Abstract
Bakgrunn
SULT1A1
Arg213His (rs9282861) polymorfisme er rapportert å være assosiert med mange typer kreftrisiko. Men funnene er i konflikt. For bedre forståelse av denne SNP nettstedet og kreftrisiko, oppsummerte vi tilgjengelige data og utført denne meta-analysen
Metoder
Data ble samlet inn fra følgende elektroniske databaser:. PubMed, Web of Knowledge og CNKI . Foreningen ble vurdert av odd ratio (OR) og tilsvarende 95% konfidensintervall (95% CI).
Resultater
I alt 53 studier inkludert 16733 kreftpasienter og 23334 kontroller basert på søkekriteriene ble analysert. Total, vi fant
SULT1A1
Arg213His polymorfisme kan øke risikoen for kreft i henhold heterozygot (OR = 1,09, 95% CI = 01.01 til 01.18, P = 0,040), dominant (OR = 1,10, 95% CI = 01.01 til 01.19 , P = 0,021) og allel (OR = 1,08, 95% CI = 1.02-1.16, P = 0,015) modeller. I subgruppeanalyser ble signifikante assosiasjoner observert i øvre aero fordøyelseskanalen (UADT) kreft (heterozygot modell: OR = 1,62, 95% CI = 1,11 til 2,35, P = 0,012; dominerende modellen: OR = 1,63, 95% KI = 1.13- 2,35, P = 0,009; allel modell: OR = 1,52, 95% CI = 1.10 til 2.11, P = 0,012) og indere (recessiv modell: OR = 1,93, 95% CI = 01.22 til 03.07, P = 0.005) undergrupper. Sykehus basert studie viste også marginalt signifikant sammenheng. I brystkreft undergruppe, etnisitet og årstall avslørt av meta-regresjonsanalyse og en studie funnet av sensitivitetsanalyse var de viktigste kildene til heterogenitet. Sammenhengen mellom
SULT1A1
Arg213His og brystkreftrisiko var ikke signifikant. Ingen publikasjonsskjevhet ble oppdaget.
Konklusjoner
Den nåværende meta-analyse antyder at
SULT1A1
Arg213His polymorfisme spiller en viktig rolle i kreftutvikling, noe som kan være en genetisk faktor som påvirker individet mottakelighet for UADT kreft.
SULT1A1
Arg213His viste ingen sammenheng med brystkreft, men den mulige risikoen i asiatiske befolkningen trenger videre etterforskning
Citation. Xiao J, Zheng Y, Zhou Y, Zhang P, Wang J, Shen F et al. (2014) sulfotransferaseaktivitet SULT1A1 Arg213His Polymorphism med kreftrisiko: En meta-analyse av 53 kasus-kontrollstudier. PLoS ONE ni (9): e106774. doi: 10,1371 /journal.pone.0106774
Redaktør: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, USA
mottatt: 10 mars 2014; Godkjent: 30 juli 2014; Publisert: 16.09.2014
Copyright: © 2014 Xiao et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Data Tilgjengelighet:. Den forfatterne bekrefter at alle data som underbygger funnene er fullt tilgjengelig uten restriksjoner. Alle data er inkludert i papir og dens saksdokumenter filer
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av tilskudd fra Natural Science Foundation of China National (Grant tall 81071957 og 81000938), (http: //www .nsfc.gov.cn /). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
sulfotransferaseaktivitet (Sult) enzymer katalyserer sulfat konjugering av et bredt spekter av underlag og spiller en viktig rolle i metabolismen av endogene og eksogene forbindelser inkludert skjoldbruskkjertelen og steroidhormoner, nevrotransmittere, narkotika og procarcinogens [1], [2 ]. Det er mange isoformer av
SULT
s supergenfamilien, hver med forskjellig aminosyresekvens identitet og substrat spesifisitet [3]. SULT1A1 er et viktig medlem av sulfotransferaseaktivitet familien involverer i patogene prosessen med ulike kreftformer [3] -. [5]
SULT1A1
genet ligger på kromosom 16p12.1-p11. 2 [6]. Forrige studien indikerte at ekson 7 av
SULT1A1
gen inneholdt en G til A overgang ved kodon 213 (rs9282861) som forårsaker en Arg Hans aminosyresubstitusjon [4]. Noen studier har vist at denne genetisk polymorfisme fører til en reduksjon i enzymatisk aktivitet av SULT1A1 og sulfoneringen effektivitet således å assosiere med følsomheten overfor en rekke kreftformer [7], [8]. Selv om den spesifikke rollen
SULT1A1
Arg213His polymorfisme i kreftutvikling har blitt undersøkt i flere case-kontrollstudier, resultatene har vært mangelfulle, selv conflictive. For å gi et helhetlig og nøyaktig resultat, utførte vi denne meta-analysen studie for å analysere sammenhengen mellom denne polymorfisme og kreftrisiko.
