Abstract
Vedlikehold av en balanse mellom commensal bakterier og mucosal immunsystem er avgjørende, og intestinal dysbiosis kan være en viktig hendelse i patogenesen av tykktarmskreft (CRC). Den toll-lignende reseptor 4 (TLR4) er en viktig mønstergjenkjenning reseptoren som regulerer betennelse og barrierefunksjonen i tarmen ved en mekanisme som innebærer aktivering av den nukleære faktor-kB (NF-kB) transkripsjonsfaktor. liv og kosttilskudd stil faktorer kan påvirke disse funksjonene. Vi brukte derfor en dansk prospektiv case-kohort studie av 1010 CRC saker og 1829 tilfeldig utvalgte deltakere fra den danske Diet, kreft og Helse kohort å undersøke tre polymorfismer i
NFKB1 Hotell og
TLR4 Hotell og deres mulige interaksjoner med kosthold og livsstilsfaktorer i forhold til risiko for CRC. Homozygot transport av varianten allel av
TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfisme var assosiert med økt risiko for CRC (insidensrate ratio (IRR) = 1,30; 95% konfidensintervall (CI): 1,05 til 1,60; P = 0,02 (gen-dose modell); IRR = 1,24; 95% KI: 1,01 til 1,51; P = 0,04 (recessivt modell)). Del-bærere av
NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfisme hadde en 17% (95% KI: 1,03 til 1,34; P = 0,02) økt risiko for CRC i forhold til homozygote bærere av ins-allelet. Men ingen av disse risikoestimater tålt justering for multiple sammenligninger. Vi fant ingen sterke gen-miljø interaksjoner mellom undersøkt polymorfisme og kosthold og livsstilsfaktorer i forhold til CRC risiko
Citation. Kopp TI, Andersen V, Tjønneland A, Vogel U (2015) Polymorfisme i
NFKB1 Hotell og
TLR4 Hotell og Interaksjon med livsstil og kostholdsfaktorer i forhold til tykktarmskreft i en dansk prospektiv case-undersøkelsen. PLoS ONE 10 (2): e0116394. doi: 10,1371 /journal.pone.0116394
Academic Redaktør: Jeffrey S. Chang, National Health Research Institutes, TAIWAN
mottatt: 21 august 2014; Godkjent: 09.12.2014; Publisert: 23 februar 2015
Copyright: © 2015 Kopp et al. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Data Tilgjengelighet: All relevant data er i avisen og dens saksdokumenter filer
Finansiering:. prosjektet ble støttet av en PhD stipend fra danske forskningsråd i programmet «en integrert tilnærming til risiko-nytte vurdering av menneskelige helseeffekter av mat og mat forurensninger «(Forskeruddannelse 2009-10), og med en doktorgrad Mobility stipend (09-06 7572) fra den danske Rådet for Independent forskning (www.ufm.dk) og som en del av prosjektet: «Beef versus svinekjøtt forbruk i etiologi av kreft i tykktarm og endetarm: undersøkelser foretatt i kosten, kreft og Helse kohort «også fra den danske Rådet for Uavhengig forskning; Medical Sciences (gi nr. 09-073597) (www.ufm.dk). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:. Forfatterne har lest journalen politikk og har følgende konkurrerende interesser: VA mottar kompensasjon som konsulent for Merck Co., Inc. (MSD) og Janssen. Dette endrer ikke forfatternes tilslutning til PLoS ONE politikk på deling av data og materialer.
