Abstract
Bakgrunn
Tykktarmskreft (CRC) Utbyggingen omfatter ofte kromosom ustabilitet (CIN) som fører til presiseringer og slettinger av store DNA-segmenter. Epidemiologiske, kliniske og cytogenetiske undersøkelser viste at det er store forskjeller mellom CRC svulster fra afrikanske amerikanere (AAS) og kaukasiske pasienter. I denne studien fant vi ut genomisk kopitall avvik i sporadiske CRC svulster fra AAs, for å undersøke mulige forklaringer på de observerte forskjellene.
Metodikk /hovedfunnene
Vi søkte genom-rekke komparativ genom hybridisering (aCGH) med en 105k chip for å identifisere kopien antall avvik i prøver fra 15 Aas. I tillegg gjorde vi en befolkning komparativ analyse med aCGH data i kaukasiere samt med et bredt omtalt liste av tykktarmskreftgener (CAN gener). Det var i gjennomsnitt 20 avvik per pasient med flere presiseringer enn slettinger. Analyse av DNA-kopi antall hyppig endrede kromosomer avslørte at delesjonene oppsto hovedsakelig i kromosom 4, 8 og 18. Kromosom duplikasjoner forekom i mer enn 50% av tilfellene i kromosomene 7, 8, 13, 20 og X. CIN profil viste noen forskjeller sammenlignet med kaukasiske endringer.
Konklusjon /Betydning
Kromosom X forsterkning i mannlige pasienter og kromosomer 4, 8 og 18 slettinger var fremtredende avvik i Aas. Noen kan gener ble endret ved høye frekvenser i AAs med
EXOC4, EPHB6, Gnas, MLL3 Hotell og
TBX22
som de mest slettet gener og
HAPLN1, ADAM29, SMAD2
og
SMAD4
som oftest forsterkede gener. Den observerte CIN kan spille en markant rolle i CRC i AAs
Citation. Ashktorab H, Schäffer AA, Daremipouran M, Smoot DT, Lee E, Brim H (2010) Tydelig genetiske endringer i tykktarmskreft. PLoS ONE 5 (1): e8879. doi: 10,1371 /journal.pone.0008879
Redaktør: Ulrich Zanger, Dr. Margarete Fischer-Bosch Institutt for klinisk farmakologi, Tyskland
mottatt: 30 september 2009; Godkjent: 02.01.2010; Publisert: 26 januar 2010
Copyright: © 2010 Ashktorab et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av PHS bevilgning fra National Institutes of Health CA102681, den egenutført Research Program fra NIH, NLM og GCRC prisen fra Howard University. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
tykktarms~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP er den tredje vanligste kreftformen i USA [1]. Den har en høyere forekomst og årsaker flere dødsfall i afrikanske amerikanere enn i andre raser. De fleste kolorektal kreft oppstår fra adenomer, i en prosess som er beskrevet som den adenom-karsinom-sekvensen [2]. Som andre kreftformer, initiering og progresjon av CRC er forbundet med en opphopning av endringer i funksjon av viktige regulatoriske gener og genetisk ustabilitet.
Tre store former for genetisk ustabilitet i CRC har blitt beskrevet [2], [3 ], [4]. I ca 13% av CRC tilfeller fører mismatch reparasjon mangel på mikro ustabilitet (MIN) [5]. Omtrent 40% av CRC svulster er preget av epigenetiske forandringer spesielt DNA metylering, et fenomen kalt CpG Islands Methylator Phenotype (CIMP) [6], [7]. I de resterende 47% av CRC, fører kromosom ustabilitet til gevinster og tap av store deler av kromosomer [8].
CIN kategorien inkluderer kreft med aneuploide eller polypoid Karyotyper, og kreft som har flere gevinster eller slettinger av kromosomarmer, eller flere trans. CIN resultater fra spesifikke mutasjoner og /eller gener som blir brakt til taushet og kan resultere fra strukturelle defekter som involverer sentromerer eller sentrosomen, microtubule dysfunksjon, telomerer erosjon, kromosombrudd og svikt i cellesyklus sjekkpunkter [9]. Oppkjøpet av tilbakevendende kromosom gevinster og tap i løpet av progresjon fra høyverdig adenomer til invasive karsinomer er funnet i CRC svulster [10]. En av de tidligste Drag genetiske avvik under CRC progresjon innebærer kromosom 7 forsterkning, som også er observert hos noen kolon adenomer [11]. På senere stadier, andre spesifikke kromosomavvik blitt vanlig, for eksempel gevinster på 8Q, 20Q [12], 7, 13 [13], [14] og slettinger på 8p, 17p, 18q [13], [15] 15Q og 20Q [16].
