Abstract
Bakgrunn
onkogene
BRAF
mutasjoner er funnet i ulike maligniteter og aktivere RAF /MEK /ERK signalering, en kritisk bane av tumorigenesis. Vi undersøkte de kliniske egenskaper og resultatene av pasienter med mutert (Mut)
BRAF
avansert kreft referert til fase en klinikk.
Metoder
anmeldt registreringer av 80 pasienter på rad med
mutBRAF
utbredt kreftsykdom og 149 med vill-type (
wt
)
BRAF plakater (matchet av tumortype) henvist til klinisk senter for målrettet terapi og analysert deres utfall .
Resultater
Av 80 pasienter med
mutBRAF
avansert kreft, 56 hadde melanom, 10 colorectal, 11 papillær skjoldbruskkjertel, 2 eggstokkreft og en spiserørskreft. Mutasjoner i kodon 600 ble funnet i 77 pasienter (62,
V600E
, 13,
V600K
, 1,
V600R
, 1, urapportert). Multivariat analyse viste mindre bløtvev (Odds ratio (OR) = 0,39, 95% KI: 0,20 til 0,77, P = 0,007), lunge (OR = 0,38, 95% KI: 0,19 til 0,73, p = 0,004) og retroperitoneale metastaser ( OR = 0,34, 95% KI: 0,13 til 0,86, p = 0,024) og flere hjernemetastaser (OR = 2,05, 95% KI: 01.02 til 04.11, P = 0.043) hos pasienter med
mutBRAF
versus
wtBRAF
. Sammenlignet med tilsvarende
wtBRAF
,
mutBRAF
melanom pasienter hadde ubetydelig trend til lengre median overlevelse fra diagnose (131 vs 78 måneder, p = 0,14), mens
mutBRAF
pasienter med kolorektal kreft hadde en ubetydelig tendens til kortere median overlevelse fra diagnose (48 vs 53 måneder, p = 0,22). I melanom,
V600K
mutasjoner i forhold til andre
BRAF
mutasjoner ble assosiert med hyppigere hjernen (75% vs. 36,3%, p = 0,02) og lungemetastaser (91,6% vs 47,7 %, p = 0,007), og kortere tid fra diagnose til metastase og til død (19 versus 53 måneder, p = 0,046 og 78 vs. 322, p = 0,024 henholdsvis). Behandling med RAF /MEK målsøkende midler (Hazard ratio (HR) = 0,16, 95% KI: 0,03 til 0,89, p = 0,037) og eventuell reduksjon i tumorstørrelse etter henvisning (HR = 0,07, 95% KI: 0,015 til 0,35, p = 0,001) korrelert med lengre overlevelse i
mutBRAF
pasienter.
Konklusjoner
BRAF
synes å være en druggable mutasjon som også definerer undergrupper av pasienter med fenotypiske overlapping, om enn med forskjeller som korrelerer med histologi eller åsted for mutasjon
Citation. El-Osta H, Falchook G, Tsimberidou A, Hong D, Naing A, Kim K, et al. (2011)
BRAF
Mutasjoner i Avanserte Kreft: Kliniske kjennetegn og resultater. PLoS ONE 6 (10): e25806. doi: 10,1371 /journal.pone.0025806
Redaktør: Hava Karsenty Avraham, Beth Israel Deaconess Medical Center, USA
mottatt: 12 mars 2011; Godkjent: 12 september 2011; Publisert: 19 oktober 2011
Copyright: © 2011 El-Osta et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Støttet i del av Grant Number RR024148 fra National Center for Forskning Resources, en del av National Institutes of Health Roadmap for medisinsk forskning. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:. Dr Razelle Kurzrock mottatt kommersielle forskningsstøtte fra GlaxoSmithKline, Astrazeneca, Genentech og Bayer. Dr. Gerald Falchook fått kommersiell forskningsstipend fra GlaxoSmithKline. Dette endrer ikke forfatternes tilslutning til alle PLoS ONE politikk på deling av data og materialer.
Innledning
Ras proteiner regulerer celleproliferasjon, overlevelse og differensiering ved å aktivere en rekke nedstrøms effektorer , inkludert RAF protein kinase. Når aktivert, stimulerer RAF en signalkaskade som involverer MEK /ERK veien. BRAF, en serin-treonin kinase, er en av tre RAF protein kinase familiemedlemmer (Araf, BRAF og hån) [1].
