Abstract
Mål
transkripsjonsfaktor 7-lignende 2 (
TCF7L2
) genet har blitt foreslått å spille en viktig rolle i patogenesen av kreft. Imidlertid har resultatene vært inkonsekvent. I denne studien utførte vi en meta-analyse for å avklare sammenhenger mellom
TCF7L2
polymorfisme og kreftrisiko.
Metoder
Publisert litteratur fra PubMed og EMBASE ble hentet. Samlede odds ratio (ORS) med 95% konfidensintervall (CIS) ble beregnet ved hjelp av fast- eller tilfeldig effekt modell.
Resultater
Totalt 19 studier (14,814 tilfeller og 33,856 kontroller) ble identifisert for analyse av sammenhengen mellom
TCF7L2
polymorfisme og kreftrisiko. Resultatene viste at
TCF7L2
polymorfisme var assosiert med brystkreft (Homogen modell: OR = 1,17, 95% CI = 1,02 til 1,35,
Jeg
2 = 21,8%,
p
for heterogenitet = 0,276; Heterogene modell: OR = 1,11, 95% CI = 01.03 til 01.20,
jeg
2 = 0,0%,
p
for heterogenitet = 0,543), prostatakreft (Homogen modell: OR = 0,89, 95% CI = 0,84 til 0,96,
jeg
2 = 0,0%,
p
for heterogenitet = 0,640; rogen~~POS=HEADCOMP modell : OR = 0,89, 95% CI = 0,84 til 0,95,
jeg
2 = 0,0%,
p
for heterogenitet = 0,871), og tykktarmskreft (Heterogene modell: OR = 1,15, 95% CI = 01.01 til 01.31,
jeg
2 = 0,0%,
p
for heterogenitet = 0,658), men ikke med tykktarmskreft, lungekreft og kreft i eggstokkene .
Konklusjoner
den nåværende meta-analyse viste at det var signifikant sammenheng mellom
TCF7L2
rs7903146 polymorfisme og risiko for brystkreft, prostata og tykktarm kreft, i stedet for tykktarmskreft , lungekreft og kreft i eggstokkene
Citation. Chen J, Yuan T, Liu M, Chen P (2013) Sammenheng mellom TCF7L2 Gene Polymorphism og kreftrisiko: A Meta-Analysis. PLoS ONE åtte (8): e71730. doi: 10,1371 /journal.pone.0071730
Redaktør: Swati Palit Deb, Virginia Commonwealth University, USA
mottatt: 21 februar 2013; Godkjent: 09.07.2013; Publisert: 09.08.2013
Copyright: © 2013 Chen et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Forfatterne har ingen støtte eller finansiering for å rapportere
konkurrerende interesser:. forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
transkripsjonsfaktor 7-lignende 2 (
TCF7L2
) genet, tidligere rapportert som
TCF-4
, har vist seg å være assosiert med type 2 diabetes. Rs7903146 variant av
TCF7L2
genet ble først identifisert som en mottakelighet markør for type 2 diabetes ved genome-wide forening studie [1]. Følgende studier ytterligere bekreftet sammenhengen mellom
TCF7L2
rs7903146 variant og type 2 diabetes [2]. I tillegg har individer som bærer T-alleler av
TCF7L2
rs7903146 variant vist høy risiko for insulinresistens [3]. Alternativt
TCF7L2
kan påvirke kreft uavhengig av diabetes, som
TCF7L2
genet produktet er involvert Wnt /β-catenin signalveien. TCF7L2 danner en aktiv kjernefysisk anlegg med β-catenin som binder og induserer ekspresjon av målgener involvert i cellulær proliferasjon, unndragelse av apoptose, og vev invasjon og metastasering.
Hittil har mange studier blitt publisert gransker sammenhengen mellom
TCF7L2
rs7903146 eller rs12255372 (det er i høy koblingsulikevekt med rs7903146) og flere typer kreft, inkludert brystkreft [4] – [8], prostatakreft [5], [9] – [ ,,,0],12], kolorektal kreft [5], [13] – [15], tykktarmskreft [5], [16], lungecancer [5] og eggstokk-kreft [6]. Imidlertid har konklusjonene vært motstridende. Derfor utførte vi en meta-analyse for å avklare sammenhengen mellom
TCF7L2
rs7903146 variant og kreftrisiko.
