Abstract
Bakgrunn
Sammenhengen mellom polymorfismer på 15q25.1 og lungekreft har blitt mye evaluert; Imidlertid har studier gitt motstridende resultater. Vi ønsket å undersøke dette inkonsekvens ved å utføre en omfattende meta-analyse på to polymorfismer (
CHRNA3
genet: rs1051730 og
AGPHD1
gen: rs8034191). På 15q25.1
metoder
data ble hentet fra 15 og 14 studier på polymorfismer rs1051730 og rs8034191 involverer 12301/14000 og 14075/12873 lungekreft tilfellene /kontroller, henholdsvis. Den tilfeldig effekt modellen ble brukt, adressering heterogenitet og publikasjonsskjevhet
Resultater
De to polymorfismer fulgt Hardy-Weinberg likevekt for alle studier (
P
0,05). . For rs1051730-G /A, bærere av A-allelet hadde en 36% økt risiko for lungekreft (95% konfidensintervall [CI]: 1,27 til 1,46;
P
0,0005), uten heterogenitet (
P
= 0,258) eller publikasjonsskjevhet (
P
Egger
= 0,462). For rs8034191-T /C, den alleliske kontrast indikerte at C-allelet overdratt en 23% økt risiko for lungekreft (95% CI: 01.08 til 01.04;
P
= 0,002), med betydelig heterogenitet (
P
0,0005), uten publikasjonsskjevhet (
P
Egger
= 0,682). Subgruppeanalyser antydet at mellom-studien heterogenitet ble avledet fra etnisitet, studere design, tilpasset informasjon, og lungekreft subtyper. For eksempel, foreningen av polymorfismer rs1051730 og rs8034191 med lungekreft var heterogen mellom kaukasiere (OR = 1,32 og 1,22; 95% KI: 1,25 til 1,44 og 1,05 til 1,42;
P
0,0005 og 0,008, henholdsvis ) og Østasiater (OR = 1,51 og 1,03; 95% KI: 0,76 til 3 og 0,47 til 2,27;
P
= 0,237 og 0,934, henholdsvis) under alleliske modell, og denne foreningen ble relativt styrket under dominerende modellen. Det var ingen observerbar publikasjonsskjevhet for begge polymorfismer.
Konklusjoner
Våre funn viser at
CHRNA3
gen rs1051730-A allel og
AGPHD1
genet rs8034191- T allel kan være risiko givende faktorer for utvikling av lungekreft i kaukasiere, men ikke i Øst-asiater
Citation. Gu M, Dong X, Zhang X, Wang X, Qi Y, Yu J, et al. (2012) sterk sammenheng mellom to Polymorfisme på 15q25.1 og Lung Cancer Risk: A Meta-Analysis. PLoS ONE 7 (6): e37970. doi: 10,1371 /journal.pone.0037970
Redaktør: Yan Gong, College of Pharmacy, University of Florida, USA
mottatt: 19. januar 2012; Godkjent: 27 april 2012; Publisert: 06.06.2012
Copyright: © 2012 Gu et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av Shanghai Rising Star-programmet (11QA1405500) og National Science Foundation for Unge Forskere i Kina (30900808). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:. Forfatterne har lest journalen politikk og har følgende konflikter: Xuezhi Zhang er en ansatt av Kina Petrokjemisk Corporation. Det finnes ingen patenter, produkter under utvikling eller markedsført produkter å erklære. Dette endrer ikke forfatternes tilslutning til alle PLoS ONE politikk på deling av data og materialer.
