Abstract
Bakgrunn
Potential xeroderma pigmentosum gruppe D (XPD), også kalt excision reparasjon kryss gratis gruppe to (ERCC2), Lys751Gln og Asp312Asn polymorfismer har vært innblandet i magekreftrisiko mellom ulike etnisiteter.
Metoder
Vi forsøkte å utforske effekten av XPD Lys751Gln og Asp312Asn polymorfismer på mottakelighet for magekreft blant ulike etnisiteter gjennom en systematisk oversikt og meta-analyse. Hver utgangspunktet inkludert artikkelen ble scoret for kvalitetsvurderingen. Ønskelig data ble hentet ut og registrert i databaser. 13 studier ble til slutt kvalifisert for meta-analyse av Lys751Gln polymorfisme og 9 studier for meta-analyse av Asp312Asn polymorfisme. Vi vedtok sannsynligvis passende genetisk modell (recessivt modell) for både Lys751Gln og Asp312Asn polymorfismer. Potensielle kilder til heterogenitet ble oppsøkt via undergruppe og følsomhetsanalyser, og publiseringsskjevheter ble estimert.
Resultater
Statistisk signifikante funn ble tilsynelatende bemerket i asiater, men ikke i kaukasiere for både XPD Lys751Gln og XPD Asp312Asn polymorfismer. En statistisk signifikant funn kan sees i noncardia-type magekreft for XPD Lys751Gln polymorfisme. En statistisk signifikant funn kan også sees i høy kvalitet undergruppe, liten og moderat utvalgsstørrelsen undergruppe, artikler publisert etter 2007, eller PCR-RFLP genotyping gruppen for XPD Asp312Asn polymorfisme.
Konklusjoner
Vår meta-analyse indikerer at XPD Gln751Gln (CC) genotype og Asn312Asn (AA) genotype kan synes å være mer utsatt for magekreft i asiatiske populasjoner men ikke i kaukasiske populasjoner, noe som tyder på at de to genotyper kan være viktige biomarkører av magekreft mottakelighet for asiatiske populasjoner, forutsetningen som må ytterligere bekreftet i godt designede studier mellom ulike etnisiteter. Gln751Gln (CC) genotype kan også være forbundet med magekreft risiko noncardia-type, som også bør bekreftes mellom ulike etniske grupper i fremtiden
Citation. Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, Huang G (2012) Effekten av XPD /ERCC2 Polymorfisme på Gastric Cancer Risk blant ulik etnisitet: en systematisk oversikt og meta-analyse. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10,1371 /journal.pone.0043431
Redaktør: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugal
mottatt: 5 april 2012; Godkjent: 20 juli 2012; Publisert: 13.09.2012
Copyright: © Xue et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet har vært støttet av The National Natural Science Foundation of China (tilskudd 30830038, 30970842, og 81071180); «973» Project (2012CB932604); New Drug Discovery Project (2012ZX09506-001-005); Key Prosjekt of Science and Technology Commission av Shanghai kommune (tilskudd 10JC1410000); og Shanghai Leading akademisk disiplin Project (tilskudd S30203). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Selv om hele verden magekreftforekomst har gått ned, rangerer sin dødelighet fortsatt andre [1]. I Kina, magekreft utgjør enda en av de mest dødelige kreftformer [2]. Som er viden kjent, er smittsomme, kosttilskudd, miljømessige og genetiske faktorer innblandet i mage karsinogenese, men de som utsettes for risikofaktorer som til slutt utvikle magekreft utgjør en mindre andel [3], noe som tyder på at verten genetisk mottakelighet spiller en viktig rolle i mage risikoen kreft blant ulike etnisiteter. Slike forskjellige følsomhet kan forklares delvis ved enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) av følsomme gener mellom forskjellige etniske [4], [5]. Våre tidligere publiserte meta-analyse avisene har gitt ytterligere bevis for slike etnisk mottakelige forskjeller [5], [6].