BRAF
proto-onkogen har nylig vært gjenstand for intensiv forskning, som sin mutasjon konstitutivt aktiverer RAF /MEK signalering, en viktig driver for kreftutvikling i ulike kreftformer, spesielt i melanom, tykktarmskreft, og papillær skjoldbrusk kreft
1. Den vanligste
BRAF
mutasjon er en substitusjon av glutaminsyre for valin i kodon 600 (V600E) [2] – [3].
I de siste årene, en mengde lovende forbindelser som er rettet mot RAS /RAF /MEK sti har skrevet kliniske studier, noen av dem viser lovende klinisk aktivitet, hovedsakelig i kreft med
BRAF
mutasjoner [4] – [6]. Følgelig, testing for aktive mutasjoner i
BRAF
blir stadig mer vanlig, spesielt hvis pasienten skal behandles med BRAF-hemmere eller andre pathway modulatorer som MEK-hemmere.
Oncogene mutasjoner som
BRAF
skje på tvers av ulike krefttyper. Heri, undersøkte vi kliniske funksjoner og utfallet forbundet med tilstedeværelse av
BRAF
mutasjoner, med hovedmålene er å skissere kliniske og prognostiske karakteristika forbundet med tilstedeværelse av
BRAF
mutasjoner, hvorvidt spesifikk
BRAF
mutasjoner har en distinkt klinisk forløp, samt prediktiv effekten av målrettet behandling.
Metoder
Pasienter
fra og med januar 2006 vi undersøkt
BRAF
mutasjonsstatus hos pasienter med avanserte svulster og tilgjengelig vev henvist til klinisk senter for målrettet terapi ved Institutt for Investigational Cancer Therapeutics (fase i kliniske studier Program) ved University of Texas MD Anderson Cancer Center. Registreringen av pasienter i databasen, patologi vurdering, og mutasjonsanalyse ble utført ved MD Anderson. Totalt 80 påfølgende pasienter med
BRAF
mutasjoner ble valgt.
For å definere skille funksjonene mutant (Mut)
BRAF
avansert kreft, valgte vi en kontrollgruppe på rad pasienter med villtype (wt)
BRAF
avansert kreft sett på senteret vårt i løpet av samme tidsperiode og matchet i en 1:02 ratio av tumortype med
mutBRAF
pasienter.
MD Anderson Cancer Center Institutional Review Board har godkjent studien. Skriftlig samtykke ble gitt av pasientene for deres informasjon skal lagres på sykehuset database og brukes til forskning.
Vevsprøver og mutasjonsanalyse
Arkiv formalinfiksert, blokker parafininnstøpte vev eller materiale fra finnålsaspirasjon biopsi innhentet fra diagnostiske og /eller terapeutiske prosedyrer ble brukt til å teste for
BRAF
mutasjoner. All patologi var sentralt bekreftet ved MD Anderson.
BRAF
mutasjonstesting ble utført i en klinisk Laboratory forbedring Amendment-sertifisert Molecular Diagnostic Laboratory i Seksjon for patologi og laboratoriemedisin ved MD Anderson. DNA ble ekstrahert fra mikro dissekert parafininnstøpte tumorsnitt og analysert ved hjelp av en polymerase kjedereaksjon (PCR) -basert DNA-sekvenseringsmetode for
BRAF
kodoner 595-600 mutasjoner i exon 15 av pyrosekvensering som beskrevet tidligere [7 ]. Substitusjon av glutaminsyre for valin i kodon 600 betegnes som V600E; V600K betegner substitusjon av lysin for valin; V600R, arginin for valin.
Når det er mulig, vi testet for andre mutasjoner som
EGFR
(eksoner 18 og 21) [8],
KIT plakater (eksoner 11, 13 og 17) [9],
PIK3CA
(eksoner 9 og 20) [10],
NRAS Hotell og
KRAS plakater (ekson 2) [7], [11 ]. PTEN tap ble vurdert ved hjelp av immunhistokjemi (monoklonalt mus anti-human PTEN, klone 6H2.1, Dako®, Danmark) [12].
Kliniske karakteristika og behandling evaluering
Alle kliniske variabler ble vurdert ved gjennomgang av elektronisk pasientjournal. Behandlingseffekten ble evaluert fra computertomografi (CT) skanner og /eller magnetisk resonans imaging (MRI) ved baseline før behandlingsstart og deretter omtrent hver 6 til 8 uker. Alle røntgenbilder ble lest ved Institutt for radiologi ved MD Anderson og anmeldt i Institutt for Investigational Cancer Therapeutics svulst måling klinikken.
