PLoS ONE: Microarray Profilering av mononukleære perifere blodceller Identifiserer Novel kandidat gener knyttet til Chemoradiation Response i rektal kreft

Abstract

Preoperativ chemoradiation forbedrer onkologisk utfallet i lokalavansert endetarmskreft. Men det er ingen effektiv metode for å forutsi tumor respons på chemoradiation hos disse pasientene. Perifere mononukleære blodceller har dukket opp nylig som patologi markører for kreft og andre sykdommer, som gjør mulig deres bruk som terapi prediktorer. Videre betydningen av immunrespons hos radiosensivity av faste organer ledet oss til en hypotese om at microarray genuttrykk profilering av perifert blod mononukleære celler kunne identifisere pasienter med respons på chemoradiation i endetarmskreft. Trettifem 35 pasienter med lokalavansert endetarmskreft ble rekruttert i første omgang å utføre studien. Perifere blodprøver ble tatt før neaodjuvant behandling. RNA ble ekstrahert og renset for å oppnå cDNA og cRNA for hybridisering av mikromatriser inngår i Human WG Code bioarrays. Kvantitativ real time PCR ble brukt til å validere microarray eksperimentdata. Resultatene ble korrelert med patologisk respons, ifølge Mandard’s kriterier og slutt UICC Stage (pasienter med tumor regresjon grad 1-2 og downstaging blir definert som respondere og pasienter med klasse 3-5 og ingen downstaging som ikke-respondere). Tyve syv av 35 pasienter ble til slutt tatt med i studien. Vi utførte en flere t-test med Betydning Analyse av mikromatriser, å finne disse genene forskjellig betydelig i uttrykk, mellom respondere (n = 11) og non-respondere (n = 16) til CRT. De forskjellig uttrykte gener var: BC 035656,1, CIR, PRDM2, CAPG, FALZ, HLA-DPB2, NUPL2, og ZFP36. Målingen av FALZ (p = 0,029) genekspresjon nivå bestemt av QRT-PCR, viste statistisk signifikante forskjeller mellom de to gruppene. Genuttrykk profilering avslører nye gener i perifere blodprøver av mononukleære celler som kan forutsi respondere og non-respondere til chemoradiation hos pasienter med lokalavansert endetarmskreft. Videre vår etterforskning lagt ytterligere bevis på viktigheten av mononukleære celler «mediert reaksjon i neoadjuvant behandling av endetarmskreft

Citation. Palma P, Cuadros M, Conde-Muiño R, Olmedo C, Cano C, Segura -Jiménez I, et al. (2013) Mikromatrise Profilering av mononukleære perifere blodceller Identifiserer Novel kandidat gener knyttet til Chemoradiation Response i endetarms kreft. PLoS ONE 8 (9): e74034. doi: 10,1371 /journal.pone.0074034

Redaktør: Roberto Amendola, ENEA, Italia

mottatt: 15. desember 2012; Godkjent: 01.08.2013; Publisert: 05.09.2013

Copyright: © 2013 Palma et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Finansiering:. Denne undersøkelsen ble støttet av Fundación INVESTIGACION BIOMEDICA Mutua Madrileña. MC, CC og AB ble støttet av prosjektene P08-TIC-4299 og CTS2200 av Junta de Andalucía, TIN2009-13489 av DGICT, Madrid, og GREIB PYR_2010-02 og 2010_05 av Universitetet i Granada. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne erklærer at de ikke har noen konkurrerende interesser

Innledning

Preoperativ kjemoradioterapi er den anbefalte standardbehandling for pasienter med lokalavansert endetarmskreft (LARC). Imidlertid har nylig studier antydet at preoperativ kjemoradioterapi (CRT), sammenlignet med postoperativ kjemoradioterapi, forbedret lokal kontroll og ble assosiert med redusert toksisitet [1] – [6]. Etter neoadjuvant CRT evnen til å oppnå patologisk downstaging, eller en komplett patologisk respons, er korrelert med økt overlevelse, redusert lokal tilbakefall, og en høyere rate av lukkebevarende operasjoner [7] -. [9]

Omtrent 40-60% av pasientene som ble behandlet med LARC neoadjuvant CRT oppnå en viss grad av patologisk respons. Imidlertid er det ingen effektiv metode for å forutsi hvilke pasienter som vil svare på neoadjuvant CRT. Prospective identifikasjon av pasienter som har en høyere sannsynlighet for å svare på preoperative CRT kan være viktig i deceasing behandling sykelighet og forbedre overlevelse og lokal kontroll i LARC. I tillegg kan pasienter som er lite sannsynlig å svare bli tilbudt alternative tilnærminger til terapi.