Innledning
Tykktarmskreft (CRC) er den tredje vanligste krefttypen hos menn og andre kvinner verdensomspennende [1]. Arvelige faktorer er anslått å bidra til bare 35% av risikoen [2] streker viktigheten av miljøfaktorer i etiologien av CRC. Faktisk har kosten og livsstilsfaktorer blitt nøye studert for sin rolle i kolorektal kreftutvikling; og alkohol, røyking, fedme og høyt inntak av kjøtt er nå etablert risikofaktorer for CRC [3-5]. Inntak av rødt og bearbeidet kjøtt har potensial til å fremkalle kreft ved kjemiske karsinogener som dannes ved koking av kjøtt ved høye temperaturer [6], produksjon av toksiske gjærings forbindelser [7-9] eller ved å fremkalle inflammasjon på grunn av endringer i bakterieblanding [10] . Omvendt, fiber, frukt og grønnsaker gir kortkjedede fettsyrer (SCFAs) til kolonepitelet ved fermentering av uabsorbert diettfiber og stivelse [11-15]. Den SCFA butyrat er viktig for colonic integritet [14], hemmer veksten av kreftceller
in vitro product: [16,17] og har anti-inflammatoriske egenskaper hovedsakelig ved inhibering av nukleær faktor-kB (NF-kB) aktiverings [18].
Toll-lignende reseptorer (TLR) er viktige mønstergjenkjenning reseptorer som regulerer betennelse og barrierefunksjon i tarmen og dermed opprettholde en balanse mellom commensal bakterier og mucosal immunsystemet [19,20] . Reseptoren for gram-negativ bakteriell lipopolysakkarid (LPS), TLR4, regulerer celleproliferasjon som respons på celleskade gjennom induksjon av cyklooksygenase 2 uttrykk [21] i en kaskade som involverer aktivering av NF-kB og epidermal vekstfaktor [22] tyder på at TLR4 er et viktig element i overgangen fra betennelse til neoplasi [19]. Faktisk har økt ekspresjon av TLR4 vært knyttet til utviklingen av betennelse-assosierte neoplasier [23-26]. I tillegg har vi tidligere har funnet bevis for at inflammasjon kan bidra til CRC carcinogenesis. Således genetisk bestemt høy IL-1 og COX-2-nivåer var assosiert med øket risiko for CRC [27].
dysbiosis i tarmen kan være en viktig hendelse i patogenesen av begge inflammatoriske tarmsykdommer (IBD) og CRC. Ved hjelp av funksjonelle enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) og deres samspill med kosthold og livsstil kan avsløre viktige veier for kolorektal kreftutvikling [28]. Siden
TLR
polymorfismer har blitt assosiert med IBD [29], vi forsøkte å undersøke en mulig felles mekanisme for IBD og CRC.
Vi har tidligere vist at å bære den varianten del-allelet av funksjonelle moduler /del
NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfisme er assosiert med økt risiko for CRC og interaksjon med kjøtt inntak i en undergruppe av den aktuelle studiegruppen [30] i samsvar med resultatene fra to andre studier også rapporterer økt risiko av CRC blant variant bærere av polymorfisme blant en malaysisk [31] og en svenske befolkningen [32], men ikke en kinesisk studie gruppe [32]. En funksjonell SNP i
TLR4 plakater (rs4986790) har blitt grundig studert og har vært assosiert med neoplastisk progresjon
in vitro product: [33], aggressiv menneskelige tykktarmskreft [33], IBD [34-37 ] og CRC [38-40]. Men andre var ikke i stand til å finne en sammenheng mellom CRC og SNP [41-43]. I en kanadisk studie [44], ble inntak av kosttilskudd mettede fettsyrer omvendt relatert til blod nivå av high density lipoprotein kolesterol hos personer homozygote for
TLR4 Twitter /rs5030728 G-allelet.
TLR4 Twitter /rs5030728 kan derfor interagere med kosten komponenter i tarmen.
Derfor forventet vi at betennelse er en viktig faktor i kolorektal kreftutvikling og dermed undersøkt om kosthold og livsstilsfaktorer (ikke- steroide antiinflammatoriske legemidler (NSAID) og røyking) modifisere CRC risikoen ved å endre mucosal immunrespons i tarmen via samspill med TLR4 og NF-kB. Vi vurderte derfor tre polymorfismer i
NFKB1 Hotell og
TLR4 Hotell og deres mulig interaksjon med kosthold og livsstilsfaktorer i en prospektiv kohort av 1010 CRC saker og 1829 tilfeldig utvalgte deltakere fra den danske Diet, Cancer og Health Study.
