Abstract
Bakgrunn
Formålet med studien var å undersøke hvilken rolle gener (
HSD3B1
,
CYP17A1
,
CYP19A1
,
HSD17B2
,
HSD17B1
) involvert i steroid hormon biosyntesebanen og progesteron reseptor (
PGR
) i etiologien av magekreft i en populasjonsbasert to-fase genetisk tilknytning studie.
Metoder
i discovery fasen, 108 kandidat SNPs i steroidhormon biosyntesebanen relaterte gener og
PGR
ble analysert i 76 magekreft tilfeller og 322 kontroller i den koreanske Multi-Center Cancer Cohort. Statistisk signifikante SNPs identifisert i discovery fasen ble re-evaluert i en utvidet sett av 386 tilfeller og 348 kontroller. Pooled- og meta-analyser ble utført for å oppsummere resultatene.
Resultater
Av de 108 SNPs i steroidhormon biosyntesebanen relaterte gener og
PGR
analysert i discovery fasen , 23 SNPs i
PGR
i recessive modellen og 10 SNPs i
CYP19A1
i recessive eller additive modeller var signifikant assosiert med økt magekreftrisiko (
p
0,05). De mindre allelfrekvensene av SNPs i både Discovery og forlengelsesfasen var ikke statistisk forskjellig. Pooled- og meta-analyser viste
CYP19A1
rs1004982, rs16964228, og rs1902580 hadde en økt risiko for magekreft (sammenslått ELLER [95% CI] = 1,22 [1,01 til 1,48], 1,31 [1,03 til 1,66], 3.03 [1.12 til 8.18], henholdsvis). I motsetning til alle
PGR
SNPs ikke var statistisk signifikant assosiert med magekreft.
Konklusjoner
Våre funn tyder på
CYP19A1
som koder
aromatase
kan spille en viktig rolle i foreningen av magekreft risiko og være en genetisk markør for magekreft mottakelighet
Citation. Cho LY, Yang JJ, Ko KP, Ma SH, Shin A, Choi BY, et al. (2012) genetisk mottakelighet Faktorer på gener som er involvert i steroid hormon biosyntesebanen og progesteron reseptor for Gastric Cancer Risk. PLoS ONE 7 (10): e47603. doi: 10,1371 /journal.pone.0047603
Redaktør: Michael Scheurer, Baylor College of Medicine, USA
mottatt: 29 april 2012; Akseptert: 12. september 2012; Publisert: 23 oktober 2012
Copyright: © Cho et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Denne studien ble støttet av en bevilgning fra (1) National R D Program for Cancer Control, Ministry of Health Velferd, Republikken Korea (0520140); (2) Basic Science Research Program gjennom National Research Foundation of Korea finansiert av departementet for utdanning, vitenskap og teknologi [NRF-2009-353-0066258]; og (3) Basic Research Laboratory (BRL) program gjennom National Research Foundation of Korea finansiert av departementet for utdanning, vitenskap og teknologi [2011-0001564]. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Gastric kreftdødelighet er den nest største i verden [1]. Gastric kreftforekomst er omtrent to ganger større blant menn enn kvinner i mange deler av verden [2], og forholdet blir mindre etter 60 år da de fleste kvinner nå menopause. Gastric kreftforekomst hos menn er mer enn dobbelt enn hos kvinner i den koreanske befolkningen (62,2
vs.
24,6 per 100 000 personer) [3]. Denne globale konsistensen av en høy mann til kvinne insidensratio i magekreft kan skyldes en hormonell forskjell mellom menn og kvinner. Derfor har det vært en teori om at kvinnelige kjønnssteroidhormoner, østrogen og progesteron, kan spille en beskyttende rolle i magekreftforekomst.
Selv om inkonsekvent, epidemiologiske studier støtter denne hypotesen. Mange epidemiologiske studier har rapportert en redusert risiko for magekreft med større levetid eksponering for endogen østrogen [4] – [11], mens noen studier viste ingen sammenheng [12] – [16]. Animal og
in vitro
studier støtter også denne hypotesen. Hunn og kastrerte rotter hadde en lavere forekomst av magekreft enn ikke-behandlede hannrotter i N-metyl-N»-nitro-N-nitrosoguanidin karsinogenese modell [17]. I
H. pylori
indusert magekreft musemodell, 17 beta-østradiol fungerte som en beskyttende faktor i magekreftutvikling [18]. Østrogen viste en økning i apoptose i AGS humane magecancerceller [19]. I tillegg har østrogen stimulert ekspresjon av trekløverpeptider som er viktige i slimhinne beskyttelse i magesekken [20]. Selv publiserte studier på østrogen påvirker magekreftrisiko er inkonsekvent, støtter en fersk meta-analyse lengre eksponering for østrogen effekter av enten ovarial eller eksogen opprinnelse kan redusere magekreft risiko [21].
