Abstract
Nylig, in vitro-studier har vist at adiponectin har antiangiogenic og tumorvekst begrensende egenskaper. I tillegg har serum adiponectin nivåer blitt forbundet med risiko for flere kreftformer; spesifikt, serum adiponectin var signifikant lavere hos lungekreftpasienter med avansert stadium sykdommen. I denne studien undersøkte vi foreningen av adiponectin genet promoter variasjoner forbundet med adiponectin genekspresjon og plasmanivåer i ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) i en Han kinesisk befolkning. Totalt 319 pasienter med NSCLC og 489 friske personer ble rekruttert til å vurdere sammenslutning av fire adiponectin genet promoter single-nukleotid polymorfismer (SNPs) (SNP-12140G A, SNP-11426A G, SNP-11391G A og SNP- 11377C G) med NSCLS risiko. I tillegg bygget vi haplotyper av disse fire SNPs og evaluert foreningen av disse haplotyper med NSCLS risiko. Våre resultater viste at blant disse fire SNPs, bare SNP-12140G A ble assosiert med NSCLC risiko (P 0,05). Den haplotype analyse viste at ingen haplotype var assosiert med NSCLC etter å ha utført en Bonferroni korreksjon (P 0,05). I tillegg kan en forening analyse av de fire SNP stratifisert i patologiske trinn I + II og III + IV viste at disse SNPs fremviste ikke signifikante forskjeller mellom patologiske trinn I + II og III + IV. Videre vi ikke observere eventuelle forskjeller i allel og genotype frekvens for disse SNPs mellom adenokarsinom og plateepitelkarsinom. Våre resultater indikerer at G-allelet av SNP-12140may være en risikofaktor for NSCLC (OR = 1,516; 95% CI: 1,098 til 2,094). I dette Han kinesiske befolkningen
Citation: Li Y, Yao Y, Qian X, Shi L, Zhou J, Ma Q, et al. (2015) The Association of Adiponectin Gene Arrangøren Variasjoner med ikke-småcellet lungekreft i en Han kinesisk befolkning. PLoS ONE 10 (5): e0127751. doi: 10,1371 /journal.pone.0127751
Academic Redaktør: Srikumar P. Chellappan, H. Lee Moffitt Cancer Center Research Institute, UNITED STATES
mottatt: 15 oktober 2014; Godkjent: 20 april 2015; Publisert: May 27, 2015
Copyright: © 2015 Li et al. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Data Tilgjengelighet: All relevant data er i avisen og dens saksdokumenter filer
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet med tilskudd fra Association Foundation Program av Yunnan Provincial Science and Technology og Kunming Medical University (No.2012FB064) og Foundation Program for Yunnan-provinsen (No.2014NS139)
konkurrerende interesser:.. forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Lungekreft er en av de viktigste årsakene til kreftdødsfall på verdensbasis og har en 5-års overlevelse på ca 15% [1], og ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) står for ca 80% av lungekreft tilfellene [2]. I Kina, blir forekomsten og dødelighet for lungekreft estimert til å være 0,7 og 0,6 millioner tilfeller, henholdsvis.
Adiponectin er en adipose tissue-utskilt protein som virker som en endogen insulin-sensibiliseringsmiddel ved binding til insulinreseptorer [3- ]. Tidligere studier har vist at adiponectin er assosiert med fedme [4, 5], insulinresistens [5, 6] og type 2 diabetes [7, 8]. Nylig har flere studier har rapportert at adiponectin har antiproliferative og proapoptotiske effekter hos brystkreftcellelinjer in vitro [9, 10]. I tillegg har mange studier har rapportert at lavere adiponectin nivåer er assosiert med en økt risiko for livmorkreft [11-14], nyrekreft [15], tykktarmskreft [16] og brystkreft [10, 17-19]. De ovenfor angitte resultater antyder at adiponectin kan spille en viktig rolle i tumorutvikling og vekst. I 2007 Petridou
et al
. funnet at serum adiponectin var ikke signifikant forskjellig hos pasienter med lungekreft, sammenlignet med kontrollene, selv om den var signifikant lavere i pasienter med avansert stadium sykdommen, noe som tyder på at adiponectin kan være en potensiell markør for progresjon lungekreft [3]. Nylig Nigro
et al
. gitt bevis for en direkte effekt av adiponectin på proliferasjonen og betennelse status til A549 celler, som støtter hypotesen om at adiponectin spiller en beskyttende rolle i lungen, og foreslo at adiponectin kan være et lovende terapeutisk mål i lungesykdommer [20].