Det er allment anerkjent at DNA må holde seg stabile til å gjennomføre sine viktige fysiologiske funksjoner, men det er vedvarende sårbare for ulike endogene og /eller eksogene skader og dermed dets sannsynlige mutasjoner kan akkumulere og kreftutvikling kan oppstå på grunn av skadet DNA. DNA-reparasjon system, derimot, spiller en viktig rolle i å opprettholde funksjonene til normale celler og genom integritet gjennom reversering av den skadede DNA [7]. Arvet funksjonelle polymorfismer eller akkumulert mutasjoner av DNA-reparasjonsgener kan påvirke verten kapasitet til å reparere skadet DNA og dermed modulere kreftrisiko [8]. SNP’er av felles DNA-reparasjonsgener er blitt identifisert [9] og demonstrert å være knyttet til sporadisk karsinogenese [10], [11].
Nukleotid excision reparasjon (NER), en av de store DNA-reparasjonsveier hos mennesker , er i stand til å fjerne helix-forvrengt basis lesjoner produsert av ultrafiolett lys (UV) og en rekke kjemiske midler [12]. XPD antas å delta i DNA avvikling under NER og transkripsjon fordi det har enkeltkjedet DNA-avhengig ATPase og 5′-3 «DNA helicase aktivitet [13], [14]. XPD (ERCC2) genet, som ligger på kromosom 19q13.3 omfatter 23 eksoner og dets polymorfismer er tenkt å skape strukturelle endringer av NER sti og innflytelse kreft mottakelighet. De mest undersøkte XPD polymorfismer i foreninger med kreft mottakelighet omfatter en nonsynonymous A C substitusjon i exon 23 forårsaker en lysin (Lys) til glutamin (Gin) substitusjon i kodon 751 (Lys751Gln, rs1052559), en nonsynonymous G En substitusjon i exon 10 fører til en asparaginsyre (Asp) til asparagin (Asn) substitusjon i kodon 312 (Asp312Asn, rs1799793), og en synonymt C A substitusjon i exon 6, mens bevare arginin (R) rest i kodon 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].
i 2005, Huang WY
et al.
publisert den første studien som er involvert i XPD Lys751Gln polymorfisme i forhold til magekreft [16]. Siden den gang har forskere rapporterte sammenslutninger av XPD Lys751Gln, Asp312Asn, og /eller Arg156Arg med mottakelighet for magekreft mellom ulike etniske grupper, men med blandede eller motstridende resultater [17] – [30]. Det er bare en publisert artikkel om Arg156Arg polymorfisme i forhold til magekreft [28]. Hittil har det vært tre relevante publiserte meta-analyse papirer med fokus på XPD polymorfismer [31] – [33]. To artikler var hovedsakelig opptatt av generelle kreft mottakelighet fremfor magekreft mottakelighet i dybden [31], [32], og dermed gi mindre informasjon om sin tilknytning til magekreft risiko. Enda viktigere, de tre meta-analyser [31] – [33] alle mislyktes i å ta i bruk den mest sannsynlige hensiktsmessige genetisk modell, og således de autentiske verdiene av disse statistiske resultater kan bli kompromittert
følgelig sikte på. vår meta-analysen var å utforske, ved hjelp av de mest aktuelle genetiske modell, effekten av XPD polymorfismer på magekreftrisiko mellom ulike etniske grupper og å identifisere mulige kilder til heterogenitet blant de utvalgte studier.
Materialer og metoder
søk Strategi
En systematisk litteratursøk ble utført for artikler om XPD /ERCC2 SNPs assosiert med magekreft risiko. Den MEDLINE, EMBASE databaser, kinesisk Nasjonalt kunnskapsinfrastruktur (CNKI), Web of Science, og BIOSIS databaser ble brukt samtidig med kombinasjonen av begrepene «XPD», «ERCC2», «DNA-reparasjon», «NER», «Lys751Gln», «Asp312Asn», eller «Arg156Arg»; «Genet»; «Polymorfi», «variant» eller «SNP»; og «magekreft», «magekreft», eller «magekreft» frem til desember 2011. Søket ble utført uten noen begrensning på språk. Omfanget av data litteratursøk ble utvidet i henhold til referanselister hentes artikler. De relevante originale artikler ble også søkt manuelt.