Østrogen og progesteron syntetiseres i steroidhormon biosyntesebanen. Steroidhormonreseptorer slik som østrogen og progesteron er blitt identifisert og er uttrykt i mageslimhinnen og cancervev [22] – [26]. Derfor kan steroidhormon biosyntesebanen og deres reseptorer endres av genetiske varianter av beslektede gener, og dermed endre og bidrar til individuell mottakelighet for magekreft. Av hormonreseptorer, særlig vi fokusert på progesteron reseptor (
PGR
) fordi progesteron kan være en viktig bidragsyter for magekreftutvikling enn østrogen. En dyrestudie [27] viste at onapriston, en progesteron anatagonist, hemmet gastrisk tumorvekst samt østradiol-stimulert vekst.
Hypotesen om den aktuelle studien er genetisk polymorfisme involvert i steroid hormon biosyntesebanen og
PGR
kan påvirke individuelle responsen i utviklingen av magekreft. For å undersøke hypotesen, ble en to-fase genetisk tilknytning studie utført: 1) discovery fasen var en kandidat genet tilnærming analyse med fokus på fem gener som er involvert i steroid biosyntesebanen (
HSD3B1
,
CYP17A1
,
CYP19A1
,
HSD17B2
, og
HSD17B1
) og hormon reseptor genet (
PGR
); 2) forlengelsen fase videre undersøkt de mest betydelige SNPs identifisert i oppdagelsen analyse.
Materialer og Metoder
Studiepopulasjon
I oppdagelsen fasen, populasjonsbasert nestet case-control studie befolkningen ble rekruttert fra den koreanske Multi-Center Cancer Cohort (KMCC), et samfunn basert prospektiv kohort av deltakerne rekruttert fra fire urbane og rurale områder i Korea (Haman, Chungju, Uljin, og Youngil) fra 1993 til 2004 [28]. Deltakerne gjennomført detaljerte standardiserte intervjubaserte spørreskjemaer om generell livsstil, medisinsk historie, fysisk aktivitet, kosthold, reproduktive faktorer, plantevernmidler eksponering, og flere miljøfaktorer. Blod og sted urinprøver ble innsamlet og lagret ved -70 ° C og -20 ° C, henholdsvis.
I 31. desember 2002, 136 magekrefttilfeller i KMCC ble identifisert gjennom datastyrte plate bindinger til det nasjonale registeret kreft, den nasjonale dødsattest, og helseforsikring medisinske poster. De passive oppfølging metoder ble rapportert å være 99% effektiv og fullstendighet ble forsikret [29]. Tilfeller diagnostisert før rekruttering (N = 36) og uten blodprøver (N = 16) ble ekskludert. Kreftfrie kontroller ble tilfeldig valgt fra den KMCC populasjonen. Det var fire kontroller tilpasset hver magekreft tilfelle av forekomsten tetthet prøvetaking basert på alder (± 5 år), kjønn, boligområde, og påmelding. I tillegg ble åtte tilfeller og 14 kontroller ekskludert på grunn av mangelfull DNA eller dårlig genotyping. Til slutt ble 76 tilfeller og 322 kontroller inkludert i discovery fasen.
I forlengelsen fase, 388 magekreft kasus-kontrollsett ble valgt som følger. Det var 95 nye magekrefttilfeller og 52 utbredte tilfeller i desember 2008 og 52 flere tilfeller hvor blodprøver ble senere hentet fra KMCC. I tillegg, fra mars 2002 til september 2006, 490 nydiagnostiserte mage kreftpasienter fra to universitetssykehusene i Korea som var Chungnam universitetssykehus og Hanyang Universitets GURI Hospital ble identifisert. Epidemiologiske data og venøse blodprøver ble oppsamlet på tidspunktet for diagnose eller før magekreft kirurgi. Blant dem var 189 tilfeller med tilstrekkelig DNA-prøver og informert samtykke inkludert. Community-baserte kontroller matchet etter alder (± 5 år), kjønn og påmelding året 2001-2005 ble tilfeldig valgt fra KMCC. Det var to tilfeller og 40 kontroller ekskludert på grunn av dårlig genotyping og utilstrekkelig prøven. Til slutt ble 386 tilfeller og 348 kontroller inkludert i forlengelsesfasen. Felles og meta-analyser inkludert 462 tilfeller og 670 kontroller.