I 2006, Heid
et al
. rapportert at
er adiponectin
promoter single-nukleotid polymorfismer (SNPs) i forbindelse med adiponectin konsentrasjoner [21]. Laumen
et al
. senere viste at
adiponectin
promoter SNPs regulere
adiponectin
promoter aktivitet [22]. Derfor
adiponectin
promoter variasjoner kan ha en innvirkning på kreftrisikoen
Vi har tidligere rapportert foreningen av to adiponectin genet promoter SNPs (SNP-12410G A og SNP-11377C G). Med NSCLC risiko i en Han kinesisk befolkning, og resultatene viste at SNP-12140G A (rs266730) er assosiert med økt NSCLC risiko [23]. For å bekrefte disse resultatene i denne studien, vi økt størrelsen på utvalget (fra 179 til 319 saker, fra 242 til 489 kontroller) og lagt to andre adiponectin genet promoter SNPs (SNP-11426A G og SNP-11391G A) for å evaluere foreningen av disse fire adiponectin genet promoter SNPs, nemlig SNP-12140G A (rs266730), SNP-11426A G (rs16861194), SNP-11391G A (rs17200539) og SNP-11377C G (rs266729), og deres haplotyper med NSCLC risiko i en Han kinesisk befolkning.
Materialer og metoder
1.1 Etikk uttalelse
Denne protokollen ble gjennomført i samsvar med Helsinkideklarasjonen og ble godkjent av Institutional Review styrene i No.1 og No.3 Affiliated sykehus av Kunming Medical University. Alle deltakerne gitt skriftlig informert samtykke.
1.2 Fag
Saken gruppen inkluderte 319 pasienter (213 menn og 106 kvinner) som ble diagnostisert med NSCLC på No.1 og No.3 Tilknyttet Sykehus Kunming Medical University fra juli 2012 til mai 2014. histologisk type lungekreft ble identifisert ifølge Verdens helseorganisasjon (WHO 2004) klassifikasjoner. Den patologisk stadium ble bestemt i henhold til det internasjonale systemet for Staging Lung Cancer [24]. Basert på patomorfologiske rapporter, NSCLC tilfeller inkludert adenokarsinom (AC), plateepitelkarsinom (SCC), og adenokarsinom og plateepitelkarsinom (AC + SCC). NSCLC pasienter med en tidligere historie av primær kreft annet enn lungekreft ble ekskludert fra studien. I tillegg personer med høyt blodtrykk, koronar hjertesykdom og diabetes ble også ekskludert fra denne studien for å unngå eventuelle forstyrrelser fra overlappende gener. Kliniske karakteristika og data, for eksempel kjønn, alder, familiehistorie med kreft, og histologisk type kreft, ble oppnådd. Den friske kontrollgruppen inkluderte 489 pasienter (313 menn og 176 kvinner) som ikke hadde noen familie historie av NSCLC og ble rekruttert fra en populasjon som gjennomgår rutinemessige helsekontroller på No.1 og No.3 Affiliated Hospitals av Kunming Medical University. Alle deltakere (NSCLC pasienter og friske kontroller) selvrapportert som etniske Hans og levde omtrent innenfor samme geografiske region (Yunnan-provinsen i Kina).
1,3 NP genotyping bruker TaqMan analysemetode
Genomisk DNA ble ekstrahert fra perifere lymfocytter ved å bruke en standard hydroksybenzen-kloroform-metoden. Fire
adiponectin
promoter SNPs, nemlig SNP-12140G A (rs266730), SNP-11426A G (rs16861194), SNP-11391G A (rs17200539) og SNP-11377C G (rs266729), ble genotypet ved hjelp av PCR forsterkning med TaqMan analysen. Primere og prober ble kjøpt fra Applied Biosystems (Foster City, CA, USA). Valgte PCR produktene ble preget av direkte sekvensering på en 3100 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Tokyo, Japan).
