanalyser ble brukt for å evaluere effektene av
pre-MIR-27a
genotyper på total overlevelse av pasienter med RCC.
P
0,05 ble ansett som statistisk signifikant. Alle de statistiske analysene ble utført med Statistical Analysis System programvare (9.1.3, SAS Institute, Cary, NC, USA) med tosidige
P
verdier. Den statistiske styrken ble beregnet ved hjelp av PS programvare (https://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize).
Results
Characteristics av studiepopulasjonen
Frekvensen distribusjoner av utvalgte demografiske kjennetegn ved sakene og kontroller er vist i tabell 1. Det var ingen forskjell mellom pasienter og kontroller på alder (
P
= 0,642) , body mass index (BMI) (
P
= 0,074), kjønn (
P
= 0,222), røykestatus (
P
= 0,127), pakke-års røyking (
P
= 0,251) og drikke status (
P
= 0,714). Men det var flere hypertensjon pasienter (36,4%) og diabetikere (13,5%) blant de tilfeller enn blant kontrollene (alle
P
0,05). Flertallet av pasientene (84,0%) hadde konvensjonell klarcellet karsinom. Andre pasienter som hadde papillær karsinom, chromophobe karsinom og kategorier ble talt nittifem (16%). Omtrent 63,5% av pasientene i stadium I, 18,4%, 6,7% og 11,4% ble funnet å være i fase II, III og IV, respektivt. I tillegg frekvensene av atom karakterer fra I til IV var 18,2%, 48,0%, 24,7% og 9,1%, henholdsvis.
Association mellom
pre-MIR-27a
polymorfisme og RCC risiko
allel frekvenser og genotype distribusjoner av
pre-MIR-27a
rs895819 polymorfisme i pasienter og kontroller er vist i tabell 2. de observerte genotypefrekvensene i kontrollene var i samsvar med som forventet fra HWE modell (χ
2 = 0,795,
P
= 0,373). Den frekvenser fordeling av G allel betydelig differensiert fra A-allelet blant tilfeller og kontroller (
P
= 0,019). Etter å ha justert for mulige konfunderende faktorer (alder, kjønn, røykestatus, drikking status, høyt blodtrykk og diabetes), logistisk regresjonsanalyse viste at når man sammenligner med AA homozygot, ble AG heterozygote forbundet med en betydelig redusert RCC risiko (justert OR = 0,68, 95% CI = 0,53 til 0,87) og enkeltpersoner med AG /GG genotype hadde også en redusert følsomhet for RCC (justert OR = 0,71, 95% CI = 0,56 til 0,90).
Videre i stratifisert analyse av alder, BMI, kjønn, røykestatus, drikking status, høyt blodtrykk og diabetes, fant vi at den reduserte risikoen var mer uttalt hos yngre personer (justert OR = 0,56, 95% CI = 0,40 til 0,78), personer med BMI≤ 24 (justert OR = 0,67, 95% CI = 0,48 til 0,93), menn (justert OR = 0,66, 95% CI = 0,49 til 0,88), ikke-røykere (justert OR = 0,71, 95% CI = 0,53 til 0,95), ikke-drikkere (justert OR = 0,72, 95% CI = 0,55 til 0,95), individer uten hypertensjon (justert OR = 0,61, 95% CI = 0,46 til 0,81) og fag uten diabetes (justert OR = 0,69, 95% CI = 0,54 -0,88) (tabell 3).
Association mellom
pre-MIR-27a
polymorfisme og kliniske kjennetegn ved RCC
i tillegg sammenhengen mellom
pre-MIR-27a
rs895819 polymorfisme og kliniske kjennetegn ved RCC ble også undersøkt. Resultatene viste at AG /GG genotype var assosiert med redusert følsomhet i lokaliserte klinisk stadium (justert OR = 0,71, 95% CI = 0,55 til 0,91) og lignende effekter ble observert i godt differensiert og dårlig differensiert RCC (justert OR = 0,71, 95% CI = 0,55 til 0,93 for godt differensiert, justert OR = 0,51, 95% CI = 0,28 til 0,93 for dårlig differensiert) (tabell 4).