CIN og MIN fenotyper ble først ansett gjensidig utelukkende fordi MIN svulster har vanligvis stabile og diploide Karyotyper [17], [18]. Imidlertid har nyere studier har funnet at MIN og CIN kan forekomme i samme tumor [19], [20]. Trautmann et al. funnet at minst 50% av MSI-H-tumorer har en viss grad av kromosomale endringer [21]. Selv om det bevis for en viss grad av CIN kan bli funnet i de fleste av MSI-H-tumorer, de spesifikke modifikasjoner som er identifisert varierte mellom MSI-H og MSS tumorer. MSI-H-tumorer båtplass gevinster kromosomer 8, 12, 13 og tap av 15Q og 18q mens MSS svulster har en høy grad og variabel kromosom rekke avvik [16], [21].
Lassmann et al. studerte 287 målsekvenser i 22 kaukasiske kolorektal tumorer og fant hyppige avvik i bestemte områder av kromosomer 7, 8, 13, 17, 20 og antydet noen kandidat gener med hyppig sletting eller forsterkning i disse regionene [22]. Studier som identifiserer gener med endrede kopien rekke forbundet med tumorigenesis kan føre til påvisning av spesifikke mål for kreftbehandling og øke vår forståelse av tumorigenesis. Vi hypotese at identifisering av kromosomavvik i CRC fra AA pasienter kan bidra til å forklare aspekter av tykktarmskreft patogenesen spesifikke for denne pasientgruppen. Derfor undersøkte vi CIN i AA CRC pasienter ved å bruke aCGH til tumorprøver. Vi sammenlignet våre resultater med de nylig publiserte funn i kaukasiere [22] og med en liste av tykktarmskreftgener foreslått av Sjöblom et al [23] etter deres grundig genetisk analyse av 11 colontumorer.
Materialer og metoder
Etikk erklæringen
Denne studien ble godkjent av Howard University Institutional Review Board, og skriftlig informert samtykke ble innhentet.
Pasient
Fersk frosne colonic biopsier (n = 15) ble hentet fra afrikansk-amerikanske pasienter som gjennomgår koloskopi ved Howard University Hospital. Denne studien ble godkjent av Howard University Institutional Review Board. Hensikten med denne studien ble forklart til pasientene før koloskopi og de deltakende pasienter ga informert samtykke. Kliniske data som er samlet på hver pasient inkludert rase, kjønn, assosiert tidligere medisinsk historie, medikamentbruk, og familiehistorie med tykktarmskreft. Pasientene ble ansett som kvalifisert hvis koloskopi resulterte i en diagnose av adenokarsinom, bekreftet ved histopatologi. Fra gjennomgang av journaler, ble klinisk informasjon samlet og registrert basert på det amerikanske Joint Committee on Cancer staging system. Pasienter i denne studien selv identifisert som Aas.
Prøver Utvalg og DNA Extraction for aCGH analyse
Friske tumorvev ble kuttet i 5 mikrometer seksjoner på Superfrost lysbilder (Fisher Scientific, Pittsburgh, PA) . Tumor og normale områder ble preget av en patolog (E.L) ved hjelp av H E matchet lysbilde og microdissected å finne svulsten samt normale områder. Tumor og normale tilsvarende områder fra ferske frosne prøvene ble anvendt for DNA-ekstraksjon ved hjelp av Puregene sett (San Francisco, CA) ifølge produsentens instruksjoner. Målet med mikrodisseksjon var å unngå krysskontaminering av normale og tumorvev som ville påvirke utfallet av aCGH forsøket.
aCGH Eksperimenter og statistisk dataanalyse
I dette forsøket, vi studerte profilen til kromosomavvik i 15 kolon adenokarsinomer. Våre referanse kontroller ble enten matchet normal eller sex-matchet normal DNA med ingen historie med sykdom å fastslå effekten av kromosomavvik ved aCGH i AA kolon adenokarsinomer. Kolon vev ble evaluert av en GI patolog for riktig histologiske funksjoner som ble brukt for denne studien blant annet størrelse, type, plassering og patologiske kriterier av karsinomer. En oligo microarray-baserte CGH ved hjelp av en chip som inneholder 105.000 mennesker prober (Agilent, Santa Clara, CA) ble brukt. De karsinom ble definert histologisk og deretter etter bekreftelse av patologen, vi brukte den tilsvarende fersk frosset vev.