1.4 Statistisk analyse
allelet og genotypefrekvensene av de fire SNPs ble beregnet av direkte tellemetoden. Hardy-Weinberg likevekt (HWE) ble testet for SNP i både NSCLC og kontrollgrupper. Den koblingsulikevekt (LD) og haplotype frekvenser (utledet fra fenotypen) ble beregnet basert på genotyping resultatene etter forventning-maksimering algoritme i SHEsis programvare [25, 26] .En χ
2 test ble benyttet for å bestemme forskjeller i allel, genotype og haplotype frekvenser mellom NSCLC og kontrollgruppene, og de odds ratio (OR) med tilhørende 95% konfidensintervall (cIS) av allel-spesifikk risiko ble beregnet. Bonferroni korreksjon ble anvendt for testing av multiple sammenligninger. Sammenhengen mellom hver SNP og NSCLC ble analysert for arve hjelp SNPStats programvare [27]. Den Akaike informasjon kriterium (AIC) og Bayesian informasjon kriterium (BIC) ble benyttet for å bestemme den optimale modellen for hver SNP. Den statistiske styrken ble beregnet ved hjelp av PS Programvare [28]. De statistiske analyser ble utført ved anvendelse av SPSS 13 (Chicago, IL). En P-verdi mindre enn 0,05 ble ansett som statistisk signifikant.
Resultater
1,1 Subject egenskaper
Tabell 1 viser egenskapene til de deltakere inkludert. Det var ingen alders- eller kjønnsforskjeller mellom NSCLC og kontrollgrupper (P 0,05). I NSCLC personer, 193 hadde AC, 121 hadde SCC, og fem hadde AC og SCC. Det var 47 pasienter i patologisk stadium I, 55 i fase II, 115 i stadium III og 102 i stadium IV
1,2 Association of adiponectin genet promoterSNP-12140G . A, SNP-11426A G, SNP-11391G A, og SNP-11377C G med NSCLC
allelet og genotypefrekvensene for SNP-12140G A, SNP-11426A G, SNP-11391G A og SNP-11377C G i NSCLC og kontrollgruppene er oppført i tabell 2. SNP-11391G A ble funnet å være monomorf (G-allel) i både NSCLC og kontrollgrupper. Genotypefrekvensene for SNP-12140G A, SNP-11426A G og SNP-11377C G var i HWE for NSCLC og kontrollgrupper (P 0,05). Men allel og genotypefrekvensene av SNP-12140G A var signifikant forskjellig i NSCLC og kontrollgrupper (P = 0,011 og 0,046, henholdsvis). G-allelet for SNP-12140G A forekom ved en betydelig høyere frekvens i NSCLC-gruppen sammenlignet med kontrollgruppen (OR = 1,516; 95% CI: 1,098 til 2,094). Allelet og genotypefrekvensene for SNP-11426A G og SNP-11377C G var ikke signifikant forskjellig i NSCLC og kontrollgrupper (P 0,05).
1,3 arve analyse av
adiponectin
promoter SNP-12140G A, SNP-11426A G og SNP-11377C G
Tabeller 3-5 presentere resultatene av arve analyse for de fire SNPs. For å sammenligne hver arv modell (codominant, dominant, recessiv, overdominant og log-additiv) til den mest generelle modellen (codominant), ble det AIC og BIC beregnet til å identifisere arven modellen som passer best til dataene [27]. Modellen med den minste AIC og BIC verdi tilsvarer minimal forventet entropi [27]. Den passer best arv modellen med lavest AIC og BIC for SNP-12140G A og SNP-11426A G var log-additiv modell. Den passer best arv modellen med lavest AIC og BIC for SNP-11377C G var den dominerende og log-additiv modell. Analysen av ulike genetiske modeller viste at GG genotype av SNP-12140G En overdratt mer NSCLC risiko i log-additiv modell. Ingen signifikante forskjeller for SNP-11426A G og SNP-11377C . Ble funnet G mellom NSCLC og kontrollgruppene i de ulike genetiske modeller
1,4 koblingsulikevekt (LD) og haplotype analyse av
adiponectin
promoter SNP-12140G A, SNP-11426A G og SNP-11377C G
Betydelig LD (D «) verdier mellom theSNP-12140G A, SNP -11426A G og SNP-11377C G loci ble funnet i alle personer. D-verdien var 0,899 mellom SNP-12140G A og SNP-11426A G, 0,857 mellom SNP-12140G A og SNP-11377C G og 0,864 mellom SNP-11426A G og SNP-11377C G. Basert på LD resultat vi beregnet haplotyper av disse tre SNPs, og Tabell 6 viser de estimerte frekvensene av SNP-12140G A-SNP-11426A G-SNP-11377C G haplotyper med frekvenser på mer enn 3%. Ingen av haplotyper var signifikant forskjellig i NSCLC og kontrollgruppene etter Bonferroni korreksjon (P 0,05)
1,5 Association analyse av
adiponectin
promoter SNP-12140G . A, SNP -11426A G, og SNP-11377C G med ulike patologiske stadier
Det var ingen forskjeller i allel og genotypefrekvensene forSNP-12140G A, SNP-11426A G og SNP-11377C G mellom patologisk stadier i + II og III + IV (tabell 7)
1,6 Association analyse av
adiponectin
promoter SNP-12140G . A, SNP-11426A G, og SNP-11377C A, SNP-11426A G og SNP-11377C G mellom AC og SCC (tabell 8).