Interaksjon analyser av rs895819 polymorfisme og risikofaktorer
Vi har vurdert om det var eksistensen av interaksjoner mellom rs895819 polymorfisme og alder, BMI, kjønn, røykestatus, drikking status, høyt blodtrykk og diabetes. Som vist i tabell S2, sammenlignet med personer som var både ≤57 år og AA bærere, ble betydelig redusert risiko observert i de som var ≤57 år med AG /GG genotype (justert OR = 0,57, 95% CI = 0,41 til 0,79) og de som var 57 med både AA og AG /GG genotyper (justert OR = 0,64, 95% CI = 0,46 til 0,89 for AA, justert OR = 0,60, 95% CI = 0,42 til 0,85 for AG /GG). Lignende effekter ble funnet i AG /GG bærere som var 24 kg /m
2, menn, røykere, nondrinkers, individer uten hypertensjon og fag uten diabetes sammenlignet med AA bærere. Vi videre observert rs895819 hadde multiplikative samhandling med alder og hypertensjon (
P
interaksjon = 0,035 for alder og
P
interaksjon = 0,030 for hypertensjon).
i tillegg Kaplan-Meier-kurver og log-rank tester ble brukt for å vurdere sammenhengen mellom genotyper og overlevelse av RCC. Men vi fant ikke rs895819 genotyper å bli assosiert med pasientenes total overlevelse. I den trinnvise Cox regresjon, resultatene antydet at kliniske stadium var den beste prognostisk faktor for overlevelse RCC fulgt av tumor klasse (data ikke vist).
Association of rs895819 polymorfisme med ekspresjonsnivåer av HSA-MIR-27a
Vi har samlet 25 kirurgisk fjernet normale nyre vevsprøver ved siden av svulster med forskjellige genotyper av rs895819, og frekvensen av fordelingen av AA, AG, GG genotypene var henholdsvis 13, 10 og 2,. Vi vurderes nærmere sammenhengen mellom polymorfisme og HSA-MIR-27a uttrykk nivåer ved hjelp av kvantitativ real-time RT-PCR. Prøvene med GG genotype ble tilsatt til prøver av AG genotype for analyse. Men på grunn av små utvalg av GG genotyper, vi fant ikke noen sammenheng mellom rs895819 og uttrykk for HSA-MIR-27a (
P
= 0,08) (data ikke vist). Videre funksjonelle studier ble garantert når vi samles store prøver.
Diskusjoner
I denne studien undersøkte vi sammenhengen mellom
pre-MIR-27a
rs895819 polymorfisme og RCC fare. Vurderer relativt knappe frekvenser av GG genotype og lignende skalaer ORS for heterozygote (AG) og homozygot (GG) likestilling som testes for å observere en ikke-signifikant
P
-verdi av 0,568 foreslå en dominerende modellen, vi kombinert AG og GG genotyper som en dominant genetisk modell i det følgende krets analyse. Vi fant at personer med AG /GG genotyper ble assosiert med en betydelig redusert RCC risiko, sammenlignet med de som bærer AA genotype. I tillegg var effekten enda sterkere hos ikke-røykere, yngre personer, menn og individer uten hypertensjon eller diabetes. Dessuten fagene bærer G allel hadde også en redusert følsomhet for lokaliserte klinisk stadium, godt differensiert og dårlig differensiert RCC. Så vidt vi vet, er dette den første studien å undersøke rollen til
pre-MIR-27a
rs895819 polymorfisme i risikoen for RCC.
I dag økende studier har antydet at miRNAs, som spiller en viktig rolle i fremgang kreft som tumor onkogener eller tumor-suppressorer er involvert i viktige biologiske prosesser, inkludert utvikling, differensiering, apoptose og proliferasjon [12], [21]. Genetiske variasjoner i mirnas har blitt rapportert å være forbundet med mange tumorer slik som brystcancer [22], magekreft [23], kolorektal kreft [24] og lungekreft [15]. Selv SNPs i mirnas har vært mye studert, sammenhengen mellom SNPs i mirnas og nyrecellekreft er fremdeles ukjent. Horikawa
et al.