Innledning
Lungekreft er den vanligste kreftformen og den første ledende årsak til kreftdødelighet, med anslagsvis 1,3 millioner nye tilfeller diagnostiseres hvert år i verden [1], [2]. Den kjente risikofaktorer for lungekreft blant annet røyking og eksponering for ioniserende stråling (for eksempel radon, medisinsk bildebehandling). Samle bevis har antydet at genetiske faktorer kan bidra til variasjon i mottakelighet for lungekreft. Det er allment akseptert at lungekreft er en kompleks multifaktoriell sykdom, skyldes interaksjonen av genetiske faktorer med miljømessige faktorer [3], [4]. Til tross for intensiv innsats viet til å undersøke de genetiske faktorene for lungekreft, kjøre gener og genetiske varianter som bestemmer utviklingen av lungekreft er uklare.
kromosom 15q25.1 regionen har blitt identifisert som et hotspot for lungekreft mottakelighet av nyere genome-wide forening (GWA) studier [5], [6], [7], [8]. Resultater av genetiske assosiasjonsstudier for nikotinavhengighet, røykevaner og røykerelaterte sykdommer har konvergert å implisere kromosom 15q25.1 regionen. Forholdet mellom polymorfismer rs1051730 i
CHRNA3
genet og rs8034191 i
AGPHD1
gen og risikoen for lungekreft eller relaterte fenotyper har vært mye undersøkt. Som det fremgår av McClellan og King, mange om ikke de fleste av de genetiske polymorfismer som er rapportert å være assosiert med vanlige lidelser i GWA studier er saklig falske foreninger forårsaket av små forskjeller i herkomst mellom populasjoner blir studert (kjent som «kryptisk befolkning lagdeling» ) [9]. Videre basert på det faktum at enkelte studier med utilstrekkelige utvalgsstørrelser mangler tilstrekkelig statistisk styrke til å påvise de vanligste variantene med små effekter på lungekreftutvikling, resultatene er ikke reproduserbare. For å utlede en mer presis estimering og undersøke inkonsekvens, vurderte vi effekten av to polymorfismer rs1051730 og rs8034191 på risikoen for lungekreft, adressering heterogenitet og publikasjonsskjevhet.
Metoder
Vi utførte dette analyse i samsvar med retningslinjene i den foretrukne Reporting Varer til systematiske oversikter og metaanalyser (PRISMA) Vern [10] (se flytskjema S1 og sjekkliste S1).
Søk Strategi for Identifisering av studier
Vi søkte PubMed og EMBASE databaser for artikler publisert før januar 2012, ved hjelp av boolske kombinasjoner av emneord (CHRNA3 ELLER AGPHD1 ELLER LOC123688) oG (lungekreft eller carcinoma ELLER svulst) oG (gen eller polymorfisme ELLER allel ELLER genotype eller variant OR mutasjon). Artikler var begrenset til engelskspråklige og studier på mennesker. Den fullstendige teksten i de hentede artiklene ble gransket for å bestemme hvorvidt informasjon om emnet av interesse var inkludert. Referanselister i disse hentes artikler og systema ble også kontrollert for sitering av artikler utgangspunktet ikke identifisert. For artikler som involverer mer enn ett geografisk eller etnisk heterogen gruppe, ble hver gruppe behandles separat. Når genotype frekvens ikke ble rapportert, kontaktet vi forfatterne å innhente relevant informasjon.
inkluderings /eksklusjonskriterier
Artikler ble inkludert i denne meta-analyse dersom de 1) undersøkt hypotesen om at
CHRNA3
genet rs1051730 polymorfisme og /eller
AGPHD1
genet rs8034191 polymorfisme var forbundet med risikoen for lungekreft; 2) fulgte en nested case-control eller case-control eller tverrsnittsstudie design; og 3) gitt tilstrekkelig informasjon om genotype /allel teller mellom saker og kontroller for å beregne odds ratio (OR) og tilsvarende 95% konfidensintervall (95% KI). De relativt komplett og siste resultater ble hentet da det var flere artikler som involverer den samme befolkningen.
hentet informasjon
Følgende informasjon ble ekstrahert selvstendig og inngått separate databaser av to forfattere (MG og WN ) fra hver kvalifiserte studien: første forfatters etternavn, publiseringsdato befolkningen etnisitet, studiedesign, baseline karakteristikker av studiepopulasjonen som alder, etnisitet, kjønn, røykestatus, og genotypen teller i saker og kontroller. Enhver oppstått avvik ble pådømt av en diskusjon til en enighet ble nådd.