Perifere mononukleære blodceller (Bachelor) omfatter de sirkulerende mononukleære celler, inkludert monocytter, T-celler, B-celler og naturlige dreper celler, og har dukket opp i de senere år som surrogatmarkører for en rekke sykdommer, inkludert inflammatoriske (for eksempel revmatoid artritt, og kronisk pankreatitt) og maligne sykdommer som nyrecellekarsinom [10] – [12]. Men i motsetning til vev markører, forblir deres rolle i forutsigelse og prognostisk evaluering av faste tumorer begrenset til nyere undersøkelser ved hjelp av gen-chips som fokuserer på bryst, spiserøret, bukspyttkjertel og kolorektal kreft [13] -. [16]

i denne studien, tester vi om genuttrykket profilen til Bachelor kunne identifisere respons på CRT og derfor være en prediktor markør i tverrfaglig behandling av pasienter med LARC.

Materialer og Metoder

pasienter og Tumor Kjennetegn

gruppen av studien opprinnelig besto av 35 lokalavansert endetarmskreft (LARC) pasienter fra Division of Colon Rektal kirurgi, HUVN, Granada, Spania, med ytterligere 8 pasienter fra valideringen gruppen. For å kvalifisere for denne studien, endetarms karsinom måtte være på scenen II eller stadium III ifølge kriteriene for International Union Against Cancer tallet (UICC), uten systemiske metastaser i positronemisjonstomografi scan og ingen kjente andre svulst. Diagnosen endetarmskreft ble bekreftet av histopatologiske analyse av endoskopiske biopsier. Studien ble godkjent av Hospital Universitario Virgen de las Nieves – Granada etikkomité. Skriftlig informert samtykke ble oppnådd fra alle pasienter før studien. Etter den første oppsetningen, alle pasienter som kvalifiserer for denne studien fikk neoadjuvant radioterapi (28 fraksjoner på 1,8 Gy, 5 fraksjoner /uke) med samtidig kjemoterapi (kapecitabin, 825 mg /m

2, to ganger daglig alene eller i kombinasjon med oxaliplatine 50 mg /m

2 en gang i uken). Standardisert kirurgi, inkludert total mesorectal eksisjon, ble foretatt 8 uker etter den standardiserte CRT protokollen beskrevet ovenfor.

Standard patologisk tumor oppsetning av resekterte prøve ble utført i henhold til retningslinjene UICC og tumorregresjon klasse (TRG). Mandard klassifikasjoner ble tildelt av minst en spesialisert gastrointestinal patolog. For denne studien ble pasienter med TRG 1 og 2 og downstaging ansett som respondere mens pasienter som er klassifisert med regresjon karakterene 3 til 5 og ingen downstaging ble behandlet som ikke-respondere. Downstaging ble definert som reduksjon av patologisk iscenesettelse (ypStage) i forhold til forbehandling scenen (cStage) (dvs. cII til ypI, cIII å ypII eller ypI).

Isolering av RNA fra Bachelor

Totalt RNA ble ekstrahert fra 12 ml av perifere mononukleære blodceller (Bachelor) prøver før behandling fra hver studie deltaker bruker PAXgene Blood RNA System (PreAnalytix, Becton Dickinson, San Diego, CA, USA) i henhold til produsentens instruksjoner. Mengde og integritet av RNA ble kontrollert ved spektrofotometri i et Nanodrop ™ (ND-1000, DE, USA) og i en ™ automatisert elektroforese system Experion® (Bio-Rad, Richmond, VA, USA), respektivt.

