PLoS ONE: programmert celledød-en Polymorfisme Reduser Cancer Risk: A Meta-Analysis Involvering tolv Case-kontroll Studies

Abstract

programmert celledød-en (

PD-1

) spiller en viktig rolle i inhiberende antitumorrespons, slik at det anses som et kraftig kandidat-gen for individets genetisk disposisjon for kreft. Nylig har noen epidemiologiske studier evaluert sammenhengen mellom

PD-1

polymorfismer og kreftrisiko. Men resultatene fra studiene er i konflikt. Derfor ble en meta-analyse utført. Vi identifiserte alle studier som rapporterer forholdet mellom

PD-1

polymorfismer og kreft ved elektronisk søker. Ifølge inklusjonskriteriene og kvalitetsvurdering av Newcastle-Ottawa Scale (NOS), ble kun høykvalitets studier inkludert. Totalt tolv relevante studier med 5,206 tilfeller og 5,174 kontroller ble rekruttert. For

PD-1

.

5 product: (rs2227981) polymorfisme, betydelig redusert kreftrisiko ble oppnådd blant befolkningen generelt, asiater undergruppe og populasjonsbasert gruppen både i TT vs. CC og TT vs. CT + CC genetiske modeller. I tillegg ble et lignende resultat også funnet i T vs. C-allel for den generelle befolkning. Men det var ingen signifikante assosiasjoner mellom enten

PD-1

.

ni plakater (rs2227982) eller

PD-1

rs7421861 polymorfismer og kreftrisiko i alle genetiske modeller og alleler . For

PD-1

.

3 plakater (rs11568821) polymorfisme, fant vi forskjellige kreft mottakelighet mellom GA vs GG og AA vs AG + GG genetiske modeller, og ingen assosiasjoner mellom AA vs. GG, AA + AG vs. GG genetiske modeller eller A vs G allel og kreftrisiko. Generelt våre resultater først indikert at

PD-1

.

5 product: (rs2227981) polymorfisme er knyttet et sterkt redusert risiko for kreft. Andre epidemiologiske studier er nødvendig for å bekrefte våre funn

Citation. Dong W, Gong M, Shi Z, Xiao J, Zhang J, Peng J (2016) programmert celledød-en Polymorfisme Reduser Cancer Risk: A Meta-Analysis Involvering Tolv kasus-kontrollstudier. PLoS ONE 11 (3): e0152448. doi: 10,1371 /journal.pone.0152448

Redaktør: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, USA

mottatt: 16 januar 2016; Godkjent: 14 mars 2016; Publisert: 31 mars 2016

Copyright: © 2016 Dong et al. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Data Tilgjengelighet:. All relevant data er innenfor papir- og saksdokumenter filer

finansiering:.. forfatterne har ingen støtte eller finansiering for å rapportere

konkurrerende interesser:. forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer

Innledning

programmert celledød-en (

PD-1

), et medlem av CD28 /B7 super av samtidig stimulerende molekyler, uttrykkes på aktiverte CD4 + og CD8 + T-celler, naturlig drepe-T (NKT) celler, B-celler, aktiverte monocytter og noen dendrittisk celle (DC) [1]. Den menneskelige genet som koder for

PD-1

ligger på kromosom 2q37.3, som koder for et 50-55 kD type I transmembranous glykoprotein protein [2, 3].

PD-1

er besto av en immunoglobulin-lignende ekstracellulært domene, og en cytoplasmaområde inneholder en immunoreceptor tyrosin-basert hemmende motiv (ITIM) og immunoreceptor tyrosin-baserte bryter motiv (ITSM) [4].