Materialer og metoder
Identifisering av godkjente studier
Den meta-analyse ble utført i henhold til kriteriene for Preferred Reporting Varer til systematiske oversikter og meta-analyser (PRISMA) (Sjekkliste S1). I denne studien, gjorde vi en uttømmende litteratursøk på studier som undersøkte sammenhengen av
SULT1A1
genet polymorfismer med kreftrisiko. Alle kvalifiserte studier ble identifisert ved søk i følgende databaser: PubMed, Web of Knowledge og Kina Nasjonalt kunnskapsinfrastruktur (CNKI, https://www.cnki.net/). Følgende betegnelser ble brukt: «sulfotransferaseaktivitet,
SULT
eller
SULT1A1
«, «polymorfisme, variasjon, variant eller mutasjon» og «kreft eller carcinoma». I CNKI database, søkte vi med disse tilsvarende stikkord i kinesiske tegn. Inkluderte studiene bør oppfylle følgende kriterier: (1) å vurdere sammenhengen mellom
SULT1A1
Arg213His polymorfisme og kreftrisiko; (2) studie utformet som case-control; (3) tilstrekkelige data for å kunne estimere en merkelig ratio (OR) med sine 95% konfidensintervall (95% CI).
Data utvinning
To etterforskere hentet ut data uavhengig og nådde enighet om følgende karakteristikk av de utvalgte studiene:. første forfatternavn, utgivelsesår, etnisitet av studiepopulasjonen, matchende kriterier, antall deltakere, genotype distribusjon og kontroll kilde
Statistisk analyse
Hardy -Weinberg likevekt ble vurdert av Chi-kvadrat test. Crude odd ratio (OR) og 95% konfidensintervall (KI) ble brukt for å estimere sammenhengen mellom
SULT1A1
polymorfisme og kreft mottakelighet under dominerende modellen (Arg /His + Hans /Hans vs. Arg /Arg) , recessiv modell (Hans /Hans vs. Arg /Arg
+ Arg /Hans), homozygot modell (Hans /Hans vs. Arg /Arg), heterozygot modell (Hans /Arg vs. Arg /Arg) og allel modell ( hans vs. Arg). Den heterogenitet blant studiene ble evaluert av Q-test og
I
2
verdien varierer fra 0% til 100% for å beskrive hvor stor prosentandel av mellom-studie variasjon som skyldes heterogenitet. P-verdien for Q-test mindre enn 0,10 indikerer eksisterende heterogenitet blant studier. Og så den samlede OR ble målt av en tilfeldig effekt modellen (DerSimonian-Laird metoden). Ellers ble en fast effekt modellen (Mantel-Haenszel metode) valgt.
Undergruppe-analyser ble utført i henhold til krefttype (brystkreft, tykktarmskreft, urothelial kreft, prostatakreft, lungekreft, øvre aero fordøyelsessystemet (UADT) kreft, eggstokkreft og magekreft), etnisitet (kaukasisk, østasiatisk, indisk og afrikansk) og kilde til kontroller (sykehus basert og befolkningen basert). Når heterogenitet ble oppdaget, til en multivariabel meta-regresjonsanalyse inkludert krefttype, etnisitet, kontroll kilde og utgivelsesår utforske potensiell kilde til heterogenitet og sensitivitetsanalyse ble utført.
Den potensielle publikasjonsskjevhet ble estimert ved hjelp Egger lineære regresjon test ved visuell inspeksjon av trakten plottet. P
0,05 ble ansett som statistisk signifikant, og alle P-verdier var tosidig. Analysene ble utført ved hjelp av programvaren omtale manager 5,3 (Cochrane Collaboration), R programvare (www.r-project.org) og STATA 12,0 programvare (StataCrop).