Etikk erklæringen
Alle deltakere gitt skriftlig informert samtykke før vi går studiene. Studien protokoller for KMCC og nåværende nestet case-kontrollstudier ble godkjent av institusjonelle gjennomgang styrene i Seoul National University Hospital og National Cancer Center of Korea (H-0110-084-002, C-0907-044-2861-170 ), og Hanyang universitetssykehus (2003-4)
Kandidat Gene og SNP Selection
det var syv gener i discovery fasen valgt fra litteraturgjennomgangen som var som følger:. progesteron reseptor (
PGR
); cytokrom P450, familie 19, underfamilien A, polypeptid 1 (
CYP19A1
); cytokrom P450, familie 17, underfamilien A, polypeptid 1 (
CYP17A1
); hydroksysteroid (17-beta) dehydrogenase 1 (
HSD17B1
); hydroksysteroid (17-beta) dehydrogenase 2 (
HSD17B2
); hydroksy-delta-5-steroid-dehydrogenase, 3 beta- og delta-steroid isomerase 1 (
HSD3B1
).
Kandidat enkelt-nukleotid polymorfismer (SNP) i utvalgte gener ble valgt i henhold til de følgende kriterier: 1) som er rapportert å ha en mulig funksjonell betydning i tidligere studier; 2) mindre allel frekvens (MAF) 0,05 i asiatiske databaser som SNP500Cancer, HapMap eller CGAP bruker dbSNP IDer (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP); 3) samtidig, MAF 0,05 i HapMap japansk (JET). Endelig, 117 SNPS med et design poengsum = 1.1, r
2 0,8 i fem kandidatgener i steroidhormon biosyntesebanen og
PGR
ble genotypet. Det var 105 SNP plassert i intron-regionen, åtte SNP som ligger i promoterregionen (flankerende region eller UTR), og fire SNP lokalisert i den kodende region (Appendix S1).
I forlengelsesfasen, var SNP’er valgt som følger. For
PGR
, i oppdagelsen analyse, 23 SNPs var betydelig og skapt en stor Haploblock. Det var to SNP’er av de 23 SNP som befinner seg i den kodende region eller 3UTR. Den rå og permutert
p
-verdier var mindre enn 0,04. For
CYP19A1
, var det ti betydelige SNPs (rå
p
-verdi 0,05) ligger i intron regionen.
CYP19A1
opprettet seks blokker og de betydelige SNPs i discovery fasen ble lokalisert i blokkene 4, 5 og 6.
Genotyping
Genomisk DNA-konsentrasjoner ble målt for alle studie fag ved et spektrofotometer (Nanodrop ND-1000, Nanodrop Technologies). Genotyping i discovery fasen ble utført ved hjelp GoldenGateTM analysen (Illumina®, San Diego, California). Av de 117 SNPs, ble ni SNPs anses ubrukelig på grunn av svikt i genotyping (rs6203 andrs9939740), SNP takst 90% (rs2236780, rs12594293, rs12592697, rs597255, og rs2830), monomorphism (rs7175531, rs4243229), og ble ekskludert analysen. Til slutt, analyserte vi 108 SNPs i seks gener (genotyping rente på 99,5%) i 76 tilfeller og 322 kontroller. For å sikre kvalitetskontroll og evaluere intraindividuell samstemmighet, ble 52 duplikatprøvene tilfeldig fordelt i genotyping plate. Konkordans priser for alle analysene var mer enn 99%.
Genotyping i forlengelsen fase ble utført ved hjelp av IlluminaVeraCodeGoldenGate analysen med BeadXpress henhold til produsentens protokoll (Illumina, San Diego, CA, USA) [16]. For å sikre påliteligheten av de to forskjellige genotyping metoder, ble 135 prøver (59 tilfeller og 76 kontroller) genotypede av både Genome-Wide Menneskelig SNP Array 5.0 og IlluminaVeraCodeGoldenGate analysen, og samstemmighet var 98,2%. På grunn av den høye overensstemmelse hastighet, ble alle prøver er inkludert i analysen; uharmoniske prøver ble ikke fjernet fra analysen.