PD-1

har blitt godt karakterisert som en negativ regulator av T-celler, og når det vekselvirker med sine to ligander PD-L1 (B7-H1) og PD-L2 (B7-DC), den kan sterkt hemme både proliferasjon og cytokinproduksjon av CD4 og CD8 T-lymfocytter [5, 6]. PD-L1 er blitt rapportert å bli uttrykt på en rekke tumor vev eller cellelinjer, inkludert brystkreft, livmorkreft, magekreft, kreft i spiserøret og laryngocarcinoma [7-11]. I tillegg

PD-1

er viktigere involvert i reguleringen av regulatoriske T-celler (Treg) funksjon hos kreftpasienter. Nylig har noen studier vist en direkte sammenheng mellom

PD-1

blokade og nedregulering av intracellulær foxp3 uttrykk ved treg til å rette immun flukt i ulike typer svulster [12-14]. Basert på den hemmende rolle

PD-1

i anti-tumorrespons, vi vurderte

PD-1

genet (Gene bank-ID: 5133) som en kraftig kandidat for genetiske mottakelighet av individer til kreft. Tidligere, de fleste studier undersøkt om sammenhengen mellom

PD-1

polymorfismer og flere autoimmune sykdommer, inkludert type 1 diabetes (T1D), Bekhterevs sykdom (AS), SLE og revmatoid artritt (RA) [15-18 ]. I de senere årene, har noen studier er endret fokus på rollen som

PD-1

polymorfismer i ulike typer kreftpasienter. Hittil har flere enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) er rapportert for

PD-1

mottakelighet for kreft i litteraturen, for eksempel

PD-1

.

5 product: ( rs2227981),

PD-1

.

ni plakater (rs2227982),

PD-1

rs7421861 og

PD-1

.

3

(rs11568821) et al. Imidlertid er sammenhengen mellom

PD-1

polymorfismer og kreftrisiko inkonsekvent. For å avklare dette spørsmålet, utførte vi en meta-analyse fra alle kvalifiserte studier for å vurdere sammenslutning av

PD-1

polymorfisme med kreftrisiko.

Materialer og metoder

Primær søkestrategi og inklusjonskriterier

Vi identifiserte alle studier som rapporterer forholdet mellom

PD-1

polymorfismer og kreft utgitt før 22 desember 2015 med elektronisk søker. Databasene inkluderer Pubmed, EMBASE, Cochrane Library database, Google Scholar, China National Knowledge Infrastructure (CNKI) og Wan Fang. Søkestrategier var basert på en kombinasjon av de følgende stikkord: ( » programmert død-1 «eller »

PD-1

«) og ( « «kreft» og» «carcinoma «) og (« «gen» eller » allel «eller » genotype» eller » mutasjon «eller » variant» eller » variant «eller » polymorfisme»), uten noen begrensning på språk. Referanselistene av anmeldelser og hentet artiklene ble også søkt med hånden for flere artikler. Vi hadde ikke melde sammendrag eller upubliserte studier. For inkludering, må studiene har oppfylt følgende kriterier: (1) studerte på mennesker; (2) klar målsetting i forholdet mellom

PD-1

polymorfismer og kreft; (3) case-control studie, uavhengig av utvalgsstørrelse, ved hjelp av et sykehusbasert eller en populasjonsbasert design; (4) tilstrekkelig publiserte data om størrelsen på utvalget, odds ratio (OR), og deres 95% konfidensintervall (CIS).

Data Extraction

Data ble nøye og uavhengig hentet fra alle kvalifiserte publikasjoner av tre av forfatterne (Wenjing Dong, Zhirong Shi og Jianjun Xiao). Enhver uenighet ble løst ved diskusjon blant forfatterne. Alle kvalifiserte data ble oppført i tabell 1: etternavn på første forfatter, publiseringsdato, kvalitetspoeng, etnisitet, kilder til kontroller, antall saker og kontroller og P verdien av Hardy-Weinberg likevekt (

HWE

). Ulike etniske grupper ble kategorisert som asiatisk og kaukasisk. Studiedesign ble stratifisert til populasjonsbaserte studier og sykehusbaserte studier.