Prognostic vurderingen ble gjort ved hjelp av Royal Marsden Hospital (RMH) [13] prognostisk poengsum som følger : 0 poeng, normal laktat dehydrogenase (LDH), albumin ≥3.5 g /dl, en ≤2 metastaser; En punkt-LDH øvre normalgrense, albumin 3,5 g /dL, 2 metastaser. Pasienter med 0-1 punkter hadde en god RMH score, og pasienter med 2-3 poeng hadde en dårlig RMH poengsum.
Statistical Analysis
Statistisk analyse ble bekreftet av vår statistiker (SW). Følgende kovariater knyttet til pasientkarakteristika ble analysert: type kreft, alder, kjønn, rase, personlige historie av kreft, historie av røyking eller alkoholisme, familiehistorie med kreft, område og antall metastaser, tilstedeværelse av ascites, pleuravæske eller dyp venøs trombose, tumormarkører (CEA, CA 19-9, CA125, CA27.29), laktatdehydrogenase, albumin, hemoglobin, hvite blodlegemer, blodplatetall, kalsium nivå, stedet for mutasjon, tilstedeværelse av andre avvik (
PIK3CA
,
NRAS eller KRAS
,
KIT
mutasjon og
PTEN
tap), dato for diagnose, lokalavansert sykdom, fjernmetastaser, henvisning, død eller dato for siste oppfølging, informasjon om beste standarden systemisk behandling for metastatisk sykdom og behandling med fase en rettssak.
Beskrivende statistikk ble brukt til å oppsummere pasientkarakteristika. Fisher eksakte test ble anvendt for å teste for en hvilken som helst forbindelse mellom to kategoriske variabler. Mann-Whitney U-test ble brukt for å teste sammenhengen mellom alder og
BRAF
mutasjonsstatus.
Total overlevelse (OS) ble målt (metode for Kaplan-Meier) fra diagnosetidspunktet, dato for metastaser, eller dato for henvisning til dødsdato eller siste oppfølging, avhengig av hva som skjedde først. Pasienter i live ble sensurert i siste oppfølging dato. Progresjonsfri overlevelse (PFS) ble definert som tidsintervallet mellom starten av behandlingen til den første observasjonen av sykdomsprogresjon (som bestemmes av Response evalueringskriterier i solide tumorer (RECIST) [36] eller død, avhengig av hva som kom først. Pasienter i live og uten sykdomsprogresjon ble sensurert i siste oppfølgingsdato. Sykdomsfri overlevelse ble målt fra diagnosetidspunktet til første fjernmetastaser. Log-rank test ble brukt for å sammenligne OS eller PFS blant undergrupper. multivariat analyse med Cox regresjonsmodell ble brukt for å vurdere en uavhengig sammenslutning mellom et kjennetegn og PFS eller OS. den «enter» metoden ble brukt der alle variablene legges inn i modellen uten å sjekke. Binary logistisk metode ble brukt til å teste for en uavhengig sammenheng mellom en kategorisk variabel og
BRAF
mutasjonsstatus. «Enter» metoden ble brukt der alle variablene legges inn i modellen uten å sjekke. alle testene var tosidig. En p-verdi mindre enn 0,05 ble ansett som statistisk signifikant. Statistisk analyse ble utført ved hjelp av SPSS (versjon 17.0, SPSS, Chicago, IL, USA)
Resultater
Pasient egenskaper
Totalt 80 pasienter med avanserte svulster og
mutBRAF
ble identifisert. Median alder var 52 år (range, 18-78 år), og 43 var menn (54%). Størstedelen av pasientene hadde melanom (n = 56, 70%), etterfulgt av papillær thyroideakarsinom (n = 11, 14%), kolorektal kreft (n = 10, 13%), og andre tumortyper (eggstokk-kreft, n = 2 , 2%, spiserørskreft, n = 1, 1%) (reflekterer henvisning mønstre til vår klinikk), (tabell 1)
De vanligste metastaser var lungene (n = 48, 60. %), overflatiske lymfeknuter (n = 39, 49%), peritoneum (n = 33, 41%), lever (n = 31, 39%), hjerne (n = 27, 34%), bløtt vev (n = 26, 33%), bein (n = 20, 25%) og retroperitoneale lymfeknuter (n = 9, 11%).
Vi identifiserte 149 kontrollpasienter med avansert kreft som testet negativt for
BRAF
mutasjoner i samme tidsperiode og som ble matchet på en 01:02 basis av tumortype med
mutBRAF
pasienter. For papillær skjoldbruskkjertelkreft, ble matching gjort med en 1:01 ratio på grunn av en utilstrekkelig antall pasienter henvist som hadde tester gjort og testet negativt for
BRAF
mutasjon. De detaljerte pasientkarakteristika er vist i tabell 1.