Definert 7 SNPs i 7 pre-mirnas, og 10 SNPs i 8 pri-mirnas, men ingen av dem hadde en betydelig innflytelse på RCC risiko [25]. Likevel Horikawa
et al.
Antydet at genetisk polymorfisme av miRNA-maskiner gener kan påvirke RCC mottakelighet individuelt og i fellesskap.
SNP rs895819 ble funnet i pre-miRNA regioner av HSA-speil 27a, som var i kromosom 19, og det var plassert i posisjon 40 i forhold til det første nukleotid. Det har blitt rapportert at en variasjon forårsaker strukturell endring i den avgjørende region av miRNA kan påvirke modning og fremgangs miRNA [26], [27]. Vi brukte RNA-fold program for å forutsi den mest stabile sekundærstruktur av
pre-MIR-27a
med to forskjellige sekvenser, men G variant av rs895819 påvirket verken konformasjon eller den frie energien i
pre -miR-27a plakater (data ikke vist). I et ord, behandling og modning av miRNA var mer komplekse og subtile enn spådd. Zeng
et al.
Observert at drosha selektivt spalter RNA hårnåler bærer en stor terminal sløyfe. Når sløyfen er forkortet ved mutasjon eller slettinger, vil modningsprosessen bli svekket [28]. I henhold til den forutsagte struktur av
pre-MIR-27a
, rs895819 er lokalisert i sentrum av terminalen sløyfe, den rs895819 A G overgang kan redusere størrelsen på løkken. Følgelig spalting ved drosha skulle bli blokkert, og modningsprosessen blir dermed hemmet. I konklusjonen, kan rs895819 spille en viktig rolle i modningen av MIR-27a. Men på grunn av vi bare hadde 2 personer med GG genotyper, fant vi ikke noen sammenheng mellom rs895819 og uttrykk for HSA-MIR-27a, disse funnene må bekreftes av videre studier.
Så vidt vi vet , mange menneskelige miRNA transkripsjoner har målsekvenser i 3′-UTR som mirnas binder og utøver posttranskripsjonelt undertrykkelse. Liu
et al.
Funnet
MIR-27a
fungerer som et onkogen i adenokarsinom i ventrikkel ved å målrette prohibitin [29] og Chintharlapalli
et al.
Antydet at onkogene
MIR-27a
var et mål for kreft agent i tykktarm kreft celler [30]. Våre resultater viste at den ville genotype AA av
før Anmeldelser –
MIR-27a
hadde høyere frekvens i tilfeller enn i kontrollene, mens enkeltpersoner bærer variant G allel hadde redusert RCC risiko, noe som indikerer at
MIR-27a
var mer sannsynlig å være et onkogen, som var i samsvar med tidligere studier [29], [30]. Mertens-Talcott
mfl.
Rapportert at i brystkreftceller, transfeksjon av antisense MIR-27a fører til økt uttrykk ZBTB10 og disse svarene ble ledsaget av redusert uttrykk for
survivin
, Videre Survivin er et strukturelt enestående medlem av inhibitoren av apoptose proteinfamilie som undertrykker apoptose og regulerer celledeling. Til tross for den redundans av celledødsveier, synes Survivin å være nødvendig for kreftcellelevedyktighet, og interferens med Survivin ekspresjon /funksjon har vært forbundet med katastrofale defekter av mitotisk overgang og induksjon av mitokondriell-indusert celledød [31]. Over-ekspresjon av Survivin mRNA og protein ble detektert i RCC-cellelinjer, men ikke i normale humane nyre epitelcellelinje [19]. Forhøyet ekspresjon av Survivin ble også observert i RCC-vev, sammenlignet med tilstøtende normalt vev [19], [32]. RCC-pasienter med høye nivåer Survivin hadde en vesentlig kortere total overlevelse tid enn de med lave nivåer [33], [34]. Med andre ord, redusert MIR-27a nivåer kan redusere forekomsten av RCC gjennom undertrykke ekspresjon av survivn indirekte. Det var derfor vi fokusere på
pre-MIR-27a
polymorfisme i RCC pasienter.