Kvalitetsvurdering

Tre forfattere (Wenjing Dong, Zhirong Shi og Jianjun Xiao) vurderte studiekvaliteten uavhengig ved hjelp Newcastle-Ottawa Scale som er en stjerne rating system [19]. Ni stjerner defineres som full score, og fem til ni stjerner er vanligvis ansett for å være en høy metodisk kvalitet, mens 0 til 4 stjerner er ansett for å være en dårlig kvalitet [20]. Kvaliteten på alle registrerte studier ble vist i Tabell 2. Eventuelle uenigheter på NOS poengsum av studiene ble løst ved diskusjon mellom forfatterne og vår meta-analyse bare registrert studier av høy kvalitet.

Statistisk analyse

Crude ORS med tilsvarende 95% CI’er ble brukt til å beregne styrken på sammenhengen mellom

PD-1

polymorfismer og kreftrisiko. Betydningen av den samlede OR ble bestemt av

Z

test og

P plakater (tosidige) 0,05 ble ansett som statistisk signifikant. Hardy-Weinberg likevekt (

HWE

) i kontrollene ble beregnet ved chi-kvadrat test og

P

0,05 betydde en avgang fra

HWE

. Mellom-studie heterogenitet ble beregnet av

Jeg

2

test. Hvis heterogenitet var statistisk signifikant (

Jeg

2

50%) [21], en tilfeldig effekt modellen (DerSimonian og Laird metode) [22] ble brukt; ellers, ble en fast effekt modellen (Mantel-Haenszel metode) [23] brukt. Subgruppeanalyser ble utført av etnisitet og kontrollkilder. Trakten tomten og Egger test ble begge brukt til å undersøke publikasjonsskjevhet. For tolkningen av Egger test, ble statistisk signifikans definert som

P

0,05 [24] sikret statistisk analyse ble utført med STATA statistisk programvare (versjon 12.0, Stata Corporation, College Station, TX, USA).

Resultater

Studie egenskaper

Fem hundre og sekstiåtte studier ble hentet etter å ha søkt og screening basert på vårt litteratursøk strategi. Det var 18 studier igjen når de irrelevante studiene ble ekskludert. Av disse hadde 14 studier analysert sammenhengen mellom

PD-1

polymorfismer og kreft. Etter datauttrekk, ble en artikkel [25] ekskludert på grunn av uten kontrollgruppe mens en annen [26] ble ekskludert som diskutert om svangerskaps trofoblastisk svulster, som inneholder både godartede og ondartede svulster. Derfor fikk vi 12 relevante studier som undersøkte sammenhengen mellom

PD-1

polymorfismer og kreftrisiko (fig 1) [27-38]. Alle av dem ble evaluert av Newcastle-Ottawa Scale og møtte høy kvalitet (tabell 2). Samlet er meta-analysen inkluderte 5,206 kreftpasienter og 5,174 kontroller fra 12 artikler. Opplysningene hentet fra alle kvalifiserte artikler ble oppsummert i tabell 1. Alle artikler vi inkluderte var case-kontrollstudier. Blant disse er brystkreft, magekreft, kolorektal kreft og lungekreft studert av to artikler, respektivt. Resten fire studiene er colon, esophageal, cervical og leverkreft studien, henholdsvis. Ut av de 12 studiene, 7 studier fokusert på

PD-1

.

5 plakater (rs2227981), mens

PD-1

.

9

(rs2227982),

PD-1

rs7421861 og

PD-1

.

3 plakater (rs11568821) ble alt diskutert i 4 studiene. Blant de 12 studiene som inngår i meta-analysen, var det 11 studier av asiater og en studie med kaukasiske. Ifølge styrekilde, bare 4 var sykehusbaserte undersøkelser, resten 8 var populasjonsbaserte undersøkelser.

PD-1

.

5 product: ( rs2227981)

data~~POS=TRUNC fra syv studier som blant 3,395 saker og 2,912 kontroller undersøkt om

PD-1

.