Grupper med
mutBRAF Hotell og
wtBRAF
var like med hensyn til median tid fra diagnose til henvisning til fase en klinikk som beregnes ved log-rank-metoden (12 vs. 12,7 måneder, p = 0,95). Initial stadieinndeling ved diagnose ble også likt fordelt mellom de to gruppene. Pasientene ble behandlet på en klinisk studie om de hadde unnlatt å svare på konvensjonell behandling. Når det er mulig, pasienter med
mutBRAF
ble tilbudt behandling rettet mot RAF /MEK veien. Pasientene hadde en median på to tidligere behandlinger, uavhengig av BRAF status.
Typer av
BRAF
mutasjoner
Av de 80 pasienter med
mutBRAF
, 77 (96%) hadde mutasjoner i kodon 600 og to (3%) i kodon 601. En (1%) pasient hadde samtidige mutasjoner i kodon 599 og 600. av de 77 pasientene med kodon 600
mutBRAF
, 62 (81%) hadde
V600E
mutasjoner (melanom, n = 40; kolorektal, n = 8; papillær tyreoideacancer, n = 11; spiserøret, n = 1 og ovarie, n = 2), 13 (17 %)
V600K
mutasjoner (melanom, n = 12; tykktarmskreft, n = 1), 1 (1%)
V600R
mutasjon (melanom, n = 1) og en av urapportert typen (colorectal, n = 1) (tabell 1).
BRAF
mutasjoner og kliniske funksjoner
Univariat analyse.
Pasientens alder ved diagnose var betydelig yngre pasienter med
mutBRAF plakater (median alder = 52 år) versus
wtBRAF
sykdom (median alder = 58 år) (p = 0,002). Menn ble oftere representert i begge
mutBRAF Hotell og
wtBRAF
grupper, men andelen kvinner trend mot å bli større i
mutBRAF
gruppe (46% vs. 33% , p = 0,06). Det var ingen signifikante forskjeller mellom
mutBRAF Hotell og
wtBRAF
gruppe for andre egenskaper, herunder etnisitet, personlig, sosial og familiehistorie, komplikasjoner inkludert trombose, ascites og pleuravæske (tabell 1).
Pasienter som hadde
mutBRAF
svulster hadde mindre hyppig involvering av lungene (60% vs. 79%, p = 0,003), retroperitoneale noder (11% vs. 25%, p = 0,004 ), og mykt vev (33% vs. 50%; p = 0,01). I undergruppeanalyse ble dette mønsteret også observert i hver av de tre store tumortyper; imidlertid på grunn av det lille antall pasienter i den ikke-melanom kohort, ble betydning bare oppnådd for pasienter med melanoma (unshown data). Det var ingen forskjell i involvering av andre områder av metastaser.
multivariat analyse.
I multivariat analyse ved hjelp av en logistisk regresjonsmodell, pasienter med
mutBRAF
hatt mindre hyppige metastaser til (i) bløtvev (OR = 0,39, 95% KI: 0,20 til 0,77, p = 0,007); (Ii) lunge (OR = 0,38, 95% KI: 0,19 til 0,73, p = 0,004); og (ii) retroperitoneum (OR = 0,34, 95% CI: 0,13 til 0,86, p = 0,024) (tabell 2). Kvinner var mer sannsynlig å ha
mutBRAF enn wtBRAF plakater (OR = 1,92, 95% KI: 1,02 til 3,57, p = 0,045). Pasienter med
mutBRAF
sammenlignet med
wtBRAF
var mer sannsynlig å ha hjernemetastaser (OR = 2,05, 95% KI: 01.02 til 04.11, p = 0,043). Pasienter som er yngre enn 60 år viste en trend mot høyere sannsynlighet for
BRAF
mutasjoner (OR = 1,88, 95% KI: 0,99 til 3,70, p = 0,053). I subgruppeanalyse av melanom, var denne trenden statistisk signifikant (multivariat p-verdi = 0,023) (tabell 3). De mindre antall pasienter med andre krefttyper utelukket en separat analyse for denne faktoren. Et intervall fra diagnose til fjernmetastaser av ≥2 år var mer sannsynlig å bli assosiert med
mutBRAF product: (Odds ratio (OR) = 2,84, 95% konfidensintervall (CI): 1.18 til 4.14, p = 0,013) (Tabell 2). Men i sykdomsspesifikke analyser, i tykk- og papillær skjoldbruskkjertelkreft, var andelen pasienter med sykdomsfritt intervall fra diagnose til metastaser på over to år var mindre for pasienter med
mutBRAF
sykdom, men dette gjorde ikke statistisk signifikant på grunn av lite antall pasienter i hver undergruppe (data ikke vist).