Resultater
Kjennetegn på utvalgte studier
den flytdiagram for litteratursøk ble gitt i Figur 1. totalt 91 studier med fokus på sammenhengen mellom
SULT1A1
Arg213His polymorfi og kreft risiko ble identifisert. 25 av dem var utelukket på grunn av utilgjengelige data eller gjentatte data. Dermed ble allel og genotypefrekvensene av
SULT1A1
Arg213His polymorfisme hentet fra 66 artikler. Imidlertid gjorde 18 artikler ikke møtes med Hardy-Weinberg likevekt og ble forlatt (Ekskludert liste S1). Som et resultat ble 53 studier av 48 artikler, som involverer 16733 tilfeller og 23334 kontroller inkludert i de samlede analysene [9] – [56]
Det som kjennetegner studier med i den aktuelle meta-analyse. er vist i tabell 1. Blant disse studiene, 13 ble utført for brystkreft, 10 for kolorektal kreft, 7 for urothelial kreft, 5 for prostatakreft, 5 for lungekreft, 5 for UADT (øvre aero fordøyelseskanalen) kreft, 3 for eggstokkreft, 2 for magekreft og en for myeloid leukemi, multippelt myelom, og livmorkreft, henholdsvis. Ved ethnics, var det 27 studier av kaukasiske, 11 studier av Østasiater, 4 studier av indianere, 2 studier av afrikanere og 9 studier av blandede ethnics. Ved kilden til kontroller, 16 studier var populasjonsbasert, 17 studier ble sykehusbasert og 20 studier var ikke klart.
Samlet analyse
Tabell 2 viser resultatene av overordnet analyse og undergruppen analyse. Analysene på hele datasettet indikerte en signifikant sammenheng av
SULT1A1
Arg213His polymorfisme med kreftrisiko: heterozygot (OR = 1,09, 95% CI = 01.01 til 01.19, P = 0,035), homozygot (OR = 1,20 , 95% CI = 1,04 til 1,39, P = 0,014), dominant (OR = 1,12, 95% CI = 01.03 til 01.22, P = 0,008) (figur S1), recessiv (OR = 1,16, 95% CI = 1,02 til 1,32 , P = 0,027) og allel modell (OR = 1,11, 95% CI = 01.04 til 01.20, P = 0,003), med høy heterogenitet blant studier (
I
2
= 63,1%, 62,6%, henholdsvis 68,5%, 58,3% og 73,7%, alle P . 0,001) (tabell 3)
undergruppe Analyser
Vi analyserte foreningen i krefttype undergruppe.
SULT1A1
Arg213His polymorfisme kan øke kreftrisiko i de følgende krefttyper: brystkreft (homozygot modell: OR = 1,37, 95% CI = 1,01 til 1,87, P = 0,045; dominerende modellen: OR = 1,18, 95% CI = 1,00 til 1,40, P = 0,050 og allel modell: OR = 1,15, 95% CI = 1,00 til 1,32, P = 0,044); UADT kreft (heterozygot modell: OR = 1,62, 95% CI = 1,11 til 2,35, P = 0,012; dominerende modellen: OR = 1,63, 95% CI = 1,13 til 2,35, P = 0,009 og allel modell: OR = 1,52, 95% CI = 1.10 til 2.11, P = 0,012). Forest plott av risiko for brystkreft og UADT kreftrisiko ble vist i Figur 2 og Figur 3 separat
Analysert av etnisitet, ble det observert en moderat økt risiko i kaukasiere (homozygot modell. OR = 1,20, 95% CI = 1,01 til 1,43, P = 0,035 og allel modell: OR = 1,10, 95% CI = 01.01 til 01.19, P = 0,019) og indere (recessive modell: OR = 1,93, 95% CI = 01.22 til 03.07 , P = 0,005). Ingen signifikant sammenheng ble funnet i andre etniske grupper i noen modell.
Etter styrekilde, ble signifikant sammenheng observert i sykehusbasert studie, men ikke befolkningen basert studie.