5 product: (rs2227981) ble slått sammen. Seks av studiene var populasjonsbasert og bare én studie ble sykehusbasert. Ifølge etnisitet ble seks artikler undersøkt om asiater og en studie var om kaukasiere. Vi gjennomførte analyser for alle genetiske modeller og allelet i samlet gruppe, asiater undergruppe og populasjonsbasert gruppen. Samlet vi fått betydelig redusert kreftrisiko både i TT vs. CC (OR = 0,72, 95% CI’er: 0,62 til 0,85, P = 0,000,

Jeg

2

= 14,0 %), TT vs. CT + CC (OR = 0,75, 95% CI’er: 0,65 til 0,87, P = 0,000,

jeg

2

= 0,0%) genetiske modeller og T vs C (OR = 0,88, 95% CI’er: 0,78 til 0,99, P = 0,04,

jeg

2

= 53,6%) allel. Det ble imidlertid ingen dramatiske assosiasjoner funnet i andre genetiske modeller (TT + CT vs. CC: OR = 0,91, 95% cis: 0,75 til 1,10, P = 0,343,

Jeg

2

= 65,6%; TC vs. CC: OR = 0,97, 95% CI’er: 0,78 til 1,19, P = 0,759,

jeg

2

= 68,2%) ( fig 2). Når stratifisert etter etnisitet, ble lignende resultater oppnådd i asiater undergruppe. Kreftrisiko ble betydelig redusert i TT vs. CC (OR = 0,75, 95% CI’er: 0,61 til 0,92, P = 0,006,

Jeg

2

= 24,1%) og TT vs. CT + CC (OR = 0,75, 95% CI’er: 0,62 til 092, P = 0,005,

jeg

2

= 10,8%) genetiske modeller. Det var ingen signifikante assosiasjoner i TT + CT vs. CC (OR = 0,94, 95% cis: 0,74 til 1,20 P = 0,625,

Jeg

2

= 69,9%), TC vs. CC (OR = 0,99, 95% CI’er: 0,76 til 1,30, P = 0,959,

jeg

2

= 72,4%) og T vs. C (OR = 0,90, 95% cis: 0,77 til 1,05, P = 0,190,

jeg

2

= 59,1%) (figur 3). Når regnet som kilden til kontrollgruppene, har vi gjennomført analyser i populasjonsbasert gruppen. Også redusert kreftrisiko ble funnet i TT vs. CC (OR = 0,71, 95% CI’er: 0,61 til 0,84, P = 0,000,

Jeg

2

= 7,5%) , TT vs. CT + CC (OR = 0,74, 95% CI’er: 0,64 til 0,86, P = 0,000,

jeg

2

= 1,9%) og T vs C (OR = 0,84, 95% cis: 0,78 til 0,91, P = 0,000,

jeg

2

= 26,5%). Men fortsatt vi hadde observert noen signifikante assosiasjoner i TT + CT vs. CC (OR = 0,85, 95% CI’er: 0,72 til 1,00, P = 0,054,

Jeg

2

= 52,0%) og TC vs. CC (OR = 0,91, 95% cis: 0.75-1.10, p = 0,335,

jeg

2

= 61,5%) (fig 4 ).

de torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke ORS og 95% CIS. Områdene av kvadratene reflektere studien-spesifikke vekter (som var den inverse av variansen). Diamantene representerer de samlede ORS og 95% CIS.

De torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke ORS og 95% CIS. Områdene av kvadratene reflektere studien-spesifikke vekter (som var den inverse av variansen). Diamantene representerer de samlede ORS og 95% CIS.

De torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke ORS og 95% CIS. Områdene av kvadratene reflektere studien-spesifikke vekter (som var den inverse av variansen). Diamantene representerer de samlede ORS og 95% CIS.