For hver aCGH eksperiment, 1,5 mikrogram av referansen DNA og 1,5 mikrogram av en svulst DNA ble brukt. I korthet, ble test- og referanse-DNA spaltet med
Alu
I og
Rsa
I (Promega, Madison, WI), og renset med QIAprep Spin Miniprep kit (Qiagen, Germantown, MD) . Test DNA (1,5 ug) og referanse-DNA (1,5 ug; Promega) ble merket ved tilfeldig priming med henholdsvis Cy5-dUTP og Cy3-dUTP, ved hjelp av Agilent Genomisk DNA Labeling Kit Plus. Etter merkingsreaksjonen, ble individuelt merket test- og referanseprøver konsentreres ved hjelp av Microcon YM-30 filter (Millipore, Billerica, MA) og deretter kombinert. Etter sonde denaturering og pre-annealing med Cot-1 DNA, ble hybridisering utført ved 65 ° C med rotasjon i 40 timer ved 20 rpm. Fire trinnene ble utført med Agilent Oligo CGH vaskeløsninger: vaskebuffer 1 ved romtemperatur i 5 min, vaskebuffer 2 ved 37 ° C i 1 minutt, en acetonitril skylle ved romtemperatur i 1 min og 30 sek vask ved romtemperatur i Agilent Stabilisering og Tørking Solution. Kopier nummer variasjoner (CNVs) ble identifisert ved Agilent Feature Extraction programvare 9 og analysert med Agilent CGH analytics 3.4 programvare ved hjelp av statistiske algoritmer z rille og ADM-2 ved hjelp av følsomhets terskler på 2,5 og 9, henholdsvis og et glidende gjennomsnitt vindu på 0,2 Mb . Steder av CNVs ble rapportert med hensyn til den menneskelige genomsekvens montering Bygg 35, Hg17 (www.ncbi.nlm.nih.gov).
Analyse av Gene innhold CNVs
Navn av gener foreslått i [22], [23] ble standardisert med HUGO Gene Nomenclature Committee nettsiden (www.genename.org). Plassering av disse genene ble bestemt ved hjelp av datafiler som ligger til grunn NCBI er MapViewer nettleser (www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview). Ved hjelp av programvare nyutviklet for denne studien identifiserte vi hver overlapping mellom kandidat gener og CNVs slik at gevinst eller tap ratio var mer ekstrem enn en brukerdefinert terskel for forholdet. For de resultatene som er vist nedenfor, brukte vi tersklene av ≥1.2 og ≤0.8 for gevinster og tap, henholdsvis. Programvaren tar som innganger:
En fil av gener med kromosomet, startposisjon, og sluttposisjon for hvert gen,
En liste over CNVs angi start, slutt, og forholdet mellom hver genet;.
Terskler for gevinster og tap
programvare~~POS=TRUNC rapporter hver genet slik at det er en kryssende gevinst /tap hvis forholdet er over /under brukerdefinerte forholdstall. For eksempel genet
APC
befinner seg på det humane kromosom 5 i intervallet [112 101 484, 112 209 836]. To pasienter har tap med forholdstall 0,8 kryssende intervallet [112101484, 112209836] og sju pasienter har gevinster med forholdstall 1,2 kryssende samme intervall. De samme terskler ble brukt i studien [22], som vi sammenlignet med våre resultater. Oppsummerende statistikk på de presiseringer og slettinger ble ordnet innenfor den nye programvaren og bruke Excel.
Resultater
Kjennetegn ved de analyserte prøvene
Vi studerte 15 kolon adenokarsinomer fra AA pasienter. Gjennomsnittsalderen for denne gruppen av pasienter var 63,5 år med åtte kvinner og sju menn. Tumorene ble hovedsakelig moderat differensierte (93%), og i trinn II eller III (87%). To tredjedeler av prøvene var høyresidig (67%; Tabell 1). En sammenligning av vår gruppe av pasienter med de i Lassmann et al [22] har vist noen statistisk signifikante forskjeller mellom de to gruppene (tabell 1).
