PLoS ONE: Betydelig rolle østrogen og progesteron reseptor sekvensvarianter i galleblæren kreft Predisposition: En Multi-Analytisk strategi

Abstract

Bakgrunn

Carcinoma av galleblæren (GBC) er en aggressiv kreft. Jo høyere forekomst av galleblæren kreft hos kvinner er delvis tilskrives hormonelle faktorer. Derfor denne studien var designet for å undersøke hvilken rolle genetiske varianter i østrogen (

ESR1, ESR2

) og progesteron (

PGR

) reseptorer i overdragelse risiko for galleblæren kreft.

Materialer og metoder

Den nåværende case-control studie rekruttert totalt 860 individer, inkludert 410 GBC pasienter, 230 gallestein pasienter og 220 kontroller. Vi undersøkte sammenslutninger av 6 utvalgte polymorfismer i tre gener:

ESR1 plakater (rs2234693, rs9340799, rs1801132),

ESR2 plakater (rs1271572, rs1256049) og

PGR plakater (rs1042838) med GBC risiko. Genotyping for alle polymorfismer ble gjort ved hjelp av PCR-RFLP. Multifaktor dimensionality reduksjon og klassifisering og regresjon tre tilnærminger ble kombinert med logistisk regresjon for å oppdage høy-order gen-gen-interaksjoner i hormonell vei.

Resultater

På sammenligne genotype frekvensfordeling i gallestein og GBC pasienter med at av friske personer, de homozygot variant genotyper av

ESR1

-397TT (rs2234693) polymorfisme viste betydelig risiko for å utvikle gallestein [odds ratio: OR = 2,9] og GBC [OR = 1,8] hhv. Detaljert haplotyper analyse antydet at

ESR1

T

rs2234693G

rs9340799C

rs1801132 har signifikant sammenheng i overdragelse risiko for både gallestein [OR = 2,2] og GBC [OR = 3,0]. Men varianten inneholder genotyper (DI + II) av

PGR plakater (rs1042838) viste lav risiko i både GBC [OR = 0,4] og gallestein pasienter [OR = 0,4] .På utfører MDR analyse,

ESR1

IVS1-397C T,

ESR1

IVS1-351A G, og

ESR2

-789 A C ga den høyeste testing nøyaktigheten av 0,634. Disse resultatene ble videre støttet av CART analyse som viste at personer med den kombinerte genotyper av

ESR1

-397 CT eller TT,

ESR1

-351 AG eller GG og

ESR2

-789 AA hadde høyest risiko for GBC [OR = 3,9].

Konklusjon

Ved hjelp av multi-analytiske tilnærminger, vår studie viste viktig rolle

ESR1

IVS1- 397C T,

ESR1

IVS1-351A G, og

ESR2

-789 A . C-varianter i GBC mottakelighet og risikoen synes å være formidlet gjennom gallestein avhengig sti

Citation: Srivastava A, Sharma KL, Srivastava N, Misra S, Mittal B (2012) betydelig rolle i østrogen og progesteron reseptor sekvensvarianter i galleblæren kreft Predisposition: En Multi-Analytisk strategi. PLoS ONE syv (7): e40162. doi: 10,1371 /journal.pone.0040162

Redaktør: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, USA

mottatt: 1 mars 2012; Godkjent: 02.06.2012; Publisert: 10. juli 2012

Legg att eit svar