PD-1

.

ni plakater (rs2227982) og

PD-1

rs7421861

PD-1

.

ni plakater (rs2227982) og

PD-1

rs7421861 polymorfismer ble både diskutert i fire studier, som blant annet 1961 og 1,975 saker, og 2,390 og 2,403 kontroller, henholdsvis. Totalt sett var det ingen signifikant sammenheng mellom enten

PD-1

.

ni plakater (rs2227982) (figur 5) eller

PD-1

rs7421861 (fig 6) og kreft i alle genetiske modeller og allel (

PD-1

9

. TT vs. CC: OR = 1,10, 95% cis: 0,84 til 1,45, p = 0,487,

i

2

= 52,4%; TT vs. CT + CC: OR = 1,04, 95% CI’er: 0,89 til 1,21, P = 0,609,

jeg

2

= 15,5%; TT + CT vs. CC: OR = 1,06, 95% CI’er: 0,93 til 1,22, P = 0,399,

jeg

2

= 41,6%; TC vs. CC: OR = 1,04, 95% CI’er: 0,90 til 1,20, P = 0,595,

jeg

2

= 25,8%; T vs. C: OR = 1,04, 95% CI’er: 0,95 til 1,14, P = 0,393,

jeg

2

= 41,5%;

PD-1

rs7421861: CC vs TT: OR = 0,86, 95% CI’er: 0,61 til 1,23, P = 0,419,

jeg

2

= 0,0%, CC vs. CT + TT: OR = 0,84, 95% cis: 0,59 til 1,19, P = 0,331,

jeg

2

= 0,0%, CC + CT vs TT: OR = 1,10, 95% cIS : 0,97 til 1,24, P = 0,137,

jeg

2

= 0,0%, CT vs TT: OR = 1,13, 95% CI’er: 0,99 til 1,28, P = 0,072

jeg

2

= 0,0%; C vs. T: OR = 1,06, 95% CI’er: 0,95 til 1,18, P = 0,322,

Jeg

2

= 0,0%). Alle studier om disse to polymorfismer er gjennomført i asiater. Når vedrørende kontrollkilder, er det to sykehusbaserte og to populasjonsbaserte artikler undersøkt om

PD-1

.

ni plakater (rs2227982) polymorfisme, mens tre sykehusbasert og en populasjonsbasert artikkel studert om

PD-1

rs7421861 polymorfisme.

de torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke ORS og 95% CIS. Områdene av kvadratene reflektere studien-spesifikke vekter (som var den inverse av variansen). Diamantene representerer de samlede ORS og 95% CIS.

De torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke ORS og 95% CIS. Områdene av kvadratene reflektere studien-spesifikke vekter (som var den inverse av variansen). Diamantene representerer de samlede ORS og 95% CIS.

PD-1

.

3 plakater (rs11568821)

Det er fire studier inneholder 1,280 saker og 1,236 kontroller diskutert dette polymorfisme. Alle disse studiene er populasjonsbasert og gjennomføres i asiater. Totalt sett en betydelig redusert risiko kreft ble funnet i AG vs. GG genetisk modell (OR = 0,79, 95% CI’er: 0,65 til 0,96, P = 0,021,

Jeg

2

= 0,0%). Interessant nok var en økt kreftrisiko funnet i AA vs AG + GG genetisk modell (OR = 2,25, 95% cis: 1.30-3.87, p = 0,004,

Jeg

2

= 48,5%). I tillegg var det ingen sammenheng mellom kreftrisiko og AA vs. GG (OR = 1,72, 95% cis: 0.50-5.94, p = 0,394,

Jeg

2

= 59,4%), AA + AG (OR = 0,92, 95% CI’er: 0,63 til 1,32, P = 0,638,

jeg

2

= 68,4%) vs. GG eller A vs. G (OR = 1,02, 95% CI’er: 0,64 til 1,62, P = 0,945,

jeg

2

= 85,5%) (figur 7)

torg og horisontale linjer tilsvarer de studiespesifikke ORS og 95% CIS. Områdene av kvadratene reflektere studien-spesifikke vekter (som var den inverse av variansen). Diamantene representerer de samlede ORS og 95% CIS.

publiseringsskjevheter

Vi utførte både trakt plott og Egger tester for alle genetiske modeller og allelet for å vurdere publikasjonsskjevhet. Våre resultater viste alle trakt tomter var symmetrisk fordeling som antydet fravær av publikasjonsskjevhet (S1-S6 figurene). Også resultatene ble støttet av Egger tester (S1 Table).