Materialer og metoder
Litteratur og Søk strategi
Vi søkte PubMed og EMBASE litteraturdatabaser. Jakten strategi for å identifisere alle mulige studier involverte bruk av følgende stikkord: (
TCF7L2
eller transkripsjonsfaktor 7-aktig to eller
TCF-4
) og (variant eller variant eller polymorfisme eller genotype) og (kreft eller karsinom eller tumor). Alle relaterte studier publisert på engelsk ble inkludert. Referanselister hentes artikler ble hånd søkte. Hvis mer enn én artikkel ble publisert ved hjelp av samme sak serien, ble kun studier med den nyeste data inkludert. Litteratursøket ble oppdatert 18. februar 2013.
inklusjonskriterier og data utvinning
Studiene inkludert i meta-analysen må oppfylle alle følgende inklusjonskriterier: (1) vurderer foreninger av
TCF7L2
polymorfisme med kreftrisiko; (2) bruker case-control eller kohort design; og (3) gir tilstrekkelige data for beregning av odds ratio (OR) med 95% konfidensintervall (KI). Følgende informasjon ble hentet fra hver studie: (1) navnet på den første forfatteren; (2) årstall; (3) opprinnelseslandet; (4) etnisitet; (5) kreft type; (6) utvalgsstørrelsen av saker og kontroller; (7) kovariater «justert OR med 95% KI med delt dominerende modellen; (8) mindre allelfrekvenser i saker og kontroller; (9)
p
for Hardy Weinberg likevekt test i kontroller; og (10) studerte polymorfisme. De to forfatterne uavhengig vurdert artiklene for samsvar med inkludering /eksklusjonskriterier, løst uenigheter og nådde en konsistent avgjørelse.
Statistical Analysis
Foreningen for
TCF7L2
polymorfisme med kreftrisiko ble estimert ved å beregne samlede ORS og 95% CI’er under en co-dominerende modellen. Betydningen av sammenslåtte ELLER ble bestemt ved Z test (P 0,05 ble ansett som statistisk signifikant). Q testen ble utført for å evaluere mellom-studien heterogenitet. En randomisert (DerSimonian-Laird metoden [17] eller med fast (Mantel-Haenszel metode) [18] effekter modellen ble brukt for å beregne samlet eller i nærvær (
P
≤0.10) eller fravær (
P
.. 0,10) av heterogenitet, henholdsvis subgruppeanalyse krefttypen ble utført for å ta opp mellom-studien heterogenitet publiseringsskjevheter ble vurdert av Begg test [19] og Egger test [20] (
P
0,05 ble ansett som statistisk signifikant) data~~POS=TRUNC analyse~~POS=HEADCOMP ble utført ved hjelp av Stata versjon 11 (StataCorp LP, College Station, TX, USA)
Resultater
Kjennetegn ved Studies
i denne studien har vi fulgt PRISMA Statement (Sjekkliste S1). et flytdiagram som beskriver prosessen med inkludering /ekskludering av studien er presentert i fig. 1. litteratur~~POS=TRUNC identifiserte totalt 128 potensielt relevante papirer. av dem ble 112 papirer ekskludert på grunn av åpenbare irrelevans ved å lese titler og sammendrag. i tillegg ble to artikler ekskludert fordi de var vurderinger. Deretter 14 papers møtte de viktigste inklusjonskriteriene. Men en papir ble ekskludert fordi det ikke gir tilstrekkelige data til å beregne eller med 95% CI [21]. Siden mer enn én studie ble inkludert i to artikler av Folsom et al [5] og Goode et al [6], ble de betraktet som separate studier i meta-analysen. I tillegg, siden rs7903146 var i høy LD med rs12255372, vi kombinert alle de inkluderte studiene sammen. Endelig, 19 studier for sammenhengen mellom
TCF7L2
polymorfisme og kreftrisiko ble inkludert i den endelige meta-analyse. Av dem, fem var på brystkreft, fem var på prostatakreft, fire var på tykktarmskreft, to var på tykktarmskreft, to var på lungekreft, og en var på eggstokkreft. Karakteristikken av de inkluderte studiene er listet opp i tabell 1. Det bør bemerkes at fordi de fleste studier gitt kovariater «justert OR med 95% KI under en co-dominerende modellen beregnet vi den samlede anslaget under denne modellen.