Study Utvalg
Studier om sammenslutning av XPD /ERCC2 SNPs (Lys751Gln, Asp312Asn, og /eller Arg156Arg) med magekreftrisiko ble inkludert hvis følgende vilkår var oppfylt: (i) enhver studie beskrev sammenslutning av minst ett av XPD /ERCC2 SNPs med magekreft; (Ii) enhver studie rapporterte tallene for både kontroller og magekrefttilfeller; (Iii) resultatene ble uttrykt som odds ratio (OR) med 95% konfidensintervall (KI); og (iv) studier
metodisk kvalitet Appraisal
For å identifisere studier av høy kvalitet, vi hovedsakelig vedtatt forhåndsdefinerte kriterier for Quality Appraisal opprinnelig foreslått av Thakkinstian var case-control eller nestet case-control seg.
et al product: [34], tilpasset av Camargo
et al product: [35], og videreutviklet av Xue
et al product: [5] -… [7]. Kriteriene (sett i tabell S1 online) dekker troverdighet av kontroller, representativitet av tilfellene, konsolidering av magekreft, genotyping undersøkelse, og foreningen vurdering. Metodisk kvalitet ble uavhengig vurdert av to etterforskere (Lin B og Lu Y). Uenighet ble løst ved diskusjon. Poeng varierte fra den laveste null til den høyeste ti. Artikler med resultatet lavere enn 6,5 ble betraktet som «lav-eller moderat kvalitet» seg, mens de som ikke lavere enn 6,5 ble tenkt på som «høy kvalitet» seg.
Data Extraction
følgende data fra hver artikkel ble hentet: forfattere, utgivelsesår, land, etnisitet deltakere (kategorisert som kaukasiere, asiater, etc.), studiedesign, kilden til kontroller, antall kontroller og av tilfellene, genotyping metode, fordeling av alder og kjønn, Lauren klassifisering (intestinal, diffuse, eller blandet), anatomisk klassifisering (Cardia eller ikke-Cardia kreft), røyking vane, drikking vane og
Helicobacter pylori
infeksjonsstatus.
data~~POS=TRUNC Det ble tatt ut og registrert i to databaser uavhengig av to forskere (Lin B og Lu Y) som var blind for tidsskriftnavn, institusjoner eller fond tilskudd. Avvik mellom disse to etterforskere ble løst av utprøver (Xue H), som deltok i diskusjon med dem og gjort en endelig beslutning.
Statistical Analysis
Alle statistiske analyser ble utført ved hjelp av Stata statistisk programvare (versjon 10.1, STATA Corp, College Station, TX). Tosidige Ps 0,05 ble ansett som statistisk signifikant. Hardy-Weinberg likevekt (HWE) i kontrollene ble beregnet på nytt i vår meta-analyse. Den chi-square egnethets ble brukt til å teste avvik fra HWE (signifikant på 0,05 nivå).
Odds ratio (OR) og 95% konfidensintervall (95% KI) ble brukt for å vurdere styrken på assosiasjoner mellom XPD /ERCC2 SNPs og magekreft risiko. OR
1, OR
2, og OR
3 ble beregnet for genotyper CC versus AA, CA versus AA, og CC versus CA for XPD Lys751Gln polymorfisme; AA versus GG, GA versus GG, og AA versus GA for XPD Asp312Asn polymorfisme; AA versus CC, CA versus CC, og AA versus CA for XPD Arg156Arg polymorfisme, henholdsvis. De parvise forskjeller ble anvendt for å bestemme den mest hensiktsmessige genetisk modell. Hvis OR
1 = OR
3 ≠ 1 og OR
2 = 1, en recessiv modell er foreslått. Hvis OR
1 = OR
2 ≠ 1 og OR
3 = 1, en dominerende modellen er underforstått. Hvis OR
2 = 1 /ELLER
3 ≠ 1 og OR
1 = 1, en komplett overdominant modellen er foreslått. Hvis OR
1 OR
2 1 og OR
1 OR
3 1 eller OR
1 OR
2 1 og OR
1 OR
3 1 er et codominant modell indikert [34]. Ta XPD Lys751Gln polymorfisme som et eksempel for å illustrere det. Hvis en dominerende modellen ble indikert, ble den opprinnelige gruppering kollapset og den nye gruppen av C bærere (CC pluss CA) ble sammenlignet med AA genotype; hvis en recessiv modell ble foreslått, var CC i forhold til gruppen av AA pluss CA; hvis en komplett overdominant modell var underforstått, ble gruppen av CC pluss AA sammenlignet med CA; eller hvis en codominant modell ble antydet, CC ble sammenlignet med CA og med AA, henholdsvis.