Statistical Analysis
Chi-kvadrat og Student
t
-test ble utført for å sammenligne utvalgte kjennetegn mellom magekrefttilfeller og kontroller. Forskjell i utvalgte egenskaper som var kjønn, alder,
H. pylori
infeksjon, CagA og VacAseropositivity, røyking, alkohol drikking, og gastritt historie mellom saker og kontroller ble bestemt av en
p
-verdi på 0,05.
Hardy-Weinberg likevekt ( HWE) ble evaluert i kontrollgruppen for alle SNPs hjelp av khikvadrattest eller Fishers eksakte test med en cut-off nivå av HWE p-verdi 0,0001. I oppdagelsen analyse, ble sammenhengen mellom individuelle SNPs og magekreftrisiko vurderes ut rå og permutert
p
-verdier hjelp av likelihood ratio test (LRT) med en grad av frihet i additiv, dominerende, og recessive modeller. Den additive modellen forutsetter en dose respons effekt med et økende antall variant alleler. De dominerende og recessive modeller er tester for mindre allelet. Hvis d er mindre allel og D er den viktigste allelet, er den dominerende modellen DD
vs.
Dd + Dd og recessive modellen er dd
vs.
DD + Dd. Permutert
p
-verdier ble anslått av 100.000 permutasjon tester i én SNP modell. For å unngå falske assosiasjoner med falske positive resultater, ble den falske funnraten (FDR) med en Benjamini-Hochberg Metode beregnet [30]. Gastric kreftrisiko ble beregnet som odds ratio (ORS) og 95% konfidensintervall (CIS) med ubetinget logistisk regresjonsmodell justert for risikofaktorer som var alder, røykestatus (noensinne
vs.
Aldri),
H. pylori
infeksjon (positiv
vs.
negativ) og CagA seropositive (positiv
vs.
negativ) i additiv, dominerende og recessive modeller. Haploblocks ble opprettet ved hjelp av standard algoritme [31] og tag-SNPs ble identifisert i haplotype analyse.
I forlengelsen fase, de mest betydelige SNPs i discovery fasen ble re-analysert. Basert på additiv og /eller recessive modeller, ble magekreft risiko estimeres ELLER [95% CI] med ubetinget logistisk regresjonsmodell justert for de samme risikofaktorene som nevnt ovenfor. Den statistisk signifikans nivå for oppdagelsen og forlengelsesfasen var
p
-verdi 0,05. For å oppsummere resultatene fra oppdagelsen og utvidelse analyser, pooled- og meta-analyser ble gjennomført. Bruke fast effekt modellen, oppsummert ELLER [95% CI] ble beregnet. Også heterogenitet på tvers av studiene ble evaluert av Cochran Q statistikk [32]
Alle statistiske analyser ble utført ved hjelp av SAS programvareversjon 9.1 (SAS Institute, Cary, North Carolina), plink programvareversjon 1.06 (http.: //pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) [33], og Haploview 4.1 programvare (http:. www.broadinstitute.org/haploview/haploview)
Resultater
Det var ingen signifikant forskjell mellom saker og kontroller for alle valgte egenskaper i oppdagelsen og skjøte fag (
p
0,05) (tabell 1). I den samlede-analyse, et større antall tilfeller var CagA og Vaca seropositive og røykere (
p
0,05).
Av de 108 SNPS i fem steroid hormon biosyntese relatert gener og
PGR
analysert i discovery fasen, 23 SNPs i
PGR
i recessive modellen og 10 SNPs i
CYP19A1
i recessive eller additive modeller var signifikant assosiert med økt magekreft risiko i enkelt SNP-analyse (
p
0,05).
PGR
rs542384,
PGR
rs543215,
PGR
rs613120, og
PGR
rs1456765 presenteres 100000 permutasjon test
p
0,01 selv om FDR p-verdier ikke var signifikante (tabell 2).
haplotype blokker ble identifisert av LD tomten. En blokk ble definert av
PGR Hotell som inkluderte alle 27
PGR
SNPs fra discovery fasen (figur S1), mens seks blokker ble definert av
CYP19A1 plakater (figur 1, 2 og 3).