Diskusjoner
Nyere bevis har vist at adiponectin har antiproliferative og proapoptotiske effekter hos brystkreftcellelinjer in vitro [9, 10]. I 2007 Petridou
et al
. fant at serum adiponectin var ikke signifikant forskjellig hos pasienter med lungekreft sammenlignet med kontroller, men at det var signifikant lavere hos pasienter ved avanserte sykdom stadier, noe som tyder på at adiponectin kan være en potensiell markør for lungekreft progresjon [3] .Pei
et al
. deretter foretok en meta-analyse for å utnytte årsaks relevansen av sirkulerende adiponektin med kreft; deres funn viser at genetisk høyere sirkulerende adiponektin dratt en beskyttende effekt mot lungekreft, men en risiko for tykktarmskreft [29].
I 2011 Cui
et al
. undersøkte sammenslutning av SNPs i adiponectin genet (rs266729, rs822395, rs822396 og rs2241766) med NSCLC [30], og SNPs de valgte var rapportert å være relatert til sirkulerende adiponectin nivåer [30]. Selv Cui
et al
. mislyktes i å observere en forening for SNP-11377C G (rs266729), som ligger i
adiponectin
promoter, med NSCLC [30], sine resultater viste at rs2241766 TT genotypen var signifikant assosiert med NSCLC mottakelighet. I 2006 Heid
et al
. rapporterte at rs2241766 var forbundet med adiponectin nivåer, med GG genotype korrelerer med økt adiponectin nivåer sammenlignet med TT genotype [21]. I tillegg Pei
et al
. også observert at rs2241766 GG genotype eller G-allelet var forbundet med betydelig høyere sirkulerende adiponectin nivåer enn TT genotype, uten heterogenitet [29]. Videre er en meta-analyse av kreftrisiko og adiponectin genet polymorfismer av Xu
et al
. og Yang
et al
. indikerte at G-allelet av rs2241766 var en potensiell beskyttelsesfaktor for kreftrisiko [31, 32]. Derfor rs2241766TTisassociated med lavere adiponectin nivåer, og thers2241766TT genotype kan være signifikant assosiert med NSCLC mottakelighet.
I 2009 Laumen
et al
. fant at SNP-11426A G, SNP-11391G A og SNP-11377C G i
adiponectin
arrangøren var regulatoriske SNPs for
adiponectin
promoter aktivitet [22]. Derfor velger vi fire
adiponectin
promoter SNPs å vurdere sammenslutning av disse SNPs og deres haplotyper med NSCLC i en Han kinesisk befolkning. Våre resultater bekrefter våre tidligere funn om at G allel av
adiponectin
promoter SNP-12140G A er en risikofaktor for NSCLC [23], og at personer med SNP-12140G En GG genotype har økt risiko for NSCLC etter log-vanedannende modeller. De andre tre adiponectin genet promoter SNPs, inkludert SNP-11377C G, ikke var korrelert med NSCLC i den aktuelle studien. I 2008 Kaklamani
et al
. rapportert at adiponectin genet promoter SNP-11377C G er assosiert med tykktarmskreft [33]. Men Carvajal-Carmona
et al
. mislyktes i å observere en sammenheng mellom SNP-11377C G og tykktarmskreft hos pasienter fra Storbritannia [34], som sier at avviket mellom resultatene andthose av Kaklamani
et al
. kan skyldes forskjeller mellom etniske grupper, differensial miljøeffekter eller falske positive resultater [34]. Pei
et al
. rapporterte en interessant funn at genetisk forhøyet sirkulerende adiponectin kan gi en beskyttende effekt mot lungecancer, men en risiko for kolorektal kreft [29]. Således kunne den type kreft være en nøkkelfaktor i forholdet mellom kreft og adiponektin genet. Våre resultater, sammen med de av Cui
et al
. [30], indikerte at SNP-11377C G ikke er assosiert med NSCLC risiko og foreslo at rollen adiponectin genet SNP-11377C G kan være spesifikke for krefttypen eller etnisitet. I tillegg våre resultater indikerte at rollen adiponectin genet promoter SNPs kan være spesifikke for SNP området, f.eks SNP-12140G En kanskje viktigere enn SNP-11377C G i den kinesiske befolkningen. Basert på disse resultatene, vi hypotese at SNP-12140G A kan påvirke
