Abstract
Bakgrunn
Ett-karbon metabolismen ser ut til å spille en viktig rolle i DNA-metylering reaksjon. Tyder på at et lavt inntak av B-vitaminer eller høyt alkoholforbruk øker kolorektal kreftrisiko. Hvordan en-karbon næringsstoffer påvirker CpG island methylator fenotype (CIMP) eller
BRAF
mutasjonsstatus i tykktarmskreft er fortsatt usikkert.
Metoder
Utnytte hendelsen tykktarm kreft i en stor prospektiv kohort av kvinner (Nurses «Health Study), vi bestemt
BRAF
status (N = 386) og CIMP status (N = 375) av 8 CIMP-spesifikke markører [
CACNA1G
,
CDKN2A plakater (p16),
CRABP1
,
IGF2
,
MLH1
,
NEUROG1
,
RUNX3
og
SOCS1
] og 8 andre CpG øyer (
CHFR
,
HIC1
,
IGFBP3
,
MGMT
, MINT -1, MINT-31, P14, og
WRN
). Vi undersøkte sammenhengen mellom inntak av ett-karbon næringsstoffer og alkohol og tykktarmskreft risiko, ved å
BRAF
mutasjon eller CIMP status.
Resultater
Høyere folat inntak var assosiert med en trend mot lav risiko for CIMP-lav /0 svulster [total folat inntak ≥400 mikrogram /dag vs. 200 mikrogram /dag; den multivariate relative risikoen = 0,73; 95% CI = 0,53 til 1,02], mens total folat inntak hadde ingen innflytelse på CIMP høye kreftrisiko (P
heterogenitet = 0,73). Verken vitamin B
6, metionin eller alkoholinntak ut til forskjellig innflytelse risiko for CIMP-high og CIMP-lav /0 svulster. Bruke 16-markør CIMP panel ikke vesentlig endre våre resultater. B-vitaminer, metionin eller alkoholinntak påvirket ikke tykktarmskreft risiko forskjellig fra
BRAF
status.
Konklusjoner
Denne molekylære patologisk epidemiologi studie tyder på at lavt nivå inntak av folat kan være forbundet med en økt risiko for CIMP-lav /0 colontumorer, men ikke den av CIMP høye tumorer. Men forskjellen mellom CIMP-high og CIMP-lav /0 kreftrisiko var ikke statistisk signifikant, og flere studier er nødvendig for å bekrefte disse observasjonene
Citation. Schernhammer ES, Giovannucci E, Baba Y, Fuchs CS , Ogino S (2011) B-vitaminer, metionin og alkoholinntak og risikoen for tykktarmskreft i forhold til
BRAF
Mutasjon og CpG Island Methylator Phenotype (CIMP). PLoS ONE seks (6): e21102. doi: 10,1371 /journal.pone.0021102
Redaktør: Qian Tao, det kinesiske universitetet i Hong Kong, Hong Kong
mottatt: 10 januar 2011; Godkjent: 20 mai 2011; Publisert: 27 juni 2011
Copyright: © 2011 Schernhammer et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av United States National Institutes of Health (NIH) [P01 CA87969 (til S. Hankinson), P01 CA55075 (til W. Willett), P50 CA127003 (CSF), K07 CA122826 (til SO), R01 CA151993 (til SO)], Bennett Family Fund for målrettet terapi forskning; og Entertainment Industry Foundation gjennom National Colorectal Cancer Research Alliance. Innholdet er utelukkende ansvaret til forfatterne og ikke nødvendigvis representerer den offisielle visninger av NCI eller NIH. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
DNA metylering er en viktig epigenetisk mekanisme i genet Slå og preging [1], [2], [3]. Avvikende epigenetisk stanse tumor undertrykkere av CpG island hypermethylation er ofte observert i menneskelige kreftformer. Den CpG island methylator fenotypen (CIMP) er karakterisert ved tilbøyelighet for omfattende CpG øy hypermethylation [4], [5]. Høy grad av CIMP (CIMP-høy) er en distinkt fenotype i tykktarmskreft, forbundet med høy alder, kvinnelig kjønn, proksimal tumor beliggenhet, mikro ustabilitet,
BRAF
mutasjon, og høyt nivå svulst LINE-en metylering [6], [7], [8], [9]. Men etiologiske faktorer for CIMP-high fortsatt i stor grad spekulativ. Til tross for en sterk sammenheng mellom CIMP og
BRAF
mutasjon i tykk- og endetarmskreft [5], [6], [7], [8], hypotesen om at
BRAF
mutasjon fører til avvikende CpG island metylering [10] har vært svært kontroversiell [11]. Nylig har DNMT3B dukket opp som en av årsakene til CpG island metylering i tumor [12], [13], [14]; likevel, sammenhengen mellom DNMT3B og CIMP i tykk- og endetarmskreft er høyst beskjeden [13] og tumor CpG island metylering ser ut til å være påvirket av flere faktorer.