Materiale og metode
Studerte fag
The Diet, kreft og Helseundersøkelsen er en pågående dansk kohortstudie designet for å undersøke sammenhengen mellom kosthold, livsstil og kreftrisiko [45]. Kohorten består av 57,053 personer, rekruttert mellom desember 1993 og mai 1997. Alle deltakerne ble født i Danmark, og enkeltpersoner var 50 til 64 år og hadde ingen tidligere kreft ved studiestart. Blodprøver og spørreskjemadata om kosthold og livsstil ble samlet ved studiestart.
Oppfølging og endepunkter
Oppfølging var basert på populasjonsbaserte kreftregistre. Mellom 1994 og 31 desember 2009, ble 1010 CRC tilfeller diagnostisert. En sub-kohort av 1829 personer ble tilfeldig valgt i kohort. 28 personer ble begge tilfeller og sub-kohort på grunn av brukte studiedesign [46]. 245 med manglende genotype data og 16 med manglende data om risikofaktorer ble ekskludert. All informasjon på genotyper og kosthold og livsstilsfaktorer var tilgjengelig for 915 CRC saker og 1719 sub-kohort medlemmer.
Fôr og livsstil spørreskjema
Informasjon om kosthold, livsstil, vekt, høyde, medisinsk behandling , miljømessige eksponeringer og andre sosio-økonomiske faktorer var samlet på innmelding bruker spørreskjemaer og intervjuer og har blitt beskrevet i detalj andre steder [27,47-49]. Kort sagt, maten frekvens spørreskjema, ble diett forbruk vurdert i 12 kategorier av forhåndsdefinerte svar, rangering fra «aldri» til «åtte ganger eller mer per dag». Den daglige inntak ble deretter beregnet ved FoodCalc [45]. Røyking status ble klassifisert som aldri, tidligere eller nåværende. Personer røyke minst en sigarett daglig i løpet av det siste året ble klassifisert som røykere. NSAID ( «Aspirin», «Paracetamol», «Ibuprofen», eller «andre smertestillende midler) ble vurdert som ≥ 2 piller per måned i løpet av ett år ved baseline.
Genotyping
Buffy coat -preparatene ble lagret ved minus 150 ° C inntil bruk. DNA ble ekstrahert som beskrevet [50]. DNA ble genotypet av LGC KBioscience (LGC KBioscience, Hoddesdon, Storbritannia) med PCR-basert KASP genotyping analysen (Feil! Hyperkobling referansen ikke er gyldig. Www.lgcgenomics.com/).
NFKB1 Twitter /rs28362491 ble analysert og rapportert for en undergruppe av den aktuelle studiegruppen [30]. To av polymorfismer (
NFKB1 Twitter /rs28362491 og
TLR4 Twitter /rs4986790) ble valgt på grunnlag av kjent funksjonalitet og deres tilknytning til CRC [30-33] og IBD [34-37] fra en litteratursøk.
TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfisme, derimot, har ingen kjent funksjonalitet. Men
TLR4 Twitter /rs4986790 er tett knyttet sammen med
TLR4 Twitter /rs5030728 (D «: 1,0; r
2: 0,017) med Haploview versjon 4.2 (Broad Institute of MIT og Harvard, Cambridge) [51] med HapMap3 Genome Browser utgivelsen # 2 (fase 3) [52]; og siden
TLR4 Twitter /rs5030728 har en høyere mindre allel frekvensen i kaukasiere enn
TLR4 Twitter /rs4986790 (0,305 g 0,035), er dette polymorphism mer egnet for gen-miljø interaksjon analyser. For å bekrefte reproduserbarhet, genotyping ble gjentatt for 10% av prøvene som gir 100% identitet.