Co-eksisterende Mutasjoner /Molecular Avvik
En undergruppe av
mutBRAF
pasienter med tilgjengelige data hadde også
PTEN
tap (2/7; 29%) eller
PIK3CA
mutasjoner (1/26, 4%) (tab 1). Hos pasienter med
wtBRAF
, 2/20 (10%) hadde
PTEN
tap og 4/46 (9%) hadde PIK3CA mutasjon. Det var ingen forskjell i forekomst av
PTEN
tap eller
PIK3CA
mutasjoner mellom
mutBRAF
vs.
wtBRAF
grupper, men de små antall pasienter kan utelukke bastante konklusjoner, særlig i PTEN gruppen.
Som forventet
KRAS Hotell og
NRAS
mutasjoner var betydelig mindre vanlig i
mutBRAF
gruppen sammenlignet til
wtBRAF
gruppe (
KRAS
: 0/24 (0%) vs. 13/45 (29%), p = 0,002;
NRAS
: 1 /17 (6%) vs. 42/108 (39%), p = 0,006). Av interesse, bør det bemerkes at en pasient hadde en samtidig
BRAF Hotell og
NRAS
mutasjon.
BRAF
status og progresjonsfri overlevelse ( PFS) på vanlig standard behandling
Vi analyserte PFS på konvensjonell behandling (før henvisning til fase en klinikk) for metastatisk sykdom i henhold til
BRAF
status. Vi valgte den lengste PFS hver pasient hadde oppnådd på en konvensjonell behandling.
Når analysert med alle pasienter inkludert, var det ingen generell forskjell i median PFS mellom
mutBRAF
vs.
wtBRAF
sykdom (7,0 måneder, 95% CI 5.6 til 8.3 vs. 7.1 måneder, 95% CI 5.7 til 8.5; p = 0,49). Men pasienter med tykktarmskreft og
mutBRAF
hadde en median PFS på 7 måneder (95% KI 5.3 til 8.6) sammenlignet med 9,2 måneder (95% KI 07.04 til 10.09) i
wtBRAF product: ( p = 0,002) (figur 1). I multivariat analyse,
mutBRAF
var en uavhengig prognostisk faktor for kortere PFS (HR: 3,76, 95% KI 1,22 til 11,49, p = 0,02). På den beste standarden systemisk behandling ved metastatisk kolorektalcancer
(En pasient med utilstrekkelig poster på tidligere behandling ble ekskludert).
i melanom og papillær skjoldbrusk kreft, var det ingen forskjell i median PFS hos pasienter med
mutBRAF
forhold til
wtBRAF
(4,3 måneder, 95% CI 1.9 til 6.8 vs. 5.5 måneder, 95% CI 3.5 til 6.7; p = 0,29, 24 måneder, 95% KI 14,4 til 33,5 vs. 25 måneder, 95% KI 0 til 55,4;. p = 0,65 henholdsvis)
BRAF
Status og Survival
Univariat analyse
Vi analyserte OS fra diagnosetidspunkt og fra. tidspunktet for metastasering. Median OS fra diagnosetidspunktet for
mutBRAF
pasienter var 322 måneder kontra 112 måneder (95% KI 58,2 til 165,7) for
wtBRAF
pasienter (p = 0,24). Median OS fra tidspunktet for metastasering av
mutBRAF
pasienter sammenlignet med
wtBRAF
var 99 måneder (95% KI 17,1 til 180,8) vs. 51 måneder (95% KI 38,7 til 63,2) (p = 0,58).
