Abstract
Innledning
Polymorphic varianter i 5p15, 6p12, 6p21, og 15q25
loci
ble demonstrert for potensielt bidra til lungekreft kreftutvikling. Derfor ble denne studien utført for å vurdere hvilken rolle disse variantene i ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) risiko og prognose i en portugisisk befolkning.
Materialer og metoder
Blod fra pasienter med NSCLC ble prospektivt samlet. For å utføre en forening studie, ble DNA fra disse pasienter og friske kontroller genotypet for et panel av 19 SNPs ved hjelp av en Sequenom® MassARRAY plattform. Kaplan-Meier-kurver ble brukt til å vurdere total overlevelse (OS) og progresjonsfri overlevelse (PFS).
Resultater
Ett hundre og førtifire pasienter med NSCLC ble vellykket fortløpende genotypet for de 19 SNPs. En SNP ble assosiert med NSCLC risiko: rs9295740 G /A. To SNPs ble assosiert med ikke-plateepitel histologi: rs3024994 (VEGF intron 2) T /C og rs401681 C /T. Tre SNPs var assosiert med svarprosent: rs3025035 (VEGF intron 7) C /T, rs833061 (VEGF -460) C /T og rs9295740 G /A. En SNP demonstrert en innflytelse på PFS: rs401681 C /T på 5p15, p = 0,021. Fire SNPs demonstrert en innflytelse på OS: rs2010963 (
VEGF
405 G /C), p = 0,042; rs3025010 (
VEGF
intron 5 C /T), p = 0,047; rs401681 C /T på 5p15, p = 0,046; og rs31489 C /A på 5p15, p = 0,029.
Konklusjoner
Vår studie tyder på at SNPs i 6p12, 6p21, og 5p15
loci
kan tjene som risiko, prediktive og prognostiske NSCLC biomarkører. I fremtiden kan SNPs identifisert i genomene til pasientene bedre NSCLC screening strategier og terapeutisk ledelse så vel
Citation. De Mello RA, Ferreira M, Soares-Pires F, Costa S, Cunha J, Oliveira P , et al. (2013) Virkningen av Polymorphic Variasjoner i 5p15, 6p12, 6p21 og 15q25
Loci
på risiko og prognose av portugisiske pasienter med ikke-småcellet lungekreft. PLoS ONE 8 (9): e72373. doi: 10,1371 /journal.pone.0072373
Redaktør: Zhengdong Zhang, Nanjing Medical University, Kina
mottatt: 6 juni 2013, Godkjent: 16 juli 2013; Publisert: 06.09.2013
Copyright: © 2013 de Mello et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette prosjektet ble støttet av Programa Doutoral em Medicina e Oncologia Molecular, Universitetet i Porto, Porto, Portugal og University of Minho, Braga, Portugal. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:. Ramon Andrade de Mello, MD, PhD (tilsvar forfatter) er en faglig redaktør for PLoS ONE. Men dette betyr ikke endre forfatternes tilslutning til alle PLoS ONE politikk på deling av data og materialer.
Innledning
Lungekreft er en aggressiv sykdom som påvirker mer enn 1,5 millioner mennesker over hele verden [ ,,,0],1]. En amerikansk studie anslått at det var 226,160 lunge krefttilfeller og 160 340 lungekreftdødsfall for begge kjønn [2], tilsvarende 29 og 14% av alle kreftrelaterte dødsfall hos menn og kvinner, henholdsvis [2]. I 2008 ble om lag 3000 nye lungekreft tilfeller og omtrent samme antall lungekreftrelaterte dødsfall rapportert i Portugal [3], [4]. Ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) representerer 85% av lungekreft tilfellene [5]. Nylig ble en randomisert studie viste overlegenhet lungekreft screening ved hjelp av lavdose computertomografi sammenlignet med standard røntgen og presenterte en 20% reduksjon i døden [6]. Dermed optimalisere screening verktøy i en høy-risiko befolkning er viktig for klinikere som forsøker å redusere kreftforekomst og dødelighet lunge.