Kvalitetspoeng Assessment
Studiet Kvaliteten ble vurdert ved hjelp av en kvalitetsvurdering skår utviklet for genetiske assosiasjonsstudier ved Thakkinstian et al [ ,,,0],11]. Totalt score varierte fra 0 (dårligst) til 12 (best). Kriteriene for kvalitetsvurdering av den genetiske sammenhengen mellom to undersøkte polymorfismer og lungekreft er beskrevet i tabell S1.
Statistical Analysis
Databehandling og statistiske analyser ble utført ved bruk av STATA programvare (StataCorp, Texas , USA, versjon 11.0 for Windows). Avvik fra Hardy-Weinberg likevekt ble testet av χ
2 eller Fishers eksakte test i kontrollgruppene. Uavhengig av mellom-studie heterogenitet, var en tilfeldig effekt-modellen ved hjelp av DerSimonian og Laird metoden implementert for å bringe de enkelte effektstørrelsesestimater sammen, og estimatet av heterogenitet ble tatt fra Mantel-Haenszel modell [12]. Ujustert OR og 95% CI ble brukt for å sammenligne allel og dominerende kontrast mellom saker og kontroller.
Mellom-studie heterogenitet ble vurdert av inkonsekvens hovedside
Jeg
2 statistikk (alt fra 0 til 100%), som ble dokumentert for den prosentandel av den observerte mellom-studie variasjoner på grunn av heterogeniteten i stedet for ved en tilfeldighet, med høyere verdier tyder på eksistensen av heterogenitet [13], [14]. I tilfelle av mellom-studie heterogenitet, undersøkte vi de studie egenskaper som kan stratifisere studier i undergrupper med homogene effekter. For å estimere hvorvidt en eller flere kovariabler forklart heterogeniteten, anvendte vi meta-regresjon, som en forlengelse av tilfeldig effekt-meta-analyse.
Kumulative meta-analyse ble utført for å identifisere påvirkning av den første publisert studie på senere publikasjoner, og utviklingen av de samlede anslagene over tid i henhold til den stigende dato for offentliggjøring. For å identifisere potensielt innflytelsesrike studier, utførte vi innflytelsesrik analyse (også kjent som sensitivitetsanalyse) ved å fjerne et selvstudium hver gang for å sjekke om noen av disse estimatene partisk det totale anslaget.
Trakten tomten og Egger test ble brukt å vurdere publikasjonsskjevhet [15]. Egger test kan påvise trakt plottet asymmetri ved å bestemme om skjæringspunktet avviker vesentlig fra null i en regresjon av de standardiserte effektestimatene mot deres nøyaktighet. Trim og fylle metoden ble også brukt til å beregne antall og utfall av potensielt mangler studier som følge av publikasjonsskjevhet. En sannsynlighet 0,05 ble betraktet som signifikant unntak av
Jeg
2 og Egger sin statistikk, som et signifikansnivå ble definert som. 0,1
Resultater
Søk på studier
Basert på vår søkestrategi, primærscreening produsert 40 potensielt relevante artikler, hvorav 12 møtte inklusjonskriteriene i et forsøk på å vurdere sammenslutning av
CHRNA3
genet rs1051730 og /eller
AGPHD1
genet rs8034191 polymorfismer med lungekreft risiko [5], [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22], [23 ], [24], [25], [26]. Et flytdiagram som skjematisk prosessen for valg og uten artikler med spesifikke årsaker (figur 1). De 12 kvalifiserte artikler ble publisert mellom 2008 og 2011 omfatter 16 studier med 9 i kaukasiere, 4 i Østasiater, to i afrikansk-amerikanere, og en i blandede (kaukasiske, afro-amerikanske og spanske) populasjoner. Kvaliteten score på studiene varierte fra 7 til 10 (gjennomsnitt: 8,5) ut av en maksimal poengsum på 12. I detalj, var det 11 (15) og 10 (14) artikler (studier) for rs1051730 og rs8034191 polymorfismer involverer 12301/14000 og 14075/12873 lungekreft tilfellene /kontroller, henholdsvis.