folsyre og relaterte vitaminer B
2, B
6 og B
12, er avgjørende for DNA-metylering og produksjon av purin og pyrimidin-nukleotider som er nødvendige for DNA-syntese. Betydelig epidemiologiske bevis tyder på at en lav-folat kosthold er assosiert med økt risiko for tykktarmskreft [15], [16], [17]. Likeledes øker alkoholforbruk og endetarmskreft [18], trolig gjennom sine anti-folat effekter [19]. Vi har nylig vist at tilstrekkelig folat inntak og lavt forbruk av alkohol er beskyttende mot LINE-en hypomethylated tykktarmskreft, men ikke mot LINE-en hypermethylated tykktarmskreft [20]. Mens en fersk studie viste en sammenheng mellom folat og CpG island metylering i normal kolorektal vev [21], hvor folat eller andre B-vitamin inntak påvirker CpG island metylering eller
BRAF
mutasjon i tumor forblir mindre godt forstått, og litteraturdata er noe begrenset [22], [23], [24], [25].
Vi har derfor vurdert om påvirkning av folat på tykktarmskreft risiko varierte avhengig av CIMP og
BRAF
status. For dette formålet, brukte vi vevsprøver fra en prospektiv kohortstudie som tidligere har vist at folat inntak ble omvendt assosiert med risiko for tykktarmskreft [26]. Tilgjengeligheten av detaljert og oppdatert informasjon om folat inntak og vevsprøver i denne kohorten tillates en mer omfattende undersøkelse av effekten av folat inntak på risikoen for å utvikle CIMP-høye og CIMP høye tykktarm kreft, samt ved
BRAF
mutasjonsstatus. Spesifisitet i sammenhengen mellom folat og tykktarmskreft til bestemte kreft fenotyper vil ytterligere styrke saken for kausalitet, og vil gi viktig innsikt i de kreftfremkallende mekanismene for folatmangel.
Materialer og metoder
forsøkspersonene
Nurses «Health Study (NHS) ble etablert i 1976 da 121,701 amerikanske kvinnelige sykepleiere, 30 til 55 år, fullførte en sendt spørreskjema [27]. Oppfølging innen kohorten i dag overstiger 92%. Vi sendte biennalen spørreskjemaer for å oppdatere informasjon og identifisere nydiagnostiserte tilfeller av kreft. I 1980 ble NHS spørreskjemaet utvidet til å omfatte en validert vurdering av kostholdet, og oppdaterte kosttilskudd vurderinger har vært gjennomført hvert fjerde år [28]. De institusjonelle gjennomgang styrene ved Brigham and Women Hospital og Harvard School of Public Health godkjent denne studien og samtykke prosedyren.