Meta-regresjonsanalyse
for å finne potensiell kilde til heterogenitet, ble multivariable meta-regresjon analyser utført i total gruppe og undergrupper inkludert krefttype, etnisitet, kontroll kilde og årstall. I brystkreft undergruppe, etnisitet (heterozygot modell, P = 0,027; recessive modell, P = 0,020) og årstall (heterozygot modell, P = 0,019; recessive modell, P = 0,012) er betydelige kilder til heterogenitet (tabell S1). Andre variabler påvirker ikke heterogenitet.
Følsomhetsanalyse
En sensitivitetsanalyse er konstruert ved å gjenta meta-analyse sekvensielt fjerne hver studie. I recessive modellen ble to studier [26], [57] funnet å påvirke den samlede OR og heterogenitet når fjernet. Studien ble utført av Khvostova var fokusert på brystkreft og Sun studie ble fokusert på tykktarmskreft blant kaukasiere, så ytterligere sensitivitetsanalyser ble gjennomført i total datasettet og brystkreft, tykktarmskreft og kaukasiske undergrupper etter fjerning av to studier (Tabell 4 og Tabell S2). Totalt gruppen ble heterogenitet betydelig redusert (
I
2
= 58,2, 42,2, 63,5, 33,1 og 66,4, henholdsvis). I undergruppen følsomhetsanalyser, fjerne de to studiene kan betydelig redusere heterogenitet blant studiene, mest
I
2
verdier som er mindre enn 50%. Og dette polymorphism viste ingen åpenbar sammenheng med risiko for brystkreft (figur 4). Endelig har vi gjennomført sensitivitetsanalyser på de resterende studiene og resultatet var stabil.
publiseringsskjevheter
trakt plott og Egger test ble utført for å vurdere publikasjonsskjevhet . Figurer av trakten tomter indikerte ingen åpenbar asymmetri (figur 5). Egger test fant ingen publikasjonsskjevhet i heterozygot (P = 0,074); homozygot (P = 0,146); dominant (P = 0,076); recessiv (P = 0,282) og alleliske modell (P = 0,081).
(A) heterozygot modell (B) homozygot modell (C) dominerende modellen (D) recessiv modell Den horisontale linje i trakten plottet indikerer faste-effekter oppsummering estimat, mens skrålinjene viser de forventede 95% konfidensintervall for et gitt SE.
Diskusjoner
SULT1A1 enzym kodet av
SULT1A1
genet spiller en viktig rolle i metabolismen xenobiotisk. Den Arg213His polymorfisme, den mest studerte polymorfisme innen
SULT1A1
genet, kan redusere enzymaktiviteten og termo, og dermed resulterer i en individuell mottakelighet for kreft [7], [8].
Det har vært noen meta-analyser med fokus på denne mutasjon og kreftrisiko [58] – [60]. Men de fleste av disse analysene ble utført før år 2012, og en ny meta-analyse er nødvendig for å gi en helhetlig konklusjon på grunn av den økende data av case-kontrollstudier.
Denne stede meta-analyse, inkludert 16 733 saker og 23334 kontroller fra 53 case-control studier, utforsket sammenhengen mellom
SULT1A1
Arg213His polymorfisme og kreftrisiko. Dette er den største skalaen meta-analyse så langt. Våre resultater antydet at
SULT1A1
Arg213His var assosiert med UADT kreftrisiko. Som øverste aero fordøyelseskanalen blir utsatt for en rekke potensielle kreftfremkallende som fenoliske xenobiotics, polysykliske aromatiske hydrokarboner og heterosykliske aromatiske aminer som finnes i røyking, miljøgifter og litt mat, manifesterer dette resultatet at mutasjon i
SULT1A1
årsaker den lave SULT1A1 aktivitet og er forbundet med høy følsomhet for krefttyper relatert til miljø.