Q statistikken ble brukt for å vurdere heterogenitet på tvers av studier inkludert i meta-analysen. I-squared (
Jeg
2) verdi, som representerer variasjon i OR skyldes heterogenitet ble så brukt til å kvantifisere graden av slik mellom-studie heterogenitet [36]. Ifølge nylig publiserte Venezia kriterier [37], «
Jeg
2 25% representerer ingen heterogenitet,
Jeg
2 = 25-50% representerer moderat heterogenitet,
jeg
2 = 50-75% representerer stor heterogenitet, og
jeg
2 75% representerer ekstrem heterogenitet «. avviket mellom-studie Tau-squared (τ
2) verdi ble også brukt til å evaluere mellom-studie varians. En fast effekt-modell, ved hjelp av Mantel-Haenszel (M-H) metode, ble anvendt for å beregne de sammenslåtte ORS når homogenitet eksisterte på basis av Q-test p-verdi ikke mindre enn 0.1.By kontrast, en tilfeldig effekt modell, bruker DerSimonian og Laird metode (D + L), ble brukt om det var heterogenitet basert på Q-test p-verdi mindre enn 0,1. Selv for homogeniteten hos-studier, ble D + L-metoden også benyttes. Meta-regresjonsanalyser og subgruppeanalyser ble brukt til å utforske og kontrollere potensielle kilder til heterogenitet på tvers av studier. Betydningen av sammenslåtte ORS ble testet av Z test (P 0,05 ble betraktet som signifikant)
Sensitivitetsanalyse ble utført, der meta-analyse estimatene ble beregnet etter hvert en studie som blir utelatt i hver sving
Til slutt, publikasjonsskjevhet ble vurdert ved å utføre trakt tomter kvalitativt, og anslått av Begg og Egger tester kvantitativt.
Resultater
Litteratur Search and Study Selection
etter omfattende søking, ble totalt 140 artikler på engelsk og 7 i kinesisk hentet. I vår meta-analyse ble først tatt med til sammen 15 studier [16] – [30] som oppfylte inklusjonskriteriene. De 15 studiene var foreløpig hensiktsmessig å meta-analyse av assosiasjoner med magekreft om XPD SNPs, hvorav 13 studier bekymret XPD Lys751Gln polymorfi [16] – [26], [28], [29], 9 studier bekymret XPD Asp312Asn polymorfisme [17] – [21], [23], [27], [28], [30], og bare en studie opptatt XPD Arg156Arg polymorfisme [28]. En artikkel [23] ble indeksert i både engelsk og kinesisk søking motorer
Tradisjonelt sett noen studie som avvek fra HWE burde vært fjernet.; imidlertid, Minelli C et al. nylig påpekte at studier som synes å avvike fra HWE bør undersøkes nærmere i stedet for bare utelukket med mindre det finnes andre grunner til å tvile på kvaliteten av studien [38]. Til dags dato er det fortsatt usikkert om studier fravikes HWE bør inkluderes eller ekskluderes i å gjennomføre meta-analyse. I vår meta-analyse, 3 studier berørte XPD Lys751Gln polymorphism [16], [25], [29] ble fraveket HWE, og 3 studier bekymret XPD Asp312Asn polymorphism [17], [27], [30] ble også fravikes HWE; Men med tanke på at antall deltakere i disse studiene var stor, og gitt at sensitivitetsanalyser vil bli gjennomført, vi endelig holdt disse studiene i vår meta-analyse
Dermed 13 studier [16] -. [26] , [28], [29] med en total på 6344 kontroller og 2750 veske XPD Lys751Gln polymorfisme, og 9 studier [17] – [21], [23], [27], [28], [30] med 3429 kontroller og 1715 saker for XPD Asp312Asn polymorfisme var slutt kvalifisert for meta-analyse av XPD polymorfismer. De tilsvarende egenskaper ble sett i tabell 1 og tabell 2. flytskjema for litteratursøk og studievalg ble belyst i figur 1.