Sammendrag av genomisk Endringer
alle 15 tilfeller vises noen kromosom ustabilitet. Disse kromosomavvik ble ikke likt fordelt over alle kromosomene. Bare kromosom 21 viste ingen presiseringer og bare kromosom 8 viste ingen strykninger. Totalt 182 forsterkning hendelser og 101 sletting hendelser ble funnet i 15 prøver alle sammen, med gjennomsnittstall på 12,1 presiseringer og 6,7 slettinger per pasient. gjennomsnitt på 20 avvik ble funnet i hver pasient på denne studien. Amplifikasjoner var fremtredende i kromosomer 2 (40%), 6 (47%), 7 (80%), 8 (60%), 12 (40%), 13 (60%), 16 (47%), 20 (67 %) og X (60%). Kromosomdelesjoner var hyppigere på kromosomer 2 (47%), 4 (53%), 5 (60%), 7 (40%), 8 (67%), 17 (40%), 18 (60%), 19 (40%), og 22 (40%, tabell 2).
de avvik ble skjevt fordelt mellom de 15 pasientene med fire pasienter som har mindre enn 10 avvik (pasienter 3, 11, 12 og 13 ). Antallet aberrasjoner synes ikke å være stadium-spesifikke siden disse fire pasienter står i trinn 1, 3c, 3c og 3a hhv. Andre pasienter ved disse trinn vist mange flere aberrasjoner (pasienter 2, 4, 5, 8, 9, 10, 11 og 13). Antallet CNVs ser ikke ut til å avhenge av alderen av pasientene ettersom pasientene en og to, den yngste i vår gruppe (51 og 53 år), har 55 og 42 avvik henholdsvis, mens pasienter 3, 11, 12 og 13 med færrest antall avvik er 65, 83, 73 og 61 år, henholdsvis. Dessuten var det ingen sammenheng mellom kjønn og hyppigheten av CNVs.
Sammenligning av aCGH data med CRC KAN Gener
En analyse av Sjöblom et al. [23] av 11 bryst og 11 colontumorer førte til etableringen av en liste over potensielt endrede gener i slike svulster. Mer enn 90% av tumorene var stadium IV i Sjöblom et al sammenlignet med 6,6% i denne studien. Vi sjekket våre aCGH data for gevinst /tap på de 68 genene som ble funnet å være generelt endres i tykktarm kreft svulster. De fleste av disse genene viser en ikke-null frekvens for endring i våre prøver. Blant de CRC genene etablert av Sjöbolm et al [23] Det mest brukte slettet i våre prøver var
EPHB6, EXOC4 (SEC8L1), Gnas, MLL3, etter og
TBX22
. De vanligst forsterkede gener var
HAPLN1 (CRTL1), ADAM29, SMAD2, etter og
SMAD4 product: (Tabell 3).
komparativ analyse av aCGH data mellom Aas og kaukasiere
Vi har sammenlignet våre aCGH data av AA pasienter med listen over mest slettet eller forsterket gener oppnådd med kaukasiske tumorvev etter Lassmann et al. [22]. Med kolorektal kreft i vår undersøkelse var mer enn 90% moderat differensierte som er lik den Lassmann et al studien. Imidlertid er andelene av trinn II og III tumorer var 68% og 32% i Lassmann et al og 33%, 53% i denne studien. Vår sammenligning viste at 29 genene har et lignende mønster av endringer i begge populasjonene mens 13 gener vist forskjellige profiler (tabell 4). Av disse 13 genene,
ATM
genet ble hovedsakelig forsterket i kaukasiere.
DCC
genet ble hovedsakelig forsterket i kaukasiere men slettes i AAs (p 0,05).
EGR2, FLII, LLGL1, MAP2K5, PCNT, RAF1, SP6, THRB
, og
TOP3A
gener ble slettet i kaukasiere men uendret i AA-pasienter. Seks gener ble slettet i AAs men ikke i kaukasiere med statistisk signifikante forskjeller nemlig;
ATM, INS, KAL1, LRRC32, TOP3A Hotell og
XIST plakater (tabell 4).