Mange risikofaktorer er kjent for å være ansvarlig for lungekreft mottakelighet, inkludert tobakk [7], passiv røyk og yrkessykdommer [8], [9]. Dessuten har den genomiske profilen nylig dukket opp som en viktig bidragsyter til lungekreft kreftutvikling [10] – [23]. I 2009, et genom-wide forbundet studie (GWAS) rapporterte at en polymorfe variant i 5p15.33
locus
, rs2736100 (
TERT
), var assosiert med lunge adenokarsinom følsomhet [10] . I 2012 Ito
et al.
Demonstrerte at variantene ligger i CHRNA5-CHRNA3-CHRNB4 klynge på kromosom 15q25 (rs12914385, rs1317286, og rs931794) endret effekten av røyking på risikoen for lungekreft i en japansk befolkning men viste ingen statistisk signifikante primære effekt på risikoen for lungekreft [11]. Vår gruppe demonstrert virkningen av epidermal vekstfaktor 61 A /G polymorfismer (ligger på kromosom 4q25-Q27) på NSCLC risiko i et portugisiske befolkningen [13].
Angiogenese er kjent for å spille en viktig rolle i NSCLC kreftutvikling [5]. Vaskulær endotelial vekstfaktor (VEGF) og dens reseptor (VEGFR) er ansett som den viktigste katalysatorene nytt fartøy opprettelse og tumor angiogenese [24]. En fersk systematisk rapportert at mange polymorfe variasjoner i 6p12 og 6p21
loci
kunne bidra til serum VEGF uttrykk modulasjon og kan dermed påvirke svulst risiko og prognose [5]. Viktigere, nåværende anti-angiogene terapier [4], [25] – [27], er i klinisk bruk, og den genetiske make-up av pasienter, særlig allele varianter av de angiogene proteiner (f.eks VEGF og VEGFR), kan modulere pasientens respons på disse terapier. Dermed vurderer alle de overordnede trekk ved polymorfe varianter i 5p15, 6p12, 6p21 og 15q25
loci Hotell og NSCLC tumor atferd, vår gruppe gjennomførte denne studien å vurdere rollen til de genetiske polymorfismer i 5p15, 6p12, 6p21 og 15q25
loci
på NSCLC risiko, med en sekundær sikte på å vurdere hvilken rolle disse variantene i pasientens utfall.
Materialer og metoder
design og innstilling
En sak styrt /prospektiv studie fra februar 2010 til april 2011 ble gjennomført i to sentrale Nord-Portugal Sykehus: São João Hospital University Center, Porto, Portugal og São Marcos Hospital, Braga, Portugal. Laboratoriestudier ble sentralisert på liv og helse Sciences Research Institute, School of Health Sciences, University of Minho, Braga, Portugal.
Fag
For den statistiske utarbeidelsen av denne studien, sample beregninger var utføres før rekruttering av pasienter med 95% konfidensielt intervall (CI) formel, og vi vurderte en genotype andel forskjell mellom saker og kontroller som strekker seg fra 10 til 20%. Vi brukte Piface programvare (https://homepage.stat.uiowa.edu/~rlenth/Power/) og estimert prøvenummer for ca 126 pasienter for en strøm 0,8 og
p
0,05 .
inklusjonskriteriene for denne studien inkluderte pasienter med en bekreftet NSCLC diagnose ved histopatologisk undersøkelse, mer enn 21 år ved opptak, en anbefaling for behandling på deltakernes institusjon, og informert samtykke etter forklaring av studiens funksjoner ved en av forskerne.