Generelt Meta-analyse, Meta-regresjon Analyser og Undergruppe Analyser
For XPD Lys751Gln polymorfisme, OR
1 (p-verdi), OR
2 (p-verdi), og OR
3 (p-verdi) var 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369), og 1,02 (p = 0,811), respektivt, neppe insinuating en bestemt modell effekt av putative mottagelig C-allelet. Heterogenitet chi-squared var 29.83 (D.F. = 12), p-verdi var 0.003, og
Jeg
2 var 59,8%. Etter meta-regresjonsanalyse ved hjelp av enkle kovariat (etnisitet sammensatt av kaukasiere, asiater, eller tyrkisk befolkning), p-verdier av koeffisienten t verdi for asiater, hvite, eller tyrkisk befolkning var 0,001, 0,139 og 0,585, henholdsvis; sterkt indikerer at asiater enkelt kovariat kan for det meste utgjøre kilden for heterogenitet på tvers av studier. τ
2 for asiater, kaukasiske, eller tyrkisk befolkning eneste kovariat var 0, 0,09178 og 0,1347, henholdsvis. For asiater eneste kovariat, redusert τ
2 0,1233 til 0, noe som indikerer asiater eneste kovariat kunne utgjøre 100% av kilden til heterogenitet på tvers av studier. Når stratifisert etter etnisitet subgruppeanalyse, OR
1 (p-verdi), OR
2 (p-verdi), og OR
3 (p-verdi) blant asiatiske befolkningen var 2,63 (p = 0,002), 1,14 ( p = 0,653), og 1,51 (p = 0,034), henholdsvis sterkt indikerer en recessiv modell effekt av putative mottakelige C-allelet (OR
1 = OR
3 ≠ 1 og OR
2 = 1).
For XPD Asp312Asn polymorfisme, OR
1 (p-verdi), OR
2 (p-verdi), og OR
3 (p-verdi) var 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549), og 1,47 (p = 0,003), henholdsvis sterkt indikerer en recessiv modell effekt av putative mottakelige A-allel (OR
1 = OR
3 ≠ 1 og OR
2 = 1) . Heterogenitet chi-squared var 9,91 (D.F. = 8), p-verdi var 0,272 og
Jeg
2 var 19,2%, noe som indikerer ingen heterogenitet på tvers av studier. Etter meta-regresjonsanalyse ved hjelp av enkle kovariat (etnisitet sammensatt av kaukasiere eller asiater), p-verdi på koeffisienten t verdi for etnisitet enkelt kovariat var 0,277, noe som indikerer at etnisitet kan utgjøre en av kildene til litt heterogenitet på tvers av studier. τ
2 redusert 0,0354 til 0,02075, noe som indikerer etnisitet kunne utgjøre 41,4% av kilden til liten heterogenitet på tvers av studier. Tilsvarende når stratifisert etter etnisitet subgruppeanalyse, OR
1 (p-verdi), OR
2 (p-verdi), og OR
3 (p-verdi) blant asiatiske befolkningen var 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574), og 1,80 (p = 0,008), henholdsvis, noe som ytterligere indikerer en recessiv modell effekt av putative mottakelige A-allel (OR
1 = OR
3 ≠ 1 og OR
2 = 1 ).
til sammen ble en recessiv genetisk modell til slutt valgt for både XPD Lys751Gln og XPD Asp312Asn polymorfismer i vår meta-analyse.
i vår meta-analyse, er de tilgjengelige data var stratifisert, i lys av etniske deltakere, i kaukasiere, asiater, og tyrkiske befolkningen. I figur 2, ble statistisk signifikante funn bemerket i asiater, men ikke i kaukasiere eller tyrkisk befolkning (både XPD Lys751Gln og XPD Asp312Asn polymorfismer). De sammenslåtte ORS (95% CIS, p-verdi) var 2,41 (1,69 til 3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82 til 1,17, p = 0,803), og 0,97 (0,33 til 2,82, p = 0,954) i asiater, hvite, og tyrkiske befolkningen (XPD Lys751Gln polymorfisme i del A) eller 1,77 (1,19 til 2,63, p = 0,005) og 1,31 (0,86 til 1,99, p = 0,211) i henholdsvis asiatere og kaukasiere (XPD Asp312Asn polymorfisme i del B),. Som for XPD Lys751Gln polymorfisme, P-verdiene av heterogenitet Q-statistikken i kaukasiere, asiater, og tyrkiske befolkningen var 0,802, 0,701 og 0,045;
Jeg
2 var 0,0%, 0,0% og 75,1%; og τ
2 var 0,0000, 0,0000 og 0,4489, henholdsvis, viser ingen heterogenitet innen kaukasiere eller asiater, men ekstrem heterogenitet innen tyrkiske befolkningen (vist i tabell 3). Som for XPD Asp312Asn polymorfisme, P-verdiene av heterogenitet Q-statistikken i kaukasiere og asiater var 0,180 og 0,470;
Jeg
2 var 41,6% og 0,0%; andτ
2 var 0,0587 og 0,0000, henholdsvis, viser ingen heterogenitet innen asiater, men moderat heterogenitet innen kaukasiere (vist i tabell 4).