Vurdering av Næringsstoffer
Inntak av ulike næringsstoffer, inkludert folat, vitamin B
6, B
12, og metionin ble vurdert ved selv-administrert mat semikvantitative frekvensspørre (SFFQ), som ble fullført i 1980, 1984, 1986, 1990, 1994 og 1998. Næringsinntak inntak~~POS=HEADCOMP ble beregnet ved å multiplisere rapporterte hyppighet av inntak av hver angitt matvaren av næringsinnholdet i den angitte porsjonsstørrelsen og deretter summere disse produktene til alle matvarer. Informasjon om multivitamin bruk og bruk av andre kosttilskudd ble også samlet inn, blant annet informasjon om hvilke merkenavn og type. En omfattende database over supplement formuleringen ble deretter anvendt for å beregne spesifikke næringsstoffer bidrag fra disse supplerende kilder. Disse nærings bidrag ble senere lagt til den spesifikke næringsinntak fra mat til å beregne et daglig inntak for hver kvinne. Denne metoden for kostvurdering har blitt grundig validert og sin pålitelighet evaluert [28]. Korrelasjonskoeffisienten var 0,55 for sammenhengen mellom total folat inntak beregnet fra 1980 spørreskjema og erytrocyttransfusjoner folat konsentrasjoner målt i 1987 i denne kohorten [29]. Dessuten, vitamin B
6 inntak som vurdert ved 1980, 1984, 1986 og SFFQs har vist seg å korrelere med en-ukes diett poster, med korrelasjoner som strekker seg 0,54 til 0,58 [28], [30].
Vurdering av eventuelle andre kovariater
Alkoholforbruket forbruket~~POS=HEADCOMP var summen av verdiene i tre typer drikkevarer: øl, vin og brennevin. Vi antok et etanolinnhold på 13,1 g for en 12-unse (38 dl) kan eller flaske øl, 11,0 g for en 4-unse (12 dl) glass vin, og 14,0 g for en standard del av brennevin. I valideringsstudier, korrelasjonskoeffisienten for sammenhengen mellom alkoholforbruk stammer fra 1980 SFFQ og gjennomsnittet av fire en-ukes diett poster var 0,90 [31]. Andre risikofaktorer for tykktarmskreft som fysisk trening og kroppsmasseindeks har generelt blitt vurdert annethvert år på hovedspørreskjemaer.
Konstatering av tykktarmskreft Saker og svulstvev Procurement
Vi inkluderte tykktarm kreft rapporterte på biennalen spørre mellom avkastningen av 1980 spørreskjema og 1. juni 2004. med tillatelse fra deltagerne, ble tykktarmskreft bekreftet gjennom legers gjennomgang av sykepleiernes medisinske poster. Dersom tillatelse ble avslått, forsøkte vi å bekrefte selvrapportert kreft med en ekstra brev eller telefon. Vi har også søkt National Death Index til å identifisere dødsfall blant de nonrespondents til hver toårs spørreskjema. Den datastyrte National Death Index er en svært følsom metode for å identifisere dødsfall i denne gruppen [32]. For alle dødsfall som skyldes tykktarmskreft, vi bedt om tillatelse fra familiemedlemmer (underlagt statlig regulering) for å gjennomgå medisinske poster. Vi lykkes innhentet prøver for 58% av tilfellene (n = 527) over 22 års oppfølging i NHS. Det var ingen signifikant forskjell i demografiske eller eksponerings variabler mellom tilfeller med tilgjengelig vev og de uten tilgjengelig vev [33].
Genomisk DNA-ekstraksjon og sekvensering av
BRAF
Genomisk DNA fra parafin-innleiret vev ble ekstrahert, og hele genom-amplifikasjon ble utført ved PCR ved anvendelse av vilkårlige 15-mer primerne [34]. PCR og sekvensering målrettet for
BRAF
kodon 600 ble utført som tidligere beskrevet [35].