Statistisk analyse
Avvik fra Hardy-Weinberg likevekt ble vurdert ved hjelp av en Chi-kvadrat test.
insidensraten forholdstall (IRR) og 95% konfidensintervall (KI) ble beregnet etter prinsippene for analyse av case-kohort studier ved hjelp av en un-vektet tilnærming [46]. Alder ble brukt som tidsskalaen i Cox regresjonsmodeller. Tester og konfidensintervall var basert på Wald tester ved hjelp av robust estimat av variansen-kovariansmatrisen for regresjonsparametrene i Cox regresjonsmodeller [53] som tidligere beskrevet [27,46,48,54-61].
Alle modellene ble justert for utgangsverdier av risikofaktorer for tykktarmskreft som kroppsmasseindeks (BMI) (kg /m
2, sammenhengende), bruk av hormonsubstitusjonsbehandling (HRT) (aldri /fortid /strøm, blant kvinner), inntak av kostfiber (g /dag, kontinuerlig), og rødt kjøtt og bearbeidet kjøtt (g /dag, kontinuerlig) og i tillegg til mistenkte risikofaktorer som NSAID (ja /nei) og røykestatus (aldri /fortid /strøm). Korn, fiber, frukt og grønnsaker ble også inngått lineært. Alle analyser ble fordelt etter kjønn, slik at de grunnleggende (underliggende) farer var kjønnsspesifikke. For alle polymorfismer, ble IRR beregnes separat for heterozygote og homozygote varianten allel bærere. For
TLR4 Twitter /rs4986790 og
NFKB1 Twitter /rs28362491, variant allel bærere ble deretter gruppert for samhandling analyser siden ingen recessive effekter ble observert.
TLR4 /
rs5030728 ble utledes både i et gen-dose og en recessiv modus i de påfølgende analysene.
Videre vurderes vi ukentlig bruk av NSAID basert på resultatene av en studie av tykk- og endetarmskreft i kosten, kreft og Helse kohort [62] rapporterer at langsiktig konsekvent bruk av Aspirin eller Non-Aspirin NSAID synes nødvendig for å oppnå en beskyttende effekt. Men det var ingen forskjeller i risikoestimater mellom månedlig eller ukentlig bruk, derfor å opprettholde den statistiske kraften i lag; vi brukte månedlig NSAID bruk i analysene.
likelihood ratio test ble brukt for samhandling analyser mellom de studerte polymorfismer og inntak av rødt og bearbeidet kjøtt, kostfiber, korn, fisk, frukt, grønnsaker, alkoholinntak, røykestatus og NSAID bruk. I samspill analyserer hvor kostholdsfaktorer ble ført som kategoriske variabler, tertile cutpoints var basert på empiriske fordelingen mellom mannlige og kvinnelige tilfeller, henholdsvis. De mulige interaksjoner ble undersøkt ved hjelp av likelihood ratio test.
Alle analysene ble utført ved hjelp av SAS versjon 9.3 (SAS Institute Inc., Cary, NC). En p 0,05 ble ansett for å være betydelig. Videre, for å teste for flere sammenligninger, ble Bonferronikorreksjon brukt.
Etikk uttalelse
Alle deltakerne ga muntlig og skriftlig informert samtykke. The Diet, kreft og Helse Studien ble godkjent av National Committee on helsefaglig forskningsetikk (journal nr. (KF) 01-345 /93) og den danske Datatilsynet.
Resultater
baseline karakteristikker av studiepopulasjonen er presentert i tabell 1. Blant sub-kohort medlemmer, genotypen fordelingen av SNPs ikke avvike fra Hardy-Weinberg likevekt (resultater ikke vist).
Sammenhenger mellom polymorfismer og CRC
Homozygote variant bærere av
TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfisme var på 1,30 ganger (95% KI: 1,05 til 1,60) økt risiko for CRC i et gen-dose modell og på 1,24 fold (95% KI: 1,01 til 1,51) økt risiko for CRC i forhold til villtype og heterozygote bærere i en recessiv modell (tabell 2). Videre bærere av
NFKB1
del-allelet hadde en 17% (95% KI: 1,03 til 1,34) økt risiko for CRC i forhold til homozygote bærere av ins-allelet (tabell 2). Disse risikoestimater ikke, men nå statistisk signifikans etter Bonferroni korreksjon. Det var ingen interaksjon mellom de to risiko genotypene
TLR4 Twitter /rs5030728 og
NFKB1 Twitter /rs28362491 men på den annen side, var det ingen additiv effekt av å være homozygot bærer av både variant alleler (S1 Table ).