Diskusjoner

Det er kjent for oss at

PD-1

er en immun gen med potente hemmende effekter på immunceller. Som en viktig genet for «fine snu» av T-lymfocytter aktivering og spredning å påvirke vert anti-tumor immunitet,

PD-1

fortjener flere undersøkelser. Mange studier har rapportert at over uttrykk for

PD-1

er assosiert med dårlig prognose i flere svulster, som blant annet brystkreft, livmorhals, mage, esophageal kreft og ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) [7-10 , 39].

PD-1

uttrykkes på kreftspesifikke T-celler, når samhandler med PD-Ls, uttrykt på svulsten og immunceller, kan i stor grad begrenser vert anti-tumor immunitet og skaper antitumor undertrykkende miljøet [40, 41]. Følgelig har det vært ansett som blokade av

PD-1

-PDLs interaksjon som en immunterapi prosedyre for å erobre immun-undertrykkelse assosiert med kreft tilstand [41]. Nylig har enkelte studier har undersøkt forholdet mellom

PD-1

polymorfismer og forskjellige kreftformer, inkludert bryst, mage, kolorektal-, lunge- og leverkreft, et al. Men resultatene er kontroversielt. Så vi utførte dette meta-analyse for å diskutere sammenhengen mellom

PD-1

polymorfismer og kreftrisiko.

Tidligere Mamat U et al. utførte en meta-analyse [42] diskuterte sammenhengen mellom

PD-1

.

5

(rs2227981) polymorfi og kreftrisiko. Deres resultater viste ingen sammenheng mellom

PD-1

.

5 product: (rs2227981) polymorfisme og total kreftrisiko, men avslørte en økt fordøyelsessystemet svulst risiko. Men vi fant ut at de feilaktig inkluderte en studie undersøkt om

PD-1

.

3 plakater (rs11568821) polymorfisme og tykktarmskreft [43] i sin meta-analyse. Derfor kan det i betydelig grad påvirke deres totale resultater og fordøyelsessystemet svulst undergruppe resultater. I tillegg har de kun registrert seks studier som blant annet en feil ett og diskutert de kreftrisiko med en polymorfisme. I motsetning til vår meta-analysen inkluderte 12 relevante publiserte studier og diskuterte kreftrisiko med fire polymorfismer. Videre vår meta-analysen inkluderte høyere antall tilfeller og kontroller enn tidligere ett. I tillegg har vi vurdert kvaliteten på studiene ved Newcastle-Ottawa Scale og alle de studiene vi inkluderte var oppfylt høy kvalitet, mens den tidligere meta-analyse ikke gjennomføre noen studie kvalitetsvurdering. Så, vår meta-analyse gjort en mer overbevisende og detaljert evaluering enn før studien gjorde. Alle egenskaper og resultatene av denne studien for

PD-1

.

5 product: (rs2227981) polymorfisme sammenlignet med tidligere meta-analyse ble oppsummert i Tabell 3.

i de senere år har anvendelsen av genom-wide forening studie (GWAS) i mange typer sykdommer eksploderte og massevis av GWASs om kreftrisiko ble publisert. Men det er ingen GWAS fokusert på

PD-1

polymorfismer og kreftrisiko. Derfor vår forskning i hovedsak opptatt på case-kontrollstudier. I denne studien sammenhengen mellom

PD-1

.

5 plakater (rs2227981),

PD-1

.

ni plakater (rs2227982),

PD-1

rs7421861 eller

PD-1

.

3 plakater (rs11568821) og kreftrisiko ble undersøkt i alle genetiske modeller og allel, og alle resultatene ble oppsummert i tabell 4 . Når det gjelder

PD-1

.

5

, viste resultatene en signifikant redusert kreftrisiko både i TT vs. CC og TT vs. CT + CC genetiske modeller for generelle befolkningen, asiater og befolkning -baserte kontroller, også betydelig redusert kreftrisiko ble funnet i T vs C-allelet for generelle befolkningen.

PD-1

.

5

lokalisert i exon 5, er et synonymt polymorfi som ikke endrer endelig aminosyresekvensen til proteinet. Dermed disse signifikante sammenhenger mellom

PD-1

.