i sykdomsspesifikke subgruppeanalyse var median OS fra diagnose og fra metastaser var numerisk lenger i melanom pasienter med
mutBRAF
sammenlignet med
wtBRAF
(131 måneder 95% KI 52,7 til 209,2 vs. 78 måneder, 95% KI 41,8 til 114,1; p = 0,14 og 35 måneder 95% KI 8,7 til 61,2 vs. 30 måneder, 95% KI 8,3 til 53,6; p = 0,63 henholdsvis). I motsetning til i tykktarmskreft, median OS fra diagnose og fra metastaser var tallmessig kortere i
mutBRAF
pasienter sammenlignet med
wtBRAF plakater (48 måneder 95% KI 23,4 til 72,5 vs. 53 måneder, 95% KI 0 til 125,2; p = 0,22 og 30 måneder, 95% KI 14,5 til 45,4 vs. 53 måneder, 95% KI 38,8 til 67,1, henholdsvis p = 0,26). Lite antall pasienter i sykdomsspesifikke undergrupper utelukket mer klare konklusjoner og kan forklare mangelen på statistisk signifikans. OS fra diagnosetidspunkt og metastaser var ikke forskjellig mellom
mutBRAF Hotell og
wtBRAF
pasienter med papillær skjoldbruskkreft. Median OS fra diagnosetidspunktet ble ikke nådd etter en oppfølging av 133 og 138 måneder for
mutBRAF Hotell og henholdsvis
wtBRAF
. Også median OS fra metastaser ble ikke nådd med en median oppfølging på 67 og 46 måneder henholdsvis.
Videre analyserer vi den prognostiske betydningen av
NRAS
i melanom ved stratifisering vår melanom pasienter som følger:
mutBRAF Twitter /
wtNRAS
,
wtBRAF /mutNRAS
, og
wtBRAF /wtNRAS
. En median OS fra diagnose i hver av de 3 gruppene var 131 måneder (95% KI 81,6 til 180,3) (
mutBRAF Twitter /
wtNRAS
), 67 måneder (95% KI 29-105) (
wtBRAF /mutNRAS
), og 109 måneder (95% KI 51,6 til 166,3) (
wtBRAF /wtNRAS
) sikret OS forskjell mellom
mutBRAF Twitter /vekt
NRAS Hotell og
wtBRAF /mutNRAS
var av border statistisk signifikans (p = 0,05). En median OS fra tidspunktet for metastaser var 35 måneder (95% KI 8,5 til 61,5), 20 måneder (95% KI 10,3 til 29,6) og 51 måneder (95% KI 4,8 til 97,1), henholdsvis (p = 0,45). Disse data tyder på at pasienter med
mutBRAF
melanom overleve lenger enn de med
NRAS-
mutant sykdom, men at overlevelsen av
mutBRAF
melanom er ikke forskjellig fra melanom pasienter med
wtBRAF Hotell og
wtNRAS
.
multivariabel analyse.
En multivariat analyse på alle 229 pasienter basert på alder, kjønn,
RAS product: (
KRAS
,
NRAS
) mutasjoner,
BRAF
mutasjoner og sykdom type ble utført for å bestemme hvorvidt noen av disse faktorene påvirker overlevelse.
NRAS
mutasjon og mannlig kjønn var de eneste uavhengige faktorer assosiert med kortere OS fra diagnosetidspunktet (Hazard ratio (HR): 2,52, 95% KI 1,32 til 4,80, p = 0,005 og HR: 2,84, 95% KI 1,46 til 5,53, p = 0,002, henholdsvis), mens diagnosen melanom spådd en bedre OS fra diagnosetidspunktet (HR: 0,15, 95% KI 0,04 til 0,58, p = 0,005). Mann kjønn var den eneste faktoren forutsi dårlig OS fra tidspunktet for metastasering. (HR: 2,79, 95% KI 1,42 til 5,45, p = 0,003)
En sykdomsspesifikke multivariat analyse inkludert alder, kjønn,
RAS product: (
KRAS
,
NRAS
) mutasjoner og
BRAF
mutasjoner ble utført. I melanom, bare
NRAS
mutasjon og mannlig kjønn var assosiert med kortere OS fra diagnosetidspunktet (HR: 2,16, 95% KI 1.11 til 4.18, p = 0,02 og HR 2,64, 95% KI 1,28 til 5,41 , p = 0,008, respektivt). Mann kjønn var den eneste prognostiske faktoren for kortere OS fra tid av metastaser (HR: 2,84, 95% KI 1,35 til 5,97, p = 0,006). I tykktarmskreft, bare
KRAS
mutasjon ble identifisert som en selvstendig indikator for dårlig OS fra diagnosetidspunktet og metastase (HR: 13.56, 95% KI 1,61 til 113,88, p = 0,016 og HR: 5,46, 95% CI 1,07 til 27,89, p = 0,04 henholdsvis). Vi oppdaget også en trend for
mutBRAF
å forutsi dårlig OS fra diagnose eller første gang av metastaser (HR: 8,31, 95% KI 0,95 til 72,56, p = 0,055 og HR: 4,05, 95% KI 0,75 til 21,76 , p = 0,10, henholdsvis).