Gene Expression Analysis

I korte trekk følgende revers transkripsjon CRNAs ble merket med Cy5 streptavidin (Amersham Biosciences, Sverige). Hybridisering av hele genomet menneskets gener som inngår i Code bioarrays (Applied mikromatriser, Tempe, AZ, USA) ble utført over natten ved 37 ° C i en shaker inkubator (Innova 4080, New Brunswick®, NJ, USA). Hybridiseringsreaksjonene Reaksjonene ble utført i duplikat. Microrrays ble lest med en GenePix 4000B laserskanner (Axon Instruments, CA, USA), kvantifiseres og normalisert ved hjelp av Codelink Software 5.0 (Applied Mikromatriser, Tempe, AZ, USA). Microarray data ble normalisert ved hjelp av ulike metoder: gjennomsnittlig normalisering og cyclicLoess. Kvaliteten på utfallet ble vurdert av ulike plott produsert av programvarepakken ArrayQualityMetrics implementert i R språk. En overvåket metode (Betydningen Analyse av Mikromatriser -SAM-) [17] ble så brukt til å finne mer signifikant (justerte p 0,05). Differensielt uttrykte gener i endetarmskreftpasienter som responderte på behandling og de som ikke gjorde det

Ved inngåelse av denne prosessen rå genekspresjon verdier ble oppnådd for hver av prøvene. Dette datasettet er gjort offentlig tilgjengelig på Gene Expression Omnibus GEO database [18] med innsending nummer GSE44172.

Korrelasjonen av Gene signaturer til CRT Response

Prøver ble gruppert i to kategorier etter respons på behandling. Differensial uttrykket av gener ble så evaluert for de foreslåtte kategoriene ved hjelp av programvaren SAM (Betydningen Analyse av mikromatriser, Stanford University, California, USA) [17]. Cut-off for signifikans ble bestemt ved å justere parameteren delta (Δ), som ble valgt på grunnlag av den falske Discovery Rate (FDR). Gener med korrigerte p-verdier. 0,05 ble betraktet som signifikant forskjellig uttrykt mellom gruppene

Validering av mikroarray data ved QRT-PCR

Vi brukte kvantitativ Real Time PCR (QRT-PCR) å bekrefte noen av resultatene som finnes i microarray genuttrykk profil. Vi optimalisert en sensitiv og spesifikk QRT-PCR analyse ved hjelp MX3005P QPCR System (Stratagene, Agilent Technologies, La Jolla, CA, USA). En mikrogram av RNA ble brukt for revers transkripsjon med QPCR-grade AffinityScript® flere temperatur revers transkriptase (AffinityScript® QPCR cDNA syntese kit, Stratagene, Agilent Technologies, La Jolla, CA, USA) ved hjelp av tilfeldige heksamer. PCR reaksjoner inneholdt 1 ug cDNA, 12,5 mL Brilliant II® qPCR Master Mix (Stratagene, Agilent Technologies, La Jolla, CA, USA), 1,25 mL Solaris® (Dharmacon, Thermo Scientific, Chicago, IL, USA) primer /sonde satt for hvert gen. PCR-betingelsene var 15 min ved 95 ° C, 15 s ved 95 ° C og 1 min ved 60 ° C i 40 sykluser. Vi har utformet konkrete Taqman® prober og primere (tabell 1). Før du utfører denne undersøkelsen GAPDH (RT-CKYD-GAPD, Yakima Yellow® Eclipse Mørk Quencher®), RPL13A (RT-CKYD-RPL13A Yakima Yellow® Eclipse Mørk Quencher®) og TBP (RT-CKYD-TBP Yakima Yellow® Eclipse Mørk Quencher ®) gener ble valgt som kandidat husholdningsgenet. Til tross for det faktum at GAPDH er overuttrykt i bcs flere ondartede sykdommer slik som cervical og eggstokk-kreft [19], GAPDH seg som det mest stabile genet, med ingen nøye sammenlignbar husholdningsgenet blant de evaluerte genene i en rekke av tumorer.