Alle de pasientoppfølging informasjonen ble innhentet ved å konsultere kliniske poster. Den lungekreft pasienten median oppfølgingstid på 12 måneder. For NSCLC risikovurdering, ble en gruppe blodgiver kontroller valgt fra et kontrollrom satt til å matche for kjønn og justere for alder i den statistiske analysen. Kontrollgruppen hadde ingen oppfølging informasjon. Signert informert samtykke ble innhentet fra hver deltaker. São João universitetssykehus Regional etisk komité godkjente denne studien. Alle pasienter og kontroller som er involvert i denne studien var portugisiske kaukasiere.
førstelinjebehandling data
Pasienter med avansert NSCLC med epidermal vekstfaktor reseptor (
EGFR)
ekson 19 og 21 mutasjoner muntlig fikk 250 mg gefitinib én gang daglig til sykdomsprogresjon ble observert.
EGFR
-negative pasienter med avansert NSCLC ble behandlet med et platinum-basert regime, ifølge kliniske tilstand og indikasjoner.
Variabel Regnes
Følgende demografiske og kliniske data var samlet: alder ved opptak, kjønn, etnisitet, histologisk diagnose, TNM klinisk stadium (i henhold til den amerikanske partssammensatt utvalg på kreft (AJCC) 2010 retningslinjer) [28], [29], Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) funksjonsstatus poengsum på opptak [30], røykestatus
EGFR
mutasjonsstatus, paknings års sigarettforbruk, total overlevelse (OS), og progresjonsfri overlevelse (PFS). Systemisk terapi responsrate (RR) ble vurdert av radiologer ved vår institusjon, i henhold til (Response Evaluere Kriterier Solid Tumor) RECIST retningslinjer versjon 1.1 [31].
Genotyping
DNA ble ekstrahert fra leukocytter i blodprøver ved bruk av kommersielle Citogene® Blood Kit i henhold til produsentens anbefalinger. [32] Den ekstraherte genomiske DNA ble analysert ved agarosegel-elektroforese, kvantifisert ved Nanodrop, og lagret ved -70 ° C inntil bruk.
loci
undersøkt i dette studiet er oppsummert i tabell 1. genotyping av allel-spesifikke primer-ekstensjonsprodukter, som ble generert fra amplifiserte DNA-sekvenser, ble utført ved anvendelse av Sequenom MassARRAY iPLEX gull plattform (Sequenom, San Diego , California) ved Instituto Gulbenkian de Ciencias, Lisboa, Portugal. Primere ble utformet ved hjelp MassARRAY analyse 3.1 programvare (Sequenom, San Diego, California) og genotyping ble utført av en etterforsker som var blindet til prøvestatus (dvs. fra case eller kontrollpersoner). Den genotyping kvalitet ble vurdert av duplikat analyse av 10% av prøvene, som viste en 100% enighet rate.
Statistical Analysis
Χ
2
og Wilcoxon-Mann Whitney tester ble brukt for å sammenligne frekvensen fordelingen av alder, kjønn og genetisk polymorfisme på 5p15, 6p12, 6p21 og 15q25
loci Hotell og allelet fordelingen blant sakene og kontroller. Videre er
Χ
2
test ble brukt til å verifisere at den observerte allel fordelingen i kontrollgruppen var i Hardy-Weinberg likevekt (HWE). Den odds ratio (OR) og 95% KI for effekten av de polymorfe varianter på risikoen for NSCLC ble estimert ved hjelp univariate og multivariate logistiske regresjonsanalyser, som ble justert for kjønn og alder som kontinuerlige variabler. Den falske-positiv rapport sannsynlighet (FPRP) ble beregnet for signifikante sammenhenger observert i multivariate tester ifølge studien ved Wacholder og kolleger [33]. Videre analyserte vi OS og PFS ved hjelp av Kaplan-Meier-kurver. Alle statistiske tester var tosidig, og betydning ble ansett for
p
0,05. Dataanalyse ble utført ved hjelp av IBM SPSS Statistics, versjon 19.0.