Real-time PCR (MethyLight) for kvantitativ DNA metylering
For å finne ut CIMP status , kvantifisert vi DNA metylering i åtte CIMP-spesifikke arrangører. Bisulfitt behandling på genomisk DNA og påfølgende real-time PCR (MethyLight) [36] ble validert og utført som tidligere beskrevet [37]. De åtte CIMP-spesifikke promo at vi tallfestet (
CACNA1G
,
CDKN2A plakater (p16),
CRABP1
,
IGF2
,
MLH1
,
NEUROG1
,
RUNX3
, og
SOCS1
) [5], [38] ble valgt ut fra screening av 195 CpG øyer [5], [39] . CIMP-høy ble definert som ≥6 /8 denaturert markører ved hjelp av åtte-markør CIMP panel, og CIMP-lav /0 ble definert som 0/8 til 5/8 metylerte markører, i henhold til tidligere etablerte kriterier [38]. I sekundære analyser, vi lagt åtte flere markører (
CHFR
,
MGMT
,
P14
,
WRN
,
HTC1
,
MINT1
,
MINT31
,
IGFBP3
) [7] for en 16-markør panel. Ved hjelp av denne 16-markør panel, vi laget to kategorier av CIMP (CIMP-høy definert som ≥11 /16 denaturert markører, og CIMP-lav /0 som 0/16 til 10/16 denaturert markører). Samstemmighet av CIMP-høy diagnose mellom 8-markør og 16-markør paneler var høy. (0,97; k = 0,89) [7]
Statistical Analysis
Vi ekskluderte kvinner som ikke fullførte grunnlinjen 1980 kosten spørreskjema eller registrerte usannsynlig kostholdsdata (n = 29 279), rapporterte en baseline historie av kreft (unntatt non-melanom hudkreft, n = 3627), inflammatorisk tarmsykdom, arvelig nonpolyposis tykktarmskreft, eller en familiær polypose syndrom ( n = 103), eller hadde dødd før baseline (n = 1). Etter disse unntakene, 88,691 kvinner var kvalifisert for analyse og påløpte oppfølgingstiden begynner på måneden retur av baseline spørreskjema og slutter på måneden diagnose av kreft i tykktarmen, død av andre årsaker, eller 1 juni 2002, avhengig av hva som kom først. I en tidligere analyse av denne gruppen, ble folat inntak signifikant assosiert med risiko for tykktarmskreft, men hadde ingen innvirkning på risikoen for kreft i endetarmen [26]; som et resultat vi ikke anser hendelsen endetarmskreft blant deltagerne i denne analysen. Som endetarmskrefttilfeller, tilfeller av tykktarmskreft som vi ikke var i stand til å kvantifisere DNA metylering sensurert fra analysene på sitt diagnosedato og ble ikke inkludert som endepunkter.
Vi beregnet forekomst av tykktarmskreft for deltakerne i en bestemt kategori av folat inntak ved å dele antall nye situasjoner med antall årsverk. Vi beregnet relativ risiko (RR) ved å dele insidensraten i en kategori ved insidensraten i referansekategorien og brukte Cox modellering for å kontrollere for flere variabler samtidig, og for å beregne 95% konfidensintervall (CI). Med unntak av folat, vitamin B
6, metionin, og alkohol, som vi brukte grunnlagsinformasjon i våre primære analysene, vi brukte den mest oppdaterte informasjonen for alle kovariatene før hver to-års intervall.
å sammenligne den spesifikke effekten av inntak av folat og andre næringsstoffer på tykktarmskreft risiko i henhold til CIMP og
BRAF
status, ansatt vi en tidligere beskrevet metode for å konkurrere risikoanalyse utnytte duplisering metode Cox regresjon [40], [41]. Denne metodikken tillater estimering av separate regresjonskoeffisienter for næringsinntak stratifisert etter type utfall [f.eks CIMP-høy kreft vs. CIMP-lav /0 kreft;
BRAF
mutasjon (+) vs. (-)]. Vi vurderte den statistiske betydningen av samspillet mellom risikoestimater i henhold til tumortype med en sannsynlighet ratio test som sammenlignet den modellen som er tillatt for egne sammenslutninger av folat og andre næringsstoffer i henhold til CIMP /
BRAF
status med en modell som er forutsatt en felles forening. Vi konservativt tolkes statistisk signifikans av resultatene på grunn av multippel hypotesetesting. For å ta hensyn til flere testing (fem en-karbon næringsstoffer ble undersøkt) vi justert våre signifikansnivå til p = 0,01 (= 0,05 /5). Vi brukte SAS versjon 9.1.3 (Cary, NC) for alle analyser. Alle P-verdier er tosidig.
Resultater
Blant 88,691 kvinner inkludert i disse analysene, de med en baseline folat inntak på mindre enn 200 mg /dag var litt mer sannsynlig å røyke og å være stillesittende, sammenlignet med kvinner med 400 mikrogram daglig folatinntak eller mer (tabell 1). De var også mindre tilbøyelige til å bruke acetylsalisylsyre eller postmenopausale hormoner regelmessig. I tillegg bare 8% av kvinner med mindre enn 200 mikrogram /dag folat inntak brukte multivitaminer, mens blant de med 400 mikrogram folat eller mer daglig, 84% rapporterte nåværende multivitamin bruk. Ytterligere detaljer er rapportert andre steder [42].