Ekspresjon ble kvantifisert etter en analyse av to forskjellige fortynninger av cDNA (1 og 1/10) i triplikat. For hver forsøksprøve ble mengden av hvert gen og endogene referanse (GAPDH) bestemt fra standardkurver. Disse standardkurver var sammensatt av fem punkter hentet fra fem-fold serielle fortynninger (1, 1/10, 1/50, 1/100 og 1/500) av cDNA fra Universal Menneskelig Reference RNA (Stratagene, Agilent Technologies, La Jolla , CA, USA). Det er sammensatt av total-RNA fra 10 humane cellelinjer. Vi vurderte kun eksperimenter der det lineære forholdet mellom Ct (terskelsyklus) og log til mengden av standardkurven for hvert gen og GAPDH var høyere enn 0,99 (korrelasjonskoeffisient). De uttrykk verdiene for hvert gen ble deretter dividert med mengden GAPDH for å oppnå en normalisert verdi. GAPDH-genet ble anvendt som en intern kontroll for RNA kvalitet revers transkripsjon og for å korrigere variasjoner i graden av RNA-degradering. Statistisk signifikans av forskjeller i transkripsjonsnivåer ble vurdert ved hjelp av ikke-parametrisk T-test (Mann Whiteney). Dataanalyser ble utført med SPSS statistisk programvare, versjon 15.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA). For å utføre kvantifisering av ekspresjonen av gener, ble en standardkurve konstruert med i det minste fire forskjellige konsentrasjoner i triplikat. GAPDH-genet ble anvendt som kontroll-genet for å teste kvaliteten av cDNA. Ekspresjon ble estimert etter analyse av to forskjellige fortynninger av cDNA, hver og en av de fortynninger som ble analysert i triplikat. Forskjeller i genuttrykk mellom Responder og Non-responder grupper ble beregnet ved hjelp av ikke-parametrisk T-test.

Resultater

Pasienter og tumor Kjennetegn

Åtte av de 35 første pasientene ble til slutt ekskludert på grunn av den dårlige kvaliteten på RNA eller motstridende resultater av Mandard’s kriterier og histopatologiske downstaging. Statistisk styrke på mer enn 0,8 ble oppnådd med disse 27 pasientene.

Kliniske data for de endelige 27 pasienter er vist i tabell 2, som videre omfatter de 8 pasienter i valideringen gruppe (pasient 28 til 35). Merk at postoperativ UICC scenen representerer svulst scenen etter neoadjuvant behandling (YPT). Ingen statistisk signifikante forskjeller (chi kvadrat) ble funnet i form av CRT, kirurgi eller sex når man sammenligner mellom de to gruppene (respons vs non-respons) (tabell 3). Videre ble ingen signifikante forskjeller (t-student) funnet totalt leukocytt tall og hemoglobin mellom begge gruppene (respondere og non-respondere) (Tabell 4).

Differensial Gene uttrykk i perifere blodprøver mellom Behandling responder og Non-responder pasienter med endetarms Tumor

en overvåket metode (Betydningen Analyse av Mikromatriser -SAM-) ble brukt til å søke etter et gen signatur som viser signifikante forskjeller mellom uttrykksprofiler for responder og non-responder undergrupper av pasienter. Vi fant ut at 8 gener ble uttrykt forskjellig (p 0,05) i Bachelor fra svaret og ikke-responder prøver. Alle disse genene presenteres signifikant høyere uttrykk nivåer (over-uttrykk) i responder LARC pasienter. Tabell 5 beskriver disse 8 gener (BC035656.1, CIR, PRDM2, CAPG, FALZ, HLA-DPB2, NUPL2, og ZFP36). Gener BC035656.1, CIR og PRDM2 viste den høyeste forskjell på genekspresjon verdier mellom de to gruppene (Log-ratio: 1,47, 1,34 og 1,24 henholdsvis).

Kvantitativ RT-PCR Validation

mRNA uttrykk nivåer av seks av de genene (CIR, PRDM2, CAPG, FALZ, NUPL2, og ZFP36) over-uttrykt i behandlings responder pasienter ble analysert ved QRT-PCR. HLA-DPB2 og BC035656.1 ble forkastet på grunn av kompleksiteten i HLA-DP-regionen og sekvensen avsluttes henholdsvis.

Måling av genuttrykk nivåer bestemt av microarray analyse positivt korrelert med QRT-PCR-analyse. Både microarray og QRT-PCR resultater bekreftet lignende trender av genuttrykk profiler av utvalgte gener i endetarmskreftpasienter. Som skjedde i microarray uttrykk analyse, fant vi signifikante forskjeller mellom uttrykket av FALZ genet (p = 0,029) i behandling svaret og ikke-responder grupper. CAPG (p = 0,268), CIR (p = 0,058), NUPL2 (p = 0,476), PRDM2 (p = 0,959), og ZFP36 (p = 0,063) viste høyere uttrykk i responder pasienter, uten noen gang å nå statistisk signifikans (figur 1 ).

FALZ, CAPG, CIR, NUPL2, PRDM2, og ZFP36 ekspresjonsnivåene ble med hell oppnådd fra 30, 13, 29, 27, 30, og 23 LARC pasienter. Bokser representerer kvartilene, median er representert ved en svart linje innenfor boksen, og sirkler (0) viser atypiske verdier (1,5-3 ganger lengden av boksen). Stjerne (*) viser ekstreme verdier (mer enn tre ganger boks). FALZ genuttrykk viste statistisk signifikante forskjeller mellom responder og ikke-responder pasienter.