Resultater
pasientens kliniske-patologiske data
I løpet av studieperioden, vi fortløpende registrert 144 pasienter med NSCLC og 144 kontroller (tabell 2). Median alder var 61 år (range: 32-89) i NSCLC gruppen og 48 år (range: 35-65) i kontrollgruppen. Tabellene 3 og 1S viser forholdet mellom fordeling av de polymorfe variant allel frekvenser i kontrollgruppen og Hardy-Weinberg likevekt. Alle kontroller var i HWE. Kjønnsfordelingen proporsjonene var den samme blant pasienter med NSCLC og kontroller (matchet 01:01).
Følsomhet Assessment
Etter univariate og multivariate analyser justert for kjønn og Alder (tabell 3 og 1S), fant vi en signifikant sammenheng mellom rs9295740 G /A (6p21) og den generelle NSCLC risiko (OR = 1,978, 95% KI: 1,076 til 3,636), som var hovedsakelig hos menn (OR = 1,921, 95% KI: 0,942 til 3,919). Vi har observert at rs9295740 GA + AA genotype gruppe representert en nesten statistisk signifikant økning i NSCLC risiko sammenliknet med rs9295740 AA genotypen gruppe (OR = 1,742, 95% CI: 0,979 til 3,098). Videre fant vi en nesten statistisk signifikant økning i den totale NSCLC risiko for rs12914385 (
CHRNA3
) C /T polymorfe variasjon (OR = 1,835, 95% KI: 0,964 til 3,490) sammenlignet med rs12914385 (
CHRNA3
) C /C-variant (tabell 3). Videre rs12914385 (
CHRNA3
) CT + TT genotype gruppen påvist en signifikant sammenheng med NSCLC risiko (OR = 1,837, 95% KI: 1,002 til 3,369).
Ved vurdering av sammenhengen mellom de polymorfe varianter i 5p15, 6p12, 6p21 og 15q25
loci Hotell og histologisk subtype, bemerket vi en sammenheng mellom de to genetisk polymorfisme rs3024994 (
VEGF
intron 2) T /C og rs401681 ( CLPTM1L) C /T og ikke-plateepitel histologisk subtype (OR = 5,315, 95% KI: 1,256 til 22,479 og OR = 3,273, 95% KI: 1,006 til 10,648, henholdsvis)
En FPRP beregning demonstrert. at alle de ovennevnte vesentlige polymorfi forbindelser (dvs. rs9295740 (vWF G /A), rs12914385 (CHRNA3 C /T), rs3024994 (VEGF intron 2 T /C), og rs401681 (CLPTM1L C /T)) forble signifikant ( FPRP≤0.5) når en tidligere forening sannsynlighet ≥10% ble vurdert.
Predictive Biomarkører (første linje Regimen Response Rate)
Tabell 4 oppsummerer forholdet mellom de polymorfe varianter studert her og NSCLC utfall hovedsakelig med hensyn til RR av førstelinjebehandling, PFS og OS. For 5p15
locus
, fant vi at rs4635969 (
TERT
) CT + TT genotype gruppen hadde en 44,4% totalt RR sammenlignet med rs4635969 CC genotype,
p
= 0,006 (tabell 4). Vi fant at tre polymorfe variasjoner i 6p12
locus
var prediktive biomarkører for den samlede platina basert regime. Den rs3025035 (
VEGF
intron 7) CT genotype hadde en høyere samlet RR enn rs3025035 (
VEGF
intron 7) CC genotype (72,2% versus 35,5%,
p
= 0,005). Den rs833061 (
VEGF
-460) CT genotype hadde en litt lavere RR enn rs833061 (
VEGF
-460) CC genotype (42,9% versus 43,8%,
p
= 0,036). Den rs833070 (
VEGF
intron 2) AG + GG genotype gruppen hadde en liten indre RR enn AA genotype gruppen (42,6% versus 43,8%,
p
= 0,011). Den rs9295740 G /A genotype i 6p21
locus
hatt en høyere samlet RR enn rs9295740 GG genotype (50% versus 41,8%,
p
= 0,042; tabell 4). Vi fant ingen prediktive biomarkører for førstelinje platinumbasert regime i 15q25
locus
.