i multivariat analyse ble ingen prognostisk faktor oppdaget for papillær skjoldbruskkreft, kanskje på grunn av det lave antallet saker.
overlevelse i klinisk senter for målrettet Therapy (fase i klinikken) i henhold til
BRAF
status
Vi utførte en univariat og multivariat analyse for å undersøke hvilke faktorer som kan forutsi OS fra tidspunktet for henvisning til klinisk senter for målrettet behandling ( fase i Program) til døden i
mutBRAF
pasienter. Faktorer som inngår var: alder (≥60 g 60 år, kjønn (menn kontra kvinner), tumortype, RMH prognostisk score, alder, Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) funksjonsstatus (0-1 vs ≥2) behandling med RAF /MEK målretting midler vs. aldri behandlet med RAF /MEK målsøkende middel, noen reduksjon i mål lesjon størrelse vs. ingen nedgang etter henvisning til fase en rettssak.
Univariat analyse i
mutBRAF .
pasienter
i univariat analyse, observerte vi en lengre OS fra henvisning hos kvinner kontra menn (ikke nådd i begge gruppene, p = 0,015 og HR 2,62, 95% KI 1.14 til 6.1; p = 0,02), RMH score på 0-1 vs 2-3 (ikke nådd vs. 5 måneder, 95% KI 3-7; p 0,001 og HR 3,69, 95% KI 1,74 til 7,82; p = 0,001), performance status ≤1 vs. 2-4 (ikke nådd vs. 6 måneder, 95% CI 2.1 til 9.9; p = 0,035 og HR 2,51, 95% CI 1.1 til 6.28; p = 0,048), behandling med RAF /MEK målretting midler (56 av de 80 pasientene fikk RAF /MEK målsøkende midler, inkludert 37 med melanom, 10 med papillær skjoldbruskkjertel, 8 med tykktarmskreft og en med eggstokkreft) vs. behandling med andre midler eller ingen behandling (ikke nådd vs. 5 måneder, 95% CI 3.4 til 6.6; p 0,001 og HR 0,20, 95% KI 0,095 til 0,43; p 0,001), papillær skjoldbruskkjertelkreft vs. andre kreftformer (ikke nådd i begge gruppene, p = 0,018 og HR 0,09, 95% KI 0,10 til 0,89; p = 0,04), og noen reduksjon i tumorstørrelse på noen fase I klinisk studie vs. ingen reduksjon (ikke nådd vs. 6 måneder, 95% CI 4.7 til 7.2; p 0,001 og HR 0,09, 95% KI 0,025 til 0,32; p 0,001). (figur 2 og tabell 4)
(pasienter som ikke har tumormålinger ved siste oppfølging (N = 9) eller pasienter som ikke var innmeldt i en fase en rettssak etter henvisning (N = 13) ble ekskludert).
Ved å utelukke pasienter som ikke fikk meldt inn i en fase en rettssak etter henvisning (13 pasienter totalt), fant vi at
mutBRAF
pasienter behandlet med RAF /MEK målsøkende midler har bedret overlevelse etter henvisning sammenlignet med
mutBRAF
pasienter behandlet med andre midler (ikke nådd vs 5 måneder, 95% KI 4-6; p = 0,002 og HR 0,26, 95% KI 0,10 til 0,66; p = 0,005) (Figur 3).
Tic merkene representerer pasienter fortsatt i live i siste oppfølging. (Av 80 pasienter med
BRAF
mutasjoner, 56 fikk en RAF /MEK målsøkende midler, 11 fikk en ikke RAF /MEK målsøkende midler og 13 ble ikke registrert på en fase 1 studie).
multivariatanalyse i
mutBRAF
pasienter.
i multivariat analyse, de eneste to faktorer som spådd en overlegen OS etter henvisning til fase i klinikken i
mutBRAF
gruppen var behandling med eventuelle RAF /MEK målsøkende midler (HR 0,16, 95% KI, 0,03 til 0,89, p = 0,037) og noen reduksjon i tumorstørrelse (RECIST måling) på en hvilken som helst fase i studie (HR 0,07, 95% CI, 0,015 -0,35, p = 0,001) (figur 4). Av notatet, HR verdiene av de følgende prediktive faktorer «melanom vs. non melanom», «tykktarmskreft vs. non kolorektal kreft» og «papillær skjoldbrusk kreft kontra ikke papillær skjoldbruskkjertelkreft» er ekstremt høy, sammenlignet med deres HR beregnes ved univariat analyse (figur 4). Dette avviket kan forklares med forskjellen i metoden som er benyttet. Til tross for sin høye absolutte verdier, bør dette tolkes med forsiktighet forutsatt at de ikke har noen statistisk signifikans som demonstrert av en p-verdi nær 1 og 95% konfidensintervall som inneholder null. Videre er deres ekstremt bredt 95CI% indikasjon på dårlig estimat av verdien.