Studier ble inngått meta-analyse sekvensielt etter utgivelsesår. Størrelsen på rutene indikerer den relative vekten av hver studie. Vekter ble avledet fra tilfeldig effekt-analyse. Barer, 95% konfidensintervall (KI). A) XPD Lys751Gln polymorfisme i forbindelse med magekreft; B) XPD Asp312Asn polymorfisme i forbindelse med magekreft.
Som vist i tabell 3 og tabell 4, spesifikke data for XPD Lys751Gln og XPD Asp312Asn polymorfismer var stratifisert, henholdsvis på basis av prøvestørrelsen, inn i to undergrupper: stor prøve (totalt antall kontroller og tilfeller ikke mindre enn 500) og liten og moderat prøve (totalt antall kontroller og tilfeller mindre enn 500) undergrupper. Ingen statistisk signifikant funn ble registrert i enten små-og-moderat prøvegruppen eller store prøven motpart for XPD Lys751Gln polymorfisme, gitt at de samlede ORS (95% CIS, p-verdi) var 0,96 (0,61 til 1,51, p = 0,858) for tidligere og 1,17 (0,84 til 1,64, p = 0,351) for det sistnevnte, henholdsvis; imidlertid en statistisk signifikant funn ble notert i små og moderate prøvegruppen, men ikke i stort utvalg motpart for Asp312Asn polymorfisme, gitt at de samlede ORS (95% CIS, p-verdi) var 1,74 (1,18 til 2,56, p = 0,005) for tidligere og 1,35 (0,82 til 2,21, p = 0,239) for sistnevnte, henholdsvis.
dataene var også stratifisert, i samsvar med kvalitet avgrensnings score, i høy kvalitet (score ikke mindre enn 6,5) og lav og moderat kvalitet (score mindre enn 6,5) undergrupper. Som for XPD Lys751Gln polymorfisme, ble ingen statistisk signifikant funn sett i enten høy kvalitet undergruppe eller lav og moderat kvalitet motstykke, gitt at de samlede ORS (95% CIS, p-verdi) var 1,20 (0,91 til 1,60, p = 0,199) for det tidligere og 0,61 (0,34 til 1,11, p = 0,104) for det sistnevnte. Når etnisitet sub-stratifisering ble utført etter høy kvalitet undergruppe, ble en statistisk signifikant funn mye tilsynelatende vitne blant asiater, men ingen statistisk signifikant funn ble registrert blant kaukasiere fordi de sammenslåtte ORS (95% CIS, p-verdi) var 2,54 (1,77 til 3,65, p = 0,000) for det førstnevnte, og 0,98 (0,82 til 1,17, p = 0,803) for det sistnevnte, respektivt. Som for Asp312Asn polymorfisme, ble en statistisk signifikant funn sett i høy kvalitet undergruppe, men ikke i lav og moderat kvalitet motstykke, gitt at de samlede ORS (95% CIS, p-verdi) var 1,56 (1,05 til 2,33, p = 0,028) for det tidligere og 1,42 (0,85 til 2,40, p = 0,184) for det sistnevnte. Likeledes når etnisitet sub-stratifisering ble utført etter høy kvalitet undergruppe, en statistisk signifikant funn ble mye tilsynelatende vitne blant asiater, men ingen statistisk signifikant funn ble registrert blant kaukasiere fordi de sammenslåtte ORS (95% CIS, p-verdi) var 2,37 (1.29- 4,36, p = 0,005) for det tidligere og 1,31 (0,86 til 1,99, p = 0,211) for sistnevnte, henholdsvis.
dataene var også stratifisert, i tråd med publikasjonen tid, inn i tidligere publikasjon undergruppe ( artikler publisert før eller i 2007) og senere publisering gruppen (artikler publisert etter 2007). Som for XPD Lys751Gln polymorfisme, ingen statistisk signifikante funn ble observert med den begrunnelse at de samlede ORS (95% CIS, p-verdi) var 0,89 (0,66 til 1,19, p = 0,428) i det tidligere og 1,23 (0,84 til 1,81, p = 0,285) i det sistnevnte, respektivt. Som for Asp312Asn polymorfisme, ble en statistisk signifikant funn observert i senere publikasjon gruppen, men ikke i den tidligere publikasjon gruppen med den begrunnelse at de samlede ORS (95% CIS, p-verdi) var 1,46 (1.2 til 2.9, p = 0,041) i førstnevnte, og 1,61 (0,89 til 2,92, p = 0,115) i det sistnevnte, respektivt.