progresjonsfri overlevelse
Den generelle PFS av kohorten var 5 måneder (variasjon: 3,95 til 6,40). PFS og genetisk polymorfisme data er oppsummert i tabellene 4 og 2S. Bare to
loci
hadde polymorfe varianter med en innvirkning på PFS: rs9295740 G /A (6p21) og rs401681 C /T (15q25). Den rs9295740 GA genotype i
locus 6p21
vist en trend mot høyere PFS enn rs9295740 GG og rs9295740 AA genotyper: 6 måneder (range: 3,21 til 8,78) versus 4 måneder (spredning: 2,06 til 5,93) versus 4 måneder (variasjon: 0,39 til 7,60), henholdsvis
p
= 0,074. Men rs9295740 GA + AA genotype gruppen hadde en høyere PFS enn rs9295740 GG genotype gruppe: 6 måneder (spredning: 4,31 til 7,68) versus 4 måneder (spredning: 2,06 til 5,93), henholdsvis
p
= 0,034. Den 5p15
locus
rs401681 TT genotype hadde en høyere PFS enn rs401681 CC og rs401681 CT genotyper: 7 måneder (0.001-14.04) versus 2 måneder (spredning: 0,945 til 3,05) versus 5 måneder (range: 3.22- 6,77) måneder, henholdsvis
p
= 0,021 (figur 1A).
Kaplan-Meir kurven av total overlevelse (OS) for rs3025010 (
VEGF
intron 5 ) C /T genetisk polymorfisme (B). Kaplan-Meir kurve for total overlevelse (OS) for rs2010963 (
VEGF
+405) G /C genetiske polymorfismer (C). Kaplan-Meir kurve for total overlevelse (OS) for rs31489 C /A-genetiske polymorfismer (D). Kaplan-Meir kurve for total overlevelse (OS) for de rs31489 CA + AA genotyper versus rs31489 CC genotype (E). Kaplan-Meir kurven av total overlevelse (OS) for rs401681 C /T genetisk polymorfisme (F).
Total overlevelse
OS av studiepopulasjonen var 10 måneder (range : 8,11 til 11,88). De polymorfe varianter i 6p12, 6p21 og 5p15
loci
var signifikant assosiert med OS (tabell 4). To polymorfe varianter i 6p12
locus
var assosiert med OS. I bare den ikke-plateepitel histologisk subtype, den rs3025010 (
VEGF
intron 5) CT genotype hadde en høyere OS enn rs3025010 (VEGF intron 5) TT og rs3025010 (VEGF intron 5) CC genotyper: 13 måneder ( område~~POS=HEADCOMP: 9,63 til 16,36) versus 10 måneder (spredning: 0,0001 til 20,22) versus 6 måneder (range: 3.16-8.83) henholdsvis
p
= 0,047 (figur 1B). Videre, bare stadier IIIB og IV, den rs2010963 (
VEGF
405) GC genotype hadde en høyere OS enn rs2010963 (
VEGF
405) GG og rs2010963 (
VEGF
+405) CC genotyper: 13 måneder (range: 8,70 til 17,29) versus 9 måneder (spredning: 4,17 til 13,82) versus 3 måneder (range: 0,0001 til 8,88), henholdsvis
p
= 0,042 (figur 1C). Den rs9295740 GA + AA genotype gruppe i 6p21
locus
hadde en høyere OS enn rs9295740 GG genotype gruppe: 13 måneder (variasjon: 9,38 til 16,61) versus 9 måneder (spredning: 5,91 til 12,08),
p
= 0,045.