Univariat analyse i
wtBRAF
pasienter.
En tilsvarende analyse ble utført i
wtBRAF
gruppe for de 104 pasientene henvist. Univariate analyser viste overlegen OS fra henvisning forbundet med følgende: RMH score på 0-1 i forhold til RMH score på 2-3 (50 måneder, 95% KI 6,4 til 93,3 vs. 6 måneder, 95% KI 2 til 10,3; p 0,001 og HR 2,94, 95% KI 1,56 til 5,56; p = 0,001), behandling med RAF /MEK målretting midler kontra behandling med andre midler eller ingen behandling (51 måneder kontra 10 måneder, 95% CI 7.1 til 12.9; p = 0,014 og HR 0,32, 95% KI 0,12 til 0,83; p = 0,019), metastaser ingen hjerne vs. hjernemetastaser registreres (15 måneder, 95% KI 0 til 34,3 vs. 7 måneder, 95% KI 3 til 10,3; p = 0.004 og HR 2,47, 95% KI 1,31 til 4,65; p = 0,005), non melanom vs. melanom (50 måneder kontra 10 måneder, 95% KI 6 til 13,9; p = 0,006 og HR 2,57, 95% KI 1.27 til 5.18 ; p = 0,008) og eventuell reduksjon i tumorstørrelse vs. ingen nedgang (50 måneder kontra 10 måneder, 95% KI 6,2 til 13,8; p = 0,006 og HR 0,32, 95% KI 0,13 til 0,75; p = 0,009) (tabell 5).
Ved å utelukke pasienter som ikke fikk meldt inn i en fase en rettssak etter henvisning (18 pasienter totalt), fant vi at
wtBRAF
pasienter behandlet med RAF /MEK målretting agenter har en tendens til bedret overlevelse etter henvisning sammenlignet med
wtBRAF
pasienter som behandles med andre legemidler (51 måneder kontra 10 måneder, 95% KI 4,7 til 15,9; p = 0,052 og HR 0,39, 95% KI 0,14 til 1,04; p = 0,06)
Multivariatanalyse i
wtBRAF
pasienter.
I multivariat analyse, ingen av disse faktorene var signifikant assosiert med en bedre OS fra henvisning (figur 5) .
Kjennetegn for melanom Pasienter med
V600K BRAF
mutasjon
Vi undersøkte oppførselen til
mutBRAF
melanom med
V600K
substitusjon i forhold til andre subtyper av
BRAF
mutasjon. (Det var 13 pasienter med V600K mutasjoner inkludert 12 med melanom og en med kolorektal kreft). I melanom gruppen, sammenlignet vi pasienter med V600K
BRAF
mutasjoner vs ikke-V600K
BRAF
mutasjoner (de aller fleste blir V600E). Vi fant at V600K var assosiert med mer hjerne (75% vs. 36,3%, p = 0,02) og lungemetastaser (91,6% vs. 47,7%, p = 0,007). (The enkelt pasient med tykktarmskreft og V600K hadde også hjernen og lungemetastaser). V600K melanomer spredning tidligere (median tid til metastase = 19 måneder, 95% KI 0-49 vs. 53 måneder, 95% KI 33-72, p = 0,046), og ble assosiert med en kortere OS fra diagnosetidspunktet (median 78 måneder, 95% KI 10-146 vs 322 måneder, p = 0,024) (figur 6).
Tic merkene representerer pasienter som var i live og sensurert ved siste oppfølging. (En pasient for hvem diagnosetidspunktet var ukjent ble ekskludert.)
Vi har også sammenlignet OS fra diagnose og fra metastaser mellom V600K melanom vs. wtBRAF melanom, og det var ikke statistisk forskjellige (P = 0,53 og 0,54, henholdsvis).
Blant de 13 pasientene med V600K
BRAF
mutasjon, åtte fikk RAF /MEK målretting midler (hvorav en var kolorektal kreft), tre ikke fikk behandling ( bare beste palliativ omsorg) og to fikk andre målsøkende midler. Det var to pasienter med stabil sykdom i over fire måneder, men ingen delvis eller fullstendig remisjon.
Diskusjoner
BRAF
er en av de hyppigst mutert protein kinase i kreft [14].