STS
genet ble slettet i kaukasiere (p 0,05) og forsterkes i AAs mens
PRPF6
ble forsterket i AAs og uendret i kaukasiere (tabell 4). Metoden for sammenligning utelukket å identifisere gener som ofte endres i AAs, men ikke inkludert i Lassmann et al studie.
Diskusjoner
For å dechiffrere de mulige genetiske årsaker som ligger til grunn den høye forekomsten av tykktarmskreft i AAs, vi tidligere gjennomført studier på MSI, metylering av CAN-gener og mutasjoner av kjente gener som
BRAF Hotell og
KRAS product: [24], [25], [26 ]. Selv om disse studiene avslørte noen av de genetiske og epigenetiske detaljene i denne populasjonen, har ingen vist noen slående forskjeller mellom Aas og den generelle befolkningen. Vi her gjennomført den første analysen av hele genomet til tykktarmskreft fra AA pasienter med mål om å ha en mer omfattende oversikt over de genomiske regioner involvert i kolon kreftutvikling. Vi sammenlignet våre resultater med de publiseres på kaukasiske prøver [22] og med en mye omtalte liste av tykktarmskreftgener [23].
Et gjennomsnitt på 20 avvik ble funnet i de analyserte svulster styrke rollen til kromosom ustabilitet i kolon kreftutvikling hos denne pasientgruppen med mer forsterkning (12,13 per sak) enn slettinger (6,73 per sak) peker mot en høyere rolle for onkogener aktivering enn tumorsuppressorgener deaktivering i denne prosessen. CRC endringer rettet mot visse kromosomer mer enn andre. Kromosomer 7, 8, 13, 20 og X ble amplifisert i mer enn 50% av tilfellene i denne studien. Det er fastslått at kromosomer 7, 8, 13 og 20 er involvert i CRC gjennom forsterker [22]. Våre funn tyder på den ytterligere betydningen av X-kromosom, som ble amplifisert i 60% av tilfellene. Mange publikasjoner henviser til kromosom X inneholder tumorsuppressorgener oppdaget etter strykninger i tumorer [27]. Forsterkning av kromosom X p og q armene forekom oftere hos (5 av 7 (71,4%)) enn de kvinnelige seg de mannlige pasientene (2 av 8 (25%)). En studie av japanske CRC pasienter funnet på samme måte som gevinst på kromosom X er mer fremtredende hos menn enn hos kvinnelige pasienter [28].
I vår undergruppe av 7 mannlige pasienter, tre (42,8%) viste en sletting av en felles region som strekker seg fra Yq11.223 gjennom cent til Yp11.31 band. Det er debatt om den mulige rollen som Y-kromosom tap i sykdommer som akutt myelogen leukemi, eller om en slik prosess er bare aldersrelatert [29]. Pasienter 4, 7 og 10 med Y kromosom slettinger er henholdsvis 71, 57 og 64 år gammel. En større mannlig CRC befolkning er nødvendig for å sortere ut hvilken rolle dette kromosomet kan spille i tykktarmskreft.
Kromosomer som slettinger er kjent for å være hyppig i CRC er 8, 15, 17 og 18 [22]. I vår gruppe, kromosomer 4, 8 og 18 vises slettinger i mer enn 50% av tilfellene, mens kromosomene 15 og 17 ble slettet ved frekvenser på 33,3% og 40% henholdsvis. Således, ved måling av kromosomer med hyppige slettinger, CRC i AAs ser ut til å være lik CRC i kaukasiere.
Vi sjekket listen over 68 gener fra Sjöblom et al [23] som er potensielt involvert i tykktarmskreft å se statusen til disse genene i vår gruppe pasienter. Alle disse genene viser en viss grad av endring (forsterkning eller sletting) i våre pasienter. Disse resultatene styrker sin CAN genet status (tabell 3). En av de mest slettede genene var
EPHB6 Hotell som er kjent for å bremse brystkreftcellelinjer invasivitet [30]. Et annet gen
EXOC4 (SEC8L1), etter som inneholder en polymorfisme forbundet med type 2-diabetes [31] ble også ofte slettet i våre prøver, og er kjent for å spille en rolle i synaptogenesis og utvikling av hjernen [32]. Proteinet EXOC4 er en del av den exocyst kompleks som har vært implisert i brystkreft invasivitet [33].