To polymorfe varianter ble assosiert med OS i 5p15
locus
. Vi observerte at i bare den ikke-liten histologi subtype, de rs31489 AA og rs31489 CA genotyper hadde en høyere OS enn rs31489 CC genotype: 13 måneder (spredning: 6,98 til 19,01) versus 13 måneder (spredning: 6,33 til 19,66) versus 6 måneder (variasjon: 1,104 til 10,896), henholdsvis
p
= 0,029 (figur 1D og 1E). Videre rs401681 CT genotype hadde en høyere OS enn rs401681 TT og rs401681 CC genotyper: 13 måneder (spredning: 8,61 til 17,38) versus 10 måneder (variasjon: 5,10 til 14,89) versus 6 måneder (range: 3,02 til 8,97), henholdsvis ,
p
= 0,046 (figur 1F).
diskusjon
NSCLC Risk Biomarkører
I 2009 Landi
et al.
rapportert at nikotin acetylkolin reseptor genvarianter på kromosom 15q25 var assosiert med en forhøyet generelle risikoen for lungekreft [10]. Disse enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) ble også sterkt forbundet med alle de store histologiske grupper av pasienter som var nåværende og tidligere røykere [10]. I vår studie ble rs9295740 G /A genotype (6p21) forbundet med NSCLC risiko i Portugal hovedsakelig hos menn. I 2012 Bae
et al.
Rapportert resultater fra en koreansk studie som vurderte 1094 koreanske pasienter og 1100 friske kontroller [12]. Forfatterne fant ingen sammenheng mellom rs9295740 G /A polymorfisme og lungekreft i en koreansk befolkning. Dette faktum kan forklares ved forskjeller i det genomiske ekspresjon av ulike populasjoner, som tidligere rapportert [34]. Videre fant vi en trend for tilknytning til risikovurdering og forhold, herunder NSCLC risiko hos menn og rs833061 (
VEGF
-460) C /T polymorfismer, samlet NSCLC og rs12914385
CHRNA3
C /T polymorfismer, samlet NSCLC og rs8034191 (LOC123688) T /C-polymorfismer og NSCLC risiko hos menn og rs931794 G /A polymorfismer. Tidligere asiatiske studier [11], [12] rapporterte også polymorfe varianter i 15q25
locus Hotell og NSCLC risiko, noe som tyder på at ustabiliteter i 15q25
locus
kan være en stor formidler av lungekreft kreft . Selv om
locus 5p15
ble tidligere rapportert [35] for å være assosiert med lungekreft følsomhet på grunn av telomerase revers transkriptase og leppe- og ganespalte trans 1-lignende gen effekter, vi kunne ikke finne en sammenheng mellom rs4635969 C /T polymorfismer og NSCLC risiko. I 6p12
locus
, observerte vi en nesten statistisk signifikant sammenheng mellom rs833061 (VEGF -460 C /T) polymorfisme og NSCLC risiko hos menn. I 2008 Zhai
et al.
Gjennomført en studie som vurderte 1.900 saker og 1,458 kontroller i et kaukasiske befolkningen [17]. Zhai og kolleger fant ingen signifikant sammenheng mellom rs833061 og NSCLC, noe som tyder på at 6p12
locus
har ingen sammenheng med overordnet lungekreft mottakelighet. Likevel, vår studie viste at varianter i 6p12 og 15q25
loci
som rs3024994 (
VEGF
intron 2) T /C og rs401681 C /T, henholdsvis, var signifikant assosiert med ikke- plateepitel lungekreft histologi risiko. I 2012, en kinesisk gruppe vurderes 196 lungekreftpasienter og 229 friske kontroller [36]. Denne gruppen fant at flere 5p15 varianter bidratt til lunge adenokarsinom mottakelighet [36].
NSCLC Predictive Biomarkører
EGFR
mutasjoner i eksoner 19 og 21 er den mest effektive, prediktive biomarkører for responsen på EGFR TKI for førstelinje avansert NSCLC behandling [37], [38]. I denne sammenheng, å finne nye prediktive biomarkører for total systemisk behandling er fremdeles en utfordring for klinikere og forskere. Videre tre polymorfe varianter i 6p12 og 6p21
loci
vist en betydelig innflytelse på den samlede svarprosent på første-linje systemisk behandling uavhengig av valgt regime inkludert rs3025035 (
VEGF
intron 7) C /T, rs833061 (
VEGF
-460) C /T, og rs9295740 G /A. Disse resultatene kan potensielt føre til nyttige biomarkører for terapeutisk prediksjon. Viktigere, kan disse genetiske polymorfismer vurderes ved hjelp av blodprøver, noe som øker deres klinisk anvendelse. I mellomtiden kan disse funnene støtter ideen om at VEGF modulasjon kan være en sentral aktør i lungekreft karsinogenese og aggressivitet, som tidligere ble foreslått i pre-kliniske og translasjonsforskning modeller [5], [39].