I denne studien var det flere hypertensjon pasienter og diabetikere blant sakene enn blant kontrollene, noe som indikerer at det var mulig sammenheng mellom de to faktorer og RCC. Vi fant også at rs895819 hadde multiplikative samhandling med hypertensjon. Det har blitt rapportert at visse typer nyresvulster og kreftbehandling kan føre til høyt blodtrykk [35], [36] og en historie med diabetes har vært knyttet til nyrecellekreft i flere kohortstudier [37], men dens rolle uavhengig av de av fedme og hypertensjon er ikke vist entydig. Dessuten våre resultater viste at personer med G-allelet har redusert RCC risiko hos ikke-røykere. Sigarettrøyking er den mest konsekvent etablert årsaks risikofaktor for RCC, og står for ca 20% av tilfellene av RCC [38]. Sammenlignet med aldri-røykere, risikoen økt ca 50% hos mannlige og 20% hos kvinnelige røykere [39]. Videre, etter stratifisering for RCC klinisk stadium, det viste seg at rs895819 GG genotype hadde en redusert risiko for RCC med lokalisert klinisk stadium. Dermed var det sannsynlig at variasjonen var involvert i de lavere stadium RCC. Imidlertid må denne hypotesen bekreftes i videre studier.
Når det gjelder sammenhengen mellom genotyper og total overlevelse av RCC, var det ingen signifikant resultat. Årsaken til dette avviket kan være at dødeligheten av vår overlevelse analyse er lav på grunn av vår korte oppfølgingstiden og de biologiske mekanismene som ligger bak forekomsten av RCC kan være forskjellige fra de underliggende prognose, og selv om
MIR-27a
polymorfisme er involvert i etiologien av RCC, det betyr ikke nødvendigvis at det påvirker utfallet.
Ved tolkning av resultatene våre, bør flere begrensninger være bekymret. For det første, vår case-control studien var en sykehusbasert studie, og det kunne ikke gi en god representasjon av generelle populasjoner. Ikke desto mindre, G allel frekvens i vår kontroller var lik den som er i den HapMap databasen. Dessuten genotypen distribusjoner av polymorfisme i våre kontroller dannet HWE. Dermed blir valget skjevhet var usannsynlig å være betydelig. Dernest vår utvalgsstørrelsen var relativt liten. Men vi hadde 83% strøm til å oppdage en minimal OR på 0,68 med en eksponering frekvens på 30% under dagens utvalgsstørrelsen. For det tredje, vi gjorde ikke utføre genet-miljø interaksjon analysen på grunn av mangel på detaljert informasjon om miljøfaktorer som yrkesmessig eksponering, kosthold og fysisk aktivitet. Men vår studie hadde også flere sterke sider. For det første, det var den første studien å undersøke sammenhengen mellom
pre-MIR-27a
rs895819 polymorfisme og mottakelighet for RCC. Dernest, vi matchet saker og kontroller etter alder og kjønn, og vi oppnådde resultatene ved justering av alder, kjønn, røyking, drikking status, høyt blodtrykk og diabetes, noe som kan redusere påvirkning av konfunderende faktorer.
I konklusjonen våre resultater forutsatt den første innsikt i bidraget av
pre-MIR-27a
rs895819 polymorfisme til risikoen for RCC i kinesisk befolkning. Selv om foreningen syntes å være statistisk signifikant i vår befolkning, bør disse funnene ytterligere validert av større, helst prospektive studier. For polymorfismer ofte varierer i ulike etniske grupper, er flere studier også nødvendig for å avklare sammenslutning av denne polymorfisme med RCC risiko i ulike etniske befolkningsgrupper.
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1.
Sekvensene av primere og probe brukes til å genotype den rs895819 polymorfisme.
doi: 10,1371 /journal.pone.0046566.s001 plakater (DOC)
Tabell S2.
Interaksjon analyser av rs895819 polymorfi og risikofaktorer.
doi: 10,1371 /journal.pone.0046566.s002 plakater (DOC)