Når magekreft ble klassifisert inn i ikke-cardia (eller distal) og cardia subtyper, en statistisk signifikant funn ble funnet blant non -cardia type, men ikke blant Cardia type for XPD Lys751Gln polymorfisme med den begrunnelse at de samlede ORS (95% CIS, p-verdi) var 2,03 (1,16 til 3,54, p = 0,013) blant ikke-Cardia type og 0,88 (0,66 til 1,18, p = 0,403) mellom Cardia type. Som for Asp312Asn polymorfisme, ble ingen statistisk signifikant funn observert blant Cardia typen med den begrunnelse at den sammenslåtte OR (95% CIS, p-verdi) var 0,89 (0,56 til 1,43, p = 0,642), men OR (95% CIS, p-verdi ) om ikke-Cardia typen kan ikke beregnes fordi bare én studie [21] tydelig nevnt antall genotyper av ikke-Cardia type.
Når det gjelder patologi, magekreft kan deles inn i tarm, diffuse, eller blandet subtyper, men bare en studie [19] tydelig behandlet og nevnte antall genotyper av diffus subtype kreft; dermed patologisk subtype lagdelingen ikke kunne gjøres i vår meta-analyse.
Medvirkende årsaker som for eksempel
Helicobacter pylori
infeksjon eller røykestatus kunne ikke analyseres i vår meta-analyse fordi nødvendige relevante data for minst to studiene kunne ikke være tilgjengelig i vår meta-analyse.
Og da genotyping teknikker ble vurdert, ingen statistisk signifikant funn ble notert i hver genotyping teknikk undergruppe for XPD Lys751Gln polymorfisme fordi sammenslått ORS (95% CIS, p-verdi) var 0,94 (0,68 til 1,29, p = 0,701) og 1,67 (0,68 til 4,14, p = 0,265) i RFLP og TagMan undergrupper, henholdsvis; imidlertid en statistisk signifikant funn ble notert i RFLP genotyping undergruppe, men ikke i direkte sekvensegruppen for Asp312Asn polymorfisme fordi sammenslåtte ORS (95% CIS, p-verdi) var 1,90 (01.09 til 03.31, p = 0,023) og 1,24 (0,70 til 2,20, p = 0.450), ble henholdsvis.
Sensitivity Analysis
Metaanalyser analyser~~POS=HEADCOMP utført gjentatte ganger når hvert enkelt studie hadde blitt fjernet. Resultatene indikerte at tilfeldig effekt-estimater før og etter sletting av hver studie var lik for øvrig, noe som tyder på moderat høy stabilitet av meta-analyse resultater. For XPD Lys751Gln polymorfisme, som vist i figur 3, del A, den mest påvirkning enkelt studie på den totale samlede anslagene syntes å være den studie utført av lang XD et al. [25], sammentreffet avvek fra HWE, sensitivitetsanalysen indikerte imidlertid moderat høy stabilitet av resultatene fra de fakta som ORS (95% KI, p-verdi) var 1,12 (0,85 til 1,48, p = 0,410) før fjerning av denne studien og 0,98 (0,83 til 1,15, p = 0,781) etter fjerning av den undersøkelsen. I lys av studien [16] ble utført av Huang WY et al. som avviker fra HWE, ORS (95% CI, p-verdi) var 1,12 (0,85 til 1,48, p = 0,410) før fjerning av den studien og 1,17 (0,87 til 1,58, p = 0,309) etter fjerning av den studien for alle etnisk, noe som indikerer høy stabilitet av resultatene. Tilsvarende, etter fjerning av studien [29] ble utført av Engin AB et al., Også avvek fra HWE, OR (95% CI, p-verdi) ble 1,19 (0,91 til 1,57, p = 0,209) for alle etnisk, indikerer høy stabilitet av resultatene. Hvis alle tre merkelig-Hwe studier [16], [25], [29] ble fjernet, OR (95% CI, p-verdi) ble 1,06 (0,88 til 1,28, p = 0,555) for alle etnisk, noe som indikerer moderat høy stabilitet av resultatene (All illustrerer tallene ble utelatt på grunn av lengden av papiret).