NSCLC Prognostic biomarkører
Vår studie også evaluert NSCLC prognose ved å vurdere de 19 SNPs og deres forhold til PFS og OS. Vår studerte viste at en polymorfe variant i 5p15
locus
, rs401681 C /T, var assosiert med PFS av ikke-plateepitelkreft svulster. Tidligere rapporter [8] viste at histologi subtypen av pasienter med NSCLC er assosiert med forskjellige kliniske oppførsel hos pasienter med NSCLC. Vi fant også at en annen polymorfe variant i 6p21, rs9295740 G /A, viste en nesten statistisk signifikant påvirkning på PFS for alle pasienter med NSCLC. Vi fant ut at fire SNPs ble forbundet med NSCLC total overlevelse (f.eks rs3025010 (
VEGF
intron 5) C /T (på 6p12), rs2010963 (
VEGF
405) G /C (på 6p12), rs31489 C /A (på 5p15) og rs401681 C /T (på 5p15)). I 2008 Heist
et al.
[16] viste at rs2010963 (
VEGF
405) GC genotype var assosiert med bedre overlevelse enn de GG og CC genotyper, som er i overensstemmelse med våre resultater. Men i 2010, Dong
et al.
[20] vist 54 SNPs i 568 kinesiske pasienter med NSCLC og vurderes foreningen av
VEGF Hotell og
EGFR
genetisk polymorfisme med NSCLC prognose. Denne studien fant ikke en sammenheng mellom rs3025010 (
VEGF
intron 5) C /T varianter og NSCLC overlevelse. GWAS [10], [11] og andre studier [12], [36], [40] fant at 5p15
locus
var assosiert med lungecancer følsomhet, men ingen av disse studier har rapportert bekymringene vedrørende total overlevelse . Dette er den første studien som rapporterer at polymorfe varianter f.eks rs31489 C /A og rs401681 C /T, i 5p15
locus
er forbundet med NSCLC total overlevelse og pasient prognose i en portugisisk befolkning.
Konklusjoner
Lungekreft er fremdeles en utfordring for forskere og klinikere over hele verden. Den omfattende forståelse av lungekreft biologi er et presserende behov. Vi tror at resultatene som presenteres i denne studien gir ytterligere funn for NSCLC forståelse. Vi fant ut at en SNP i 6p21
locus
er assosiert med NSCLC risiko, en SNP i 6p12 locus og en SNP i 15q25 locus er assosiert med ikke-plateepitel histologi, en SNP på 5p15 er forbundet med PFS , 2 SNPs på 5p15 og 2 SNPs på 6p12 er forbundet med OS, 2 SNPs på 6p12 og en SNP på 6p21 er forbundet med RR for førstelinjebehandling. Vårt arbeid antyder at varianter på kromosomene 5p15 og 6p21 er prognostiske biomarkører for avansert NSCLC. I tillegg varianter på 6p21 er NSCLC risiko biomarkører, og varianter på 6p12 og 6p21 er prediktive NSCLC biomarkører. I fremtiden kan SNPs identifisert i genomene til pasientene bedre NSCLC screening strategier og terapeutisk ledelse.
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1. .
Case-kontroll analyse av alle 19 SNPs
doi: 10,1371 /journal.pone.0072373.s001 plakater (DOC)
Tabell S2.
Analyse av alle 19 SNPs og pasienter utfallet
doi:. 10,1371 /journal.pone.0072373.s002 plakater (DOC)