Gene-miljø analyser
Vi fant ingen interaksjon mellom noen av kostholdsfaktorer og de studerte polymorfismer i forhold til risiko for CRC i de lineære analyser (S2 Table). I tertile analyser, det var svak interaksjon mellom
TLR4 Twitter /rs5030728 og inntak av grønnsaker (Gene-dose modell: P-verdi for samhandling (P
int) = 0,05; Recessiv modell: P
int = 0,03) (tabell 3). Videre er en border statistisk signifikant interaksjon mellom inntak av kjøtt og
NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfisme (P
int = 0,06) ble funnet (tabell 3). For ins-bærere, risikoestimater var sammenlignbare på tvers tertiles kjøttinntak. Motsatt, blant del-bærere, inntak av kjøtt i den andre (IRR = 1,46; 95% KI: 1,17 til 1,83) og tredje tertile (IRR = 1,24; 95% KI: 0,99 til 1,56) var assosiert med risiko for CRC, mens del-allel bærere var ikke i fare i første tertile med lavt inntak av kjøtt (IRR = 0,98; 95% KI: 0,78 til 1,23). Med hensyn til alkohol, variant bærere av
NFKB1 Twitter /rs28362491 og homozygot A-allelet bærere av
TLR4 Twitter /rs5030728 var assosiert med CRC risiko i forhold til de homozygote villtype bærere blant deltakerne med en lav inntak av alkohol. Videre, for variant bærere av alle tre polymorfismer, et lavt inntak (første tertile) av alkohol var assosiert med høyest CRC risiko sammenlignet med moderat (andre tertile) inntak-som ble assosiert med lavest risiko og høyt alkoholinntak (tredje tertile ) (Tabell 3).
Det var ingen interaksjon mellom NSAID bruk eller røykestatus og de studerte genotyper (S3 og S4 tabeller). Blant ikke-røykere (S4 tabell), men
TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfisme demonstrert gen-dose effekt som kan sammenlignes med resultatene sett blant deltakerne med lavt inntak av alkohol (tabell 3). I en modell der risikoen for CRC ble utledes per 25 g inntak av kjøtt per dag deles av NSAID, risiko for CRC ved inntak av kjøtt økte på en doseavhengig måte blant variant allel bærere av
TLR4 Twitter /rs5030728 i fravær av NSAID, men ikke blant NSAID-brukere (S5 Table). Dermed kjøtt inntak ble ikke forbundet med risiko blant homozygote bærere av villtype-allelet, mens kjøtt inntaket var assosiert med en 4% økt risiko per 25 g kjøtt /dag (95% KI: 1,00 til 1,09) blant heterozygoter og 11% økt risikoen blant homozygot variant allel bærere (95% CI: 01.02 til 01.22). Men det var ingen statistisk signifikante interaksjoner (S5 tabell).
Diskusjoner
I denne studien fant vi at homozygot variant transport av
TLR4 Twitter /rs5030728 og variant vogn av
NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfisme var assosiert med økt risiko for CRC, men ikke etter korreksjon for multippel testing. Vi fant bare svake interaksjoner med noen kostholdsfaktorer, og dermed var vi ikke i stand til å reprodusere tidligere funnet samspillet mellom
NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfisme og kjøtt inntak. Mangelen på sammenheng mellom
TLR4 Twitter /rs4986790 og CRC funnet i denne studien kan være på grunn av svært lav variant allel frekvens i den danske befolkningen. Bare én person var homozygot variant allel bærer. Vi kan derfor ikke utelukke at den funksjonelle effekten av denne SNP påvirker kolorektal kreftutvikling.
NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfisme har heller konsekvent blitt assosiert med CRC risiko [30-32], og til en viss grad også IBD [29,63,64]. Som tidligere beskrevet [65,66],
NFKB1
koder p50 /P105 subenheter av transkripsjonsfaktoren NF-kB. NF-kB består av homo- eller heterodimerer av et antall forskjellige subenheter p65, P50, P105, C-rel og relB [67,68] og kombinasjonen bestemmer målgenet spesifisitet. Som et p65 /p50 heterodimer, komplekset er pro-inflammatorisk [68], mens p50-homodimer har anti-inflammatoriske egenskaper [65,67,69,70]. Den relative overflod av P50 /P65 P50 heterodimerer og homodimerer vil derfor bestemme størrelsen av betennelse ved å balansere den pro-inflammatorisk og anti-inflammatoriske respons [67].
NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfisme genererer en sletting av fire nukleotider i promoter regionen forårsaker senket transkripsjonsnivå og dermed delvis utarming av p50 [63]. Etter avtale med dette, ble det funnet at mRNA nivåer av
NFKB1
var lavere i tykktarm biopsi av friskt vev fra homozygot del-operatører i forhold til heterozygoter [71]. Dette disfavours den anti-inflammatoriske respons siden dannelsen av pro-inflammatoriske p65 /p50 heterodimer avhenger av konsentrasjonen av p50, mens dannelsen av den anti-inflammatoriske p50 homodimer avhenger av konsentrasjonen av p50 kvadrerte [65].
TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfisme har ennå ikke vært knyttet til CRC [20] og dens funksjon er ukjent [72].
TLR4 Twitter /rs4986790, som har vært assosiert med IBD og CRC, er tett knyttet sammen med
TLR4 Twitter /rs5030728. Det er derfor ikke klart hvilke av de to polymorfismer er den biologisk relevant en. Men våre resultater viser at transport av
TLR4 Twitter /rs4986790 var ikke forbundet med risiko for CRC, mens transport av
TLR4 Twitter /rs5030728 var forbundet med risiko. Dette tyder på at risikoen gitt av
TLR4 Twitter /rs5030728 vogn var ikke forårsaket av sammenhengen med
TLR4 Twitter /rs4986790. Interessant, variant transport av
TLR4 Twitter /rs5030728 A-allelet har vært forbundet med gunstig respons på anti-TNF behandling blant pasienter med IBD [73], noe som tyder på at disse pasientene kan ha en høyere baseline aktivitet eller uttrykk for TLR4.
de to
TLR4
SNP er tilstede på flere vanlige GWAS arrays (https://www.broadinstitute.org/mpg/snap/ldsearch.php) mens ins /del
NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfi ikke er overvåket kobling i GWAS [65]. Ingen av de to TLR4 SNPs ble assosiert med CRC i GWAS. Men vårt hovedfokus var å søke etter gen-miljø interaksjoner, snarere enn å identifisere loci med sterke assosiasjoner til CRC. Gene-miljø interaksjoner blir sjelden vurdert i GWAS.
Vi fant ikke noen sterke indikasjoner på gen-miljø interaksjoner. For variant bærere av
NFKB1 Twitter /rs28362491 og homozygot A-allelet bærere av
TLR4 Twitter /rs5030728, risiko for CRC blant lave kjøtt forbrukerne ble lavere sammenlignet med middels og høy kjøtt forbrukere, som hadde risiko estimatene mellom 1,24 og 1,70 indikerer en sterkere rolle kjøtt i kolorektal kreftutvikling hos pasienter med genetisk betinget høy betennelsesreaksjon. Alternativt kjøtt inntak covaries med andre livsstilsfaktorer som
per se
indusere en betennelsesreaksjon som vi ikke har vært i stand til å justere for.
Den fant samspill med grønnsaker og
TLR4
/rs5030728 i denne studien er ikke direkte tolkes og kan være på grunn av små grupper i tertiles. Men grønnsaker virket litt økt risiko for CRC i denne studien, som bør tas opp i andre prospektive studier.