5 Hotell og kreft trolig kan være

PD-1

.

5

variasjon koblingsulikevekt med andre

PD-1

gen polymorfismer som kan føre til å endre

PD-1

uttrykk nivå [44]. Nylig, Zhang Hua et al. [29] rapporterte at frekvensene av CC genotype og C-allel var høyere hos brystkreftpasienter enn dem hos kontrollpersoner i kinesisk befolkning, og CC genotype og C-allel kan spille en potensiell risiko rolle i brystkreft. Konsekvent våre resultater indikerte at i

PD-1

.

5

, TT genotype kan redusere kreftrisikoen.

Vi har også undersøkt

PD -1

.

ni plakater (rs2227982) og

PD-1

rs7421861 polymorfismer. Det har blitt identifisert som

PD-1

.

ni

, som ligger i ekson 5, er en ikke-synonymt SNP av

PD-1

, noe som resulterer aminosyren substitusjon fra valin til alanine under proteinsyntesen, noe som trolig fører til ulike strukturer og ulike funksjoner av

PD-1

. Som for

PD-1

rs7421861, det ligger i intron en der en rekke regulatoriske elementer og skjøting betjeningselementer eksisterer [45, 46]. Derfor, på grunn av ødeleggelse av spleisesetet eller endring av den mRNA-sekundærstruktur,

PD-1

rs7421861 kan indusere avvikende spleising, og ytterligere resultat i translasjonell forebyggelse [47-49]. Men vi klarte ikke å finne sammenhengen mellom kreftrisiko og

PD-1

.

ni plakater (rs2227982) eller

PD-1

rs7421861 i alle genetiske modeller og alleler . Den begrensede utvalgsstørrelsen kan være en viktig grunn av resultatene, og vi bør behandle resultatene med forsiktighet. Videre studier er også nødvendig for å bestemme funksjonen til disse to polymorfismer.

I tillegg har vi diskutert

PD-1

.

3 plakater (rs11568821) polymorfisme i vår meta -analyse.

PD-1

.

3

polymorfisme var en guanin (G) til adenin (A) enkeltnukleotidpolymorfi (SNP) ved nukleotid 7146 i

PD-1

intron 4. en region av

PD-1

intron 4 ble beskrevet som en forbedrer-lignende struktur som inneholder bindingssteder for flere transkripsjonsfaktorer [50]. Eksisterende studie har vist at

PD-1

.

3

polymorfisme i denne regionen kan påvirke binding av runt relaterte transkripsjonsfaktor 1 (RUNX1) og endre transkripsjonsregulering og effektivitet av

PD-1

genet [51]. Videre indikerte forskning at tilstedeværelsen av et allel av

PD-1

.

3

polymorfisme forstyrret bindingssetet for RUNX1 transkripsjonsfaktorer og resulterte nedskrivning av

PD-1

hemmende effekt og høyere lymfocytt aktivitet [50]. Derfor A-allelet av

PD-1

.

3

polymorfisme kan ha økt svulst immunitet kapasitet og redusert mottakelighet for kreft. Konsekvent våre resultater av

PD-1

.

3 plakater (rs11568821) polymorfisme viste en redusert kreftrisiko i GA vs GG, men en økt kreftrisiko ble funnet i AA vs AG + GG. Dessuten ble det ikke dramatiske assosiasjoner funnet mellom AA vs GG, AA + AG vs. GG genetiske modeller eller A vs G-allel og kreftrisiko. Imidlertid vil i stor skala og strengere analytiske studier være nødvendig for å bekrefte sammenhengen mellom

PD-1

.

3

polymorfisme og kreftrisiko.

Det er noen begrensninger bør bli behandlet i denne meta-analysen. Først av alt, begrenset antall deltakere for

PD-1

.

3 plakater (rs11568821) polymorfisme kan føre til utilstrekkelig statistisk styrke til å utforske den virkelige fotballkrets. Dernest, hetrogeniteter var signifikant i noen genetiske modeller og alleler for

PD-1

.