Studie kjennetegn
baseline karakteristika av alle kvalifiserte studier er oppsummert i tabell 1. genotype distribusjoner av to polymorfismer var i Hardy -Weinberg likevekt for alle studier (
P
0,05). Ti av 16 kvalifiserte studier ble matchet på alder eller kjønn eller røykestatus mellom saker og kontroller [16], [18], [19], [21], [22], [24], [25], [26]. Fem studier var sykehusbasert [16], [19], [23], [26], og resten var populasjonsbasert. Tre studier som er involvert ikke-småcellet lungekreft som et sluttpunkt, og en studie involverte plateepitel lungekreft som et sluttpunkt. Frekvensen av
CHRNA3
gen rs1051730-A-allelet varierte mye mellom kaukasiere og Østasiater med afrikansk-amerikanere i mellom. For eksempel i kontrollgruppene, den rs1051730-A-allelet varierte fra 29,45% til 37,14% i kaukasiere, fra 1,39% til 3,3% i Østasiater, og fra 16.15% til 19,85% i afrikansk-amerikanere. Observasjonen var lik for
AGPHD1
genet rs8034191-C-allelet, med frekvenser som strekker seg fra 23,04% til 39,47% i kaukasiske kontroller, fra 1,82% til 3,72% i østasiatiske kontroller, og fra 16.15% til 31,44 i afrikanske -amerikanske kontroller.
Samlet analyse
på grunn av sparseness av mutante alleler fra begge studerte polymorfismer i Østasiater og å maksimere statistisk styrke til å påvise en sammenheng, vurderte vi det risikoen effekten av to polymorfismer i henhold til både allel og dominerende modeller
Den totale sammenligningen av
CHRNA3
gen rs1051730-A-allelet ga en bemerkelsesverdig økt risiko for lungekreft (OR = 1,33;. 95% KI : 1,24 til 1,44;
P
0,0005) i forhold til rs1051730-G allelet; Det var imidlertid moderat bevis for mellom-studie heterogenitet (
Jeg
2 = 57,8%;
P
= 0,003). Risikoen magnitude ble litt forsterket under dominerende modellen (OR = 1,36; 95% KI: 1,27 til 1,46;
P
0,0005), men heterogenitet var fraværende (
Jeg
2 = 18,4%;
P
= 0,258) (tabell 2). Likeledes for
AGPHD1
gen rs8034191-T /C polymorfisme, sammenlignet med T-allelet, C allele tildeles en betydelig 23% økt risiko for lungekreft (95% CI: 01.08 til 01.04;
P
= 0.002) med heterogenitet (
jeg
2 = 87,2%;
P
0,0005). Risikoen magnitude ble litt svekket under dominerende modellen (OR = 1,2; 95% KI: 1,02 til 1,42;
P
= 0,03;
Jeg
2 = 85,2%;
P
. 0,0005) (tabell 3)
For begge polymorfismer, som reflekteres av den visuelle trakt tomten inspeksjon (Figur 2-A og 2-C) og Egger s regresjon asymmetri statistikk, var det lav sannsynlighet for publikasjonsskjevhet (
P
= 0,742 og 0,682 for rs1051730 og rs8034191, henholdsvis). Ytterligere bevis for selektiv publisering antydet at det ikke var noen mangler studier som kreves for å gjøre trakten tomten symmetrisk for både polymorfismer (Figur 3-B og 3-D).