Vi dokumentert 375 hendelsen tilfeller av tykktarmskreft tilgjengelig for kvantifisering av DNA metylering under 1,861,934 årsverk. Ved hjelp av DNA-metylering analyser på følgende 375 coloncancere, ble 87 (23%) tumorer funnet å være CIMP-høy. Tilsvarende
BRAF
mutasjonsstatus var tilgjengelig for 386 tilgjengelige hendelsen tykktarm kreft tilfeller dokumentert under 1,861,927 årsverk, hvorav 86 (22%) var
BRAF
mutert.
Som i våre tidligere studier [18], [26], [43], [44], ble det observert en invers sammenheng mellom folat og vitamin B
6 inntaks- og tykktarmskreftrisiko blant alle tilfeller i vår kohort (tabellene 1 og 2 ).
Vi har evaluert ytterligere påvirkning av en-karbon næringsstoffer på tykktarmskreft risiko i henhold til CIMP status i tykktarmskreft. Totalt sett ingen av foreningene undersøkt nådde statistisk signifikans ved den konservative signifikansnivå (p = 0,01). For total folat inntak (tabell 2), til fordel for forbruk utover 200 mikrogram per dag ut til å være begrenset til CIMP-lav /0 kreft. Sammenlignet med kvinner med mindre enn 200 mikrogram folat per dag, den multivariate RR for utvikling av CIMP-lav /0 tykktarmskreft blant de som rapporterer 400 mikrogram eller mer av folat inntak per dag var 0,73 (95% KI, 0,53 til 1,02; P for trend = 0,15) om statistisk signifikans ble ikke nådd. I kontrast, total folat inntak hadde ingen innflytelse på risikoen for CIMP høye tumorer (RR, 0,98; 95% CI, 0,54 til 1,77).
Vi videre undersøkt forholdet mellom vitamin B
6 og B
12 inntak ifølge CIMP status (tabell 2). Fordelen med vitamin B
6 inntak også dukket begrenset til CIMP-lav /0 kreft (multivariat RR 0,77; 95% KI, 0,48 til 1,23 sammenligne ekstreme kvintilene), mens B
6 inntak hadde ingen innflytelse på risikoen av CIMP høye svulster. Men var det ingen differensial effekt av vitamin B
12 på tykktarmskreft med tumor CIMP status, og ingen av de observerte foreninger nådde statistisk signifikans.
Vi undersøkte også påvirkning av metionin inntak og alkoholinntak i henhold å CIMP status (tabell 2). Det syntes å være et beskjedent større reduksjon i risikoen for CIMP-høy kreftformer med økende metionin inntak. Vi har ikke observere en betydelig påvirkning av alkohol inntak på tykktarmskreft risiko, og effekten synes ikke å variere i henhold til CIMP status.
Når du bruker vår 16-markør panel, samlet, forble resultatene uendret (data ikke vist).
Tilsvarende for
BRAF
mutasjonsstatus, vises ingen av de undersøkte næringsstoffer en betydelig effekt samlet, eller ved mutasjonsstatus (tabell 3).
diskusjon
Vår nåværende studien er en prototypiske studie i «
molekylær Patologisk Epidemiologi
«, begrepet som nylig har blitt beskrevet og konsolidert av Ogino et al. [45]. Det representerer en relativt ny, spesialisert innen epidemiologien, basert på molekylær klassifisering av kreft. I molekylær patologisk epidemiologi, er kjent eller mistenkt etiologisk faktor undersøkt i forhold til en bestemt somatisk molekylær endring, for å få innsikt i den kreftfremkallende mekanisme [45]. Anta, en gitt etiologisk faktor (livsstil, kosttilskudd, miljømessige eller genetisk), er antatt å forårsake en viss somatisk molekylær forandring. Hvis vi kan demonstrere en bestemt sammenheng mellom den etiologiske faktor og molekylær endring, kan det gi bevis for kausalitet. I tillegg, for en person som har en følsomhet for et bestemt somatisk molekylær endring som fører til kreft, kan vi være i stand til å utvikle en personlig forebyggende tiltak, som retter seg mot spesifikke molekyler eller veier [45]. Derfor kan molekylær patologisk epidemiologi forskning bidra til å tyde den kreftfremkallende prosessen samt optimalisere forebyggende strategier [45].