MLL3
gen ikke endres på koreansk CRC pasienter [34] og sjelden endres i en annen studie [35], men det er en av de hyppigste målene for sletting i vår gruppe pasienter.
Gnas
gen hvis uttrykk øker Galphas uttrykk er en proapoptotiske gen involvert i mange organ kreft [36]. Dens funksjon er i tråd med vår opplever at det er også sterkt slettet i AA CRC pasienter. Mutasjoner i ofte slettet genet
TBX22
er knyttet til ikke-syndrom ganespalte [37], men
TBX2
har ingen kjent rolle i tumordannelse.
Blant CAN gener fra Sjöblom et al. liste [23], følgende er blant de hyppigst forsterkes i AA-pasienter:
SMAD2, SMAD4, ADAM29
, og
HAPLN1
. Proteiner av ADAM-familien er en gruppe av metalloproteinase som ADAM17 er mest studert. ADAM17 er nødvendig for genereringen av de aktive former av epidermal vekstfaktor-reseptor (EGFR) ligander, og dens funksjon er viktig for utviklingen av epitelvev [38]. Bør ADAM29 fungere også for å aktivere vekst reseptorer, deretter sin forsterkning i tumorer ville være fornuftig.
HAPLN1 product: (
CRTL1
) genet koder for et ekstracellulært matrix protein, som spiller en viktig rolle i hjerte utvikling [39]. Uttrykket av
HAPLN1
kan bli endret i løpet av kolorektal kreftutvikling [40]. Begge
SMAD2 Hotell og
SMAD4
er kjent for å være involvert i celleproliferasjon, apoptose og differensiering gjennom TGF vei [41]. Som sådan, kan deres forsterkning være medvirkende til å fremme veksten og kreftutvikling sammen med andre gener.
Vi sjekket 42 CRC gener slått av Lassmann et al. å være hyppige mål for CNVs [22]. Vi kommenterer noen av de genene som de kaukasiske og AA-prøvene viste ulike mønstre av avvik.
ATM
gen, hvis kodede protein er nødvendig for DNA-skade respons og bidrar til cellulær homeostase [42], ofte ble amplifisert i kaukasiske pasienter men ikke i AA-gruppen. På den annen side,
PRPF6
kun forsterkes i AAs (tabell 4). Mutasjoner i gener fra samme familie (
PRPF3
,
8
, og
31
) har vært innblandet i retinitis pigmentosa [43]. Men ingen rolle i kreft
PRPF6
eller andre beslektede gener er kjent. To gener viste motstående endringer i de to pasientgrupper;
DCC
ble primært forsterket i kaukasiere men slettet i AAs, mens
STS
genet ble slettet i kaukasiere og forsterkes i Aas. Faktisk
DCC
er generelt nedregulert eller slettes i kolon kreftpasienter på grunn av sin TSG egenskaper som er mer i samsvar med sin status sletting bruker aCGH i våre pasienter [44]. Den konstitutive ekspresjon av
STS
genet (steroid sulfatase-genet) fremmer veksten av humane brystcancerceller [45]. Mens forskjellene mellom Lassmann et al, Sjöblom et al [22], [23], og vår studie kan være delvis på grunn av nivået av kromosomalt avvik, dataene innenfor vår studie viste at hverken tumorstadium eller differensieringen status hadde en effekt på kromosom ustabilitet. Fremtidige studier er nødvendig der scenen og differensiering matchet svulster fra ulike populasjoner blir evaluert.
I konklusjonen, viser vår aCGH analyse av 15 AA kolorektal karsinom at alle svulster inneholde en viss grad av kromosom ustabilitet. Georgiades et al. har identifisert en gruppe av karsinomer uten CIN [4]. Slik er ikke tilfelle for våre AA pasienter. Et større antall pasienter som er nødvendig for å undersøke hvorvidt slike CRC tumorer eksistere innenfor AAs eller alle AA CRC har noen grad av CIN. En mer omfattende analyse involverer MSI og metylering profiler av de analyserte svulster, i tillegg til CIN analyse kan også kaste mer lys over detaljene og særegenheter av disse ulike prosessene i tumorigenesis. Rollen av kromosom X forsterkning i tykktarm karsinogenese i AA-pasienter, spesielt menn, fortjener videre undersøkelser.
Takk
Forfatterne takker M. Nouraie for sine kommentarer til den statistiske delen av dette manuskriptet.