For hver studie, OR er vist ved midten av det blå faste stoff sirkel hvis øvre og nedre ytterpunkter representerer den tilsvarende 95% CI. OR verdier ble beregnet for de nåværende røykere mot røykere (inkludert tidligere røykere) når det er tilgjengelig eller eks-røykere mot aldri-røykere på annen måte. Den grønne stiplede linjen er plottet ved å montere OR og røyking prosent i saker for de inkluderte studiene.
Akkumulert og innflytelsesrike Analyser
I den kumulative meta-analyse, på tvers av alle genetiske modellene vi fant ingen bevis som tyder på at den første publiserte studien som rapporterte et potensielt betydelig resultat deretter utløst påfølgende publikasjon replikering. Den innflytelsesrike Analysen viste at ingen enkelt studie påvirket det samlede resultatet vesentlig for begge polymorfismer (data ikke vist).
subgruppeanalyse
I lys av betydelig heterogenitet og til å søke for sine potensielle kilder, vi utført et panel av subgruppeanalyser på etnisitet, matchet informasjon, studiedesign, og sykdom type.
Gruppering studier av nedstigningen av populasjoner indikerte at oddsen for å utvikle lungekreft ble betydelig utvidet i afrikansk-amerikanere for begge polymorfismer, og var ikke-signifikant eller bemerkelsesverdig senket i Østasiater for
CHRNA3
genet rs1051730 polymorfisme (allel modell: OR = 1,51; 95% KI: 0,76 til 3,0;
P
= 0,237, og dominant modell: OR = 1,22; 95% CI: 0.59-2,52;
P
= 0,592) (tabell 2), og
AGPHD1
genet rs8034191 polymorfisme (allel modell: OR = 1,03; 95% KI: 0,47 til 2,27;
P
= 0,934, og dominerende modellen: OR = 0,72; 95% KI: 0,52 til 0,99;
P
= 0,043) (tabell 3). I kontrast, var det ingen vesentlige endringer i risikoestimater i kaukasiere for både polymorfismer. Etter stratifisering av matchet informasjon om alder eller kjønn eller røykestatus mellom saker og kontroller, ble anslagene risiko relativt svekket i matchet studier for både polymorfismer i henhold til både allel og dominerende modeller (tabell 2 og 3), og kvaliteten på heterogenitet var ikke . forbedret
i subgruppeanalyse studiedesign, sammenslutning av begge studerte polymorfismer med lungekreft ble forsterkes i sykehusbaserte studier i henhold allel modell (rs1051730: OR = 1,56, 95% KI: 01.01 til 02.21,
P
= 0,012, og rs8034191: OR = 1,31, 95% KI: 0,96 til 1,79,
P
= 0,092), mens i henhold dominerende modellen, ble denne foreningen forsterkes i populasjonsbaserte studier (rs1051730 : OR = 1,39, 95% KI: 1,31 til 1,48,
P
0,0005, og rs8034191: OR = 1,25, 95% KI: 1,03 til 1,51,
P
= 0,021). Begrense analyse til den ikke-små-celle lungekreft det ikke observert noen tegn på heterogenitet, og fant at risikoen størrelsen var signifikant, men forholdsvis svekket i henhold til allelisk modell (rs1051730: OR = 1,24, 95% CI: 1,1 til 1,38,
P
0,0005, og rs8034191: OR = 1,21, 95% KI: 1,08 til 1,36,
P
= 0,001), mens denne størrelsesorden er betydelig styrket i henhold dominerende modellen (rs1051730: OR = 1,38, 95 % KI: 1,18 til 1,61,
P
0,0005, og rs8034191: OR = 1,35, 95% KI:. 1,16 til 1,58,
P
0,0005)
Meta-regresjonsanalyse
for å identifisere andre kilder til heterogenitet, foretok vi meta-regresjonsanalyse av alder (gjennomsnittlig eller median verdi), kjønn (mann prosent), og andelen røykere (andel av nåværende og tidligere røykere) . Blant disse variablene, foreningen av
CHRNA3
genet rs1051730 (korrelasjonskoeffisient: 0,48,
P
= 0,069) og
AGPHD1
genet rs8034191 (korrelasjonskoeffisient: 0,57,
P
= 0,043) polymorfismer med lungekreft ble observert i tilfeller med høy røyking hastighet under allel modellen (figur 3).