I denne prospektive kohort studie, fant vi forslag til både lav folat og vitamin B
6 intakes å være assosiert med økt risiko for CIMP-lav /0 coloncancere, men ikke med den for CIMP høye tumorer. Høyden i risiko ble i hovedsak begrenset til deltakerne med de laveste nivåene av folat og vitamin B
6 inntak. I tillegg observerte vi at virkningen av et høyere metionin inntak på tykktarmskreft beskjedent varierte med tumoral CIMP status, med den fordelaktige effekten av metionin som blir i hovedsak begrenset til CIMP-høy kreft. Det var ingen forskjell i effekten av folat og B-vitaminer på tykktarm kreft stratifisert etter
BRAF
status. Videre er ingen av de observerte assosiasjoner nådde statistisk signifikans.
Mekanistisk, synes det plausibelt at kronisk folatmangel kan være involvert i CpG øy metylering [46]. I en japansk populasjon, redusert aktivitet av enzymet metylentetrahydrofolat-reduktase (MTHFR) på grunn av
MTHFR
kodon 429 variant (rs1801131), og derved hemme folatmetabolismen, har vært assosiert med CIMP høye tumorer i den proksimale tykktarm [ ,,,0],47]. I en kaukasiske befolkningen, genetisk variasjon i
MTHFR
rs1801131 variant synes å øke risikoen for CIMP høye colontumorer [48], [49] selv om dette ikke har blitt bekreftet av Nederland Cohort Study data [22] , [50]. Forholdet mellom
MTHFR
SNP og CIMP i tykktarmskreft er sterk i kombinasjon med lav folat og metionin inntak samt høyt alkoholforbruk [49], [51]. En nyere studie tyder på at lav uttrykk for gamma-glutamyltransferase hydrolase (GGH) er sterkt assosiert med CIMP høye svulster, som gir ytterligere støtte for en rolle av en-karbonomsetningen i denne fenotype [52].
En tidligere case-control studie av 1154 colontumorer vurderes påvirkning av en-karbonnæringsinntak på CIMP samt
BRAF
status i disse svulstene og fant dem ikke å bli assosiert med enten CIMP-høy eller
BRAF
mutasjon [51]. Men sammenlignet med vår nåværende studie, nonquantitative metylering-spesifikke PCR på en annen CpG island panel, og en mindre streng definisjon av CIMP-høy (to mer på 5 eller markører metylert) ble brukt i denne studien. Interessant, forfatterne har også observert at fedme er forbundet med en to-fold risiko for å ha en ikke-CIMP-høy tumor [51]. I vår studie, etter nøye justert for fedme, både folat og vitamin B
6 (inntak som er sterkt korrelert i vår befolkning) var assosiert med risiko for CIMP-lav /0 svulster.
I en annen sak-case-studie i Nederland Cohort Study, pasienter med kolorektal kreft i lav folat /høyt alkoholinntak gruppen er mer sannsynlig å ha arrangøren hypermethylation enn pasientene i den høye folat /lav alkoholgruppe [53]. Spesielt, har Nederland undersøkelsen vist en mulig sammenheng mellom vitamin B
6 og
MLH1
metylering [22] og en invers sammenheng mellom
MTR
rs1805087 polymorfisme og CIMP hos menn [22 ].
i en av de siste studien å vurdere sammenhengen mellom en karbon metabolismen og tykktarmskreft med CIMP /
BRAF
status, til dags dato, utnytte en nestet case-control tilnærming innenfor Nord-Sverige helse og sykdom studie (190 tilfeller og 1:2 matchede kontroller) [24], van Guelpen et al. viser en lavere risiko for CIMP-lav /CIMP høye kolorektal tumorer med svært lave folatnivåer. Kollektivt, er det akkumulerende bevis for hypotesen om at en balanse mellom forskjellige metabolske mellomprodukter av metyl-gruppen påvirker locus-spesifikke CpG øy metylering reaksjon. Utnytte data fra et adenom forebygging prøveversjon av folsyre og aspirin, endelig, høyere RBC folatnivåer, men ikke høyere kost folat forbruk, var assosiert med høyere metylering nivåer [21].