Meta-analyse resultater
i alt 14814 tilfeller og 33856 kontroller ble identifisert for analyse av sammenhengen mellom
TCF7L2
polymorfisme med kreftrisiko. Resultatene indikerte at
TCF7L2
polymorfisme kan ikke bli assosiert med kreft risiko under co-dominerende modellen (Homogen modell: OR = 1,07, 95% CI = 0,95 til 1,21,
Jeg
2 = 61,4%,
p
for heterogenitet 0,001, figur 2; Heterogene modell: OR = 1,04, 95% CI = 0,97 til 1,12,
jeg
2 = 58,1%,
p
for heterogenitet = 0,001, figur 3). Men ytterligere subgruppeanalyse krefttype antydet at effekten størrelsen var betydelig for brystkreft (Homogen modell: OR = 1,17, 95% CI = 1,02 til 1,35,
Jeg
2 = 21,8%,
p
for heterogenitet = 0,276; Heterogene modell: OR = 1,11, 95% CI = 01.03 til 01.20,
jeg
2 = 0,0%,
p
for heterogenitet = 0,543), prostatakreft (Homogen modell: OR = 0,89, 95% CI = 0,84 til 0,96,
jeg
2 = 0,0%,
p
for heterogenitet = 0,640; rogen~~POS=HEADCOMP modell: OR = 0,89, 95% CI = 0,84 til 0,95,
jeg
2 = 0,0%,
p
for heterogenitet = 0,871), og tykktarmskreft (Heterogene modell: OR = 1,15, 95% CI = 01.01 til 01.31,
jeg
2 = 0,0%,
p
for heterogenitet = 0,658), men ikke for tykktarmskreft, lungekreft og eggstokkreft kreft (alle
p
0,05, tabell 2)
Potential publikasjonsskjevhet
Ingen publikasjonsskjevhet kunne påvises etter homogen. co-dominerende modellen (
p
= 0.780 for Begg test og
p
= 0,123 for Egger test) og heterogen co-dominerende modellen (
p
= 0,889 for Begg test og
p
= 0,274 for Egger test).
Diskusjoner
Så langt vi kjenner til, representerer vår meta-analyse den første undersøke sammenhengen mellom
TCF7L2
rs7903146 polymorfisme og kreftrisiko. Resultatene antydet at
TCF7L2
rs7903146 polymorfisme kan ikke være forbundet med kreftrisiko. Imidlertid ytterligere lagdelt analyse viste signifikant sammenheng med brystkreft, prostatakreft og tykktarmskreft, snarere enn tykktarmskreft, lungekreft og eggstokk-kreft.
Interessant, T-allelen av rs7903146 polymorfisme, som er blitt assosiert med økt risiko for type 2 diabetes, viste det inverse sammenheng med prostatakreft basert på vår meta-analyse. Funnene var i overensstemmelse med de fra de enkelte studier av Folsom et al. [5] og Machiela et al [12]. Imidlertid gjorde de andre tre inkluderte studiene antyder ingen tilknytning [9] – [11]. I tillegg fant vi positiv sammenheng mellom rs7903146 polymorfisme og risiko for brystkreft. Nylig, Michailidou K et al. [22] har funnet rs7904519 i intron 4 av
TCF7L2 plakater (r
2 = 0,37 med rs7904519 /rs12255372), til å bli assosiert med brystkreft. Videre studier er nødvendig for å undersøke de potensielle ulike mekanismer for
TCF7L2
polymorfisme i ulike kreftformer.
heterogenitet mellom studiene er vanlig i meta-analyse av genetiske assosiasjonsstudier. Selv om heterogenitet kan tas i betraktning ved å utføre en tilfeldig effekt-modell, ville det øke oddsen for type I feil [23]. Vi fant signifikant mellom-studie heterogenitet i foreningen av
TCF7L2
rs7903146 polymorfisme med kreftrisiko. Derfor ble subgruppeanalyse krefttyper utføres for å utforske kilden til heterogenitet. Resultatene viste at mellom-studien heterogenitet forsvant i flere undergrupper, men forble i andre undergrupper som tyder på andre kovariater kan forvirre foreningen.
Den aktuelle meta-analyse har flere sterke sider. Først, OR (95% CI) etter kovariabler justering fra individuelle studier ble anvendt for å beregne den sammenslåtte anslaget, som økte nøyaktigheten av estimatet virkning. For det andre, statistisk styrke økte betraktelig for foreningen studie av
TCF7L2
rs7903146 polymorfisme i samleanalysen. Imidlertid flere begrensninger skal også bemerkes. Først tilfelle – ikke kontroll studiedesign ikke tillate for slutning om årsakssammenheng mellom genet polymorfisme og utfallet. For det andre, effekten av genet – gen /gen – miljø interaksjoner ble ikke behandlet i denne meta-analysen. For det tredje, selv om etnisitet spiller en viktig rolle i foreningen av
TCF7L2
rs7903146 polymorfisme med kreftrisiko, det gjorde vi ikke utføre ytterligere subgruppeanalyse etnisitet på grunn av begrensede studier for hver krefttype.
som konklusjon viser resultatene indikerte at det var en signifikant sammenheng mellom
TCF7L2
rs7903146 polymorfisme og risikoen for brystkreft, prostatakreft og tykktarmskreft, snarere enn tykktarmskreft, lungekreft og eggstokk-kreft. Videre veldesignede store studier med behandling av gene-gen og gen-miljø interaksjoner bør gjennomføres for å undersøke sammenhengen i fremtiden.
Hjelpemiddel Informasjon
Sjekkliste S1.
PRISMA Sjekkliste
doi:. 10,1371 /journal.pone.0071730.s001 plakater (DOC)