Diskusjoner
Via en omfattende meta-analyse evaluert vi foreningen av to vanlige polymorfismer på 15q25.1 med risiko for lungekreft. Totalt Resultatene viste at
CHRNA3
gen rs1051730-A allel og
AGPHD1
gen rs8034191-T-allelet kan være risiko givende faktorer for utvikling av lungekreft i kaukasiere, men ikke i Øst-asiater . Selv om potensielle kilder til heterogenitet ikke kan lett elimineres, denne studien, til vår kunnskap, er den første meta-analyse for å date håndtere foreningen av disse to polymorfismer med lungekreft mottakelighet.
Vi identifiserte etnisitet som en potensiell kilde til mellom-studie heterogenitet ved subgruppeanalyse. Genetisk heterogenitet er uunngåelig i sykdom identifikasjon strategi [27]. Vi fant at foreningen av rs1051730 og rs8034191 polymorfismer med lungekreft var heterogen mellom kaukasiere og Østasiater. Betydningen ble kun observert i det tidligere, som besto med resultatene av GWA studier fra vestlige populasjoner. Vi har også lagt merke til store forskjeller i hvilke
CHRNA3
gen rs1051730-A allel og
AGPHD1
gen rs8034191-C-allelet mellom kaukasiere og Østasiater, noe som gjør det svært vanskelig å oppdage den svake foreningen i asiater mindre undersøker en svært stor befolkning. Dette tyder på at ulike genetiske bakgrunn kan forårsake dette avviket eller at ulike populasjoner kan ha ulike koblingsulikevekt mønstre. De undersøkte polymorfismer kan være i binding med en annen variant årsaks i en etnisk populasjon, men ikke i en annen [28]. For eksempel er rs1051730 polymorfisme i fullstendig koblingsulikevekt med potensielt patogene allelet av rs16969968 (D398N) i
CHRNA5
genet [17], [29]. Vi har derfor spekulerer i at polymorfi rs1051730 kan ha en pleiotropisk effekt på etiologi av lunge kreftutvikling på tvers av ulike etniske grupper. I lys av de avvikende genetiske bakgrunn, er det nødvendig å bygge en database av polymorfismer knyttet til lungekreft i hver etnisk /rasegruppe.
I tillegg til den forstyrrende påvirkning av etnisitet på totale anslaget, noe estimat bør behandles med Vær forsiktig når studiene ble fordelt etter studiedesign. I denne meta-analyse, for både polymorfismer, risikoestimater i sykehusbaserte studiene var sterkere enn i befolkningsbaserte studier. I tillegg til relativt liten utvalgsstørrelse, bør ulempene med sykehusbaserte studier ikke ses bort fra, som befolkningen stratifisering er fortsatt et viktig tema [30]. To studier hadde rekruttert fag fra bare ett sykehus, og dermed kan det være en smal sosioøkonomisk profil for begge tilfeller og kontroller. I tillegg kan dårlig sammenlignbarhet mellom saker og kontrollene i sykehusbaserte studier utøve en konfunderende effekt på den sanne foreningen i lys av en regional spesialitet for sykdommen og de differensial sykehusinnleggelse priser mellom saker og kontroller [31]. I kontrast, kan fagene trukket fra samfunnet eller den generelle befolkningen være mer representative for befolkningen, noe som gjør resultatene fra befolkningsbaserte studier mer overbevisende. Tatt i betraktning de bredere konfidensintervall av estimater, er flere studier er nødvendig for å kvantifisere effekten størrelse pålitelig.