I tillegg til påvirkning av en-karbon næringsstoffer tyder bevis for at lokale DNA sekvens kontekst kan påvirke monteringen av en metylering reaksjon maskiner og locus-spesifikk DNA metylering. Studier har vist at
cis
-acting elementer årsaks allel-spesifikk metylering i pattedyrgenomet [54], [55], [56]. Dermed germline variasjoner i
cis
-acting elementer kan påvirke epigenetisk status inkludert DNA metylering.
MLH1
rs1800734 promoter SNP har vært forbundet med
MLH1
arrangøren metylering [57], [58] og MSI [59] i tykk- og endetarmskreft. En annen studie har vist at
MGMT
rs16906252 promoter SNP er sterkt assosiert med
MGMT
promoter metylering og tap av uttrykk i tykk- og endetarmskreft [60], og med
MGMT
metylering i perifere blodceller og normal tarmslimhinnen hos individer uten tykktarmskreft [61], [62]. Det gjenstår å bli undersøkt om disse eller andre
cis
-acting germline varianter samhandle med andre en-karbon-relaterte faktorer å endre mottakelighet for avvikende DNA metylering.
Vår studie har flere viktige styrker. Først fordi vi samlet detaljert og oppdatert informasjon om en rekke kosttilskudd og livsstil kovariater relevante til tykktarmskreft over 22 år med oppfølging og med høye oppfølgings priser, var vi i stand til å undersøke langsiktige eksponeringer til ett-karbon næringsstoffer og å ta hensyn til viktige konfunderende faktorer. For det andre, er vår studie prospektive, eliminerer bekymringer på differensial recall bias, særlig med hensyn til våre kosttilskudd vurderinger. Eventuelle gjenværende skjevhet fra eksponering feilklassifisering var dermed trolig nondifferential av natur, spenn våre resultater kun mot null. Videre har vi lykkes knyttet disse næringsstoffene-som vurderes via en semikvantitativ mat frekvens spørreskjema (SFFQ) -to andre relevante endepunkter i tidligere analyser, noe som indikerer at målefeil er ikke stor nok til å skjule noen virkelige assosiasjoner.
Begrensninger av notatet er knyttet til folat festningsverk, som ble obligatorisk i 1998 [63]. Vi har flere vurderinger av en-karbon inntaket av næringsstoffer før festningsverk. Videre uendret våre resultater når begrenset til saker som oppsto før folat befestning (1998), som også er vist i tidligere analyser [20], [42], [64]. Andre begrensninger og begrensninger som er spesifikke for molekylær patologisk epidemiologi generelt har vært diskutert andre steder [45]
Vi kan ikke utelukke muligheten for rest forvirrende som en potensiell forklaring på våre funn.; likevel, i våre multivariate analyser som inkluderte mange kjente eller mistenkte risikofaktorer for tykktarmskreft, de multivariate risikoestimater ikke vesentlig forskjellig fra de aldersjusterte resultater. Videre var vi ikke i stand til å få svulstvev fra alle tilfeller av bekreftet tykktarmskreft oppdages i Nurses «Health Study kohorten, men risikofaktorer i disse tilfellene ikke vesentlig forskjellige fra de i tilfeller med svulstvev tilgjengelig. Til slutt, selv før mandat festningsverk i 1998 [63], våre deltakere hadde fortsatt relativt høyt folat og vitamin B
6 nivåer. Det er derfor mulig at vi kan ha funnet enda sterkere assosiasjoner i denne studien hvis våre folatnivåer ville ha tatt en enda lavere rekkevidde.
Oppsummert viser vi at den reduserte risikoen for tykktarmskreft assosiert med replete folat status er noe begrenset til CIMP-lav /0 kreft. Ytterligere studier er nødvendig for å belyse den eksakte mekanismen for en abnormitet i en karbon metabolismen fører til avvikende CpG island metylering.
Takk
Vi vil gjerne takke Caroline Niu for programmering støtte, og deltakerne i Nurses «Health Study for deres samarbeid og medvirkning.