Validering av Predictive Biomarkører

For å evaluere den prognostiske betydningen av FALZ, CIR og ZFP36 gener, søkte vi QRT -PCR. For å oppnå en tilstrekkelig kraft i analysen, har vi lagt validering kohort (n = 8) til den generelle befolkningen studert (n = 27). Ifølge kriteriene som brukes (pasienter med Mandard’s TRG 1 og 2 ble vurdert som respondere), ble bare én av dem er klassifisert som en responder. For hver mRNA (matrise og QRT-PCR data) en mottaker som opererer karakteristikk (ROC) kurve ble generert. Areal under kurven (AUC) verdier og 95% konfidensintervall (CI) ble beregnet for å bestemme spesifisiteten og sensitiviteten av respons på behandling forutsigelse. ROC kurver av FALZ mikromatriser «data reflektert moderat evne til å skille mellom responder gruppen og ikke-responder undergruppe, med en AUC på 0,843. På en cut-off point satt til 20,72, FALZ ga en sensitivitet på 80,0% og en spesifisitet på 85,7%. ROC kurver av FALZ QRT-PCR data hadde en AUC på 0,681.

Diskusjoner

Moderne onkologisk behandling beslutninger i økende grad avhenge av såkalt klinisk og laboratorie forutsigbar og prognostiske markører. Mens prognostiske markører forklare variasjon uavhengig av behandlingen, planlegger vår studie å bruke prediktiv markører for å forklare utfallet forskjell i respons på behandling.

Gene uttrykk profil ved hjelp av microarray teknologi har ført til en rekke lovende resultater gjennom vev genekspresjon profilering av forskjellige maligniteter, inkludert kreft. Interessant, har genet signaturer blitt brukt med hell som prognostisk prediktor for pasienter med kolorektal karsinom [20]. I denne forbindelse, Ghadimi et al. var i stand til å forutsi respons på behandling ved hjelp av genuttrykk profiler. Tumor oppførsel var riktig forutsagt i 83% av pasientene. Følsomhet (korrekt forutsigelse av respons) var 78%, og spesifisitet (korrekt forutsigelse av nonresponse) var 86% [21].

Tilsvarende har det gjentatte ganger blitt demonstrert i de senere år at genetisk ekspresjon i BCs er endret i sammenheng med malignitet. Denne observasjonen av en endret Bachelor genetisk uttrykk profil i kreftpasienter ble først rapportert i hematologiske maligniteter. I dag, aktuelle publikasjoner tyder på at Bachelor kan være verdifulle surrogatmarkører med diagnostisk potensial og prognostiske programmer på forskjellige kreft lokaliseringer som nyre-, bryst, esophageal, bukspyttkjertelen og tykktarms [12] – [16]. Likevel, til vår kunnskap, ingen publikasjon noen gang har forsøkt å undersøke den genetiske profilen til Bachelor som surrogat prediktive markører for respons på behandlingen i solide organer.

Men som kan være begrunnelsen for vår etterforskning? I denne sammenheng er det blitt foreslått at tumorkrympning er ikke bare avhengig av direkte skader på bestrålte tumorceller, men at den er også sterkt påvirket av vertens immunrespons [22]. Faktisk, in vivo-studier har antydet at kreftceller, døde eller døende på grunn av CRT, kan presentere tumorassosierte antigener til vertsimmunceller, og derved fremkalle anti-tumor immunresponser [23], [24]. Videre monterings kliniske data tyder på tilstedeværelsen av stråling-indusert anti-tumor immunitet hos mennesker [25], [26].

Siden lymfocytter, spesielt T-celler, spiller en sentral rolle i anti-tumor immunitet, Molling et al viste at høye nivåer av sirkulerende invariant natural killer T (INKT) celler forutsi kliniske utfall av pasienter med hode og hals plateepitelkarsinom [27]. Videre spesielt for endetarmskreft, Kitayama et al. [28] spekulert, etter å observere at prosentandelen av lymfocytter viste en sterk forbindelse med reaksjon på CRT, at lymfocytt-mediert immunrespons mot skadede tumorceller er av kritisk betydning for å oppnå reaksjon.