Videre vår meta-regresjonsanalyse fant en sammenslutning av to undersøkte polymorfismer med kreftrisiko lunge hos pasienter med en høyere andelen røykere . Vi definerte røyking rate basert på prosentandelen av nåværende og tidligere røykere hvis tilgjengelig. Denne definisjonen er lite sannsynlig å undergrave vår observasjon siden utelukkelse av stadig røyking kan føre til en undervurdering av risikoen for lungekreft. Videre ble våre data om røyking og andre confounders hentet fra nyere publikasjoner (etter år 2008) fra profesjonelle kreft tidsskrifter som reflekteres av høy kvalitet poengsum. I tillegg er røyking den klart største bidragsyteren til lungekreft, sto for ca 90% av forekomsten av lungekreft [32] den. Tidligere studier har vist at polymorfismer i
CHRNA3
genet ble forbundet med økt risiko for oppstart av røyking, noe som indikerer en potensiell genotype-fenotype interaksjon [33].
De sterke sider av denne studien omfatter relativt stor utvalgsstørrelse, ingen avvik fra Hardy-Weinberg likevekt, og den høye kvaliteten på kvalifiserte studier. Imidlertid bør vår nåværende studien tolkes med flere tekniske begrensninger i tankene. For det første, de fleste av studiene i denne meta-analysen var case-kontrollstudier, som er utsatt for seleksjonsskjevhet ved å inkludere bare ikke-fatale tilfeller. For det andre, fordi bare publiserte studier i engelsk ble hentet og «grå» litteratur (artikler på andre språk enn engelsk) var ikke inkludert, kan publikasjonsskjevhet være mulig, selv om våre trakt plott og statistiske tester ikke viste det. Men asymmetri i trakten tomten, blir enten visuelt tolket eller statistisk testet, kan skyldes en vesentlig forskjell mellom de små og større studier som oppstår fra iboende mellom-studie heterogenitet [34]. Fordi i dag har vi ingen gylden standard for å sammenligne resultatene av trakt tomten tester [34], Egger test og den vanlige trakt tomten har blitt utfordret. Vi kan ikke helt utelukke en lav sannsynlighet for at små negative studier mangler fra tomten. Likevel, trim og fylle metoden foreslått noen mangler studier som kreves for å gjøre trakten tomten symmetrisk for både polymorfismer. For det tredje, enkelt locus-baserte natur meta-analyse utelukket muligheten av gen-genet og genet-miljø interaksjoner, såvel som haplotype-baserte effekter, noe som tyder på at ytterligere studier som vurderer disse aspektene er nødvendig. For det fjerde har vi fokusert bare på to polymorfismer på 15q25.1 og ikke vurdere andre kandidatgener eller polymorfismer. Det er sannsynlig at de studerte polymorfismer av seg selv gjøre et mindre bidrag til risiko prediksjon i lungekreftpasienter, men om de to polymorfismer når integrert med andre risikofaktorer vil forbedre prediksjon krever videre undersøkelser.
Til sammen vi har utvidet tidligere enkeltstudier ved å gi overbevisende bevis for at
CHRNA3
gen rs1051730-A allel og
AGPHD1
gen rs8034191-T-allelet kan være risiko givende faktorer for utvikling av lungekreft hos kaukasiere , men ikke i Øst-asiater. Vi har styrket de tidligere funn om foreningen av høy røyke sats med økt risiko for lungekreft. Videre studier bør undersøke markører på og ved siden av 15q25.1 å avklare om den nåværende foreningen er kausal eller på grunn av koblingsulikevekt.
Hjelpemiddel Informasjon
Tabell S1.
Kriterier for kvalitetsvurdering av genetiske sammenslutning av
CHRNA3
genet rs1051730 polymorfisme og
AGPHD1
genet rs8034191 polymorfisme med lungekreft
doi:. 10,1371 /journal.pone.0037970.s001 product: (DOC)
Flytskjema S1. .
PRISMA flyt
doi: 10,1371 /journal.pone.0037970.s002 product: (PDF)
Sjekkliste S1.
PRISMA sjekkliste
doi:. 10,1371 /journal.pone.0037970.s003 plakater (DOC)
