Med anvendelser av multi-omics tilnærminger for å undersøke epigenome, det? Eld av epigenetikk er klar til å forandre seg. Vi fokuserer på integrering av omics tilnærminger som brukes til DNA modi? Kasjon for high-throughput tilnærminger
Bakterie epigenome er en dynamisk funksjon som endrer under vekst i respons på ytre stimuli, og dermed tilrettelegge for tilpasning til varierende miljø forhold. Mange teknikker har blitt utviklet for å kvantifisere metylering, antall modi? Ed nukleotider, og forbedre deteksjon oppløsning. Bisul? Te sekvensering var det? Rst metode som brukes for å bestemme DNA-metylering via sekvensering. NGS har banet vei for en rekke storskala sekvense innsats, noe som vil øke oppdagelsen av metylering tetthet, plassering og katalytiske enzymer.
Den eksplosive produksjon av epigenomes i de kommende årene spår behovet for nye dataverktøy og plattformer for å kjøre storskala dataanalyse for genom og epigenetisk merknader. Databaser for high-throughput analyser av fysiske og funksjonelle protein-protein interaksjoner inkluderer STRING, som spår protein-protein interaksjonsnettverk for en enkelt genom er svært nødvendig. De fremtidige utfordringer er spennende og? Lled med mange muligheter til å gjøre nye funn som de? Ne Epigenomics i rollen som den bakterielle livssyklus i en tid med multi-omics integrering.
forløpere celler forplikte seg til sin skjebne i en steg-for-steg differensiering prosess, som er drevet av en rekke innganger og er ledsaget av epigenetiske tiltak styrke forpliktelsen beslutninger. Forberedelsene til seksuell reproduksjon er en tre-trinns prosess som består av sletting av somatiske signaturer i bakterie celle forløpere via et omfattende omprogrammering prosess, etablering av kjønnsspesifikke og bakterie celle-spesifikke epigenetiske signaturer og transkripsjon profiler og til slutt, etter befruktning fjerning av disse signaturene til å utløse den embryonale utviklings program og begynnelsen på en ny livssyklus.
DNA metylering er vanlig i eukaryoter alt fra sopp til virveldyr, selv om dens betydning og funksjon i disse organismene varierer. Den dominerende plassering av 5mC i den symmetriske CpG sammenheng førte til tidlig forslaget av DNA metylering arv gjennom semiconservative DNA replikasjon, etter
5-hydroxymethylcytosine (5hmC) og den nylige oppdagelsen av 1011 trans (Tet) familie av dioxygenases foreslå nye muligheter for aktiv DNA demetylering.
det er nå klart at passiv DNA demetylering er den mest parsimonious mekanisme både PGCs og preimplantation embryoer og er sannsynligvis tilstrekkelig for det formålet.
epigenetiske omprogrammering forskjellig i detaljer blant pattedyrarter, noe som tyder på at demetylering-metylering i embryo er nye mekanismer.