Andre undersøkelser i endetarmskreft pasienter studere økt apoptose av lymfocytter i gode respondere til in vitro-bestråling, tyder på at radiosensivity av maligne celler kan bli korrelert med den for normale celler i endetarmskreft og øke muligheten for at kreften som reaksjon på CRT kan forutsies ved å analysere perifere BCs [29].

resultatene som presenteres her viser at bare noen få gener blant flere tusen testet var forskjellig uttrykt med en statistisk signifikant frekvens mellom perifere mononukleære celler av Bachelor fra svaret og ikke-responder LARC pasienter til CRT. Expression nivåer av CIR, PRDM2, CAPG, FALZ, NUPL2, og ZFP36 var høyere i responder pasienter. Resultatene fra QRT-PCR viste trender som sammenfalt med microarray, selv om de eneste statistisk signifikante endringer i uttrykk var for FALZ genet (CIR og ZFP36 viser verdier nær signifikansnivå). Forholdet mellom FALZ uttrykk og effekten av neoadjuvant behandling på endetarmskreft er ikke undersøkt. Det er imidlertid bevis som tyder på at de kan være nye molekylære markører for å forutsi responsen til neoadjuvancy i rektale kreftpasienter. De FALZ locus koder ulike transkripsjonsfaktorer, som har overuttrykk fører til apoptose [30], og det er kjent at i mange svulster, er apoptose den viktigste mekanismen for død av kreft celler som svar på vanlige behandlingsregimer. ZFP36 indusere vaskulær endotelial faktor (VEGF) mRNA degradering [31] og mink Ras avhengige VEGF uttrykk [32]. VEGF Reduksjonen har vært knyttet til prediksjon av effekt av behandling med cetuximab pluss ukentlig irinotecan i kraftig behandlet avanserte pasienter med kolorektal kreft, samt total overlevelse [33]. Imidlertid er ytterligere studier for å konkludere om FALZ, CIR og ZFP36 er involvert i respons på behandling.

For å undersøke om genuttrykket profil i Bachelor er en representasjon av genene uttrykt i vev selv, kan vi også sett på noen likhet mellom de forskjellig uttrykte gener identifisert i vår studie og de observert av microarray analyse i svulstvev av LARC pasienter (data ikke vist). Vi fant ikke noen av de åtte gener som ble forskjellig uttrykt i Bachelor i å svare og ikke-responderende pasienter i genuttrykk mønstre av LARC vev (upubliserte data). Det ser derfor ut som, generelt, ikke-genekspresjon i BCs ikke etterligne det i den primære tumor og er derfor ikke en artifakt av sirkulerende tumorceller.

På den annen side, mens tilsetningen av oxaliplatine til noen pasienter kan reflektere en ulempe av studien, bør det understrekes at hovedbehandlingseffekten av RCT er avhengig av radioterapi. Faktisk resulterer fra fase III-studier [34] skissere viktigheten av å levere 50,4 Gy uavhengig av chemotherapeutical middel som anvendes (kapecitabin alene eller i kombinasjon med oxaliplatine).

Konklusjoner

I den foreliggende studien vi analyserer genuttrykk profiler oppnås gjennom hele genombasert mikromatriser i perifere BCs prøver fra LARC pasienter til å vurdere sin nytte som prediktor for responsen på CRT. Våre data viser signifikante forskjeller i genuttrykk profilering når man sammenligner respondere og non-respondere. Bruke uttrykk mikromatriser har vi identifisert åtte gener hvis uttrykk skilte seg mellom respondere og non-respondere. En av dem ble FALZ genet corrobated hjelp av qPCR, en uavhengig analyse og mer nøyaktig. Interessant nok har FALZ en relevant funksjon i anti-tumor-immunitet.

Så vidt vi vet, representerer den foreliggende studien den første analysen av BCs gen profilen fra pasienter med LARC avhengig respons på CRT. Etablering av et slikt differensialuttrykk har potensial til å gi en rik kompendium av potensielle gener for videre forfølgelse som nye prediktive markører. Videre kan genene identifisert i vår studie gir ny innsikt i immunsystemets feilregulering i LARC.

Takk

Vi ønsker å anerkjenne arbeidet til E Coll, P Calderón, MD Galvez, og jeg García for innsamling av prøver og JL Marín for histopatologisk analyse.

Legg att eit svar