D «og LOD verdier ble brukt for utvelgelse av LD fargevalget i discovery fasen. Av de seks blokkene i
CYP19A1
betydelige SNPs i discovery fasen ble plassert i blokker 4, 5 og 6.
Vesentlige SNPs i discovery fasen ble plassert i blokker 4, 5 og 6. SNPs angitt i boksene representerer SNPs re-analysert i forlengelsesfasen.
de mindre allelfrekvensene av SNPs i både oppdagelse og forlengelsesfasen var ikke signifikant forskjellig . Pooled- og meta-analyser viste
CYP19A1
var statistisk signifikant assosiert med magekreft risiko. Mindre alleler G, T, og A for rs1004982, rs16964228, og rs1902580 henholdsvis rapporterte en 1,22 (95% CI [1,01 til 1,48]), 1,31 (95% CI [1,03 til 1,66]), og 3,03 (95% KI [01.12 til 08.18]) økt risiko for magekreft, henholdsvis i sammenslåtte-analyse. Meta-analysen viste lignende foreninger. I motsetning til alle
PGR
SNPs ikke var statistisk signifikant assosiert med magekreft (tabell 3).
Diskusjoner
CYP19A1
genetisk polymorfismer, spesielt rs1004982, rs16964228, rs1902580, var assosiert med økt risiko for magekreft i denne studien. Oppdagelsen Analysen viste 23 SNPs i
PGR
var assosiert med økt magekreftrisiko og skapte en stor haploblock i haplotype analyse, selv om foreninger ikke var signifikante i den samlede-analyse.
CYP19A1
koder
CYP19
aromatase, et medlem av cytokrom P450 super som er det viktigste enzymet som katalyserer den endelige og hastighetsbegrensende trinn østrogenbiosyntese (aromatization av androstendion og testosteron til østron og østradiol, henholdsvis ) [34].
CYP19
genet er kartlagt til kromosom 15q21.1, spenner over ca 123 kb, og det regulatoriske regionen inneholder minst 190 forskjellige arrangører som regulerer i et signal sti-spesifikk måte [35] eller vev-spesifikk med hormonelt kontrollert promotorer slik som gonadal eller adipose stroma [36] – [39].
CYP19
mutasjoner har vist økt eller redusert aromatase aktivitet og dermed endre nivåer av sirkulerende østrogen [40] – [43].
CYP19A1
genetisk variasjon knyttet studier undersøkt sammenhengen med ulike hormonrelaterte kreftformer som brystkreft, endometrial, ovarian, og prostata [44] – [49]. Aromatase aktivitet stimuleres brystkreft cellevekst [50], aromatase uttrykk nivåer økt i brystsvulster [51], og var den viktigste kilden til 17β-østradiol i brystsvulster og omkringliggende vev hos postmenopausale kvinner [52], [53]. Studier på rollen til
CYP19A1
spesifikke for human gastrisk kreftutvikling er begrenset. Men sterkt uttrykk av mRNA
CYP19
aromatase ble vist i mageslimhinnen hos voksne rotter, og aromatase aktivitet i magekreft humane prøver ble demonstrert [25]. Dette tyder på en mekanisme som Polym koding Orphic varianter av
CYP19
gener kan påvirke kreft mottakelighet ved å endre sin kodet enzym, enten gjennom uttrykk eller funksjon, for å modulere østrogen syntese. Våre funn tyder på muligheten for at genetiske varianter av
CYP19A1 plakater (rs1004982, rs16964228, og rs1902580) kan være involvert i å endre østrogennivået og påvirker apoptose, mucosal funksjon, kreftutvikling, og dermed magekreftrisiko.