i sensitivitetsanalyser, studien utført av Khvostova påvirker de samlede estimater og heterogenitet mest i brystkreft undergruppe. Og etter å ha fjernet denne studien var signifikant sammenheng mellom
SULT1A1
Arg213His og brystkreftrisiko ble null (figur 2 og figur 4). Vi ytterligere sjekket data fra Khvostova og observerte prosentandelen av vill homozygot genotype i Khvostova studie var tydeligvis lavere enn i andre studier dermed forårsaker stor heterogenitet. Endelig et robust resultat ble oppnådd, og ikke klarte å avsløre signifikant sammenheng i brystkreft undergruppe. Dette resultatet er lik Wang, Lee og Jiang [61] – [63], men de fant en positiv sammenheng med denne polymorfisme med brystkreft mottakelighet blant asiater. Mens i vår meta-analyse, vi bare rekruttert én papir fokusert på brystkreft blant asiater fordi andre papirer på asiater avvike fra
HWE Hotell og ble ekskludert. Dette er en begrensning av denne meta-analyse og flere uavhengige case-control studier utført på asiater er nødvendig for å inngå en mer omfattende resultat.
I den etniske subgruppeanalyse, fant vi at genotypen distribusjoner av SNP nettstedet er forskjellige i etniske grupper. Ved beregning av prosentandel av alleler i hvert etnisk, fant vi at Hans allel i asiater (9,58%) er betydelig mindre enn i kaukasiere (35,2%). Ulike etniske grupper kan ha ulike genetiske bakgrunn, og dermed forårsaker ulike genotypefrekvensene i asiatiske og andre etniske grupper som kan påvirke kreft mottakelighet.
Li og Kotnis har gjennomført meta-analyser med fokus på miljørelaterte kreftformer, som tobakks relatert kreft og funnet kreftrisiko kan moduleres ved interaksjon mellom genetiske varianter og miljøfaktorer [58], [59]. Som utsatte miljøfaktorer er forskjellige i henhold til krefttyper, for eksempel røyking fører til lungekreft, mens inntaket av kjøtt påvirker brystkreft og tykktarmskreft [64], [65] og vår analyse tok mange typer kreft i betraktning, har vi besluttet ikke å inkludere miljøfaktorer. Videre definisjonene av utsatte miljøfaktorer var ikke konsekvent i studiene, noe som kan føre til stor heterogenitet. Våre anslag var basert på råolje eller verdier, ikke justert OR verdier, som kan gi unøyaktig beregningen.
Det var flere kilder som tar med heterogenitet, for eksempel studiedesign, alders- og kjønnsfordeling, og etnisitet. Meta-regresjonsanalyse ble gjennomført for å finne kilden til heterogenitet. I brystkreft gruppen, kan årstall forårsake stor heterogenitet og ytterligere oppmerksomhet ble betalt til år. Vi fant alle rekruttert studiene ble utført før 2005 eller etter 2010, og det var ingen studier mellom 2006 og 2009. Hans allelet var 29,6% i studiene før 2005 og 33,0% etter 2010, som var signifikant forskjellig (P = 0,02 ). Dette kan være forårsaket av ulike studiepopulasjonen, og trenger flere case-control studier for å illustrere.
I konklusjonen, tyder vår meta-analyse at
SULT1A1
Arg213His polymorfisme kan bidra kreftrisiko UADT . Som et resultat ble beregnet ved sampling statikk og statistisk forskjell er ikke det samme som klinisk forskjell, kan resultatet bli brukt for klinisk referanse, ikke for klinisk diagnose av kreft. Ytterligere detaljert undersøkelse med større antall deltakere over hele verden er nødvendig for å avklare hvilken rolle denne polymorfisme i kreftrisiko.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
Forest tomt på sammenhengen mellom
SULT1A1
Arg213His polymorfisme og samlet kreftrisiko i dominerende modellen
doi:. 10,1371 /journal.pone.0106774.s001 plakater (TIF)
Table S1. .
P-verdi på meta-regresjon i generelle og brystkreft grupper
doi: 10,1371 /journal.pone.0106774.s002 plakater (docx)
Tabell S2.
Heterogenitet test etter å utelate studier av Khvostova og søn
doi: 10,1371 /journal.pone.0106774.s003 plakater (docx)
Sjekkliste S1.
PRISMA 2009 Sjekkliste
doi:. 10,1371 /journal.pone.0106774.s004 plakater (DOC)
Ekskludert liste S1.
Ekskludert studier liste med grunner
doi:. 10,1371 /journal.pone.0106774.s005 plakater (XLS)