resultatene ble beregnet ved å utelate hver studie (på venstre side) etter tur. Barer, 95% konfidensintervall. Meta-analyse tilfeldig effekt-estimater (eksponentiell form) ble brukt. A) Innflytelse analyse av sammendraget odds ratio koeffisienter på foreningen for XPD Lys751Gln polymorfisme med magekreft risiko; B) Innflytelse analyse av sammendraget odds ratio koeffisienter på foreningen for XPD Asp312Asn polymorfisme med magekreftrisiko.
For Asp312Asn polymorfisme, som vist i Figur 3 del B, den mest påvirkning enkelt studie på ordnede samlede estimater syntes å være studie utført av Chen Z et al. [28], sensitivitetsanalysen indikerte imidlertid moderat høy stabilitet av resultatene fra de fakta som ORS (95% KI, p-verdi) var 1,48 (1,12 til 1,97, p = 0,007) før fjerning av den studien og 1,32 (1,04 til 1,70, p = 0,025) etter fjerning av den undersøkelsen. Hvis alle tre merkelig-Hwe studier [17], [27], [30] ble fjernet, OR (95% CI, p-verdi) ble 1,56 (1,05 til 2,33, p = 0,028) for alle etnisk, også indikerer moderat høy stabilitet av resultatene (de illustrerer tallene ble utelatt på grunn av lengden på papiret).
Akkumulert Meta-analyse
Akkumulert meta-analyser av XPD Lys751Gln polymorfisme foreningen ble også gjennomført blant asiater og kaukasiere via utvalg av publikasjonen tid og totalt antall utvalgsstørrelse. Som vist i Figur 4 del A, kunne dragning mot signifikante sammenhenger for XPD Lys751Gln polymorfisme sees blant asiater. I figur 4 del B tilbøyeligheter mot null foreninger for XPD Lys751Gln polymorfisme kunne noteres blant kaukasiere i kronologisk rekkefølge. Lignende tilbøyeligheter kunne observeres for Asp312Asn polymorfisme mellom ulike etnisitet populasjoner (Tall ikke vist)
A) blant asiater.; B) blant kaukasiere.
publikasjonsskjevhet Analyse
publiseringsskjevheter ble preliminært undersøkt av trakt tomter kvalitativt og anslått av Begg og Egger tester kvantitativt. For XPD Lys751Gln polymorfisme, sin trakt plott (figur 5A) viste at prikker nesten symmetrisk fordelt, hovedsakelig innen pseudo 95% konfidensintervall. P-verdiene var 0,428 og 0,989 i Begg test og Egger test henholdsvis insinuerer ingen publikasjonsskjevhet. For Asp312Asn polymorfisme, sin trakt plott (figur 5B) viste at prikker nesten symmetrisk fordelt, hovedsakelig innen pseudo 95% konfidensintervall. P-verdiene var 0,108 og 0,045 i Begg test og Egger test henholdsvis insinuerer ingen eller litt publikasjonsskjevhet
Merk:. Trakt tomt med pseudo 95% konfidensintervall ble brukt. A) trakt tomt på publikasjonsskjevhet for XPD Lys751Gln polymorfisme; B) Trakt tomt på publikasjonsskjevhet for XPD Asp312Asn polymorfisme.
Diskusjoner
I vår meta-analyse statistisk signifikante funn ble tilsynelatende bemerket i asiater, men ikke i kaukasiere for både XPD Lys751Gln og XPD Asp312Asn polymorfismer. Også basert på resultatene av kumulative meta-analyser, kunne dragning mot signifikante sammenhenger i asiater for både XPD Lys751Gln og XPD Asp312Asn polymorfismer bli åpenbart sett når sortert etter publiserings og total utvalgsstørrelse. XPD Gln751Gln (CC) og Asn312Asn (AA) genotyper kan synes å være mer utsatt for magekreft i asiater.