5 product: (rs2227981) og

PD-1

.

3

(rs11568821) polymorfismer. Når vi utført subgruppeanalyser stratifisert etter etnisitet og kontroll kilde ble hetrogeniteter i enkelte undergrupper reduseres eller fjernes mens i noen undergrupper ble fortsatt eksisterte. For det tredje mangler av de opprinnelige dataene begrenset vår videre evaluering av potensialet gen-gen, gen-miljø, eller til og med forskjellig polymorfisme loci av det samme genet, som alle kan påvirke kreftrisikoen.

I sammendraget, vår meta- analyse antydet at

PD-1

.

5 product: (rs2227981) polymorfisme er forbundet med betydelig redusert kreftrisiko både i TT vs. CC og TT vs. CT + CC genetiske modeller, uansett for generelle befolkningen, asiater undergruppe eller populasjonsbasert undergruppe, også redusert kreftrisiko ble funnet i T vs C-allelet for generelle befolkningen. Ingen sammenhenger ble funnet mellom kreftrisiko og

PD-1

.

ni plakater (rs2227982) eller

PD-1

rs7421861 i alle genetiske modeller og allel. I tillegg, for

PD-1

.

3 plakater (rs11568821) polymorfisme, fant vi forskjellig kreft mottakelighet mellom GA vs GG og AA vs AG + GG genetiske modeller, og ingen assosiasjoner mellom AA vs GG, AA + AG vs. GG genetiske modeller eller A vs G-allel og kreftrisiko. Men våre resultater først avdekket en betydelig redusert risiko mellom

PD-1

polymorfismer og kreft, selv om dataene kan være begrenset. Derfor stor skala, veldesignede epidemiologiske studier vil være nødvendig for å bekrefte våre funn i fremtiden.

Hjelpemiddel Informasjon

S1 Fig. Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av

PD-1

5 product: (rs2227981) polymorfisme og kreftrisiko for generelle populasjoner (A for TT vs. CC, b. For TT vs. CT + CC C for TT + CT vs. CC; D for TC vs. CC og E for T vs C)

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s001 plakater (TIF)

S2 fig. . Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av

PD-1

5 product: (rs2227981) polymorfisme og kreftrisiko for asiater gruppen (A for TT vs. CC, b. For TT vs. CT + CC C for TT + CT vs. CC; D for TC vs. CC og E for T vs C)

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s002 plakater (TIF)

S3 fig. . Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av

PD-1

5 product: (rs2227981) polymorfisme og kreftrisiko for populasjonsbasert gruppen (A for TT vs. CC, b. For TT vs. CT + CC, C for TT + CT vs. CC; D for TC vs. CC og E for T vs C)

doi:. 10,1371 /journal.pone.0152448.s003 plakater (TIF)

S4 fig. Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av

PD-1

ni plakater (rs2227982) polymorfisme og kreftrisiko for generelle populasjoner (A for TT vs. CC, b. For TT vs. CT + CC C for TT + CT vs. CC; D for TC vs. CC og E for T vs C)

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s004 plakater (TIF)

S5 fig. . Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av

PD-1

rs7421861 polymorfisme og kreftrisiko for generelle populasjoner (A for CC vs TT; B for CC vs. CT + TT C i CC + CT vs TT; D for CT vs TT og E for C vs. T)

doi:. 10,1371 /journal.pone.0152448.s005 plakater (TIF)

S6 fig. Trakt tomt for publikasjonsskjevhet av

PD-1

3 plakater (rs11568821) polymorfisme og kreftrisiko for generelle populasjoner (A for AA vs GG;. B for AA vs AG + GG C for AA + AG vs. GG; D for AG vs. GG og E for A vs. G)

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s006 plakater (TIF)

S1 Meta. -analysemetoder på Genetic Association Studies Form.

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s007 plakater (docx)

S1 Table. Oppsummering av Egger test

P

-verdi

doi: 10,1371 /journal.pone.0152448.s008 plakater (docx)

Legg att eit svar