Vi hadde begrenset statistisk styrke til å påvise gen-miljø interaksjoner. Men den prospektive studien utformingen anvendt i denne studien er godt egnet for gen-miljø interaksjon analyser på grunn av samling av kosttilskudd og livsstilsfaktorer før diagnose, eliminerer risikoen for tilbakekalling skjevhet. Endring i kosttilskudd og livsstil vaner under oppfølging er imidlertid mulig, men er ikke forventet å medføre differensial feilklassifisering mellom saker og sammenligningsgruppen. I tillegg er den foreliggende studien gruppen bestående av homogen danske og to av de studerte polymorfismer har høye allel frekvenser. Ved hjelp av denne studien gruppen, har vi tidligere funnet gen-miljø interaksjoner mellom kosthold og
IL10
rs3024505 (P
int, kjøtt = 0,04, fisk = 0,007, fiber = 0,0008, grønnsaker = 0,0005),
IL1B
C-3737T (P
int; NSAID = 0,040),
PTGS2
G-765C (P
int, kjøtt = 0,006, fiber = 0,0003, frukt 0,004) og
PTGS2
T8473C (P
int, frukt = 0,03) og
PTGS2
A-1195G (P
int, fiber 0.020 og røkte = 0,046) [27] . Vi justerte risikoestimater for mistanke om risikofaktorer og nøye utvalgte polymorfismer basert på funksjon og /eller tidligere funn på samarbeid med kostholdsfaktorer, CRC eller IBD. Imidlertid har ingen av analysene motsto å justere for multiple testing. Dermed kan vi ikke utelukke at våre funn skyldes en tilfeldighet, og de bør derfor ikke betraktes som signifikante sammenhenger.
I konklusjonen, denne studien var ikke i stand til å demonstrere sammenhengen mellom de studerte polymorfismer i inflammatoriske mediator gener
NFKB1 Hotell og
TLR4
som ingen av de funnet foreninger motsto justering for multiple sammenligninger. Vi fant ingen sterke gen-miljø interaksjoner mellom de undersøkte polymorfismer og kosthold og livsstilsfaktorer i forhold til CRC risiko.
Hjelpemiddel Informasjon
S1 Table. IRR for CRC i forhold til kombinasjoner av
NFKB1 Twitter /rs2836249 og
TLR4 Twitter /rs5030728 genotyper
doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s001 plakater (docx)
S2 Table. Interaksjon mellom kostholdsfaktorer og de studerte polymorfismer i forhold til CRC risiko
doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s002 plakater (docx)
S3 Table. Interaksjon mellom NSAID og de studerte polymorfismer i forhold til CRC risiko
doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s003 plakater (docx)
S4 Table. Interaksjon mellom røykestatus og de studerte polymorfismer i forhold til risiko for CRC
doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s004 plakater (docx)
S5 Table. Interaksjon mellom NSAID og de studerte polymorfismer per 25 g rødt og bearbeidet kjøtt inntak per dag i forhold til CRC risiko
doi:. 10,1371 /journal.pone.0116394.s005 plakater (docx)
takk til
Vi takker Nick Martinussen og Katja Boll for teknisk assistanse med data styring; og Jane Christensen for statistisk rådgivning. Prosjektet ble støttet av en PhD stipend fra danske forskningsråd i programmet «En integrert tilnærming til risiko-nytte vurdering av menneskelige helseeffekter av mat og mat forurensninger «(Forskeruddannelse 2009-10), og med en doktorgrad mobilitetsstipend (09 -06 7572) fra den danske Rådet for Independent forskning (www.ufm.dk) og som en del av prosjektet: «Beef versus svinekjøtt forbruk i etiologien av kreft i tykktarm og endetarm: undersøkelser foretatt i kosten, kreft og helse kohort «også fra det danske Rådet for Uavhengig forskning; Medical Sciences (gi nr. 09-073597) (www.ufm.dk). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet.