adiponectin
promoter aktivitet, genekspresjon, plasma adiponectin nivå og til slutt NSCLC risiko. Dessverre, til dags dato, rollen SNP-12140G A i
adiponectin
promoter aktivitet og genekspresjon har ikke blitt testet. Derfor funksjonen til denne SNP i
adiponectin
promoter aktivitet og genekspresjon bør undersøkes i fremtiden. Det var en interessant funn som bare SNP-12140G A ble assosiert med NSCLC i vår studie. Våre data viste at SNP-12140G A bare var delvis i koblingsulikevekt med SNP-11426A G og SNP-11377C G. Derfor antok vi at dette kunne være mulig en av årsakene til avvik som bare SNP-12140G En assosiert med NSCLC i dette Han kinesiske befolkningen, men ikke SNP-11426A G og SNP-11377C . G
i denne studien også observerte vi at det var ingen forskjell i allel og genotype frekvens for SNP-12140G A, SNP-11426A G og SNP-11377C G mellom AC og SCC (tabell 8). I tillegg var det ingen forskjeller i allel og genotype frekvens for SNP-12140G A, SNP-11426A G og SNP-11377C G mellom patologiske etapper I + II og III + IV (tabell 7). Men i 2007, Petridou
et al
. fant at adiponectin nivået var ikke signifikant forskjellig mellom lungekreft personer sammenlignet med kontroller, selv om det var signifikant lavere hos pasienter med avansert sykdom stadium [3]. Disse forfatter spostulated at årsaken til at en betydelig lavere adiponectin nivået ble observert i fremskreden sykdom stadium pasienter kan være på grunn av reduksjon i total fettmasse i avansert lungekreft, fører til redusert produksjon av adiponectin ved subkutan fettvev [3]. dermed SNP-12140G A kan være bare en mottakelighet faktor for NSCLC i Han-kinesiske befolkningen og ikke forbundet med lungekreft stadium. Foreningen av lavere adiponectin med avansert sykdom stadium kan være på grunn av redusert produksjon av adiponectin indusert av reduksjon i fettmasse i avanserte lungekreft stadier. Fordi vi ikke måle adiponectin nivåer i NSCLC og kontrollgruppene, som er en begrensning i vår studie, gjorde vi ikke observere en sammenheng mellom genetiske data, adiponectin nivåer og NSCLC risiko og NSCLC patologisk stadium.
Det var andre flere begrensninger i denne studien. En relativt liten utvalgsstørrelse kan begrense den statistiske kraften i vår studie. Den statistisk styrke for effekten av SNP-12140G A ble beregnet ved hjelp av PS programvare [28], og vi fant ut at vårt utvalg nådde 74,1% av statistisk effekt. Derfor bør en større populasjon undersøkes ytterligere å bekrefte resultatene. Den andre begrensningen med denne studien var at vi ikke fastslå røykestatus av kontrollpersoner, noe som gjør det vanskelig å utføre fremtidige analyser av slike eksponeringsvariabler og utføre et gen fritt interaksjonsanalyse. Denne begrensningen kan nøytralisere effekten av røyking og utsette effekten av genetiske varianter i vår studie.
Konklusjoner
I denne studien, utførte vi en forening studie for
adiponektin
promoter SNP-12140G A, SNP-11426A G og SNP-11377C G og NSCLC i en Han kinesisk befolkning og fant at G-allelet av SNP-12140G A er en risikofaktor for NSCLC; personer med SNP-12140G En GG genotype viste økt risiko for NSCLC etter log-vanedannende modeller. I fremtiden blir større skala studier for å bedre klargjøre og undersøke sammenslutning av adiponectin genet promoter variasjoner med NSCLC mottakelighet. Videre funksjonen av SNP-12140 i
adiponectin
promoter aktivitet og genekspresjon bør undersøkes.
Hjelpemiddel Informasjon
S1 Table.
doi: 10,1371 /journal.pone.0127751.s001 plakater (XLSX)
S2 Table.
doi: 10,1371 /journal.pone.0127751.s002 plakater (XLSX)