det er begrenset med studier som undersøker gener av steroid hormon metabolisme vei og magekreft. En japansk studie observert en statistisk signifikant sammenheng mellom flere
CYP19A1
SNPs (rs4646 og rs1902586) og magekreft [54]. En populasjonsbasert studie i Polen som inkluderte 295 mage krefttilfeller og 415 kontroller også genotypet et par av de samme SNPs (rs4646 og rs1902586), men en signifikant sammenheng ble ikke funnet [55]. Disse SNPs ikke var genotypet i vår studie, men andre SNPs av
CYP19A1
viste statistisk signifikante assosiasjoner. Vi genotypet
CYP19A1
rs16964228, rs1902580, og rs1004982 som er plassert i intron-regionen i tre blokker, Block 4, blokk 5, og blokk 6, respektivt. Selv om den funksjonelle relevansen av
CYP19A1
rs16964228, rs1902580, og rs1004982 for
CYP19
enzym er ikke klart,
CYP19A1
kan fungere som en viktig markør for individuell følsomhet og dens genetiske varianter kan endre utviklingen av magekreft, men ytterligere bekreftelse er garantert
Mange studier undersøkte
CYP19A1
med hormonelt tilknyttede kreftformer, som brystkreft, prostatakreft, livmor [56] -. [59] . SNPs rs10046 (T) og rs936306 (t) er foreslått å være «høyt aktivitets alleler «på grunn av deres tilknytning til 10% til 20% økte nivåer av sirkulerende østradiol og østron hos postmenopausale kvinner [58], [60], [61] selv om ikke viser signifikant sammenheng med brystkreft [60], [62]. I denne studien ble rs10046 ikke genotypet, men rs936306 ble genotypet. Mens rs936306 var signifikant i discovery fasen, rs936306 var ubetydelig i samlede og meta-analyser.
Vår oppdagelse analyse viste 23 SNPs i
PGR
var assosiert med økt risiko for magekreft. I vår haplotype-analyse ble de signifikante 23 SNP fra oppdagelsen analyse, i tillegg til de resterende fire
PGR
SNP som ble genotypet for å danne en stor blokk, tyder disse SNP’er er korrelert med hverandre og er forbundet med gastrisk kreft. Men på grunn av utilstrekkelig effekt i recessive modellen, utvidelse fase ikke rapportere en statistisk signifikant sammenheng med noen
PGR
SNPs.
PGR
nivåene var signifikant økt i magekreftpasienter «vev mens den ikke er i normalt vev [63] tyder på mageslimhinnen kan være målet vev for progesteron handling [64]. Derfor er polymorfe varianter av
PGR
kan være involvert i modifisering av magekreft følsomhet ved å endre dets kodede reseptor status ekspresjon og funksjon.
Selv om dette var en to-fase studie som forsøkte å øke antallet av forsøkspersonene, makt var likevel lav, og ikke tillate stratifisert analyse ifølge hormonrelaterte faktorer som menopausal status, kjønn og type kreft som hjerte- og ikke-kardiale. Årsakene til magekreft er flere faktorer, og en grundig forståelse av risiko- og beskyttelsesfaktorer og dets samspill vil bidra til å gi en enda bedre forståelse av sykdommen. Videre, i forlengelsen fase, sykehus og nærmiljøbaserte saker ble matchet til community-baserte kontroller som kan introdusere skjevheter. Men informasjon skjevhet ble minimert siden folk er født med sine gener og endringer i gener er ikke vanlig. Også utvalgsskjevhet ble minimert fordi sakene ble matchet med kontroller i henhold til viktige risikofaktorer i den første studien design stadiet.
Studiet er et to-fase genetisk tilknytning studien. I kandidaten tilnærming genetisk analyse, betydelige SNPs som ble identifisert i discovery fasen ble re-analysert i forlengelsen fase. For det andre er dette populasjonsbaserte nested case-control studie fri for mange skjevheter vanlige i retrospektive design. Medvirkende årsaker ble justert for i multivariate modeller.
I sammendraget, denne befolkningsbaserte to-fase genetisk tilknytning studien rapportene
CYP19A1
genetiske varianter, rs16964228, rs1902580 og rs1004982 er signifikant assosiert med magekreft risiko og ser ut til å være en genetisk markør av følsomhet i mage karsinogenese i den koreanske befolkningen. Gitt
CYP19A1
«s nøkkelrolle i østrogenbiosyntese,
CYP19A1
polymorfismer som endrer østrogenproduksjonen kan være involvert i magekreftutvikling. Fremtidige studier av østrogen og testosteron biomarkører fra blod og urin for å bekrefte og videre forstå det molekylære grunnlaget.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
PGR
genet kart og LD blokk. D «og LOD verdier ble brukt for utvelgelse av LD fargevalget i discovery fasen. SNPs angitt i boksene representerer SNPs re-analysert i forlengelsen
doi:. 10,1371 /journal.pone.0047603.s001 plakater (TIFF)
Vedlegg S1.
Detaljert informasjon om kandidatgener og SNPs i steroid hormon biosyntesebanen og
PGR
.
doi: 10,1371 /journal.pone.0047603.s002 plakater (docx)
